sp|Q9C5D6|CAAT9_ARATH ----> Cationic amino acid transporter 9, chloroplastic

Intron 1 GTGTGACAAT ... TGTGCTAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	74.26	35	127	75
A2	70.48	31	94	54
A3	71.43	46	137	93
A4	75.86	28	101	75
A5	74.65	18	65	41
A6	74.23	71	217	192
A7	76.45	77	304	196
A8	64.99	66	125	120
A9	75.14	67	247	158
A10	70.3	98	276	188

>TRINITY_DN42258_c0_g1_i9 from sample A8 / Example spliced isoform

ATAACTCTCACTGCGTAAATGCCTGAAAACAAACACAATCCAAAAACACATCGGTCCTGAAGAAAAAACAAATATTTGAATGAGCAATCCATCACACAGCGTGGAAAATTACGATGAAAGATGCACAGACGCTTCACGGCACTGAGAAATTAAATGTTTTCCCCAAGAGGCCATCAATGTATAGAAACCCATTATATTAT
TCAAGTTCTGCTCCATTTTCCAGGCGACTTTAAAGTGTGGACGGGATGCAGGGAAGGATGAAAGGGCAATCATGGCTAACCCAATTCGGGAAGGCAGCCCGCCGTGCTAAAACGTATAATATATCGTATAGGCGCACAGATCATATACTAATTGAAGGAGAGGGAGGTCTGGTTAGACGGTTGGGATTATTCGATCTCAT
ATTGCTGGGAATCGGGGCTTCAATTGGGGCAGGCATCTTCGTCGTCACAGGCACTGTTGCCGCCGATGCCGGCCCAGATTGCGATTGTTCTGCTGGTAATTATCAGTGGTTCTTTTGAGATCGATGTGTCAAATTGGACTCCTTTTGCTCCAAATGGATTCAAAGAAATTGTTGTAGGTGCAACAGTGGTGTTTTTTGCC
TATGTTGGATTTGATGCAGTAGCTAATTCCGCTGAAGAATGTAGGAAACCAAAGAGGGACTTGCCAATAGGCATACTTGTCAGCCTACTTGCTTGTGTGGCTTTGTACATTGGTGTTTGCTTAGTGTTAACGGGCATGGTGCCGTACAAATTATTAGGTGGAGATGCACCTTTGGCTGAAGCGTTTTCTGCAAAGGGCCT
AAAATTCATTGTTGTTCTTATCAGTGTGGGTGCTGTTGCCGGTCTCACTACCACACTTCTAGTTGGATTGTATGTTCAGTCACGACTGTACCTTGGTCTGGGACGGGATGGTTTATTGCCATCATTTTTTGCAAAGATTCACCCAAAACGTCGCACCCCTATCTGCGCACAAGTTTGGGTTGGCTCTGTTGCTGGAATAA
TGGCAACCTTCTTTAATGTCAAAGCACTTTCTCACATTTTGTCAGTTGGTACACTGACAGGATACTCAGTTGTTTCAGCATGTGTTATTATGCTTCGTGTGAAAAGTGATTCACAAAACGATTATGGAGCTCTTGCCAAAGGATTCACAAAATGGCATGAAGCTCTTATGTGTATTCTTAGTGTGGCATGCTGTGCCTTT
GCATCTGGTCTGTGTTACCGATTTGGTACCTACTTTATTTATCCTGTGGTCATAGCTATCATGGCTATCCTCCCGGCCACTGCTCTTCATTATCGGCAAGAATACGCAGAACCTCCTGGGTTTTCATGTCCAGGGACTCCTCTGCTGCCAGTGGCTAGTATATTTTTCAACATTTTCTTGTTTGCTCAGTTACATTGGGA
AGGCTGGGTGAGATTTCTTGTTCTCAATACAGTTGCAATTATAATCTATGCTCTATATGGACAATATCACGCAGACCCTAATCTCTCTGCATTGCAAGAATCGTCTCAATATGACAGAGCTCCAACTGTGGATGATGAAGGACTCAATGCTTCAAATGCTTAATCTGATTTTTCCAGCTTCCACCAGTGACACTAGCAAC
TATTGTTTCCCATCCTCTATGTCCAATGGCTATTAAGGTTAAAAGGTTGAACTAGATATCTTCTTTAAGAACTTCTTATTCAGGCTGGTTGTATTATAATCTCTATTGCAATTTTTTTTACCTCTGTAAGTATTTATGGAAATATTTTTTTTGATTTTATGTGATGGCTAATGAAAGTAAATGTTTTCCATTGTTGCATT
TAATGTTAGATCTTGGTTTTGAGGACATCTATGTATAGGACCTTAGATACACAGGGTAAGAACTTTAGGAATAGAGATATGGAATGTTTCAGTATCTAACTTGATAAAACTGATACTATTGTGATGTGTACAGATCTCTATAACAGGAAATTGATCGTCCTTGTATTGGTTCAAAATTTTCC

