sp|Q8H0P8|RBP1_MEDTR ----> RNA-binding protein 1

Intron 1 GTAGGTTTTG ... TGTCGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	60	2	6	0
A2	41.18	5	1	6
A3	50	5	1	9
A4	60	1	3	0
A5	-1	0	0	0
A6	34.88	28	15	15
A7	39.62	16	8	13
A8	33.33	21	12	9
A9	35.56	29	10	22
A10	42.86	6	2	7

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

TGGGAGGCATACAAAGCCATCGTAGCAGTAACTTCAAAGCTTCTTTAAATAAAAAATAATCGACCAGTTAAGTCGCTTCAGCATTATGCCCTCGACCCGGGGATTTAGAGGTTCCTCAGCTGACTGTTATTTCGCTTTTTAAATTGGTCATTCGTGAAAGGTTTTAGCCGCGATAGCAGTTTCCAGTTTTGACGGAAAAC
AATGTCGGGCTCACTCAGAAGGACGACCGTGCACAGTCGAGATCTCCGCTATAATCCACTTGGAATTAGAAAAATTACCCGGAACAGTCTTGGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATATCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTACTCTGATGGGCTATT
ACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACGTATCCTTCTCCTGGTGCTTCTCAGGTTTATTTTGTTACTTATGACGATATAAACTGTGCCGCAGCTGCCTTAAA
AGTGCTAAATGGGTATGATTTTGATCGAAGTCGCCCTAATTTATACCGTTTACACGCGCAATTTGGACATCTTCCTGGTAGACGGGGCATTTGATTTTACAACTTTCAACAACAGGTGAGAGATTCTAGTGCCCCGCGAATAACTCTACTCCGTGCTCGAAAGATTCGCTGGTCGATCGAGCTGTTTTTGAAGGCGCGAG
TCCGGAAATCAAGTATCAGTAGGTGGTGTTGTCAGTATTGTTTGTCAGTATGTGGTGTTGTCAGTATTAGTTTAACCAAAGTGGCTAGTGGTTGACGCTGGAATCTGGATGGGTTTCAATTTTACACTAATTAGGTTAATGATTCCAATACTATGGTACATCATTTTGTTTCTTCAAGGATATGGATTCTCCTGCAGCAA
TAATTTAAGTACTTAATATAAGCATATTGAAATATTATTACCTGG

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TGGGAGGCATACAAAGCCATCGTAGCAGTAACTTCAAAGCTTCTTTAAATAAAAAATAATCGACCAGTTAAGTCGCTTCAGCATTATGCCCTCGACCCGGGGATTTAGAGGTTCCTCAGCTGACTGTTATTTCGCTTTTTAAATTGGTCATTCGTGAAAGGTTTTAGCCGCGATAGCAGTTTCCAGTTTTGACGGAAAAC
AATGTCGGGCTCACTCAGAAGGACGACCGTGCACAGTCGAGATCTCCGCTATAATCCACTTGGAATTAGAAAAATTACCCGGAACAGTCTTGGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATATCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTACTCTGATGGGCTATT
ACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACGTATCCTTCTgtaggttttgggttctctagtaactgacttgttttattttgtatgtatgcttgtaccgtagcgtc
cgtttttactcaacctgacagcagacattttccgtttatgtaatattggctggaaaacattgcatgtaaaacagatacctacacgagtaagtgatgtagcttctaagaagtttgattggtatagaatctaaatgcactgtatctattgtgttttttaattatatctttggctttaatacatgtgtgcagcttaaaaaagg
tttgattggtatatatgcagcctagattgtgcatttttggaatttatagaacgctgatgaaatattcggcgatcttgtgtgtcgtgcagCCTGGTGCTTCTCAGGTTTATTTTGTTACTTATGACGATATAAACTGTGCCGCAGCTGCCTTAAAAGTGCTAAATGGGTATGATTTTGATCGAAGTCGCCCTAATTTATAC
CGTTTACACGCGCAATTTGGACATCTTCCTGGTAGACGGGGCATTTGATTTTACAACTTTCAACAACAGGTGAGAGATTCTAGTGCCCCGCGAATAACTCTACTCCGTGCTCGAAAGATTCGCTGGTCGATCGAGCTGTTTTTGAAGGCGCGAGTCCGGAAATCAAGTATCAGTAGGTGGTGTTGTCAGTATTGTTTGTC
AGTATGTGGTGTTGTCAGTATTAGTTTAACCAAAGTGGCTAGTGGTTGACGCTGGAATCTGGATGGGTTTCAATTTTACACTAATTAGGTTAATGATTCCAATACTATGGTACATCATTTTGTTTCTTCAAGGATATGGATTCTCCTGCAGCAATAATTTAAGTACTTAATATAAGCATATTGAAATATTATTACCTGG

