NA ----> NA


Intron 1 GTAGATGTTC ... CTTTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A162.96152229
A261.296910
A385.7141929
A460.53151828
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A679.5951029
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A873.3381826
A955.34231938
A1069.23101134



>TRINITY_DN41280_c0_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoform
CACTTCAAGAGTCATTATATGAAGCTCCTCAGTTCAAGGAGGTTGATGTACAAGCTCTTGCACATGCAGTGGGGCTTCCAAGACAGGGTGCAATTGACAGCTTGAGATACACAGATGGTGATTTATTTGCTGCGTTTCAGAATGAACTGAGTCGAATGAAGCTAAATGTGCCAATGGTTGATGAGCTGGTTCACGAATAT
TGTCTTTACAGAGGTCTCATTTATGGTACCTTAAATTCTTCCTCAGATTTTCAAATTTCTCTCAAGCCCAAGATAAAAGATAGTTGCTGCAGGGAGGCATTCTCTTCATCAAATCTTGATGTGAATCGTTCTGTAGTACAGCAGTGGGGAAGCTTGCAGCACCAGTGGAGCATGCCAGACTGAGAATCCTGGAATACGCT
CTGGTAGGCTAAGAAACTGGATGCAAGCAGAGAGGGATAGTCAACCGAGATGGAGAGGGCGATGTTTTGAGAGTAAAGCAGAAGGGAAAATTGAGTTGTACAGTACCAAGGCTGATTCAAAGAGTTATGGTGTGGATAGATTTCAAATTGTACTGGAGATGCGAGAACTAGTAACCAAGGGTATGATTGTGAAGGTGGTT
CATGAAATCAAGGAATGGAATCCACATTTTTTTGAGCAAAATCCTATTCTGTTATTTCAACTGAAGCAGGTGGAGTTCCTTAAGTTGGTCGAGGATGGGAATTACACGGGAGCTCTGAGAGTGGCACGCTCTGACTTGGGTCCACTTGCTGCAAGTTATCAAAATTTGCTCAAACCTTTGAAAGAGACACTGCTGGCCTT
GGCAAGACCAGAGGAGAATGCATCAGTAAAATGCATTCCACTGAATATTGTTGCCACTTCTCTTCAGGTTGCATTGGGTGCCAGTATTGGGATTGAAGAACCACTATTGATGAAGTTAATGAGGGCCACACTTTATACTCATGCACAGTGGTTTAAGCTTCAAATGTGTACAGACCGTTTTGAGAAACTTTTGAGGATAA
GTGAGTTGAAAGAGCTGGATCCTACCATGGTTACAACATCAAAATCTGAACCCAACCCAGACTTATGCAGTGGTGCTACTTCCCATGTTACAGGAAATTCATGTAATTCAAATCCATCAGATGGTAGTAATCAACCACCAGAGGCTTCTGGAGGCCTCTTTAATGAAACTGCAATCCTCCAAGTCATGGAAGTTTTAGCT
TTGCCGAGATCTGACGCAATCCAGTTGCTTGCACAGTATGATGGAAGTGCTGATGCAGTATTTCAGCAAATCTTTAATTAAATTGTTTAATAAGATATATTGGTTCATTTGTTAATGTTATTCCAAATCTTAATTCCATTCATTCATTTGCTCTGTAAGGAATAGAATATCCTCAAAAGCCTTTTAGTGAGGCACGCTTT
TTATTATTTGTTTCCATGTTTATTGCACAACATGTGCTTATGCTGTCATTTGTAAATGGGGCTTTTGTCGCTGGGAAACACTGTCCATAATGGTCATCTTATGAAGTAATTAATGACGGAAGAACATCACTCGCATCTTTTCAGACATCGTGGATGGTTGATTTAATAGTGTTTTATGAATGCTAGTTGTAATTACAATA