>TRINITY_DN42258_c0_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

ATAACTCTCACTGCGTAAATGCCTGAAAACAAACACAATCCAAAAACACATCGGTCCTGAAGAAAAAACAAATATTTGAATGAGCAATCCATCACACAGCGTGGAAAATTACGATGAAAGATGCACAGACGCTTCACGGCACTGAGAAATTAAATGTTTTCCCCAAGAGGCCATCAATGTATAGAAACCCATTATATTAT
TCAAGTTCTGCTCCATTTTCCAGGCGACTTTAAAGTGTGGACGGGATGCAGGGAAGGATGAAAGGGCAATCATGGCTAACCCAATTCGGGAAGGCAGCCCGCCGTGCTAAAACGTATAATATATCGTATAGGCGCACAGATCATATACTAATTGAAGGAGAGGGAGGTCTGGTTAGACGGTTGGGATTATTCGATCTCAT
ATTGCTGGGAATCGGGGCTTCAATTGGGGCAGGCATCTTCGTCGTCACAGGCACTGTTGCCGCCGATGCCGGCCCAGgtgtgacaattagtttcatactagctggagcagcttgtgtgcttaatgccttgtgctatgcagaactctcatctcgtttccctgcacttgttggaggagcatatctatatgcatattcagctt
tcaatgagctaactgcatttcttgtttttggtcaactgatggttgactatcatattggtgctgctagcatagcacgtagcttggcaggttatgtggtgacagttttggaactcttcccttttataaaggaacatatgcctcaatggcttcgtcctgggggcatggagctctttgggggctttctgtcggtcaatgttttg
gctccaatattgctgatagtagtaacccttgtactgtgtcaaggtgtaagagagtcatccattgtgaatgctgtcatgactgtgctaaagATTGCGATTGTTCTGCTGGTAATTATCAGTGGTTCTTTTGAGATCGATGTGTCAAATTGGACTCCTTTTGCTCCAAATGGATTCAAAGAAATTGTTGTAGGTGCAACAGT
GGTGTTTTTTGCCTATGTTGGATTTGATGCAGTAGCTAATTCCGCTGAAGAATGTAGGAAACCAAAGAGGGACTTGCCAATAGGCATACTTGTCAGCCTACTTGCTTGTGTGGCTTTGTACATTGGTGTTTGCTTAGTGTTAACGGGCATGGTGCCGTACAAATTATTAGGTGGAGATGCACCTTTGGCTGAAGCGTTTT
CTGCAAAGGGCCTAAAATTCATTGTTGTTCTTATCAGTGTGGGTGCTGTTGCCGGTCTCACTACCACACTTCTAGTTGGATTGTATGTTCAGTCACGACTGTACCTTGGTCTGGGACGGGATGGTTTATTGCCATCATTTTTTGCAAAGATTCACCCAAAACGTCGCACCCCTATCTGCGCACAAGTTTGGGTTGGCTCT
GTTGCTGGAATAATGGCAACCTTCTTTAATGTCAAAGCACTTTCTCACATTTTGTCAGTTGGTACACTGACAGGATACTCAGTTGTTTCAGCATGTGTTATTATGCTTCGTGTGAAAAGTGATTCACAAAACGATTATGGAGCTCTTGCCAAAGGATTCACAAAATGGCATGAAGCTCTTATGTGTATTCTTAGTGTGGC
ATGCTGTGCCTTTGCATCTGGTCTGTGTTACCGATTTGGTACCTACTTTATTTATCCTGTGGTCATAGCTATCATGGCTATCCTCCCGGCCACTGCTCTTCATTATCGGCAAGAATACGCAGAACCTCCTGGGTTTTCATGTCCAGGGACTCCTCTGCTGCCAGTGGCTAGTATATTTTTCAACATTTTCTTGTTTGCTC
AGGTATATATCCGTCATACTCTGCTCAAAAAATTCATATTCACGAGTTACATTGGGAAGGCTGGGTGAGATTTCTTGTTCTCAATACAGTTGCAATTATAATCTATGCTCTATATGGACAATATCACGCAGACCCTAATCTCTCTGCATTGCAAGAATCGTCTCAATATGACAGAGCTCCAACTGTGGATGATGAAGGAC
TCAATGCTTCAAATGCTTAATCTGATTTTTCCAGCTTCCACCAGTGACACTAGCAACTATTGTTTCCCATCCTCTATGTCCAATGGCTATTAAGGTTAAAAGGTTGAACTAGATATCTTCTTTAAGAACTTCTTATTCAGGCTGGTTGTATTATAATCTCTATTGCAATTTTTTTTACCTCTGTAAGTATTTATGGAAAT
ATTTTTTTTGATTTTATGTGATGGCTAATGAAAGTAAATGTTTTCCATTGTTGCATTTAATGTTAGATCTTGGTTTTGAGGACATCTATGTATAGGACCTTAGATACACAGGGTAAGAACTTTAGGAATAGAGATATGGAATGTTTCAGTATCTAACTTGATAAAACTGATACTATTGTGATGTGTACAGATCTCTATAA
CAGGAAATTGATCGTCCTTGTATTGGTTCAAAATTTTCC

