sp|P41918|RANA1_TOBAC ----> GTP-binding nuclear protein Ran-A1
Intron 1 GTATGCTTTC ... GATTTCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.93 | 279.5 | 2 | 132 |
| A2 | 24.12 | 254 | 4 | 102 |
| A3 | 27.05 | 305 | 18 | 141.5 |
| A4 | 24.55 | 305.5 | 6 | 124.5 |
| A5 | 27.13 | 154 | 9 | 71 |
| A6 | 27.49 | 1290.5 | 13 | 611.5 |
| A7 | 27.41 | 1039 | 12 | 493.5 |
| A8 | 26.31 | 777.5 | 13 | 348.5 |
| A9 | 26.45 | 1127.5 | 13 | 515 |
| A10 | 26.27 | 954 | 6 | 429 |
>TRINITY_DN109229_c0_g4_i3 from sample A3 / Example spliced isoformGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCGTATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCAT
TCACCAGTCGAGATTCGATCATGGTACCTCAATCTCCATTTCCTGTCCTCTTTAAAATAAATGCATTTCATGCAATCTTCCTTGCTGTATTGTATTTTCATATAAATGCAACCAATTTGGGGTGATGTTCTCGGCTCTCTGAAATTAGGGTTTAAGTTTTCGGCTTTGTGAAATAAGGATTCGGGATTTAATCGTGAATG
CTCAAATTCATTTTCATCCGGTCACCAACTCTTGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTTACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAA
TTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTACATCAACGGGCAGTGTGCTATTATTATGTTCGATGTCACTGCACGTTTGACATACAAGAATGTCCCAACATGGCACAGGGACCTTTGTCGGGTCTGTGAAAATATTCCCATTGTTCTTTGCGGTA
ACAAGGTTGATGTTAAGAACCGACAAGTGAAAGCCAAGCAAGTTACTTTTCATAGGAAGAAGAATCTTCAGTATTATGAAATATCTGCTAAGAGTAACTACAATTTTGAGAAGCCTTTTCTCTATCTTGCTAGGAAGCTTTCTGGGGATCCTAACCTACATTTCGTCGAGTCACCTGCTCTTGCTCCACCAGAGGTTCAA
ATTGATATGGCCACACAACACCAGTACGAAGCAGAATTGGCTGCAGCTGCTGCACAGCCTCTTCCTGATGACGATGATGATGTATTTGATAGTTAAACGCTTTTTGTTGTACGTATTGCCAAAAACACGGTTTTCCTGTGGATGGTGGGAGAGCTGGAATATTTTCTTTCGCTATAATCTAGTTTTATTATCTGTTAGTA
ATGCCTTTATTAAATGCTAGGTTACCTTTCAGATGCCTATTGTGCATAATAATCTTTTTGACCAACAGATGATTTTGACAGTATATTTAATGATAGGTTTTTTAAGTCATTCATTAATGACATATTTTTCTCGCATGTAAAAACTGAACCACACAAGGCAATTTCAAAATGCAATCATTCTGTTTCTTTATTCTAGTCTA
TTTACCAATACAATTATTTTTCTGGAACTGTGTGCCTCTATGGATTATTGATGCATGTATAGTAGTAGTGTACTATTTACTCAGCGAG
>TRINITY_DN109229_c0_g4_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCGTATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCAT
TCACCAGTCGAGATTCGATCATGGTACCTCAATCTCCATTTCCTGTCCTCTTTAAAATAAATGCATTTCATGCAATCTTCCTTGCTGTATTGTATTTTCATATAAATGCAACCAATTTGGGGTGATGTTCTCGGCTCTCTGAAATTAGGGTTTAAGTTTTCGGCTTTGTGAAATAAGGATTCGGGATTTAATCGTGAATG
CTCAAATTCATTTTCATCCGGTCACCAACTCTTgtatgctttcattcgtcaatctgctgggaacatctcttcggtgttccagggtttatgtatttatttgttttctctttttatctttcttagaatgaccgaggatttatgatttctcagGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGT
TGGCGATGGAGGCACCGGTAAGGGTTTTATCATTTGTCATTCTATACATAATAGGTTCCCACCATTTAAATTTTTTTAAAGCATTATTTTTTTAGTCATGTTTTTCGTAGCAAGTCTTGTATGCAAGTTGCGGAATGATGATAAATCATAAAACAAATGACAGTGGGTGCCTTGGGGTCTTTTGGTCAGGGATCCATATC
CATGTGTAAAATGTTTTCAGAGGTTTGAGACCTTCTTGGTTGGTCTTTTGAATCTGTTTTCCTAGAGTCAACTCTAATTTAATTGGGAATTTAATTAGGAATTTGATAAGTATGTTTGGTTGTTAAGATCTCGTCTCTCTAGTCAATAACTCATTAATGCAATTTACTAGTCCATTTAGATCAACATCTTGTGCATTTTC
ATTGAGTCCTTAAATGAATATTACGTGTTTTCCCTGCAGGGAA
Intron 2 GTAAGGGTTT ... TTCCCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 2.19 | 952.7 | 2 | 14 |
| A2 | 0.2 | 906.3 | 3.7 | 1 |
| A3 | 0.48 | 1015.3 | 1.7 | 3 |
| A4 | 1.52 | 985.5 | 4.7 | 10 |
| A5 | 1.98 | 501.3 | 2 | 6 |
| A6 | 0 | 4918.5 | 1.3 | 0 |
