sp|Q41141|PFPB_RICCO ----> Pyrophosphate--fructose 6-phosphate 1-phosphotransferase subunit beta
Intron 1 GTACTTGGAC ... TACCCTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 10.82 | 995 | 135.5 | 111.3 |
| A2 | 11.22 | 708 | 102.5 | 65.3 |
| A3 | 13.63 | 822 | 151.5 | 90.7 |
| A4 | 11.1 | 708 | 99.5 | 84 |
| A5 | 14.48 | 368 | 74.5 | 31.3 |
| A6 | 14.52 | 372 | 73 | 49.7 |
| A7 | 13.54 | 1524 | 280 | 176.7 |
| A8 | 14.06 | 641 | 121.5 | 83 |
| A9 | 14.19 | 1233 | 242 | 146.7 |
| A10 | 14.98 | 1404 | 297 | 163.7 |
>TRINITY_DN122253_c2_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformATACAACCAATTTAAAAAATATAACCAATGATTAATTAATTAAATTGTATGGTAAAAAATTCATAACTAATAGCGTTTCTGAAATCACGTGACATGTGACACACTAGCTTCCATTTTGAACATCCTTCAAGACAAAATAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGA
AGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCTCTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTTTGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGA
TCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTCCAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCAGCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGC
TGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACAGCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCCAAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGG
ACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTATCCATATCGAAACCAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATTGAGACTCCTGAACAGTTCAGGCAAGCGGAGGAAACTGTACTGAATCTTGATTTAGATGGTCTT
GTTATCATTGGTGGAGATGATTCAAATACAAATGCCTGCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGGGAGAAAAACTTAAAAACGCAGGTGATTGGCTGTCCAAAAACAATTGATGGTGATCTTAAATCTAAGGAAGTTCCAACAAGTTTTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGA
TGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTTTGTGAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTGCAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGAGGAGGTAGCTGTGAAAAAACAAACTCTTAAAAGTGTCACAGGCTACATTACAGATGTGATCTGTAAACGAGCAGAGCGTGGGTACA
ATTATGGTGTTGTACTTATACCAGAGGGTCTTATTGACTTCATTCCAGAGGTGCAACAGTTGATTGCTGAGCTGAATGAGATTTTGGCCCATGATGTAATAGATGAAGGTGGCCTTTGGAAACAAAAACTGCAATCTCAATCCCAAACGCTTTTTGACTTATTGCCTGGAAGTATTCAGGAGCAGTTGATGCTTGAAAGG
GATCCTCATGGAAATGTGCAGGTTGCAAAAATAGAGACTGAAAAAATGCTTATATCGATGGTTGAAACTGAATTGGAAAAAAGAATGGAAGAGGGGACCTACAAAGGACATTTTAAGGGGCAATCACATTTCTTTGGCTATGAGGGAAGGTGTGGATTGCCTACAAATTTTGATGCAACTTACTGCTATGCTCTGGGGTA
TGCGGCAGGAGTACTTCTTCATGCCGGACATACAGGCCTTATAGCTTCGGTTCGCAATTTGGCAGCACCAGCAAGAGATTGGATAGTTGGTGGAACTGCTCTTACACAACTCATGGATGTTGAGAGACGACAAGGAAAGTTCAAACCTGTTATTAAGAAAGCTATGGTGGAACTAGATGGAGCACCATTCAAGAAGTTTG
CTTCCATGCGAGAAGAGTGGGCTTTGCAAAATAAATACACCAATCCAGGTCCTATACAGTTTTTTGGTCCGACTGCAGACAAGAGCAACTTCACGTTGATGTTAGAACTTGGAGCCATGGCATGACTTTGTTACTCAAAACCAAATTGCTAAATTTCTCAGGTTCTATAATATTTGGCTCTTGGTCACAGTACTAGCATT
TTTGGACTTTTAGTTCTAGCAACTTGAAATAATAGTTCCCCATAGCAAGGATGCCCACCAAATCTCAATCCTGCGGTCTAATGAGGCACCATGTTTGGCAGCGCATGCCCGAGGAACCATGTTTGGTTCAACGAAGCTCATGATTGAAGTAGATGCTTGGTGACATATCTTGTTAATTTTTCACTCTCGTCTATCCTTTG
GTTATGGGTGAAACATTGACAGCTTAGTCAACCTTTTGGAAAGGTTACGTGCTTGTTAAATTTCAAATAAAATATTTCCATTCTTTGGTAGAAGCATATGCTTTACCCAGTGCATTTGACACAGAGTTGAAGTTATGCTATAGTTGTGTCACCTAGAGTAATATGCAACTTGACACAGAAATGCTTAGCAAATTAATTTT
TCGGTTTAGATATAAGAATAGATCAATTACACACTTATCAGGCGATTTTGAAGCAGTTTTACAATGTGAGAATGAATTTTCCTTGATCAAAATAAGTCCTCCGTGCTTGTACTCCATTTAAGCAGAACAGGAAATTAAACAGGCAAGGATTTACGTAGCAATACAACACAATACTGAGGCATATATATATATATGATTTA
AAATATGTCAAACATGTTAAAATTCCTTTATTGTATACCTTCCCAAGGTGCATAGATAAATTCACAGCTAC
