NA ----> NA
Intron 1 GTATGTGCTT ... TTGTGTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 61.91 | 1.3 | 0 | 2.3 |
| A2 | 36.36 | 7 | 5 | 3 |
| A3 | 20 | 2 | 1 | 0 |
| A4 | 23.33 | 5.3 | 0 | 3.3 |
| A5 | -1 | 0.3 | 0 | 0.3 |
| A6 | 25.13 | 41.7 | 5 | 23 |
| A7 | 14.82 | 23.7 | 1 | 7.3 |
| A8 | 20.1 | 16.3 | 6 | 2.3 |
| A9 | 20.77 | 34.3 | 6 | 12 |
| A10 | 11.2 | 34.3 | 4 | 4.7 |
>TRINITY_DN33557_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformCGAAATGTGCGGTGGGGGTGCTTCGTTGGTGCCAGACGCTTGCTCCCAAGGTTTATGGTTTCCCCATCTTGTTTTGACCTGTCGACATGTTGGTTTCTCTCCTTGCCCGTGTTGGTTTCTCTAATTCTGGCTGTTAGTTCTTCGACGGTTTCTTGGTTCTTAGTCCTGTTGTGCGAGGTTTCGCTGGAGCTGTGTGGATG
GAGAGCCTAGCAGTTGGAGCATCGTTGGTGGCTGAAAAGGGTTTCCCGGGTTGGAGCTTCTGTCGTTTGTGGGTTTTTCTCCTCATAGGCTTGTTGGGCACTGTGTATAGGACTTTTAGTGATAGGATTTGGCATATCTGTGAATGTATGGTTTAATTCCATAGGTTTCGAAAGAGAAATGAATTTGGTTACCGTGATTT
CACAGAATTGCCAATGTAATGGTGCTTTGTTTGTATTGCTTTCCTTCAGGTGTTTAAATGCTGTAATTGGTTAATGATTTAAAGTAAATTAATGAGCGCTTTTGTGTTTGTG
>TRINITY_DN33557_c0_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:CGAAATGTGCGGTGGGGGTGCTTCGTTGGTGCCAGACGCTTGCTCCCAAGGTTTATGGTTTCCCCATCTTGTTTTGACCTGTCGACATGTTGGTTTCTCTCCTTGCCCGTGTTGGTTTCTCTAATTCTGGCTGTTAGTTCTTCGACGGTTTCTTGGTTCTTAGTCCTGTTGTGCGAGgtatgtgcttaattaaaggcatt
tttttttggttctcagcgagtttatggggttccaatgtgtgactgttgtgtgcagGTTTCGCTGGAGCTGTGTGGATGGAGAGCCTAGCAGTTGGAGCATCGTTGGTGGCTGAAAAGGGTTTCCCGGGTTGGAGCTTCTGTCGTTTGTGGGTTTTTCTCCTCATAGGCTTGTTGGGCACTGTGTATAGGACTTTTAGTGA
TAGGATTTGGCATATCTGTGAATGTATGGTTTAATTCCATAGGTTTCGAAAGAGAAATGAATTTGGTTACCGTGATTTCACAGAATTGCCAATGTAATGGTGCTTTGTTTGTATTGCTTTCCTTCAGGTGTTTAAATGCTGTAATTGGTTAATGATTTAAAGTAAATTAATGAGCGCTTTTGTGTTTGTG