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AG
ATATTGTCTGGGGAGCAAGAAAAATTGCGTTCATCAATGCGGACTTCAAAATCTCCAAAGAGCAATTCACAAACACCACCGCGGTCATTGCCAGTTGCTAGGTCAAGGGACTTGAATGGAGCAGCAGGAATGGAAGATCCAGATGGGATATGGGCAAGTATTGCAGAATTTATTGAACAACTCCAGGCAAATATATGT
ACATCAGCTGAAAAGGAGCTGGTAACAAAACATCTTTTGGATCTTGCGAAGTCTAGAAAGGATGCCAGGGCTGCAATTGGTTCTCATTCGCAAGCAATACCTTTGCTTGTTGCACTTCTCAGATCTGGAACTAACACTACAAAGGTCAATGCAGCTTTAACCTTAGGGTTTCTATGTAAGGAAGAGGATTTAAGAGTGAA
AGTATTGCTAGGAGGGTGCATACCTTCCTTGCTTGCACTGCTAAGGTCTGGGGTTGCAGAAGCTCAGAAAGCAGCAGCAAAGGCAATATGTGCAGTATCACATGGTGGTGTGTCAGATCACGTTGGAATGAAGATATTTGTGACAGAGGGTGTTGTGCCCAGTCTCTGGGATCAGCTTCATCCAAAGCGCAAGCATGAAA
AATTAGTTGATGATCTTCTTACTGGTGCATTAAAAAATTTGTGTACGAATACTGAAGGTTTCTGGCAAACAACCCTTGAAGCTGGTGGAGTAGATATCCTCGTAAGACTTATTTCTTCTGGGAGTACAGTTGCTCAATCGAATGCATCCTCCCTCTTGGCTAGTCTGATGTTAGCTTCAGAGGCTAGTTGTACTAAGGTT
CTGAATGCTGGTGCTGTTCAACACCTACTGAAGCTTTTAGGTCCTGAAAATGAAGTCTGTGTCCGTGCTGAAGCAGCTGGTGCATTACAGGCTCTCTCTTCTAAACTGATTAGTGCGAAGAAAGCTATAGTGGACGAAGGTGGCATTCCCATTTTAATCAGTTCAGTCGTAGCACCTTCAAAAGAGTTTATGCAAGGGCT
ACCTGCTCAAGCCCTTCAGGAACATGCAATGGGTGCTTTAGTGAACATTTCAGGTGGAATGTCTGCTATTGTGCTCAGCCTTGGAGAAAGCATTGAGTCATTTCGGTCTGACATTCAAGTGGCTGACATTATTGGTGCCCTGGCCTATGCATTAATGGTGTTTAATGAAAACTCATATAATGCAGGCTCACTTGATGCAG
TTAAAATAGAAGGACTATTAGTCAGACAACTCAAACCTCATAACTCTCAGCTGGTGCAAGAACGTGCAATTGAAGCTTTGGCTAGTCTCTATGGCAATGCTTACCTTTCTATAGGGTTGTTACACGCTGAAGCAAAAAAAATGCTGGTTGGACTGGTGACTATGGCTAGTTGTGAGATACAAAAAGAACTCATGCACTTA
TTAAGAAGCCTGTGTTCTGTCAATTCAGATCTCTGGCAGTCATTTAGGGGGCGAGAGGGAATTCAGCTTTTAATTTCATTTCTTGGTTTATCTACTGAGCAACAACAGGAGCATGCTGTTGCTTTGCTTTCTATTTTGTCTGTAGAAGTTGATGACAGTAAATGGGCAATTACAGCAGCAGGTGGGATACCTCCACTTGT
CCAGCTGCTGGAAACTGGATCCTGGAAAGCAAAAGAGGATGCTGCACTTTTGCTAGGAAATTTATGTTCTCATAGTGAAGAAATTCGTGCTTGTGTTGAAAGTGCAGATGCTGTTCCAGCCCTCCTGTGGCTCTTGAGAAATGCTGATCCAAAAGGACAAGAAGTTGCTGCCAAGGCGCTTAAGCATCTTATTAGAGATG
CAGATGCTGCCACTGTCAACCAGTTGGTGGCTTTACTTTCAGGGAATAAACCAAACTCAAAAGTCCATGTGATAACGGTGTTGGGTTGCTTACTTTCAGTGGCATCTCATGAAGAGCTCGTACAAAACGGAGGTGCTGCAAATAAAGGTCTCCAATCTCTAGTTCAGATTCTTGGGTCTTCCAGAGAAGAAACTCAGGAA
AACGCTGCATCAATTCTTGCTGATGTTTTTGGTGTAAGAAAAGATATTTGTGAAAATCTTAGAAGGCTAGAAATCATCAACCCTTTTATCAAGTTATTAGATATTGGAACTGAGCGTGTTGCTATGCAGTCAGCTCGAGCACTTGGAGCACTTTTCTCCTCAACTGAAACAACCAAAGATGTGGTATATATTGCTAGTGG
TGCAGTCAAACCATTAATTGAACTTGGGAAGTCTTCAAGCATTTCTGCTGCAGAAATGGCAATCAATGCATTGGCTAATCTTCTTTCAGATGCCCAAATTGCTGAGCAGGCTTTAGCAGAGGATATCATCCCATCATTGACAAGAGTCCTGAGGGATGGCACGAAAGGGGGAAAGGGGCATGCAGCAAATGCGCTTGCTC
GATTGCTGAGTCATATGCCTGTTGATGATGTGCTCGTTGAACGTATACATCATTGTGGTACAGTTCTTGCCTTGGTAACCTTTCTGGCTTCCACTGATCTGGACAATGTAACATCGTCAGATGCTTTAGAATCCCTTGCCATATTGGCTAGAGTGAAACAAGGTGGAGGTCCTGGCATTCCAACATGGGCAGTCCTTGCT
GAATTGCCGAACAGCTTGGAACCATTGGTGAAGTGCTTGGCCATCGGACTTCCACCAGTTCAAGAAAAGGCAATTGAGGTTCTTTCGAGACTGTGTAGAGACCAGTCTGTAGTTCTTGGAGATTTAGTGGTAGAAACACCAAGATGCATTGATGCTTTGACAAACCGAGTCATATATTCTTCTAGCTTAGAAGTGAAAGT
TGGAGGAACTGCTCTTCTTATTTGTGCTGCCAAGGAACACAAGCAAATAGCACTGGATGCTCTCAATGAATCTGGGCTCTTTTCACAGCTTATTCACTCTCTTGTTCACATGATGAAGTATGCTATGGAAATGAATGATTTGATAGTTGATAGATTTGAAGAAGTTCAAGGTCGCACATTTCAGGGAGGGCATGTTCAGG
GAAGAGAAGCATTCCCAGTGCATGATCCTGCATCAGTGTTGGGAGGAACAGTTGCACTGTGGTTGCTATCAATAATTGCTTCTTATAGTAGTGAAAGTAAAGTGGCCATCATGGAAAAAGGTGCAATCGAGGTGTTAATTAAAAAACTGGCAAATTTTTCTCCTAGCGCACATCAAATAGAGATGGAGGATGGTGGAGGT
ACATGGGTCAGTGCATTGCTATTAGCTATTCTATTCCAAGACAGAGATGTTATTCGAGCTGGTGCTACAATGCGTGCCATACCATCCCTTGCCTTATTACTGAGGTCTGATGAAGTGATTGATAGGTATTTTGCTGCTCAAGCATTGGCTAGTCTTGTCTGCAATGGAAACAGGGGAACACTTCTTGCAGTTGCAAATTC