>TRINITY_DN122253_c2_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:TGTGTATCCATATCGAAACCAGgtacttggacattgcagcatctgtgaaggtgcataattgaagaattgcattatattgaacgtattttttgttacgtactaaatcaaaatctttttactaaaaagggaactaaacatggttaccaaggcctacagttgactgtggcccaagttatagtaaatacctggatgagggacat
ctacctatggcattgagatgattgtagcattatttgtgtggaaactaggtgactgaatgaggcatgagttattggatagaagtcagtaaaagattacagaataacctggctagtacagtattttagctatatagaatattgtcagtctttgaagtcttatttttcttgccaattattatcacagatatctgttttccagt
ttttctgaatgtcattgtaatatacgaagatacatatagaagcaaatctcatgtcaacaaatatttgaatctttcctttcagtctcacaaaatattccaatagaattacgatgccatcagctattggttcaattttgacacctacatggaagctggagctagaatcagtgtaaaaatcacataaacacatctctgattag
tctaatgtgtgttaatttgcaaacttcttgattcaagttttcaactatggataatgccatgccagacagaaacagaaaacgggttttattttttagttcgattccaatgttccatgtattccacccaactggtgattcttcttggtgcacccatgtagagcatgagatgaaatgcagcatcaccctttttggtcgctcaa
atgacttttgtgtttcatgaaatcactagaggacattctctaggtgaaatacaatgtcaaaagaacaattccttatggtcatgactcataattgataaatctgtattactagttctttaagaaatataagggccattataggggttgtcaactgttgcatgtgaggggaacattgtatgggccatttttattattctatg
gcatggcatggtctgattgaagcaaaggcatgtcaacagcaattaaatgaatggttctaagtattagaagagttaactttctttgtgatgggtccttagttttgcaaaatctagttggttttatgttgtaatctagctcatctgttttgtctaccttcctttcacattaccatccttaaggggagttggagtaagatttt
cactaatatacaagaatgataaatccaggaatagtatagatgattaccatgttccgaatatccaaggtgtttttatattcagtcctgaaatgatttctggtatgaacagtattattaaccagtgggaggtttctttttatttgttttaccctacagGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATTGAGAC
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TTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGATGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTTTGTGAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTGCAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGAGGAGGTAGCTGTGAAAAAACAAACTCTT
AAAAGTGTCACAGGCTACATTACAGATGTGATCTGTAAACGAGCAGAGCGTGGGTACAATTATGGTGTTGTACTTATACCAGAGGGTCTTATTGACTTCATTCCAGAGGTGCAACAGTTGATTGCTGAGCTGAATGAGATTTTGGCCCATGATGTAATAGATGAAGGTGGCCTTTGGAAACAAAAACTGCAATCTCAATC
CCAAACGCTTTTTGACTTATTGCCTGGAAGTATTCAGGAGCAGTTGATGCTTGAAAGGGATCCTCATGGAAATGTGCAGGTTGCAAAAATAGAGACTGAAAAAATGCTTATATCGATGGTTGAAACTGAATTGGAAAAAAGAATGGAAGAGGGGACCTACAAAGGACATTTTAAGGGGCAATCACATTTCTTTGGCTATG
AGGGAAGGTGTGGATTGCCTACAAATTTTGATGCAACTTACTGCTATGCTCTGGGGTATGCGGCAGGAGTACTTCTTCATGCCGGACATACAGGCCTTATAGCTTCGGTTCGCAATTTGGCAGCACCAGCAAGAGATTGGATAGTTGGTGGAACTGCTCTTACACAACTCATGGATGTTGAGAGACGACAAGGAAAGTTC
AAACCTGTTATTAAGAAAGCTATGGTGGAACTAGATGGAGCACCATTCAAGAAGTTTGCTTCCATGCGAGAAGAGTGGGCTTTGCAAAATAAATACACCAATCCAGGTCCTATACAGTTTTTTGGTCCGACTGCAGACAAGAGCAACTTCACGTTGATGTTAGAACTTGGAGCCATGGCATGACTTTGTTACTCAAAACC
AAATTGCTAAATTTCTCAGGTTCTATAATATTTGGCTCTTGGTCACAGTACTAGCATTTTTGGACTTTTAGTTCTAGCAACTTGAAATAATAGTTCCCCATAGCAAGGATGCCCACCAAATCTCAATCCTGCGGTCTAATGAGGCACCATGTTTGGCAGCGCATGCCCGAGGAACCATGTTTGGTTCAACGAAGCTCATG
ATTGAAGTAGATGCTTGGTGACATATCTTGTTAATTTTTCACTCTCGTCTATCCTTTGGTTATGGGTGAAACATTGACAGCTTAGTCAACCTTTTGGAAAGGTTACGTGCTTGTTAAATTTCAAATAAAATATTTCCATTCTTTGGTAGAAGCATATGCTTTACCCAGTGCATTTGACACAGAGTTGAAGTTATGCTATA
GTTGTGTCACCTAGAGTAATATGCAACTTGACACAGAAATGCTTAGCAAATTAATTTTTCGGTTTAGATATAAGAATAGATCAATTACACACTTATCAGGCGATTTTGAAGCAGTTTTACAATGTGAGAATGAATTTTCCTTGATCAAAATAAGTCCTCCGTGCTTGTACTCCATTTAAGCAGAACAGGAAATTAAACAG
GCAAGGATTTACGTAGCAATACAACACAATACTGAGGCATATATATATATATGATTTAAAATATGTCAAACATGTTAAAATTCCTTTATTGTATACCTTCCCAAGGTGCATAGATAAATTCACAGCTAC
Intron 2 GTATATTTCA ... TGTGATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0.93 | 1002.1 | 12 | 6 |
| A2 | 0.27 | 764.9 | 3 | 1 |
| A3 | 0.72 | 856 | 8 | 4 |
| A4 | 0.6 | 769.1 | 3 | 6 |
| A5 | 0.42 | 368.4 | 3 | 0 |
| A6 | 0.13 | 399 | 1 | 0 |
| A7 | 0.07 | 1543.9 | 2 | 0 |
| A8 | 0 | 681.7 | 0 | 0 |
| A9 | 0 | 1220.4 | 0 | 0 |
| A10 | 0.15 | 1327.6 | 4 | 0 |
