sp|Q0E2F9|UBP15_ORYSJ ----> Ubiquitin C-terminal hydrolase 15

Intron 1 GTAAGTAACA ... TATAATTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.27	4	1	2
A2	36.84	6	3	4
A3	100	0	4	2
A4	28	9	4	3
A5	-1	0	0	0
A6	36	8	6	3
A7	39.39	10	6	7
A8	28	9	1	6
A9	18.52	11	2	3
A10	40	3	0	4

>TRINITY_DN41327_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

TTTTTTCCTATTTTTCGTTTTTATGCACTCGATATATTCACGGGGTAGACAGCTTGGTATGTTATCGAGAGGTTCGGAAGTGTGAAATCAGGGCGTGTAGGGCTGAAATATGTTTAGCAGGCAGAGTTAGGGGCAGAGCGACTGTTGTGGGGTGCTGATACAACAAAAAAATGGGCGATACTCAAATGGAAATGGAAAAG
GAGGGCCAGAGCATTGAAAAGGCGTTGGCCCGCCTGCACCTTCCACCCCAAGAGCTTGCAGTAAGAGACACTGAAAGCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAATGGAGGACGATCCAATAATAATATTAGGTTTCGTACAGAAGCCTGAAAGTCCTCATTCACTTGCTCGGCATTTCTTCCCTGATAAAGCTGGAGGCAC
ACCGGCATGGCTGGATCCAATTAACATACCCAATGTGCCGCACTCGTGCTGTGGCATCTGTGGAAATCCATTGCAATTTTTGATACAGGTTTATGCACCGATCAAAGAGAAAGATGACGCATTTCATAGAACGTTATTTGTCTTCATGTGCCCTTCAATGGCATGTCTCCAACAAGATCAGATTGAACAGAGAAAGCTTC
CCATGGAGAAGTCATGTAGAAGTGTGAAGGTATTTCGTTGCCAGCTTGCTCGGAACAATCCTTTCTACCCAGATGATAGTTCAAAGCATGATGGACATGATGCACCATCCTCTAGTGGTGTTGCTCTTTGTAGTTGGTGTGGGACATGGAGAGGGGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGC
CAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGATTCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGATTACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGA
CGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAATTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTTTCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGGTACTGTAGGTCTAAGAATG
CAAAAATCTTGTGGCCAGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCCTAAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTGATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTATTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAAT
TCCCTGGGTTATGTAGAGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCACATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATAGTATGCCTTGCAGTTGGTCTATTAGAGAACTTGTAACCTCCTAGAGGAGCTGCTTCTGCTGGTGTGATTAGCCTTTGGGAAGAGTAACATGTTTGGGATTGCA
TCTAAAAATTAGTCATTTTAGGTCTGAGCTCTCTTGTGGTCATTTTGTCGATTCATATGAACTCAAACATGATAATATATGTAAGCATAAGCTGCAATTTTCTAGAAGCTCGACTAAGAGTCTGTGCCGTCACCTTTGCAGAGTTGCGTTTTTGCGTGAATCCATTTATTGTCTATTTCAGGTTATTATTTGCTCAAAAA
ATGATCTTATAATTTGCGCTGTTAATTCAGTGATGACATCATCACTGTTTAATTTATTAAAAAGTTTGGGCAACATATTTAATAAATTTGAAATGAAAGAGCTAGGAATGATTCTGACAAATTTGTATAATGTTCAGAAATCCTATTGAAGTATGAATTCTGGGTTGCTAAGTTGCAGGAAACTACTGATACCCCAAACA
TTTCAAGGTTTATCATGTTTTGAGTGCGAAGTGGATTTTGCAGGTATCATTTAACATTTTGGGCAACACATGATATAATCTTCTATGAGACTTAATATATAAATGCAGTTTTTATTAAAAAAA