Intron 2 GTAGGGAATG ... TTGTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	36.92	81	32	62.8
A2	31.96	52	22.1	26.7
A3	28.99	96.5	48.8	30
A4	32.18	80.9	31.2	45.6
A5	38.92	51	30	35
A6	31.47	142.4	59	71.8
A7	32.32	196.7	91.4	96.5
A8	34.11	75.1	41.5	36.3
A9	32.52	177.5	63.4	107.7
A10	31.38	184	85.4	82.9

>TRINITY_DN119002_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

CCTGAAAACAAACACAATCCAAAAACACATCGGTCCTGAAGAAAAAACAAATATTTGAATGAGCAATCCATCACACAGCGTGGAAAATTACGATGAAAGATGCACAGACGCTTCACGGCACTGAGAAATTAAATGTTTTCCCCAAGAGGCCATCAATGTATAGAAACCCATTATATTATTCAAGTTCTGCTCCATTTTCC
AGGCGACTTTAAAGTGTGGACGGGATGCAGGGAAGGATGAAAGGGCAATCATGGCTAACCCAATTCGGGAAGGCAGCCCACCGTGCTAAAACGTATAATATATCGTATAGGCGCACAGATCATATACTAATTGAAGGAGAGGGAGGTCTGGTTAGACGGTTGGGATTATTCGATCTCATATTGCTGGGAATCGGGGCTTC
AATTGGGGCAGGCATCTTCGTCGTCACAGGCACTGTTGCCGCCGATGCCGGCCCAGGTGTGACAATTAGTTTCATACTAGCTGGAGCAGCTTGTGTGCTTAATGCCTTGTGCTATGCAGAACTCTCATCTCGTTTCCCTGCACTTGTTGGAGGAGCATATCTATATGCATATTCAGCTTTCAATGAGCTAACTGCATTTC
TTGTTTTTGGTCAACTGATGGTTGACTATCATATTGGTGCTGCTAGCATAGCACGTAGCTTGGCAGGTTATGTGGTGACAGTTTTGGAACTCTTCCCTTTTATAAAGGAACATATGCCTCAATGGCTTCGTCCTGGGGGCATGGAGCTCTTTGGGGGTTTTCTGTCGGTCAATGTTTTGGCTCCAATATTGCTGATAGTA
GTAACCCTTGTACTGTGTCAAGGTGTAAGAGAGTCATCCATTGTGAATGCTGTCATGACTGTGCTAAAGATTGCGATTGTTCTGCTGGTAATTATCAGTGGTTCTTTTGAGATCGATGTGTCAAATTGGACTCCTTTTGCTCCAAATGGATTCAAAGAAATTGTTGTAGGTGCAACAGTGGTGTTTTTTGCCTATGTTGG
ATTTGATGCAGTAGCTAATTCCGCTGAAGAATGTAGGAAACCAAAGAGGGACTTGCCAATAGGCATACTTGTCAGCCTACTTGCTTGTGTGGCTTTGTACATTGGTGTTTGCTTAGTGTTAACGGGCATGGTGCCGTACAAATTATTAGGTGGAGATGCACCTTTGGCTGAAGCGTTTTCTGCAAAGGGCCTAAAATTCA
TTGTTGTTCTTATCAGTGTGGGTGCTGTTGCCGGTCTCACTACCACACTTCTAGTTGGATTGTATGTTCAGTCACGACTGTACCTTGGTCTGGGACGGGATGGTTTATTGCCATCATTTTTTGCAAAGATTCACCCAAAACGTCGCACCCCTATCTGCGCACAAGTTTGGGTTGGCTCTGTTGCTGGAATAATGGCAACC
TTCTTTAATGTCAAAGCACTTTCTCACATTTTGTCAGTTGGTACACTGACAGGATACTCAGTTGTTTCAGCATGTGTTATTATGCTTCGTGTGAAAAGTGATTCACAAAATGATTATGGAGCTCTTGCCAAAGGATTCACAAAATGGCATGAAGCTCTTATGTGTATTCTTAGTGTGGCATGCTGTGCCTTTGCATCTGG
TCTGTGTTACCGATTTGGTACCTACTTTATTTATCCTGTGGTCATAGCTATCATGGCTATCCTCCCGGCCACTGCTCTTCATTATCGGCAAGAATACGCAGAACCTCCTGGGTTTTCATGTCCAGGGACTCCTCTGCTGCCAGTGGCTAGTATATTTTTCAACATTTTCTTGTTTGCTCAGTTACATTGGGAAGGCTGGG
TGAGATTTCTTGTTCTCAATACAGTTGCAATTATAATCTATGCTCTATATGGACAATATCACGCAGACCCTAATCTCTCTGCATCGCAAGAATCGTCTCAATATGACAGAGCTCCAACTTTGGATGATGAAGGACTCAATGCTTCAAATGCTTAATCTGATTTTTCCACTAGCAACTATTGTTTCCCAGCCTATGTCCAA
TGGCTATTCAGGTTAAAAGGTTGAACTTGATATCTTCTTTAAGAACTTCTTATTCAGGCTGGTTGTATTATAATCTCTATTGCAATTTTTTTTACCTCTGTAAGTATTTATGGAAATATTTTTTTTGATTTTATGTGATGGCTT