>TRINITY_DN113134_c10_g2_i3 from sample A3 / Example spliced isoformTAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGAAGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCTCTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTT
TGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGATCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTCCAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCA
GCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGCTGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACAGCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCC
AAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGGACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTATCCATATCGAAACCAGGTACTTGGACATTGCAGCATCTGTGAAGGTGCATAATTG
AAGAATTGCATTATATTGAACGTATTTTTTGTTACGTACTAAATCAAAATCTTTTTACTAAAAAGGGAACTAAACATGGTTACCAAGGCCTACAGTTGACTGTGGCCCAAGTTATAGTAAATACCTGGATGAGGGACATCTACCTATGGCATTGAGATGATTGTAGCATTATTTGTGTGGAAACTAGGTGACTGAATGAG
GCATGAGTTATTGGATAGAAGTCAGTAAAAGATTACAGAATAACCTGGCTAGTACAGTATTTTAGCTATATAGAATATTGTCAGTCTTTGAAGTCTTATTTTTCTTGCCAATTATTATCACAGATATCTGTTTTCCAGTTTTTCTGAATGTCATTGTAATATACGAAGATACATATAGAAGCAAATCTCATGTCAACAAA
TATTTGAATCTTTCCTTTCAGTCTCACAAAATATTCCAATAGAATTACGATGCCATCAGCTATTGGTTCAATTTTGACACCTACATGGAAGCTGGAGCTAGAATCAGTGTAAAAATCACATAAACACATCTCTGATTAGTCTAATGTGTGTTAATTTGCAAACTTCTTGATTCAAGTTTTCAACTATGGATAATGCCATG
CCAGACAGAAACAGAAAACGGGTTTTATTTTTTAGTTCGATTCCAATGTTCCATGTATTCCACCCAACTGGTGACTCTTCTTGGTGCACCCATGTAGAGCATGAGATGAAATGCAGCATCACCCTTTTTGGTCGCTCAAATGACTTTTGTGTTTCATGAAATCACTAGAGGACATTCTCTAGGTGAAATACAATGTCAAA
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TATTAGAAGAGTTAACTTTCTTTGTGATGGGTCCTTAGTTTTGCAAAATCTAGTTGGTTTTATGTTGTAATCTAGCTCATCTGTTTTGTCTACCTTCCTTTCACATTACCATCCTTAAGGGGAGTTGGAGTAAGATTTTCACTAATATACAAGAATGATAAATCCAGGAATAGTATAGATGATTACCATGTTCCGAATAT
CCAAGGTGTTTTTATATTCAGTCCTGAAATGATTTCTGGTATGAACAGTATTATTAACCAGTGGGAGGTTTCTTTTTATTTGTTTTACCCTACAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATTGAGACTCCTGAACAGTTCAGGCAAGCGGAGGAAACTGTACTGAATCTTGATTTAGATGGTCTTGTT
ATCATTGGTGGAGATGATTCAAATACAAATGCCTGCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGGTAATAAGATAGGATAACATAAGATGATTTTATTAATGTCCAATGAATGACCATAAAGTTGGTCAATGGGACTAGAAAGAACAGCCAATGTGTATACACAGTGGGAGTA
>TRINITY_DN113134_c10_g2_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:TAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGAAGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCTCTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTT
TGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGATCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTCCAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCA
GCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGCTGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACAGCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCC
AAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGGACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTATCCATATCGAAACCAGGTACTTGGACATTGCAGCATCTGTGAAGGTGCATAATTG
AAGAATTGCATTATATTGAACGTATTTTTTGTTACGTACTAAATCAAAATCTTTTTACTAAAAAGGGAACTAAACATGGTTACCAAGGCCTACAGTTGACTGTGGCCCAAGTTATAGTAAATACCTGGATGAGGGACATCTACCTATGGCATTGAGATGATTGTAGCATTATTTGTGTGGAAACTAGGTGACTGAATGAG
GCATGAGTTATTGGATAGAAGTCAGTAAAAGATTACAGAATAACCTGGCTAGTACAGTATTTTAGCTATATAGAATATTGTCAGTCTTTGAAGTCTTATTTTTCTTGCCAATTATTATCACAGATATCTGTTTTCCAGTTTTTCTGAATGTCATTGTAATATACGAAGATACATATAGAAGCAAATCTCATGTCAACAAA
TATTTGAATCTTTCCTTTCAGTCTCACAAAATATTCCAATAGAATTACGATGCCATCAGCTATTGGTTCAATTTTGACACCTACATGGAAGCTGGAGCTAGAATCAGTGTAAAAATCACATAAACACATCTCTGATTAGTCTAATGTGTGTTAATTTGCAAACTTCTTGATTCAAGTTTTCAACTATGGATAATGCCATG