AGGACTATAAAGCTCCAACTTCAGAATTTTAAGTGCGTTGACGGTTACGAAGCAGCGGTATTCTGTAGAGTGTTAAATACATATTCATGTCTATTTATACAGCACGTCACTGTAAGTTACAAAAGTCAATGCCCGGTTTTTAGTGCATGTGCTATCCTCAAGTTG


>TRINITY_DN41280_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:
ATTAGAGGGAGTTCTTCCATTCTATCTTCGTAGTTACATTACATTAGGAGTCAGGACACGCTTTGTGCGACGATAAGGAGGGTCGATATTCTTGCCTTTAATTCCCCAGAAGACAGATGACGATTACACCAACACTTCTATAAAATCTTCTCTCCTCTCTCCAACAGGCGTGGGAAACCATGGTTAAATAATGAGCTTGG
CTGTGGTGCACCACCAGATTTTATGTTGATGACGAAGAGGGAAAGGTGTGAGAGAAGACAAGCCATTTAGCTGTTATTACTGGTATATAAAAATCAGGAAATAAGGAAGAACCATCTGCAGCAACAACAACGCTCATGGAGAAGACGGGGACGGGGGAGAGGGCGAGAGGCATAGCAGGCTCATCAGGTGGTGGAGAAGC
AGAAAAAGAGATAGAGAGAACGCCTGTGAATTGGTTTGCCTTGGATGCTCTAGTACTCGATTACGCCAAATCAGAGAGACTTCTACTCGATCATGACAACGGCGTCCACTCCCCCTCCCCCTCCACCACCTCCTGCTCCTCCTCCTCTTCTTCGTTTAATTCTTCTTCGTCGTCTAATTGTATCCGTGAAGTGATAGAGG
CGACAAGGAAATTGATAGAGGAGGGGAGTATCGACCAGGTATTCAGTCTCCTCTCCCTCCACGCTCCTGCCGTGCTCGACGACCAGCACCTTGTTTTCCGTTTGCAGAAGCAGAAATTCATTGAATTGCTGAGGACCGGGAAAGGGGAGTCTCGTGATTTGGCCATCAACTGCTGTAGAACTGCACTCGGCCCTTGTGCT
CTCAACGCTTATCCTGAGGCTTATGAGGAGTTCAAGCGGGTACTATTGGCTTTTATATATGACAAGGACGACCAAACTTCACCAGTGGCAGAAGAGTGGTCTGAAAAAAGGAGATCTGCGTTAGCAGCCTTAGTGGCATCAACAATGAAAGCACGTCTACGGGCTTATGATCCATGCTTTTCACAGACACTAAAATATCT
GCTAAGTGTACACAATGGATTCTGCTACCGCCAATCTTTTACATCCACAATTTCTCATATTAGCAAGAAATTGCTTTCAGAAGAACGGGATCCTCCTGCAACACTTCAAGAGTCATTATATGAAGCTCCTCAGTTCAAGGAGGTTGATGTACAAGCTCTTGCACATGCAGTGGGGCTTCCAAGACAGGGTGCAATTGACA
GCTTGAGATACACAGATGGTGATTTATTTGCTGCGTTTCAGAATGAACTGAGTCGAATGAAGCTAAATGTGCCAATGGTTGATGAGCTGGTTCACGAATATTGTCTTTACAGAGGTCTCATTTATGGTACCTTAAATTCTTCCTCAGATTTTCAAATTTCTCTCAAGCCCAAGATAAAAGATAGTTGCTGCAGGGAGGCA
TTCTCTTCATCAAATCTTGATGTGAATCGTTCTGTAGTACAGCAGgtagatgttcaaactgctgcaggggatgtgatcatggaagattttactggtacatgctcagatggttcgcagggacaacagatagatgttgaattgagaatcccaagtgaaactttttacagTGGGGAAGCTTGCAGCACCAGTGGAGCATGCCA
