sp|F4IVL6|GRV2_ARATH ----> DnaJ homolog subfamily C GRV2

Intron 1 GTACCAAACT ... GAATTTTAAG

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A2	9.13	225.9	26	27.1
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A6	6.95	513.4	37	47.9
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A8	7.12	806.6	65	75.7
A9	7.09	593.6	38	55.1
A10	7.93	503.3	27	54.7

>TRINITY_DN113694_c0_g1_i7 from sample A2 / Example spliced isoform

TTGTGTAACTTGTTTGTTGTGAAATTTCTAACTTCAAAGCACATAAATACAGATATGTGCATGTGCACATACACACAAATGTATGCAAATATATACATACACACATGCACACAAATATATGCAGACATACATGCATATAAGTAATCATGCAGGTAGCTTTTGAATCTTGATGAATTATGGAATCTCCATGAAATAACTGA
ATCCATGTAACTGACTTTAAATGTTTGAGCATCCAAGTTTATATGTATTAATTGTTATCTCTGTGTTGATTTTGGGATGTGGATGCTTGTATGTTTTGCAGATTATGAGAGTAACACCTGTAGGAATTGAAATCATGGAATCAAAAACTAGAGACCTACGTTGGTGTTTGGATTTCAGGGACATGGATTCTCCTGGAATC
ATTGTCTTATCTGATGCATATGGAAAGAAAGGTGAAGAGGGTGGGGGGTTTGTTCTTTGTCCCATGTATGGAAGAAAATGCAAAGCTTTTATGGCAGCTTCTGGTGCCTCAAACACAGCAATTATATCAAAACTGACGAAAACTCCAAAATCACTAGTGGGAATAATGGTTTCTTTAGACAACTCTCAGACAATCGGTGC
TTCAGAATTTTTGAAGCAAAGGGCCAAGGTTGCAGTTGGTGCAGAAGAAACTCCATTGGGGGAATGGTCTGTAACAAGGCTACGATCTGCTGCTCATGGAACTGCTAACACTCTGGGATTAACCTTGGGTGTTGGGCCCAAAGGTGGGCTGGGTGAGAGGGGTGATGCTGTATCTAGGCAACTTATACTGACGAAAATGT
CACTAGTTGAACGCCGACCAGACAATTATGAGGCAGTCATTGTTCGCCCATTGTCTGCTGTGGGTGCCCTTGTTCGCTTTGCTGAGGAGCCACAAATGTTTGCTATTGAATTCAATGATGGATGTCCAATTCACGTCTATGCAAGTACTTCCCGTGACAACTTGCTTGCAGCAGTTCGAGATGTTCTGCAAACAGAAAGA
CAGTGCCCCATTCCCATTTTGCCAAGATTGACTATGCCTGGCCATTGTCTTAATCCTCCCTGTGGAAGAATTTCTCCACAACCTCAACAAGTTGCAAGTGCAGCACAGCGTCTTTTTGCAGATGTCGAAGGTGAGGCTATGCATCTAAAACATCTGGCAGCTGCAGCCAAAGATGCTGTAGCTGAAGGCGGATCTATTCC
TGGTTCAAGAGCGAAGCTATGGCGCAGAGTCAGAGAATTTAATGCTTGCATTCCTTATAGTGGAGTCCTGCCTAATACAGAAGTCCCAGAGGTGGCATTAATGGCCTTGATGACAATGCTTCCAGCCCCCCCAAACTTACCTCCAGAATTACCACCACCACCACCTCCCTCTCCCAAAGCATCTGCAACTCTTATGGGTT
TTATTGCATGCCTACGTCGCTTGCTGACATCAGTTAGTGCAGCTTCAGCTGTTCTGTCAATTCCTGCTGCTGTAATCAGAATAATGGGTTTGCTGAGAAGTGGTTCAGAAGGAGTAGCTGCAGAAGCAGCTGGGCTGGTGGCCATGCTTATCGGAGGTGGTCCTGGAGAAACGAATTTGCAACTGGATTCCAAGGGTGAG
CATCATGCTACTTCCATGCACACAAAATCAGTGCTATTTGGCCATCAAAATTATGTAACTATCCTTGTCAACAGACTCAAGCCAGTGTCAGTATCACCTTTGCTATCAATGGCAGTGGTGGAAGTTCTTGAGGCAATGCTATGTGAACCTTTGGGTGAGACAACACAGCTTGCTACTTTTGTCGAAATGTTGCGTCAAGT
AGCTGGCTTGCGGCGGCGATTGTTTGCCTTGTTTGGGCATCCTGCAGAAAGTGTAAGAGAAACTGTGGCAGTGATCATGCGAACAATTGCAGAGGAGGATGCTATTGCGGCTGAGTCAATGCGTGATGCTGCATTACGTGATGGTGCTTTACTGCGACATCTGGTACATGCATTTTTTCTTCCTGTTGGTGAGCGTCGTG
AAGTTAGTCGGCAGCTTGTAGCTTTGTGGGCAGATTCCTATCAGCCTGCTTTGGATCTACTGTCACGAATGCTTCCTCCGGGGCTTGTTGCATATTTACATACACGTCCAGCTGAGGATGATAATGATGATGGGCAGGTACAACTTAACCAGGCAGTAACTTCTTCTAAACGTAGGCAGAGGCGTATTCTTCAGCGTAGA
AAAGGTCGCATTGCAAGGGTGAAAGGTGCTAGTGAATACAATCCAGCTTCTAACAAGGTAGAAGATGTATCACGGGCTGTAGATGGCTTCCTGCACTCAAATGGAAACTCACATTTGGGACAGGGTTCAACCTATTCTGCTGGAATATCTGGTGTGCCTATAGTCAATGCAGTTTCTAATGCAGGAAATACAGGTTGTGA