CCAGACAGAAACAGAAAACGGGTTTTATTTTTTAGTTCGATTCCAATGTTCCATGTATTCCACCCAACTGGTGACTCTTCTTGGTGCACCCATGTAGAGCATGAGATGAAATGCAGCATCACCCTTTTTGGTCGCTCAAATGACTTTTGTGTTTCATGAAATCACTAGAGGACATTCTCTAGGTGAAATACAATGTCAAA
AGAACAATTCCTTATGGTCATGACTCATAATTGATAAATCTGTATTACTAGTTCTTTAAGAAATATAAGGGCCATTATAGGGGTTGTCAACTGTTGCATGTGAGGGGAACATTGTATGGGCCATTTTTATTATTCTATGGCATGGCATGGTCTGATTGAAGCAAAGGCATGTCAACAGCAATTAAATGAATGGTTCTAAG
TATTAGAAGAGTTAACTTTCTTTGTGATGGGTCCTTAGTTTTGCAAAATCTAGTTGGTTTTATGTTGTAATCTAGCTCATCTGTTTTGTCTACCTTCCTTTCACATTACCATCCTTAAGGGGAGTTGGAGTAAGATTTTCACTAATATACAAGAATGATAAATCCAGGAATAGTATAGATGATTACCATGTTCCGAATAT
CCAAGGTGTTTTTATATTCAGTCCTGAAATGATTTCTGGTATGAACAGTATTATTAACCAGTGGGAGGTTTCTTTTTATTTGTTTTACCCTACAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATTGAGACTCCTGAACAGgtatatttcaataactggcatctgttaccctttcaaacataacgtgcatgg
tgccatcaaatcatcttttctgactggatctggtccagtgggtctgtcccgtgaaggccaccatttcttgcactgatagtagttaatattcatcctagctattgtattttaatgagtcaatagatttactgataaaggttgcacatttgatgtgattcagTTCAGGCAAGCGGA
Intron 3 GTAATAAGAT ... CTGTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.53 | 1195 | 3 | 290 |
| A2 | 14.94 | 905 | 5 | 159 |
| A3 | 16.01 | 1007 | 2 | 192 |
| A4 | 15.96 | 842.5 | 4 | 160 |
| A5 | 15.13 | 505 | 0 | 90 |
| A6 | 17.15 | 546 | 0 | 113 |
| A7 | 15.59 | 2008 | 0 | 371 |
| A8 | 18.51 | 1039 | 0 | 236 |
| A9 | 15.61 | 1491.5 | 0 | 276 |
| A10 | 14.03 | 1679 | 0 | 274 |
>TRINITY_DN122253_c2_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformATACAACCAATTTAAAAAATATAACCAATGATTAATTAATTAAATTGTATGGTAAAAAATTCATAACTAATAGCGTTTCTGAAATCACGTGACATGTGACACACTAGCTTCCATTTTGAACATCCTTCAAGACAAAATAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGA
AGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCTCTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTTTGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGA
TCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTCCAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCAGCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGC
TGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACAGCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCCAAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGG
ACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTATCCATATCGAAACCAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATTGAGACTCCTGAACAGTTCAGGCAAGCGGAGGAAACTGTACTGAATCTTGATTTAGATGGTCTT
GTTATCATTGGTGGAGATGATTCAAATACAAATGCCTGCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGGGAGAAAAACTTAAAAACGCAGGTGATTGGCTGTCCAAAAACAATTGATGGTGATCTTAAATCTAAGGAAGTTCCAACAAGTTTTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGA
TGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTTTGTGAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTGCAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGAGGAGGTAGCTGTGAAAAAACAAACTCTTAAAAGTGTCACAGGCTACATTACAGATGTGATCTGTAAACGAGCAGAGCGTGGGTACA
ATTATGGTGTTGTACTTATACCAGAGGGTCTTATTGACTTCATTCCAGAGGTGCAACAGTTGATTGCTGAGCTGAATGAGATTTTGGCCCATGATGTAATAGATGAAGGTGGCCTTTGGAAACAAAAACTGCAATCTCAATCCCAAACGCTTTTTGACTTATTGCCTGGAAGTATTCAGGAGCAGTTGATGCTTGAAAGG
GATCCTCATGGAAATGTGCAGGTTGCAAAAATAGAGACTGAAAAAATGCTTATATCGATGGTTGAAACTGAATTGGAAAAAAGAATGGAAGAGGGGACCTACAAAGGACATTTTAAGGGGCAATCACATTTCTTTGGCTATGAGGGAAGGTGTGGATTGCCTACAAATTTTGATGCAACTTACTGCTATGCTCTGGGGTA
TGCGGCAGGAGTACTTCTTCATGCCGGACATACAGGCCTTATAGCTTCGGTTCGCAATTTGGCAGCACCAGCAAGAGATTGGATAGTTGGTGGAACTGCTCTTACACAACTCATGGATGTTGAGAGACGACAAGGAAAGTTCAAACCTGTTATTAAGAAAGCTATGGTGGAACTAGATGGAGCACCATTCAAGAAGTTTG
CTTCCATGCGAGAAGAGTGGGCTTTGCAAAATAAATACACCAATCCAGGTCCTATACAGTTTTTTGGTCCGACTGCAGACAAGAGCAACTTCACGTTGATGTTAGAACTTGGAGCCATGGCATGACTTTGTTACTCAAAACCAAATTGCTAAATTTCTCAGGTTCTATAATATTTGGCTCTTGGTCACAGTACTAGCATT
