sp|O24606|EIN3_ARATH ----> Protein ETHYLENE INSENSITIVE 3
Intron 1 GTAAGTGTTT ... TGTAATGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 26.09 | 51 | 1 | 18 |
| A2 | 27.42 | 45 | 0 | 17 |
| A3 | 22.57 | 58.3 | 0 | 17 |
| A4 | 19.57 | 37 | 3 | 9 |
| A5 | 22.22 | 14 | 0 | 4 |
| A6 | 33.33 | 4 | 0 | 2 |
| A7 | 10 | 36 | 0 | 4 |
| A8 | 0 | 12.7 | 0 | 0 |
| A9 | 12.82 | 34 | 0 | 5 |
| A10 | 15.79 | 48 | 0 | 9 |
>TRINITY_DN104966_c0_g2_i6 from sample A4 / Example spliced isoformTGCTTTTCCATGGGTTACTAATTGGTCTCTCTTGATTTCCTTATTGCGAGCAGCCTCAAAGGGCATTGGGTTGCTTGACCCTGCTTTCATATCATGCATGGTTGGGCTTAAAGGACAGCGATCAAATCTGTTGAACTCCATTCAAGCATCAGCAGCAGATCATGTTCTGCTGTAGGGGTACGAGCAATTATTGTTTCAGA
GGTGCTCCAGATTATCAATCAATCAATGGGGCTCTTTAATTCCTATGTTTTGGTTAGGGAAACACATCCGTGGCTGCACCCGATAACAGGAACTTCCTTCAGCTTAAGTGCTAGGTCTGAGGAATAAATATTCCACCAGCGTTGTATGGGACTTAATCCATTCTCGTACATTTTTTAGACATGTCATTTGGGTGGGGTAG
ACCATGGCGAGAATGGAACCCTGGTAAATGGGTTTATACTCTGTCGACCTCAGGGCTCTGTTGGCTATTCTAGGATCTTTGCTATGGATTTGCCAGCTCGTTTGTTCTTTTGATTGTTAATAGTTGCTGGAGGGAGTCATAAAAACCTAGACCTTTTGTAAGTCAGGGAAATGGAACAGCCAGTGGTTACTGATAATGAG
GCTGGGGAGAATTCAGATACTGATGTTGGGGATGTTGGAGAGGGGATGGCGGAAGAGGGGATGGCTGAAGAGGATGTTAGTGATGAAGAAATTGAACTCAATGAATTGGAGAAACGCATGTGGAAAGATAGGATCAAATATAGACGACTTAAAGAGCAAGAGATGAACATAGCTGAGAAGAGCAATAATGAAAAGCGAAA
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GATGACTGCCAAAGAGAGTGCAACTTGGTTGGGAGTTTTGAATCAAGAGGAAGCTTGCATAAGGCAGTTGAATCAAAGCCATGGAGCATCAAACGGCTCTTCTATCTCAGGAAGTGCTAATGATGCAGGGTGTATGACAACAAGCAGTGGCAATGAGTATGACATTGAAGATTACAATTATTCTCCAAGTTCGGATTCTA
CTAAAGATGATGCCCAAAATGAACAGACAGAAGTTAATCCTCGTGAGCGCAACATGAACATAAGAGGAGGTCCTACAGCTTCTGAAAGAAATAGTTTAAATAATAAAACCACAGAAAATTCAGCGGTGGCTGCTCGAGGTGGGGGGTTGGTATCAAATTCCAAGAGAAAAAGGTCTCATAGCAACAGTTCAAGACAAGAG
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TCCAAGATGGTGCAAGCCCGGTGTTTGGGCCTCCCTTAGTAATGAACAGCAGTTCAACTGAGCTCTGCGGAGATGTAACTAATTGGCAAAAGGATGGTTTCAACAGTGTCACTGGCAAGTTTGTTGGAAATCACTTCGAGCCTCAGTCTGATGGCCTGCCAGTGGATTATAGATTTAGCAGTTTTGATTTTGGAATTGAT
GGTGCTGTTTCATTGGATGCAGACCTAGATTTCTCCTTGGATGAGGACTTTATTCAATATTTTGGAGCTTAAAGTAACCTCTTAAACTGGAATGAAGGTTTATGGTACAGATTGGCATGTCACAAAGATGGCTTAAACGCCCTTTCAAAAGCTCTGGTAACACTTTAACTCCCTTTCAGAAGCTCTGGTAACACTTTAAC
TCCCTTTCAGAAGCTCTGGTAACATTTATGCTTTGTTAATGCTCAGGCAAACATATTCTTTACCAGATAAAAGCATTTTTCTTGTCTCTAAGGAAACATTTCTGAGAAAGAAAGCAAGATCAAATGAGTGAAGTGCCACATATGGGTTGTGATTATGACATGCCACGTAAAGCAAGTTGTCAGGATGAAGAGCTGTGCAA
