NA ----> NA

Intron 1 GTGCGTCTTT ... GGGTTTTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	28	18	10	4
A2	11.76	30	5	3
A3	19.72	57	9	19
A4	10.34	39	6	3
A5	26.09	17	5	7
A6	17.14	87	14	22
A7	13.19	158	27	21
A8	12.84	95	11	17
A9	9.83	156	16	18
A10	19.87	123	22	39

>TRINITY_DN111370_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

GGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTAGCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTAT
AAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGTTGCTTGCCAGAACTTGGGTCCATTGAACAAGGGTGGGACAGTTATTGGTATTGACGTAAAGAACAGAAAGTGAAGGTGCCTTCAGCTTACTGCGATGAACGAGTCCAAACAGTGTGTGGGGATGTTATGAAACTTATGTCTGG
ACAACTAAGAGCACTGTCACCTCAGGTAATGTGATATTATTATTGAATTGGATGAACTGCACTTTGAACTGGATGCTTTTGAAATTAGAATCCACTTGTTTATATAATATGCCCAGTTTTTCTACTTCTATAATAGCAGAGTTAAAGTGTACCTGTTAAGTTTTATTGAACCGTTCTCATAATAGTGATGCTACTTTCAC
CAACTAGCAAGCAGCTGTAATTGTATTCATCAAAGTTATGCATCTGTTTTACTTCTGCAACATTTTTCCTTCTTGGAATTTAGTTCTATTGGCTACTAGGTAGTGGGCACAAAGGCTGATAAGATTAAGTTTAAGCCATAGAATCTGATCAGAAAAGGTTTCTCACTGTTTGAATATATAAAAATTTAGAGGAACTTGTG
GGCCACTTGAAGGTCAAACTTTCAGAGTGAAGTAGCCTGAAGTCTCTCTACCTTTGCAAGGTTGGAAATTTGGAGTTTGATAGAATCATGCTTGACTGCTGGCAGAAGAGAGTAGAATAATGGTTAGTGGGGTGTTCCCAGAATGTACACGGATGCTACACTCTTTTCAAGTAGTGGACTCCATACACTAGTATCCTTTT
GAGATAATCATTCCTGAGCACTTGCATCACTTTTACATGCCAATTCTGTCACTTCTACCTCCTTACCATCCTGACATTAATGTCTTATTTATATTAGTTTTCTATTTTTGGGTATGGTGTGAGGTTGGCAGCCGGTTCACACCATATTGCCCCTCCCCCCCTCTCTTGTGCTTCTTTGTCTTTGGCAATGACTATTCTTC
TCATCATTCTTTTTGCTTCGTCATTCGCTAAGTATATGGCTCTTATAAGTTATTACTTCGCTTCGTAGACTGTTAGGTTCCTTCAAGATTCACTTATACCGTTTTGTATAGAAAGCTTTAATTACCAGATCCACTCGCCTTCTTCCTGCTCGCCCTGCTCACATTGTCCTTGCCACTTTTTTCCAGGCTAGGATATGCAA
CTTCTTCTACCCTCTTGGTCCTTTCCATTGGAAAAATTTGAAAATGCTTTCCAAATTTGATAAACAGTTGTTGGGGCCATCAGAATGGTACTTTGATATAGAGGAATCACTGGGAGCACTGATTAAATGAGCACTGTTTTCCTGCCAAAGAAAGATATTTATTGGTCCAAGAGTTTGAATTGCTTATTAACTTATCAATA
ATCAGATCCCAGTCTCTTTCCGTATGATTAGCCTCCAAGATAATGAAGCCAAAGTATTTTG

>TRINITY_DN111370_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTAGCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTAT
AAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGTTGCTTGCCAGAACTTGGGTCCATTGAACAAGGGTGGGACAGTTATTGGTATTGACGTAAAGgtgcgtctttggctcttttcatattgtcaagcacattctgatgttctttcagtatcctgtatatgcagcttggataagatct
gattattgcaaaatataggaggatatctcatgtgtgtgtgaataaaatcgggggttttcagAACAGAAAGTGAAGGTGCCTTCAGCTTACTGCGATGAACGAGTCCAAACAGTGTGTGGGGATGTTATGAAACTTATGTCTGGACAACTAAGAGCACTGTCACCTCAGG