TTTGGACTTTTAGTTCTAGCAACTTGAAATAATAGTTCCCCATAGCAAGGATGCCCACCAAATCTCAATCCTGCGGTCTAATGAGGCACCATGTTTGGCAGCGCATGCCCGAGGAACCATGTTTGGTTCAACGAAGCTCATGATTGAAGTAGATGCTTGGTGACATATCTTGTTAATTTTTCACTCTCGTCTATCCTTTG
GTTATGGGTGAAACATTGACAGCTTAGTCAACCTTTTGGAAAGGTTACGTGCTTGTTAAATTTCAAATAAAATATTTCCATTCTTTGGTAGAAGCATATGCTTTACCCAGTGCATTTGACACAGAGTTGAAGTTATGCTATAGTTGTGTCACCTAGAGTAATATGCAACTTGACACAGAAATGCTTAGCAAATTAATTTT
TCGGTTTAGATATAAGAATAGATCAATTACACACTTATCAGGCGATTTTGAAGCAGTTTTACAATGTGAGAATGAATTTTCCTTGATCAAAATAAGTCCTCCGTGCTTGTACTCCATTTAAGCAGAACAGGAAATTAAACAGGCAAGGATTTACGTAGCAATACAACACAATACTGAGGCATATATATATATATGATTTA
AAATATGTCAAACATGTTAAAATTCCTTTATTGTATACCTTCCCAAGGTGCATAGATAAATTCACAGCTAC
>TRINITY_DN122253_c2_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:GCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGgtaataagataggataacataagatgattttattaatgtccaatgaatgaccataaagttggtcaatgggactagaaagaacagccaatgtgtatacacagtgggagtacgaaagcaactcctatcactaatctactaaaagcagagaaagatccaactaactagccaatggacacac
aagaagtattgcaaatatcttcagtagctgaaaattgatggttctagataaaatttaaggttacatattcatttatatacacgtagatgcatgtgttaatcatcattggggcatttatgagaaaattttcaaactttgttttcctggaagtcataatgtttcagttcattaaataatgaattgtttgcataaaaacagag
ttaaaagacaggaaatatgcatgaatgagatgcagatttttgaagatgcactttttaagctgagatagtgtcctttaattgtatggcattcagttagtctctagagtacttaagttgattgacatgtttgtttgtctgttttcagGGAGAAAAACTTAAAAACGCAGGTGATTGGCTGTCCAAAAACAATTGATGGTGAT
CTTAAATCTAAGGAAGTTCCAACAAGTTTTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGATGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTTTGTGAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTGCAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGA
GGAGGTAGCTGTGAAAAAACAAACTCTTAAAAGTGTCACAGGCTACATTACAGATGTGATCTGTAAACGAGCAGAGCGTGGGTACAATTATGGTGTTGTACTTATACCAGAGGGTCTTATTGACTTCATTCCAGAGGTGCAACAGTTGATTGCTGAGCTGAATGAGATTTTGGCCCATGATGTAATAGATGAAGGTGGCC
TTTGGAAACAAAAACTGCAATCTCAATCCCAAACGCTTTTTGACTTATTGCCTGGAAGTATTCAGGAGCAGTTGATGCTTGAAAGGGATCCTCATGGAAATGTGCAGGTTGCAAAAATAGAGACTGAAAAAATGCTTATATCGATGGTTGAAACTGAATTGGAAAAAAGAATGGAAGAGGGGACCTACAAAGGACATTTT
AAGGGGCAATCACATTTCTTTGGCTATGAGGGAAGGTGTGGATTGCCTACAAATTTTGATGCAACTTACTGCTATGCTCTGGGGTATGCGGCAGGAGTACTTCTTCATGCCGGACATACAGGCCTTATAGCTTCGGTTCGCAATTTGGCAGCACCAGCAAGAGATTGGATAGTTGGTGGAACTGCTCTTACACAACTCAT
GGATGTTGAGAGACGACAAGGAAAGTTCAAACCTGTTATTAAGAAAGCTATGGTGGAACTAGATGGAGCACCATTCAAGAAGTTTGCTTCCATGCGAGAAGAGTGGGCTTTGCAAAATAAATACACCAATCCAGGTCCTATACAGTTTTTTGGTCCGACTGCAGACAAGAGCAACTTCACGTTGATGTTAGAACTTGGAG
CCATGGCATGACTTTGTTACTCAAAACCAAATTGCTAAATTTCTCAGGTTCTATAATATTTGGCTCTTGGTCACAGTACTAGCATTTTTGGACTTTTAGTTCTAGCAACTTGAAATAATAGTTCCCCATAGCAAGGATGCCCACCAAATCTCAATCCTGCGGTCTAATGAGGCACCATGTTTGGCAGCGCATGCCCGAGG
AACCATGTTTGGTTCAACGAAGCTCATGATTGAAGTAGATGCTTGGTGACATATCTTGTTAATTTTTCACTCTCGTCTATCCTTTGGTTATGGGTGAAACATTGACAGCTTAGTCAACCTTTTGGAAAGGTTACGTGCTTGTTAAATTTCAAATAAAATATTTCCATTCTTTGGTAGAAGCATATGCTTTACCCAGTGCA
TTTGACACAGAGTTGAAGTTATGCTATAGTTGTGTCACCTAGAGTAATATGCAACTTGACACAGAAATGCTTAGCAAATTAATTTTTCGGTTTAGATATAAGAATAGATCAATTACACACTTATCAGGCGATTTTGAAGCAGTTTTACAATGTGAGAATGAATTTTCCTTGATCAAAATAAGTCCTCCGTGCTTGTACTC
CATTTAAGCAGAACAGGAAATTAAACAGGCAAGGATTTACGTAGCAATACAACACAATACTGAGGCATATATATATATATGATTTAAAATATGTCAAACATGTTAAAATTCCTTTATTGTATACCTTCCCAAGGTGCATAGATAAATTCACAGCTAC
Intron 4 GTAAGTAACC ... TGTTATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 10.21 | 950 | 108 | 14 |
| A2 | 12.42 | 691 | 98 | 8 |
| A3 | 9.93 | 762 | 84 | 13 |
| A4 | 10.76 | 771 | 93 | 8 |
| A5 | 14.04 | 306 | 50 | 2 |
| A6 | 10.3 | 479 | 55 | 6 |
| A7 | 9.65 | 1639 | 175 | 2 |
| A8 | 8.97 | 1188 | 117 | 7 |
| A9 | 11.88 | 1320 | 178 | 7 |
| A10 | 11.16 | 1266 | 159 | 0 |
