sp|Q0WRJ7|FK202_ARATH ----> Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP20-2, chloroplastic
Intron 1 GTGATTATCC ... CAACAGATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 56.52 | 5 | 8 | 5 |
| A2 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A3 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
| A4 | 55.56 | 2 | 3 | 2 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 52.73 | 13 | 12 | 17 |
| A7 | 54.29 | 8 | 8 | 11 |
| A8 | 50 | 4 | 4 | 4 |
| A9 | 64.1 | 7 | 12 | 13 |
| A10 | 53.85 | 9 | 12 | 9 |
>TRINITY_DN33574_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformTTTAAATTTGGACTGGCGTTCAGTTGAATAAAATTCATCCACCCATGCAGTACTAGTAGTCGGTAATAGCAGGAGGATAAGGTAGGGGCAACGTCAGCTTCTTCGCCATGGCAATAACAATGGCAAGCCCTGCTTCTTCAATACTCACATTATTTCGTCCTCCAGGGTTTTTGCCACATTCACTCTACTCTGGTTCTCAC
ACTTATCATTGTCCGTGCATATCTTGCAAACAGTTGTTGCAAGCTGCAACATGTTCAGTCAACCATTTTTTGAGTATTTATAAGGAGTGTGGATTTAGATTGACTTGTTGTCTAGGAGAGTTCCAGCTTCACAGAGGAGACAAACATGACAAATGGTGTAGGCTCAAACAATATAAACATTATAGGGATGATTCTATGTA
CCTTGCTTCTACTTTATATTGTCGAGCAGAAAAATGGCAGCAACATGAGGTGGAAGGACATCTTAGCAGTTGCTCCTCAAGCAATTACACAAATGTCGGCGAGGATGAACCATCGATGAGATTAATAGATCAATATTGTTCTGCATTGGTAGGGCGAAGGTGTTTCTTTTCATTAGCTTCAGTCTGCTTAGAAACACTGC
TGACAGCATCTGGACCATCTGCATCGGCTGTCACTACAAGGGAACGAAAGTTGAGTTCTTATGATGAACAGCGCCTTCTTGAACAAAATAAGCGTATTCAAAATGCAAATGGCGTCCCTACAGACTTTCCAAATTTTATCAGAGAAGGCTTTAATGTGAAGGTGGTGACACCTGACAACTATGTTAGGTGTGATTCGGGG
CTTATCTATTGGGACATAAAAGACGGCGAAGTTTTTCACTACACGGGATTTAACGAGTCAGGTCGTCGCATTGATAGCAGTTATCAGCAAGGGAGACCAGCTAAGACTCGTATGGGCATTAATGGGTTGGTTCCAGGCATTGAAGAAGGAATTCAGACTATGAAACCAGGTGGAAAGCGAAGAATAATTGTTCCGCCAGA
ACTTGGTCCTCCTGTAGGACCTTCCACCTTTTTCAGTGCAAAGCAGTTTGAAGTTTTTGATGTGGAGCTCTTGAGCGTGCAAGATTGCAAACGAAGAACTTTTGGATTTTACTCAGACTTTGTATGTGATTGAGTCTGTAAGGTGCCTGTTTGGTCCAGTTTACTAGCTTTTCTCATTTGTGCATATTACTCTTTTTTTC
AAGTTATGGGCTATCAATTATTTGTGGCTTGTGATCTTATTGGGACGTCTCAAGGTTCACACGAGAATTTTTGTAGCTGTATTTGGTCTGATTGGTCCACGAAGACATCATTTACACTGTTGGCCCTTGAGATGTAAAAGATAATTTGTTGCTTTCTTTGGAGAGAAATATTAGCTTCACAACTCAGATGGTATGGGAGC
