sp|Q0J349|SWT7B_ORYSJ ----> Bidirectional sugar transporter SWEET7b

Intron 1 GTAAGGTTTC ... GCTGTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25	3	3	1
A2	28.57	5	0	2
A3	33.33	10	2	5
A4	0	4	0	0
A5	12.5	7	0	1
A6	12.84	95	2	14
A7	18.11	104	1	23
A8	12.5	70	0	10
A9	20.18	178	1	45
A10	17.76	125	0	27

>TRINITY_DN40945_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

GTTGGTAACGTTGCTCAGAACGAGTATGTGGTTTATATTATTTTTTCAAGAGAATCCACATATTGAGTTTTCAAAACTCTAGGATTCTATAAGTTTGCCTCATTTTAATTCGTGCAAGGGTCTGCCCGTTTCGTTTAATGCGCTTCCATCAGAATGCCGATCGAATGCCGTAGCACCTTCAGCAAATCTGGGAACTTTCT
TTCTCTGATACTCTACCTGGCTCCAGCGTGGCTATTCTACAAGGTGTGTAGACAGAAATCCACCGGCCACTTATCAGTCGTCCCGTTCGTTTTAACGCTCCCCAATTGCATGCTCTGGATCGTTTACGGCCTGCCCATTGTGCATCCCTACAGCATTCTCGTCACGGAAATTAACGGAGCCGGATTCGTTCTGGAATCAA
TTTACGTCACCATATTCATCATTTACTCCAACAGAGACAACAGGGTGAAGCTGCTGAAACTGTTGGCCGGGGTGGCGGTAATCTTCTCGTCTGCGGTGGTGCCGACGATCATGTTAGCGCAGAGTCACGAGAGACGGTCGTCAAATGTGAGAATTCTGTGCTGTATAGCCGGCATCATCATGTATTGTTCTCCCGTCTAC
GACATAGTTTTGGATTCTGTTGAGCAGAGATCTGTTATTCGCGGGACCAAAAGGGTAATAAGGAACATGCCATTTTTTATTTCGCTGGCCAACTTCTTCAACGCGTCTACGTGGACAGCCTATTCATACATAAATTACGATAAAACTCTTCTGATTCCTAATGCAATAGGAGCCTTGGTCAGCGCAGTGGAGATTATACT
CTATGTGATATGCAAAAGAATCCCTTTGGATGAGGATTCTTTATCAAAACAGTTAGATGACGACAGCCCTAGCCAGCCTCTGTTACAGGGTAACGTACCTGACAACGAGGATGCTGAATTGCATGACAGGGAGGATCATGAAAATGCTGACTTGGATAACAACCAATCAAATGGCAATGGGGACGACGATGCTGAATTGG
ATGACAGCGAGGATATAAGAATGATATAATGATAGTGAAGAACATGCAAACTAAACTTTGTGGATTGTGGCCTAAATGCTGTAATTAGCTTATTAATATTTCGTTATTTTCTGTAGCGTTTTCTAAGTTTTATTTGTAGAGGCTTCAAAATTGAGAGCTCCACGCAACATTCTTTTTCAATTTTGGCCTCACCGATTCTA
TGAAGTAATTATGGATAGTAACCAGAGATTTTTAGTCTTTTTTTTGTTGCTTTACCCTGTAAGATGTCAAAGTCACAGGTTCTTTATTTTGAAATTATTAAGGTCCTTTATCTTGAAGTGACTTTTTTAAATAAAGCACTTATCTCAGGTTGTAGGATATTATGTCTTAATTCCATGTTTTGATTTTCAATTCTGTTTCC
TTTTGATCAATCATGAATTTTCACAAGATGTGCGAGTAAAATGCAAGAAATTAAACTATTG