>TRINITY_DN113134_c10_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoformTAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGAAGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCTCTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTT
TGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGATCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTCCAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCA
GCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGCTGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACAGCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCC
AAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGGACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTATCCATATCGAAACCAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATT
GAGACTCCTGAACAGTTCAGGCAAGCGGAGGAAACTGTACTGAATCTTGATTTAGATGGTCTTGTTATCATTGGTGGAGATGATTCAAATACAAATGCCTGCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGGGAGAAAAACTTAAAAACGCAGGTGATTGGCTGTCCAAAAACAATTGATGGTGATCTTAAATCTAAGGAAGTTCCAAC
AAGTTTTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGATGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTTTGTGAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTGCAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGAGGAGGTAGCTGTGAAAAAACAAA
CTCTTAAAAGTGTCACAGGCTACATTACAGATGTGATCTGTAAACGAGCAGAGCGTGGGTACAATTATGGTGTTGTACTTATACCAGAGGGTCTTATTGACTTCATTCCAGAGGTGCAACAGTTGATTGCTGAGCTGAATGAGATTTTGGCCCATGATGTAATAGATGAAGGTGGCCTTTGGAAACAAAAACTGCAATCT
CAATCCCAAACGCTTTTTGACTTATTGCCTGGAAGTATTCAGGAGCAGTTGATGCTTGAAAGGGATCCTCATGGAAATGTGCAGGTTGCAAAAATAGAGACTGAAAAAATGCTTATATCGATGGTTGAAACTGAATTGGAAAAAAGAATGGAAGAGGGGACCTACAAAGGACATTTTAAGGGGCAATCACATTTCTTTGG
CTATGAGGGAAGGTGTGGATTGCCTACAAATTTTGATGCAACTTACTGCTATGCTCTGGGGTATGCGGCAGGAGTACTTCTTCATGCCGGACATACAGGCCTTATAGCTTCGGTTCGCAATTTGGCAGCACCAGCAAGAGATTGGATAGTTGGTGGAACTGCTCTTACACAACTCATGGATGTTGAGAGACGACAAGGAA
AGTTCAAACCTGTTATTAAGAAAGCTATGGTGGAACTAGATGGAGCACCATTCAAGAAGTTTGCTTCCATGCGAGAAGAGTGGGCTTTGCAAAATAAATACACCAATCCAGGTCCTATACAGTTTTTTGGTCCGACTGCAGACAAGAGCAACTTCACGTTGATGTTAGAACTTGGAGCCATGGCATGACTTTGTTACTCA
AAACCAAATTGCTAAATTTCTCAGGTTCTATAATATTTGGCTCTTGGTCACAGTACTAGCATTTTTGGACTTTTAGTTCTAGCAACTTGAAATAATAGTTCCCCATAGCAAGGATGCCCACCAAATCTCAATCCTGCGGTCTAATGAGGCACCATGTTTGGCAGCGCATGCCCGAGGAACCATGTTTGGTTCAACGAAGC
TCATGATTGAAGTAGATGCTTGGTGACATATCTTGTTAATTTTTCACTCTCGTCTATCCTTTGGTTATGGGTGAAACATTGACAGCTTAGTCAACCTTTTGGAAAGGTTACGTGCTTGTTAAATTTCAAATAAAATATTTCCATTCTTTGGTAGAAGCATATGCTTTACCCAGTGCATTTGACACAGAGTTGAAGTTATG
CTATAGTTGTGTCACCTAGAGTAATATGCAACTTGACACAGAAATGCTTAGCAAATTAATTTTTCGGTTTAGATATAAGAATAGATCAATTACACACTTATCAGGCGATTTTGAAGCAGTTTTACAATGTGAGAATGAATTTTCCTTGATCAAAATAAGTCCTCCGTGCTTGTACTCCATTTAAGCAGAACAGGAAATTA
AACAGGCAAGGATTTACGTAGCAATACAACACAATACTGAGGCATATATATATATATGATTTAAAATATGTCAAACATGTTAAAATTCCTTTATTGTATACCTTCCCAAGGTGCATAGATAAATTCACAGCTACTAGAGTCGACCAAAAGAATGACCCAGC
>TRINITY_DN113134_c10_g2_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:TAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGAAGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCTCTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTT
TGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGATCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTCCAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCA
GCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGCTGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACAGCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCC
AAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGGACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTATCCATATCGAAACCAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATT
GAGACTCCTGAACAGTTCAGGCAAGCGGAGGAAACTGTACTGAATCTTGATTTAGATGGTCTTGTTATCATTGGTGGAGATGATTCAAATACAAATGCCTGCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGGGAGAAAAACTTAAAAACGCAGGTGATTGGCTGTCCAAAAACAATTGATGGTGATCTTAAATCTAAGGAAGTTCCAAC
AAGTTTTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGATGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTgtaagtaacctgtctgtctagaaataaacaaaaaatcccaaaagccaaaaaacaaaaaatcattatttgtcagtaaagtgtctgtctgaaaaaccggcatattcataa
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GAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTGCAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGAGGAGGTGACTTCCTTTCTCATACCTTTCTCATATCTTATCCCTCCACCTCTATGGAAAATGAAGGATACTATAAGTGTTGATACATTATAAAGTGATTTACTTGACACTGAAACTAAT
Intron 5 GTTCGCAATT ... AGACGACAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 69.39 | 548 | 1519 | 965 |
| A2 | 66.86 | 550 | 1273 | 946 |
| A3 | 69.04 | 523 | 1340 | 993 |
| A4 | 71.04 | 375 | 1063 | 777 |
| A5 | 68.28 | 164 | 434 | 272 |
| A6 | 67.15 | 802 | 1732 | 1547 |
| A7 | 68.78 | 1910 | 4661 | 3754 |
| A8 | 68.54 | 1770 | 4155 | 3559 |
| A9 | 65.81 | 1714 | 3555 | 3042 |
| A10 | 67.56 | 1527 | 3685 | 2674 |
>TRINITY_DN33403_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoformAATCACGTGACATGTGACACACTAGCTTCCATTTTGAACATCCTTCAAGACAAAATAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGAAGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCT
CTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTTTGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGATCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTC
CAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCAGCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGCTGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACA
GCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCCAAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGGACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTA
TCCATATCGAAACCAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATTGAGACTCCTGAACAGTTCAGGCAAGCGGAGGAAACTGTACTGAATCTTGATTTAGATGGTCTTGTTATCATTGGTGGAGATGATTCAAATACAAATGCCTGCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGGGAGAAAAACTTAAAAACGCAGG
TGATTGGCTGTCCAAAAACAATTGATGGTGATCTTAAATCTAAGGAAGTTCCAACAAGTTTTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGATGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTTTGTGAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTG
CAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGAGGAGGTAGCTGTGAAAAAACAAACTCTTAAAAGTGTCACAGGCTACATTACAGATGTGATCTGTAAACGAGCAGAGCGTGGGTACAATTATGGTGTTGTACTTATACCAGAGGGTCTTATTGACTTCATTCCAGAGGTGCAACAGTTGATTGCTGAGCTGAATGAGAT
TTTGGCCCATGATGTAATAGATGAAGGTGGCCTTTGGAAACAAAAACTGCAATCTCAATCCCAAACGCTTTTTGACTTATTGCCTGGAAGTATTCAGGAGCAGTTGATGCTTGAAAGGGATCCTCATGGAAATGTGCAGGTTGCAAAAATAGAGACTGAAAAAATGCTTATATCGATGGTTGAAACTGAATTGGAAAAAA
GAATGGAAGAGGGGACCTACAAAGGACATTTTAAGGGGCAATCACATTTCTTTGGCTATGAGGGAAGGTGTGGATTGCCTACAAATTTTGATGCAACTTACTGCTATGCTCTGGGGTATGCGGCAGGAGTACTTCTTCATGCCGGACATACAGGCCTTATAGCTTCGGAAAGTTCAAACCTGTTATTAAGAAAGCTATGG
TGGAACTAGATGGAGCACCATTCAAGAAGTTTGCTTCCATGCGAGAAGAGTGGGCTTTGCAAAATAAATACACCAATCCAGGTCCTATACAGTTTTTTGGTCCGACTGCAGACAAGAGCAACTTCACGTTGATGTTAGAACTTGGAGCCATGGCATGACTTTGTTACTCAAAACCAAATTGCTAAATTTCTCAGGTTCTA
TAATATTTGGCTCTTGGTCACAGTACTAGCATTTTTGGACTTTTAGTTCTAGCAACTTGAAATAATAGTTCCCCATAGCAAGGATGCCCACCAAATCTCAATCCTGCGGTCTAATGAGGCACCATGTTTGGCAGCGCATGCCCGAGGAACCATGTTTGGTTCAACGAAGCTCATGATTGAAGTAGATGCTTGGTGACATA
TCTTGTTAATTTTTCACTCTCGTCTATCCTTTGGTTATGGGTGAAACATTGACAGCTTAGTCAACCTTTTGGAAAGGTTACGTGCTTGTTAAATTTCAAATAAAATATTTCCATTCTTTGGTAGAAGCATATGCTTTACCCAGTGCATTTGACACAGAGTTGAAGTTATGCTATAGTTGTGTCACCTAGAGTAATATGCA