GACTGAGAATCCTGGAATACGCTCTGGTAGGCTAAGAAACTGGATGCAAGCAGAGAGGGATAGTCAACCGAGATGGAGAGGGCGATGTTTTGAGAGTAAAGCAGAAGGGAAAATTGAGTTGTACAGTACCAAGGCTGATTCAAAGAGTTATGGTGTGGATAGATTTCAAATTGTACTGGAGATGCGAGAACTAGTAACCA
AGGGTATGATTGTGAAGGTGGTTCATGAAATCAAGGAATGGAATCCACATTTTTTTGAGCAAAATCCTATTCTGTTATTTCAACTGAAGCAGGTGGAGTTCCTTAAGTTGGTCGAGGATGGGAATTACACGGGAGCTCTGAGAGTGGCACGCTCTGACTTGGGTCCACTTGCTGCAAGTTATCAAAATTTGCTCAAACCT
TTGAAAGAGACACTGCTGGCCTTGGCAAGACCAGAGGAGAATGCATCAGTAAAATGCATTCCACTGAATATTGTTGCCACTTCTCTTCAGGTTGCATTGGGTGCCAGTATTGGGATTGAAGAACCACTATTGATGAAGTTAATGAGGGCCACACTTTATACTCATGCACAGTGGTTTAAGCTTCAAATGTGTACAGACCG
TTTTGAGAAACTTTTGAGGATAAGTGAGTTGAAAGAGCTGGATCCTACCATGGTTACAACATCAAAATCTGAACCCAACCCAGACTTATGCAGTGGTGCTACTTCCCATGTTACAGGAAATTCATGTAATTCAAATCCATCAGATGGTAGTAATCAACCACCAGAGGCTTCTGGAGGCCTCTTTAATGAAACTGCAATCC
TCCAAGTCATGGAAGTTTTAGCTTTGCCGAGATCTGACGCAATCCAGTTGCTTGCACAGTATGATGGAAGTGCTGATGCAGTATTTCAGCAAATCTTTAATTAAATTGTTTAATAAGATATATTGGTTCATTTGTTAATGTTATTCCAAATCTTAATTCCATTCATTCATTTGCTCTGTAAGGAATAGAATATCCTCAAA
AGCCTTTTAGTGAGGCACGCTTTTTATTATTTGTTTCCATGTTTATTGCACAACATGTGCTTATGCTGTCATTTGTAAATGGGGCTTTTGTCGCTGGGAAACACTGTCCATAATGGTCATCTTATGAAGTAATTAATGACGGAAGAACATCACTCGCATCTTTTCAGACATCGTGGATGGTTGATTTAATAGTGTTTTAT
GAATGCTAGTTGTAATTACAATAAGGACTATAAAGCTCCAACTTCAGAATTTTAAGTGCGTTGACGGTTACGAAGCAGCGGTATTCTGTAGAGTGTTAAATACATATTCATGTCTATTTATACAGCACGTCACTGTAAGTTACAAAAGTCAATGCCCGGTTTTTAGTGCATGTGCTATCCTCAAGTTG



Intron 2 GTGAGTTGAA ... CATGTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A170.4992617
A289.1922310
A376.9262614
A461.117139
A566.67271
A662.39224033
A776.84114033
A861.8172530
A969.41133425
A1081.25125153



>TRINITY_DN113095_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform
AATTGTATCCGTGAAGTGATAGAGGCGACAAGGAAATTGATAGAGGAGGGGAGTATCGACCAGGTATTCAGTCTCCTCTCCCTCCACGCTCCTGCCGTGCTCGACGACCAGCACCTTGTTTTCCGTTTGCAGAAGCAGAAATTCATTGAATTGCTGAGGACCGGGAAAGGGGAGTCTCGTGATTTGGCCATCAACTGCTG
TAGAACTGCACTCGGCCCTTGTGCTCTCAACGCTTATCCTGAGGCTTATGAGGAGTTCAAGCGGGTACTATTGGCTTTTATATATGACAAGGACGACCAAACTTCACCAGTGGCAGAAGAGTGGTCTGAAAAAAGGAGATCTGCGTTAGCAGCCTTAGTGGCATCAACAATGAAAGCACGTCTACGGGCTTATGATCCAT