| A7 | 0 | 3892.2 | 0.3 | 0 |
| A8 | 0.12 | 2832.5 | 0.7 | 2 |
| A9 | 0 | 4175.5 | 0.7 | 0 |
| A10 | 0 | 3393.7 | 0.7 | 0 |
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformCACAGATACGTAGGCAACCATGGATTTCTCTAGTACTAGTTAATTAAACTAGCAACTCTCCGTTAATTTTAGCGGACATGTGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCG
TATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCATTCACCAGTCGAGATTCGATCATGGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTT
ACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTATTAATGGTACACCGATGGATCATGAAGGCCCACTCAAGCATGCCTCCAATCAAT
CCAAGTGTGAAGACATATTATGCAATGAGAGTGTTTGAATTGTTGGTGTGTAGGTGGTGAGTAGTTCACCATCGTGAATCAAAGATTTGAATATTTACCCACAAAACAACTTGAAAGAGTTTGAGGAAGTGAGGATGATCCCTATAGGAAGGCAGGATGTTTGTATTAAGGTAGTTGTTTTTATTTGCGACCTTGTGAGG
TGGGCTTGAGGCACTTGTGGGCCCAGCCATAACATGAGCCAAGTTCTCCAAGAAGTAAGCAAATTGGGTTTTGTTTTGAATGTCACTGTGTTATCGGCCTAATGTTTCTCACCCACTTTGCCATGAGTATTTTCAGCATTATGCATCACTTTGTAAAATTTAGCCTTTATTTCCATCAACTCCTTCACCATACGACCTCA
GTTCTGCCAGCAAGAGTTGAGTGAAACCTTGAAATTTGATCATGAAAGTCAACATACACTGTTTGCTTAATTTTCTGCATGTAGCTGCTAGCGTGTGTTAAATGCCTTAAAATCTGTGCTTTGACCCCAAATTGTAAAAAATAGTATCTTTTTGGCTCATTTATGTTGTGCACATTCAAAAAATGGTGTAGTGACCTCAC
TTCTATGGGAAGGTAATTTTTTTTTTTTTGGAATATGTTTTAGTTTTCTGAAGACTTCCGTTCTCTTATCTAGGTCATTAACGACATTATAGAAGTGACATCAACTATCAACTATAATTATTCATTATCGTTCCTACTAACAACATTCATTTATATATTAAATGAGACATAAATAACAATTCCAATGAAATAAACAATGT
AGCTAACATTCTCATAAGATTCCCGCCTTAACCCTGGAACTAAAACTATTAAGAATTTAATGTACTAATTTAAGTCGAGTTTACCAATACATAAGATGATTTCATACTTAGAGGCATAATCAATTTCCATGCATTTGTTTACTGCGATATTAATACCAATTCTAACCATAGCACAATAAAATTGATCAATAATTATTAAT
TACAATAAACATGCAATTATTGAATAATCTTTTGTTCTTCATTCAATTATCTATCTTTCATTTCGTTGTTACAATCATAAGAATTTATTCCAATGGGATATAATCACATATGTCAACAAGATACATTTTATCCCATGGTTACGTAGAGTGACTTGCCAAGTCCAGGAGCGATTCTTCTTATTAGTTCGCTACCATCTGTG
GCTTCCACTTCTCTGTCACAACATGTTAGCTATCCATGATATATATAAGCAAATAGACTGAATTCAAATTATAAATAAACTATGGATATCCCAGCCAACTCGGCGTGGGTATCCTTTATTAATATTTGCTGCAACGTGACTACTTTTTCCCTGAAACGTTAACATAAGCAAAACATTATAACAACATTATCTTGTTCAAA
TAGCCAACTATGAACTAATAAGCATTAATACATTAGCATATATGATCAAGGTAAACTATAGATATCCTGCCGAACTGGCATGTAGACCCTCCAGTTCGTTTCCCTGTAGGCGTTAGTTTCATTTCATGCAATAATTATATGAAAATGTTAACGCTGTAATTATATCAAATAACCAAATTTAAACAAAGAATTGATAAATG
GATATTCATATTATTAAGACAGGGTTGAATTGTAATAATGTTTGAACCAATGTTACAAATATCGTGTCGGCAAATATATCGCCGAGGGTCCAAAAACAAAATATCGGATTTATCGGGGAAAATGTCGGCAAACATCGGCAATATATCGGCGAAATTAAAAAATACAAAAATATTAATTTTTTGACTCGGCCC
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCGTTGGCGATGGAGGCACCGgtaagggttttatcatttgtcattctatacataataggttcccaccatttaaatttttttaaagcattatttttttagtcatgtttttcgtagcaagtcttgtatgcaagttgcggaatgatgataaatcataaaacaaatgacagtgggtgccttggggtcttttggtcagggatcc
atatccatgtgtaaaatgttttcagaggtttgagaccttcttggttggtcttttgaatctgttttcctagagtcaactctaatttaattgggaatttaattaggaatttgataagtatgtttggttgttaagatctcgtctctctagtcaataactcattaatgcaatttactagtccatttagatcaacatcttgtgca
ttttcattgagtccttaaatgaatattacgtgttttccctgcagGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTTACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCGTAAGTACTTCTTTCTTTCAATCATATCTTCTCGTTATCTGTTTGGGATGGATTGCTATAGTATCTGAACCTAGATTTTAGTCACCGTAGAAAACGAGT
