sp|Q8S9J0|TAUE4_ARATH ----> Sulfite exporter TauE/SafE family protein 4


Intron 1 GTAAGTGCCT ... TGTCATATAG

Found issues: Low number of reads   


SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A133.33321
A220201
A30100
A433.33101
A5100001
A60200
A7100011
A833.33303
A933.33220
A1050111



>TRINITY_DN28130_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform
GGATTGGAACACTAGAAACAATTTGTTTCAACATTAGATGGAAAGGACTTTCGGTTCTCATGGTTGTATGGATTTCATTTCTAATTCTCCAAATATTAAAGAATGGTTCAGTTCTTTGTGGTATGGAGTATTGGACAGTGAATGTCTTGCAGATTCCAGTGGCATTTGGTGTTTGCATCTATGAAGCAATGTTCCTATAC
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TGATTTTCATTAGCGCATTGACAATGGGGGCCGTTGGAATTGAGAGAAGTATTCATATGATCCAAGAGAAGGAGTACATGGGATTTTTCAACCTTTGCCAAGAAACCTAATAAGTTCTATACTTGATGGTCTCTCCAATCTAGAAATAAAAAGAAGTATATGTATACACAAAGGAGACATGCAAGTTAAGAAATATTAGA
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>TRINITY_DN28130_c0_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:
GGATTGGAACACTAGAAACAATTTGTTTCAACATTAGATGGAAAGGACTTTCGGTTCTCATGGTTGTATGGATTTCATTTCTAATTCTCCAAATATTAAAGAATGGTTCAGTTCTTTGTGGTATGGAGTATTGGACAGTGAATGTCTTGCAGgtaagtgcctatagaagactagatgatttaacccaacaaagataaggt
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Intron 2 ATGTGTCTAG ... AATATTAAAC

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A143.75970
A253.33780
A3-1000
A4-1000
A5-1000
A660692
A758.33570
A845.8313112
A931.251150
A10-1004



>TRINITY_DN28130_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoform
GGATTGGAACACTAGAAACAATTTGTTTCAACATTAGATGGAAAGGACTTTCGGTTCTCATGGTTGTATGGATTTCATTTCTAATTCTCCAAATATTAAAGAATGGTTCAGTTCTTTGTGGTATGGAGTATTGGACAGTGAATGTCTTGCAGATTCCAGTGGCATTTGGTGTTTGCATCTATGAAGCAATGTTCCTATAC
AAGTGTAGCAAGAGCAAGAGACAATGTGGAGACACAGATAATGTTTGTGAGGCTTCTGTTGAGTGGGGGGTAACCGTGTTAGTTTTGTGTGCATCTTGTGGAATTGTGGGTGGCATTGTTGGAGGTTTACTTGGATCTGGTGGTGGATTCATATTAGGGCCTCTACTTCTTGAAATTGGTGTAATGCCACAGGTTGCTAG
TGCCACTGCAACCTTTGTGATGATGTTTTCCTCCTCACTGTCTGTGTTGGAATTCTATTTTCTGAATAGATTTCCACTCCCCTATGCTTTGTATCTTATCAGTGTCTCTATTTTAGCTGGATTTTGGGGGCAATATTTCATTCGAAAGCTTGTGACAATACTTGGAAGAGCTTCAATCATTGTTTTCATCCTCTCTGGGG
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>TRINITY_DN28130_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
TGCATCTATGAAGCAATGTTCCTATACAAGTGTAGCAAGAGCAAGAGACAATGTGGAGACACAGATAATGTTTGTGAGGCTTCTGTTGAGTGGGGGGTAACCGTGTTAGTTTTGTGTGCATCTTGTGGAATTGTGGGTGGCATTGTTGGAGGTTTACTTGGATCTGGTGGTGGATTCATATTAGGGCCTCTACTTCTTGA
AATTGGTGTAATGCCACAGGTTGCTAGTGCCACTGCAACCTTTGTGATGATGTTTTCCTCCTCACTGTCTGTGTTGGAATTCTATTTTCTGAATAGATTTCCACTCCCCTATGCTTTGTATCTTATCAGTGTCTCTATTTTAGCTGGATTTTGGGGGCAATATTTCATTCGAAAGCTTGTGACAATACTTGGAAGAGCTT
CAATCATTGTTTTCATCCTCTCTGGGGTGATTTTCATTAGCGCATTGACAATGGGGGCCGTTGGAATTGAGAGAAGTATTCATATGATCCAAGAGAAGGAGTACATGGGATTTTTCAACCTTTGCCAAGAAACCTAATAAGTTCTATACTTGATGGTCTCTCCAATCTAGAAATAAAAAGAAGTATATGTATACACAAAG
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CTTTGCCTAGGTTCAATTAGGGTGGTTCATCAAGGGATCTTGTAGGTTAAGAAGTATTAGAGGTATTGTCTAATTTA