>TRINITY_DN41327_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

TTTTTTCCTATTTTTCGTTTTTATGCACTCGATATATTCACGGGGTAGACAGCTTGGTATGTTATCGAGAGGTTCGGAAGTGTGAAATCAGGGCGTGTAGGGCTGAAATATGTTTAGCAGGCAGAGTTAGGGGCAGAGCGACTGTTGTGGGGTGCTGATACAACAAAAAAATGGGCGATACTCAAATGGAAATGGAAAAG
GAGGGCCAGAGCATTGAAAAGGCGTTGGCCCGCCTGCACCTTCCACCCCAAGAGCTTGCAGTAAGAGACACTGAAAGCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAATGGAGGACGATCCAATAATAATATTAGGTTTCGTACAGAAGCCTGAAAGTCCTCATTCACTTGCTCGGCATTTCTTCCCTGATAAAGCTGGAGGCAC
ACCGGCATGGCTGGATCCAATTAACATACCCAATGTGCCGCACTCGTGCTGTGGCATCTGTGGAAATCCATTGCAATTTTTGATACAGGTTTATGCACCGATCAAAGAGAAAGATGACGCATTTCATAGAACGTTATTTGTCTTCATGTGCCCTTCAATGGCATGTCTCCAACAAGATCAGATTGAACAGAGAAAGCTTC
CCATGGAGAAGTCATGTAGAAGTGTGAAGGTATTTCGTTGCCAGCTTGCTCGGAACAATCCTTTCTACCCAGATGATAGTTCAAAGCATGATGGACATGATGCACCATCCTCTAGTGGTGTTGCTCTTTGTAGTTGGTGTGGGACATGGAGAGGGGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGC
CAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGATTCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGATTACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGA
CGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAATTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTTTCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGGTACTGTAGGTCTAAGAATG
CAAAAATCTTGTGGCCAGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCCTAAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTGATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTATTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAAT
TCCCTGGGTTATGTAGAGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCACATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATAGTgtaagtaacaccaaagtagtgctttactccgtcgtggaagattttttgttgccgttttcttcctttgtataagttctttattaggactttgaatgtgtaac
atgattgtcttgtaacatgatatatatatatatatattggataagttgtagtatgctgttaacttcagaaaaccacaaatctgaccttgttcttgtataattcagATGCCTTGCAGTTGGTCTATTAGAGAACTTGTAACCTCCTAGAGGAGCTGCTTCTGCTGGTGTGATTAGCCTTTGGGAAGAGTAACATGTTTGGG
ATTGCATCTAAAAATTAGTCATTTTAGGTCTGAGCTCTCTTGTGGTCATTTTGTCGATTCATATGAACTCAAACATGATAATATATGTAAGCATAAGCTGCAATTTTCTAGAAGCTCGACTAAGAGTCTGTGCCGTCACCTTTGCAGAGTTGCGTTTTTGCGTGAATCCATTTATTGTCTATTTCAGGTTATTATTTGCT
CAAAAAATGATCTTATAATTTGCGCTGTTAATTCAGTGATGACATCATCACTGTTTAATTTATTAAAAAGTTTGGGCAACATATTTAATAAATTTGAAATGAAAGAGCTAGGAATGATTCTGACAAATTTGTATAATGTTCAGAAATCCTATTGAAGTATGAATTCTGGGTTGCTAAGTTGCAGGAAACTACTGATACCC
CAAACATTTCAAGGTTTATCATGTTTTGAGTGCGAAGTGGATTTTGCAGGTATCATTTAACATTTTGGGCAACACATGATATAATCTTCTATGAGACTTAATATATAAATGCAGTTTTTATTAAAAAAA

Intron 2 GTAAGTAACA ... TATAATTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20	4	1	0
A2	33.33	6	3	0
A3	100	0	4	2
A4	30.77	9	4	1
A5	-1	0	0	0
A6	42.86	8	6	1
A7	37.5	10	6	2
A8	10	9	1	0
A9	15.38	11	2	0
A10	0	3	0	0