Intron 2 GTTGCTTGCC ... GTCACCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	75.7	6.5	12	27
A2	68.28	13.5	20	32
A3	76.91	10.5	13	56
A4	73.61	15	28	49
A5	88.86	2	9	22
A6	69.4	43	74	106
A7	74.53	57	87	231
A8	66.45	52.5	48	156
A9	64.97	92	95	235
A10	73.29	65.5	96	246

>TRINITY_DN42234_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

AGAAGATCCATGTATATCCCAGTTTAATACATTTTGAATGCAAATTGAATGGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTA
GCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTATAAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGGAAAAGGTTATTCAGTAATTTTATCAGACATGTGTCCTCCAGTTTCTGGAATACACACGAAGGATACAGCCTTATCCTGCGAATTGGGGACTCG
TGCACTTACCTTGGCATTGGGTGAAATCGATTTGGAAGATACAAATAATGCATCTAGTACTCTAAAAGATGAAGAAGCACATGGTTATGCACAGTGTGATGCTTGTGAAGGCATGCTTCAGCTGCGGGGAAGTCTTGTCATTAAGTTTCTTGAATGTGAAGAAAGCCAAGGATTTCCCAAATTTTGCAAAAAACATTTTA
GAAAAGTATCCTGGTTGAGGCCAAAAGCAACACGTTCTTCCTCCAGAGAGATATACTTGATTTGTCAAGATTTGAGATGACCTCTTCTATGCAACAGAGATTTTAGTGTTCCACAAGGAAATTGATGAATGGTGTTGATAGTAGGTTTTTGAAGTCAGTGACATGGAAGGGGGATAATTTATTATTGCAGAAATGCATTT
CATTTATATGCTCCTTGTATGCCTACCCATAGAAGTACATTAGGACTAACAAATCAAGGTGTTTTGAGGCGAGTGATTAGGCACTTGGGATTTTCCAAGGCCATTCACATCAAATAGTTTTGCAGTATAGTCATATGGGGGTCACACTTTCTGGAGACGGGCTTCAATCGTCTGCCAAGTTTTCAAGTAGGTCACCTGTC
TGTATTTGTTAGCAAAGCATTGCTATAAATTGTGCTTTGAAAATCATGACAATTGCTTGCTTCTCAGATGTAACAATGAGATGAAATAAATGGATTCAACTTGCATGAAAGTTTAAAAAATGGGTATTTTGGAGTAGATCACAGGGACAAAAGCCACTAGAGCATGGATATATACAGGTTTGAGGTTGAGGGGATTATGT
AAGGGTTAAAATCCACTTTTCTTTTCACCATCCTTTGATATTTTATTTAATTGCTCTTGATATTTATTCCAACTTTTCAATCTGTTTTTAAACTGTCATTTCCTGATTCTATTATGGATAAGATATGCAAAATGGTTCAGGTTGAGTGCATTTCTCCCTCCTTACCATCTATATCACATATTTATATATTCTATATGGAT
TATAGATGCGGGGTTCTCTATTTCGAACAAACCCATTTTGAATCAGGATTCAGGGTACAATAAAAGGCATTTAC