CTCGGTTTTGTCTCAGAAAGGTTCAAGTTAAGTAGTTGTTGCTGTTTTCTTTTACTGGGTTATTTGCTAAATTCATGAAATTTATTTATATATGTATTATGCTGGAATTATTTGTTGTGAAATAGATCAATTATGCAATTTTTATATTTTAACATTGTTGTTTTAAAATTTGAACAGCCACAATAGGAGTGGAAGTTCAC
CCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTAGTAAGTTATAGCCTTATTTATTTTTTCAGAATTATTTATGCGTTCTTTTGTTTTTAAGATTATTAAACGTAGGGATGCTTCCTAGAGTCTTTTTGGGAATTGTAG
GGCAGCCAAAATATTCAGAACTGGCGTGTTAGGTTCCAGATTATATTCCTTAGCTCGATCCATTTGAAAGCTGCTCCATGTAATAACTTCCGTAGTAAGGAGTCACTTTCTAGAAATATGGCATTACAATAGGATGGTGGCCTTTTGTTTTTACTTTGGTAATCCAGCTGTCCATCAGTTCTGGTATGGTTCCCCATTAT
GTTTAATGACTTGTCAAAAAACAGTCCCGTCAAACACCAATTTTTTAGGCAAAGGCCAAGTTTAGGTATTTTGCTTTAACCATCATAACAAAGGGATCTGAATCATAGTGGTCTATAACATACTTTCTTGTGTTACATGTATAACAGAAGCTGCAATTTTCAGAAAAAAATTAAGTAACTTCCCACATGGAACAATAGTT
CAATAGTTTTGAGCTGCACCCAATAAGTTTACTTTTCTTGCAACAGAATAGTGCAGTGTATATCTTATCAATTATTTGGTATTTGCTCCCTTCTTTAAGGTGTTTTTATCAGTAAAAAGAGATTACTGTTGTGGCTATAACATGTAATAGAATACAAAACACCTGTTCTTTTTATTCATAATCTTGAATCAGTGTATGCT
AGGCCTCCTGCTATCCTCACTCATTGTTGTACTTGTCACATATATTGTCTCATTTTTTTTCTATCCTTCATACAATGAACAACTACACGTTTCTTGATGTGTTACAGCTTGAACTAGCATGCATGATTAAACCCCCAAAGAATGAGGCTAGCCCATCTGTAACCTAGAGGTGTAACCCACTATCACCTTGATAACCACCT
CTCTACACTTTAGGTTGGCTGTTCTCCAACTCAAGGGTAACATACCGAGGATAGGATTTGCTAGGTTATGGCAATATAGGTACAA
Intron 3 GTAAGTCGTT ... AACTCCACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 10.83 | 822.3 | 1 | 102.2 |
| A2 | 8.98 | 683 | 0 | 68.7 |
| A3 | 9.75 | 819 | 0 | 90.3 |
| A4 | 9.69 | 670.7 | 0 | 73.5 |
| A5 | 10.28 | 476.3 | 1 | 55.8 |
| A6 | 9.37 | 7617.3 | 2 | 803.7 |
| A7 | 8.77 | 5692.7 | 0 | 557.7 |
| A8 | 9.67 | 6758.7 | 2 | 739.2 |
| A9 | 9.72 | 6246.7 | 1 | 687 |
| A10 | 9.2 | 4354 | 1 | 450.2 |
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoformCACAGATACGTAGGCAACCATGGATTTCTCTAGTACTAGTTAATTAAACTAGCAACTCTCCGTTAATTTTAGCGGACATGTGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCG
TATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCATTCACCAGTCGAGATTCGATCATGGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTT
ACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTACATCAACGGGCAGTGTGCTATTATTATGTTCGATGTCACTGCACGTTTGACATA
CAAGAATGTCCCAACATGGCACAGGGACCTTTGTCGGGTCTGTGAAAATATTCCCATTGTTCTTTGCGGTAACAAGGTTGATGTTAAGAACCGACAAGTGAAAGCCAAGCAAGTTACTTTTCATAGGAAGAAGAATCTTCAGTATTATGAAATATCTGCTAAGAGTAACTACAATTTTGAGAAGCCTTTTCTCTATCTTG
CTAGGAAGCTTTCTGGGGATCCTAACCTACATTTCGTCGAGTCACCTGCTCTTGCTCCACCAGAGGTTCAAATTGATATGGCCACACAACACCAGTACGAAGCAGAATTGGCTGCAGCTGCTGCACAGCCTCTTCCTGATGACGATGATGATGTATTTGATAGTTAAACGCTTTTTGTTGTACGTATTGCCAAAAACACG
GTTTTGCTGTGGATGGTGGGAGAGCTGGAATATTTTCTTTCGCTATAATCTAGTTTTATTATCTGTTAGTAATGCCTTTATTAAATGCTAGGTTACCTTTCAGATGCCTATTGTGCATAATAATCTTTTTGACCAACAGATGATTTTGACAGTATATTTAATGATAGGTTTTTTAAGTCATTCATTAATGACATATTTTT
CTCGCATGTAAAAACTGAACCACACAAGGCAATTTCAAAATGCAATCATTCTGTTTCTTTATTCTAGTCTATTTACCAATACAATTATTTTTCTGGAACTGTGTGCCTCTATGGATTATTGATGCATGTATAGTAGTAGTGTACTATTTACTCAGCGAGAAAATCATGCATGACATTGGACATGTTACATTAAAGTGGAT
GAAATAGTTTCAAGGAAATAAGCAAAATGTTCCCAAAACTAATTACCAAAAAGCCAAAATAGGAACCGCGGGGATGATTTGCGGACAGCTGCATTCTATAGCACTTCGTACATCTGGCTTAGTCTTACAGAGTGTATTTGCTTGTGTATACAATCAAAGATAAAGTTGATAGGCTAGCTGCATTTCATTGCACTTTGTAC