>TRINITY_DN40161_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

CGGGTATGTTATCGAGAGGTTCGGAAGTGTGAAATCAGGGCGTGTAGGGCTGAAATATGTTTAGCAGGCAGAGTTAGGGGCAGAGCGACTGTTGTGGGGTGCTGATACAACAAAAAAATGGGCGATACTCAAATGGAAATGGAAAAGGAGGGCCAGAGCATTGAAAAGGCGTTGGCCCGCCTGCACCTTCCACCCCAAGA
GCTTGCAGTAAGAGACACTGAAAGCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAATGGAGGACGATCCAATAATAATATTAGGTTTCGTACAGAAGCCTGAAAGTCCTCATTCACTTGCTCGGCATTTCTTCCCTGATAAAGCTGGAGGCACACCGGCATGGCTGGATCCAATTAACATACCCAATGTGCCGCACTCGTGCTGTG
GCATCTGTGGAAATCCATTGCAATTTTTGATACAGGTTTATGCACCGATCAAAGAGAAAGATGACGCATTTCATAGAACGTTATTTGTCTTCATGTGCCCTTCAATGGCATGTCTCCAACAAGATCAGATTGAACAGAGAAAGCTTCCCATGGAGAAGTCATGTAGAAGTGTGAAGGTATTTCGTTGCCAGCTTGCTCGG
AAAAATCCTTTCTACCCAGATGATAGTTCAAAGCATGATGGACATGATGCACCATCCTCTAGTGGTGTTGCTCTTTGTAGTTGGTGTGGGACATGGAGAGGGGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGCCAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGAT
TCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGATTACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGACGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAA
TTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTTTCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGGTGAAATTTTTTGAGCTACAATTGCTTCTCAAAGAAGTGCCCCCTTTGCTTGGATCATTGGATTATCTTTTTA
TGTATTGAACTTTACTTTGTTGTCAGCTCCTTTTTTATATCATTTCTTTCAAAAATTGCAATACTAATAATTTTATAATAGATACTATCTTACTAACACTGCTTTGCCTCAGCATTCTAAAAATAAGAGTGTATATGATTAGTGTTGCCTCAATTTTATTCAGGAGAAATCTGATGGAGGTCTTAAGGTCCACGTTCTCC
TTATTAATAAGTCTTTGACTTTGGAAGTACTGCTCATGTATTTTACACCTCTGTTATGTGTTTTTTTAGACAGTGACCTGTTTCATAATTGTAATTATGTCATCACAATTGTGAGCTGCAAATTGTAATATAATGTTCCTTGCTATAACATGTTTCTGAAACAGGTACTGTAGGTCTAAGAATGCAAAAATCTTGTGGCC
AGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCCCAAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTGATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTATTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAATTCCCTGGGTTATGTAG
AGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCACATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATAGTATGCCTTGCAGTTGGTCTATTAGAGAACTTGTAACCTCCTAGAGGAGCTGCTTCTGCTGGTGTGATTAGCCTTTGGGAAGAGTAACATGTTTGGGATTGCATCTAAAAATTAGTCAT
TTTAGGTCTGAGCTCTCTTGTGGTCATTTTGTCGATTCATATGAACTCAAACATGATAATATATGTAAGCATAAGCTGCAATTTTCTAGAAGCTCGACTAAGAGTCTGTGCCGTCACCTTTGCAGAGTTGCGTTTTTGCGTGAATCCATTTATTGTCTATTTCAGGTTATTATTTGCTCAAAAAATGATCTTATAATTTG
CGCTGTTAATTCAGTGATGACATCATCACTGTTTAATTTATTAAAAAGTTTGGGCAACATATTTAATAAATTTGAAATGAAAGAGCT

