sp|Q9LRP2|PT317_ARATH ----> Probable sugar phosphate/phosphate translocator At3g17430


Intron 1 GTAAGTGATT ... TTGTATTCAG

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A1089.82.5633



>TRINITY_DN47770_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform
TCTCAATATACATCTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATGGC
ACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGAGG
TAAGTGAAGCAAAGCTCTTTGCTCTGTCATCAATTGCTTCTGGTTGGAGTTTTTCTTTCTTGTTGTGTTTGTTTATGTGCGTGTGTGAGTCTTCGGGCATGGAATCTTCTGAAAGTAGATAACTACAGTAATCAAATGGTTGGATCATTGTTGCAAACCCTATTCAATGTTCACTACTAGTAACATTACAGATTAATTTC
ATTAGCTAATTGTTTCAGCCTTTGTGTTTTTCAGCAAGCAGCATATCAGCATACCGATAGGAATCGCCTGAGAAAATAGGCTCTCTGAGATCTAGTAGGAAATATACCAGACTCAGGTGCTTTATCTCTTTAGCATTTCACGCAAACAAAAGCTAGGTTGATGTGTTTTGGCTTACTGGAATCTGGCTTGTCTCCATGGG
AAACTTAAAAAACAAGGCATCAAATCTCAGACGCATAAGTTTTCCTTCCAGGATGCTTGGAACAAGGTTCTTCACCCTTCCAAGATCGGCCTATCAAGATTGGCTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTGATCAGATTTACGAAAAGAAACAGATAATATATCTCTATTCATTTTTCATGGTGTCGATGACTTGCGGCTT
GCCATTGGGAAGCAAAAATAAGGCTGCAGTTACGACGCAACATAGAAGAAGTGCACAGGCTAGGCTACATAATCATATCCACTCTATGAGTTGTTTATTAGATGAAATTGTTCTGCATTCATGCTTTTCAACCTTTTCTGGCCTTCCAGACCAGAGTCCTCCTTATGATCTTGCCCCACTGTATGGTAGGTGAATGTTGC
AGACTGTCTTTGGCCATCATAACAATAGCAGGGTATATGGCAAGAGTAAATAGTTTACCTTCCCATCTCAATGAGCAGCAAATTTATGCAATACTCCCTTAGATGGAGAACTTCAGAATCCTAGTATGGGCTGGTGGGTTGTGTACATTGATAATGCATGAGATATGATGCTTGTAGGAGATGATCCATACAAAATCCAG
TGATCATTGTGATTGACAAAAGGTTTGATTGTTTGAACAGCATGATTCAATTTCATGTATGGTGGCTTATGACATCTGCTATATTTTGATTATGCAACGCCAAATCTCGCTATTGTTTTGATGGCCAGGGGTAGTCTTTTTTTACACTACGGTCGACAATGTTAGCTAGATCCTTTGGAAGAATCTATTCTTTACAGTCT
GGAAAAACATGAATGCATTGCTCTTTACGGTTTAGAAAAGCATGAATGCAGAACAATTTCCTCCCATAAATAACTCATTAGGTGAATGTAATGATATGGCATAGCCTCTACAACTCTTTTATCATGGGTCATGACCGCAATCTTATTTTTGATCTCCGATGGAAAACAAAGAGAGCTTTTTTCTTATCAGATTTTGATTT
TGATCACATGGAAGTTTGGTCTGCATGAGCATCTTGGACCAGTTGTGTTTAACCTTGGATATCTACGATAGTGCCAGCCAAAACAGAGGGATAATGAAGGAGACATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTGCTCAATACTCCACTGATCATTGTCGATTAAAACGTTGTTTTATTGTTTGACCGG
TATGATTCAATTTCATTTCCTATAACTTTTGTGTATTGATTTGTATGTTATGATGTAATTACAGGGGGTTCTGTAGCATTGTGCAAAACTGTTTTATTTACACTTCTGAAGAGGAATAGAAAATGACTCAAGGGGCTGTGAGCACGAAGGTTTCAGGATGATCAGAAGATATAACAATTACCCAAGAAACTTCCAAGTAG
TTCAAACCTTAAAATTTTTTGGATCCCTATGTTTCCTTGGAGACGTTATGCAGGGCATTGAATTAATTTCAGATTGTATGGTGCTTTCTGTATCATTTGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATAGCTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCA
GGCATCCAATAAAACTTGATGCACACATGGATTTTTGTATTAAGGCACTTCAAAGGTTTGGCAATACTGCATATCTTCATATTTCAGTGGCCTTCATTCA


>TRINITY_DN47770_c0_g1_i7 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TCTCAATATACATCTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATGGC
ACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGAGC
AAGCAGCATATCAGCATACCGATAGGAATCGCCTGAGAAAATAGGCTCTCTGAGATCTAGTAGGAAATATACCAGACTCAGGTGCTTTATCTCTTTAGCATTTCACGCAAACAAAAGCTAGGTTGATGTGTTTTGGCTTACTGGAATCTGGCTTGTCTCCATGGGAAACTTAAAAAACAAGGCATCAAATCTCAGACGCA
TAAGTTTTCCTTCCAGGATGCTTGGAACAAGGTTCTTCACCCTTCCAAGATCGGCCTATCAAGATTGGCTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTGATCAGATTTACGAAAAGAAACAGATAATATATCTCTATTCATTTTTCATGGTGTCGATGACTTGCGGCTTGCCATTGGGAAGCAAAAATAAGGCTGCAGTTACGA
CGCAACATAGAAGAAGTGCACAGGCTAGGCTACATAATCATATCCACTCTATGAGTTGTTTATTAGATGAAATTGTTCTGCATTCATGCTTTTCAACCTTTTCTGGCCTTCCAGACCAGAGTCCTCCTTATGATCTTGCCCCACTGTATGGTAGGTGAATGTTGCAGACTGTCTTTGGCCATCATAACAATAGCAGGGTA
TATGGCAAGAGTAAATAGTTTACCTTCCCATCTCAATGAGCAGCAAATTTATGCAATACTCCCTTAGATGGAGAACTTCAGAATCCTAGTATGGGCTGGTGGGTTGTGTACATTGATAATGCATGAGATATGATGCTTGTAGGAGATGATCCATACAAAATCCAGTGATCATTGTGATTGACAAAAGGTTTGATTGTTTG
AACAGCATGATTCAATTTCATGTATGGTGGCTTATGACATCTGCTATATTTTGATTATGCAACGCCAAATCTCGCTATTGTTTTGATGGCCAGGGGTAGTCTTTTTTTACACTACGGTCGACAATGTTAGCTAGATCCTTTGGAAGAATCTATTCTTTACAGTCTGGAAAAACATGAATGCATTGCTCTTTACGGTTTAG
AAAAGCATGAATGCAGAACAATTTCCTCCCATAAATAACTCATTAGGTGAATGTAATGATATGGCATAGCCTCTACAACTCTTTTATCATGGGTCATGACCGCAATCTTATTTTTGATCTCCGATGGAAAACAAAGAGAGCTTTTTTCTTATCAGATTTTGATTTTGATCACATGGAAGTTTGGTCTGCATGAGCATCTT
GGACCAGTTGTGTTTAACCTTGGATATCTACGATAGTGCCAGCCAAAACAGAGGGATAATGAAGGAGACATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTGCTCAATACTCCACTGATCATTGTCGATTAAAACGTTGTTTTATTGTTTGACCGGTATGATTCAATTTCATTTCCTATAACTTTTGTGTA
TTGATTTGTATGTTATGATGTAATTACAGGGGGTTCTGTAGCATTGTGCAAAACTGTTTTATTTACACTTCTGAAGAGGAATAGAAAATGACTCAAGGGGCTGTGAGCACGAAGGTTTCAGGATGATCAGAAGATATAACAATTACCCAAGAAACTTCCAAGTAGTTCAAACCTTAAAATTTTTTGGATCCCTATGTTTC
CTTGGGTATAAAAAATTCCACTGCTCAACACTTTTATCTTGTCTATATGCATTGTGTCTCATGTTTACTGAGGTAGCTTCTAAATGATCAAATGACATGTCTTGGTTGGCTCTATGTTGTAGAGACGTTATGCAGGGCATTGAATTAATTTCAGATTGTATGGTGCTTTCTGTATCATTTGgtaagtgatttgttataac
ttcagcatcgattatgaaggtacaccccagggcccatgctttgtttagcagttagaaagtttcaagaacaacgtggtcagtgcaaaattatccttaaagtagttccagtcttttctaaactattttgatcaaggaaagagatataatcccagtttgattttgtattcag
GTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTT
TGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATAGCTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCAGGCATCGACTGATCAAATTCTTGAAAGCGTGTCTTGAGTTGTTGGCTGTTTCTGCATATTAATGGTAATTGGCTAGTTGTTGATTCCGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTT
TCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATGGATTTTTGTATTAAGGCACTTCAAAGGTTTGGCAATACTGCATATCTTCATATTTCAGTGGCCTTCATTCATAAAAAAAATTGATGCTCACATGGTTTTCTGTATTATGTAAATGTTCTACTTTTGCATTGGCTCTGGTCATAATAAATGTTCAAAGTTTGCTATGTGGAA
TGAGTATGAAGATGACAAGTAAATACCTGCAAGGTAGTACCCGCATCAAGGATTTGTGCTTGCGTAGATAAATTGCATAAGCAACAGGAACATACCCATAACATAATATTGCAGAAGTTAGAAAATTTGCATACTAAAATTGCAGAAGATGGGAGAACTGCAAAACCTATCTTTCTGAAAGCAGTAAGCCTATAGCCTTG
CATTGTGCAATTCAGATGCTCACAAGCACAGCACCCTGAATTGCAGAATACAACAACCTGCAATAGGGAGTTGCATAACCAGAAGCGACAAAGAGGCATCACAGAATACGACATCCTAAATTGCAGAATACAGCGAATTGTATTACCAGTCCGCGATGGCCTTGAGAAGCTTGCAAAGAAGCTTAACCTATTTATTCATT
ATAGAAGGTGAATTGATATCCTTTGCAGTTGTAAGTGACAGATCTTGTCACTGATGTACATGAGTATCCAATAGGGGATTAATTTTGGGTAGTGACAGAATCTTAAATTGTATTTAGGATATCGAGTGCATTATGCCTTGTACAGACGCTATAGTCTAAAGAAGTATGATATTATTATAACTACTGTGTGTTTGTCCAGT
GATTCTTTAAAAATGTTTCTGTAGATTTCCAC