ACGTGGCATAAAGTCCTACAAAGGTGTTAAGATACAGTTCATAACCCTTTTTATTTGAATGGAAAAATACAATGGACATTTCTAGGATATTCGGAAAATTAGACATTTCATATTTCAAGAGATGGAAGGAATTTTTAATAAACTAACCATTTATTATTATTTCTGAAAATATCACTAATATGAA
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCTTGCTAGGAAGCTTTCTGGgtaagtcgttattgatatactttttcactgtagatgttatacggggttttaagtatgtgaattgcaaggtattcatcacactggtctcacatatatttaactccacagGGATCCTAACCTACATTTCGTCGAGTCACCTGCTCTTGCTCCACCAGAGGTTCAAATTGATATGGCCACA
CAACACCAGTAAGTGCTTTACCTGCTGAGTTAGTATTTTCTTTCCTGTTGAATATTATTTTTGTTGAAAACCCCTGAATCAGAAACATTCTGCTTCATCTGCTTAAGGTCATTGGAGTACTTTTTAATTATTTGTTATGGACCTTCTGTAGATTTCATGGGAATTTGAATAAGAGTCTTTCCCCTTTAAAGAAAATAATT
TGCATGTCTCTCCTGGTTATTGAAAAATAAATTTGTTTTTCTTTCAGGTACGAAGCAGAATTGGCTGCAGCTGCTGCACAGCCTCTTCCTGATGACGATGATGATGTATTTGATAGTTAAACGCTTTTTGTTGTACGTATTGCCAAAAACACGGTTTTGCTGTGGATGGTGGGAGAGCTGGAATATTTTCTTTCGCTATA
ATCTAGTTTTATTATCTGTTAGTAATGCCTTTATTAAATGCTAGGTTACCTTTCAGATGCCTATTGTGCATAATAATCTTTTTGACCAACAGATGATTTTGACAGTATATTTAATGATAGGTTTTTTAAGTCATTCATTAATGACATATTTTTCTCGCATGTAAAAACTGAACCACACAAGGCAATTTCAAAATGCAATC
ATTCTGTTTCTTTATTCTAGTCTATTTACCAATACAATTATTTTTCTGGAACTGTGTGCCTCTATGGATTATTGATGCATGTATAGTAGTAGTGTACTATTTACTCAGCGAGAAAATCATGCATGACATTGGACATGTTACATTAAAGTGGATGAAATAGTTTCAAGGAAATAAGCAAAATGTTCCCAAAACTAATTACC
AAAAAGCCAAAATAGGAACCGCGGGGATGATTTGCGGACAGCTGCATTCTATAGCACTTCGTACATCTGGCTTAGTCTTACAGAGTGTATTTGCTTGTGTATACAATCAAAGATAAAGTTGATAGGCTAGCTGCATTTCATTGCACTTTGTACACGTGGCATAAAGTCCTACAAAGGTGTTAAGATACAGTTCATAACCC
TTTTTATTTGAATGGAAAAATACAATGGACATTTCTAGGATATTCGGAAAATTAGACATTTCATATTTCAAGAGATGGAAGGAATTTTTAATAAACTAACCATTTATTATTATTTCTGAAAATATCACTAATATGAA
Intron 4 GTACCTCAAT ... GATTTCTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 7.18 | 1228 | 95 | 68 |
| A2 | 7.54 | 1153 | 94 | 52 |
| A3 | 5.76 | 1274.5 | 78 | 74.8 |
| A4 | 6.64 | 1266 | 90 | 64.3 |
| A5 | 4.64 | 616 | 30 | 37 |
| A6 | 4.5 | 5779 | 272 | 309.3 |
| A7 | 4.77 | 4727 | 237 | 248.3 |
| A8 | 5.04 | 3372.8 | 179 | 175.3 |
| A9 | 5.13 | 5141 | 278 | 259.5 |
| A10 | 5.2 | 4116 | 226 | 215.5 |
>TRINITY_DN109229_c0_g4_i2 from sample A3 / Example spliced isoformGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCGTATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCAT
TCACCAGTCGAGATTCGATCATGGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTTACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCGTAAGTACTTCTTTCTTTCAATCATATCTTCTCGTTATCTGTTTGGGATGGAT
TGCTATAGTATCTGAACCTAGATTTTAGTCACCGTAGAAAACGAGTCTCGGTTTTGTCTCAGAAAGGTTCAAGTTAAGTAGTTGTTGCTGTTTTCTTTTACTGGGTTATTTGCTAAATTCATGAAATTTATTTATATATGTATTATGCTGGAATTATTTGTTGTGAAATAGATCAATTATGCAATTTTTATATTTTAACA
TTGTTGTTTTAAAATTTGAACAGCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTAGTAAGTTATAGCCTTATTTATTTTTTCAGAATTATTTATGCGTTCTTTTGTTTTTAAGA
TTATTAAACGTAGGGATGCTTCCTAGAGTCTTTTTGGGAATTGTAGGGCAGCCAAAATATTCAGAACTGGCGTGTTAGGTTCCAGATTATATTCCTTAGCTCGATCCATTTGAAAGCTGCTCCATGTAATAACTTCCGTAGTAAGGAGTCACTTTCTAGAAATATGGCATTACAATAGGATGGTGGCCTTTTGTTTTTAC
TTTGGTAATCCAGCTGTCCATCAGTTCTGGTATGGTTCCCCATTATGTTTAATGACTTGTCAAAAAACAGTCCCGTCAAACACCAATTTTTTAGGCAAAGGCCAAGTTTAGGTATTTTGCTTTAACCATCATAACAAAGGGATCTGAATCATAGTGGTCTATAACATACTTTCTTGTGTTACATGTATAACAGAAGCTGC
AATTTTCAGAAAAAAATTAAGTAACTTCCCACATGGAACAATAGTTCAATAGTTTTGAGCTGCACCCAATAAGTTTACTTTTCTTGCAACAGAATAGTGCAGTGTATATCTTATCAATTATTTGGTATTTGCTCC
