sp|Q9LMM6|BPS1_ARATH ----> Protein BPS1, chloroplastic


Intron 1 GTGAGTTTTG ... CTTGTGACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN121362_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
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AATCTGTACTGGTTACAATTTGTGTGTTTGAGCGGATTGCCGAGAATTTCATCTTACGAGCAAGTGCCTGTGAGGTAATAACAGCATCTTCACAATAAAATAAATTGATTAAAGCCTGAAGGGACAGATCAGAGTAGAGGCGAGAACTGCATAATAGAGTGTTTCTGTGTTGTGCTTCCGAACCTTTGGTTCACCCTGAG
GAATATTGGTTCAGATGCTTCGTTTTTATGTAGTTTGAAGACCTTTTCTGCCTACAGTACTGTATTGTTTCCTTTTTAGCGCTTCGACTGAGTCAGGCCTTGATCTGACCATGAGTCGTCCTCATGATGGTCATTCGATGTCCTCGTTATTTGGAAATCCTTTTAGAATTTTTATTCGCAAGCGATCATTCAATTCCTCT
GCAAGGCTTAATCAGGTATTGAAAGCTTTTGAGACTGCTTTAGCAGAAAGATTAGAGCTGCTCAAGCTGAATAAACCAAAAGACTTTATAGATCTGACATGGATGCGACAAGCCATGGAAACCTTGTGCACACTGCACAGTGATTTGAGATCCTTGGTTGCGGAGATTCGGTTTCCTATAGCAAAATGGGATCAAAAATG
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GAATATACAGTGTGAAATGGCCTGTAATTTGATTCCTATTTATATGATGATGA


>TRINITY_DN121362_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
GTCCTTCAAAGGAGAAAGCAAAGGCTAACGGACCGACCTATATCAGAGATACCGCTTGTTTTCTCCATACCGCTTTTCACAAAAGCCGCACGGACAAAGACAAAATTCAAACCTAATTTGAACCCTTTCAACGATAATCTGTTACACACATGGCCTAAAGAGCAAGTGTTCAGGATTTTCGGGAACTCCTTTTCAAGAAA
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CCTGGTCCATTGGTGGACTTGAGCATTCCTGATCAGTTTTTGTGGACAGCTTCATTTATGACGTTGCAGCAAGAATTGAATGAAGAAATCAGGGGCGGGTTTGCCACTGGCCGTGTTACAGTTCTGAAAGAGCTGGAGAGCTTGGATGCAGCAGTTAAAAATGTTCACTCAACGATTCAGATGTTATCCCTGGACCTACC
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atttgtatatattgatggacagatatgtgtaatctttcagttttcaaatatatgtataatcttagacttttcaaatatatgtatagtcttagacttttcaaatatatgtataatctttgagtttcttgagtctgacattgtagagcatgttgatgcttcccatccagcctttgtattgtatcagtgtttcaaattaatct
ggtttccaaataaacaaatagggtgtcatctctatatactcattttttctttaatcaacttgcatcttgtgacagGATTCATCATTGTGCAACATCCGTTAAAAGGATATTTTATGGCAATTAATAACTATTTCCCTGTAAACTATTTTCTGTTCTTTTGCATATAGTTGATATGCCATTGTCTCTTCTCCAAAGACAAA
ATTATTTTCACCATATAAATCCCGGTGTTCGGATCTGGGTTATTAATTTGGTGTTTGAACTTGGGACATTAAGTTGGCAGCGCCCTGTCTCAATCACTAGACTACAGCTTGATACTGACTGCAGCTAGAGTATCTGAGGACAAATAAAGCTGCTTCCTATTTTGGCTGCAAGGTATGATTTCACACAGGCTGATATTTCA
AACTAATCAAATTAAAATAGTCAGACCAGAGTAAATTAAGGTAAATGCTAAAACAGTGCAAGATATAATCAAGCTTTTGTTGACAAATAGTGATTGAATATACAGTGTGAAATGGCCTGTAATTTGATTCCTATTTATATGATGATGA