Intron 2 GTCTCGGATA ... GTAATCTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	0	1	0	0
A2	0	2	0	0
A3	48.75	3.5	0	3
A4	-1	0	0	0
A5	-1	2	0	0
A6	50.79	4	0	4
A7	72.91	4	0	10
A8	63.97	5.5	0	9
A9	50.58	14	0	14
A10	54.16	6	0	7

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i7 from sample A7 / Example spliced isoform

GTCGGCCGCAGAAACACATTATGAAAGGCTACAGAGTTAATGCCTGTGAAGACGACGCTTCCTCTGGATTAGGGCTCTAGAAACGAAAAGGTTGCCTAAATAGCACGAAAAAGGTTCCTGAATCGCACGCATTCTACAGACACTATGAGATTAACGTGTTTACTAGAATGCCAATTTTCTAGACGTGAAATCGAGACAGA
TAAAAGTCGCAGGATGTTTTTATGGTTCTAAGGTTTCTGGGATTCGATTTTTAACAGGAAACGAAAAAGTTGCCTGAATTGCACGAAAATGTTGCTTCAATAGCACGCAAAAGTTGCCTGAATCGCACGCATTCCACAGTCACTATGAGATTAACTTGTTTACTAGAATGCCAATTTTCTAGACGTGAAATCGAGACAGA
TAAGTCTAGGATAAGAGATTGAGTTTTTTGTTTTTACTGCAAACTATACGATGCTTTTTCTTATTTATCTGCAAATACAATAAATCTCACCACTCT

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TAGAATGCCAATTTTCTAGgtctcggataagtctcggataagagctttgagttttttgtttttactgcaaatagatatattaatagatgatttagttctttatttttgctgattgctaacgaagatatattaatgttttgtggtaatcttagACGTGAAATCGAGACAGATAAAAGTCGCAGGATGTTTTTATGGTTCTA
AGGTTTCTGGGATTCGATTTTTAACAGGGTATCAATTTGGTCATTGATAAATGAAGTTTTAATGCAGAAATATTTCTTTATGTGCGTTTACTGCAAACTACTAACTACTGATGTTTTCTCTTATTTGCCTATCAGAAACGAAAAAGTTGCCTGAATTGCACGAAAATGTTGCTTCAATAGCACGCAAAAGTTGCCTGAAT
CGCACGCATTCCACAGTCACTATGAGATTAACTTGTTTACTAGAATGCCAATTTTCTAGACGTGAAATCGAGACAGATAACGGATAAGTCTGGGATAAGAGCTTTGAGTTTTTTGTTTTTACTGCAAACTAT

Intron 3 GTATCCTTCT ... CTGACAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	85.71	1	6	0
A2	25	3	1	0
A3	25	3	1	1
A4	30.77	9	4	0
A5	0	3	0	0.6
A6	22.58	48	14	10.6
A7	24.32	28	9	8.4
A8	28.26	33	13	6.7
A9	21.15	41	11	6.7
A10	5.26	18	1	4.9