TGATGCTCTAGCCTCTGCACCTTTCAGAGGGTCTTCTTTTCCTGTATCATCACAGTTGGGGAATTCGGTTACTTCAGACTCAGTTGAATATGATGCCAATGCAGGGATTTCTTCACAATCGACTTTTCCTGCACCAGCACAAGTGGTTGTAGAAAATACACCTGTAGGCTCTGGCAGACTTCTTTGTAACTGGCCTGAAT
TTTGGAGGGAATTTAGTCTTGATCACAACCGTGCAGATCTGATATGGAATGAGCAGACGAGACAGGAGCTTAGGGAGGCTCTTCAGGCAGAAGTTCATAATTTAGATGTTGAGAAAGCACGCACTGAGGATGTTCTTGGTCTTGGAGGTCACACAGATGAGGAGAGCATGGGCCAGGAGACTGCAATTCAATTATCTTGG
AATTATACGGAATTTTCTGTTCGATATCCTAGTTTGTCAAAAGAAGTATGTGTTGGACAGTATTACCTACGTCTTTTGCTTGATAGCGGAGCTGGAGGCAGTGCTCAGGATTTTCCTCTCAGAGATCCAGTTGCTTTCTTCAGAGCACTATATCACAGGTTTCTCTGTGATGCAGACGTAGGACTTACTGTTGAAGGTGC
AGCTCCGGATGTGTTAGGTGCATCGGATGACTGGTGTGATATGGGAAGGTTGGATGGTTTTGGTGGGGGTGGAGGTTCATCTGTTAGGGAACTTTGTGCAAGGGCAATGACAATTGTTTATGAGCAGCATTATCAAGCAATAGGTCCTTTTGATGGCACTGCACATATTACTGTGTTACTTGATAGAACAAATGACAGAG
CACTTAGACACCGTCTGTTGTTACTCTTGAAGGTACTGATGAAAGTTCCAGCAAATGTGGAGGCATGTGTCTCAGTTGGAGGTTGTGCATTAGCTGTAGATCTTCTCACAACAAGTCACGAGGCATCTGAGAGGACATCAATTCCTTTGCAATCCAATTTAATTGCTGCCACTGCATTTATGGAGCCACCCAAGGAATGG
TTATTTGTTAACAAGGATGGTGTGCAGGTTGGACCAGTTGAGAAGGATGGGGTAAGAAGAGCTTGGTCGAAACAAGAGATTGACTTGAACTCCAGGTGTTGGGCTTCAGGGATGACAGAATGGAAAAGAATGCGTGACGTTCGTGAGTTGCGATGGGCCATGGCATCTCGTATTGCTGTCCTTACTCCGGTGCAGGTTGG
GGAGGCTGCATTGTCCATATTACACAGTATGGTATCTGTCCATTCAGACTTGGATGATGCTGGAGAGATTGTAACTCCTACCCCTAGAGTGAAGAGAATTCTGTCAAGTCCTCGCTGCCTTCCTCATATAGCTCAGGTTTTGTTAACAGGGGAGCCAGGTATTGTGGAAGGTGCAGCTGTGTTGCTGAAGGCAGTTGTGA
CAAGGAATCCCAAGGCAATGGTTCGACTTTATAACACAGGTGTTTTCTATTTTGCATTAGTTTATGCTGGATCCAATCTATCTACAATTGCAAAGCTTTTTGCTGTGACGCATGGGCACCAAGCATTTCATGGTGGGGAGGATGCTGCAGTGTCATCCTCACTACCTTTGGCAAAGCGCAGTGTTTTGGGAGGAATCTTG
CCTGAGTCATTGCTCTATGTTCTTGAGCGGAGTGGTCCATATGCATTTGCAGCTGGCATGATTTCTGATTCTGATACCCCAGAGATAATTTGGACCCACAAGATGCGCGCAGAACGTTTAATTGTTCAGGTTATGCAGCATCTGGGGGATTTCCCACAAAAGCTATCTCAGCACTGTCATTTATTATATGAGTATGCTCC
CATGCCGCCTGTAACATATCCAGAGTTGCAGGATGAGATGTGGTGCCATCGGTACTATCTAAGGAACCTTTGTGATGAGATACGGTTTCCTGGTTGGCCAATTGTTGAACATGTAGAGTTTCTGCAGTCATTGTTGGCTATGTGGCGGGAGGAGCTAACTAGGCGACCTATGGATCTTTCTGAAGAGGAAGCTTGTAAAA
TATTAGAGATTCCTTTGGATGATGACAGTGGCATAGTAGATGATGCTGATTGCAAGCAAAATAATGACCTTGAAGAAGATGGGAGTATTAAAGGCAAGCTGATTGGACGGGTAGATGAAGAAAAACTCAAACGGCAATATCGGAAGTTAGCTATGAAGTATCATCCTGATAAAAATCCAGAAGGAAGAGAGAAGTTTGTC
TCAGTTCAAAAAGCCTATGAACGGCTTCAGGCTACACTGCAAGGTTTGCAAGGACCACAACTTTGGAGGCTACTGCTTCTGCTGAAAGGGCAGTGTATATTATATAGGAGATATGGAGATGTGTTGCAACCTTTTAAGTATGCTGGTTACCCCATGTTACTTAATGCAATAACAGTTGACAAAGATGATAGCAATTTCCT
CTCTGCTGAACGGGCTCCTCTACTTGTAGCAGCTTCTGAGCTTACATGGTTAACGTGTGTCTCTTCTGCATTGAATGGTGAGGAGCTTGTGAGGGATGGGGGTGTGCCTCTACTGGCAACTCTTTTGACTCGGTGTATGTATGTGGTGCAGCCAAGTACGCCTCCAACTGAACCATCTGCAATGATTGTGACAAATGTGA
TGCAAACATTTGCATGCATTAGTAAGTTTGCAAGTGCGCGATCTGAGATGCTTCATTGTGCTGGGTTTGTGGAAGATGTTGTACATTGTACTGAATTGGAATTTGCTACTGCTGCCGTTGATGCTGCCCTTCAGACTGTTGCACTTCTTACTGCCTCATCAGAGTTACAGGATAATTTACTGAAGGCTGGTGTTTTGTGG