AGGAGCAGCTGGAGGTCTATTACCACTACTTGGTAGTGGGGAGTCAGACATATCAAATCTTGTCAAATTAACTGAAGAATTTTCTTTGATCTGCAATCCTGACCAGGTTGTTCTTGAACGCCTTTTTAGAGTGGATGACATAAGGGTGGGTGCAACTGCTCGGAAATCTATCCCTGCTTTAGTGGAGCTGCTTAAACCTA
TGCCAGACCGACCAGGGGCACCTCCACTTGCTTTGGGACTTCTGACTCAGATTGCAAAAGGCAATAATGCCAATAAAGTAGCCATGGCTGAGGCGGGAGCTTTGGAAGCCTTAACTAAATATCTATCTTTAGGTCCTCTGGATGTGATAGAAGAGGCTGCAGCAGATTTATTGAGAATCCTCTTTAGCAGTACTGATCTT
AGGCGCCATGAGGCTGTAATGGGGGCTGTAAACCAGCTTATAGCAGTTCTTCGAATGGGTTCAAGGGGTGCCAGATACAATGCAGCTCAGGCTCTCCAAGGCCTCTTTGAGGCTGAAAACATTAAATATAGTGATGTTGCAAGGCAAGCTATTCAACCATTAGTAGAAATGCTCAGTGTAGGGTCTGAGAAAGAGCAACA
GGCTGCAATTGGTGCACTAATCAAATTGTCATCTAAAAATCCTCCAAAGGCATTAGCTATTGCAGATGCAGAAGTAAATCCTGTAGAAAGCTTATACAAAATTTTGGCATCGTCTCTTTCCTTGGAGTTAAAGGAAGATGCAGCATTGCTTTGCTCTGTGTTATTTGCAAACTCCAGAGTACGGGCAACACCTGCAGCTT
CTGATTGTATTCAACCCCTTGTGGAACTTGTTAGTATAGATTCTTCTCCAGTTCAGGAGGCTTGTGTCCGTGCCCTTGATAATCTGTTGGATGATGAACAACAGGCAGAGCTTGTTGCAACATATGGTGCTGTGGTTCTTCTTGTTGGACTTGTTAGTGGAACGAATTATCCATTGCTCGAGGCTGTAGTCAGTGCTCTT
GTAAAGTTGGGAAAGGATCGTCCCCTTTGCAAGCTTGACATGGTCAAAGCTGGGGTGATTGACAGTGTTCTTGAAATTCTTCATGTTGCACCAGATTCTTTGTGTGCTTTAATTGCAGAATTACTACGCATCTTAACAAACAATAGTAGCATTGCAAAAAGTGCATCTGCTGCTGCAGTGGTAGAGCCTCTTTTTCTATG
TTTGACCCATCCAGAATTAAGTACATGGGGACAGCATAGTGCATTGCAAGCACTTATTAATATCTTGGAGAAACCTCAAGCTCTTGATAACCTGCAACTCACCCCTAGCCAGGCTATTGAGCCACTGATTATATTTCTTGAATCACCATCCCATTTAGTACAGCAACTTGGGGCTGAATTACTCTCACATCTTCTTTTTC
AAGAGTATTTTCAGCGAGATATTACAACACAGCAGGCTGTCATTCCACTTGTACACCTTGCAGGAGTTGGGATTCCAAACTTACAGCAGAAAGCAATAAAAGCACTTGAAAGTGCTTCTGTCAGCTGGCCAAATGCAGTCGCAGATGCTGGTGGCATTATCGAGCTCTCTAAGGTCATTTTACAAGTTGATCCACAGCCA
TCACATGCTTTATGGGAATCAGCTGCCTTGGTGCTTTCAAATGTTTTGTGCTATAGTTCTCAGTACTATTTAAAAGTGCCTCTTGCAGTTCTTGTGAAGCTGTTACGATCAGGCAGTGAGCAGACAGTTGTAGTATCTCTTAATGCACTGATTGTTTTAGAGAAAGACGATGCATCAAGTGCTGAACTAATGGCAGAGGC
TGGTGCCGTGGAAGTGCTTTTGGATCTTTTAAGGTCTCACCAATGTGAAGAAGCAGCAGCCCGGCTACTTGAAGCTCTATTTAATAATATCAAAGTACGAGACATGAAAGTATCAAAGTTTGCTATTTCTCCTTTGTCACAGTATCTTCTTGATCCACAGACCCGAGTTCAGCCTGCCAGATTATTGGCTACTCTTGCAC
TTGGTGATCTTTTCCAGCATGATGGGCTTGCAAGAACAACTGATGCAGTGTCAGCTTGCCGTGCATTGGTTAGCTTGCTTGAGGATCAGCCAACTGAAGAAATGACAATGGTGGCCGTATGTTCATTGCAGAACCTAGTCATGCACAGTAGAACAAACAGGCGAGCTGTTGCAGAAGCAGGTGGTGTACTAGTTGTGCAA
GAACTTCTTAGTTCAAACAATTCAGAGATGATTACACAAGCAGCATTGCTCATCAAATTTCTATTCTCCAATCATACTCTTCAAGAATATGTATCCACTGAGCTTGTAAGGTGTTTGACAGCTGCTCTGGACAAGGAATTATGGGCTACTGCTACTATCAACGAGGAGGTTGTGAAAGCTATCAACATACTTTTCAGTAA
CTTTTCAAAGCTTCGGGGCACTGAAGCAGCTACTCTTTGTATCCCACACCTAGTTGGTGCACTAAAGGCTGGAACAGAACCAGCACAGGAGGCAGCTCTTGATGCATTATGCTTGTTAAAGAATTCGTGGCCATCTATTCCTGCTGAATCCGGCAAAGAACAAGCCATGGTTGCAGCAGAAGCTATTCCTGTATTACAGC
TACTAATACGTACTGGTCCACCTCATTTCCAGGAGAACGCTGACAGTTTGTTACAATGTTTACCTGGAAGCTTGACAGTAACAATAAAACGCGGCAATAACCTGAAGCAGTCTATGGGAAGCACCAATGCATTCTGTAAATTGACACTTGGTAATGGTCCTCCAAGGCTAACGAAAGTGGTAAGTCGAAGCACATCTCCA
GAATGGAAACAGGGATTTGCATGGGCCTTTGACATGCCTCCTAAGGGTCAGAAACTGCACATATCTTGCAAGAGCAAGAATACCTTTGGAAAGGGTTCTTTGGGGAAAGTAACCATTCAGATTGACAAAGTGGTAATGCTTGGAATAATCAGTGGCCAGTATACTCTTGTTCCTGATGCTAACCGAGATGGTACTTCTCG
AACACTTGAAATAGAATTTCAGTGGTCTAACAGGTGATCGTAATAGCATGCCATAGCAGGGATGGTGACACATCCAGTTTTTAGGAATGACTGGCAGCGCTTTGTGTTCTTGGACATTGTTGGTATTGAACGAGTTCAGTTTTGTCCAGCAAGTAGCAATGCTGCTTCTGAGATGATAATATTTTAAAGTTGCAACATCA
TCCCATATTATTAATAGTCTTGCATGAGGATGCCACGAGTGATAATTTCAAGGGAGTTCTTTCTGTACAAAGTCCTTGGAATGATCTGTGCTCTGCAAAGCAAGCCATTTTTAGTCTCAAATCTCAGGAAGGAAGTTGCTATTTCATTTTTAAACAGGCATACTTTTAGATCTCTTTTTCCACATTTATGTGGTTGTCCA
GGCTATTTAACAGCTTATGGTGATTTCTTACAAAGAAACTTTGTTAAAGATCAACACCAGTAAGGAGGGATAGGCCTAATTCTATTTCAGGATTCAAAGAACGGGATTTCAATTGAGAAGAACAGCTATATCTTAAAAGGTTTGCCATAGTTTAACGCCATTGGCTGTGCAGACTATAGCACTAACTCTTGGGCAGGAAC