>TRINITY_DN42748_c3_g2_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

CGAATACGGTGGGAGGCATACAAAGCCATCGTAGCAGTAACTTCAAAGCTTCTTTAAATAAAAAATAATCGACCAGTTAAGTCGCTTCAGCATTATGCCCTCGACCCGGGGATTTAGAGGTTCCTCAGCTGACTGTTATTTCGCTTTTTAAATTGGTCATTCGTGAAAGGTTTTAGCCGCGATAGCAGTTTCCAGTTTTG
ACGGAAAACAATGTCGGGCTCACTCAGAAGGACGACCGTGCACAGTCGAGATCTCCGCTATAATCCACTTGGAATTAGAAAAATTACCCGGAACAGTCTTGGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATATCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTACTCTGA
TGGGCTATTACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACACATTTTCCGTTTATGTAATATTGGCTGGAAAACATTGCATGTAAAACAGATACCTACACGACCTG
GTGCTTCTCAGGTTTATTTTGTTACTTATGACGATATAAACTGTGCCGCAGCTGCCTTAAAAGTGCTAAATGGGTATGATTTTGATCGAAGTCGCCCTAATTTATACCGTTTACACGCGCAATTTGGACATCTTCCTGGTAGACGGGGCATTTGATTTTACAACTTTCAACAACAGGTGAGAGATTCTAGTGCCCCGCGA
ATAACTCTACTCCGTGCTCGAAAGATTCGCTGGTCGATCGAGCTGTTTTTGAAGGCGCGAGTCCGGAAATCAAGTATCAGTAGGTGGTGTTGTCAGTATTGTTTGTCAGTATGTGGTGTTGTCAGTATTAGTTTAACCAAAGTGGCTAGTGGTTGACGCTGGAATCTGGATGGGTTTCAATTTTACACTAATTAGGTTAA
TGATTCCAATACTATGGTACATCATTTTGTTTCTTCAAGGATATGGATTCTCCTGCAGCAATAATTTAAGTACTTAATATAAGCATATTGAAATATTATTACCTGGCA

>TRINITY_DN42748_c3_g2_i6 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TTTTGACGGAAAACAATGTCGGGCTCACTCAGAAGGACGACCGTGCACAGTCGAGATCTCCGCTATAATCCACTTGGAATTAGAAAAATTACCCGGAACAGTCTTGGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATATCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTAC
TCTGATGGGCTATTACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACgtatccttctgtaggttttgggttctctagtaactgacttgttttattttgtatgtatgct
tgtaccgtagcgtccgtttttactcaacctgacagcagACATTTTCCGTTTATGTAATATTGGCTGGAAAACATTGCATGTAAAACAGATACCTACACGAGTAAGTGATGTAGCTTCTAAGAAGTTTGATTGGTATAGAATCTAA

Intron 4 GTAAGTGATG ... TGTCGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	0	1	0	0
A2	54.55	5	0	6
A3	60	6	0	9
A4	0	4	0	0
A5	0	2	0	0
A6	24.19	47	0	15
A7	32.5	27	9	13
A8	28.13	23	8	9
A9	29.73	52	2	22
A10	18.42	31	3	7

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

TGGGAGGCATACAAAGCCATCGTAGCAGTAACTTCAAAGCTTCTTTAAATAAAAAATAATCGACCAGTTAAGTCGCTTCAGCATTATGCCCTCGACCCGGGGATTTAGAGGTTCCTCAGCTGACTGTTATTTCGCTTTTTAAATTGGTCATTCGTGAAAGGTTTTAGCCGCGATAGCAGTTTCCAGATGCTCTTGGTGTG
GTAGCGTAAGGGTTTCTAAACGAGGGTTTCCGTTTGTGTATGGCAACGAAATTGCAGTTTTGACGGAAAACAATGTCGGGCTCACTCAGAAGGACGACCGTGCACAGTCGAGATCTCCGCTATAATCCACTTGGAATTAGAAAAATTACCCGGAACAGTCTTGGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATA
TCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTACTCTGATGGGCTATTACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACACAT
TTTCCGTTTATGTAATATTGGCTGGAAAACATTGCATGTAAAACAGATACCTACACGACCTGGTGCTTCTCAGGTTTATTTTGTTACTTATGACGATATAAACTGTGCCGCAGCTGCCTTAAAAGTGCTAAATGGGTATGATTTTGATCGAAGTCGCCCTAATTTATACCGTTTACACGCGCAATTTGGACATCTTCCTG
GTAGACGGGGCATTTGATTTTACAACTTTCAACAACAGGTGAGAGATTCTAGTGCCCCGCGAATAACTCTACTCCGTGCTCGAAAGATTCGCTGGTCGATCGAGCTGTTTTTGAAGGCGCGAGTCCGGAAATCAAGTATCAGTAGGTGGTGTTGTCAGTATTGTTTGTCAGTATGTGGTGTTGTCAGTATTAGTTTAACC
AAAGTGGCTAGTGGTTGACGCTGGAATCTGGATGGGTTTCAATTTTACACTAATTAGGTTAATGATTCCAATACTATGGTACATCATTTTGTTTCTTCAAGGATATGGATTCTCCTGCAGCAATAATTTAAGTACTTAATATAAGCATATTGAAATATTATTACCTGG