TATCTTCTACCATTGCTTTTACAGTATGACTCTACTGCCGAAGAAAATGCAGCTGCAGAAGCCCATGGTGTTGGAAGTAATGTGCAGATTGCAAAAAATACACATGCTGTGCTATCAGCTCGAGCACTGGCAAGAATTGCTGGATATCGTGGAGACGAACTTACTACACCATACAACCCTACAGCAGCTAATTCATTGAA
AGCCCTATTAACTCCAAAACTGTCAGATATGCTTAACGATGACTTGTCAAAGGAGCTTCTCTCAAACCTTATCTCAAACTTGGAGTCACCAGAGATAATTTGGAATTCGGCTACCCGAGCAGAGTTATTAAAGTTTGTAGATCAACAGAGGGCATGTCAATGCCCAGATGGTTCTTATGATATGCAGGAAGCACAGCTTT
TCAAGTACAAAGCACTCTCGAAAGAAATACAAGTTGGGAGTGTCTATTTGAGAGTATACAATGAGCAACCTGATTTTGAGATTAGCCAACCAGAATCATTTTGTGCTGCACTCCTTCAGTTTCTATGGAAACTTGTGGAAGATAGGAAGAAGATCCGGGAATCTAATATTCTTGAAGAGTCGTTGAGCAATAAAGAGGTT
GTGTTGGATATCTCTAAAGTTAAACCACTTGAGCCCATAGATGATATGAATGAAGAAGATTGCACATGGCAAGAAGAAGCTGTAATAGAATCAGCTGATGAACAAGCATCTGTTAAAGACCACAATTTAGTTAACAATTTGACCATTGGATTGACATCTCTTCAGAATTTACTTACATCTAATCCAGGACTTGCAGTAAT
GTTTTCAGCAAAAGAACAGCTTATACCCTTGTTTGAATGTTTTGTTGATACAAATACATCAAGTGGGGAAGTCCCTCAACTCTGCCTCAATGTATTATCACGTTTGACAACATACGCTCCATGTTTGGAGGCCATGGTTGCAGACCGGGAAAGTTTGCTTCTCTTGTTACAACTATTACACTGTACTCCATCTTGCAGGC
CAGGTGCACTTCATGTTCTTTATGCTCTAGCTAGCACGTCAGAGCTTGGATGGGCGACAGCAAAACATGGGGGAGTTGTGTACATTCTCCAGCTTCTTTTACCAGTCCAAGAAGAGATTCCTTTACAACAAAGAGCAGCTGCTGCCTCTTTACTGGGGAAACTTGTTGGGCAGCCGATGCATGGGCCTCGGGTGGCTATA
GCATTGGCCAGGTTTTTTCCAGATGGCTTGGTTTCTGCAATAAGAGATGGACCTGGTGAATCTGTAGTCACAGCTCTCGAGCAGACTTCAGAGACACCAGAACTAGTTTGGACACCAGCAATGGCTGCCTCATTAGGAGCACAAATTGCAACCATGGCATCTGATCTTTATCGTGAACAGATAAAAGGTCGGGTTGTAGA
CTGGGATCTTCCAGAGCATGCATCGGGTCAGGAAATGAAAGATGAGCCACAGGTTGGTGGTGTTTATGTACGCCTGTTTCTGAAAGATCCAAAGTTCCCTTTGAGAAACCCTAAAAGATTCCTGGAAGGGCTGTTGGACCAATATGTCTCAGCTGTTGCTGCTACTCATTACACAAAAGAGATGCAGCCTGCTGATCCAG
AGCTCCCTTTGTTGCTATCTGCAGCTCTTGTATCACTATTACGAGTTCATCCTGCTCTGGCAGACCATGTGGGATATCTTGGATATGTTCCAAAGCTGGTTGCAGCCATGGCATATGAAGGAAGGAGAGAAACGATGGCCTCAGAGGATGTAAAAACTGCAAATCATTGTCAACCTGGCGAGTTTTGGGACCCTGAAGAT
GGTGAGAGTAACCTAGGTAGCCAAACGTCACAGGAGCGTGTTCGACTTAGTTGTTTACGGGTTCTACATCAGCTTGCTGCAAGCACTACTTGTGCTGAAGCTATGGCAACGGCAAGCACAGGCACACCCCAGGTTGTTCCACTGCTAATGAAAGCAATAGGATGGCAAGGAGGGAGCGTACTGGCACTTGAGACACTTAA
ACGTGTAGTTGTTGCTGGCAATCGAGCTAGAGATGCCCTTGTGGCTCAAGGTCTAAAAATTGGCTTGGTTGAAGTTCTGTTAGGTTTGCTTGACTGGAGAGCTGGAGGTACACATGGACTTTGTGCGCAGATGAAATGGAATGAATCTGAAGCTTCTGTTGGGAGGGTGTTGGCAGTTGAGGTATTGCACGCCTTCGCAA
CTGAAGGAGCACACTGCGCTAAAGTTCGCAATATACTTAATGCATCAGATGTTTGGAGTGCATACAAGGATCAGAGGCATGATCTTTTTCTTCCCTCAAATGCTCAATCAGCTGCAGCTGGGGTAGCAGGCCTTATTGAAAGCTCTTCAGGGAGACAAACCTATGCACTCACAGCTCCAACACCACAGCCTGCTCTTGGG
AGACTGCCCACTTCAAGGAATACTCAAGCAGATGCCAGGGAGGAAGTTTCAACAGAACAGTAGTCCATTATTCAAGAATCATGATTGAGATTCTCAAGTTTATAATGCCTAATCAACTGTGCTGTTTAAGGTTTAACTAGGAAACTTATTTTTGGAAAAAAAAGGTATAATGACGAGGGTCTCATCTACGTATCAAATAT
AAGCGGTTTGTTGAGCTCTGAAAGATGGTATTAAGTTACAGAAGCAGTCTAAGTTGTAGAGGCACATAGTCATGCTGTCAGAGCCACTAGGCTGATTTGTAATATGTTTGTCTGTGTTCAGGTGTGGCTGATTTGCCATAAGGTGCCAGCTGATATTTCTCATATGGATTTTTCACTTTCTGTGCAGTCCTTTTTTACCC