Intron 2 GTAAGTTAAT ... GTTTTTGCAG

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>TRINITY_DN116010_c2_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
CTTTTCCTTTTTATAAATATCTCTCTACCGTGAACGATTCCCTATCTCAGTTGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTTTGGTGGTTACAGCTAGCCGTTTCCTTCTTTTGGCATCTCGCTTCTCGTCTGTGCTTTCATGTTTGTTTGGCCTTAATGTAATGGCGGCAGCGCCTGTAGAAACATGGCACGCGGACGGCTCG
TTACTGACCTTACAGAGGAAAATCCCATGTCTATAGGATGAAAATGTTATGTTGATGGATGAGCCGGGCAGGCAGTCTCTGTTGAAGTTATATATCCGTGATGTGCGATGATCCATCCCCTCTGTGCAAGAGGCGCGGCTGTCATGATAAGTGGAACTTCATCCATTCGGGATTGGTTGGTAAGCAAACAGCCGAAAGGA
ATCGCCTGTAGAAAATAAGCTTTCTTTGAGATCTAGTAGGAAATATACCGGACTCAGGTGCCTAATCTTTATAGCATTTCACGCAAATAAAAGCCAGGTTGATGTGTTTTGTGTTACTGGAACCTGGCTTGTCTCCATGGGTAACTTAAAAAATAAGGCACCAAATCTCAGCTGCATAAGTTATCCTTCCATGCTACCTG
GAACAGGGTTCTTCAACCTTCCAAGATCGGCCTATCGAGATTGACTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTAATCAGATTTACGAAAAGAAATCGATGATATATCTCTATCCGTCTTTCATGGTGTCGATGACTTGTGGCTTGCCATTTGAAAGCTAAAATAAGGCTGCAGTTACGACGCAACATAGAAGAAGTGCACAGG
CTATGCTACATAATCATATCCACTCGATGAGTTGTTTATTAGATGAATTGTTTTGTATCATGCTTTTCAACCTTTTCTGGCCGTCCAGACCAGAGTCCTTCATATGATCATGCTCCACTGTATGGTAGGTGAAAACTGCTTTGGCCATCATAACAATAGCAGGGTATATGACAATACTGAAGAACTTCAAAATCCTAGCT
GGGGTTGGTGGATTGTGTACATTGTTAATGCAGGAGATATGATGCTTGTAGGAGATGATCCATACAGATATTCCACTGATCATTGTTGATTGAAAAATCGTTTGATTGTTTGAACAACACGATTCAATTTCATGTATGGTGGCTTATGACATCTGATTATACAATGTCAAATCTCGCTATTGTTTTGATGGCCAGGGGTA
GTCCTCTCTTACACTGCGGTGGACAATGTTAGCTAGATCCTTTGGAGGAATCTGTTATGTACAGTCTGGAAAAACATGAATGCATTGCTATGTACGGCCTAGAAAAGCATGAATGCAGAACAATTTCCTCCTATAAATAACGCATTAGGTGAATGTAATGAAATGGCACAGCCTCTCCAACTCTTTTATCATGGGTCATG
ATTGCAATCTTATTTTTGTTCTCTGACAAAGAGAGCATTTTTCTTGTTAGATTTTGAAGATTTTGATTGTACCAAGTGAAACGAGGTACTCTACAGCTCAGTATCTACAGCTTAGTATGGGAGGGTCTATGAATGAAGAGTCAAATTTCTTGAGTTTAAATTTAAAAAAAGAAATGCATCTCAAGAAATTGGATCCTTCT
TGGTGCTTGATAGATACGGGGTTAAGATGGATCTACGATGGTTTCAATCACATGGAAGTTTGGTCTGCTTGAGCATCTCGGACATCTCAGACAAGCTGTGTTTAACCATGGATTTCTGCCATACTGCCAGCCAAACCAGGGGATAATGAAGGAGGCATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTACT
CGATACTCCATTGGTCATTGTTGATGAAAACGTTGTTTGATTGATTGAGCGGTATGATTCAATTTCATGTCCTATAAATTTTGGTGTATTTGTTTGTATGTTATGATGTAATTACAAGGGGTTCTGTAGCATTGCGCAAAATGACTCTACCCAAGAAACATCCAAGTAGTTCAAATCATCAAAATTTATGGATCCCTACG
TCCCTTGGGTATAAAAAATTCCACTGCTTCAACACTTCTAACTAGTCCATATGCATTGTGCCTCATGTTTACTAAGGTAGCTTCTAAATGATCAAATGACATGTCTTGGTTGGCTCTATGTTGTAGAGACGTTATGCAGGGCGTTGAATTCATTTCAGATTCTATGGTGCTTTCTGTATCATTCTCTGAGTGATTTGTTC
TAACTTCAGCGTCAATTATGAAGGGACGTTATGCAGGGCGTTGAATTAATTTCAGATTCTATGGTGCTTTCTGTATCATTCTGTATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTTGCTAGTTGTTGATTCTGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTT
TGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATCACTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCATGCATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAAAGTGTGTCTTAAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTGGCTAGTTGTTGTGATGCGGAGCATCCACGCTCACCTCCACTCCACCACATTGT
CTTCCATCTGTGACAGCCAGTGCATCATCTTCAAGTTATTGACAGGTGTTGAAATGTGGCAGCCTTGCATAATATTGAAGGGCCACGATTTCATTATTGTGATCTAGAAAATCATGAGGGGGAGAGAGACTTGGAGTCTTAGAGAGACCTGCGAGCCAGAAGGATCAGGTTGAAGGAAGAAGGTGTTGGTGCCCTTCAAA
TCATGTGCGGAGATTTTCTGTGGAGTTCTGCTGTACCATAGATTTGGGGATTTGTTTATTTAAATGTTAGTATGAGGGCCTCCGAGCCTGGATCTAGATT