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TGGGAGGCATACAAAGCCATCGTAGCAGTAACTTCAAAGCTTCTTTAAATAAAAAATAATCGACCAGTTAAGTCGCTTCAGCATTATGCCCTCGACCCGGGGATTTAGAGGTTCCTCAGCTGACTGTTATTTCGCTTTTTAAATTGGTCATTCGTGAAAGGTTTTAGCCGCGATAGCAGTTTCCAGTTTTGACGGAAAAC
AATGTCGGGCTCACTCAGAAGGACGACCGTGCACAGTCGAGATCTCCGCTATAATCCACTTGGAATTAGAAAAATTACCCGGAACAGTCTTGGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATATCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTACTCTGATGGGCTATT
ACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACGTATCCTTCTGTAGGTTTTGGGTTCTCTAGTAACTGACTTGTTTTATTTTGTATGTATGCTTGTACCGTAGCGTC
CGTTTTTACTCAACCTGACAGCAGACATTTTCCGTTTATGTAATATTGGCTGGAAAACATTGCATGTAAAACAGATACCTACACGAgtaagtgatgtagcttctaagaagtttgattggtatagaatctaaatgcactgtatctattgtgttttttaattatatctttggctttaatacatgtgtgcagcttaaaaaagg
tttgattggtatatatgcagcctagattgtgcatttttggaatttatagaacgctgatgaaatattcggcgatcttgtgtgtcgtgcagCCTGGTGCTTCTCAGGTTTATTTTGTTACTTATGACGATATAAACTGTGCCGCAGCTGCCTTAAAAGTGCTAAATGGGTATGATTTTGATCGAAGTCGCCCTAATTTATAC
CGTTTACACGCGCAATTTGGACATCTTCCTGGTAGACGGGGCATTTGATTTTACAACTTTCAACAACAGGTGAGAGATTCTAGTGCCCCGCGAATAACTCTACTCCGTGCTCGAAAGATTCGCTGGTCGATCGAGCTGTTTTTGAAGGCGCGAGTCCGGAAATCAAGTATCAGTAGGTGGTGTTGTCAGTATTGTTTGTC
AGTATGTGGTGTTGTCAGTATTAGTTTAACCAAAGTGGCTAGTGGTTGACGCTGGAATCTGGATGGGTTTCAATTTTACACTAATTAGGTTAATGATTCCAATACTATGGTACATCATTTTGTTTCTTCAAGGATATGGATTCTCCTGCAGCAATAATTTAAGTACTTAATATAAGCATATTGAAATATTATTACCTGG

Intron 5 GTAACTCTCT ... CATTTTAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	40	9	0	6
A2	0	2	0	0
A3	7.69	12	0	1
A4	40	9	0	6
A5	30.95	4.5	0	2
A6	14.29	36	0	6
A7	18.34	49	0	11
A8	16.83	44.5	0	9
A9	18.85	56	0	13
A10	23.73	45	0	14