TATTAGTTTTTATTGCTTAGTTATTCTTTTTGGAAATTAAATTGAGATGTAACTACTGTAAAATTGAAGGTTCATGTGCAATAGAATGGAAAGTTTCGTTTTTTAATATGTATTTTGAAGATAATCTTCAATCATACTGCGCATGCATGTAAAATATTTGACAATTTTGGTGGAGGGCTTCACAGTTTAGGCCATGTCAG
ATGTCATTGTAATTTATTTGGTACTCTGCTGAAGTCTATATGCAATTGGGATGATCTATTTCTCTCAATCTATAATTGAATCTAAATCCTTGCCACAGTGGCTACATGCTATAATACGTTTTTTGTCATTGCACTGGTAGGCCATGAAATTTGCTGGATGGTGCTAGTAACAGGG

>TRINITY_DN113694_c0_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CAAGCTCCAGCTTTTAATACTTTTTGGTTTCCTTTAAATAGTAAATTCATATGCTGCGTACTTTAAACACCATTCCTTTACATCCACATACTGCTCATCTGGAAATTTTTGGATTCAAGCACATAGTTTAAGGCTGTAAGAGGGAGTGACAAACTGCAACAACAATGTTTTGCAGAAATACTTGGTCTCAAACTTGGAGA
TAGGAAAGAAGCAGAAAGAATAGTGAGATAAGGCATCATCTTCTTTTGTTTCTTATGTATCTGTGATTATGCTTTTATTTTTCCTTCATTTGTTTTATGCAACAATGATAGCAGGAGAAAATAACAATGTAATCAGGCCTGTAGTCATATTAGGTGTCTGCAGGAACCAAGAATGTTCTCATTTTAATAATTTTACTGTA
TTTAATCTATGATATTTTTCATTGTATGGGTGTCAAAGACGGCACCATTTTGTTTCAGGAGATGCTATTTCAATTTTCTAGATATTGCATTTTATGTGGCCCTCTTAGTTGTTGATTATCCAATGTTAATCCTGTGAAATGTTTTTGTCTGCATGAAATATTTTGATTTTTTCGACTGTTTAAATAAAACACTTATCTTT
TCTGTAGTGTTGTAGGTGTTAAGGTCCATGAATGAACTCATAATTAACTAAAATCTTATCTTTTGCTCTGAAAAAAGCTCTTCCTTGTTCTTACAAGAAATGGCACTGTCTTGCAGAAGAGATTCCTTTACAACAAAGAGCAGCTGCTGCCTCTTTACTGGGGAAACTTGTTGGGCAGCCGATGCATGGGCCTCGGGTGG
CTATAGCATTGGCCAGGTTTTTTCCAGATGGCTTGGTTTCTGCAATAAGAGATGGACCTGGTGAATCTGTAGTCACAGCTCTCGAGCAGACTTCAGAGACACCAGAACTAGTTTGGACACCAGCAATGGCTGCCTCATTAGGAGCACAAATTGCAACCATGGCATCTGATCTTTATCGTGAACAGATAAAAGGTCGGGTT
GTAGACTGGGATCTTCCAGAGCATGCATCGGGTCAGGAAATGAAAGATGAGCCACAGGTTGGTGGTGTTTATGTACGCCTGTTTCTGAAAGATCCAAAGTTCCCTTTGAGAAACCCTAAAAGATTCCTGGAAGGGCTGTTGGACCAATATGTCTCAGCTGTTGCTGCTACTCATTACACAAAAGAGATGCAGCCTGCTGA
TCCAGAGCTCCCTTTGTTGCTATCTGCAGCTCTTGTATCACTATTACGAGTTCATCCTGCTCTGGCAGACCATGTGGGATATCTTGGATATGTTCCAAAGCTGGTTGCAGCCATGGCATATGAAGGAAGGAGAGAAACGATGGCCTCAGAGGATGTAAAAACTGCAAATCATTGTCAACCTGGCGAGTTTTGGGACCCTG
AAGATGGTGAGAGTAACCTAGGTAGCCAAACGTCACAGGAGCGTGTTCGACTTAGTTGTTTACGGGTTCTACATCAGCTTGCTGCAAGCACTACTTGTGCTGAAGCTATGGCAACGGCAAGCACAGGCACACCCCAGGTTGTTCCACTGCTAATGAAAGCAATAGGATGGCAAGGAGGGAGCGTACTGGCACTTGAGACA
CTTAAACGTGTAGTTGTTGCTGGCAATCGAGCTAGAGATGCCCTTGTGGCTCAAGGTCTAAAAATTGGCTTGGTTGAAGTTCTGTTAGGTTTGCTTGACTGGAGAGCTGGAGGTACACATGGACTTTGTGCGCAGATGAAATGGAATGAATCTGAAGCTTCTGTTGGGAGGGTGTTGGCAGTTGAGgtaccaaactctga
ttttctgggcacgaaaatcaaggagcaggctgggcatgaattttaagGTATTGCACGCCTTCGCAACTGAAGGAGCACACTGCGCTAAAGTTCGCAATATACTTAATGCATCAGATGT

Intron 2 GTTATTTCTT ... TTGTTGATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	26.91	258	1	95
A2	27.52	158	2	60
A3	28.66	224	0	90
A4	26.97	195	2	72
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A9	29.53	241	0	101
A10	26.8	213	0	78

>TRINITY_DN106663_c0_g1_i9 from sample A4 / Example spliced isoform

GGAGGGCAGGACAACATGCGAAGGGACCCTCTCTTCCTCGGGGAGAGGGAGGTGGAGGGATAACCATAGGTTACTTGGCTATATATAATCGCTAATCACGGGTAATTTTCTCTCTTCTCGCTCGAGACAAGGAGACCGTCGATTTGGGCTTTTGGCTTGCCTTCGTTTTTGTGTTATGTAGTCATTTCTCTGCCCCCTCC