>TRINITY_DN116010_c2_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTTTCCTTTTTATAAATATCTCTCTACCGTGAACGATTCCCTATCTCAGTTGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTTTGGTGGTTACAGCTAGCCGTTTCCTTCTTTTGGCATCTCGCTTCTCGTCTGTGCTTTCATGTTTGTTTGGCCTTAATGTAATGGCGGCAGCGCCTGTAGAAACATGGCACGCGGACGGCTCG
TTACTGACCTTACAGAGGAAAATCCCATGTCTATAGGATGAAAATGTTATGTTGATGGATGAGCCGGGCAGGCAGTCTCTGTTGAAGTTATATATCCGTGATGTGCGATGATCCATCCCCTCTGTGCAAGAGGCGCGGCTGTCATGATAAGTGGAACTTCATCCATTCGGGATTGGTTGGTAAGgtaagttaatcaatgc
tctttgctctgccgtcaatggcttctggtcggagcttttcttttttgtcctgtttgtttatgtgcgtgtgtgtgttcgggtgtggaatcttctgaaagtagaaaactacagtaatcaaatggttggatcatcgttgtaaacactattcaatgttcactactagtaaaattacagagtaatttcattagctaattgtttca
gtctttgtttttgcag
CAAACAGCCGAAAGGAATCGCCTGTAGAAAATAAGCTTTCTTTGAGATCTAGTAGGAAATATACCGGACTCAGGTGCCTAATCTTTATAGCATTTCACGCAAATAAAAGCCAGGTTGATGTGTTTTGTGTTACTGGAACCTGGCTTGTCTCCATGGGTAACTTAAAAAATAAGGCACCAAATCT
CAGCTGCATAAGTTATCCTTCCATGCTACCTGGAACAGGGTTCTTCAACCTTCCAAGATCGGCCTATCGAGATTGACTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTAATCAGATTTACGAAAAGAAATCGATGATATATCTCTATCCGTCTTTCATGGTGTCGATGACTTGTGGCTTGCCATTTGAAAGCTAAAATAAGGCTGC
AGTTACGACGCAACATAGAAGAAGTGCACAGGCTATGCTACATAATCATATCCACTCGATGAGTTGTTTATTAGATGAATTGTTTTGTATCATGCTTTTCAACCTTTTCTGGCCGTCCAGACCAGAGTCCTTCATATGATCATGCTCCACTGTATGGTAGGTGAAAACTGCTTTGGCCATCATAACAATAGCAGGGTATA
TGACAATACTGAAGAACTTCAAAATCCTAGCTGGGGTTGGTGGATTGTGTACATTGTTAATGCAGGAGATATGATGCTTGTAGGAGATGATCCATACAGATATTCCACTGATCATTGTTGATTGAAAAATCGTTTGATTGTTTGAACAACACGATTCAATTTCATGTATGGTGGCTTATGACATCTGATTATACAATGTC
AAATCTCGCTATTGTTTTGATGGCCAGGGGTAGTCCTCTCTTACACTGCGGTGGACAATGTTAGCTAGATCCTTTGGAGGAATCTGTTATGTACAGTCTGGAAAAACATGAATGCATTGCTATGTACGGCCTAGAAAAGCATGAATGCAGAACAATTTCCTCCTATAAATAACGCATTAGGTGAATGTAATGAAATGGCA
CAGCCTCTCCAACTCTTTTATCATGGGTCATGATTGCAATCTTATTTTTGTTCTCTGACAAAGAGAGCATTTTTCTTGTTAGATTTTGAAGATTTTGATTGTACCAAGTGAAACGAGGTACTCTACAGCTCAGTATCTACAGCTTAGTATGGGAGGGTCTATGAATGAAGAGTCAAATTTCTTGAGTTTAAATTTAAAAA
AAGAAATGCATCTCAAGAAATTGGATCCTTCTTGGTGCTTGATAGATACGGGGTTAAGATGGATCTACGATGGTTTCAATCACATGGAAGTTTGGTCTGCTTGAGCATCTCGGACATCTCAGACAAGCTGTGTTTAACCATGGATTTCTGCCATACTGCCAGCCAAACCAGGGGATAATGAAGGAGGCATGATTCTTGTA
GGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTACTCGATACTCCATTGGTCATTGTTGATGAAAACGTTGTTTGATTGATTGAGCGGTATGATTCAATTTCATGTCCTATAAATTTTGGTGTATTTGTTTGTATGTTATGATGTAATTACAAGGGGTTCTGTAGCATTGCGCAAAATGACTCTACCCAAGAAACATCCAAGTA
GTTCAAATCATCAAAATTTATGGATCCCTACGTCCCTTGGGTATAAAAAATTCCACTGCTTCAACACTTCTAACTAGTCCATATGCATTGTGCCTCATGTTTACTAAGGTAGCTTCTAAATGATCAAATGACATGTCTTGGTTGGCTCTATGTTGTAGAGACGTTATGCAGGGCGTTGAATTCATTTCAGATTCTATGGT
GCTTTCTGTATCATTCTCTGAGTGATTTGTTCTAACTTCAGCGTCAATTATGAAGGGACGTTATGCAGGGCGTTGAATTAATTTCAGATTCTATGGTGCTTTCTGTATCATTCTGTATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTTGCTAGTTGTTGATTCTGTATTCA
GGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATCACTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCATGCATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAAAGTGTGTCTTAAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTGGCTAGTTGTTGTGATGCGGAG
CATCCACGCTCACCTCCACTCCACCACATTGTCTTCCATCTGTGACAGCCAGTGCATCATCTTCAAGTTATTGACAGGTGTTGAAATGTGGCAGCCTTGCATAATATTGAAGGGCCACGATTTCATTATTGTGATCTAGAAAATCATGAGGGGGAGAGAGACTTGGAGTCTTAGAGAGACCTGCGAGCCAGAAGGATCAG
GTTGAAGGAAGAAGGTGTTGGTGCCCTTCAAATCATGTGCGGAGATTTTCTGTGGAGTTCTGCTGTACCATAGATTTGGGGATTTGTTTATTTAAATGTTAGTATGAGGGCCTCCGAGCCTGGATCTAGATT