GTAAAGGTTGGAGCATGCAATTTTGAGATTTGCATGATTTGATGCTGGTTAACAATATCATGCGGAGGCAGAATATTTGGCATGCTATACCATAGGTGACAATAATCTGTGGCGATATCTATGTTGATGCCTATCTTCATACATATGAGTTATTGGAGCGACCATAACAGCATAATCAACTGAACTTGAAAGTCTAAAAT
TCAAAATTTTAGACTATTCTCTATCTAAAAGCCTATTTCAGGTCACATGATAAATCTGTGCACAATTACCCTTCAGCTTTGAAACTGAGGAAAAGAGCAGAACTAACAGTATGCATCTGTAAGGCATTCAGGGTACATTACTACATTCTGAATTATAGGCATACTCTGAATGCAAGAAATACCGCAGAGTCAATGGGTGT
ATATCCTTCTCCAGTTTGAGATCTCAAAGGAGTACACAAGAAATTTCAAATCCTTGTCAAGAAAAGGATGGCTCAGTGGCTATTTTGGTTTTGGCTTTTAAGAATGAATATTGATCTGTTGTGATTCTTTATACAATGAATAGGAAAGGAAATGTATTATTATGAACTGGCGAACAATGTCTCATCTCCCG


>TRINITY_DN110665_c2_g1_i5 from sample A5 / Example unspliced isoform:
CTGACGAATTCGAAGgtacgtttaatcgtctctaaatttgtgaggaggtccgctgttgttgctgttaatgttagatttcatatcagaagctctgtctgcaagtactttcatctatcggcaatagaggttaggcgagatatttgtttcttgcagctggtcatggcgagttgactctttttgtactatttgatacagaggag
tttgtgttgctcaagcataacag
ATATTGTCTGGGGAGCAAGAAAAATTGCGTTCATCAATGCGGACTTCAAAATCTCCAAAGAGCAATTCACAAACACCACCGCGGTCATTGCCAGTTGCTAGGTCAAGGGACTTGAATGGAGCAGCAGGAATGGAAGATCCAGATGGGATATGGGCAAGTATTGCAGAATTTATTGAA
CAACTCCAGGCAAATATATGTACATCAGCTGAAAAGGAGCTGGTAACAAAACATCTTTTGGATCTTGCGAAGTCTAGAAAGGATGCCAGGGCTGCAATTGGTTCTCATTCGCAAGCAATACCTTTGCTTGTTGCACTTCTCAGATCTGGAACTAACACTACAAAGGTCAATGCAGCTTTAACCTTAGGGTTTCTATGTAA
GGAAGAGGATTTAAGAGTGAAAGTATTGCTAGGAGGGTGCATACCTTCCTTGCTTGCACTGCTAAGGTCTGGGGTTGCAGAAGCTCAGAAAGCAGCAGCAAAGGCAATATGTGCAGTATCACATGGTGGTGTGTCAGATCACGTTGGAATGAAGATATTTGTGACAGAGGGTGTTGTGCCCAGTCTCTGGGATCAGCTTC
ATCCAAAGCGCAAGCATGAAAAATTAGTTGATGATCTTCTTACTGGTGCATTAAAAAATTTGTGTACGAATACTGAAGGTTTCTGGCAAACAACCCTTGAAGCTGGTGGAGTAGATATCCTCGTAAGACTTATTTCTTCTGGGAGTACAGTTGCTCAATCGAATGCATCCTCCCTCTTGGCTAGTCTGATGTTAGCTTCA
GAGGCTAGTTGTACTAAGGTTCTGAATGCTGGTGCTGTTCAACACCTACTGAAGCTTTTAGGTCCTGAAAATGAAGTCTGTGTCCGTGCTGAAGCAGCTGGTGCATTACAGGCTCTCTCTTCTAAACTGATTAGTGCGAAGAAAGCTATAGTGGACGAAGGTGGCATTCCCATTTTAATCAGTTCAGTCGTAGCACCTTC
AAAAGAGTTTATGCAAGGGCTACCTGCTCAAGCCCTTCAGGAACATGCAATGGGTGCTTTAGTGAACATTTCAGGTGGAATGTCTGCTATTGTGCTCAGCCTTGGAGAAAGCATTGAGTCATTTCGGTCTGACATTCAAGTGGCTGACATTATTGGTGCCCTGGCCTATGCATTAATGGTGTTTAATGAAAACTCATATA
ATGCAGGCTCACTTGATGCAGTTAAAATAGAAGGACTATTAGTCAGACAACTCAAACCTCATAACTCTCAGCTGGTGCAAGAACGTGCAATTGAAGCTTTGGCTAGTCTCTATGGCAATGCTTACCTTTCTATAGGGTTGTTACACGCTGAAGC




Intron 2 GTACGTTTAA ... ATAACAGCAG

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>TRINITY_DN109770_c0_g3_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
ATACAATACATTTGATTTTTCTCTCTACCGACCGATGAGAGGTAGCACAGCTCTGCTAACCCTCAATTGCTTTTGGGAGGACCGGAGACATGCATATCCGTTTGTTTGTTAGCAACCAACGAGGTCAACAGTTAGATCCCGCTTCGCTTCGCCTTGAATTCATATTAGACGAGAGCAGGATGATTTCACAGTCTCCAGCA
TGGGTAGCGACGCATCCCTGACGAATTCGAAGATATTGTCTGGGGAGCAAGAAAAATTGCGTTCATCAATGCGGACTTCAAAATCTCCAAAGAGCAATTCACAAACACCACCGCGGTCATTGCCAGTTGCTAGGTCAAGGGACTTGAATGGAGCAGCAGGAATGGAAGATCCAGATGGGATATGGGCAAGTATTGCAGAA
TTTATTGAACAACTCCAGGCAAATATATGTACATCAGCTGAAAAGGAGCTGGTAACAAAACATCTTTTGGATCTTGCGAAGTCTAGAAAGGATGCCAGGGCTGCAATTGGTTCTCATTCGCAAGCAATACCTTTGCTTGTTGCACTTCTCAGATCTGGAACTAACACTACAAAGGTCAATGCAGCTTTAACCTTAGGGTT
TCTATGTAAGGAAGAGGATTTAAGAGTGAAAGTATTGCTAGGAGGGTGCATACCTTCCTTGCTTGCACTGCTAAGGTCTGGGGTTGCAGAAGCTCAGAAAGCAGCAGCAAAGGCAATATGTGCAGTATCACATGGTGGTGTGTCAGATCACGTTGGAATGAAGATATTTGTGACAGAGGGTGTTGTGCCCAGTCTCTGGG
ATCAGCTTCATCCAAAGCGCAAGCATGAAAAATTAGTTGATGATCTTCTTACTGGTGCATTAAAAAATTTGTGTACGAATACTGAAGGTTTCTGGCAAACAACCCTTGAAGCTGGTGGAGTAGATATCCTCGTAAGACTTATTTCTTCTGGGAGTACAGTTGCTCAATCGAATGCATCCTCCCTCTTGGCTAGTCTGATG
TTAGCTTCAGAGGCTAGTTGTACTAAGGTTCTGAATGCTGGTGCTGTTCAACACCTACTGAAGCTTTTAGGTCCTGAAAATGAAGTCTGTGTCCGTGCTGAAGCAGCTGGTGCATTACAGGCTCTCTCTTCTAAACTGATTAGTGCGAAGAAAGCTATAGTGGACGAAGGTGGCATTCCCATTTTAATCAGTTCAGTCGT