TTCAACTGGTGCAATTTTCAATATTTAATATATATTAGCTTCTCAGCTCAGATGGCATGGGAGCTTTCAACTGCTGCAATTTGCAATATTTAATTTGTATTGTTAGGCGCCATGATTGATTTGTCGTAAAATTTTATATACATAATTTTCC
>TRINITY_DN33574_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:TTTAAATTTGGACTGGCGTTCAGTTGAATAAAATTCATCCACCCATGCAGTACTAGTAGTCGGTAATAGCAGGAGGATAAGGTAGGGGCAACGTCAGCTTCTTCGCCATGGCAATAACAATGGCAAGCCCTGCTTCTTCAATACTCACATTATTTCGTCCTCCAGGGTTTTTGCCACATTCACTCTACTCTGGTTCTCAC
ACTTATCATTGTCCGTGCATATCTTGCAAACAGTTGTTGCAAGCTGCAACATGTTCAGTCAACCATTTTTTGAGTATTTATAAGGAGTGTGGATTTAGATTGACTTGTTGTCTAGGAGAGTTCCAGCTTCACAGAGGAGACAAACATGACAAATGGTGTAGGCTCAAACAATATAAACATTATAGGGATGATTCTATGTA
CCTTGCTTCTACTTTATATTGTCGAGCAGAAAAATGGCAGCAACATGAGGTGGAAGGACATCTTAGCAGTTGCTCCTCAAGCAATTACACAAATGTCGGCGAGGATGAACCATCGATGAGATTAATAGATCAATATTGTTCTGCATTGGTAGGGCGAAGGTGTTTCTTTTCATTAGCTTCAGTCTGCTTAGAAACACTGC
TGACAGCATCTGGACCATCTGCATCGGCTGTCACTACAAGGGAACGAAAGTTGAGTTCTTATGATGAACAGCGCCTTCTTGAACAAAATAAGCGTATTCAAAATGCAAATGGCGTCCCTACAGACTTTCCAAATTTTATCAGAGAAGGCTTTAATGTGAAGGTGGTGACACCTGACAACTATGTTAGGTGTGATTCGGGG
CTTATCTATTGGGACATAAAAGACGGCGAAGgtgattatcccaagtctggtcaacagatagTTTTTCACTACACGGGATTTAACGAGTCAGGTCGTCGCATTGATAGCAGTTATCAGCAAGGGAGACCAGCTAAGACTCGTATGGGCATTAATGGGTTGGTTCCAGGCATTGAAGAAGGAATTCAGACTATGAAACCAGG
TGGAAAGCGAAGAATAATTGTTCCGCCAGAACTTGGTCCTCCTGTAGGACCTTCCACCTTTTTCAGTGCAAAGCAGTTTGAAGTTTTTGATGTGGAGCTCTTGAGCGTGCAAGATTGCAAACGAAGAACTTTTGGATTTTACTCAGACTTTGTATGTGATTGAGTCTGTAAGGTGCCTGTTTGGTCCAGTTTACTAGCTT
TTCTCATTTGTGCATATTACTCTTTTTTTCAAGTTATGGGCTATCAATTATTTGTGGCTTGTGATCTTATTGGGACGTCTCAAGGTTCACACGAGAATTTTTGTAGCTGTATTTGGTCTGATTGGTCCACGAAGACATCATTTACACTGTTGGCCCTTGAGATGTAAAAGATAATTTGTTGCTTTCTTTGGAGAGAAATA
TTAGCTTCACAACTCAGATGGTATGGGAGCTTCAACTGGTGCAATTTTCAATATTTAATATATATTAGCTTCTCAGCTCAGATGGCATGGGAGCTTTCAACTGCTGCAATTTGCAATATTTAATTTGTATTGTTAGGCGCCATGATTGATTTGTCGTAAAATTTTATATACATAATTTTCC
Intron 2 GCTTTAATGT ... ACTATGTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 7 | 8 |
| A2 | 33.33 | 1 | 1 | 0 |
| A3 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A4 | 100 | 0 | 5 | 5 |