Intron 3 GTATGATTCA ... TATGTTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A952.38574
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>TRINITY_DN47770_c0_g1_i13 from sample A7 / Example spliced isoform
CGATGGTTTCAATCACATGGAAGTTTGGTCTGCTTGAGCATCTCGGACATCTCAGACAAGCTGTGTTTAACCATGGATTTCTGCCATACTGCCAGCCAAACCAGGGGATAATGAAGGAGGCATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTACTCGATACTCCATTGGTCATTGTTGATGAAAACGTTG
TTTGATTGATTGAGCGAGACGTTATGCAGGGCGTTGAATTCATTTCAGATTCTATGGTGCTTTCTGTATCATTCTCTGAGTGATTTGTTCTAACTTCAGCGTCAATTATGAAGGGACGTTATGCAGGGCGTTGAATTAATTTCAGATTCTATGGTGCTTTCTGTATCATTCTGTAAGTGATTTGTTCTAACTTCAGCGTC
AATTATGAAGGTAACCCCGATGCTTTGTTTTGCAGTTAGAAAGTTTTAAGAACAGGGTGGTCAGTGCAAACTTATCCTTAAAAAGTAGTTCCAGTCTTTTCTAAACTGTTTTGATCAAGGAAAGGGATATAATCCCAGTTTGTTTTTTGTATCTCCTCCTACAAAGAAACATTTATAATTAGGAATGTTTTCCATCTCTA
ATCAAACTGAGAGAAATAGTTGGCTGCAGTTTTATGTAATTTTGATGCTTTAAGCCTTTGGATAGTTTACGCTCTTAGATGCAAGGTAAAGAGCATGTGCTGAAAACAGACACTGCTAGTGTTGTCTTGTGTCCTTTACAATTTCTTTTTAAAGTCTGTTCGGAACCTATATATTTATTATTAGTGTCAAAAGCACTTTA
AAGAAATCTCTCTGGTATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTTGCTAGTTGTTGATTCTGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATCACTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCT
CAGGCATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAAAGTGTGTCTTAAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTGGCTAGTTGTTGTGATGCGGAGCATCCACGCTCACCTCCACTCCACCACATTGTCTTCCATCTGTGACAGCCAGTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGGCA
TCATCTTCAAGTTATTGACAGGTGTTGAAACGTGGCAGCCTTGCATATTATTGAAGGGCCACGATTTCATTATTGTGATCTAGAAAACAATAAAACTTGATGCACACATGGATTTTTGTATTAAGGCACTTCAAAGGTTTGGCAATACTGCATATCTTCATATTTCAGTGGCCTTCATTCATCATGAGGGGGAGAGAGAC
TTGGAGTCTTAGAGAGACCTGCGAGCCAGAAGGATCAGGTTGAAGGAAGAAGGTGTTGGTGCCCTTCAAATCATGTGCGGAGATTTTCTGTGGAGTTCTGCTGTAGCATAGATTTGGGGATTTGTTTATTTAAATGTTAGTATGAGGGCCTCCGAGCTTGGATCTAGATTTTAATTAAATAAGAGGCCTGCGTGCTTCAC
CTGGGTGAATGAATACAGTGTAAGGATGTAATCCAGTTATTCAATATGAATATATTTGATGTCCGGTTGTTTTGAGACTCTCGCTGTTTTATTTTTCTGTGTTAGACATGTTCTCTGTTTTTAGTTGTCTTTAGTCTTTGGCTGCAGAGTGACTGCATCATTTTGGTATCAGAGCAACCCACAATGGCCCAGAGGAGAAT
ACATTGTTGCAGACTGATCGTTGGAGACTTAGCTGCTTAAACTGAAGAGTTGGTTCCAGAGGAGAACTAAGTGAGCTCGGAGGAGCCGAAGAGTTGGTTCGAGAGGAGAACCAAGTGTGCTCGGAGGAGCACTAGATTGCACAGAGGTGCATTATTGTTACCAGTGGGATTGGCTATGGAAAGCCATATTGTGAACAACT
TTAAGAGAGCAAGCTCTTGAAAAGCCAAAGAGAGAGAGATTGGCAAGTAAAAGTTAAAAATGACAAAGGAGAAGCGGGTGAGCCAAGAAGAGAAATAATGGATCAAGGCAGAGATACAAGCAATTAGGCAACTAATCAAAGTGCGTGATGAAAGACTGCAAAGAAAAGCGGACATCCGAGCCATACGAAAGGTGATAAGG
ACCTTGGAGGAGAAAGAAAGACATCAAATTGAAAAGAGAGTTTTCAAAGGGGGTCTTAGTTGTGGAAGTGCTTTGCTACTCGGAAGAAGGTGAAGCACTTGTGGAAGTGCTTTGCCACCCGGAAGAAGGTGAAGCACTTGAAGAAGAATACAGTGCTGCTGAGCACAT


>TRINITY_DN47770_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:
CGATGGTTTCAATCACATGGAAGTTTGGTCTGCTTGAGCATCTCGGACATCTCAGACAAGCTGTGTTTAACCATGGATTTCTGCCATACTGCCAGCCAAACCAGGGGATAATGAAGGAGGCATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTACTCGATACTCCATTGGTCATTGTTGATGAAAACGTTG
TTTGATTGATTGAGCGgtatgattcaatttcatgtcctataaattttggtgtatttgtttgtatgttatgatgtaattacaaggggttctgtagcattgcgcaaaatgactctacccaagaaacatccaagtagttcaaatcatcaaaatttatggatccctacgtcccttgggtataaaaaattccactgcttcaacac
ttctaactagtccatatgcattgtgcctcatgtttactaaggtagcttctaaatgatcaaatgacatgtcttggttggctctatgttgtag
AGACGTTATGCAGGGCGTTGAATTCATTTCAGATTCTATGGTGCTTTCTGTATCATTCTCTGAGTGATTTGTTCTAACTTCAGCGTCAATTATGAAGGGACGTTATGCA
GGGCGTTGAATTAATTTCAGATTCTATGGTGCTTTCTGTATCATTCTGTAAGTGATTTGTTCTAACTTCAGCGTCAATTATGAAGGTAACCCCGATGCTTTGTTTTGCAGTTAGAAAGTTTTAAGAACAGGGTGGTCAGTGCAAACTTATCCTTAAAAAGTAGTTCCAGTCTTTTCTAAACTGTTTTGATCAAGGAAAGG
GATATAATCCCAGTTTGTTTTTTGTATCTCCTCCTACAAAGAAACATTTATAATTAGGAATGTTTTCCATCTCTAATCAAACTGAGAGAAATAGTTGGCTGCAGTTTTATGTAATTTTGATGCTTTAAGCCTTTGGATAGTTTACGCTCTTAGATGCAAGGTAAAGAGCATGTGCTGAAAACAGACACTGCTAGTGTTGT
CTTGTGTCCTTTACAATTTCTTTTTAAAGTCTGTTCGGAACCTATATATTTATTATTAGTGTCAAAAGCACTTTAAAGAAATCTCTCTGGTATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTTGCTAGTTGTTGATTCTGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGC
AGCCTTTTGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATCACTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCAGGCATCAACTGATCAAATTCTTGTCATGAAAGTGTGTCTTAAGTTGTTGGCTGTTTTTGCATATTAATTGGTAATTGGCTAGTTGTTGTGATGCGGAGCATCCACGCTCACCTCCACTCCACC
ACATTGTCTTCCATCTGTGACAGCCAGTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGGCATCATCTTCAAGTTATTGACAGGTGTTGAAACGTGGCAGCCTTGCATATTATTGAAGGGCCACGATTTCATTATTGTGATCTAGAAAACAATAAAACTTGATGCACACATGGATTTTTGTATTAAG
GCACTTCAAAGGTTTGGCAATACTGCATATCTTCATATTTCAGTGGCCTTCATTCATCATGAGGGGGAGAGAGACTTGGAGTCTTAGAGAGACCTGCGAGCCAGAAGGATCAGGTTGAAGGAAGAAGGTGTTGGTGCCCTTCAAATCATGTGCGGAGATTTTCTGTGGAGTTCTGCTGTAGCATAGATTTGGGGATTTGT
TTATTTAAATGTTAGTATGAGGGCCTCCGAGCTTGGATCTAGATTTTAATTAAATAAGAGGCCTGCGTGCTTCACCTGGGTGAATGAATACAGTGTAAGGATGTAATCCAGTTATTCAATATGAATATATTTGATGTCCGGTTGTTTTGAGACTCTCGCTGTTTTATTTTTCTGTGTTAGACATGTTCTCTGTTTTTAGT
TGTCTTTAGTCTTTGGCTGCAGAGTGACTGCATCATTTTGGTATCAGAGCAACCCACAATGGCCCAGAGGAGAATACATTGTTGCAGACTGATCGTTGGAGACTTAGCTGCTTAAACTGAAGAGTTGGTTCCAGAGGAGAACTAAGTGAGCTCGGAGGAGCCGAAGAGTTGGTTCGAGAGGAGAACCAAGTGTGCTCGGA
GGAGCACTAGATTGCACAGAGGTGCATTATTGTTACCAGTGGGATTGGCTATGGAAAGCCATATTGTGAACAACTTTAAGAGAGCAAGCTCTTGAAAAGCCAAAGAGAGAGAGATTGGCAAGTAAAAGTTAAAAATGACAAAGGAGAAGCGGGTGAGCCAAGAAGAGAAATAATGGATCAAGGCAGAGATACAAGCAATT
AGGCAACTAATCAAAGTGCGTGATGAAAGACTGCAAAGAAAAGCGGACATCCGAGCCATACGAAAGGTGATAAGGACCTTGGAGGAGAAAGAAAGACATCAAATTGAAAAGAGAGTTTTCAAAGGGGGTCTTAGTTGTGGAAGTGCTTTGCTACTCGGAAGAAGGTGAAGCACTTGTGGAAGTGCTTTGCCACCCGGAAG
AAGGTGAAGCACTTGAAGAAGAATACAGTGCTGCTGAGCACAT