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

TGGGAGGCATACAAAGCCATCGTAGCAGTAACTTCAAAGCTTCTTTAAATAAAAAATAATCGACCAGTTAAGTCGCTTCAGCATTATGCCCTCGACCCGGGGATTTAGAGGTTCCTCAGCTGACTGTTATTTCGCTTTTTAAATTGGTCATTCGTGAAAGGTTTTAGCCGCGATAGCAGTTTCCAGTTTTGACGGAAAAC
AATGTCGGGCTCACTCAGAAGGACGACCGTGCACAGTCGAGATCTCCGCTATAATCCACTTGGAATTAGAAAAATTACCCGGAACAGTCTTGGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATATCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTACTCTGATGGGCTATT
ACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACGTATCCTTCTCCTGGTGCTTCTCAGGTTTATTTTGTTACTTATGACGATATAAACTGTGCCGCAGCTGCCTTAAA
AGTGCTAAATGGGTATGATTTTGATCGAAGTCGCCCTAATTTATACCGTTTACACGCGCAATTTGGACATCTTCCTGGTAGACGGGGCATTTGATTTTACAACTTTCAACAACAGGTGAGAGATTCTAGTGCCCCGCGAATAACTCTACTCCGTGCTCGAAAGATTCGCTGGTCGATCGAGCTGTTTTTGAAGGCGCGAG
TCCGGAAATCAAGTATCAGTAGGTGGTGTTGTCAGTATTGTTTGTCAGTATGTGGTGTTGTCAGTATTAGTTTAACCAAAGTGGCTAGTGGTTGACGCTGGAATCTGGATGGGTTTCAATTTTACACTAATTAGGTTAATGATTCCAATACTATGGTACATCATTTTGTTTCTTCAAGGATATGGATTCTCCTGCAGCAA
TAATTTAAGTACTTAATATAAGCATATTGAAATATTATTACCTGG

>TRINITY_DN46047_c0_g1_i9 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AAATTACCCGGAACAGTCTTGgtaactctctgtagatccgtattttcctggtttctttgtgcccttttgtttcaatcaagggagggtttactttattattcttttgtgtttgttatttaaatgatctgaaagctgtattaagaaaataaccccgagggtgtagtccgcagttaatgacaaacacctcctttggtttaggt
ccgaggtttgtttgttgtgtttctgctaaagttgtcaattttggtacatggcctcacctattttttgatcttgccatttgtactgcagaattgaatcctgataaacagcttaatgccccatccacgttataagacccaagattgtgttgtcagttatgtttgctacggggtagttccttcttgtaaataagttattttat
atgccctgagtgaaattattgtttcttttctaaagaaatgtgagcattattgtttatttaccgctgagaagagtaagctcaactttagtttttagtgtttttagatcaaaatcaagtagaaagtattgaaatggtaattttaggttactggaattgcataatctagatgctcaggaataattgaatccattcctacagtc
aaatttacaattccagcatcccaaattgcaatttcagctatttcccatcacctatttccagattccagcaaaaaactgcagaacactcgcacttaggtctagacgaatctgtgtgctattatacacgagtcttatccagtaggtaggttatggcagttctttttgttcttctgaatgtgtggccattgaaatctgtggaa
tggatttttaaaatttatatggtacatttattatgatgttaaattgtgttggcttgactttttgacatttggtggctaatttggaaatctgcattttaaagGTCCTTTATGGATAAGTGGCCGAAATTATGGTGGATATCGGAACTCTGGTGGTAATGGGAACTCGGGAACTCGAATTCTGGTGGTCATCGGTACTCTGA
TGGGCTATTACCCCCGCCCGGTGGAACAATAACACGGCCATCCTCAGGGTTTCAATTTGGAAATCAGCTTTACGCATCGCCTACCCTTATTGTTGAGGGTATTCCTGCTGATTGTACTGCCAGGGAAGCGGAACGTATCCTTCTCCTGGTGCTTCTCAGGTTTATTTTGTTACTTATGACGATATAAACTGTGCCGCAGC
TGCCTTAAAAGTGCTAAATGGGTATGATTTTGATCGAAGTCGCCCTAATTTATACCGTTTACACGCGCAATTTGGACATCTTCCTGGTAGACGGGGCATTTGATTTTACAACTTTCAACAACAGGTGAGAGATTCTAGTGCCCCGCGAATAACTCTACTCCGTGCTCGAAAGATTCGCTGGTCGATCGAGCTGTTTTTGA
AGGCGCGAGTCCGGAAATCAAGTATCAGTAGGTGGTGTTGTCAGTATTGTTTGTCAGTATGTGGTGTTGTCAGTATTAGTTTAACCAAAGTGGCTAGTGGTTGACGCTGGAATCTGGATGGGTTTCAATTTTACACTAATTAGGTTAATGATTCCAATACTATGGTACATCATTTTGTTTCTTCAAGGATATGGATTCTC
CTGCAGCAATAATTTAAGTACTTAATATAAGCATATTGAAATATTATTACCTGG