GCTTTTCACAGACACTAAAATATCTGCTAAGTGTACACAATGGATTCTGCTACCGCCAATCTTTTACATCCACAATTTCTCATATTAGCAAGAAATTGCTTTCAGAAGAACGGGATCCTCCTGCAACACTTCAAGAGTCATTATATGAAGCTCCTCAGTTCAAGGAGGTTGATGTACAAGCTCTTGCACATGCAGTGGGG
CTTCCAAGACAGGGTGCAATTGACAGCTTGAGATACACAGATGGTGATTTATTTGCTGCGTTTCAGAATGAACTGAGTCGAATGAAGCTAAATGTGCCAATGGTTGATGAGCTGGTTCACGAATATTGTCTTTACAGAGGTCTCATTTATGGTACCTTAAATTCTTCCTCAGATTTTCAAATTTCTCTCAAGCCCAAGAT
AAAAGATAGTTGCTGCAGGGAGGCATTCTCTTCATCAAATCTTGATGTGAATCGTTCTGTAGTACAGCAGGTAGATGTTCAAACTGCTGCAGGGGATGTGATCATGGAAGATTTTACTGGTACATGCTCAGATGGTTCGCAGGGACAACAGATAGATGTTGAATTGAGAATCCCAAGTGAAACTTTTTACAGTGGGGAAG
CTTGCAGCACCAGTGGAGCATGCCAGACTGAGAATCCTGGAATACGCTCTGGTAGGCTAAGAAACTGGATGCAAGCAGAGAGGGATAGTCAACCGAGATGGAGAGGGCGATGTTTTGAGAGTAAAGCAGAAGGGAAAATTGAGTTGTACAGTACCAAGGCTGATTCAAAGAGTTATGGTGTGGATAGATTTCAAATTGTA
CTGGAGATGCGAGAACTAGTAACCAAGGGTATGATTGTGAAGGTGGTTCATGAAATCAAGGAATGGAATCCACATTTTTTTGAGCAAAATCCTATTTTGTTATTTCAACTGAAGCAGGTGGAGTTCCTTAAGTTGGTCGAGGATGGGAATTACGCGGGAGCTCTGAGAGTGGCACGCTCTGACTTGGGTCCACTTGCTGC
AAGTTATCAAAATTTGCTCAAACCTTTGAAAGAGACACTGCTGGCCTTGGCAAGACCAGAGGAGAATGCATCAGTAAAATGCATTCCACTGAATATTGTTGCCACTTCTCTTCAGGTTGCATTGGGTGCCAGTATTGGGATTGAAGAACCACTATTGATGAAGTTAATGAGGGCCACACTTTATACTCATGCACAGTGGT
TTAAGCTTCAAATGTGTACAGACCGTTTTGAGAAACTTTTGAGGATAAGAAATTCATGTAATTCAAATCCATCAGATGGTAGTAATCAACCACCAGAGGCTTCTGGAGGCCTCTTTAATGAAACTGCAATCCTCCAAGTCATGGAAGTTTTAGCTTTGCCGAGATCTGACGCAATCCAGTTGCTTGCACAGTATGATGGA
AGTGCTGATGCAGTATTTCAGCAAATCTTTAATTAAATTGTTTAATAAGATATATTGGTTCATTTGTTAATGTTATTCCAAATCTTAATTCCATTCATTCATTTGCTCTGTAAGGAATAGAATATCCTCAAAAGCCTTTTAGTGAGGCACGCTTTTTATTATTTGTTTCCATGTTTATTGCACAACATGTGCTTATGCTG
TCATTTGTAAATGGGGCTTTTGTCGCTGGGAAACACTGCC


>TRINITY_DN113095_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
AATTGTATCCGTGAAGTGATAGAGGCGACAAGGAAATTGATAGAGGAGGGGAGTATCGACCAGGTATTCAGTCTCCTCTCCCTCCACGCTCCTGCCGTGCTCGACGACCAGCACCTTGTTTTCCGTTTGCAGAAGCAGAAATTCATTGAATTGCTGAGGACCGGGAAAGGGGAGTCTCGTGATTTGGCCATCAACTGCTG