| A5 | 81.82 | 1 | 5 | 4 |
| A6 | 75 | 6 | 20 | 16 |
| A7 | 71.43 | 3 | 9 | 6 |
| A8 | 91.67 | 1 | 11 | 11 |
| A9 | 76 | 3 | 8 | 11 |
| A10 | 85.71 | 2 | 11 | 13 |
>TRINITY_DN36993_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoformAGCTAGTCTATTTCCTGTGCGTTTAGTTTAAATTTGGACTGGCGTTCAGTTGAATAAAATTCATCCACCCATGCAGTACTAGTAGTCGGTAATAGCAGGAGGATAAGGTAGGGGCAACGTCAGCTTCTTCGCCATGGCAATAACAATGGCAAGCCCTGCTTCTTCAATACTCACATTATTTCGTCCTCCAGGGTTTTTGC
CACATTCACTCTACTCTGGTTCTCACACTTATCATTGTCCGTGCATATCTTGCAAACAGTTGTTGCAAGCTGCAACATGTTCAGTCAACCATTTTTTGAGTATTTATAAGGAGTGTGGATTTAGATTGACTTGTTGTCTAGGAGAGTTCCAGCTTCACAGAGGAGACAAACATGACAAATGGTGTAGGCTCAAACAATAT
AAACATTATAGGGATGATTCTATGTACCTTGCTTCTACTTTATATTGTCGAGCAGAAAAATGGCAGCAACATGAGGTGGAAGGACATCTTAGCAGTTGCTCCTCAAGCAATTACACAAATGTCGGCGAGGATGAACCATCGATGAGATTAATAGATCAATATTGTTCTGCATTGGTAGGGCGAAGGTGTTTCTTTTCATT
AGCTTCAGTCTGCTTAGAAACACTGCTGACAGCATCTGGACCATCTGCATCGGCTGTCACTACAAGGGAACGAAAGTTGAGTTCTTATGATGAACAGCGCCTTCTTGAACAAAATAAGCGTATTCAAAATGCAAATGGCGTCCCTACAGACTTTCCAAATTTTATCAGAGAAGGTGTGATTCGGGGCTTATCTATTGGGA
CATAAAAGACGGCGAAGGTGATTATCCCAAGTCTGGTCAACAGATAGTTTTTCACTACACGGGATTTAACGAGTCAGGTCGTCGCATTGATAGCAGTTATCAGCAAGGGAGACCAGCTAAGACTCGTATGGGCATTAATGGGTTGGTTCCAGGCATTGAAGAAGGAATTCAGACTATGAAACCAGGTGGAAAGCGAAGAA
TAATTGTTCCGCCAGAACTTGGTCCTCCTGTAGGACCTTCCACCTTTTTCAGTGCAAAGCAGTTTGAAGTTTTTGATGTGGAGCTCTTGAGCGTGCAAGATTGCAAACGAAGAACTTTTGGATTTTACTCAGACTTTGTATGTGATTGAGTCTGTAAGGTGCCTGTTTGGTCCAGTTTACTAGCTTTTCTCATTTGTGCA
TATTACTCTTTTTTTCAAGTTATGGGCTATCAATTATTTGTGGCTTGTGATCTTATTGGGACGTCTCAAGGTTCACACGAGAATTTTTGTAGCTGTATTTGGTCTGATTGGTCCACGAAGACATCATTTACACTGTTGGCCCTTGAGATGTAAAAGATAATTTGTTGCTTTCTTTGGAGAGAAATATTAGCTTCACAACT
CAGATGGTATGGGAGCTTCAACTGGTGCAATTTTCAATATTTAATATATATTAGCTTCTCAGCTCAGATGGCATGGGAGCTTTCAACTGCTGCAATTTGCAATATTTAATTTGTATTGTTAGGCGCCATGATTGATTTGTCGTAAAATTTTATATACATAATTTTCCATAATTTGTTCATGTACAATCCTCAAGTACAGG
AATAGTACAATGCAAATGAACATAAAATACGAACATGGATTTTCATCCGTACAGTTATGGTTGAACTATTTTGGTAAGTTTATGTCAAAATTTTCAAATCGGAGTGTGATTGAAGCTTGTTCCAATCTATAAAATTCAATATTTATTATGGTGTGA