>TRINITY_DN40945_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CGCTAAGTAATTTTTTATGATAGGGTTTCGCTTACAAGATTTTCAGAAAGGATTTTAACAATTCCAGTGTCTTGCAGGGAACTTTCTTTCTCTGATACTCTACCTGGCTCCAGCgtaaggtttccaccatctttgtttcatgggccaataatggaagtttaatatatactcggattcatttaaattatgagagctttgct
tgacggatcaatgtttgaagattgctgttgcagGTGGCTATTCTACAAGGTGTGTAGACAGAAATCCACCGGCCACTTATCAGTCGTCCCGTTCGTTTTAACGCTCCCCAATTGCATGCTCTGGATCGTTTACGGCCTGCCCATTGTGCATCCCTACAGCATTCTCGTCACGGAAATTAACGGAGCCGGATTCGTTCTGG
AATCAATTTACGTCACCATATTCATCATTTACTCCAACAGAGACAACAGGGTGAAGCTGCTGAAACTGTTGGCCGGGGTGGCGGTAATCTTCTCGTCTGCGGTGGTGCCGACGATCATGTTAGCGCAGAGTCACGAGAGACGGTCGTCAAATGTGAGAATTCTGTGCTGTATAGCCGGCATCATCATGTATTGTTCTCCC
GTCTACGACATAGTTTTGGATTCTGTTGAGCAGAGATCTGTTATTCGCGGGACCAAAAGGGTAATAAGGAACATGCCATTTTTTATTTCGCTGGCCAACTTCTTCAACGCGTCTACGTGGACAGCCTATTCATACATAAATTACGATAAAACTCTTCTGATTCCTAATGCAATAGGAGCCTTGGTCAGCGCAGTGGAGAT
TATACTCTATGTGATATGCAAAAGAATCCCTTTGGATGAGGATTCTTTATCAAAACAGTTAGATGACGACAGCCCTAGCCAGCCTCTGTTACAGGGTAACGTACCTGACAACGAGGATGCTGAATTGCATGACAGGGAGGATCATGAAAATGCTGACTTGGATAACAACCAATCAAATGGCAATGGGGACGACGATGCTG
AATTGGATGACAGCGAGGATATAAGAATGATATAATGATAGTGAAGAACATGCAAACTAAACTTTGTGGATTGTGGCCTAAATGCTGTAATTAGCTTATTAATATTTCGTTATTTTCTGTAGCGTTTTCTAAGTTTTATTTGTAGAGGCTTCAAAATTGAGAGCTCCACGCAACATTCTTTTTCAATTTTGGCCTCACCG
ATTCTATGAAGTAATTATGGATAGTAACCAGAGATTTTTAGTCTTTTTTTTGTTGCTTTACCCTGTAAGATGTCAAAGTCACAGGTTCTTTATTTTGAAATTATTAAGGTCCTTTATCTTGAAGTGACTTTTTTAAATAAAGCACTTATCTCAGGTTGTAGGATATTATGTCTTAATTCCATGTTTTGATTTTCAATTCT
GTTTCCTTTTGATCAATCATGAATTTTCACAAGATGTGCGAGTAAAATGCAAGAAATTAAACTATTG

Intron 2 GTAATAATAA ... TGTCTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.33	2	1	1
A2	25	3	1	1
A3	37.09	8.5	5	5
A4	0	3	0	0
A5	14.29	6	0	1
A6	22.38	81.5	0	23.5
A7	21.39	73.5	0	20
A8	30.01	59.5	0	25.5
A9	23.31	125	1	38
A10	22.33	90.5	1	26