ACCTGCTTTACTAATACACCGCACCACAGGTGAAGAAGAAGGAGGAGGTTAATGGTGTGGAGTCGAAGTTTCTTCTGTAAATAAAAAATCTCGAGAATTAACTAGTACTGGATCGATCACAGGTAAAGGTAGGTTTGGATTGGATTCATGACAAATCGCAATTGCAATTTCAGATGGTAGAAGCTGGTGCCGATGAAGAA
TATGTTTCCTTGGGCTGATACGGGGAGGGAGGGTTTGAGGGGAATTCAAGCAAATTGAGATACGATCGTTCGATCTTCGTGATCAGATTTTCCTTAGGGCTTCAAATAGGGAGAGCTGGGGGCGAATCAGTCCAGGGGCGGAGGCAGCACAGCAGTTAAGTGGTGGGGTTGGTGGCTCCTCCGCCCGAATGCGACTCGAA
CCCGCTACCTTGAGTTACTTCCGCACATGGATTTCGTGAGTAGACACGCATCCTCATCGTCCCATGATCAGCCGTCGTCCTCTTCAGGCGATGTTCTGGCGGAGGAGATGGATTACCTTGCGCGTTACTTGGTGACGAAGCACTCATGGAGGGGGCGGTACAAAAGGATTCTCTGTATTTCGCAGTTGTCCATCGTCACT
CTCGATCCCGCGACCTTAAATGTTACAAATTCCTATGACGTGCTCAACGATTTCGAGGGAGCTGCGCCCTTGTTTGGTCGAGACGACAATGCGAGTGAGTTTACGATTAGTGTCAGGACCGACGGCCGCGGCAAGTTCAAGCCTATGAAATTTTCATCCAGGTACCGGGCAGGCATTTTGACAGAGTTACATAGATTAAG
GTGGAACAAAAATGTTGGACATGCACTGAGTACGGTAGTTGTGGCAGAATTCTCGGTACTACATCTTCGTCGAAGGAATTCTGATTGGATACCATTTATTATGAGAGTAACACCTGTAGGAATTGAAATCATGGAATCAAAAACTAGAGACCTACGTTGGTGTTTGGATTTCAGGGACATGGATTCTCCTGGAATCATTG
TCTTATCTGATGCATATGGAAAGAAAGGTGAAGAGGGTGGGGGGTTTGTTCTTTGTCCCATGTATGGAAGAAAATGCAAAGCTTTTATGGCAGCTTCTGGTGCCTCAAACACAGCAATTATATCAAAACTGACGAAAACTCCAAAATCACTAGTGGGAATAATGGTTTCTTTAGACAACTCTCAGACAATCGGTGCTTCA
GAATTTTTGAAGCAAAGGGCCAAGGTTGCAGTTGGTGCAGAAGAAACTCCATTGGGGGAATGGTCTGTAACAAGGCTACGATCTGCTGCTCATGGAACTGCTAACACTCTGGGATTAACCTTGGGTGTTGGGCCCAAAGGTGGGCTGGGTGAGAGGGGTGATGCTGTATCTAGGCAACTTATACTGACGAAAATGTCACT
AGTTGAACGCCGACCAGACAATTATGAGGCAGTCATTGTTCGCCCATTGTCTGCTGTGGGTGCCCTTGTTCGCTTTGCTGAGGAGCCACAAATGTTTGCTATTGAATTCAATGATGGATGTCCAATTCACGTCTATGCAAGTACTTCCCGTGACAACTTGCTTGCAGCAGTTCGAGATGTTCTGCAAACAGAAAGACAGT
GCCCCATTCCCATTTTGCCAAGATTGACTATGCCTGGCCATTGTCTTAATCCTCCCTGTGGAAGAATTTCTCCACAACCTCAACAAGTGGCAAGTGCAGCACAGCGTCTTTTTGCAGATGTCGAAGGTGAGGCTATGCATCTAAAACATCTGGCAGCTGCAGCCAAAGATGCTGTAGCTGAAGGCGGATCTATTCCTGGT
TCAAGAGCGAAGCTATGGCGCAGAGTCAGAGAATTTAATGCTTGCATTCCTTATAGTGGAGTCCTGCCTAATACAGAAGTACCAGAGGTGGCATTAATGGCCTTGATGACAATGCTTCCAGCCCCCCCAAACTTACCTCCAGAATTACCACCACCACCACCTCCCTCTCCCAAAGCATCTGCAACTCTTATGGGTTTTAT
TGCATGCCTACGTCGCTTGCTGACATCAGTTAGTGCAGCTTCAGCTGTTCTGTCAATTCCTGCTGCTGTAATCAGAATAATGGGTTTGCTGAGAAGTGGTTCAGAAGGAGTAGCTGCAGAAGCAGCTGGGCTGGTGGCCATGCTTATCGGAGGTGGTCCTGGAGAAACGAATTTGCAACTGGATTCCAAGGGTGAGCATC
ATGCTACTTCCATGCACACAAAATCAGTGCTATTTGGCCATCAAAATTATGTAACTATCCTTGTCAACAGACTCAAGCCAGTGTCAGTATCACCTTTGCTATCAATGGCAGTGGTGGAAGTTCTTGAGGCAATGCTATGTGAACCTTTGGGTGAGACAACACAGCTTGCTACTTTTGTCGAAATGTTGCGTCAAGTAGCT
GGCTTGCGGCGGCGATTGTTTGCCTTGTTTGGGCATCCTGCAGAAAGTGTAAGAGAAACTGTGGCAGTGATCATGCGAACAATTGCAGAGGAGGATGCTATTGCGGCTGAGTCAATGCGTGATGCTGCATTACGTGATGGTGCTTTACTGCGACATCTGGTACATGCATTTTTTCTTCCTGTTGGTGAGCGTCGTGAAGT
TAGTCGGCAGCTTGTAGCTTTGTGGGCAGATTCCTATCAGCCTGCTTTGGATCTACTGTCACGAATGCTTCCTCCGGGGCTTGTTGCATATTTACATACACGTCCAGCTGAGGATGATAATGATGATGGGCAGGTACAACTTAACCAGGCAGTAACTTCTTCTAAACGTAGGCAGAGGCGTATTCTTCAGCGTAGAAAAG