>TRINITY_DN36993_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:AGCTAGTCTATTTCCTGTGCGTTTAGTTTAAATTTGGACTGGCGTTCAGTTGAATAAAATTCATCCACCCATGCAGTACTAGTAGTCGGTAATAGCAGGAGGATAAGGTAGGGGCAACGTCAGCTTCTTCGCCATGGCAATAACAATGGCAAGCCCTGCTTCTTCAATACTCACATTATTTCGTCCTCCAGGGTTTTTGC
CACATTCACTCTACTCTGGTTCTCACACTTATCATTGTCCGTGCATATCTTGCAAACAGTTGTTGCAAGCTGCAACATGTTCAGTCAACCATTTTTTGAGTATTTATAAGGAGTGTGGATTTAGATTGACTTGTTGTCTAGGAGAGTTCCAGCTTCACAGAGGAGACAAACATGACAAATGGTGTAGGCTCAAACAATAT
AAACATTATAGGGATGATTCTATGTACCTTGCTTCTACTTTATATTGTCGAGCAGAAAAATGGCAGCAACATGAGGTGGAAGGACATCTTAGCAGTTGCTCCTCAAGCAATTACACAAATGTCGGCGAGGATGAACCATCGATGAGATTAATAGATCAATATTGTTCTGCATTGGTAGGGCGAAGGTGTTTCTTTTCATT
AGCTTCAGTCTGCTTAGAAACACTGCTGACAGCATCTGGACCATCTGCATCGGCTGTCACTACAAGGGAACGAAAGTTGAGTTCTTATGATGAACAGCGCCTTCTTGAACAAAATAAGCGTATTCAAAATGCAAATGGCGTCCCTACAGACTTTCCAAATTTTATCAGAGAAGgctttaatgtgaaggtggtgacacctg
acaactatgttagGTGTGATTCGGGGCTTATCTATTGGGACATAAAAGACGGCGAAGGTGATTATCCCAAGTCTGGTCAACAGATAGTTTTTCACTACACGGGATTTAACGAGTCAGGTCGTCGCATTGATAGCAGTTATCAGCAAGGGAGACCAGCTAAGACTCGTATGGGCATTAATGGGTTGGTTCCAGGCATTGAA
GAAGGAATTCAGACTATGAAACCAGGTGGAAAGCGAAGAATAATTGTTCCGCCAGAACTTGGTCCTCCTGTAGGACCTTCCACCTTTTTCAGTGCAAAGCAGTTTGAAGTTTTTGATGTGGAGCTCTTGAGCGTGCAAGATTGCAAACGAAGAACTTTTGGATTTTACTCAGACTTTGTATGTGATTGAGTCTGTAAGGT
GCCTGTTTGGTCCAGTTTACTAGCTTTTCTCATTTGTGCATATTACTCTTTTTTTCAAGTTATGGGCTATCAATTATTTGTGGCTTGTGATCTTATTGGGACGTCTCAAGGTTCACACGAGAATTTTTGTAGCTGTATTTGGTCTGATTGGTCCACGAAGACATCATTTACACTGTTGGCCCTTGAGATGTAAAAGATAA
TTTGTTGCTTTCTTTGGAGAGAAATATTAGCTTCACAACTCAGATGGTATGGGAGCTTCAACTGGTGCAATTTTCAATATTTAATATATATTAGCTTCTCAGCTCAGATGGCATGGGAGCTTTCAACTGCTGCAATTTGCAATATTTAATTTGTATTGTTAGGCGCCATGATTGATTTGTCGTAAAATTTTATATACATA
ATTTTCCATAATTTGTTCATGTACAATCCTCAAGTACAGGAATAGTACAATGCAAATGAACATAAAATACGAACATGGATTTTCATCCGTACAGTTATGGTTGAACTATTTTGGTAAGTTTATGTCAAAATTTTCAAATCGGAGTGTGATTGAAGCTTGTTCCAATCTATAAAATTCAATATTTATTATGGTGTGA
Intron 3 GTGATTATCC ... TGGTCAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.23 | 10 | 5.5 | 4 |