>TRINITY_DN119002_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CCTGAAAACAAACACAATCCAAAAACACATCGGTCCTGAAGAAAAAACAAATATTTGAATGAGCAATCCATCACACAGCGTGGAAAATTACGATGAAAGATGCACAGACGCTTCACGGCACTGAGAAATTAAATGTTTTCCCCAAGAGGCCATCAATGTATAGAAACCCATTATATTATTCAAGTTCTGCTCCATTTTCC
AGgtagggaatggagggatcaaacatacctgattaatcataaacatattgggtcacacatacttataactgatttgttctcagGCGACTTTAAAGTGTGGACGGGATGCAGGGAAGGATGAAAGGGCAATCATGGCTAACCCAATTCGGGAAGGCAGCCCACCGTGCTAAAACGTATAATATATCGTATAGGCGCACAGA
TCATATACTAATTGAAGGAGAGGGAGGTCTGGTTAGACGGTTGGGATTATTCGATCTCATATTGCTGGGAATCGGGGCTTCAATTGGGGCAGGCATCTTCGTCGTCACAGGCACTGTTGCCGCCGATGCCGGCCCAGGTGTGACAATTAGTTTCATACTAGCTGGAGCAGCTTGTGTGCTTAATGCCTTGTGCTATGCAG
AACTCTCATCTCGTTTCCCTGCACTTGTTGGAGGAGCATATCTATATGCATATTCAGCTTTCAATGAGCTAACTGCATTTCTTGTTTTTGGTCAACTGATGGTTGACTATCATATTGGTGCTGCTAGCATAGCACGTAGCTTGGCAGGTTATGTGGTGACAGTTTTGGAACTCTTCCCTTTTATAAAGGAACATATGCCT
CAATGGCTTCGTCCTGGGGGCATGGAGCTCTTTGGGGGTTTTCTGTCGGTCAATGTTTTGGCTCCAATATTGCTGATAGTAGTAACCCTTGTACTGTGTCAAGGTGTAAGAGAGTCATCCATTGTGAATGCTGTCATGACTGTGCTAAAGATTGCGATTGTTCTGCTGGTAATTATCAGTGGTTCTTTTGAGATCGATGT
GTCAAATTGGACTCCTTTTGCTCCAAATGGATTCAAAGAAATTGTTGTAGGTGCAACAGTGGTGTTTTTTGCCTATGTTGGATTTGATGCAGTAGCTAATTCCGCTGAAGAATGTAGGAAACCAAAGAGGGACTTGCCAATAGGCATACTTGTCAGCCTACTTGCTTGTGTGGCTTTGTACATTGGTGTTTGCTTAGTGT
TAACGGGCATGGTGCCGTACAAATTATTAGGTGGAGATGCACCTTTGGCTGAAGCGTTTTCTGCAAAGGGCCTAAAATTCATTGTTGTTCTTATCAGTGTGGGTGCTGTTGCCGGTCTCACTACCACACTTCTAGTTGGATTGTATGTTCAGTCACGACTGTACCTTGGTCTGGGACGGGATGGTTTATTGCCATCATTT
TTTGCAAAGATTCACCCAAAACGTCGCACCCCTATCTGCGCACAAGTTTGGGTTGGCTCTGTTGCTGGAATAATGGCAACCTTCTTTAATGTCAAAGCACTTTCTCACATTTTGTCAGTTGGTACACTGACAGGATACTCAGTTGTTTCAGCATGTGTTATTATGCTTCGTGTGAAAAGTGATTCACAAAATGATTATGG
AGCTCTTGCCAAAGGATTCACAAAATGGCATGAAGCTCTTATGTGTATTCTTAGTGTGGCATGCTGTGCCTTTGCATCTGGTCTGTGTTACCGATTTGGTACCTACTTTATTTATCCTGTGGTCATAGCTATCATGGCTATCCTCCCGGCCACTGCTCTTCATTATCGGCAAGAATACGCAGAACCTCCTGGGTTTTCAT
GTCCAGGGACTCCTCTGCTGCCAGTGGCTAGTATATTTTTCAACATTTTCTTGTTTGCTCAGTTACATTGGGAAGGCTGGGTGAGATTTCTTGTTCTCAATACAGTTGCAATTATAATCTATGCTCTATATGGACAATATCACGCAGACCCTAATCTCTCTGCATCGCAAGAATCGTCTCAATATGACAGAGCTCCAACT
TTGGATGATGAAGGACTCAATGCTTCAAATGCTTAATCTGATTTTTCCACTAGCAACTATTGTTTCCCAGCCTATGTCCAATGGCTATTCAGGTTAAAAGGTTGAACTTGATATCTTCTTTAAGAACTTCTTATTCAGGCTGGTTGTATTATAATCTCTATTGCAATTTTTTTTACCTCTGTAAGTATTTATGGAAATAT
TTTTTTTGATTTTATGTGATGGCTT