>TRINITY_DN42234_c0_g1_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AGAAGATCCATGTATATCCCAGTTTAATACATTTTGAATGCAAATTGAATGGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTA
GCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTATAAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGgttgcttgccagaacttgggtccattgaacaagggtgggacagttattggtattgacgtaaaggaggatatctcatgtgtgtgtgaataaaatcg
ggggttttcagaacagaaagtgaaggtgccttcagcttactgcgatgaacgagtccaaacagtgtgtggggatgttatgaaacttatgtctggacaactaagagcactgtcacctcagGGAAAAGGTTATTCAGTAATTTTATCAGACATGTGTCCTCCAGTTTCTGGAATACACACGAAGGATACAGCCTTATCCTGCG
AATTGGGGACTCGTGCACTTACCTTGGCATTGGGTGAAATCGATTTGGAAGATACAAATAATGCATCTAGTACTCTAAAAGATGAAGAAGCACATGGTTATGCACAGTGTGATGCTTGTGAAGGCATGCTTCAGCTGCGGGGAAGTCTTGTCATTAAGTTTCTTGAATGTGAAGAAAGCCAAGGATTTCCCAAATTTTGC
AAAAAACATTTTAGAAAAGTATCCTGGTTGAGGCCAAAAGCAACACGTTCTTCCTCCAGAGAGATATACTTGATTTGTCAAGATTTGAGATGACCTCTTCTATGCAACAGAGATTTTAGTGTTCCACAAGGAAATTGATGAATGGTGTTGATAGTAGGTTTTTGAAGTCAGTGACATGGAAGGGGGATAATTTATTATTG
CAGAAATGCATTTCATTTATATGCTCCTTGTATGCCTACCCATAGAAGTACATTAGGACTAACAAATCAAGGTGTTTTGAGGCGAGTGATTAGGCACTTGGGATTTTCCAAGGCCATTCACATCAAATAGTTTTGCAGTATAGTCATATGGGGGTCACACTTTCTGGAGACGGGCTTCAATCGTCTGCCAAGTTTTCAAG
TAGGTCACCTGTCTGTATTTGTTAGCAAAGCATTGCTATAAATTGTGCTTTGAAAATCATGACAATTGCTTGCTTCTCAGATGTAACAATGAGATGAAATAAATGGATTCAACTTGCATGAAAGTTTAAAAAATGGGTATTTTGGAGTAGATCACAGGGACAAAAGCCACTAGAGCATGGATATATACAGGTTTGAGGTT
GAGGGGATTATGTAAGGGTTAAAATCCACTTTTCTTTTCACCATCCTTTGATATTTTATTTAATTGCTCTTGATATTTATTCCAACTTTTCAATCTGTTTTTAAACTGTCATTTCCTGATTCTATTATGGATAAGATATGCAAAATGGTTCAGGTTGAGTGCATTTCTCCCTCCTTACCATCTATATCACATATTTATAT
ATTCTATATGGATTATAGATGCGGGGTTCTCTATTTCGAACAAACCCATTTTGAATCAGGATTCAGGGTACAATAAAAGGCATTTAC

Intron 3 GTGCGTCTTT ... TTCAGAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.32	21	10	5
A2	10.53	34	5	3
A3	17.72	65	9	19
A4	9.28	44	6	3
A5	26.09	17	5	7
A6	15.93	95	14	22
A7	11.88	178	27	21
A8	11.76	105	11	17
A9	8.72	178	16	18
A10	17.18	147	22	39

>TRINITY_DN111370_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform

GGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTAGCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTAT
AAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGTTGCTTGCCAGAACTTGGGTCCATTGAACAAGGGTGGGACAGTTATTGGTATTGACGTAAAGAAAGTGAAGGTGCCTTCAGCTTACTGCGATGAACGAGTCCAAACAGTGTGTGGGGATGTTATGAAACTTATGTCTGGACAAC
TAAGAGCACTGTCACCTCAGGGAAAAGGTTATTCAGTAATTTTATCAGACATGTGTCCTCCAGTTTCTGGAATACACACGAAGGATACAGCCTTATCCTGCGAATTGGGGACTCGTGCACTTACCTTGGCATTGGGTGAAATCGATTTGGAAGATACAAATAATGCATCTAGTACTCTAAAAGATGAAGAAGCACATGGT
TATGCACAGTGTGATGCTTGTGAAGGCATGCTTCAGCTGCGGGGAAGTCTTGTCATTAAGTTTCTTGAATGTGAAGAAAGCCAAGGTATTTAGTCTTAAATTTCTGAAAATAATGTGCATTTCAATAAAATTTAATATGAACTAGCGATTGTGCTTAATTCCTTGTAAATTTATGCAGGATTTCCCAAATTTTGCAAAAA
ACATTTTAGAAAAGTATCCTGGTTGAGGCCAAAAGCAACACGTTCTTCCTCCAGAGAGATATACTTGATTTGTCAAGATTTGAGATGACCTCTTCTATGCAACAGAGATTTTAGTGTTCCACAAGGAAATTGATGAATGGTGTTGATAGTAGGTTTTTGAAGTCAGTGACATGGAAGGGGGATAATTTATTATTGCAGAA
ATGCATTTCATTTATATGCTCCTTGTATGCCTACCCATAGAAGTACATTAGGACTAACAAATCAAGGTGTTTTGAGGCGAGTGATTAGGCACTTGGGATTTTCCAAGGCCATTCACATCAAATAGTTTTGCAGTATAGTCATATGGGGGTCACACTTTCTGGAGACGGGCTTCAATCGTCTGCCAAGTTTTCAAGTAGGT
CACCTGTCTGTATTTGTTAGCAAAGCATTG