>TRINITY_DN109895_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CAAGGGTCTGCCCGTTTCGTTTAATGCGCTTCCATCAGAATGCCGATCGAATGCCGTAGCACCTTCAGCAAATCTGGGAACTTTCTTTCTCTGATACTCTACCTGGCTCCAGCGTGGCTATTCTACAAGGTGTGTAGACAGAAATCCACCGGCCACTTATCAGTCGTCCCGTTCGTTTTAACGCTCCCCAATTGCATGCT
CTGGATCGTTTACGGCCTGCCCATTGTGCATCCCTACAGCATTCTCGTCACGGAAATTAACGGAGCCGGATTCGTTCTGGAATCAATTTACGTCACCATATTCATCATTTACTCCAACAGAGACAACAGGGTGAAGCTGCTGAAACTGTTGGCCGGGGTGGCGGTAATCTTCTCGTCTGCGGTGGTGCCGACGATCATGT
TAGCGCAGAGTCACGAGAGACGGTCGTCAAATGTGAGAATTCTGTGCTGTATAGCCGGCATCATCATGTATTGTTCTCCCGTCTACGACATAGTTTTGGATTCTGTTGAGCAGAGATCTGTTATTCGCGGGACCAAAAGGGTAATAAGGAACATGCCATTTTTTATTTCGCTGGCCAACTTCTTCAACGCGTCTACGTGG
ACAGCCTATTCATACATAAATTACGATAAAACTCTTCTGATTCCTAATGCAATAGGAGCCTTGGTCAGCGCAGTGGAGATTATACTCTATGTGATATGCAAAAGAATCCCTTTGGATGAGGATTCTTTATCAAAACAGTTAGATGACGACAGCCCTAGCCAGCCTCTGTTACAGGGTAACGTACCTGACAACGAGGATGC
TGAATTGCATGACAGGGAGGATCATGAAAATGCTGACTTGGATAACAACCAATCAAATGGCAATGGGGACGACGATGCTGAATTGGATGACAGCGAGGATATAAGAATGATATAATGATAGTGAAGAACATGCAAACTAAACTTTGTGGATTGTGGCCTAAATGCTGTAATTAGCTGATTAATATTTCGTTATTTTCTGT
AGCGTTTTCTAAGTTTTATTTGTAGAGGCTTCAAAATTGAGAGCTCCACGCAACATTCTTTTTCAATTTTGGCCTCACCGATTCTATGAAGTAATTATGGATAGTAACCAGAGATTTTTAGTCTTTTTTTTGTTGCTTTACCCTGTAAGATGTCAAAGTCACAGGTTCTTTATTTTGAAATTATTAAGGTCCT

>TRINITY_DN109895_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CAAGGGTCTGCCCGTTTCGTTTAATGCGCTTCCATCAGAATGCCGATCGAATGCCGTAGCACCTTCAGCAAATCTGgtaataataacagcagcaactccgctaagtaattttttatgatagggtttcgcttacaagattttcagaaaggattttaacaaatccagtgtcttgcagGGAACTTTCTTTCTCTGATACTCTA
CCTGGCTCCAGCGTGGCTATTCTACAAGGTGTGTAGACAGAAATCCACCGGCCACTTATCAGTCGTCCCGTTCGTTTTAACGCTCCCCAATTGCATGCTCTGGATCGTTTACGGCCTGCCCATTGTGCATCCCTACAGCATTCTCGTCACGGAAATTAACGGAGCCGGATTCGTTCTGGAATCAATTTACGTCACCATAT
TCATCATTTACTCCAACAGAGACAACAGGGTGAAGCTGCTGAAACTGTTGGCCGGGGTGGCGGTAATCTTCTCGTCTGCGGTGGTGCCGACGATCATGTTAGCGCAGAGTCACGAGAGACGGTCGTCAAATGTGAGAATTCTGTGCTGTATAGCCGGCATCATCATGTATTGTTCTCCCGTCTACGACATAGTTTTGGAT
TCTGTTGAGCAGAGATCTGTTATTCGCGGGACCAAAAGGGTAATAAGGAACATGCCATTTTTTATTTCGCTGGCCAACTTCTTCAACGCGTCTACGTGGACAGCCTATTCATACATAAATTACGATAAAACTCTTCTGATTCCTAATGCAATAGGAGCCTTGGTCAGCGCAGTGGAGATTATACTCTATGTGATATGCAA
AAGAATCCCTTTGGATGAGGATTCTTTATCAAAACAGTTAGATGACGACAGCCCTAGCCAGCCTCTGTTACAGGGTAACGTACCTGACAACGAGGATGCTGAATTGCATGACAGGGAGGATCATGAAAATGCTGACTTGGATAACAACCAATCAAATGGCAATGGGGACGACGATGCTGAATTGGATGACAGCGAGGATA
TAAGAATGATATAATGATAGTGAAGAACATGCAAACTAAACTTTGTGGATTGTGGCCTAAATGCTGTAATTAGCTGATTAATATTTCGTTATTTTCTGTAGCGTTTTCTAAGTTTTATTTGTAGAGGCTTCAAAATTGAGAGCTCCACGCAACATTCTTTTTCAATTTTGGCCTCACCGATTCTATGAAGTAATTATGGA
TAGTAACCAGAGATTTTTAGTCTTTTTTTTGTTGCTTTACCCTGTAAGATGTCAAAGTCACAGGTTCTTTATTTTGAAATTATTAAGGTCCT