Intron 3 GTATATATCC ... TATTCACGAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	15.59	46	11	8.5
A2	19.99	38	3	9.5
A3	24.39	31	2	10
A4	6.25	45	12	3
A5	20.83	19	2	5
A6	24.94	311.5	27	103.5
A7	24.92	223	23.5	74
A8	23.14	320.5	41	96.5
A9	17.67	233	25.5	50
A10	18.82	110	10	25.5

>TRINITY_DN41936_c0_g1_i8 from sample A6 / Example spliced isoform

CTCACTGCGTAAATGCCTGAAAACAAACACAATCCAAAAACACATCGGTCCTGAAGAAAAAACAAATATTTGAATGAGCAATCCATCACACAGCGTGGAAAATTACGATGAAAGATGCACAGACGCTTCACGGCACTGAGAAATTAAATGTTTTCCCCAAGAGGCCATCAATGTATAGAAACCCATTATATTATTCAAGT
TCTGCTCCATTTTCCAGGTAGGGAATGGAGGGATCAAACATACCTGATTAATCATAAACATATTGGGTCACACATACTTATAACTGATTTGTTCTCAGGCGACTTTAAAGTGTGGACGGGATGCAGGGAAGGATGAAAGGGCAATCATGGCTAACCCAATTCGGGAAGGCAGCCCGCCGTGCTAAAACGTATAATATATC
GTATAGGCGCACAGATCATATACTAATTGAAGGAGAGGGAGGTCTGGTCAGACGGTTGGGATTATTCGATCTCATATTGCTGGGAATCGGGGCTTCAATTGGGGCAGGCATCTTCGTCGTCACAGGCACTGTTGCCGCCGATGCCGGCCCAGGTGTGACAATTAGTTTCATACTAGCTGGAGCAGCTTGTGTGCTTAATG
CCTTGTGCTATGCAGAACTCTCATCTCGTTTCCCTGCACTTGTTGGAGGAGCATATCTATATGCATATTCAGCTTTCAATGAGCTAACTGCATTTCTTGTTTTTGGTCAACTGATGGTTGACTATCATATTGGTGCTGCTAGCATAGCACGTAGCTTGGCAGGTTATGTGGTGACAGTTTTGGAACTCTTCCCTTTTATA
AAGGAACATATGCCTCAATGGCTTCGTCCTGGGGGCATGGAGCTCTTTGGGGGTTTTCTGTCGGTCAATGTTTTGGCTCCAATATTGCTGATAGTAGTAACCCTTGTACTGTGTCAAGGTGTAAGAGAGTCATCCATTGTGAATGCTGTCATGACTGTGCTAAAGATTGCGATTGTTCTGCTGGTAATTATCAGTGGTTC