AGCACCTTCAAAAGAGTTTATGCAAGGGCTACCTGCTCAAGCCCTTCAGGAACATGCAATGGGTGCTTTAGTGAACATTTCAGGTGGAATGTCTGCTATTGTGCTCAGCCTTGGAGAAAGCATTGAGTCATTTCGGTCTGACATTCAAGTGGCTGACATTATTGGTGCCCTGGCCTATGCATTAATGGTGTTTAATGAAA
ACTCATATAATGCAGGCTCACTTGATGCAGTTAAAATAGAAGGACTATTAGTCAGACAACTCAAACCTCATAACTCTCAGCTGGTGCAAGAACGTGCAATTGAAGCTTTGGCTAGTCTCTATGGCAATGCTTACCTTTCTATAGGGTTGTTACACGCTGAGGCAAAAAAAATGCTGGTTGGACTGGTGACTATGGCTAGT
TGTGAGATACAAAAAGAACTCATGCACTTATTAAGAAGCCTGTGTTCTGTCAATTCAGATCTCTGGCAGTCATTTAGGGGGCGAGAGGGAATTCAGCTTTTAATTTCATTTCTTGGTTTATCTACTGAGCAACAACAGGAGCATGCTGTTGCTTTGCTTTCTATTTTGTCTGTAGAAGTTGATGACAGTAAATGGGCAAT
TACAGCAGCAGGTGGGATACCTCCACTTGTCCAGCTGCTGGAAACTGGATCCTGGAAAGCAAAAGAGGATGCTGCACTTTTGCTAGGAAATTTATGTTCTCATAGTGAAGAAATTCGTGCTTGTGTTGAAAGTGCAGATGCTGTTCCAGCCCTCCTGTGGCTCTTGAGAAATGCTGATCCAAAAGGACAAGAAGTTGCTG
CCAAGGCGCTTAAGCATCTTATTAGAGATGCAGATGCTGCCACTGTCAACCAGTTGGTGGCTTTACTTTCAGGGAATAAACCAAACTCAAAAGTCCATGTGATAACGGTGTTGGGTTGCTTACTTTCAGTGGCATCTCATGAAGAGCTCGTACAAAACGGAGGTGCTGCAAATAAAGGTCTCCAATCTCTAGTTCAGATT
CTTGGGTCTTCCAGAGAAGAAACTCAGGAAAACGCTGCATCAATTCTTGCTGATGTTTTTGGTGTAAGAAAAGATATTTGTGAAAATCTTAGAAGGCTAGAAATCATCAACCCTTTTATCAAGTTATTAGATATTGGAACTGAGCGTGTTGCTATGCAGTCAGCTCGAGCACTTGGAGCACTTTTCTCCTCAACTGAAAC
AACCAAAGATGTGGTATATATTGCTAGTGGTGCAGTCAAACCATTAATTGAACTTGGGAAGTCTTCAAGCATTTCTGCTGCAGAAATGGCAATCAATGCATTGGCTAATCTTCTTTCAGATGCCCAAATTGCTGAGCAGGCTTTAGCAGAGGATATCATCCCATCATTGACAAGAGTCCTGAGGGATGGCACGAAAGGGG
GAAAGGGGCATGCAGCAAATGCGCTTGCTCGATTGCTGAGTCATATGCCCGTTGATGATGTGCTCGTTGAACGTATACATCATTGTGGTACAGTTCTTGCCTTGGTAACCTTTCTGGCTTCCACTGATCTGGACAATGTAACATCGTCAGATGCTTTAGAATCCCTTGCCATATTGGCTAGAGTGAAACAAGGTGGAGGT
CCTGGCATTCCAACATGGGCAGTCCTTGCTGAATTGCCGAACAGCTTGGAACCATTGGTGAAGTGCTTGGCCATCGGACTTCCACCAGTTCAAGAAAAGGCAATTGAGGTTCTTTCGAGACTGTGTAGAGACCAGTCTGTAGTTCTTGGAGATTTAGTGGTAGAAACACCAAGATGCATTGATGCTTTGACAAACCGAGT
CATATATTCTTCTAGCTTAGAAGTGAAAGTTGGAGGAACTGCTCTTCTTATTTGTGCTGCCAAGGAACACAAGCAAATAGCACTGGATGCTCTCAATGAATCTGGGCTCTTTTCACAGCTTATTCACTCTCTTGTTCACATGATGAAGTATGCTATGGAAATGAATGATTTGATAGTTGATAGATTTGAAGAAGTTCAAG
GTCGCACATTTCAGGGAGGGCATGTTCAGGGAAGAGAAGCATTCCCAGTGCATGATCCTGCATCAGTGTTGGGAGGAACAGTTGCACTGTGGTTGCTATCAATAATTGCTTCTTATAGTAGTGAAAGTAAAGTGGCCATCATGGAAAAAGGTGCAATCGAGGTGTTAATTAAAAAACTGGCAAATTTTTCTCCTAGCGCA
CATCAAATAGAGATGGAGGATGGTGGAGGTACATGGGTCAGTGCATTGCTATTAGCTATTCTATTCCAAGACAGAGATGTTATTCGAGCTGGTGCTACAATGCGTGCCATACCATCCCTTGCCTTATTACTGAGGTCTGATGAAGTGATTGATAGGTATTTTGCTGCTCAAGCATTGGCTAGTCTTGTCTGCAATGGAAA
CAGGGGAACACTTCTTGCAGTTGCAAATTCAGGAGCAGCTGGAGGTCTATTACCACTACTTGGTAGTGGGGAGTCAGACATATCAAATCTTGTCAAATTAACTGAAGAATTTTCTTTGATCTGCAATCCTGACCAGGTTGTTCTTGAACGCCTTTTTAGAGTGGATGACATAAGGGTGGGTGCAACTGCTCGGAAATCTA
TCCCTGCTTTAGTGGAGCTGCTTAAACCTATGCCAGACCGACCAGGGGCACCTCCACTTGCTTTGGGACTTCTGACTCAGATTGCAAAAGGCAATAATGCCAATAAAGTAGCCATGGCTGAGGCGGGAGCTTTGGAAGCCTTAACTAAATATCTATCTTTAGGTCCTCTGGATGTGATAGAAGAGGCTGCAGCAGATTTA
TTGAGAATCCTCTTTAGCAGTACTGATCTTAGGCGCCATGAGGCTGTAATGGGGGCTGTAAACCAGCTTATAGCAGTTCTTCGAATGGGTTCAAGGGGTGCCAGATACAATGCAGCTCAGGCTCTCCAAGGCCTCTTTGAGGCTGAAAACATTAAATATAGTGATGTTGCAAGGCAAGCTATTCAACCATTAGTAGAAAT
GCTCAGTGTAGGGTCTGAGAAAGAGCAACAGGCTGCAATTGGTGCACTAATCAAATTGTCATCTAAAAATCCTCCAAAGGCATTAGCTATTGCAGATGCAGAAGTAAATCCTGTAGAAAGCTTATACAAAATTTTGGCATCGTCTCTTTCCTTGGAGTTAAAGGAAGATGCAGCATTGCTTTGCTCTGTGTTATTTGCAA
ACTCCAGAGTACGGGCAACACCTGCAGCTTCTGATTGTATTCAACCCCTTGTGGAACTTGTTAGTATAGATTCTTCTCCAGTTCAGGAGGCTTGTGTCCGTGCCCTTGATAATCTGTTGGATGATGAACAACAGGCAGAGCTTGTTGCAACATATGGTGCTGTGGTTCTTCTTGTTGGACTTGTTAGTGGAACAAATTAT
