sp|P49215|RS17_SOLLC ----> Small ribosomal subunit protein eS17

Intron 1 GTGAGCTCAG ... GTTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.84	40.9	6	15
A2	23.08	50	0.5	15
A3	29.31	41	6.8	17
A4	26.39	53	3.1	19
A5	34.78	30	5.2	16
A6	25.68	301	11.2	104
A7	28.06	207.7	1.2	81
A8	31.06	111	1.2	50
A9	26.84	199	0	73
A10	31.09	164	2	74

>TRINITY_DN107681_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GCATCTTCAATACATTTGATGGGAGTATCCAACCCTCCTGAAAATAGGGTTTAGGCTTTCACTTTTCATCTAAAACAAACAATATTGGACGTTTCGATTTCTAAATTCTCCACCCAAAGAGAGACTCCAACCTGCCCCATTAGTTTTTGCTTAAGAGCTCAGCGTTTCACCCAAACAATGGGGCGTGTGAGAACGAAAAC
CGTGAAGAAGTCCTCTCGGCAGGTGATCGAGAGGTACTATTCTCGCATGACTCTCGACTTCCATACCAACAAGAAGATCGTGGAGGAGGTGGCCATAATCCCCTCGAAGCGCTTGAGGAATAAGATTGCAGGGTTCAGCACCCATTTGATCAAGCGCATTCAAAGAGGTCCAGTGCGAGGCATCTCTCTCAAGCTTCAAG
AAGAGGAGCGTGAGAGGCGTATGGACTACGTTCCTGACGAGTCTGCCATCAAAATCGATGTTATTGAGGTGGACAAAGAAACCATGGACATGCTTGCTTTCTTGGGCATGGCTAATTTACCTGGAGTTGTCAAGCAGGCAGATCCACCAGTGGGTGGTGGTTTTATAAGGCCAGGAGGTGGTTACCTGGGTGGTGCACAG
GGGAGAAGATAATAAAATTGTCTTGCTTCAACGTATACTACAAAATGAAGTATATGCTATTTGTGGTTGATGATTTTTTTTCTCATGAATCGAATCATTTAGTTGGTTGCGGATAATAGTTTGCAGGCTAGAATTCATGTGATGTAAGTCTAGTTGGGAGGAGAGTTTTAATAGTATTCTGATTAAGTTGTCATTAATAT
TTACACTAGGGTTAAAATACCTTTCAAGTCAAGTAGGGGGTTAATGTGGGACAATGATTGCTGAATCAAATTGGTGCATAATAAAAGGGCCGTTTTATTGACGCTTGTATGCAGATCATGATCACCAATTGGTTCCAAATTTAGTGTTTCTTGTTCCATGTAATGAAAGGTGTTTTGTTATGGTCGCAAAAGCTATCAAA
GGCCACGCCGTGGCATTGGTATTTGTGGGCTGTTTTCTATCTTCTTTACTTTAAAAGTGTAATGCTGTTATTGAGACTAGCTTCTTCCCTACGAGGTTTTATTTTTCTTCTCTGGTGCATGGGTAAATGAAATCGTTTTAAACAGGGAAACAATTCATATTACAATATTGTAATTATTTTAATTCGAATAAATAAATACT
TTTGATAATTGTTTTGATTAAGCCAAAACCAATAGGATACATGGCGGTAGACAACTGGTAAAGTGTTATGATATCAAATAAAGATGAGAACCATAATTTTGGGTGAATATCAAGGGTG

>TRINITY_DN107681_c0_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GCATCTTCAATACATTTGATGGGAGTATCCAACCCTCCTGAAAATAGGGTTTAGGCTTTCACTTTTCATCTAAAACAAACAATATTGGACGTTTCGATTTCTAAATTCTCCACCCAAAGAGAGACTCCAACCTGCCCCATTAGTTTTTGCTTAAGAGCTCAGCGTTTCACCCAAACAATGgtgagctcagagatcatcgc
cattagaatatgtatctgtcactataaacttactgaaggttttgatctgcaaacaaatgataaagatgggttgggtttgtgcagGGGCGTGTGAGAACGAAAACCGTGAAGAAGTCCTCTCGGCAGGTGATCGAGAGGTACTATTCTCGCATGACTCTCGACTTCCATACCAACAAGAAGATCGTGGAGGAGGTGGCCAT
AATCCCCTCGAAGCGCTTGAGGAATAAGATTGCAGGGTTCAGCACCCATTTGATCAAGCGCATTCAAAGAGGTCCAGTGCGAGGCATCTCTCTCAAGCTTCAAGAAGAGGAGCGTGAGAGGCGTATGGACTACGTTCCTGACGAGTCTGCCATCAAAATCGATGTTATTGAGGTGGACAAAGAAACCATGGACATGCTTG
CTTTCTTGGGCATGGCTAATTTACCTGGAGTTGTCAAGCAGGCAGATCCACCAGTGGGTGGTGGTTTTATAAGGCCAGGAGGTGGTTACCTGGGTGGTGCACAGGGGAGAAGATAATAAAATTGTCTTGCTTCAACGTATACTACAAAATGAAGTATATGCTATTTGTGGTTGATGATTTTTTTTCTCATGAATCGAATC
ATTTAGTTGGTTGCGGATAATAGTTTGCAGGCTAGAATTCATGTGATGTAAGTCTAGTTGGGAGGAGAGTTTTAATAGTATTCTGATTAAGTTGTCATTAATATTTACACTAGGGTTAAAATACCTTTCAAGTCAAGTAGGGGGTTAATGTGGGACAATGATTGCTGAATCAAATTGGTGCATAATAAAAGGGCCGTTTT
ATTGACGCTTGTATGCAGATCATGATCACCAATTGGTTCCAAATTTAGTGTTTCTTGTTCCATGTAATGAAAGGTGTTTTGTTATGGTCGCAAAAGCTATCAAAGGCCACGCCGTGGCATTGGTATTTGTGGGCTGTTTTCTATCTTCTTTACTTTAAAAGTGTAATGCTGTTATTGAGACTAGCTTCTTCCCTACGAGG
TTTTATTTTTCTTCTCTGGTGCATGGGTAAATGAAATCGTTTTAAACAGGGAAACAATTCATATTACAATATTGTAATTATTTTAATTCGAATAAATAAATACTTTTGATAATTGTTTTGATTAAGCCAAAACCAATAGGATACATGGCGGTAGACAACTGGTAAAGTGTTATGATATCAAATAAAGATGAGAACCATAA
TTTTGGGTGAATATCAAGGGTG