>TRINITY_DN40161_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CGGGTATGTTATCGAGAGGTTCGGAAGTGTGAAATCAGGGCGTGTAGGGCTGAAATATGTTTAGCAGGCAGAGTTAGGGGCAGAGCGACTGTTGTGGGGTGCTGATACAACAAAAAAATGGGCGATACTCAAATGGAAATGGAAAAGGAGGGCCAGAGCATTGAAAAGGCGTTGGCCCGCCTGCACCTTCCACCCCAAGA
GCTTGCAGTAAGAGACACTGAAAGCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAATGGAGGACGATCCAATAATAATATTAGGTTTCGTACAGAAGCCTGAAAGTCCTCATTCACTTGCTCGGCATTTCTTCCCTGATAAAGCTGGAGGCACACCGGCATGGCTGGATCCAATTAACATACCCAATGTGCCGCACTCGTGCTGTG
GCATCTGTGGAAATCCATTGCAATTTTTGATACAGGTTTATGCACCGATCAAAGAGAAAGATGACGCATTTCATAGAACGTTATTTGTCTTCATGTGCCCTTCAATGGCATGTCTCCAACAAGATCAGATTGAACAGAGAAAGCTTCCCATGGAGAAGTCATGTAGAAGTGTGAAGGTATTTCGTTGCCAGCTTGCTCGG
AAAAATCCTTTCTACCCAGATGATAGTTCAAAGCATGATGGACATGATGCACCATCCTCTAGTGGTGTTGCTCTTTGTAGTTGGTGTGGGACATGGAGAGGGGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGCCAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGAT
TCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGATTACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGACGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAA
TTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTTTCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGGTACTGTAGGTCTAAGAATGCAAAAATCTTGTGGCCAGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCCC
AAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTGATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTATTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAATTCCCTGGGTTATGTAGAGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCAC
ATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATAGTgtaagtaacaccaaagtagtgctttactccgtcgtggaagattttttgttgccgttttcttcctttgtataagttctttattaggactttgaatgtgtaacatgattgtcttgtaacatgatatatattggataagttgtagtatgctgttaac
ttcagaaaaccacaaatctgaccttgttcttgtataattcagATGCCTTGCAGTTGGTCTATTAGAGAACTTGTAACCTCCTAGAGGAGCTGCTTCTGCTGGTGTGATTAGCCTTTGGGAAGAGT

Intron 3 GTATGTTTGG ... GAGGAACCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	33.33	3	2	1
A2	53.85	3	4	3
A3	40	9	4	8
A4	11.11	4	0	1
A5	42.86	2	2	1
A6	30	7	3	3
A7	15.79	8	1	2
A8	20.75	21	4	7
A9	21.21	13	1	6
A10	50	4	2	6

>TRINITY_DN91685_c0_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform

GGACATGGAGAGGTGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGCCAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGATTCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGAT
TACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGACGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAATTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTT
TCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGGTACTGTAGGTCTAAGAATGCAAAAATCTTGTGGCCAGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCCCAAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTG
ATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTGTTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAATTCCCTGGGTTATGTAGAGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCACATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATAGTATGCCTTGCAGTTGGTCTATTAGAGAACTTGTAACCTCCTAG
AGGAGCTGCTTCTGCTGGTGTGATTAGCCTTTGGGAAGAGTAACATGTTTGGGATTGCATCTAAAAATTAGTCATTTTAGGTCTGAGCTCTCTTGTGGTCATTTTGTCGATTCATATGAACTCAAACATGATAATATATGTAAGCATAAGCTGCAATTTTCTAGAAGCTCGACTAAGAGTCTGTGCCGTCACCTTTGCAG
AGTTGCGTTTTTGCGTGAATCCATTTATTGTCTATTTCAGGTTATTATTTGCTCAAAAAATGATCTTATAATTTGCGCTGTTAATTCAGTGATGACATCATCACTGTTTAATTTATTAAAAAGTTTGGGCAACATATTTAATAAATTTGAAATGAAAGAGCTAGGAATGATTCTGACAAATTTGTATAATGTTCAGAAAT
CCTATTGAAGTATGAATTCTG

>TRINITY_DN91685_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGACATGGAGAGGTGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGCCAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGATTCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGAT
TACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGACGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAATTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGgtatgtttggttgtcatttctaattttttcat
taaacactgttattgcacaatttgctcactgtaccactgtatggactgaggaaccagGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTTTCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGGTACTGTAGGTCTAAGAATGCAAAAATCTTGTGGCCAGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCC
CAAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTGATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTGTTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAATTCCCTGGGTTATGTAGAGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCA
CATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATATTGTAAGTAACACCAAAGTAGTGCTTTACTCCGTCGTGGAAGATTTTTTGTTGCCGTTTTCTTCATTTGTATA

