sp|Q8VZJ0|SIA1_ARATH ----> Sialyltransferase-like protein 1
Intron 1 GTAAGTTAGA ... ACAGATTAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.82 | 173 | 59 | 32 |
| A2 | 23.17 | 126 | 44 | 32 |
| A3 | 19.88 | 137 | 36 | 32 |
| A4 | 22.92 | 190 | 76 | 37 |
| A5 | 13.33 | 52 | 10 | 6 |
| A6 | 18.97 | 284 | 76 | 57 |
| A7 | 21.19 | 465 | 150 | 100 |
| A8 | 20.16 | 307 | 81 | 74 |
| A9 | 21.35 | 396 | 130 | 85 |
| A10 | 20.42 | 415 | 135 | 78 |
>TRINITY_DN43267_c2_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoformGTGAAAAGAGAGTAAGAGAAGAGCCCAAAGATATAGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCA
GATCCAGAACAGGCAAAGTGAAATGAAGTAGTTCATTGGTTAAGGATAAATAATGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGTAATGTACCGACGTCCTTGGGTGTTGG
CGTTTGTATTATTAGTCTTACTGTTCTCCTTTGGGATGCTTGCTGCTCAGTACATCCTCTTCTCTGGTATTCAAGGATACGATGCCAACAAAAAAAATATGAAGACTCTCTACGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTT
GCATACCCTGAAGGCACAAATAGTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCGTTGGAGTACCCATTTGATGTTTGCGAGACCATATTGCTCTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATT
GGGCATGGACAAATGCTACAATCAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACGTCAATTTGAGACGTGTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTG
AGAAATATGCCAAGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGA
GGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTCATTAGAATCCATTC
ACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTC
CTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAAT
GCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATG
TTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAA
TTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTTTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACAACTTTTTATAGTCTGATAAGTATATGTGAAACCTGT
TCTTTACGCTAGTAATTGCATTTG
>TRINITY_DN43267_c2_g1_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:GTGAAAAGAGAGTAAGAGAAGAGCCCAAAGATATAGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCA
GATCCAGAACAGGCAAAGTGAAATGAAGTAGTTCATTGGTTAAGGATAAATAATGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGTAATGTACCGACGTCCTTGGGTGTTGG
CGTTTGTATTATTAGTCTTACTGTTCTCCTTTGGGATGCTTGCTGCTCAGTACATCCTCTTCTCTGGTATTCAAGGATACGATGCCAACAAAAAAAATATGAAGACTCTCTACGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTT
GCATACCCTGAAGGCACAAATAGTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCGTTGGAGTACCCATTTGATGTTTGCGAGACCATATTGCTCTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATT
GGGCATGGACAAATGCTACAATCAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACGTCAATTTGAGACGTGTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTG
AGAAATATGCCAAGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGA
GGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGgtaagttagaatggtta
aatcatgcttccgttttatggttaaagctgattaacaggcattggcttccaacagattaagGTCATTAGAATCCATTCACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTG
GACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAAC
AAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAATGCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTA
TATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACC
AGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTTTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGA
CAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACAACTTTTTATAGTCTGATAAGTATATGTGAAACCTGTTCTTTACGCTAGTAATTGCATTTG
Intron 2 GTTTGTTTGT ... GGTTTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.95 | 176 | 62 | 37 |
| A2 | 24.12 | 195 | 79 | 45 |
| A3 | 21.84 | 238 | 90 | 43 |
| A4 | 20.16 | 202 | 58 | 44 |
| A5 | 20.54 | 118 | 44 | 17 |
| A6 | 23.42 | 188 | 77 | 38 |
| A7 | 23.91 | 506 | 231 | 87 |
| A8 | 23.57 | 201 | 78 | 46 |
| A9 | 22.8 | 479 | 184 | 99 |
| A10 | 21.8 | 522 | 220 | 71 |
>TRINITY_DN100233_c0_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoformGCCCAAAGATATAGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCAGATCCAGAACAGGCAAAGTGAA