| A2 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A3 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
| A4 | 25 | 3 | 1.5 | 1.5 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 31.93 | 22 | 7.5 | 14 |
| A7 | 42.77 | 11 | 7 | 9.5 |
| A8 | 33.76 | 5 | 2.5 | 3 |
| A9 | 46.85 | 13 | 10.5 | 12.5 |
| A10 | 42.99 | 11 | 9 | 8 |
>TRINITY_DN36993_c0_g1_i3 from sample A9 / Example spliced isoformAGCTAGTCTATTTCCTGTGCGTTTAGTTTAAATTTGGACTGGCGTTCAGTTGAATAAAATTCATCCACCCATGCAGTACTAGTAGTCGGTAATAGCAGGAGGATAAGGTAGGGGCAACGTCAGCTTCTTCGCCATGGCAATAACAATGGCAAGCCCTGCTTCTTCAATACTCACATTATTTCGTCCTCCAGGGTTTTTGC
CACATTCACTCTACTCTGGTTCTCACACTTATCATTGTCCGTGCATATCTTGCAAACAGTTGTTGCAAGCTGCAACATGTTCAGTCAACCATTTTTTGAGTATTTATAAGGAGTGTGGATTTAGATTGACTTGTTGTCTAGGAGAGTTCCAGCTTCACAGAGGAGACAAACATGACAAATGGTGTAGGCTCAAACAATAT
AAACATTATAGGGATGATTCTATGTACCTTGCTTCTACTTTATATTGTCGAGCAGAAAAATGGCAGCAACATGAGGTGGAAGGACATCTTAGCAGTTGCTCCTCAAGCAATTACACAAATGTCGGCGAGGATGAACCATCGATGAGATTAATAGATCAATATTGTTCTGCATTGGTAGGGCGAAGGTGTTTCTTTTCATT
AGCTTCAGTCTGCTTAGAAACACTGCTGACAGCATCTGGACCATCTGCATCGGCTGTCACTACAAGGGAACGAAAGTTGAGTTCTTATGATGAACAGCGCCTTCTTGAACAAAATAAGCGTATTCAAAATGCAAATGGCGTCCCTACAGACTTTCCAAATTTTATCAGAGAAGGCTTTAATGTGAAGGTGGTGACACCTG
ACAACTATGTTAGGTGTGATTCGGGGCTTATCTATTGGGACATAAAAGACGGCGAAGATAGTTTTTCACTACACGGGATTTAACGAGTCAGGTCGTCGCATTGATAGCAGTTATCAGCAAGGGAGACCAGCTAAGACTCGTATGGGCATTAATGGGTTGGTTCCAGGCATTGAAGAAGGAATTCAGACTATGAAACCAGG
TGGAAAGCGAAGAATAATTGTTCCGCCAGAACTTGGTCCTCCTGTAGGACCTTCCACCTTTTTCAGTGCAAAGCAGTTTGAAGTTTTTGATGTGGAGCTCTTGAGCGTGCAAGATTGCAAACGAAGAACTTTTGGATTTTACTCAGACTTTGTATGTGATTGAGTCTGTAAGGTGCCTGTTTGGTCCAGTTTACTAGCTT
TTCTCATTTGTGCATATTACTCTTTTTTTCAAGTTATGGGCTATCAATTATTTGTGGCTTGTGATCTTATTGGGACGTCTCAAGGTTCACACGAGAATTTTTGTAGCTGTATTTGGTCTGATTGGTCCACGAAGACATCATTTACACTGTTGGCCCTTGAGATGTAAAAGATAATTTGTTGCTTTCTTTGGAGAGAAATA
TTAGCTTCACAACTCAGATGGTATGGGAGCTTCAACTGGTGCAATTTTCAATATTTAATATATATTAGCTTCTCAGCTCAGATGGCATGGGAGCTTTCAACTGCTGCAATTTGCAATATTTAATTTGTATTGTTAGGCGCCATGATTGATTTGTCGTAAAATTTTATATACATAATTTTCCATAATTTGTTCATGTACAA