>TRINITY_DN109229_c0_g4_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:GTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCGTATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCAT
TCACCAGTCGAGATTCGATCATGgtacctcaatctccatttcctgtcctctttaaaataaatgcatttcatgcaatcttccttgctgtattgtattttcatataaatgcaaccaatttggggtgatgttctcggctctctgaaattagggtttaagttttcggctttgtgaaataaggattcgggatttaatcgtgaatg
ctcaaattcattttcatccggtcaccaactcttgtatgctttcattcgtcaatctgctgggaacatctcttcggtgttccagggtttatgtatttatttgttttctctttttatctttcttagaatgaccgaggatttatgatttctcagGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGT
TGGCGATGGAGGCACCGGTAAGGGTTTTATCATTTGTCATTCTATACATAATAGGTTCCCACCATTTAAATTTTTTTAAAGCATTATTTTTTTAGTCATGTTTTTCGTAGCAAGTCTTGTATGCAAGTTGCGGAATGATGATAAATCATAAAACAAATGACAGTGGGTGCCTTGGGGTCTTTTGGTCAGGGATCCATATC
CATGTGTAAAATGTTTTCAGAGGTTTGAGACCTTCTTGGTTGGTCTTTTGAATCTGTTTTCCTAGAGTCAACTCTAATTTAATTGGGAATTTAATTAGGAATTTGATAAGTATGTTTGGTTGTTAAGATCTCGTCTCTCTAGTCAATAACTCATTAATGCAATTTACTAGTCCATTTAGATCAACATCTTGTGCATTTTC
ATTGAGTCCTTAAATGAATATTACGTGTTTTCCCTGCAGGGAA
Intron 5 GTGAGGAGTA ... CCTTTGCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.25 | 710 | 93.5 | 148 |
| A2 | 17.52 | 659 | 91.5 | 140 |
| A3 | 19.04 | 740 | 113.5 | 174 |
| A4 | 17.93 | 641 | 105 | 140 |
| A5 | 20.68 | 372 | 55 | 97 |
| A6 | 21.99 | 6126 | 895.5 | 1727 |
| A7 | 21.84 | 4700 | 689.5 | 1313 |
| A8 | 22.29 | 4017 | 504.5 | 1152 |
| A9 | 21.51 | 4836 | 681 | 1325 |
| A10 | 21.39 | 3679 | 543.5 | 1001 |
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoformCACAGATACGTAGGCAACCATGGATTTCTCTAGTACTAGTTAATTAAACTAGCAACTCTCCGTTAATTTTAGCGGACATGTGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCG
TATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCATTCACCAGTCGAGATTCGATCATGGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTT
ACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTACATCAACGGGCAGTGTGCTATTATTATGTTCGATGTCACTGCACGTTTGACATA
CAAGAATGTCCCAACATGGCACAGGGACCTTTGTCGGGTCTGTGAAAATATTCCCATTGTTCTTTGCGGTAACAAGGTTGATGTTAAGAACCGACAAGTGAAAGCCAAGCAAGTTACTTTTCATAGGAAGAAGAATCTTCAGTATTATGAAATATCTGCTAAGAGTAACTACAATTTTGAGAAGCCTTTTCTCTATCTTG
CTAGGAAGCTTTCTGGGGATCCTAACCTACATTTCGTCGAGTCACCTGCTCTTGCTCCACCAGAGGTTCAAATTGATATGGCCACACAACACCAGTACGAAGCAGAATTGGCTGCAGCTGCTGCACAGCCTCTTCCTGATGACGATGATGATGTATTTGATAGTTAAACGCTTTTTGTTGTACGTATTGCCAAAAACACG
GTTTTGCTGTGGATGGTGGGAGAGCTGGAATATTTTCTTTCGCTATAATCTAGTTTTATTATCTGTTAGTAATGCCTTTATTAAATGCTAGGTTACCTTTCAGATGCCTATTGTGCATAATAATCTTTTTGACCAACAGATGATTTTGACAGTATATTTAATGATAGGTTTTTTAAGTCATTCATTAATGACATATTTTT
CTCGCATGTAAAAACTGAACCACACAAGGCAATTTCAAAATGCAATCATTCTGTTTCTTTATTCTAGTCTATTTACCAATACAATTATTTTTCTGGAACTGTGTGCCTCTATGGATTATTGATGCATGTATAGTAGTAGTGTACTATTTACTCAGCGAGAAAATCATGCATGACATTGGACATGTTACATTAAAGTGGAT
GAAATAGTTTCAAGGAAATAAGCAAAATGTTCCCAAAACTAATTACCAAAAAGCCAAAATAGGAACCGCGGGGATGATTTGCGGACAGCTGCATTCTATAGCACTTCGTACATCTGGCTTAGTCTTACAGAGTGTATTTGCTTGTGTATACAATCAAAGATAAAGTTGATAGGCTAGCTGCATTTCATTGCACTTTGTAC
ACGTGGCATAAAGTCCTACAAAGGTGTTAAGATACAGTTCATAACCCTTTTTATTTGAATGGAAAAATACAATGGACATTTCTAGGATATTCGGAAAATTAGACATTTCATATTTCAAGAGATGGAAGGAATTTTTAATAAACTAACCATTTATTATTATTTCTGAAAATATCACTAATATGAA