GGTGTTGTAGTAATAAAAGAACATATGGTTGTCAACATCCTAGGTTGGTTTTGTACCTGTCCTGATTACTGCCTCCAAAACTTCTCACTGCTATTAATAAAACTAATGATAAACAAATTCATAGAGAACTGATGAATCTACATACATGGAATCACATCATTTCTCTAGTTCAAGGATGTGCATTTTTTTTTGTTTTGTAC
AAGATCATGACTTTGTAAATGTTATCAGGAGGACATTTCATTGTTTCAACTATTATGTATCTGTGATCCGTGGAGGGCCATAATACCTTAACTTGCTAAATCATTCTCGTTGAGTTCATATAATGATTCTTTTATTTTTGACAAATAGCCAGACAAATTGATCTGCAACTCCGGCGAGTTTATACTTGGATCG
>TRINITY_DN104966_c0_g2_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:GGGTACGAGCAATTATTGTTTCAGAGGTGCTCCAGATTATCAATCAATCAATGGGGCTCTTTAATTCCTATGTTgtaagtgttttggaggttttaggttgatccgccttttggattttctgatttgttttgattcaatccaataagagcagttgggttgtgccgttgccctatattctaggattttatttattaattttt
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TTGGGGATGTTGGAGAGGGGATGGCGGAAGAGGGGATGGCTGAAGAGGATGTTAGTGATGAAGAAATTGAACTCAATGAATTGGAGAAACGCATGTGGAAAGATAGGATCAAATATAGACGACTTAAAGAGCAAGAGATGAACATAGCTGAGAAGAGCAATAATGAAAAGCGAAAGTACAAACAGTCATTGGAGCAAGCT
AGAAGGAAGAAGATGGCACGAGCTCAAGATGGCATTTTAAAATACATGTTAAAGATTATGGAAGTTTGTAAAGCACAAGCTTTTGTATATGGTATAATACCTGAGAAAGGGAAGCCTGTAAGCGGTGCTTCAGACAACATAAGAGCGTGGTGGAAAGAAAAGGTGAAGTTTGACAAGAATGGTCCAGCAGCAATTGCAAA
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ATTGGTGGCCTCAATTGGGTTTGCAGAAAGGTCAAGGCTCTCCCCCTTACAAAAAGCCCCATGATTTAAAAAAGGTTTGGAAAGTTGGGGTTCTCACATCTGTGATCAAGCACATGTCTCCTGATATCTCAAAGGTTAGGAAACTCATCAGACAGTCAAAGTGCTTGCAGGATAAGATGACTGCCAAAGAGAGTGCAACT
TGGTTGGGAGTTTTGAATCAAGAGGAAGCTTGCATAAGGCAGTTGAATCAAAGCCATGGAGCATCAAACGGCTCTTCTATCTCAGGAAGTGCTAATGATGCAGGGTGTATGACAACAAGCAGTGGCAATGAGTATGACATTGAAGATTACAATTATTCTCCAAGTTCGGATTCTACTAAAGATGATGCCCAAAATGAACA
GACAGAAGTTAATCCTCGTGAGCGCAACATGAACATAAGAGGAGGTCCTACAGCTTCTGAAAGAAATAGTTTAAATAATAAAACCACAGAAAATTCAGCGGTGGCTGCTCGAGGTGGGGGGTTGGTATCAAATTCCAAGAGAAAAAGGTCTCATAGCAACAGTTCAAGACAAGAGCAGCGTCCATTTCTGTGCCCCTATG
GAGGTTGCCAGCATCAGGATCAAAGAAATGGGTTCCTTGATATCAGTCAGAGGAATTCGCATGCAAATAAATGCCCTTACAAGTCTGGAGCAGAGGGATACATGGATGCAGGTACTGGGGTGAATCAAGAAGAATTGTTAATAGAGCCTTTGTCTCAATACAGCCCCGGGTTTCCTTCTGTCTGTGCAATCTCTAACCAT
ATGTATACTGAAGGTGATCGGCAAGAATTGTTTACAGGTTTCCATAAGACTGGTGTACAATCTGAAAGCCATCCAGGTTTAAGTAGATTCAGTGAATCAGATCAAAGTTCTCGTACTAGACAGAAGCTGCAACCAAGTAATGATGGGAATCAAGTTGGGCGAGCAATGGTAGGAATCCAAGATGGTGCAAGCCCGGTGTT
TGGGCCTCCCTTAGTAATGAACAGCAGTTCAACTGAGCTCTGCGGAGATGTAACTAATTGGCAAAAGGATGGTTTCAACAGTGTCACTGGCAAGTTTGTTGGAAATCACTTCGAGCCTCAGTCTGATGGCCTGCCAGTGGATTATAGATTTAGCAGTTTTGATTTTGGAATTGATGGTGCTGTTTCATTGGATGCAGACC
TAGATTTCTCCTTGGATGAGGACTTTATTCAATATTTTGGAGCTTAAAGTAACCTCTTAAACTGGAATGAAGGTTTATGGTACAGATTGGCATGTCACAAAGATGGCTTAAACGCCCTTTCAAAAGCTCTGGTAACACTTTAACTC