TTTTGAGATCGATGTGTCAAATTGGACTCCTTTTGCTCCAAATGGATTCAAAGAAATTGTTGTAGGTGCAACAGTGGTGTTTTTTGCCTATGTTGGATTTGATGCAGTAGCTAATTCCGCTGAAGAATGTAGGAAACCAAAGAGGGACTTGCCAATAGGCATACTTGTCAGCCTACTTGCTTGTGTGGCTTTGTACATTG
GTGTTTGCTTAGTGTTAACGGGCATGGTGCCGTACAAATTATTAGGTGGAGATGCACCTTTGGCTGAAGCGTTTTCTGCAAAGGGCCTAAAATTCATTGTTGTTCTTATCAGTGTGGGTGCTGTTGCCGGTCTCACTACCACACTTCTAGTTGGATTGTATGTTCAGTCACGACTGTACCTTGGTCTGGGACGGGATGGT
TTATTGCCATCATTTTTTGCAAAGATTCACCCAAAACGTCGCACCCCTATCTGCGCACAAGTTTGGGTTGGCTCTGTTGCTGGAATAATGGCAACCTTCTTTAATGTCAAAGCACTTTCTCACATTTTGTCAGTTGGTACACTGACAGGATACTCAGTTGTTTCAGCATGTGTTATTATGCTTCGTGTGAAAAGTGATTC
ACAAAACGATTATGGAGCTCTTGCCAAAGGATTCACAAAATGGCATGAAGCTCTTATGTGTATTCTTAGTGTGGCATGCTGTGCCTTTGCATCTGGTCTGTGTTACCGATTTGGTACCTACTTTATTTATCCTGTGGTCATAGCTATCATGGCTATCCTCCCGGCCACTGCTCTTCATTATCGGCAAGAATACGCAGAAC
CTCCTGGGTTTTCATGTCCAGGGACTCCTCTGCTGCCAGTGGCTAGTATATTTTTCAACATTTTCTTGTTTGCTCAGTTACATTGGGAAGGCTGGGTGAGATTTCTTGTTCTCAATACAGTTGCAATTATAATCTATGCTCTATATGGACAATATCACGCAGACCCTAATCTCTCTGCATCGCAAGAATCGTCTCAATAT
GACAGAGCTCCAACTTTGGATGATGAAGGACTCAATGCTTCAAATGCTTAATCTGATTTTTCCAGCTTCCACCAGTGACACTAGCAACTATTGTTTCCCATCCTCTATGTCCAATGGCTATTAAGGTTAAAAGGTTGAACTAGATATCTTCTTTAAGAACTTCTTATTCAGGCTGGTTGTATTATAATCTCTATTGCAAT
TTTTTTTACCTCTGTAAGTATTTATGGAAATATTTTTTTTGATTTTATGTGATGGCTAATGAAGGTAAATGTTTTCCATTGTTGCATTTAATGTTAGATCTTTGTTTTGAGGACATCTATGTATAGGACCTTAGATACACAGGGTAAGAACTTTAGGAATAGAGATATGGAATGTTTCAGTATCTAACTTGATAAAACTG
AT

