NA ----> NA
Intron 1 GTTTGAAAAA ... CCTGATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.95 | 12 | 16 | 23 |
| A2 | 67.93 | 5.2 | 14 | 8 |
| A3 | 53.35 | 9.8 | 9.4 | 13 |
| A4 | 55.82 | 11.8 | 14.8 | 15 |
| A5 | 94.29 | 0.4 | 6.6 | 3 |
| A6 | 68 | 0.8 | 1.8 | 1 |
| A7 | 91.11 | 0.8 | 9 | 7 |
| A8 | 73.34 | 1.6 | 4.6 | 3 |
| A9 | 57.72 | 5.2 | 7.2 | 7 |
| A10 | 56.46 | 6.6 | 11 | 6 |
>TRINITY_DN125561_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCCAACGATTCACACCCCAAGCTTACTCGTCCGATAATTATCATCGGATCGCCCTTAGGGGCATTTGCATATTGTCATTTCGATGAAGCTTTCCCGGACAGATCTTTTTCAGACATATTGTTTCGGACAAAATTCCTAAAGAACCCGAGCCGATGGCCTTCCCAGCGTTGTATTACAGATTTGACGTCGCCATTGATTCTC
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>TRINITY_DN125561_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:CCAACGATTCACACCCCAAGCTTACTCGTCCGATAATTATCATCGGATCGCCCTTAGGGGCATTTGCATATTGTCATTTCGATGAAGCTTTCCCGGACAGATCTTTTTCAGACATATTGTTTCGGACAATTTCGTATTGGATTCTTTTTCTTTTAATTCCTAAAGAACCCGAGCCGATGGCCTTCCCAGCGTTGTATTAC
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CTAGACTGTCTATTGAGGCAAGAAATACCGTCAGGAGTATTGGAGATTGGTATATTCAGGAATTTTATACATACATCAGAATTCTTGGGCATACTTCTGCACCACACCTTCTTCCAAAATATGTTCCAGATTGGTTGGTGTTAAGGGAGATTGCATATCAAACTATGGTGGAGGGAGTTACTGCTCTTTTGTCTTTTCAC
TCAAAGAAGACATGGCCAAAATTCCCTATTAAAGTGGGAATTTTTACTCTATTAAACGGCCGTCATGCACTTAAAGAAGCTGCTGCTATTAAGGAACTTTGCCTTTGTACAGGGACCCTAAGGAGACATGATCCAAAAGGTTTTATTGAGGAGCACATCAAAATTGTAGGGTTATCCCCTTCCTATCAACATGATTCAAC
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GTGGTTCCTCCTCCTATTGATGCTGGTACACTTGTTGTTCCTGCAGGAGCAGATCCTCCTTCCTCATCTTTAGAATTGAAAAGGACAGATGAAGCTGATGATGCAGTTGTTTCATTAGGAGATTACTTTTTCAGCAAATCCAGAAAAGGAGTTATTAAAAAACCTGCCAAAAGACCAAGATTAGAAGAAGCTTCAAGTAA
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AAGACCAGTATAAGCAACAGGTCACTCAGATAACAGAGCAGCATGAGGCTCAGATGAAGTCCCTTCAAGAAGAACATCTTCAGGGGGTTGAGAAACTTAAGAAAGAACATGAAGGGATAGTTTGTCAAGTTAAAACCCTGCAGGAGAAAATTCAGTTGTTCAATTCTCAGCTAGAAGAAAGAAGCAAAAGGACATTAGAT
CCTACTGTTTTTAAGGAGGAAGCCCTCATAGCTAATGAAAATCTGAGAAGTGCTCAAAAAAGATTCTTCACCAAGCTAGATGAAGTACAACAGTGTCATGATGATTTAATCAGGATCTCTGATCAAGTTAAATTACAGTTGGAAGCGAGAAAGGTAGCCCAAAATGCATTTGATCAGCTTGTTGACTGGCAAAAACAGTA
TAAGGAAGCCCCTGAATCAATTCCTAGGCTTGATCAAAGGGAGAAGGGAAAAGCTCAAGTTTTGCTGGATTCATGGAAGATGGTATGTGATGAAATAAATGATGATATTACTATTTCCACTAAAGCATGTTACAATTTGTGGAATTCAGTAGATGATATCTTAGAGGAATTTGGTATGCCTGTTATGGAGGAGTTGAGTC
AAGCTGCTCCTAGTAAGTTGAGGGTTGCAGATGTGGATCAGAAAAGAGATACCAGTACTGAATTAATCAAGCAGCTCACTGAAGTAAATAAGGATGTTTTGAACAGTTTCCTGGTATCACCAATCAGGTTAGCCACCCTGTCAGATGACTATGTACAGCAGCTTGGAAAGGATTTAAAACGAGAGGTTATTGAGAAGATT
TGTGTAAGTGAACTACAGTTGGAGCAAATGAAATATGCTCGGATTTCTCACATTCTTGAAGTTCATGAGATGTGGAAGCCTTATAGAGATGGATAAAATTTAGAAAATTGTAATTTTGTAAAAGAAAGAAGAAGCGTTTGTGGGGTTAGTTAAATTGGTTATGAAAACTTCCTCTCAGCTTCCTTTTAAAAGGAAGTATT
CAATGTGTAATGGGGGGACTTTTTGGGCGAATAGACCTTTGTAATATTTTTATTGAAAGGAATACAAGGGCAGGACTTGCAGCCTTGGATAAGTATTCAACTGTGTTGATTAAGATTTTTCTTTACTTCCAGTTGATGTAATTAATTACAATATGCATCCAAACATGAAAGCATGTGGAATGGCCTGAATGCATGAGCAT
CTATAAATGAAACTACATTTAAGTTTAATAAACAAATTTAAATGGGCATCAGATCCCTGGAATTGAAGTCTGGCTG