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:CATGGCACAGGGACCTTTGTCGgtgaggagtagcttgttttcagtccttagaatttatgatcacattaattggtttgttttattctccaacatgatctaatttttagatttgccttttcaattttcctttgccagGGTCTGTGAAAATATTCCCATTGTTCTTTGCGGTAACAAGGTTGATGTTAAGAACCGACAAGTGA
AAGCCAAGCAAGTTACTTTTCATAGGAAGAAGAATCTTCAGTATTATGAAATATCTGCTAAGAGTAACTACAATTTTGAGAAGCCTTTTCTCTATCTTGCTAGGAAGCTTTCTGGGGATCCTAACCTACATTTCGTCGAGTCACCTGCTCTTGCTCCACCAGAGGTTCAAATTGATATGGCCACACAACACCAGTACGAA
GCAGAATTGGCTGCAGCTGCTGCACAGCCTCTTCCTGATGACGATGATGATGTATTTGATAGTTAAACGCTTTTTGTTGTACGTATTGCCAAAAACACGGTTTTGCTGTGGATGGTGGGAGAGCTGGAATATTTTCTTTCGCTATAATCTAGTTTTATTATCTGTTAGTAATGCCTTTATTAAATGCTAGGTTACCTTTC
AGATGCCTATTGTGCATAATAATCTTTTTGACCAACAGATGATTTTGACAGTATATTTAATGATAGGTTTTTTAAGTCATTCATTAATGACATATTTTTCTCGCATGTAAAAACTGAACCACACAAGGCAATTTCAAAATGCAATCATTCTGTTTCTTTATTCTAGTCTATTTACCAATACAATTATTTTTCTGGAACTG
TGTGCCTCTATGGATTATTGATGCATGTATAGTAGTAGTGTACTATTTACTCAGCGAGAAAATCATGCATGACATTGGACATGTTACATTAAAGTGGATGAAATAGTTTCAAGGAAATAAGCAAAATGTTCCCAAAACTAATTACCAAAAAGCCAAAATAGGAACCGCGGGGATGATTTGCGGACAGCTGCATTCTATAG
CACTTCGTACATCTGGCTTAGTCTTACAGAGTGTATTTGCTTGTGTATACAATCAAAGATAAAGTTGATAGGCTAGCTGCATTTCATTGCACTTTGTACACGTGGCATAAAGTCCTACAAAGGTGTTAAGATACAGTTCATAACCCTTTTTATTTGAATGGAAAAATACAATGGACATTTCTAGGATATTCGGAAAATTA
GACATTTCATATTTCAAGAGATGGAAGGAATTTTTAATAAACTAACCATTTATTATTATTTCTGAAAATATCACTAATATGAA
Intron 6 GTAAGTGCTT ... TTTCTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.51 | 471 | 5 | 100 |
| A2 | 21.15 | 410 | 0 | 110 |
| A3 | 17.82 | 475 | 2 | 103 |
| A4 | 15.35 | 342 | 2 | 62 |
| A5 | 13.31 | 228 | 1 | 35 |
| A6 | 20.45 | 5153.5 | 4 | 1325 |
| A7 | 20 | 3388 | 3 | 847 |
| A8 | 20.62 | 4895 | 1 | 1271 |
| A9 | 20.75 | 4130 | 2 | 1081 |
| A10 | 21.19 | 2533 | 0 | 681 |
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoformCACAGATACGTAGGCAACCATGGATTTCTCTAGTACTAGTTAATTAAACTAGCAACTCTCCGTTAATTTTAGCGGACATGTGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCG
TATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCATTCACCAGTCGAGATTCGATCATGGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTT
ACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTACATCAACGGGCAGTGTGCTATTATTATGTTCGATGTCACTGCACGTTTGACATA
CAAGAATGTCCCAACATGGCACAGGGACCTTTGTCGGGTCTGTGAAAATATTCCCATTGTTCTTTGCGGTAACAAGGTTGATGTTAAGAACCGACAAGTGAAAGCCAAGCAAGTTACTTTTCATAGGAAGAAGAATCTTCAGTATTATGAAATATCTGCTAAGAGTAACTACAATTTTGAGAAGCCTTTTCTCTATCTTG
CTAGGAAGCTTTCTGGGGATCCTAACCTACATTTCGTCGAGTCACCTGCTCTTGCTCCACCAGAGGTTCAAATTGATATGGCCACACAACACCAGTACGAAGCAGAATTGGCTGCAGCTGCTGCACAGCCTCTTCCTGATGACGATGATGATGTATTTGATAGTTAAACGCTTTTTGTTGTACGTATTGCCAAAAACACG
GTTTTGCTGTGGATGGTGGGAGAGCTGGAATATTTTCTTTCGCTATAATCTAGTTTTATTATCTGTTAGTAATGCCTTTATTAAATGCTAGGTTACCTTTCAGATGCCTATTGTGCATAATAATCTTTTTGACCAACAGATGATTTTGACAGTATATTTAATGATAGGTTTTTTAAGTCATTCATTAATGACATATTTTT
CTCGCATGTAAAAACTGAACCACACAAGGCAATTTCAAAATGCAATCATTCTGTTTCTTTATTCTAGTCTATTTACCAATACAATTATTTTTCTGGAACTGTGTGCCTCTATGGATTATTGATGCATGTATAGTAGTAGTGTACTATTTACTCAGCGAGAAAATCATGCATGACATTGGACATGTTACATTAAAGTGGAT
GAAATAGTTTCAAGGAAATAAGCAAAATGTTCCCAAAACTAATTACCAAAAAGCCAAAATAGGAACCGCGGGGATGATTTGCGGACAGCTGCATTCTATAGCACTTCGTACATCTGGCTTAGTCTTACAGAGTGTATTTGCTTGTGTATACAATCAAAGATAAAGTTGATAGGCTAGCTGCATTTCATTGCACTTTGTAC