>TRINITY_DN111370_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTAGCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTAT
AAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGTTGCTTGCCAGAACTTGGGTCCATTGAACAAGGGTGGGACAGTTATTGGTATTGACGTAAAGgtgcgtctttggctcttttcatattgtcaagcacattctgatgttctttcagtatcctgtatatgcagcttggataagatct
gattattgcaaaatataggaggatatctcatgtgtgtgtgaataaaatcgggggttttcagaacagAAAGTGAAGGTGCCTTCAGCTTACTGCGATGAACGAGTCCAAACAGTGTGTGGGGATGTTATGAAACTTATGTCTGGACAACTAAGAGCACTGTCACCTCAGG

Intron 4 GTTGCTTGCC ... GTCACCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	78.53	6.5	16	30
A2	73.14	13.5	35	32
A3	77.64	10.5	17	55
A4	76.36	15	37	53
A5	88.86	2	8	23
A6	71.47	43	93	107
A7	77.39	57	137	237
A8	68.86	52.5	68	160
A9	68.1	92	134	247
A10	74.56	65.5	124	242

>TRINITY_DN42234_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform

AGAAGATCCATGTATATCCCAGTTTAATACATTTTGAATGCAAATTGAATGGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTA
GCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTATAAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGGAAAAGGTTATTCAGTAATTTTATCAGACATGTGTCCTCCAGTTTCTGGAATACACACGAAGGATACAGCCTTATCCTGCGAATTGGGGACTCG
TGCACTTACCTTGGCATTGGGTGAAATCGATTTGGAAGATACAAATAATGCATCTAGTACTCTAAAAGATGAAGAAGCACATGGTTATGCACAGTGTGATGCTTGTGAAGGCATGCTTCAGCTGCGGGGAAGTCTTGTCATTAAGTTTCTTGAATGTGAAGAAAGCCAAGGATTTCCCAAATTTTGCAAAAAACATTTTA
GAAAAGTATCCTGGTTGAGGCCAAAAGCAACACGTTCTTCCTCCAGAGAGATATACTTGATTTGTCAAGATTTGAGATGACCTCTTCTATGCAACAGAGATTTTAGTGTTCCACAAGGAAATTGATGAATGGTGTTGATAGTAGGTTTTTGAAGTCAGTGACATGGAAGGGGGATAATTTATTATTGCAGAAATGCATTT
CATTTATATGCTCCTTGTATGCCTACCCATAGAAGTACATTAGGACTAACAAATCAAGGTGTTTTGAGGCGAGTGATTAGGCACTTGGGATTTTCCAAGGCCATTCACATCAAATAGTTTTGCAGTATAGTCATATGGGGGTCACACTTTCTGGAGACGGGCTTCAATCGTCTGCCAAGTTTTCAAGTAGGTCACCTGTC
TGTATTTGTTAGCAAAGCATTGCTATAAATTGTGCTTTGAAAATCATGACAATTGCTTGCTTCTCAGATGTAACAATGAGATGAAATAAATGGATTCAACTTGCATGAAAGTTTAAAAAATGGGTATTTTGGAGTAGATCACAGGGACAAAAGCCACTAGAGCATGGATATATACAGGTTTGAGGTTGAGGGGATTATGT
AAGGGTTAAAATCCACTTTTCTTTTCACCATCCTTTGATATTTTATTTAATTGCTCTTGATATTTATTCCAACTTTTCAATCTGTTTTTAAACTGTCATTTCCTGATTCTATTATGGATAAGATATGCAAAATGGTTCAGGTTGAGTGCATTTCTCCCTCCTTACCATCTATATCACATATTTATATATTCTATATGGAT
TATAGATGCGGGGTTCTCTATTTCGAACAAACCCATTTTGAATCAGGATTCAGGGTACAATAAAAGGCATTTAC

