sp|Q9M9S6|UTR3_ARATH ----> UDP-galactose/UDP-glucose transporter 3
Intron 1 GTAAGTTAAT ... TTTCTTTGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20 | 32 | 12 | 4 |
| A2 | 25.27 | 34 | 11 | 12 |
| A3 | 11.11 | 40 | 7 | 3 |
| A4 | 12 | 22 | 6 | 0 |
| A5 | 20 | 24 | 11 | 1 |
| A6 | 16.22 | 62 | 20 | 4 |
| A7 | 16.86 | 143 | 36 | 22 |
| A8 | 17.65 | 77 | 24 | 9 |
| A9 | 18.47 | 128 | 43 | 15 |
| A10 | 20 | 148 | 55 | 19 |
>TRINITY_DN105671_c1_g1_i1 from sample A2 / Example spliced isoformCTGTGCGCAGAGCTTTCCAATTGCTTAAGAATCAATTTGAAGGCCGTGCGCGTAGCTTTCCAATTGCTTATTTTCCTAAAAAATTCCAGGGAGAATCGATTAAGAGGCCGAAGGAGAGTACTCAAGGATCCATTAAAAAATGGAGAAGGAAGTTAGTGCATTTCAGCGCGTTGTATGGCTTCTCATTTGCGTGGGGGGGA
TTTTTGGAGCTTACATATATCAAGGATTTTTGCAGGAAACATTATCCACAAAACGTTTCGGTCCCGATGGCCAGAGATTTCAACACCTGCAATTCTTGAACTTTTCACAGAATGTAGTCTGCTTAGCCTGGTCATACATAATGATGAAATTTTGGTCCACAAAAAGTAGTGGCACAGCTCCACTGCGGGAATTTTGCAGC
CCCAGCATAACAAATACTATTGGACCAGCATTGGGTCTCCAAGCATTGAAGTACATCAGCTACCCTGCCCAGGTTTTGGCGAAATCCTCAAAAATGATTCCAGTTATGCTGGTTGGAGGACTGTTTTATGGCATCAAATATACTTTGCCTGAATACATCTGTACTTTTCTTGTTGCTGGCGGTGTATCTTTATTTGCACT
CTCTAAGAGTAGTTCAAAGACAGTAAGTAAGCTTGCACACCCTAATGCACCATGGGGATACGGACTTTGCCTTGCTAATCTCCTCTTGGATGGATACACAAATTCCACCCAGGATAATATAAAAAAAAGATATCCTAAAACAAGTGGATGGGATATCATGCTAGGGATGAATCTCTGGGGTTCTGTGTACTCTCTCTATA
TGTTTATCTTGCCAGGTGCTGGTGGTTTTGAGGCAGTGCATTTCTGCAAACAGCACCCTGAAGCTGCATGGGATATTTTATGGTTCTGTGTTTGTGGAGCGATCGGGCAGAATTTCATCTTTATGACCATAAGTATGTTTGGGTCTTTGGCAAATACCACCATAACTACTGTACGCAAATTTTTTAGCATTCTGGTATCA
TCACTGTTTAGTGGTAACCCACTCTCAGATAGACAATGGGTTAGTGTATTCATGGTATTCGGTGGCTTGGCATGTCAAATCTACTTGAAATGGAAACGGACACAGCCTAGGAGCAAAGCTATCTAGCCAAAAAATGATGTATGATGATAGCAGAGTAGGGTTTCGGATGTCTTCCGTACATGGGATGTTTAGGCAATCGT
GGCTTTGGAATCCTTGGATGGTCATGTCTCAAATTGACCAGCTATGCTTGTTCCAGAAAAAGAATGTGTAATGAAAGAATTGCATTAATTTACAGGAAGTGGTGCAAACTTAACTAATTTTCCCCTCATGTGAGGCTGCCGTGCATTGGAAAAGAGGAGAACCATAAGATAGATTCTTGGTAAGCTCTTGAAGTTCTGAG