CCATTGCTCGAGGCTGTAGTCAGTGCTCTTGTAAAGTTGGGAAAGGATCGTCCCCTTTGCAAGCTTGACATGGTCAAAGCTGGGGTGATTGACAGTGTTCTTGAAATTCTTCATGTTGCACCAGATTCTTTGTGTGCTTTAATTGCAGAATTACTACGCATCTTAACAAACAATAGTAGCATTGCAAAAAGTGCATCTGC
TGCTGCAGTGGTAGAGCCTCTTTTTCTATGTTTGACCCATCCAGAATTAAGTACATGGGGACAGCATAGTGCATTGCAAGCACTTATTAATATCTTGGAGAAACCTCAAGCTCTTGATAACCTGCAACTCACCCCTAGCCAGGCTATTGAGCCACTGATTATATTTCTTGAATCACCATCCCATTTAGTACAGCAACTTG
GGGCTGAATTACTCTCACATCTTCTTTTTCAAGAGTATTTTCAGCGAGATATTACAACACAGCAGGCTGTCATTCCACTTGTACACCTTGCAGGAGTTGGGATTCCAAACTTACAGCAGAAAGCAATAAAAGCACTTGAAAGTGCTTCTGTCAGCTGGCCAAATGCAGTCGCAGATGCTGGTGGCATTATCGAGCTCTCT
AAGGTCATTTTACAAGTTGATCCACAGCCATCACATGCTTTATGGGAATCAGCTGCCTTGGTGCTTTCAAATGTTTTGTGCTATAGTTCTCAGTACTATTTAAAAGTGCCTCTTGCAGTTCTTGTGAAGCTGTTACGATCAGGCAGTGAGCAGACAGTTGTAGTATCTCTTAATGCACTGATTGTTTTAGAGAAAGACGA
TGCATCAAGTGCTGAACTAATGGCAGAGGCTGGTGCCGTGGAAGTGCTTTTGGATCTTTTAAGGTCTCACCAATGTGAAGAAGCAGCAGCCCGGCTACTTGAAGCTCTATTTAATAATATCAAAGTACGAGACATGAAAGTATCAAAGTTTGCTATTTCTCCTTTGTCACAGTATCTTCTTGATCCACAGACCCGAGTTC
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GCAGAAGCAGGTGGTGTACTAGTTGTGCAAGAACTTCTTAGTTCAAACAATTCAGAGATGATTACACAAGCAGCATTGCTCATCAAATTTCTATTCTCCAATCATACTCTTCAAGAATATGTATCCACTGAGCTTGTAAGGTGTTTGACAGCTGCTCTGGACAAGGAATTATGGGCTACTGCTACTATCAACGAGGAGGT
TGTGAAAGCTATCAACATACTTTTCAGTAACTTTTCAAAGCTTCGGGGCACTGAAGCAGCTACTCTTTGTATCCCACACCTAGTTGGTGCACTAAAGGCTGGAACAGAACCAGCACAGGAGGCAGCTCTTGATGCATTATGCTTGTTAAAGAATTCATGGCCATCTATTCCTGCTGAATCCGGCAAAGAACAAGCCATGG
TTGCAGCAGAAGCTATTCCTGTATTACAGCTACTAATACGTACTGGTCCACCTCATTTCCAGGAGAACGCTGACAGTTTGTTACAATGTTTACCTGGAAGCTTGACAGTAACAATAAAACGCGGCAATAACCTGAAGCAGTCTATGGGAAGCACCAATGCATTCTGTAAATTGACACTTGGTAATGGTCCTCCAAGGCTA
ACGAAAGTGGTAAGTCGAAGCACATCTCCAGAATGGAAACAGGGATTTGCATGGGCCTTTGACATGCCTCCTAAGGGTCAGAAACTGCACATATCTTGCAAGAGCAAGAATACCTTTGGAAAGGGTTCTTTGGGGAAAGTAACCATTCAGATTGACAAAGTGGTAATGCTTGGAATAATCAGTGGCCAGTATACTCTTGT
TCCTGATGCTAACCGAGATGGTACTTCTCGAACACTTGAAATAGAATTTCAGTGGTCTAACAGGTGATCGTAATAGCATGCCATAGCAGGGATGGTGACACATCCAGTTTTTAGGAATGACTGGCAGCGCTTTGTGTTCTTGGACATTGTTGGTATTGAACGAGTTCAGTTTTGTCCAGCAAGTAGCAATGCTGCTTCTG
AGATGATAATATTTTAAAGTTGCAACATCATCCCATATTATTAATAGTCTTGCATGAGGATGCCACGAGTGATAATTTCAAGGGAGTTCTTTCTGTACAAAGTCCTTGGAATGATCTGTGCTCTGCAAAGCAAGCCATTTTTAGTCTCAAATCTCAGGAAGGAAGTTGCTATTTCATTTTTAAACAGGCATACTTTTAGA
TCTCTTTTTCCACATTTATGTGGTTGTCCAGGCTATTTAACAGCTTATGGTGATTTCTTACAAAGAAACTTTGTTAAAGATCAACACCAGTAAGGAGGGATAGGCCTAATTCTATTTCAGGATTCAAAGAACGGGATTTCAATTGAGAAGAACAGCTATATCTTAAAAGGTTTGCCATAGTTTAACGCCATTGGCTGTGC
AGACTATAGCACTAACTCTTGGGCAGGAACGTAAAGGTTGGAGCATGCAATTTTGAGATTTGCATGATTTGATGCTGGTTAACAATATCATGCGGAGGCAGAATATTTGGCATGCTATACCATAGGTGACAATAATCTGTGGCGATATCTATGTTGATGCCTATCTTCATACATATGAGTCATTGGAGCGACCATAACAG
CATAATCAACTGAACTTGAAAGTCTAAAATTCAAAATTTTAGACTATTCTCTATCTAAAAGCCTATTTCAGGTCACATGATAAATCTGTGCACAATTACCCTTCAGCTTTGAAACTGAGGAAAAGAGCAGAACTAACAGTATGCATCTGTAAGGCATTCAGGGTACATTACTACATTCTGAATTATAGGCATACTCTGAA
TGCAAGAAATACCGCAGAGTCAATGGGTGTATATCCTTCTCCAGTTTGAGATCTCAAAGGAGTACACAAGAAATTTCAAATCCTTGTCAAGAAAAGGATGGCTCAGTGGCTATTTTGGTTTTGGCTTTTAAGAATGAATATTGATCTGTTGTGATTCTTTATACAATGAATAGGAAAGGAAATGTATTATTATGAACTGG
TGAACAATGTCTCATCTCCCTTATTTTACTGATGTTGTAGATGTGCTATATTGGATTTCTTGATGGAACGAGTATACTATGT


>TRINITY_DN109770_c0_g3_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
ATACAATACATTTGATTTTTCTCTCTACCGACCGATGAGAGGTAGCACAGCTCTGCTAACCCTCAATTGCTTTTGGGAGGACCGGAGACATGCATATCCGTTTGTTTGTTAGCAACCAACGAGGTCAACAGTTAGATCCCGCTTCGCTTCGCCTTGAATTCATATTAGACGAGAGCAGGATGATTTCACAGTCTCCAGCA
TGGGTAGCGACGCATCCCTGACGAATTCGAAGgtacgtttaatcgtctctaaatttgtgaggaggtccgctgttgttgctgttaatgttagatttcatatcagaagctctgtctgcaagtactttcatctatcggcaatagaggttaggcgagatatttgtttcttgcagctggtcatggcgagttgactctttttgtac