>TRINITY_DN42234_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

AGAAGATCCATGTATATCCCAGTTTAATACATTTTGAATGCAAATTGAATGGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTA
GCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTATAAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGgttgcttgccagaacttgggtccattgaacaagggtgggacagttattggtattgacgtaaagaacagaaagtgaaggtgccttcagcttactgc
gatgaacgagtccaaacagtgtgtggggatgttatgaaacttatgtctggacaactaagagcactgtcacctcagGGAAAAGGTTATTCAGTAATTTTATCAGACATGTGTCCTCCAGTTTCTGGAATACACACGAAGGATACAGCCTTATCCTGCGAATTGGGGACTCGTGCACTTACCTTGGCATTGGGTGAAATCGA
TTTGGAAGATACAAATAATGCATCTAGTACTCTAAAAGATGAAGAAGCACATGGTTATGCACAGTGTGATGCTTGTGAAGGCATGCTTCAGCTGCGGGGAAGTCTTGTCATTAAGTTTCTTGAATGTGAAGAAAGCCAAGGATTTCCCAAATTTTGCAAAAAACATTTTAGAAAAGTATCCTGGTTGAGGCCAAAAGCAA
CACGTTCTTCCTCCAGAGAGATATACTTGATTTGTCAAGATTTGAGATGACCTCTTCTATGCAACAGAGATTTTAGTGTTCCACAAGGAAATTGATGAATGGTGTTGATAGTAGGTTTTTGAAGTCAGTGACATGGAAGGGGGATAATTTATTATTGCAGAAATGCATTTCATTTATATGCTCCTTGTATGCCTACCCAT
AGAAGTACATTAGGACTAACAAATCAAGGTGTTTTGAGGCGAGTGATTAGGCACTTGGGATTTTCCAAGGCCATTCACATCAAATAGTTTTGCAGTATAGTCATATGGGGGTCACACTTTCTGGAGACGGGCTTCAATCGTCTGCCAAGTTTTCAAGTAGGTCACCTGTCTGTATTTGTTAGCAAAGCATTGCTATAAAT
TGTGCTTTGAAAATCATGACAATTGCTTGCTTCTCAGATGTAACAATGAGATGAAATAAATGGATTCAACTTGCATGAAAGTTTAAAAAATGGGTATTTTGGAGTAGATCACAGGGACAAAAGCCACTAGAGCATGGATATATACAGGTTTGAGGTTGAGGGGATTATGTAAGGGTTAAAATCCACTTTTCTTTTCACCA
TCCTTTGATATTTTATTTAATTGCTCTTGATATTTATTCCAACTTTTCAATCTGTTTTTAAACTGTCATTTCCTGATTCTATTATGGATAAGATATGCAAAATGGTTCAGGTTGAGTGCATTTCTCCCTCCTTACCATCTATATCACATATTTATATATTCTATATGGATTATAGATGCGGGGTTCTCTATTTCGAACAA
ACCCATTTTGAATCAGGATTCAGGGTACAATAAAAGGCATTTAC

Intron 5 GTATTTAGTC ... ATTTATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	40	15	8	12
A2	22.45	19	8	3
A3	30.12	29	17	8
A4	27.27	24	7	11
A5	0	2	0	0
A6	22.22	147	38	46
A7	22.61	178	40	64
A8	23.04	147	44	44
A9	26.25	170	53	68
A10	21.55	111	27	34