Intron 4 GTAAGTGAAG ... TGTTTTTCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A161.54588
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>TRINITY_DN47770_c0_g1_i7 from sample A7 / Example spliced isoform
TCTCAATATACATCTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATGGC
ACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGAGC
AAGCA
GCATATCAGCATACCGATAGGAATCGCCTGAGAAAATAGGCTCTCTGAGATCTAGTAGGAAATATACCAGACTCAGGTGCTTTATCTCTTTAGCATTTCACGCAAACAAAAGCTAGGTTGATGTGTTTTGGCTTACTGGAATCTGGCTTGTCTCCATGGGAAACTTAAAAAACAAGGCATCAAATCTCAGACGCA
TAAGTTTTCCTTCCAGGATGCTTGGAACAAGGTTCTTCACCCTTCCAAGATCGGCCTATCAAGATTGGCTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTGATCAGATTTACGAAAAGAAACAGATAATATATCTCTATTCATTTTTCATGGTGTCGATGACTTGCGGCTTGCCATTGGGAAGCAAAAATAAGGCTGCAGTTACGA
CGCAACATAGAAGAAGTGCACAGGCTAGGCTACATAATCATATCCACTCTATGAGTTGTTTATTAGATGAAATTGTTCTGCATTCATGCTTTTCAACCTTTTCTGGCCTTCCAGACCAGAGTCCTCCTTATGATCTTGCCCCACTGTATGGTAGGTGAATGTTGCAGACTGTCTTTGGCCATCATAACAATAGCAGGGTA
TATGGCAAGAGTAAATAGTTTACCTTCCCATCTCAATGAGCAGCAAATTTATGCAATACTCCCTTAGATGGAGAACTTCAGAATCCTAGTATGGGCTGGTGGGTTGTGTACATTGATAATGCATGAGATATGATGCTTGTAGGAGATGATCCATACAAAATCCAGTGATCATTGTGATTGACAAAAGGTTTGATTGTTTG
AACAGCATGATTCAATTTCATGTATGGTGGCTTATGACATCTGCTATATTTTGATTATGCAACGCCAAATCTCGCTATTGTTTTGATGGCCAGGGGTAGTCTTTTTTTACACTACGGTCGACAATGTTAGCTAGATCCTTTGGAAGAATCTATTCTTTACAGTCTGGAAAAACATGAATGCATTGCTCTTTACGGTTTAG
AAAAGCATGAATGCAGAACAATTTCCTCCCATAAATAACTCATTAGGTGAATGTAATGATATGGCATAGCCTCTACAACTCTTTTATCATGGGTCATGACCGCAATCTTATTTTTGATCTCCGATGGAAAACAAAGAGAGCTTTTTTCTTATCAGATTTTGATTTTGATCACATGGAAGTTTGGTCTGCATGAGCATCTT
GGACCAGTTGTGTTTAACCTTGGATATCTACGATAGTGCCAGCCAAAACAGAGGGATAATGAAGGAGACATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTGCTCAATACTCCACTGATCATTGTCGATTAAAACGTTGTTTTATTGTTTGACCGGTATGATTCAATTTCATTTCCTATAACTTTTGTGTA
TTGATTTGTATGTTATGATGTAATTACAGGGGGTTCTGTAGCATTGTGCAAAACTGTTTTATTTACACTTCTGAAGAGGAATAGAAAATGACTCAAGGGGCTGTGAGCACGAAGGTTTCAGGATGATCAGAAGATATAACAATTACCCAAGAAACTTCCAAGTAGTTCAAACCTTAAAATTTTTTGGATCCCTATGTTTC
CTTGGGTATAAAAAATTCCACTGCTCAACACTTTTATCTTGTCTATATGCATTGTGTCTCATGTTTACTGAGGTAGCTTCTAAATGATCAAATGACATGTCTTGGTTGGCTCTATGTTGTAGAGACGTTATGCAGGGCATTGAATTAATTTCAGATTGTATGGTGCTTTCTGTATCATTTGGTAAGTGATTTGTTATAAC
TTCAGCATCGATTATGAAGGTACACCCCAGGGCCCATGCTTTGTTTAGCAGTTAGAAAGTTTCAAGAACAACGTGGTCAGTGCAAAATTATCCTTAAAGTAGTTCCAGTCTTTTCTAAACTATTTTGATCAAGGAAAGAGATATAATCCCAGTTTGATTTTGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTT
TGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATAGCTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCAGGCATCGACTGATCAAATTCTTGAAAGCGTGTCTTGAGTTGTTGGCTGTTTCTGCATATTAATGGTAATTGGCTAGTTGTTGATTCCGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTT
TCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATGGATTTTTGTATTAAGGCACTTCAAAGGTTTGGCAATACTGCATATCTTCATATTTCAGTGGCCTTCATTCATAAAAAAAATTGATGCTCACATGGTTTTCTGTATTATGTAAATGTTCTACTTTTGCATTGGCTCTGGTCATAATAAATGTTCAAAGTTTGCTATGTGGAA
TGAGTATGAAGATGACAAGTAAATACCTGCAAGGTAGTACCCGCATCAAGGATTTGTGCTTGCGTAGATAAATTGCATAAGCAACAGGAACATACCCATAACATAATATTGCAGAAGTTAGAAAATTTGCATACTAAAATTGCAGAAGATGGGAGAACTGCAAAACCTATCTTTCTGAAAGCAGTAAGCCTATAGCCTTG
CATTGTGCAATTCAGATGCTCACAAGCACAGCACCCTGAATTGCAGAATACAACAACCTGCAATAGGGAGTTGCATAACCAGAAGCGACAAAGAGGCATCACAGAATACGACATCCTAAATTGCAGAATACAGCGAATTGTATTACCAGTCCGCGATGGCCTTGAGAAGCTTGCAAAGAAGCTTAACCTATTTATTCATT
ATAGAAGGTGAATTGATATCCTTTGCAGTTGTAAGTGACAGATCTTGTCACTGATGTACATGAGTATCCAATAGGGGATTAATTTTGGGTAGTGACAGAATCTTAAATTGTATTTAGGATATCGAGTGCATTATGCCTTGTACAGACGCTATAGTCTAAAGAAGTATGATATTATTATAACTACTGTGTGTTTGTCCAGT
GATTCTTTAAAAATGTTTCTGTAGATTTCCAC