GTCGCATTGCAAGGGTGAAAGGTGCTAGTGAATACAATCCAGCTTCTAACAAGGTAGAAGATGTATCACGGGCTGTAGATGGCTTCCTGCACTCAAATGGAAACTCACATTTGGGACAGGGTTCAACCTATTCTGCTGGAATATCTGGTGTGCCTATAGTCAATGCAGTTTCTAATGCAGGAAATACAGGTTGTGATGAT
GCTCTAGCCTCTGCACCTTTCAGAGGGTCTTCTTTTCCTGTATCATCACAGTTGGGGAATTCGGTTACTTCAGACTCAGTTGAATATGATGCCAATGCAGGGATTTCTTCACAATCGACTTTTCCTGCACCAGCACAAGTGGTTGTAGAAAATACACCTGTAGGCTCTGGCAGACTTCTTTGTAACTGGCCTGAATTTTG
GAGGGAATTTAGTCTTGATCACAACCGTGCAGATCTGATATGGAATGAGCAGACGAGACAGGAGCTTAGGGAGGCTCTTCAGGCAGAAGTTCATAATTTAGATGTTGAGAAAGCACGCACTGAGGATGTTCTTGGTCTTGGAGGTCACACAGATGAGGAGAGCATGGGCCAGGAGACTGCAATTCAATTATCTTGGAATT
ATACGGAATTTTCTGTTCGATATCCTAGTTTGTCAAAAGAAGTATGTGTTGGACAGTATTACCTACGTCTTTTGCTTGATAGCGGAGCTGGAGGCAGTGCTCAGGATTTTCCTCTCAGAGATCCAGTTGCTTTCTTCAGAGCACTATATCACAGGTTTCTCTGTGATGCAGACGTAGGACTTACTGTTGAAGGTGCAGCT
CCGGATGTGTTAGGTGCATCGGATGACTGGTGTGATATGGGAAGGTTGGATGGTTTTGGTGGGGGTGGAGGTTCATCTGTTAGGGAACTTTGTGCAAGGGCAATGACAATTGTTTATGAGCAGCATTATCAAGCAATAGGTCCTTTTGATGGCACTGCACATATTACTGTGTTACTTGATAGAACAAATGACAGAGCACT
TAGACACCGTCTGTTGTTACTCTTGAAGGTACTGATGAAAGTTCCAGCAAATGTGGAGGCATGTGTCTCAGTTGGAGGTTGTGCATTAGCTGTAGATCTTCTCACAACAAGTCACGAGGCATCTGAGAGGACATCAATTCCTTTGCAATCCAATTTAATTGCTGCCACTGCATTTATGGAGCCACCCAAGGAATGGTTAT
TTGTTAACAAGGATGGTGTGCAGGTTGGACCAGTTGAGAAGGATGGGGTAAGAAGAGCTTGGTCGAAACAAGAGATTGACTTGAACTCCAGGTGTTGGGCTTCAGGGATGACAGAATGGAAAAGAATGCGTGACGTTCGTGAGTTGCGATGGGCCATGGCATCTCGTATTGCTGTCCTTACTCCGGTGCAGGTTGGGGAG
GCTGCATTGTCCATATTACACAGTATGGTATCTGTCCATTCAGACTTGGATGATGCTGGAGAGATTGTAACTCCTACCCCTAGAGTGAAGAGAATTCTGTCAAGTCCTCGCTGCCTTCCTCATATAGCTCAGGTTTTGTTAACAGGGGAGCCAGGTATTGTGGAAGGTGCAGCTGTGTTGCTGAAGGCAGTTGTGACAAG
GAATCCCAAGGCAATGGTTCGACTTTATAACACAGGTGTTTTCTATTTTGCATTAGTTTATGCTGGATCCAATCTATCTACAATTGCAAAGCTTTTTGCTGTGACGCATGGGCACCAAGCATTTCATGGTGGGGAGGATGCTGCAGTGTCATCCTCACTACCTTTGGCAAAGCGCAGTGTTTTGGGAGGAATCTTGCCTG
AGTCATTGCTCTATGTTCTTGAGCGGAGTGGTCCATATGCATTTGCAGCTGGCATGATTTCTGATTCTGATACCCCAGAGATAATTTGGACCCACAAGATGCGCGCAGAACGTTTAATTGTTCAGGTTATGCAGCATCTGGGGGATTTCCCACAAAAGCTATCTCAGCACTGTCATTTATTATATGAGTATGCTCCCATG
CCGCCTGTAACATATCCAGAGTTGCAGGATGAGATGTGGTGCCATCGGTACTATCTAAGGAACCTTTGTGATGAGATACGGTTTCCTGGTTGGCCAATTGTTGAACATGTAGAGTTTCTGCAGTCATTGTTGGCTATGTGGCGGGAGGAGCTAACTAGGCGACCTATGGATCTTTCTGAAGAGGAAGCTTGTAAAATATT
AGAGATTCCTTTGGATGATGACAGTGGGATAGTAGATGATGCTGATTGCAAGCAAAATAATGACCTTGAAGAAGATGGGAGTATTAAAGGCAAGCTGATTGGACGGGTAGATGAAGAAAAACTCAAACGGCAATATCGGAAGTTAGCTATGAAGTATCATCCTGATAAAAATCCAGAAGGAAGAGAGAAGTTTGTCTCAG
TTCAAAAAGCCTATGAACGGCTTCAGGCTACACTGCAAGGTTTGCAAGGACCACAACTTTGGAGGCTACTGCTTCTGCTGAAAGGGCAGTGTATATTATATAGGAGATATGGAGATGTGTTGCAACCTTTTAAGTATGCTGGTTACCCCATGTTACTTAATGCAATAACAGTTGACAAAGATGATAGCAATTTCCTCTCT
GCTGAACGGGCTCCTCTACTTGTAGCAGCTTCTGAGCTTACATGGTTAACGTGTGTCTCTTCTGCATTGAATGGTGAGGAGCTTGTGAGGGATGGGGGTGTGCCTCTACTGGCAACTCTTTTGACTCGGTGTATGTATGTGGTGCAGCCAAGTACGCCTCCAACTGAACCATCTGCAATGATTGTGACAAATGTGATGCA