>TRINITY_DN111370_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

GGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTAGCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTAT
AAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGTTGCTTGCCAGAACTTGGGTCCATTGAACAAGGGTGGGACAGTTATTGGTATTGACGTAAAGAAAGTGAAGGTGCCTTCAGCTTACTGCGATGAACGAGTCCAAACAGTGTGTGGGGATGTTATGAAACTTATGTCTGGACAAC
TAAGAGCACTGTCACCTCAGGGAAAAGGTTATTCAGTAATTTTATCAGACATGTGTCCTCCAGTTTCTGGAATACACACGAAGGATACAGCCTTATCCTGCGAATTGGGGACTCGTGCACTTACCTTGGCATTGGGTGAAATCGATTTGGAAGATACAAATAATGCATCTAGTACTCTAAAAGATGAAGAAGCACATGGT
TATGCACAGTGTGATGCTTGTGAAGGCATGCTTCAGCTGCGGGGAAGTCTTGTCATTAAGTTTCTTGAATGTGAAGAAAGCCAAGGATTTCCCAAATTTTGCAAAAAACATTTTAGAAAAGTATCCTGGTTGAGGCCAAAAGCAACACGTTCTTCCTCCAGAGAGATATACTTGATTTGTCAAGATTTGAGATGACCTCT
TCTATGCAACAGAGATTTTAGTGTTCCACAAGGAAATTGATGAATGGTGTTGATAGTAGGTTTTTGAAGTCAGTGACATGGAAGGGGGATAATTTATTATTGCAGAAATGCATTTCATTTATATGCTCCTTGTATGCCTACCCATAGAAGTACATTAGGACTAACAAATCAAGGTGTTTTGAGGCGAGTGATTAGGCACT
TGGGATTTTCCAAGGCCATTCACATCAAATAGTTTTGCAGTATAGTCATATGGGGGTCACACTTTCTGGAGACGGGCTTCAATCGTCTGCCAAGTTTTCAAGTAGGTCACCTGTCTGTATTTGTTAGCAAAGCATTG

>TRINITY_DN111370_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGTTTTGCAGGGAAGAGAAACCTATTGTCTTTCCTATTGAAGACATTTTTCATAGCAATATCCATCACACCGAAGTCTGGGTGCGAGCAAATGAGTGGGGCAGGACTTCCCGACTTCTTCTGCAGGGAGGCTCAGCGTCTGGGCTATGTAGCTCGATCTGCTTTCAAGCTTTTGCAGATACAGAAACAGTTTAAAATTAT
AAAGCCTGGGGCGTCCATCTTGGACTTGGGATGTGCTCCTGGTGCTTGGTTACAGGTTGCTTGCCAGAACTTGGGTCCATTGAACAAGGGTGGGACAGTTATTGGTATTGACGTAAAGAAAGTGAAGGTGCCTTCAGCTTACTGCGATGAACGAGTCCAAACAGTGTGTGGGGATGTTATGAAACTTATGTCTGGACAAC
TAAGAGCACTGTCACCTCAGGGAAAAGGTTATTCAGTAATTTTATCAGACATGTGTCCTCCAGTTTCTGGAATACACACGAAGGATACAGCCTTATCCTGCGAATTGGGGACTCGTGCACTTACCTTGGCATTGGGTGAAATCGATTTGGAAGATACAAATAATGCATCTAGTACTCTAAAAGATGAAGAAGCACATGGT
TATGCACAGTGTGATGCTTGTGAAGGCATGCTTCAGCTGCGGGGAAGTCTTGTCATTAAGTTTCTTGAATGTGAAGAAAGCCAAGgtatttagtcttaaatttctgaaaataatgtgcatttcaataaaatttaatatgaactagcgattgtgcttaattccttgtaaatttatgcagGATTTCCCAAATTTTGCAAAAA
ACATTTTAGAAAAGTATCCTGGTTGAGGCCAAAAGCAACACGTTCTTCCTCCAGAGAGATATACTTGATTTGTCAAGATTTGAGATGACCTCTTCTATGCAACAGAGATTTTAGTGTTCCACAAGGAAATTGATGAATGGTGTTGATAGTAGGTTTTTGAAGTCAGTGACATGGAAGGGGGATAATTTATTATTGCAGAA
ATGCATTTCATTTATATGCTCCTTGTATGCCTACCCATAGAAGTACATTAGGACTAACAAATCAAGGTGTTTTGAGGCGAGTGATTAGGCACTTGGGATTTTCCAAGGCCATTCACATCAAATAGTTTTGCAGTATAGTCATATGGGGGTCACACTTTCTGGAGACGGGCTTCAATCGTCTGCCAAGTTTTCAAGTAGGT
CACCTGTCTGTATTTGTTAGCAAAGCATTG