sp|Q653H7|ARFR_ORYSJ ----> Auxin response factor 18
Intron 1 GTACGTATTC ... TTGATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 18.95 | 248 | 66 | 50 |
| A2 | 17.26 | 187 | 38 | 40 |
| A3 | 18.33 | 147 | 36 | 30 |
| A4 | 15.25 | 164 | 28 | 31 |
| A5 | 9.09 | 55 | 7 | 4 |
| A6 | 17.29 | 806 | 136 | 201 |
| A7 | 18.13 | 970.7 | 177 | 253 |
| A8 | 17.66 | 1660 | 333 | 379 |
| A9 | 18.42 | 1092 | 211 | 282 |
| A10 | 19.59 | 706 | 152 | 192 |
>TRINITY_DN41455_c0_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoformTAGTTATGCCCGCTTGCCGGCTGAACTAAACCCACGTGCATGTCGATGCGGGAAGCTGACTGCGACCCGGCGTGCGTAAATAGACCAAACGTGCGTCATGGAATGGGTGTTTGTGTTCTAAGCCGAGTCTCGCTCGACATTCATGGGGGATTTTGAGGGCGTGTTTGTTTGTTGGGCCAAATCTTTTTGTTATATGTCAT
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>TRINITY_DN41455_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:TAGTTATGCCCGCTTGCCGGCTGAACTAAACCCACGTGCATGTCGATGCGGGAAGCTGACTGCGACCCGGCGTGCGTAAATAGACCAAACGTGCGTCATGGAATGGGTGTTTGTGTTCTAAGCCGAGTCTCGCTCGACATTCATGGGGGATTTTGAGGGCGTGTTTGTTTGTTGGGCCAAATCTTTTTGTTATATGTCAT
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TGTTAGCGGTATCACCGCCAGTCCTCCTGCGCCTTACAGGGCCTCCAGATGGGAGGTGAAGGCCGCTGACTATTTTTCCGGCATTGCCACTGCCAATTCCAATGGGGCCACCGGATTTTCTAGAAATAGAGGCAGAGTTAGCGCTAAATCTGTGATCGAGGCTTGTACTCTGGCGGTCTCTGGACAGCCCTTTGAGGTCG
TTTATTATCCCCGTGCTAGTACTCCTGAGTTCTGTGTTAAAGCCAAGTCTGTGGATTCTTCGCTCAGGATTCAATGGAGTCCTGGGATGCGGTTTAAGATGCCCTTTGAGACCGAGGACTCTTCAAGGATCAGTTGGTTTATGGGTACCGTTTCTTTTGTACAGTTTGCAGACCCGGTGCTTTGGCCTAATTCTCCTTGG
CGCCTTCTTCAGGTAACATGGGATGAGCCAGATATGTTACAAAATGTGAAGAGAGTCAGCCCATGGCTGGTCGAGTTGGTTTCCAATATGCCACCTATTCAAATGACTCCTTTCACTTTACCAAAGAAGAAGCTAAGAGTTACTCAATCTCCAGATTTCCAGCTTGAAGGGCAAGGAATCATGGGGCTTCAGATGAGTAC
AGTTAGCAATAGCCTGCTAAGGCAGATCAACCCTTGGCATGGTTTTTCAGAAAATGTTCCTGTGGGCATCCAGGGAGCCAGGCAAGATCGCATTTATGGGATCTCTTTATCAGATATTTTTACTAACAAAGGTCAAAATGGGTTGTTCTTCAAGCATCCATCTCACCAAGAGCAGGGGCTTATGTCAAGCCGTGTCTGCA
CAGAGCTTAACATAGGAAATTCTCCACAGCATGATGGCTCTGGTATGCAGAGTAGCCCTTCTTCTTTCTTGACAGTAGGAAATTCATCACAAAATGAACAGAAAACAAGTAGTGGGTCGGCTAGTAGCTCAACCACAAAAGGCGCATCCTTTCTGCTGTTTGGGAAGCCAATCCACGCAGCACCGTCTCCTAAATCTTGC
CAGCAGCAGCAATCGGGATTGAGCTCCTCAGATGGGACAGCTTTTCACATCTTTACTGAGAATGGTTCATCCGGGCTAACCAGTAACACCTCAAGTAATGGAAATCAAGAAGCTTTAGAACGGGTGCAGAAATTGGTCACGGGCAGGAGAGATGGGACCAAACTATCTGAAAATTATGGGTTACGGCTTTCCCATGGGGA
GAGCCTGGATTATGCAACCAATGGTATCAGTAATCTTCAAAGGTTTAAGGATCAGACTTCGGTTCTAAAGCTGGAGAAGGATAAACAAGAAAATACCTTTGAAGACAGCATTGTTCATTGTAAAGTATTCAAGGAGACTGAAGAAGTTGGTCGAACTCTTGACCTTTCCATGTTTTGTACATATGAGCAGCTCTATGACA
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TCCAAGATTTCTGTGACTTAGCTATGTAATTGGATGGTATTGGCTAAAGTCAAATTATATTGAACAGTGGATTATATAACGCAATAAAGCTAAGATCTGCAAAGATTCCTAGACGTTGGCTCACTTGTGAAATTCCTATCATATAGGCTCTATAGATGCCAAAAGACTCGTTAAACTACATTTTCTTGTCACTTGTCTTC
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TTTGTCTGTTGGATAGAGTGAACAAGATGGATTGTAATTATGATGCATGTCGGATGGATCTTTCAGGGTAATTGTTATTATGATGCATGTTGGATGGATCTTTCACGGTAATTGTAATTATGATGCATGCTGGATGGATCTTTCAGTGTAATTGTGAGTCTCTTAGTAACTTAGTACATTGGTACTTAAGTGGCCAAGAT
TACATCCATCTTGATTAATTATTTTGCTCCTCACTCTGAACATTTCAAATAATTTTTAGCCTGAGATGGATGCTCTTAATCTTCTTATAACGGC