CACTGAAAACACAATTAATTTTTGATTTATCGCAGCCCTATAAAATTGGGTTTAACCTGTATGTAATGAGGTATGGTACTTGCCAATTCAATGAAATGGAATTAATTCTTTATTAACAGTTTACAAAGAGTTTCTACAGTTGAGCTCCACCTCATATATCTGTAATAGTGTATACTGCTCGCAAAGCGTTACTAACCTGT
G
>TRINITY_DN105671_c1_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:CTGTGCGCAGAGCTTTCCAATTGCTTAAGAATCAATTTGAAGGCCGTGCGCGTAGCTTTCCAATTGCTTATTTTCCTAAAAAATTCCAGGGAGAATCGATTAAGAGGCCGAAGGAGAGTACTCAAGGATCCATTAAAAAATGGAGAAGGAAGTTAGTGCATTTCAGCGCGTTGTATGGCTTCTCATTTGCGTGGGGGGGA
TTTTTGGAGCTTACATATATCAAGGATTTTTGCAGGAAACATTgtaagttaataaataccatttgattatttcagttgtttttgtttttctctttgtttatacggatatttttcctgctaggtgttttttggacttctagtttctttgagATCCACAAAACGTTTCGGTCCCGATGGCCAGAGATTTCAACACCTGCAAT
TCTTGAACTTTTCACAGAATGTAGTCTGCTTAGCCTGGTCATACATAATGATGAAATTTTGGTCCACAAAAAGTAGTGGCACAGCTCCACTGCGGGAATTTTGCAGCCCCAGCATAACAAATACTATTGGACCAGCATTGGGTCTCCAAGCATTGAAGTACATCAGCTACCCTGCCCAGGTTTTGGCGAAATCCTCAAAA
ATGATTCCAGTTATGCTGGTTGGAGGACTGTTTTATGGCATCAAATATACTTTGCCTGAATACATCTGTACTTTTCTTGTTGCTGGCGGTGTATCTTTATTTGCACTCTCTAAGAGTAGTTCAAAGACAGTAAGTAAGCTTGCACACCCTAATGCACCATGGGGATACGGACTTTGCCTTGCTAATCTCCTCTTGGATGG
ATACACAAATTCCACCCAGGATAATATAAAAAAAAGATATCCTAAAACAAGTGGATGGGATATCATGCTAGGGATGAATCTCTGGGGTTCTGTGTACTCTCTCTATATGTTTATCTTGCCAGGTGCTGGTGGTTTTGAGGCAGTGCATTTCTGCAAACAGCACCCTGAAGCTGCATGGGATATTTTATGGTTCTGTGTTT
GTGGAGCGATCGGGCAGAATTTCATCTTTATGACCATAAGTATGTTTGGGTCTTTGGCAAATACCACCATAACTACTGTACGCAAATTTTTTAGCATTCTGGTATCATCACTGTTTAGTGGTAACCCACTCTCAGATAGACAATGGGTTAGTGTATTCATGGTATTCGGTGGCTTGGCATGTCAAATCTACTTGAAATGG
AAACGGACACAGCCTAGGAGCAAAGCTATCTAGCCAAAAAATGATGTATGATGATAGCAGAGTAGGGTTTCGGATGTCTTCCGTACATGGGATGTTTAGGCAATCGTGGCTTTGGAATCCTTGGATGGTCATGTCTCAAATTGACCAGCTATGCTTGTTCCAGAAAAAGAATGTGTAATGAAAGAATTGCATTAATTTAC
AGGAAGTGGTGCAAACTTAACTAATTTTCCCCTCATGTGAGGCTGCCGTGCATTGGAAAAGAGGAGAACCATAAGATAGATTCTTGGTAAGCTCTTGAAGTTCTGAGCACTGAAAACACAATTAATTTTTGATTTATCGCAGCCCTATAAAATTGGGTTTAACCTGTATGTAATGAGGTATGGTACTTGCCAATTCAATG
AAATGGAATTAATTCTTTATTAACAGTTTACAAAGAGTTTCTACAGTTGAGCTCCACCTCATATATCTGTAATAGTGTATACTGCTCGCAAAGCGTTACTAACCTGTG