>TRINITY_DN47770_c0_g1_i15 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TCTCAATATACATCTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATGGC
ACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGAGg
taagtgaagcaaagctctttgctctgtcatcaattgcttctggttggagtttttctttcttgttgtgtttgtttatgtgcgtgtgtgagtcttcgggcatggaatcttctgaaagtagataactacagtaatcaaatggttggatcattgttgcaaaccctattcaatgttcactactagtaacattacagattaatttc
attagctaattgtttcagcctttgtgtttttcag
CAAGCAGCATATCAGCATACCGATAGGAATCGCCTGAGAAAATAGGCTCTCTGAGATCTAGTAGGAAATATACCAGACTCAGGTGCTTTATCTCTTTAGCATTTCACGCAAACAAAAGCTAGGTTGATGTGTTTTGGCTTACTGGAATCTGGCTTGTCTCCATGGG
AAACTTAAAAAACAAGGCATCAAATCTCAGACGCATAAGTTTTCCTTCCAGGATGCTTGGAACAAGGTTCTTCACCCTTCCAAGATCGGCCTATCAAGATTGGCTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTGATCAGATTTACGAAAAGAAACAGATAATATATCTCTATTCATTTTTCATGGTGTCGATGACTTGCGGCTT
GCCATTGGGAAGCAAAAATAAGGCTGCAGTTACGACGCAACATAGAAGAAGTGCACAGGCTAGGCTACATAATCATATCCACTCTATGAGTTGTTTATTAGATGAAATTGTTCTGCATTCATGCTTTTCCTGACCGTGGAGACACACAACAGAGTCCTGCATACACAAACGAGCCTCGAAAGGAGATCACACAGCATAGT
ACTGCAAACACAGATATCGAGCCTCCAAAGGAGCTCAGGAATGTCACCGACGAAATTGTTCTAAAATGTGGCGGACTACCCTTGGCCCTGAAAACAATAGGAGCGTCTATGGCAAGAGTAAGGAGGCTTCCTAATGACTGGGATCCATCCTGAAAAGTCTAAA




Intron 5 GTAAGTGAAG ... TATGTTGTAG

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>TRINITY_DN42564_c2_g2_i4 from sample A8 / Example spliced isoform
GTTCTCAATATACAACTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATG
GCACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGA
G
AGACGTTATGCAGGGCATTGAATTAATTTCAGATTGTATGGTGCTTTCTGTATCATTTGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATAGCTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCAGGCATCGACTGATCAAATTCTTGAAAGCGTGTCTTGAGT
TGTTGGCTGTTTCTGCATATTAATGGTAATTGGCTAGTTGTTGATTCCGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGTAAAAAAAATTGATGCTCACATGGTTTTCTGTATTATGTAAATGTTCTACTTTTGCATTGGCTCTGGTCATAATAAATGTTCAAAGTTTGCTATGTGGAATGA
GTATGAAGATGACAAGTAAATACCTGCAAGGTAGTACCCGCATCAAGGATTTGTGCTTGCGTAGATAAATTGCATAAGCAACAGGAACATACCCATAACATAATATTGCAGAAGTTAGAAAATTTGCATACTAAAATTGCAGAAGATGGGAGAACTGCAAAACCTATCTTTCTGAAAGCAGTAAGCCTATAGCCTTGCAT
TGTGCAATTCAGATGCTCACAAGCACAGCACCCTGAATTGCAGAATACAACAACCTGCAATAGGGAGTTGCATAACCAGAAGCGACAAAGAGGCATCACAGAATACGACATCCTAAATTGCAGAATACAGCGAATTGTATTACCAGTCCGCGATGGCCTTGAGAAGCTTGCAAAGAAGCTTAACCTATTTATTCATTATA
GAAGGTGAATTGATATCCTTTGCAGTTGTAAGTGACAGATCTTGTCACTGATGTACATGAGTATCCAATAGGGGATTAATTTTGGGTAGTGACAGAATCTTAAATTGTATTTAGGATATCGAGTGCATTATGCCTTGTACAGACGCTATAGTCTAAAGAAGTATGATATTATTATAACTACTGTGTGTTTGTCCAGTGAT
TCTTTAAAAATGTTTCTGTAGATTTCCACCTGCATTTGTGAACAAACAGCACACTGGATACACTAGTGTCAGTCTTATCATGCATTAGTAAAATATGGAAGTGAAAAATAGACGCAACAACATGCCACATCTATTTGGTGTGGAGCAATGAAGATGACAAGCAAATTCCTGCAATGTAGCTTCCACAACAAGAATGTGTA
GTTCCATAGAGAAATTGCGCAGGCAACATGAACATCCCCATAACCCAATATTGCAGAATTTAGAAGATTTGCAATCTTAAGTTGCAGAATATGGGAGAACTGCAACCTATATTTCTGAAATCAGCAACCCAATATTGCAGAATTTAGAAGATTTGCAATCTTAAGTTGCAGAATATGGGAGAACTGCAACCTATATTTCT
GAAATCAGCAACCTAATAACCTAGCATTGTGCAATTCAAATGCTCACAAGCAGAGATTGTGTAGATGGCAGACCCACAAACTTCAAAGAGGCATTGCAGAATACAACACCCTGAATTGCAGAATACAGCACTCTGCAATAGGGAGTTGCATAACCTGAAGCTACAGATAGGCATCACAGAATACAGCATCCTGAATTGCA
GAATACAACACCCTTCAGCACGAAGTTGGATTAGCGGTGAGCAATGACCTTGAGAAGCTTACCTAATTCATCCATTATGGATATTGATATTCTTTGCAGTTGTAACTGACATATCTTGTAAATGATGTACATGAGTATCCACTAGGGGGATTAATTTTTGGTAATGACCAAAACTTAAATTGTATTTAGGATATTGAGTG
CATTGTGCCCTCTGTACAATCAGTATGATCTAATGAAATATGATATTATTATAACTGCTGTACGTTTGTTCAATGATTCTTTAAAAATGTTTCTCTG