TAGAACTGCACTCGGCCCTTGTGCTCTCAACGCTTATCCTGAGGCTTATGAGGAGTTCAAGCGGGTACTATTGGCTTTTATATATGACAAGGACGACCAAACTTCACCAGTGGCAGAAGAGTGGTCTGAAAAAAGGAGATCTGCGTTAGCAGCCTTAGTGGCATCAACAATGAAAGCACGTCTACGGGCTTATGATCCAT
GCTTTTCACAGACACTAAAATATCTGCTAAGTGTACACAATGGATTCTGCTACCGCCAATCTTTTACATCCACAATTTCTCATATTAGCAAGAAATTGCTTTCAGAAGAACGGGATCCTCCTGCAACACTTCAAGAGTCATTATATGAAGCTCCTCAGTTCAAGGAGGTTGATGTACAAGCTCTTGCACATGCAGTGGGG
CTTCCAAGACAGGGTGCAATTGACAGCTTGAGATACACAGATGGTGATTTATTTGCTGCGTTTCAGAATGAACTGAGTCGAATGAAGCTAAATGTGCCAATGGTTGATGAGCTGGTTCACGAATATTGTCTTTACAGAGGTCTCATTTATGGTACCTTAAATTCTTCCTCAGATTTTCAAATTTCTCTCAAGCCCAAGAT
AAAAGATAGTTGCTGCAGGGAGGCATTCTCTTCATCAAATCTTGATGTGAATCGTTCTGTAGTACAGCAGGTAGATGTTCAAACTGCTGCAGGGGATGTGATCATGGAAGATTTTACTGGTACATGCTCAGATGGTTCGCAGGGACAACAGATAGATGTTGAATTGAGAATCCCAAGTGAAACTTTTTACAGTGGGGAAG
CTTGCAGCACCAGTGGAGCATGCCAGACTGAGAATCCTGGAATACGCTCTGGTAGGCTAAGAAACTGGATGCAAGCAGAGAGGGATAGTCAACCGAGATGGAGAGGGCGATGTTTTGAGAGTAAAGCAGAAGGGAAAATTGAGTTGTACAGTACCAAGGCTGATTCAAAGAGTTATGGTGTGGATAGATTTCAAATTGTA
CTGGAGATGCGAGAACTAGTAACCAAGGGTATGATTGTGAAGGTGGTTCATGAAATCAAGGAATGGAATCCACATTTTTTTGAGCAAAATCCTATTTTGTTATTTCAACTGAAGCAGGTGGAGTTCCTTAAGTTGGTCGAGGATGGGAATTACGCGGGAGCTCTGAGAGTGGCACGCTCTGACTTGGGTCCACTTGCTGC
AAGTTATCAAAATTTGCTCAAACCTTTGAAAGAGACACTGCTGGCCTTGGCAAGACCAGAGGAGAATGCATCAGTAAAATGCATTCCACTGAATATTGTTGCCACTTCTCTTCAGGTTGCATTGGGTGCCAGTATTGGGATTGAAGAACCACTATTGATGAAGTTAATGAGGGCCACACTTTATACTCATGCACAGTGGT
TTAAGCTTCAAATGTGTACAGACCGTTTTGAGAAACTTTTGAGGATAAgtgagttgaaagagctggatcctaccatggttacaacatcaaaatctgaacccaacccagacttatgcagtggtgctacttcccatgttacagGAAATTCATGTAATTCAAATCCATCAGATGGTAGTAATCAACCACCAGAGGCTTCTGGA
GGCCTCTTTAATGAAACTGCAATCCTCCAAGTCATGGAAGTTTTAGCTTTGCCGAGATCTGACGCAATCCAGTTGCTTGCACAGTATGATGGAAGTGCTGATGCAGTATTTCAGCAAATCTTTAATTAAATTGTTTAATAAGATATATTGGTTCATTTGTTAATGTTATTCCAAATCTTAATTCCATTCATTCATTTGCT
CTGTAAGGAATAGAATATCCTCAAAAGCCTTTTAGTGAGGCACGCTTTTTTATTATTTGTTTCCATGTTTATTGCACAACATGTGCTTATGCTGTCATTTGTAAATGGGGCTTTTGTCGCTGGGAAACACTGCC