ACGTGGCATAAAGTCCTACAAAGGTGTTAAGATACAGTTCATAACCCTTTTTATTTGAATGGAAAAATACAATGGACATTTCTAGGATATTCGGAAAATTAGACATTTCATATTTCAAGAGATGGAAGGAATTTTTAATAAACTAACCATTTATTATTATTTCTGAAAATATCACTAATATGAA
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:ATCTTGCTAGGAAGCTTTCTGGGTAAGTCGTTATTGATATACTTTTTCACTGTAGATGTTATACGGGGTTTTAAGTATGTGAATTGCAAGGTATTCATCACACTGGTCTCACATATATTTAACTCCACAGGGATCCTAACCTACATTTCGTCGAGTCACCTGCTCTTGCTCCACCAGAGGTTCAAATTGATATGGCCACA
CAACACCAgtaagtgctttacctgctgagttagtattttctttcctgttgaatattatttttgttgaaaacccctgaatcagaaacattctgcttcatctgcttaaggtcattggagtactttttaattatttgttatggaccttctgtagatttcatgggaatttgaataagagtctttcccctttaaagaaaataatt
tgcatgtctctcctggttattgaaaaataaatttgtttttctttcagGTACGAAGCAGAATTGGCTGCAGCTGCTGCACAGCCTCTTCCTGATGACGATGATGATGTATTTGATAGTTAAACGCTTTTTGTTGTACGTATTGCCAAAAACACGGTTTTGCTGTGGATGGTGGGAGAGCTGGAATATTTTCTTTCGCTATA
ATCTAGTTTTATTATCTGTTAGTAATGCCTTTATTAAATGCTAGGTTACCTTTCAGATGCCTATTGTGCATAATAATCTTTTTGACCAACAGATGATTTTGACAGTATATTTAATGATAGGTTTTTTAAGTCATTCATTAATGACATATTTTTCTCGCATGTAAAAACTGAACCACACAAGGCAATTTCAAAATGCAATC
ATTCTGTTTCTTTATTCTAGTCTATTTACCAATACAATTATTTTTCTGGAACTGTGTGCCTCTATGGATTATTGATGCATGTATAGTAGTAGTGTACTATTTACTCAGCGAGAAAATCATGCATGACATTGGACATGTTACATTAAAGTGGATGAAATAGTTTCAAGGAAATAAGCAAAATGTTCCCAAAACTAATTACC
AAAAAGCCAAAATAGGAACCGCGGGGATGATTTGCGGACAGCTGCATTCTATAGCACTTCGTACATCTGGCTTAGTCTTACAGAGTGTATTTGCTTGTGTATACAATCAAAGATAAAGTTGATAGGCTAGCTGCATTTCATTGCACTTTGTACACGTGGCATAAAGTCCTACAAAGGTGTTAAGATACAGTTCATAACCC
TTTTTATTTGAATGGAAAAATACAATGGACATTTCTAGGATATTCGGAAAATTAGACATTTCATATTTCAAGAGATGGAAGGAATTTTTAATAAACTAACCATTTATTATTATTTCTGAAAATATCACTAATATGAA
Intron 7 GTAAGTACTT ... ATTTGAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20.57 | 1293.8 | 160.8 | 335 |
| A2 | 16.99 | 1104 | 125.6 | 226 |
| A3 | 15.63 | 1192.8 | 158 | 221 |
| A4 | 21.17 | 1210 | 153.4 | 325 |
| A5 | 17.78 | 615.3 | 85.8 | 133 |
| A6 | 15.09 | 6077 | 799.9 | 1080 |
| A7 | 14.19 | 4890.5 | 619.9 | 809 |
| A8 | 15.32 | 3660.5 | 385.3 | 662 |
| A9 | 13.68 | 4905 | 596.6 | 777 |
| A10 | 14.04 | 4311 | 503.4 | 704 |
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i8 from sample A1 / Example spliced isoformCACAGATACGTAGGCAACCATGGATTTCTCTAGTACTAGTTAATTAAACTAGCAACTCTCCGTTAATTTTAGCGGACATGTGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCG
TATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCATTCACCAGTCGAGATTCGATCATGGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTT
ACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTGGTGGCCTTAGAGATGGTTATTATTAATGGTACACCGATGGATCATGAAGGCCCACTCAAGCATGCCTCCAATCAAT
CCAAGTGTGAAGACATATTATGCAATGAGAGTGTTTGAATTGTTGGTGTGTAGGTGGTGAGTAGTTCACCATCGTGAATCAAAGATTTGAATATTTACCCACAAAACAACTTGAAAGAGTTTGAGGAAGTGAGGATGATCCCTATAGGAAGGCAGGATGTTTGTATTAAGGTAGTTGTTTTTATTTGCGACCTTGTGAGG
TGGGCTTGAGGCACTTGTGGGCCCAGCCATAACATGAGCCAAGTTCTCCAAGAAGTAAGCAAATTGGGTTTTGTTTTGAATGTCACTGTGTTATCGGCCTAATGTTTCTCACCCACTTTGCCATGAGTATTTTCAGCATTATGCATCACTTTGTAAAATTTAGCCTTTATTTCCATCAACTCCTTCACCATACGACCTCA
GTTCTGCCAGCAAGAGTTGAGTGAAACCTTGAAATTTGATCATGAAAGTCAACATACACTGTTTGCTTAATTTTCTGCATGTAGCTGCTAGCGTGTGTTAAATGCCTTAAAATCTGTGCTTTGACCCCAAATTGTAAAAAATAGTATCTTTTTGGCTCATTTATGTTGTGCACATTCAAAAAATGGTGTAGTGACCTCAC