>TRINITY_DN42564_c2_g2_i14 from sample A8 / Example unspliced isoform:
GTTCTCAATATACAACTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATG
GCACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGA
G
gtaagtgaagcaaagctctttgctctgtcatcaattgcttctggttggagtttttctttcttgttgtgtttgtttatgtgcgtgtgtgagtcttcgggcatggaatcttctgaaagtagataactacagtaatcaaatggttggatcattgttgcaaaccctattcaatgttcactactagtaacattacagattaatt
tcattagctaattgtttcagcctttgtgtttttcagcaagcagcatatcagcataccgataggaatcgcctgagaaaataggctctctgagatctagtaggaaatataccagactcaggtgctttatctctttagcatttcacgcaaacaaaagctaggttgatgtgttttggcttactggaatctggcttgtctccatg
ggaaacttaaaaaacaaggcatcaaatctcagacgcataagttttccttccaggatgcttggaacaaggttcttcacccttccaagatcggcctatcaagattggctagctgaaattcctctttcaagactgatcagatttacgaaaagaaacagataatatatctctattcatttttcatggtgtcgatgacttgcggc
ttgccattgggaagcaaaaataaggctgcagttacgacgcaacatagaagaagtgcacaggctaggctacataatcatatccactctatgagttgtttattagatgaaattgttctgcattcatgcttttcaaccttttctggccttccagaccagagtcctccttatgatcttgccccactgtatggtaggtgaatgtt
gcagactgtctttggccatcataacaatagcagggtatatggcaagagtaaatagtttaccttcccatctcaatgagcagcaaatttatgcaatactcccttagatggagaacttcagaatcctagtatgggctggtgggttgtgtacattgataatgcatgagatatgatgcttgtaggagatgatccatacaaaatcc
agtgatcattgtgattgacaaaaggtttgattgtttgaacagcatgattcaatttcatgtatggtggcttatgacatctgctatattttgattatgcaacgccaaatctcgctattgttttgatggccaggggtagtctttttttacactacggtcgacaatgttagctagatcctttggaagaatctattctttacagt
ctggaaaaacatgaatgcattgctctttacggtttagaaaagcatgaatgcagaacaatttcctcccataaataactcattaggtgaatgtaatgatatggcatagcctctacaactcttttatcatgggtcatgaccgcaatcttatttttgatctccgatggaaaacaaagagagcttttttcttatcagattttgat
tttgatcacatggaagtttggtctgcatgagcatcttggaccagttgtgtttaaccttggatatctacgatagtgccagccaaaacagagggataatgaaggagacatgattcttgtaggagatgaaccatggcattaagttcaactgctcaatactccactgatcattgtcgattaaaacgttgttttattgtttgacc
ggtatgattcaatttcatttcctataacttttgtgtattgatttgtatgttatgatgtaattacagggggttctgtagcattgtgcaaaactgttttatttacacttctgaagaggaatagaaaatgactcaaggggctgtgagcacgaaggtttcaggatgatcagaagatataacaattacccaagaaacttccaagt
agttcaaaccttaaaattttttggatccctatgtttccttgggtataaaaaattccactgctcaacacttttatcttgtctatatgcattgtgtctcatgtttactgaggtagcttctaaatgatcaaatgacatgtcttggttggctctatgttgtag
AGACGTTATGCAGGGCATTGAATTAATTTCAGATTGTATGG
TGCTTTCTGTATCATTTGGTAAGTGATTTGTTATAACTTCAGCATCGATTATGAAGGTACACCCCAGGGCCCATGCTTTGTTTAGCAGTTAGAAAGTTTCAAGAACAACGTGGTCAGTGCAAAATTATCCTTAAAGTAGTTCCAGTCTTTTCTAAACTATTTTGATCAAGGAAAGAGATATAATCCCAGTTTGATTTTGT
ATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATAGCTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCAGGCATCGACTGATCAAATTCTTGAAAGCGTGTCTTGAGTTGTTGGCTGTTTCTGCATATTAATGGTAATTGGCTAGTTGTTGATTCCGTATTC
AGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGTAAAAAAAATTGATGCTCACATGGTTTTCTGTATTATGTAAATGTTCTACTTTTGCATTGGCTCTGGTCATAATAAATGTTCAAAGTTTGCTATGTGGAATGAGTATGAAGATGACAAGTAAATACCTGCAAGGTAGTACCCGCATCAAGGATTTGT
GCTTGCGTAGATAAATTGCATAAGCAACAGGAACATACCCATAACATAATATTGCAGAAGTTAGAAAATTTGCATACTAAAATTGCAGAAGATGGGAGAACTGCAAAACCTATCTTTCTGAAAGCAGTAAGCCTATAGCCTTGCATTGTGCAATTCAGATGCTCACAAGCACAGCACCCTGAATTGCAGAATACAACAAC
CTGCAATAGGGAGTTGCATAACCAGAAGCGACAAAGAGGCATCACAGAATACGACATCCTAAATTGCAGAATACAGCGAATTGTATTACCAGTCCGCGATGGCCTTGAGAAGCTTGCAAAGAAGCTTAACCTATTTATTCATTATAGAAGGTGAATTGATATCCTTTGCAGTTGTAAGTGACAGATCTTGTCACTGATGT
ACATGAGTATCCAATAGGGGATTAATTTTGGGTAGTGACAGAATCTTAAATTGTATTTAGGATATCGAGTGCATTATGCCTTGTACAGACGCTATAGTCTAAAGAAGTATGATATTATTATAACTACTGTGTGTTTGTCCAGTGATTCTTTAAAAATGTTTCTGTAGATTTCCACCTGCATTTGTGAACAAACAGCACAC
TGGATACACTAGTGTCAGTCTTATCATGCATTAGTAAAATATGGAAGTGAAAAATAGACGCAACAACATGCCACATCTATTTGGTGTGGAGCAATGAAGATGACAAGCAAATTCCTGCAATGTAGCTTCCACAACAAGAATGTGTAGTTCCATAGAGAAATTGCGCAGGCAACATGAACATCCCCATAACCCAATATTGC
AGAATTTAGAAGATTTGCAATCTTAAGTTGCAGAATATGGGAGAACTGCAACCTATATTTCTGAAATCAGCAACCCAATATTGCAGAATTTAGAAGATTTGCAATCTTAAGTTGCAGAATATGGGAGAACTGCAACCTATATTTCTGAAATCAGCAACCTAATAACCTAGCATTGTGCAATTCAAATGCTCACAAGCAGA
GATTGTGTAGATGGCAGACCCACAAACTTCAAAGAGGCATTGCAGAATACAACACCCTGAATTGCAGAATACAGCACTCTGCAATAGGGAGTTGCATAACCTGAAGCTACAGATAGGCATCACAGAATACAGCATCCTGAATTGCAGAATACAACACCCTTCAGCACGAAGTTGGATTAGCGGTGAGCAATGACCTTGAG
AAGCTTACCTAATTCATCCATTATGGATATTGATATTCTTTGCAGTTGTAACTGACATATCTTGTAAATGATGTACATGAGTATCCACTAGGGGGATTAATTTTTGGTAATGACCAAAACTTAAATTGTATTTAGGATATTGAGTGCATTGTGCCCTCTGTACAATCAGTATGATCTAATGAAATATGATATTATTATAA
CTGCTGTACGTTTGTTCAATGATTCTTTAAAAATGTTTCTCTG




Intron 6 GTATAAAAAA ... TATGTTGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A193.3311216
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A957.89465
A1067.4471811



>TRINITY_DN47770_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform
TCTCAATATACATCTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATGGC
ACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGAGG
TAAGTGAAGCAAAGCTCTTTGCTCTGTCATCAATTGCTTCTGGTTGGAGTTTTTCTTTCTTGTTGTGTTTGTTTATGTGCGTGTGTGAGTCTTCGGGCATGGAATCTTCTGAAAGTAGATAACTACAGTAATCAAATGGTTGGATCATTGTTGCAAACCCTATTCAATGTTCACTACTAGTAACATTACAGATTAATTTC
ATTAGCTAATTGTTTCAGCCTTTGTGTTTTTCAGCAAGCAGCATATCAGCATACCGATAGGAATCGCCTGAGAAAATAGGCTCTCTGAGATCTAGTAGGAAATATACCAGACTCAGGTGCTTTATCTCTTTAGCATTTCACGCAAACAAAAGCTAGGTTGATGTGTTTTGGCTTACTGGAATCTGGCTTGTCTCCATGGG
AAACTTAAAAAACAAGGCATCAAATCTCAGACGCATAAGTTTTCCTTCCAGGATGCTTGGAACAAGGTTCTTCACCCTTCCAAGATCGGCCTATCAAGATTGGCTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTGATCAGATTTACGAAAAGAAACAGATAATATATCTCTATTCATTTTTCATGGTGTCGATGACTTGCGGCTT
GCCATTGGGAAGCAAAAATAAGGCTGCAGTTACGACGCAACATAGAAGAAGTGCACAGGCTAGGCTACATAATCATATCCACTCTATGAGTTGTTTATTAGATGAAATTGTTCTGCATTCATGCTTTTCAACCTTTTCTGGCCTTCCAGACCAGAGTCCTCCTTATGATCTTGCCCCACTGTATGGTAGGTGAATGTTGC
AGACTGTCTTTGGCCATCATAACAATAGCAGGGTATATGGCAAGAGTAAATAGTTTACCTTCCCATCTCAATGAGCAGCAAATTTATGCAATACTCCCTTAGATGGAGAACTTCAGAATCCTAGTATGGGCTGGTGGGTTGTGTACATTGATAATGCATGAGATATGATGCTTGTAGGAGATGATCCATACAAAATCCAG
TGATCATTGTGATTGACAAAAGGTTTGATTGTTTGAACAGCATGATTCAATTTCATGTATGGTGGCTTATGACATCTGCTATATTTTGATTATGCAACGCCAAATCTCGCTATTGTTTTGATGGCCAGGGGTAGTCTTTTTTTACACTACGGTCGACAATGTTAGCTAGATCCTTTGGAAGAATCTATTCTTTACAGTCT
GGAAAAACATGAATGCATTGCTCTTTACGGTTTAGAAAAGCATGAATGCAGAACAATTTCCTCCCATAAATAACTCATTAGGTGAATGTAATGATATGGCATAGCCTCTACAACTCTTTTATCATGGGTCATGACCGCAATCTTATTTTTGATCTCCGATGGAAAACAAAGAGAGCTTTTTTCTTATCAGATTTTGATTT
TGATCACATGGAAGTTTGGTCTGCATGAGCATCTTGGACCAGTTGTGTTTAACCTTGGATATCTACGATAGTGCCAGCCAAAACAGAGGGATAATGAAGGAGACATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTGCTCAATACTCCACTGATCATTGTCGATTAAAACGTTGTTTTATTGTTTGACCGG
TATGATTCAATTTCATTTCCTATAACTTTTGTGTATTGATTTGTATGTTATGATGTAATTACAGGGGGTTCTGTAGCATTGTGCAAAACTGTTTTATTTACACTTCTGAAGAGGAATAGAAAATGACTCAAGGGGCTGTGAGCACGAAGGTTTCAGGATGATCAGAAGATATAACAATTACCCAAGAAACTTCCAAGTAG
TTCAAACCTTAAAATTTTTTGGATCCCTATGTTTCCTTGGAGACGTTATGCAGGGCATTGAATTAATTTCAGATTGTATGGTGCTTTCTGTATCATTTGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATAGCTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCA
GGCATCCAATAAAACTTGATGCACACATGGATTTTTGTATTAAGGCACTTCAAAGGTTTGGCAATACTGCATATCTTCATATTTCAGTGGCCTTCATTCA