ATGAAGTGGTTCATTGGTTAAGGATAAATAACGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGCAATGTACCGACGTCCTTGGGTGTTGGCGTTTGTATTATTAGTCTTACT
GTTCTCCTTTGGGATGCTTGCTGCTCAGTACATCCTCTTCTCTGGTATTCAAGGATACGATGCCAACAAAAAAAATATGAAGACTCTCTACGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTTGCATACCCTGAAGGCACAAATA
GTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCATTGGAGTACCCATTTGATGTTTGCGAGACCATATTGCTCTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATTGGGCATGGACAAATGCTACAAT
CAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACGTCAATTTGAGACGTGTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTGAGAAATATGCCAAGTATGTAGG
CATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGAGGTGCAAAAGGAACTGGAATGA
AATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTCATTAGAATCCATTCACCAATGCGAGAGCAGAAAAAA
CAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGTAGGGGCTCTAACTA
CAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTACAGATATCTAAATGCAACTAACACAGCTGGTGAAA
TTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCTTCAGGGTTTCCTGG
TCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTTTTATTGAAGTCTAA
GGCTTTCATGCTTCTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAAC
>TRINITY_DN100233_c0_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:GCCCAAAGATATAGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCAGATCCAGAACAGGCAAAGTGAA
ATGAAGTGGTTCATTGGTTAAGGATAAATAACGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGCAATGTACCGACGTCCTTGGGTGTTGGCGTTTGTATTATTAGTCTTACT
GTTCTCCTTTGGGATGCTTGCTGCTCAGTACATCCTCTTCTCTGgtttgtttgttttcattgtcattaccaccgtcatcattttcaatctatttataattcatatttcctcaacgatattcggatctgttgaatctgacatagtgttgacatgaactgatttgggtttgtttggtttttcagGTATTCAAGGATACGATG
CCAACAAAAAAAATATGAAGACTCTCTACGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTTGCATACCCTGAAGGCACAAATAGTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCATTGGAGTACCCATTTGATGTTTGC
GAGACCATATTGCTCTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATTGGGCATGGACAAATGCTACAATCAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACG
TCAATTTGAGACGTGTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTGAGAAATATGCCAAGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCA
ATGGATCTGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGAGGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGAT
CCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTCATTAGAATCCATTCACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAG
GTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAA
GTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTACAGATATCTAAATGCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCC
AGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAG
TTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTCTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTA
TCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAAC
Intron 3 GTAACAATAT ... GTCACTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.05 | 176.8 | 10 | 41 |
| A2 | 11.66 | 183.4 | 12 | 23.8 |
| A3 | 6.52 | 173.7 | 15 | 11.9 |
| A4 | 17.31 | 195.3 | 3 | 39.8 |
| A5 | 14.92 | 80.9 | 5 | 14 |
| A6 | 14.67 | 271.5 | 0 | 46 |
| A7 | 13.84 | 575.3 | 10 | 90.8 |
| A8 | 19.24 | 330.9 | 10 | 77.9 |
| A9 | 13.09 | 438.2 | 4 | 65 |
| A10 | 14.23 | 527.6 | 6 | 85.5 |
>TRINITY_DN105656_c1_g1_i2 from sample A5 / Example spliced isoformAGTGAAGAGAGCGTAAGAGAAGAGCCCAAAGATATGGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCA
GATCCAGAACAGGCAAAGTGAAATGAAGTGGTTCATTGGTTAAGGATAAATAACGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGCAATGTACCGACGTCCTTGGGTGTTGG
CGTTTGTATTATTAGTCTTACTGTTCTCCTTTGGGATGCTTGCTGCTCAGTACATCCTCTTCTCTGGTATTCAAGGATACGATGCCAACAAAAAAAATATGAAGACTCTCTATGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTT
GCATACCCTGAAGGCACAAATAGTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCATTGGAGTACCCATTTGATGTTTGCGAGACCATATTGCTCTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATT
GGGCATGGACAAATGCTACAATCAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACGTCAATTTGAGACGTGTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTG
AGAAATATGCCAAGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGA
GGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTCATTAGAATCCATTC
ACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTC
CTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAAT
GCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATG
TTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAA
TTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTCTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACA
>TRINITY_DN105656_c1_g1_i1 from sample A5 / Example unspliced isoform:ATCAAAGTTGCCAATGGATCTGGTATGTTTTTTTATTTATGGGAGTGAAGGTTGACCTTATATGTAGCTTTCTTATTTAAGTTTTGTGAGGTTGAACACTTGGCCATATATTTTAATGGATCTAATTAGTTTGAGTTAAGTGGGCTGGCTGATTTTGCAGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGA
CTTCAATGCTATGATCAAGgtaacaatattgtaagaaattgaggagattagctgtcctatgctcgagtggaggctactaatgcatttctgtatacagtgttctacttctattgatagtttagcctaaggatttgaaatgatgtgtgagaaatgttgtaaaacataggcatgtgaaataggaaaaaatggttggccaaaaa
agaaaatcggttctgaattattttcacagtacttgatttttttttcaccatgccaatgttaatattatgaatatgttgtaaaaagattaaacactgatgctatcattacatgctaatagattgtactttgttctgtcactccagGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGAGGTGCAAA
AGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTCATTAGAATCCATTCACCAATGC
GAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGT
AGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAATGCAACTAA
CACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCT
TCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTT
TTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTCTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACA
Intron 4 GTAAGTTAGA ... TTATATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21 | 173 | 59 | 33 |
| A2 | 22.7 | 126 | 45 | 29 |
| A3 | 18.69 | 137 | 35 | 28 |
| A4 | 22.76 | 190 | 76 | 36 |
| A5 | 14.75 | 52 | 12 | 6 |
| A6 | 18.62 | 284 | 79 | 51 |
| A7 | 21.25 | 465 | 151 | 100 |
| A8 | 19.84 | 307 | 83 | 69 |
| A9 | 20.88 | 396 | 129 | 80 |
| A10 | 20.27 | 415 | 135 | 76 |
>TRINITY_DN43267_c2_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoformGTGAAAAGAGAGTAAGAGAAGAGCCCAAAGATATAGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCA
GATCCAGAACAGGCAAAGTGAAATGAAGTAGTTCATTGGTTAAGGATAAATAATGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGTAATGTACCGACGTCCTTGGGTGTTGG
CGTTTGTATTATTAGTCTTACTGTTCTCCTTTGGGATGCTTGCTGCTCAGTACATCCTCTTCTCTGGTATTCAAGGATACGATGCCAACAAAAAAAATATGAAGACTCTCTACGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTT
GCATACCCTGAAGGCACAAATAGTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCGTTGGAGTACCCATTTGATGTTTGCGAGACCATATTGCTCTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATT
GGGCATGGACAAATGCTACAATCAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACGTCAATTTGAGACGTGTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTG
AGAAATATGCCAAGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGA
GGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTCATTAGAATCCATTC
ACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTC
CTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAAT
GCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATG
TTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAA
TTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTTTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACAACTTTTTATAGTCTGATAAGTATATGTGAAACCTGT
TCTTTACGCTAGTAATTGCATTTG
>TRINITY_DN43267_c2_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:CGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGAGGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTAT
ACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGgtaagttagaatggttaaatcatgcttccgttttatggttaaagctgattaacaggcattggcttccaacagattaaggtaaccttgatttgaatatccctgcttctaca
tcaacactactgtttagttgatggctgattaatgtcaggatttacgttttaacttgccagccttttgaagctgcgtggtataatttgctgtggcttttttgtcgttatattcagGTCATTAGAATCCATTCACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCA
CACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCAC
GTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAATGCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTG
CTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTA
TTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTTTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTG
TTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACAACTTTTTATAGTCTGATAAGTATATGTGAAACCTGTTCTTTACGCTAGTAATTGCATTTG
Intron 5 GTATGTTTTT ... GATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 9.83 | 151.4 | 25.6 | 16.9 |
| A2 | 10.68 | 169.1 | 21.1 | 21 |
| A3 | 14.37 | 157.3 | 19.6 | 27.5 |
| A4 | 8.03 | 194.4 | 22.6 | 17.7 |
| A5 | 13.96 | 77 | 7.9 | 12.8 |
| A6 | 5.85 | 239.4 | 35 | 16.3 |
| A7 | 9.31 | 470.1 | 42.2 | 51.7 |
| A8 | 8.27 | 290.8 | 44.9 | 27.7 |
| A9 | 8.22 | 383.7 | 45.7 | 37.7 |
| A10 | 7.65 | 489.1 | 59.4 | 42.5 |
>TRINITY_DN118414_c0_g2_i8 from sample A1 / Example spliced isoformAAAGAGAGTAAGAGAAGAGCCCAAAGATATAGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCAGATC
CAGAACAGGCAAAGTGAAATGAAGTAGTTCATTGGTTAAGGATAAATAATGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGTATTCAAGGATACGATGCCAACAAAAAAAAT
ATGAAGACTCTCTACGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTTGCATACCCTGAAGGCACAAATAGTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCGTTGGAGTACCCATTTGATGTTTGCGAGACCATATTGCT
CTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATTGGGCATGGACAAATGCTACAATCAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACGTCAATTTGAGACGT
GTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTGAGAAATATGCCAAGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGCGGAT
GAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGAGGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGA
ATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTCATTAGAATCCATTCACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCC
ATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTC
ACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAATGCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATA
ATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGC
CTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTCTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTG
TCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACAACTTTTTATAGTCTGATAAGTATATGTGAAACC
>TRINITY_DN118414_c0_g2_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:GGTCATTCATTGGACATTAATAAAATTATCTTATCTTATCTATATACAGAATGAAGAACTTAAGAAGGCACATTACATTGATTTTTCTATTTGTACTATATTTCTGATTCTCAAAACCTGTTGATGTGTTCTGAGAAGATCTGTTTTATCATGGCAGTTTTCTGAGGAATATTTTTTTTTCAATTTGCAGAAATATGCCA
AGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGgtatgtttttttatttatgggagtgaaggttgaccttatatgtagctttcttatttaagttttgtgaggttgaacacttggccatatattttaatggatctaattagtttgggttaagt
gggctggctgattttgcagCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGTAACAATATTGTAAGAAATTGAGGAGATTAGCTGTCCTATGCTCGAGTGGAGGCTACTAATGCATTTCTGTATACAGTGTTCTACTTCTATTGATAGTTTAGCCTAAGGATTTGAAATGAT
GTGTGAGAAATGTTGTAAAACATAGGCATGTGAAATAGGAAAAAATGGTTGGCC
Intron 6 GTAACCTTGA ... TTATATTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 50.77 | 32 | 3 | 33 |
| A2 | 47.54 | 32 | 2 | 29 |
| A3 | 46.67 | 32 | 5 | 28 |
| A4 | 49.32 | 37 | 3 | 36 |
| A5 | 50 | 6 | 1 | 6 |
| A6 | 47.22 | 57 | 5 | 51 |
| A7 | 50 | 100 | 12 | 100 |
| A8 | 48.25 | 74 | 11 | 69 |
| A9 | 48.48 | 85 | 4 | 80 |
| A10 | 49.35 | 78 | 7 | 76 |