Intron 2 GTATTACATA ... ACAATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.41 | 45 | 2.4 | 13 |
| A2 | 36.67 | 19 | 2.8 | 11 |
| A3 | 19.23 | 21 | 2.4 | 5 |
| A4 | 25 | 33 | 7.6 | 11 |
| A5 | 14.29 | 6 | 0.8 | 1 |
| A6 | 21.05 | 75 | 8.4 | 20 |
| A7 | 23.46 | 137 | 14 | 42 |
| A8 | 23.33 | 115 | 23.4 | 35 |
| A9 | 21.58 | 109 | 9.6 | 30 |
| A10 | 23.44 | 98 | 20 | 30 |
>TRINITY_DN96409_c0_g1_i6 from sample A4 / Example spliced isoformGTTTCTGTGCGCAGAGCTTTCCAATTGCTTAAGAATCAATTTGAAGGCCGTGCGCGTAGCTTTCCAATTGCTTATTTTCCTAAAAAATTCCAGGGAGAATCGATTAAGAGGCCGAAGGAGAGTACTCAAGGATCCATTAAAAAATGGAGAAGGAAGTTAGTGCATTTCAGCGCGTTGTATGGCTTCTCATTTGCGTGGGG
GGGATTTTTGGAGCTTACATATATCAAGGATTTTTGCAGGAAACATTATCCACAAAACGTTTCGGTCCCGATGGCCAGAGATTTCAACACCTGCAATTCTTGAACTTTTCACAGAATGTAGTCTGCTTAGCCTGGTCATACATAATGATGAAATTTTGGTCCACAAAAAGTAGTGGCACAGCTCCACTGCGGGAATTTTG
CAGCCCCAGCATAACAAATACTATTGGACCAGCATTGGGTCTCCAAGCATTGAAGTACATCAGCTACCCTGCCCAGGTTTTGGCGAAATCCTCAAAAATGATTCCAGTTATGCTGGTTGGAGGACTGTTTTATGGCATCAAATATACTTTGCCTGAATACATCTGTACTTTTCTTGTTGCTGGCGGTGTATCTTTATTTG
CACTCTCTAAGAGTAGTTCAAAGACAGTAAGTAAGCTTGCACACCCTAATGCACCATGGGGATACGGACTTTGCCTTGCTAATCTCCTCTTGGATGGATACACAAATTCCACCCAGGATAATATAAAAAAAAGATATCCTAAAACAAGTGGATGGGATATCATGCTAGGGATGAATCTCTGGGGTTCTGTGTACTCTCTC
TATATGTTTATCTTGCCAGGTGCTGGTGGTTTTGAGGCAGTGCATTTCTGCAAACAGCACCCTGAAGCTGCATGGGATATTTTATGGTTCTGTGTTTGTGGAGCGATCGGGCAGAATTTCATCTTTATGACCATAAGTATGTTTGGGTCTTTGGCAAATACCACCATAACTACTGTACGCAAATTTTTTAGCATTCTGGT
ATCATCACTGTTTAGTGGTAACCCACTCTCAGATAGACAATGGGTTAGTGTATTCATGGTATTCGGTGGCTTGGCATGTCAAATCTACTTGAAATGGAAACGGACACAGCCTAGGAGCAAAGCTATCTAGCCAAAAAATGATGTATGATGATAGCAGAGTAGGGTTTCGGATGTCTTCCGTACATGGGATGTTTAGGCAA
TCGTGGCTTTGGAATCCTTGGATGGTCATGTCTCAAATTGACCAGCTATGCTTGTTCCAGAAAAAGAATGTGTAATGAAAGAATTGCATTAATTTACAGGAAGTGGTGCAAACTTAACTAATTTTCCCCTCATGTGAGGCTGCCGTGCATTGGAAAAGAGGAGAACCATAAGATAGATTCTTGGTAAGCTCTTGAAGTTC