Intron 4 GTGAAATTTT ... TCTGAAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	45.45	6	4	6
A2	38.46	4	3	2
A3	28.57	5	4	0
A4	41.18	5	3	4
A5	0	2	0	0
A6	14.29	12	2	2
A7	18.75	13	3	3
A8	28.89	16	11	2
A9	17.24	12	3	2
A10	18.18	9	2	2

>TRINITY_DN40161_c0_g1_i6 from sample A6 / Example spliced isoform

CGGGTATGTTATCGAGAGGTTCGGAAGTGTGAAATCAGGGCGTGTAGGGCTGAAATATGTTTAGCAGGCAGAGTTAGGGGCAGAGCGACTGTTGTGGGGTGCTGATACAACAAAAAAATGGGCGATACTCAAATGGAAATGGAAAAGGAGGGCCAGAGCATTGAAAAGGCGTTGGCCCGCCTGCACCTTCCACCCCAAGA
GCTTGCAGTAAGAGACACTGAAAGCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAATGGAGGACGATCCAATAATAATATTAGGTTTCGTACAGAAGCCTGAAAGTCCTCATTCACTTGCTCGGCATTTCTTCCCTGATAAAGCTGGAGGCACACCGGCATGGCTGGATCCAATTAACATACCCAATGTGCCGCACTCGTGCTGTG
GCATCTGTGGAAATCCATTGCAATTTTTGATACAGGTTTATGCACCGATCAAAGAGAAAGATGACGCATTTCATAGAACGTTATTTGTCTTCATGTGCCCTTCAATGGCATGTCTCCAACAAGATCAGATTGAACAGAGAAAGCTTCCCATGGAGAAGTCATGTAGAAGTGTGAAGGTATTTCGTTGCCAGCTTGCTCGG
AAAAATCCTTTCTACCCAGATGATAGTTCAAAGCATGATGGACATGATGCACCATCCTCTAGTGGTGTTGCTCTTTGTAGTTGGTGTGGGACATGGAGAGGGGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGCCAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGAT
TCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGATTACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGACGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAA
TTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTTTCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGGTACTGTAGGTCTAAGAATGCAAAAATCTTGTGGCCAGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCCC
AAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTGATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTATTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAATTCCCTGGGTTATGTAGAGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCAC
ATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATATTATGCCTTGCAGTTGGTCTATTAGAGAACTTGTAACCTCCTAGAGGAGCTGCTTCTGCTGGTGTGATTAGCCTTTGGGAAGAGTGGCATGTTTGGGATTGCATCTAAAAATTAGTCATTTTAGGTCTGAGCTCTCTTGTGGTCATTTTGTCGATT
CATATGAACTCAAACATGATAATATATGTAAGCATAAGCTGCAATTTTCTAGAAGCTCGACTAAGAGTCTGTGCCGTCACCTTTGCAGAGTTGCGTTTTTGCGTGAATCCATTTATTGTCTATTTCAGGTTATTATTTGCTCAAAAAATGATCTTATAATTTACACTGTTAATTCAGTGATGACATCATCACTGTTTAAT
TTATTAAAAAGTTTGGGCAACATATTTAATAAATTTGAAATGAAAGAGCT