>TRINITY_DN43267_c2_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoformGTGAAAAGAGAGTAAGAGAAGAGCCCAAAGATATAGAGAGAGTCATAGATTAATAACTTACCCATAAGATATAATCCCCAAAATAATACATGATATGATAAATTCTATAAAATTAATACCATATTGAAATGTCTAAAAAATAATGCAATCTTCCTTTGTTTGCATTTTCCGCTTCATGAGACAGTGTGAGCGAGTATTCA
GATCCAGAACAGGCAAAGTGAAATGAAGTAGTTCATTGGTTAAGGATAAATAATGTACATCTATTAATATTGGTGTATACAGTCTGTTGAAGGCTTTCTTTGCAAATTTGATCGAAGAGGAGGAGAGGAGAGCGTGTCCACACTAAAAGCAATGAAGACTGCAAAGCCAATTGTAATGTACCGACGTCCTTGGGTGTTGG
CGTTTGTATTATTAGTCTTACTGTTCTCCTTTGGGATGCTTGCTGCTCAGTACATCCTCTTCTCTGGTATTCAAGGATACGATGCCAACAAAAAAAATATGAAGACTCTCTACGCCTTCCAGAAACAAGTCAAACAATGCGTGCAAAGGAATGGTCTGGGGCTTATGGCAAATATAGTGGACCACTGTAAACTTGTTCTT
GCATACCCTGAAGGCACAAATAGTACCTGGTATAATGAACAATTCAAAATTTATGAACCGTTGGAGTACCCATTTGATGTTTGCGAGACCATATTGCTCTGGGAACAGTATCGCAATATGACCACAGTCTTGACAAGGGATTACCTGGATGCTCGGCCTGAGGGTTGGATGGATTATGCAGCAAAGCGAATTGCACAATT
GGGCATGGACAAATGCTACAATCAAACTCTATGTGAAGAGCACCTAAGCCTGGTTTTACCATCTAAACCACCATTTCATCCACGTCAATTTGAGACGTGTGCAGTTGTAGGAAACTCAGGAGATTTACTGAAAAATGAGTTTGGTCGAGAAATAGATGACCATGATGCAGTTATTCGAGACAATGAAGCTCCAGTGACTG
AGAAATATGCCAAGTATGTAGGCATGAAGAGAAACTTTCGTCTTCTGGCAAGGGGAGTAGCAAGAAACATGATCAAAGTTGCCAATGGATCTGCGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGA
GGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTATACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTAAGTTAGAATGGTTA
AATCATGCTTCCGTTTTATGGTTAAAGCTGATTAACAGGCATTGGCTTCCAACAGATTAAGGTCATTAGAATCCATTCACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCACACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTG
GACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCACGTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAAC
AAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAATGCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTGCTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTA
TATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTATTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACC
AGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTTTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTGTTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGA
CAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACAACTTTTTATAGTCTGATAAGTATATGTGAAACCTGTTCTTTACGCTAGTAATTGCATTTG
>TRINITY_DN43267_c2_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:CGGATGAGGTGTTGATTATTAAGAGTGTGATCCATAGAGACTTCAATGCTATGATCAAGGAGCTTCCTAATCCAGTTTATCTTTTCCAAGGTGTGGTCTTTCGAAGAGGTGCAAAAGGAACTGGAATGAAATCTATAGAATTAGCACTTTCCATGTGTGACACGGTTGATATATATGGCTTCACTGTAGATCCAGGTTAT
ACAGAATGGACACGCTATTTCTCGAGCCCACGCAAAGGGCATAATCCGTTGCAGGGACGAGCCTATTATCAGCTTCTTGAATGCCTTGGGGTAAGTTAGAATGGTTAAATCATGCTTCCGTTTTATGGTTAAAGCTGATTAACAGGCATTGGCTTCCAACAGATTAAGgtaaccttgatttgaatatccctgcttctaca
tcaacactactgtttagttgatggctgattaatgtcaggatttacgttttaacttgccagccttttgaagctgcgtggtataatttgctgtggcttttttgtcgttatattcagGTCATTAGAATCCATTCACCAATGCGAGAGCAGAAAAAACAAGATTGGTCTATTGTTCCTAGCCGAGCAATGGTTAATAGGGCTCA
CACTGCCGCAATGAGGTTAAAAGGTTTCCATAATAAGCACCCAGGCAGTGTTGGACGATTTAGTGCTTGTAAGGTTTGGGCAACGGCGTCTTCTGAGAATGGTCCTATTTCAGGTTCAATAGACATGAGTCCTGTGCGTAGGGGCTCTAACTACAGCAAATGGGAGTTACTAAAGTTAAGTGACTTGCGGAAGGAAGCAC
GTGAACACTACAAAAGTATGAATGGTGTCACGTTGTACAAATTAGATGGCAACAAACTGGATGATCTTGTATGTGTGAAGCATCCTTCACAATCCGTGACTTGATTTGATCCATAGTAAAGATATCTAAATGCAACTAACACAGCTGGTGAAATTCATGACATCTGAATTGTAAGTATGCATGTCTGTTATTTGAGTGTG
CTCTTCAGCCTCTCCAGAATTTGCATATAATGCTCAGAATCATAAGGATTCTATATCCTTTTCGGGACAGTCAAAGTCAGAAGTAACTGAGGCAAAAATAGAGGTATTCTAAAAGTGGGGTATAGTCAATGTTACATCTTCAGGGTTTCCTGGTCAATTTTGACAGTGAATTGCCACTAGTATATTCCAGCAAATGCTTA
TTCTGTTGGACCTAGTTGTTGGGGAATGCCTCAGCTATTCCAGTAACTTAACCAGACTCTGAAGCAAGAGGATGGCTCACTGGTGGAAGCTCCATGGTCTTCACAAATTAAAACTTGCATGTATGTTCTAATTTTTGTTTTATTGAAGTCTAAGGCTTTCATGCTTTTGGCAAGGTTTTTCTATGTTTGAAGCCAGGGTG
TTGCAAGCTCTCTTATCCTCTAACCTTTGTCCAGATTAGGTGTGGTGGAATGACAAAGTATTCATTATTCTTCTAAATGCAAATAAACGTTAACAACTTTTTATAGTCTGATAAGTATATGTGAAACCTGTTCTTTACGCTAGTAATTGCATTTG