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ATATTGTCTGGGGAGCAAGAAAAATTGCGTTCATCAATGCGGACTTCAAAATCTCCAAAGAGCAATTCACAAACACCACCGCGGTCATTGCCAGTTGCTAGGTCAAGGGACTTGAATGGAGCAGCAGGAATGGAAGATCCAGATGGGATATGGGCAA
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ACCTTAGGGTTTCTATGTAAGGAAGAGGATTTAAGAGTGAAAGTATTGCTAGGAGGGTGCATACCTTCCTTGCTTGCACTGCTAAGGTCTGGGGTTGCAGAAGCTCAGAAAGCAGCAGCAAAGGCAATATGTGCAGTATCACATGGTGGTGTGTCAGATCACGTTGGAATGAAGATATTTGTGACAGAGGGTGTTGTGCC
CAGTCTCTGGGATCAGCTTCATCCAAAGCGCAAGCATGAAAAATTAGTTGATGATCTTCTTACTGGTGCATTAAAAAATTTGTGTACGAATACTGAAGGTTTCTGGCAAACAACCCTTGAAGCTGGTGGAGTAGATATCCTCGTAAGACTTATTTCTTCTGGGAGTACAGTTGCTCAATCGAATGCATCCTCCCTCTTGG
CTAGTCTGATGTTAGCTTCAGAGGCTAGTTGTACTAAGGTTCTGAATGCTGGTGCTGTTCAACACCTACTGAAGCTTTTAGGTCCTGAAAATGAAGTCTGTGTCCGTGCTGAAGCAGCTGGTGCATTACAGGCTCTCTCTTCTAAACTGATTAGTGCGAAGAAAGCTATAGTGGACGAAGGTGGCATTCCCATTTTAATC
AGTTCAGTCGTAGCACCTTCAAAAGAGTTTATGCAAGGGCTACCTGCTCAAGCCCTTCAGGAACATGCAATGGGTGCTTTAGTGAACATTTCAGGTGGAATGTCTGCTATTGTGCTCAGCCTTGGAGAAAGCATTGAGTCATTTCGGTCTGACATTCAAGTGGCTGACATTATTGGTGCCCTGGCCTATGCATTAATGGT
GTTTAATGAAAACTCATATAATGCAGGCTCACTTGATGCAGTTAAAATAGAAGGACTATTAGTCAGACAACTCAAACCTCATAACTCTCAGCTGGTGCAAGAACGTGCAATTGAAGCTTTGGCTAGTCTCTATGGCAATGCTTACCTTTCTATAGGGTTGTTACACGCTGAGGCAAAAAAAATGCTGGTTGGACTGGTGA
CTATGGCTAGTTGTGAGATACAAAAAGAACTCATGCACTTATTAAGAAGCCTGTGTTCTGTCAATTCAGATCTCTGGCAGTCATTTAGGGGGCGAGAGGGAATTCAGCTTTTAATTTCATTTCTTGGTTTATCTACTGAGCAACAACAGGAGCATGCTGTTGCTTTGCTTTCTATTTTGTCTGTAGAAGTTGATGACAGT
AAATGGGCAATTACAGCAGCAGGTGGGATACCTCCACTTGTCCAGCTGCTGGAAACTGGATCCTGGAAAGCAAAAGAGGATGCTGCACTTTTGCTAGGAAATTTATGTTCTCATAGTGAAGAAATTCGTGCTTGTGTTGAAAGTGCAGATGCTGTTCCAGCCCTCCTGTGGCTCTTGAGAAATGCTGATCCAAAAGGACA
AGAAGTTGCTGCCAAGGCGCTTAAGCATCTTATTAGAGATGCAGATGCTGCCACTGTCAACCAGTTGGTGGCTTTACTTTCAGGGAATAAACCAAACTCAAAAGTCCATGTGATAACGGTGTTGGGTTGCTTACTTTCAGTGGCATCTCATGAAGAGCTCGTACAAAACGGAGGTGCTGCAAATAAAGGTCTCCAATCTC
TAGTTCAGATTCTTGGGTCTTCCAGAGAAGAAACTCAGGAAAACGCTGCATCAATTCTTGCTGATGTTTTTGGTGTAAGAAAAGATATTTGTGAAAATCTTAGAAGGCTAGAAATCATCAACCCTTTTATCAAGTTATTAGATATTGGAACTGAGCGTGTTGCTATGCAGTCAGCTCGAGCACTTGGAGCACTTTTCTCC
TCAACTGAAACAACCAAAGATGTGGTATATATTGCTAGTGGTGCAGTCAAACCATTAATTGAACTTGGGAAGTCTTCAAGCATTTCTGCTGCAGAAATGGCAATCAATGCATTGGCTAATCTTCTTTCAGATGCCCAAATTGCTGAGCAGGCTTTAGCAGAGGATATCATCCCATCATTGACAAGAGTCCTGAGGGATGG
CACGAAAGGGGGAAAGGGGCATGCAGCAAATGCGCTTGCTCGATTGCTGAGTCATATGCCCGTTGATGATGTGCTCGTTGAACGTATACATCATTGTGGTACAGTTCTTGCCTTGGTAACCTTTCTGGCTTCCACTGATCTGGACAATGTAACATCGTCAGATGCTTTAGAATCCCTTGCCATATTGGCTAGAGTGAAAC
AAGGTGGAGGTCCTGGCATTCCAACATGGGCAGTCCTTGCTGAATTGCCGAACAGCTTGGAACCATTGGTGAAGTGCTTGGCCATCGGACTTCCACCAGTTCAAGAAAAGGCAATTGAGGTTCTTTCGAGACTGTGTAGAGACCAGTCTGTAGTTCTTGGAGATTTAGTGGTAGAAACACCAAGATGCATTGATGCTTTG
ACAAACCGAGTCATATATTCTTCTAGCTTAGAAGTGAAAGTTGGAGGAACTGCTCTTCTTATTTGTGCTGCCAAGGAACACAAGCAAATAGCACTGGATGCTCTCAATGAATCTGGGCTCTTTTCACAGCTTATTCACTCTCTTGTTCACATGATGAAGTATGCTATGGAAATGAATGATTTGATAGTTGATAGATTTGA
AGAAGTTCAAGGTCGCACATTTCAGGGAGGGCATGTTCAGGGAAGAGAAGCATTCCCAGTGCATGATCCTGCATCAGTGTTGGGAGGAACAGTTGCACTGTGGTTGCTATCAATAATTGCTTCTTATAGTAGTGAAAGTAAAGTGGCCATCATGGAAAAAGGTGCAATCGAGGTGTTAATTAAAAAACTGGCAAATTTTT
CTCCTAGCGCACATCAAATAGAGATGGAGGATGGTGGAGGTACATGGGTCAGTGCATTGCTATTAGCTATTCTATTCCAAGACAGAGATGTTATTCGAGCTGGTGCTACAATGCGTGCCATACCATCCCTTGCCTTATTACTGAGGTCTGATGAAGTGATTGATAGGTATTTTGCTGCTCAAGCATTGGCTAGTCTTGTC
TGCAATGGAAACAGGGGAACACTTCTTGCAGTTGCAAATTCAGGAGCAGCTGGAGGTCTATTACCACTACTTGGTAGTGGGGAGTCAGACATATCAAATCTTGTCAAATTAACTGAAGAATTTTCTTTGATCTGCAATCCTGACCAGGTTGTTCTTGAACGCCTTTTTAGAGTGGATGACATAAGGGTGGGTGCAACTGC