AACATTTGCATGCATTAGTAAGTTTGCAAGTGCGCGATCTGAGATGCTTCATTGTGCTGGGTTTGTGGAAGATGTTGTACATTGTACTGAATTGGAATTTGCTACTGCTGCCGTTGATGCTGCCCTTCAGACTGTTGCACTTCTTACTGCCTCATCAGAGTTACAGGATAATTTACTGAAGGCTGGTGTTTTGTGGTATC
TTCTACCATTGCTTTTACAGTATGACTCTACTGCCGAAGAAAATGCAGCTGCAGAAGCCCATGGTGTTGGAAGTAATGTGCAGATTGCAAAAAATACACATGCTGTGCTATCAGCTCGAGCACTGGCAAGAATTGCTGGATATCGTGGAGACGAACTTACTACACCATACAACCCTACAGCAGCTAATTCATTGAAAGCC
CTATTAACTCCAAAACTGTCAGATATGCTTAACGATGACTTGTCAAAGGAGCTTCTCTCAAACCTTATCTCAAACTTGGAGTCACCAGAGATAATTTGGAATTCGGCTACCCGAGCAGAGTTATTAAAGTTTGTAGATCAACAGAGGGCATGTCAATGCCCAGATGGTTCTTATGATATGCAGGAAGCACAGCTTTTCAA
GTACAAAGCACTCTCGAAAGAAATACAAGTTGGGAGTGTCTATTTGAGAGTATACAATGAGCAACCTGATTTTGAGATTAGCCAACCAGAATCATTTTGTGCTGCACTCCTTCAGTTTCTATGGAAACTTGTGGAAGATAGGAAGAAGATCCGGGAATCTAATATTCTTGAAGAGTCGTTGAGCAATAAAGAGGTTGTGT
TGGATATCTCTAAAGTTAAACCACTTGAGCCCATAGATGATATGAATGAAGAAGATTGCACATGGCAAGAAGAAGCTGTAATAGAATCAGCTGATGAACAAGCATCTGTTAAAGACCACAATTTAGTTAACAATTTGACCATTGGATTGACATCTCTTCAGAATTTACTTACATCTAATCCAGGACTTGCAGTAATGTTT
TCAGCAAAAGAACAGCTTATACCCTTGTTTGAATGTTTTGTTGATACAAATACATCAAGTGGGGAAGTCCCTCAACTCTGCCTCAATGTATTATCACGTTTGACAACATACGCTCCATGTTTGGAGGCCATGGTTGCAGACCGGGAAAGTTTGCTTCTCTTGTTACAACTATTACACTGTACTCCATCTTGCAGGCCAGG
TGCACTTCATGTTCTTTATGCTCTAGCTAGCACGTCAGAGCTTGGATGGGCGACAGCAAAACATGGGGGAGTTGTGTACATTCTCCAGCTTCTTTTACCAGTCCAAGAAGAGATTCCTTTACAACAAAGAGCAGCTGCTGCCTCTTTACTGGGGAAACTTGTTGGGCAGCCGATGCATGGGCCTCGGGTGGCTATAGCAT
TGGCCAGGTTTTTTCCAGATGGCTTGGTTTCTGCAATAAGAGATGGACCTGGTGAATCTGTAGTCACAGCTCTCGAGCAGACTTCAGAGACACCAGAACTAGTTTGGACACCAGCAATGGCTGCCTCATTAGGAGCACAAATTGCAACCATGGCATCTGATCTTTATCGTGAACAGATAAAAGGTCGGGTTGTAGACTGG
GATCTTCCAGAGCATGCATCGGGTCAGGAAATGAAAGATGAGCCACAGGTTGGTGGTGTTTATGTACGCCTGTTTCTGAAAGATCCAAAGTTCCCTTTGAGAAACCCTAAAAGATTCCTGGAAGGGCTGTTGGACCAATATGTCTCAGCTGTTGCTGCTACTCATTACACAAAAGAGATGCAGCCTGCTGATCCAGAGCT
CCCTTTGTTGCTATCTGCAGCTCTTGTATCACTATTACGAGTTCATCCTGCTCTGGCAGACCATGTGGGATATCTTGGATATGTTCCAAAGCTGGTTGCAGCCATGGCATATGAAGGAAGGAGAGAAACGATGGCCTCAGAGGATGTAAAAACTGCAAATCATTGTCAACCTGGCGAGTTTTGGGACCCTGAAGATGGTG
AGAGTAACCTAGGTAGCCAAACGTCACAGGAGCGTGTTCGACTTAGTTGTTTACGGGTTCTACATCAGCTTGCTGCAAGCACTACTTGTGCTGAAGCTATGGCAACGGCAAGCACAGGCACACCCCAGGTTGTTCCACTGCTAATGAAAGCAATAGGATGGCAAGGAGGGAGCGTACTGGCACTTGAGACACTTAAACGT
GTAGTTGTTGCTGGCAATCGAGCTAGAGATGCCCTTGTGGCTCAAGGTCTAAAAATTGGCTTGGTTGAAGTTCTGTTAGGTTTGCTTGACTGGAGAGCTGGAGGTACACATGGACTTTGTGCGCAGATGAAATGGAATGAATCTGAAGCTTCTGTTGGGAGGGTGTTGGCAGTTGAGGTTAGTCTTTTGTCATTGCTGAA
ACTTTTGCTTGAAATGTTACCCATCTTTTTATAGACTGGTTGAAGACATTGAGTTAAGATGATCTCTTTAATTTTAAGGATACATGGAAGTTTGTCTTTCATGTTTTCATGACTATCTTGCACAAGTCTTATCATCAAACATTGGCACCATGGCTGTCTGCACCATCTCTATTTGCTGCTGATTATTGGAACTAACAAGC
AACACTCTACATTTGTAAAAATTGTCATGTAACATAGGAAAATTGGTAACTGTTTGTTCTCATGTATTTGGAAATCAATTCCATCCAAATCAATGACAAAAGGGTGCTCATCATCCATGAGTTGGGCAAAAACTTTCGTTATGTGGCTGTTCCTCCC