TTCTATGGGAAGGTAATTTTTTTTTTTTTGGAATATGTTTTAGTTTTCTGAAGACTTCCGTTCTCTTATCTAGGTCATTAACGACATTATAGAAGTGACATCAACTATCAACTATAATTATTCATTATCGTTCCTACTAACAACATTCATTTATATATTAAATGAGACATAAATAACAATTCCAATGAAATAAACAATGT
AGCTAACATTCTCATAAGATTCCCGCCTTAACCCTGGAACTAAAACTATTAAGAATTTAATGTACTAATTTAAGTCGAGTTTACCAATACATAAGATGATTTCATACTTAGAGGCATAATCAATTTCCATGCATTTGTTTACTGCGATATTAATACCAATTCTAACCATAGCACAATAAAATTGATCAATAATTATTAAT
TACAATAAACATGCAATTATTGAATAATCTTTTGTTCTTCATTCAATTATCTATCTTTCATTTCGTTGTTACAATCATAAGAATTTATTCCAATGGGATATAATCACATATGTCAACAAGATACATTTTATCCCATGGTTACGTAGAGTGACTTGCCAAGTCCAGGAGCGATTCTTCTTATTAGTTCGCTACCATCTGTG
GCTTCCACTTCTCTGTCACAACATGTTAGCTATCCATGATATATATAAGCAAATAGACTGAATTCAAATTATAAATAAACTATGGATATCCCAGCCAACTCGGCGTGGGTATCCTTTATTAATATTTGCTGCAACGTGACTACTTTTTCCCTGAAACGTTAACATAAGCAAAACATTATAACAACATTATCTTGTTCAAA
TAGCCAACTATGAACTAATAAGCATTAATACATTAGCATATATGATCAAGGTAAACTATAGATATCCTGCCGAACTGGCATGTAGACCCTCCAGTTCGTTTCCCTGTAGGCGTTAGTTTCATTTCATGCAATAATTATATGAAAATGTTAACGCTGTAATTATATCAAATAACCAAATTTAAACAAAGAATTGATAAATG
GATATTCATATTATTAAGACAGGGTTGAATTGTAATAATGTTTGAACCAATGTTACAAATATCGTGTCGGCAAATATATCGCCGAGGGTCCAAAAACAAAATATCGGATTTATCGGGGAAAATGTCGGCAAACATCGGCAATATATCGGCGAAATTAAAAAATACAAAAATATTAATTTTTTGACTCGGCCC
>TRINITY_DN118757_c6_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:CACAGATACGTAGGCAACCATGGATTTCTCTAGTACTAGTTAATTAAACTAGCAACTCTCCGTTAATTTTAGCGGACATGTGTCCAGCCCGATGACCGGCGTCGTTTGGAAGCGAGGGTAGATCGGACGGCGGAGGGTGTCGCGTTGATAGAAAGCCATTTATACCAGTTGTAAAAGAGCATCGTTGGACCTCATTCTCG
TATGAGAAATTTCGCAGCACGGACATAATATTATCTATCTCTGTGTGTCCGAGCGAGCGCGCGTTTCAGTTTCATCCTCATTCACCAGTCGAGATTCGATCATGGCTTTTGCCGGTCCACACGTCGATTGCCCAAATTTCAAGCTTGTTATCGTTGGCGATGGAGGCACCGGGAAGACAACTTTTGTCAAACGGCATCTT
ACTGGAGAATTTGAAAAAAGATATGAGCgtaagtacttctttctttcaatcatatcttctcgttatctgtttgggatggattgctatagtatctgaacctagattttagtcaccgtagaaaacgagtctcggttttgtctcagaaaggttcaagttaagtagttgttgctgttttcttttactgggttatttgctaaatt
catgaaatttatttatatatgtattatgctggaattatttgttgtgaaatagatcaattatgcaatttttatattttaacattgttgttttaaaatttgaacagCCACAATAGGAGTGGAAGTTCACCCTCTTGATTTCTTTACAAATTGTGGGAAGATTCGATTTAATTGCTGGGATACTGCAGGCCAAGAGAAATTTG
GTGGCCTTAGAGATGGTTATTAGTAAGTTATAGCCTTATTTATTTTTTCAGAATTATTTATGCGTTCTTTTGTTTTTAAGATTATTAAACGTAGGGATGCTTCCTAGAGTCTTTTTGGGAATTGTAGGGCAGCCAAAATATTCAGAACTGGCGTGTTAGGTTCCAGATTATATTCCTTAGCTCGATCCATTTGAAAGCTG
CTCCATGTAATAACTTCCGTAGTAAGGAGTCACTTTCTAGAAATATGGCATTACAATAGGATGGTGGCCTTTTGTTTTTACTTTGGTAATCCAGCTGTCCATCAGTTCTGGTATGGTTCCCCATTATGTTTAATGACTTGTCAAAAAACAGTCCCGTCAAACACCAATTTTTTAGGCAAAGGCCAAGTTTAGGTATTTTG
CTTTAACCATCATAACAAAGGGATCTGAATCATAGTGGTCTATAACATACTTTCTTGTGTTACATGTATAACAGAAGCTGCAATTTTCAGAAAAAAATTAAGTAACTTCCCACATGGAACAATAGTTCAATAGTTTTGAGCTGCACCCAATAAGTTTACTTTTCTTGCAACAGAATAGTGCAGTGTATATCTTATCAATT
ATTTGGTATTTGCTCCCTTCTTTAAGGTGTTTTTATCAGTAAAAAGAGATTACTGTTGTGGCTATAACATGTAATAGAATACAAAACACCTGTTCTTTTTATTCATAATCTTGAATCAGTGTATGCTAGGCCTCCTGCTATCCTCACTCATTGTTGTACTTGTCACATATATTGTCTCATTTTTTTTCTATCCTTCATAC
AATGAACAACTACACGTTTCTTGATGTGTTACAGCTTGAACTAGCATGCATGATTAAACCCCCAAAGAATGAGGCTAGCCCATCTGTAACCTAGAGGTGTAACCCACTATCACCTTGATAACCACCTCTCTACACTTTAGGTTGGCTGTTCTCCAACTCAAGGGTAACATACCGAGGATAGGATTTGCTAGGTTATGGCA
ATATAGGTACAA