TGAGCACTGAAAACACAATTAATTTTTGATTTATCGCAGCCCTATAAAATTGGGTTTAACCTGTATGTAATGAGGTATGGTACTTGCCAATTCAATGAAATGGAATTAATTCTTTATTAACAGTTTACAAAGAGTTTCTACAGTTGAGCTCCACCTCATATATCTGTAATAGTGTATACTGCC
>TRINITY_DN96409_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:GTTTCTGTGCGCAGAGCTTTCCAATTGCTTAAGAATCAATTTGAAGGCCGTGCGCGTAGCTTTCCAATTGCTTATTTTCCTAAAAAATTCCAGGGAGAATCGATTAAGAGGCCGAAGGAGAGTACTCAAGGATCCATTAAAAAATGGAGAAGGAAGTTAGTGCATTTCAGCGCGTTGTATGGCTTCTCATTTGCGTGGGG
GGGATTTTTGGAGCTTACATATATCAAGGATTTTTGCAGGAAACATTATCCACAAAACGTTTCGGTCCCGATGGCCAGAGATTTCAACACCTGCAATTCTTGAACTTTTCACAGAATGTAGTCTGCTTAGCCTGGTCATACATAATGATGAAATTTTGGTCCACAAAAAGTAGTGGCACAGCTCCACTGCGGGAATTTTG
CAGCCCCAGCATAACAAATACTATTGGACCAGCATTGGGTCTCCAAGCATTGAAGTACATCAGCTACCCTGCCCAGGTTTTGGCGAAATCCTCAAAAATGATTCCAGTTATGCTGGTTGGAGGACTGTTTTATGGCATCAAATATACTTTGCCTGAATACATCTGTACTTTTCTTGTTGCTGGCGGTGTATCTTTATTTG
CACTCTCTAAGgtattacatatatttcagcatctgtgtattctttttgtgcaataacttaacattgcactgctatgactgcactttatttggagcacaattgcagAGTAGTTCAAAGACAGTAAGTAAGCTTGCACACCCTAATGCACCATGGGGATACGGACTTTGCCTTGCTAATCTCCTCTTGGATGGATACACAAA
TTCCACCCAGGATAATATAAAAAAAAGATATCCTAAAACAAGTGGATGGGATATCATGCTAGGGATGAATCTCTGGGGTTCTGTGTACTCTCTCTATATGTTTATCTTGCCAGGTGCTGGTGGTTTTGAGGCAGTGCATTTCTGCAAACAGCACCCTGAAGCTGCATGGGATATTTTATGGTTCTGTGTTTGTGGAGCGA
TCGGGCAGAATTTCATCTTTATGACCATAAGTATGTTTGGGTCTTTGGCAAATACCACCATAACTACTGTACGCAAATTTTTTAGCATTCTGGTATCATCACTGTTTAGTGGTAACCCACTCTCAGATAGACAATGGGTTAGTGTATTCATGGTATTCGGTGGCTTGGCATGTCAAATCTACTTGAAATGGAAACGGACA
CAGCCTAGGAGCAAAGCTATCTAGCCAAAAAATGATGTATGATGATAGCAGAGTAGGGTTTCGGATGTCTTCCGTACATGGGATGTTTAGGCAATCGTGGCTTTGGAATCCTTGGATGGTCATGTCTCAAATTGACCAGCTATGCTTGTTCCAGAAAAAGAATGTGTAATGAAAGAATTGCATTAATTTACAGGAAGTGG
TGCAAACTTAACTAATTTTCCCCTCATGTGAGGCTGCCGTGCATTGGAAAAGAGGAGAACCATAAGATAGATTCTTGGTAAGCTCTTGAAGTTCTGAGCACTGAAAACACAATTAATTTTTGATTTATCGCAGCCCTATAAAATTGGGTTTAACCTGTATGTAATGAGGTATGGTACTTGCCAATTCAATGAAATGGAAT
TAATTCTTTATTAACAGTTTACAAAGAGTTTCTACAGTTGAGCTCCACCTCATATATCTGTAATAGTGTATACTGCC