>TRINITY_DN47770_c0_g1_i7 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TCTCAATATACATCTCACACGAAGTTTAAGAACCTTTTCCTTTTTATAAATATATCTCAATTCCATTCGATGGTGATTAGGGTTCATAGGGTTCTGGTGGATACATCGAGCCGTCTCCTCCTGGCATCTCGCTTCTCTTCTGTGCTTTCATGTTGTTTTTGCCTTTAACGTAATGGCGGCCGCGCCTGGAGAAACATGGC
ACGAGGAAGGCTAGGTACTGACCTTACAGAGGAAAATTCCATGTCTACAGAATGAAAATGTTATGTTGATGGATGGGCCGGGCAGGCAGGCTCTGTTAAAATTATATATACGTGATGTGCGATGATCCACCCCCTCTGTGCAAGAGACGCGGCTGCAATAATAAGTGGAACTTTCATCCATTCAAAATTGGTTGGTGAGC
AAGCAGCATATCAGCATACCGATAGGAATCGCCTGAGAAAATAGGCTCTCTGAGATCTAGTAGGAAATATACCAGACTCAGGTGCTTTATCTCTTTAGCATTTCACGCAAACAAAAGCTAGGTTGATGTGTTTTGGCTTACTGGAATCTGGCTTGTCTCCATGGGAAACTTAAAAAACAAGGCATCAAATCTCAGACGCA
TAAGTTTTCCTTCCAGGATGCTTGGAACAAGGTTCTTCACCCTTCCAAGATCGGCCTATCAAGATTGGCTAGCTGAAATTCCTCTTTCAAGACTGATCAGATTTACGAAAAGAAACAGATAATATATCTCTATTCATTTTTCATGGTGTCGATGACTTGCGGCTTGCCATTGGGAAGCAAAAATAAGGCTGCAGTTACGA
CGCAACATAGAAGAAGTGCACAGGCTAGGCTACATAATCATATCCACTCTATGAGTTGTTTATTAGATGAAATTGTTCTGCATTCATGCTTTTCAACCTTTTCTGGCCTTCCAGACCAGAGTCCTCCTTATGATCTTGCCCCACTGTATGGTAGGTGAATGTTGCAGACTGTCTTTGGCCATCATAACAATAGCAGGGTA
TATGGCAAGAGTAAATAGTTTACCTTCCCATCTCAATGAGCAGCAAATTTATGCAATACTCCCTTAGATGGAGAACTTCAGAATCCTAGTATGGGCTGGTGGGTTGTGTACATTGATAATGCATGAGATATGATGCTTGTAGGAGATGATCCATACAAAATCCAGTGATCATTGTGATTGACAAAAGGTTTGATTGTTTG
AACAGCATGATTCAATTTCATGTATGGTGGCTTATGACATCTGCTATATTTTGATTATGCAACGCCAAATCTCGCTATTGTTTTGATGGCCAGGGGTAGTCTTTTTTTACACTACGGTCGACAATGTTAGCTAGATCCTTTGGAAGAATCTATTCTTTACAGTCTGGAAAAACATGAATGCATTGCTCTTTACGGTTTAG
AAAAGCATGAATGCAGAACAATTTCCTCCCATAAATAACTCATTAGGTGAATGTAATGATATGGCATAGCCTCTACAACTCTTTTATCATGGGTCATGACCGCAATCTTATTTTTGATCTCCGATGGAAAACAAAGAGAGCTTTTTTCTTATCAGATTTTGATTTTGATCACATGGAAGTTTGGTCTGCATGAGCATCTT
GGACCAGTTGTGTTTAACCTTGGATATCTACGATAGTGCCAGCCAAAACAGAGGGATAATGAAGGAGACATGATTCTTGTAGGAGATGAACCATGGCATTAAGTTCAACTGCTCAATACTCCACTGATCATTGTCGATTAAAACGTTGTTTTATTGTTTGACCGGTATGATTCAATTTCATTTCCTATAACTTTTGTGTA
TTGATTTGTATGTTATGATGTAATTACAGGGGGTTCTGTAGCATTGTGCAAAACTGTTTTATTTACACTTCTGAAGAGGAATAGAAAATGACTCAAGGGGCTGTGAGCACGAAGGTTTCAGGATGATCAGAAGATATAACAATTACCCAAGAAACTTCCAAGTAGTTCAAACCTTAAAATTTTTTGGATCCCTATGTTTC
CTTGG
gtataaaaaattccactgctcaacacttttatcttgtctatatgcattgtgtctcatgtttactgaggtagcttctaaatgatcaaatgacatgtcttggttggctctatgttgtagAGACGTTATGCAGGGCATTGAATTAATTTCAGATTGTATGGTGCTTTCTGTATCATTTGGTAAGTGATTTGTTATAAC
TTCAGCATCGATTATGAAGGTACACCCCAGGGCCCATGCTTTGTTTAGCAGTTAGAAAGTTTCAAGAACAACGTGGTCAGTGCAAAATTATCCTTAAAGTAGTTCCAGTCTTTTCTAAACTATTTTGATCAAGGAAAGAGATATAATCCCAGTTTGATTTTGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTT
TGTTTCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATAGCTTTCTGTATTAAGGCACTTCAAAGGAAATTTCTCAGGCATCGACTGATCAAATTCTTGAAAGCGTGTCTTGAGTTGTTGGCTGTTTCTGCATATTAATGGTAATTGGCTAGTTGTTGATTCCGTATTCAGGTTACAGTTCTCTTGTTACAATGCAGCCTTTTGTT
TCCCAGCAATAAAACTTGATGCACACATGGATTTTTGTATTAAGGCACTTCAAAGGTTTGGCAATACTGCATATCTTCATATTTCAGTGGCCTTCATTCATAAAAAAAATTGATGCTCACATGGTTTTCTGTATTATGTAAATGTTCTACTTTTGCATTGGCTCTGGTCATAATAAATGTTCAAAGTTTGCTATGTGGAA
TGAGTATGAAGATGACAAGTAAATACCTGCAAGGTAGTACCCGCATCAAGGATTTGTGCTTGCGTAGATAAATTGCATAAGCAACAGGAACATACCCATAACATAATATTGCAGAAGTTAGAAAATTTGCATACTAAAATTGCAGAAGATGGGAGAACTGCAAAACCTATCTTTCTGAAAGCAGTAAGCCTATAGCCTTG
CATTGTGCAATTCAGATGCTCACAAGCACAGCACCCTGAATTGCAGAATACAACAACCTGCAATAGGGAGTTGCATAACCAGAAGCGACAAAGAGGCATCACAGAATACGACATCCTAAATTGCAGAATACAGCGAATTGTATTACCAGTCCGCGATGGCCTTGAGAAGCTTGCAAAGAAGCTTAACCTATTTATTCATT
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