ACTTGACACAGAAATGCTTAGCAAATTAATTTTTCGGTTTAGATATAAGAATAGATCAATTACACACTTATCAGGCGATTTTGAAGCAGTTTTACAATGTGAGAATGAATTTTCCTTGATCAAAATAAGTCCTCCGTGCTTGTACTCCATTTAAGCAGAACAGGAAATTAAACAGGCAAGGATTTACGTAGCAATACAAC
ACAATACTGAGGCATATATATATATATGATTTAAAATATGTCAAACATGTTAAAATTCCTTTATTGTATACCTTCCCAAGGTGCATAGATAAATTCACAGCTACTAGAGTCGACCAAAAGAATGACTCAGCTTGGTTGAAGACTTCCTAATATGCGAGTTACTAGAGCAGACTCTGAGATTGACTCAGCGTTGCTCAAGG
TTAAGATTTGATTTAGACTTGGGAAAAAGTGGATAGCTGATTTGGAAAATTCAAAAATAAAAAATTATACCATAAAATATAATTTTATTAATATGAAAGTTTACAGTTCCT
>TRINITY_DN33403_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:AATCACGTGACATGTGACACACTAGCTTCCATTTTGAACATCCTTCAAGACAAAATAAAAAAATACCTTAAAAAATAAATCCATCTGAAAGTCCAATCAACCAGTCCGTCAAATACGAAGTTATTTTGCCGGCGAGACACGCCGGCGTCTACTTCTCCTAACAACTACCATTATTATCCACAACAAAACCCTGCCTACCT
CTGCATTATTTGAAGGCTTTTCAAGAACTGGAATCTTCCTTAGGGTCACTGATTTTGCAGAATCAATCGCTTAACAATCAGCGGCCATTACACGGCTGTGCAGACTGTATTGCCCCGATCCCAACTCGATAGATTTTGCGGGAAAAGAATGGCGAAATCCGTGCCCAACGGGGATGCTTCTGCACAGAAGCAAGCGGCTC
CAACGAGGGACATTTCTGTTTACAGTGAGGTGCAATCGAGTCGTCTGGATCATCAGCTACCCCTGCCTAGCGTGTTAGAGGCGCCATTTAAGCTCGTCAGCGGACCTCCTACTACTGCTGCTGGCAGTCCAGAGGAGATTGCTAAGCTATTTCCGCAACTTTACGGACAGGCATCGGTCCAGCTCGTGCCAAGCGATACA
GCGGCTTTAAAGTCAGACCGGAAATTGAACATCGGTGTCGTGCTTTCCGGTGGCCAAGCTCCAGGTGGTCACAATGTTATTGCAGGATTGTTCGATTATGTCCAAAATAACACTAAGGACAGCACTTTGTTTGGATTCAAAGGTGGCCCAGCAGGAGTAATGAAATGTAAATATGTTGAGATGACAAAAGAGTTTGTGTA
TCCATATCGAAACCAGGGTGGCTTTGACATTATTTGCAGCGGCCGAGACAAAATTGAGACTCCTGAACAGTTCAGGCAAGCGGAGGAAACTGTACTGAATCTTGATTTAGATGGTCTTGTTATCATTGGTGGAGATGATTCAAATACAAATGCCTGCCTTCTTGCAGAAAAATTCAGGGAGAAAAACTTAAAAACGCAGG
TGATTGGCTGTCCAAAAACAATTGATGGTGATCTTAAATCTAAGGAAGTTCCAACAAGTTTTGGGTTCGACACAGCTTGTAAGATTTATGCAGAGATGATAGGGAATGTGATGGTTGATGCAAGATCAACTGGAAAGTATTATCACTTTGTGAGGCTTATGGGCCGTGCAGCTTCGCACATTACACTAGAATGTGCTTTG
CAGACACATCCCAACATTACTGTAATTGGCGAGGAGGTAGCTGTGAAAAAACAAACTCTTAAAAGTGTCACAGGCTACATTACAGATGTGATCTGTAAACGAGCAGAGCGTGGGTACAATTATGGTGTTGTACTTATACCAGAGGGTCTTATTGACTTCATTCCAGAGGTGCAACAGTTGATTGCTGAGCTGAATGAGAT
TTTGGCCCATGATGTAATAGATGAAGGTGGCCTTTGGAAACAAAAACTGCAATCTCAATCCCAAACGCTTTTTGACTTATTGCCTGGAAGTATTCAGGAGCAGTTGATGCTTGAAAGGGATCCTCATGGAAATGTGCAGGTTGCAAAAATAGAGACTGAAAAAATGCTTATATCGATGGTTGAAACTGAATTGGAAAAAA
GAATGGAAGAGGGGACCTACAAAGGACATTTTAAGGGGCAATCACATTTCTTTGGCTATGAGGGAAGGTGTGGATTGCCTACAAATTTTGATGCAACTTACTGCTATGCTCTGGGGTATGCGGCAGGAGTACTTCTTCATGCCGGACATACAGGCCTTATAGCTTCGgttcgcaatttggcagcaccagcaagagattgg
atagttggtggaactgctcttacacaactcatggatgttgagagacgacaagGAAAGTTCAAACCTGTTATTAAGAAAGCTATGGTGGAACTAGATGGAGCACCATTCAAGAAGTTTGCTTCCATGCGAGAAGAGTGGGCTTTGCAAAATAAATACACCAATCCAGGTCCTATACAGTTTTTTGGTCCGACTGCAGACAA
GAGCAACTTCACGTTGATGTTAGAACTTGGAGCCATGGCATGACTTTGTTACTCAAAACCAAATTGCTAAATTTCTCAGGTTCTATAATATTTGGCTCTTGGTCACAGTACTAGCATTTTTGGACTTTTAGTTCTAGCAACTTGAAATAATAGTTCCCCATAGCAAGGATGCCCACCAAATCTCAATCCTGCGGTCTAAT
GAGGCACCATGTTTGGCAGCGCATGCCCGAGGAACCATGTTTGGTTCAACGAAGCTCATGATTGAAGTAGATGCTTGGTGACATATCTTGTTAATTTTTCACTCTCGTCTATCCTTTGGTTATGGGTGAAACATTGACAGCTTAGTCAACCTTTTGGAAAGGTTACGTGCTTGTTAAATTTCAAATAAAATATTTCCATT
CTTTGGTAGAAGCATATGCTTTACCCAGTGCATTTGACACAGAGTTGAAGTTATGCTATAGTTGTGTCACCTAGAGTAATATGCAACTTGACACAGAAATGCTTAGCAAATTAATTTTTCGGTTTAGATATAAGAATAGATCAATTACACACTTATCAGGCGATTTTGAAGCAGTTTTACAATGTGAGAATGAATTTTCC
TTGATCAAAATAAGTCCTCCGTGCTTGTACTCCATTTAAGCAGAACAGGAAATTAAACAGGCAAGGATTTACGTAGCAATACAACACAATACTGAGGCATATATATATATATGATTTAAAATATGTCAAACATGTTAAAATTCCTTTATTGTATACCTTCCCAAGGTGCATAGATAAATTCACAGCTACTAGAGTCGACC
AAAAGAATGACTCAGCTTGGTTGAAGACTTCCTAATATGCGAGTTACTAGAGCAGACTCTGAGATTGACTCAGCGTTGCTCAAGGTTAAGATTTGATTTAGACTTGGGAAAAAGTGGATAGCTGATTTGGAAAATTCAAAAATAAAAAATTATACCATAAAATATAATTTTATTAATATGAAAGTTTACAGTTCCT