TCGGAAATCTATCCCTGCTTTAGTGGAGCTGCTTAAACCTATGCCAGACCGACCAGGGGCACCTCCACTTGCTTTGGGACTTCTGACTCAGATTGCAAAAGGCAATAATGCCAATAAAGTAGCCATGGCTGAGGCGGGAGCTTTGGAAGCCTTAACTAAATATCTATCTTTAGGTCCTCTGGATGTGATAGAAGAGGCTG
CAGCAGATTTATTGAGAATCCTCTTTAGCAGTACTGATCTTAGGCGCCATGAGGCTGTAATGGGGGCTGTAAACCAGCTTATAGCAGTTCTTCGAATGGGTTCAAGGGGTGCCAGATACAATGCAGCTCAGGCTCTCCAAGGCCTCTTTGAGGCTGAAAACATTAAATATAGTGATGTTGCAAGGCAAGCTATTCAACCA
TTAGTAGAAATGCTCAGTGTAGGGTCTGAGAAAGAGCAACAGGCTGCAATTGGTGCACTAATCAAATTGTCATCTAAAAATCCTCCAAAGGCATTAGCTATTGCAGATGCAGAAGTAAATCCTGTAGAAAGCTTATACAAAATTTTGGCATCGTCTCTTTCCTTGGAGTTAAAGGAAGATGCAGCATTGCTTTGCTCTGT
GTTATTTGCAAACTCCAGAGTACGGGCAACACCTGCAGCTTCTGATTGTATTCAACCCCTTGTGGAACTTGTTAGTATAGATTCTTCTCCAGTTCAGGAGGCTTGTGTCCGTGCCCTTGATAATCTGTTGGATGATGAACAACAGGCAGAGCTTGTTGCAACATATGGTGCTGTGGTTCTTCTTGTTGGACTTGTTAGTG
GAACAAATTATCCATTGCTCGAGGCTGTAGTCAGTGCTCTTGTAAAGTTGGGAAAGGATCGTCCCCTTTGCAAGCTTGACATGGTCAAAGCTGGGGTGATTGACAGTGTTCTTGAAATTCTTCATGTTGCACCAGATTCTTTGTGTGCTTTAATTGCAGAATTACTACGCATCTTAACAAACAATAGTAGCATTGCAAAA
AGTGCATCTGCTGCTGCAGTGGTAGAGCCTCTTTTTCTATGTTTGACCCATCCAGAATTAAGTACATGGGGACAGCATAGTGCATTGCAAGCACTTATTAATATCTTGGAGAAACCTCAAGCTCTTGATAACCTGCAACTCACCCCTAGCCAGGCTATTGAGCCACTGATTATATTTCTTGAATCACCATCCCATTTAGT
ACAGCAACTTGGGGCTGAATTACTCTCACATCTTCTTTTTCAAGAGTATTTTCAGCGAGATATTACAACACAGCAGGCTGTCATTCCACTTGTACACCTTGCAGGAGTTGGGATTCCAAACTTACAGCAGAAAGCAATAAAAGCACTTGAAAGTGCTTCTGTCAGCTGGCCAAATGCAGTCGCAGATGCTGGTGGCATTA
TCGAGCTCTCTAAGGTCATTTTACAAGTTGATCCACAGCCATCACATGCTTTATGGGAATCAGCTGCCTTGGTGCTTTCAAATGTTTTGTGCTATAGTTCTCAGTACTATTTAAAAGTGCCTCTTGCAGTTCTTGTGAAGCTGTTACGATCAGGCAGTGAGCAGACAGTTGTAGTATCTCTTAATGCACTGATTGTTTTA
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GACCCGAGTTCAGCCTGCCAGATTATTGGCTACTCTTGCACTTGGTGATCTTTTCCAGCATGATGGGCTTGCAAGAACAACTGATGCAGTGTCAGCTTGCCGTGCATTGGTTAGCTTGCTTGAGGATCAGCCAACTGAAGAAATGACAATGGTGGCCGTATGTTCATTGCAGAACCTAGTCATGCACAGTCGAACAAACA
GGCGAGCTGTTGCAGAAGCAGGTGGTGTACTAGTTGTGCAAGAACTTCTTAGTTCAAACAATTCAGAGATGATTACACAAGCAGCATTGCTCATCAAATTTCTATTCTCCAATCATACTCTTCAAGAATATGTATCCACTGAGCTTGTAAGGTGTTTGACAGCTGCTCTGGACAAGGAATTATGGGCTACTGCTACTATC
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ACAAGCCATGGTTGCAGCAGAAGCTATTCCTGTATTACAGCTACTAATACGTACTGGTCCACCTCATTTCCAGGAGAACGCTGACAGTTTGTTACAATGTTTACCTGGAAGCTTGACAGTAACAATAAAACGCGGCAATAACCTGAAGCAGTCTATGGGAAGCACCAATGCATTCTGTAAATTGACACTTGGTAATGGTC
CTCCAAGGCTAACGAAAGTGGTAAGTCGAAGCACATCTCCAGAATGGAAACAGGGATTTGCATGGGCCTTTGACATGCCTCCTAAGGGTCAGAAACTGCACATATCTTGCAAGAGCAAGAATACCTTTGGAAAGGGTTCTTTGGGGAAAGTAACCATTCAGATTGACAAAGTGGTAATGCTTGGAATAATCAGTGGCCAG
TATACTCTTGTTCCTGATGCTAACCGAGATGGTACTTCTCGAACACTTGAAATAGAATTTCAGTGGTCTAACAGGTGATCGTAATAGCATGCCATAGCAGGGATGGTGACACATCCAGTTTTTAGGAATGACTGGCAGCGCTTTGTGTTCTTGGACATTGTTGGTATTGAACGAGTTCAGTTTTGTCCAGCAAGTAGCAA
TGCTGCTTCTGAGATGATAATATTTTAAAGTTGCAACATCATCCCATATTATTAATAGTCTTGCATGAGGATGCCACGAGTGATAATTTCAAGGGAGTTCTTTCTGTACAAAGTCCTTGGAATGATCTGTGCTCTGCAAAGCAAGCCATTTTTAGTCTCAAATCTCAGGAAGGAAGTTGCTATTTCATTTTTAAACAGGC
ATACTTTTAGATCTCTTTTTCCACATTTATGTGGTTGTCCAGGCTATTTAACAGCTTATGGTGATTTCTTACAAAGAAACTTTGTTAAAGATCAACACCAGTAAGGAGGGATAGGCCTAATTCTATTTCAGGATTCAAAGAACGGGATTTCAATTGAGAAGAACAGCTATATCTTAAAAGGTTTGCCATAGTTTAACGCC
ATTGGCTGTGCAGACTATAGCACTAACTCTTGGGCAGGAACGTAAAGGTTGGAGCATGCAATTTTGAGATTTGCATGATTTGATGCTGGTTAACAATATCATGCGGAGGCAGAATATTTGGCATGCTATACCATAGGTGACAATAATCTGTGGCGATATCTATGTTGATGCCTATCTTCATACATATGAGTCATTGGAGC
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>TRINITY_DN104221_c1_g2_i2 from sample A4 / Example spliced isoform
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AGTAAATGGGCAATTACAGCAGCAGGTGGGATACCTCCACTTGTCCAGCTGCTGGAAACTGGATCCTGGAAAGCAAAAGAGGATGCTGCACTTTTGCTAGGAAATTTATGTTCTCATAGTGAAGAAATTCGTGCTTGTGTTGAAAGTGCAGATGCTGTTCCAGCCCTCCTGTGGCTCTTGAGAAATGCTGATCCAAAAGG