TCCTCAAGTACAGGAATAGTACAATGCAAATGAACATAAAATACGAACATGGATTTTCATCCGTACAGTTATGGTTGAACTATTTTGGTAAGTTTATGTCAAAATTTTCAAATCGGAGTGTGATTGAAGCTTGTTCCAATCTATAAAATTCAATATTTATTATGGTGTGA
>TRINITY_DN36993_c0_g1_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:AGCTAGTCTATTTCCTGTGCGTTTAGTTTAAATTTGGACTGGCGTTCAGTTGAATAAAATTCATCCACCCATGCAGTACTAGTAGTCGGTAATAGCAGGAGGATAAGGTAGGGGCAACGTCAGCTTCTTCGCCATGGCAATAACAATGGCAAGCCCTGCTTCTTCAATACTCACATTATTTCGTCCTCCAGGGTTTTTGC
CACATTCACTCTACTCTGGTTCTCACACTTATCATTGTCCGTGCATATCTTGCAAACAGTTGTTGCAAGCTGCAACATGTTCAGTCAACCATTTTTTGAGTATTTATAAGGAGTGTGGATTTAGATTGACTTGTTGTCTAGGAGAGTTCCAGCTTCACAGAGGAGACAAACATGACAAATGGTGTAGGCTCAAACAATAT
AAACATTATAGGGATGATTCTATGTACCTTGCTTCTACTTTATATTGTCGAGCAGAAAAATGGCAGCAACATGAGGTGGAAGGACATCTTAGCAGTTGCTCCTCAAGCAATTACACAAATGTCGGCGAGGATGAACCATCGATGAGATTAATAGATCAATATTGTTCTGCATTGGTAGGGCGAAGGTGTTTCTTTTCATT
AGCTTCAGTCTGCTTAGAAACACTGCTGACAGCATCTGGACCATCTGCATCGGCTGTCACTACAAGGGAACGAAAGTTGAGTTCTTATGATGAACAGCGCCTTCTTGAACAAAATAAGCGTATTCAAAATGCAAATGGCGTCCCTACAGACTTTCCAAATTTTATCAGAGAAGGTGTGATTCGGGGCTTATCTATTGGGA
CATAAAAGACGGCGAAGgtgattatcccaagtctggtcaacagATAGTTTTTCACTACACGGGATTTAACGAGTCAGGTCGTCGCATTGATAGCAGTTATCAGCAAGGGAGACCAGCTAAGACTCGTATGGGCATTAATGGGTTGGTTCCAGGCATTGAAGAAGGAATTCAGACTATGAAACCAGGTGGAAAGCGAAGAA
TAATTGTTCCGCCAGAACTTGGTCCTCCTGTAGGACCTTCCACCTTTTTCAGTGCAAAGCAGTTTGAAGTTTTTGATGTGGAGCTCTTGAGCGTGCAAGATTGCAAACGAAGAACTTTTGGATTTTACTCAGACTTTGTATGTGATTGAGTCTGTAAGGTGCCTGTTTGGTCCAGTTTACTAGCTTTTCTCATTTGTGCA
TATTACTCTTTTTTTCAAGTTATGGGCTATCAATTATTTGTGGCTTGTGATCTTATTGGGACGTCTCAAGGTTCACACGAGAATTTTTGTAGCTGTATTTGGTCTGATTGGTCCACGAAGACATCATTTACACTGTTGGCCCTTGAGATGTAAAAGATAATTTGTTGCTTTCTTTGGAGAGAAATATTAGCTTCACAACT
CAGATGGTATGGGAGCTTCAACTGGTGCAATTTTCAATATTTAATATATATTAGCTTCTCAGCTCAGATGGCATGGGAGCTTTCAACTGCTGCAATTTGCAATATTTAATTTGTATTGTTAGGCGCCATGATTGATTTGTCGTAAAATTTTATATACATAATTTTCCATAATTTGTTCATGTACAATCCTCAAGTACAGG
AATAGTACAATGCAAATGAACATAAAATACGAACATGGATTTTCATCCGTACAGTTATGGTTGAACTATTTTGGTAAGTTTATGTCAAAATTTTCAAATCGGAGTGTGATTGAAGCTTGTTCCAATCTATAAAATTCAATATTTATTATGGTGTGA