>TRINITY_DN41936_c0_g1_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TCAACATTTTCTTGTTTGCTCAGgtatatatccgtcatactctgctcaaaaaattcatattcacgagTTACATTGGGAAGGCTGGGTGAGATTTCTTGTTCTCAATACAGTTGCAATTATAATCTATGCTCTATATGGACAATATCACGCAGACCCTAATCTCTCTGCATCGCAAGAATCGTCTCAATATGACAGAGCTC
CAACTTTGGATGATGAAGGACTCAATGCTTCAAATGCTTAATCTGATTTTTCCAGCTTCCACCAGTGACACTAGCAACTATTGTTTCCCATCCTCTATGTCCAATGGCTATTAAGGTTAAAAGGTTGAACTAGATATCTTCTTTAAGAACTTCTTATTCAGGCTGGTTGTATTATAATCTCTATTGCAATTTTTTTTACC
TCTGTAAGTATTTATGGAAATATTTTTTTTGATTTTATGTGATGGCTAATGAAGGTAAATGTTTTCCATTGTTGCATTTAATGTTAGATCTTTGTTTTGAGGACATCTATGTATAGGACCTTAGATACACAGGGTAAGAACTTTAGGAATAGAGATATGGAATGTTTCAGTATCTAACTTGATAAAACTGAT