>TRINITY_DN40161_c0_g1_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CGGGTATGTTATCGAGAGGTTCGGAAGTGTGAAATCAGGGCGTGTAGGGCTGAAATATGTTTAGCAGGCAGAGTTAGGGGCAGAGCGACTGTTGTGGGGTGCTGATACAACAAAAAAATGGGCGATACTCAAATGGAAATGGAAAAGGAGGGCCAGAGCATTGAAAAGGCGTTGGCCCGCCTGCACCTTCCACCCCAAGA
GCTTGCAGTAAGAGACACTGAAAGCGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAAATGGAGGACGATCCAATAATAATATTAGGTTTCGTACAGAAGCCTGAAAGTCCTCATTCACTTGCTCGGCATTTCTTCCCTGATAAAGCTGGAGGCACACCGGCATGGCTGGATCCAATTAACATACCCAATGTGCCGCACTCGTGCTGTG
GCATCTGTGGAAATCCATTGCAATTTTTGATACAGGTTTATGCACCGATCAAAGAGAAAGATGACGCATTTCATAGAACGTTATTTGTCTTCATGTGCCCTTCAATGGCATGTCTCCAACAAGATCAGATTGAACAGAGAAAGCTTCCCATGGAGAAGTCATGTAGAAGTGTGAAGGTATTTCGTTGCCAGCTTGCTCGG
AAAAATCCTTTCTACCCAGATGATAGTTCAAAGCATGATGGACATGATGCACCATCCTCTAGTGGTGTTGCTCTTTGTAGTTGGTGTGGGACATGGAGAGGGGGGAAGATTTGTAGTGGTTGCAAGATTGCACGGTATTGTTCTCGCCAACATCAGGTTGACCATTGGCGAACAGGCCATGCAGCAGATTGTCGTCAGAT
TCAATCAATGTCAACATCTGTTGCAGCTGTCAATGGTCCTACTGGAAATTGCAACTCACTTGTCAATGGACATGGCTCCCAAAATGATTACCTGGTAAAAGCAGCAAGCACTCGTTTATGGCCCGAGCTAGAGATAATAGATGTAGACGAGGATAATATGGATTCTGAAGGGCTTGATGAGCAAGTCCCAGAAAATGCAA
TTGCTGCTAATCAGAAAAAGGATGAAGAATTTATTAGACAGTTCAAGGGTATGGAGGCATCCAGAGATCAAAAACATTGGGCATCCTTTCAAGCATGCATTTCAAGATATCCAGACCAAGTTCTCAGgtgaaattttttgagctacaattgcttctcaaagaagtgccccctttgcttggatcattggattatcttttta
tgtattgaactttactttgttgtcagctccttttttatatcatttctttcaaaaattgcaatactaataattttataatagatactatcttactaacactgctttgcctcagcattctaaaaataagagtgtatatgattagtgttgcctcaattttattcaggagaaatctgatggaggtcttaaggtccacgttctcc
ttattaataagtctttgactttggaagtactgctcatgtattttacacctctgttatgtgtttttttagacagtgacctgtttcataattgtaattatgtcatcacaattgtgagctgcaaattgtaatataatgttccttgctataacatgtttctgaaacagGTACTGTAGGTCTAAGAATGCAAAAATCTTGTGGCC
AGGATTAGAAGGGCAGCCACGGATCACTGACATTCCCAAATGTACCATGTGTGACGGATCTCGATACTTTGAGTTCCAGATTTTACCTCAATTACTTTACTTCTTCAAAGTACAAAATGATAGTGATTCATTGGACTGGGGCACGATAGTTATTTACACATGCCCCGCTTCGTGTGGAATGAATTCCCTGGGTTATGTAG
AGGAGTTTGCTTGGGTTCAGTTGGCTTCTTGATGCACATGATGAGATGTTTTGTAAATTAATCTCCAAACCTCACGGAATAGTATGCCTTGCAGTTGGTCTATTAGAGAACTTGTAACCTCCTAGAGGAGCTGCTTCTGCTGGTGTGATTAGCCTTTGGGAAGAGTAACATGTTTGGGATTGCATCTAAAAATTAGTCAT
TTTAGGTCTGAGCTCTCTTGTGGTCATTTTGTCGATTCATATGAACTCAAACATGATAATATATGTAAGCATAAGCTGCAATTTTCTAGAAGCTCGACTAAGAGTCTGTGCCGTCACCTTTGCAGAGTTGCGTTTTTGCGTGAATCCATTTATTGTCTATTTCAGGTTATTATTTGCTCAAAAAATGATCTTATAATTTG
CGCTGTTAATTCAGTGATGACATCATCACTGTTTAATTTATTAAAAAGTTTGGGCAACATATTTAATAAATTTGAAATGAAAGAGCT