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TTGACAAACCGAGTCATATATTCTTCTAGCTTAGAAGTGAAAGTTGGAGGAACTGCTCTTCTTATTTGTGCTGCCAAGGAACACAAGCAAATAGCACTGGATGCTCTCAATGAATCTGGGCTCTTTTCACAGCTTATTCACTCTCTTGTTCACATGATGAAGTATGCTATGGAAATGAATGATTTGATAGTTGATAGATT
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GTCTGCAATGGAAACAGGGGAACACTTCTTGCAGTTGCAAATTCAGGAGCAGCTGGAGGTCTATTACCACTACTTGGTAGTGGGGAGTCAGACATATCAAATCTTGTCAAATTAACTGAAGAATTTTCTTTGATCTGCAATCCTGACCAGGTTGTTCTTGAACGCCTTTTTAGAGTGGATGACATAAGGGTGGGTGCAAC
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CTGCAGCAGATTTATTGAGAATCCTCTTTAGCAGTACTGATCTTAGGCGCCATGAGGCTGTAATGGGGGCTGTAAACCAGCTTATAGCAGTTCTTCGAATGGGTTCAAGGGGTGCCAGATACAATGCAGCTCAGGCTCTCCAAGGCCTCTTTGAGGCTGAAAACATTAAATATAGTGATGTTGCAAGGCAAGCTATTCAA
CCATTAGTAGAAATGCTCAGTGTAGGGTCTGAGAAAGAGCAACAGGCTGCAATTGGTGCACTAATCAAATTGTCATCTAAAAATCCTCCAAAGGCATTAGCTATTGCAGATGCAGAAGTAAATCCTGTAGAAAGCTTATACAAAATTTTGGCATCGTCTCTTTCCTTGGAGTTAAAGGAAGATGCAGCATTGCTTTGCTC
TGTGTTATTTGCAAACTCCAGAGTACGGGCAACACCTGCAGCTTCTGATTGTATTCAACCCCTTGTGGAACTTGTTAGTATAGATTCTTCTCCAGTTCAGGAGGCTTGTGTCCGTGCCCTTGATAATCTGTTGGATGATGAACAACAGGCAGAGCTTGTTGCAACATATGGTGCTGTGGTTCTTCTTGTTGGACTTGTTA
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AAAAGTGCATCTGCTGCTGCAGTGGTAGAGCCTCTTTTTCTATGTTTGACCCATCCAGAATTAAGTACATGGGGACAGCATAGTGCATTGCAAGCACTTATTAATATCTTGGAGAAACCTCAAGCTCTTGATAACCTGCAACTCACCCCTAGCCAGGCTATTGAGCCACTGATTATATTTCTTGAATCACCATCCCATTT
AGTACAGCAACTTGGGGCTGAATTACTCTCACATCTTCTTTTTCAAGAGTATTTTCAGCGAGATATTACAACACAGCAGGCTGTCATTCCACTTGTACACCTTGCAGGAGTTGGGATTCCAAACTTACAGCAGAAAGCAATAAAAGCACTTGAAAGTGCTTCTGTCAGCTGGCCAAATGCAGTCGCAGATGCTGGTGGCA
TTATCGAGCTCTCTAAGGTCATTTTACAAGTTGATCCACAGCCATCACATGCTTTATGGGAATCAGCTGCCTTGGTGCTTTCAAATGTTTTGTGCTATAGTTCTCAGTACTATTTAAAAGTGCCTCTTGCAGTTCTTGTGAAGCTGTTACGATCAGGCAGTGAGCAGACAGTTGTAGTATCTCTTAATGCACTGATTGTT
TTAGAGAAAGACGATGCATCAAGTGCTGAACTAATGGCAGAGGCTGGTGCCGTGGAAGTGCTTTTGGATCTTTTAAGGTCTCACCAATGTGAAGAAGCAGCAGCCCGGCTACTTGAAGCTCTATTTAATAATATCAAAGTACGAGACATGAAAGTATCAAAGTTTGCTATTTCTCCTTTGTCACAGTATCTTCTTGATCC
ACAGACCCGAGTTCAGCCTGCCAGATTATTGGCTACTCTTGCACTTGGTGATCTTTTCCAGCATGATGGGCTTGCAAGAACAACTGATGCAGTGTCAGCTTGCCGTGCATTGGTTAGCTTGCTTGAGGATCAGCCAACTGAAGAAATGACAATGGTGGCCGTATGTTCATTGCAGAACCTAGTCATGCACAGTAGAACAA
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GTCCTCCAAGGCTAACGAAAGTGGTAAGTCGAAGCACATCTCCAGAATGGAAACAGGGATTTGCATGGGCCTTTGACATGCCTCCTAAGGGTCAGAAACTGCACATATCTTGCAAGAGCAAGAATACCTTTGGAAAGGGTTCTTTGGGGAAAGTAACCATTCAGATTGACAAAGTGGTAATGCTTGGAATAATCAGTGGC
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TTATTATGAACTGGCGAACAATGTCTCATCTCCCTA


>TRINITY_DN104221_c1_g2_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TATGAATAGATTTATTCAGTTTTGGAGAAGTGCAAATGATCAAAATATTATCTCTTTTACTTGTCTGCCAATACAAAATATACATCTGCAAATCCTTGTCAAACATTTGGTTGAGTGGAAAGTCACATAGTTGGATTACGTTTATACTGGTGAATAAGTTTGCAATTTTATTTATTGGATTGTATTAATCAGGTTTGTGA
ATGTGCACAGGTGGTAAGTCGAAGCACATCTCCAGAATGGAAACAGGGATTTGCATGGGCCTTTGACATGCCTCCTAAGGGTCAGAAACTGCACATATCTTGCAAGAGCAAGAATACCTTTGGAAAGgtacgttgcttaattttattatataaaattcaatgataacctgggtttatccagaaatttagagctagtatgg
cactcattgttatattttctactgacag
GGTTCTTTGGGGAAAGTAACCATTCAGATTGACAAAGTGGTAATGCTTGGAATAATCAGTGGCCAGTATACTCTTGTTCCTGATGCTAACCGAGATGGTACTTCTCGAACACTTGAAATAGAATTTCAGTGGTCTAACAGGTGATCGTAATAGCATGCCATAGCAGGGATGG
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GGATGGCTCAGTGGCTATTTTGGTTTTGGCTTTTAAGAATGAATATTGATCTGTTGTGATTCTTTATACAATGAATAGGAAAGGAAATGTATTATTATGAACTGGCGAACAATGTCTCATCTCCCTA