>TRINITY_DN106663_c0_g1_i7 from sample A4 / Example unspliced isoform:

AAATGAAAGATGAGCCACAGgttatttcttctttaatctaagactaggttgctactgaaggaagataagttagtgatagaggatgttatgcaatgaagcaaaaaaaaaaggaaataattgtaacagctgaataatgctctttatctctcattttatttgttgatagGTTGGTGGTGTTTATGTACGCCTGTTTCTGAAAG
ATCCAAAGTTCCCTTTGAGAAACCCTAAAAGATTCCTGGAAGGGCTGTTGGACCAATATGTCTCAGCTGTTGCTGCTACTCATTACACAAAAGAGATGCAGCCTGCTGATCCAGAGCTCCCTTTGTTGCTATCTGCAGCTCTTGTATCACTATTACGAGTTCATCCTGCTCTGGCAGACCATGTGGGATATCTTGGATAT
GTTCCAAAGCTGGTTGCAGCCATGGCATATGAAGGAAGGAGAGAAACGATGGCCTCAGAGGATGTAAAAACTGCAAATCATTGTCAACCTGGCGAGTTTTGGGACCCTGAAGATGGTGAGAGTAACCTAGGTAGCCAAACGTCACAGGAGCGTGTTCGACTTAGTTGTTTACGGGTTCTACATCAGCTTGCTGCAAGCAC
TACTTGTGCTGAAGCTATGGCAACGGCAAGCACAGGCACACCCCAGGTTGTTCCACTGCTAATGAAAGCAATAGGATGGCAAGGAGGGAGCGTACTGGCACTTGAGACACTTAAACGTGTAGTTGTTGCTGGCAATCGAGCTAGAGATGCCCTTGTGGCTCAAGGTCTAAAGTATGTTATGCATACTTACGGTAACTAGG
ATATATTTGTTAAAGTGCCA

Intron 3 GTATAATGAC ... CTGTGTTCAG

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A9	66.85	331	724	611
A10	62.67	235	502	287

>TRINITY_DN106663_c0_g1_i1 from sample A4 / Example spliced isoform

GGAGGGCAGGACAACATGCGAAGGGACCCTCTCTTCCTCGGGGAGAGGGAGGTGGAGGGATAACCATAGGTTACTTGGCTATATATAATCGCTAATCACGGGTAATTTTCTCTCTTCTCGCTCGAGACAAGGAGACCGTCGATTTGGGCTTTTGGCTTGCCTTCGTTTTTGTGTTATGTAGTCATTTCTCTGCCCCCTCC
ACCTGCTTTACTAATACACCGCACCACAGGTGAAGAAGAAGGAGGAGGTTAATGGTGTGGAGTCGAAGTTTCTTCTGTAAATAAAAAATCTCGAGAATTAACTAGTACTGGATCGATCACAGGTAAAGGTAGGTTTGGATTGGATTCATGACAAATCGCAATTGCAATTTCAGATGGTAGAAGCTGGTGCCGATGAAGAA
TATGTTTCCTTGGGCTGATACGGGGAGGGAGGGTTTGAGGGGAATTCAAGCAAATTGAGATACGATCGTTCGATCTTCGTGATCAGATTTTCCTTAGGGCTTCAAATAGGGAGAGCTGGGGGCGAATCAGTCCAGGGGCGGAGGCAGCACAGCAGTTAAGTGGTGGGGTTGGTGGCTCCTCCGCCCGAATGCGACTCGAA
CCCGCTACCTTGAGTTACTTCCGCACATGGATTTCGTGAGTAGACACGCATCCTCATCGTCCCATGATCAGCCGTCGTCCTCTTCAGGCGATGTTCTGGCGGAGGAGATGGATTACCTTGCGCGTTACTTGGTGACGAAGCACTCATGGAGGGGGCGGTACAAAAGGATTCTCTGTATTTCGCAGTTGTCCATCGTCACT
CTCGATCCCGCGACCTTAAATGTTACAAATTCCTATGACGTGCTCAACGATTTCGAGGGAGCTGCGCCCTTGTTTGGTCGAGACGACAATGCGAGTGAGTTTACGATTAGTGTCAGGACCGACGGCCGCGGCAAGTTCAAGCCTATGAAATTTTCATCCAGGTACCGGGCAGGCATTTTGACAGAGTTACATAGATTAAG
GTGGAACAAAAATGTTGGACATGCACTGAGTACGGTAGTTGTGGCAGAATTCTCGGTACTACATCTTCGTCGAAGGAATTCTGATTGGATACCATTTATTATGAGAGTAACACCTGTAGGAATTGAAATCATGGAATCAAAAACTAGAGACCTACGTTGGTGTTTGGATTTCAGGGACATGGATTCTCCTGGAATCATTG
TCTTATCTGATGCATATGGAAAGAAAGGTGAAGAGGGTGGGGGGTTTGTTCTTTGTCCCATGTATGGAAGAAAATGCAAAGCTTTTATGGCAGCTTCTGGTGCCTCAAACACAGCAATTATATCAAAACTGACGAAAACTCCAAAATCACTAGTGGGAATAATGGTTTCTTTAGACAACTCTCAGACAATCGGTGCTTCA
GAATTTTTGAAGCAAAGGGCCAAGGTTGCAGTTGGTGCAGAAGAAACTCCATTGGGGGAATGGTCTGTAACAAGGCTACGATCTGCTGCTCATGGAACTGCTAACACTCTGGGATTAACCTTGGGTGTTGGGCCCAAAGGTGGGCTGGGTGAGAGGGGTGATGCTGTATCTAGGCAACTTATACTGACGAAAATGTCACT
AGTTGAACGCCGACCAGACAATTATGAGGCAGTCATTGTTCGCCCATTGTCTGCTGTGGGTGCCCTTGTTCGCTTTGCTGAGGAGCCACAAATGTTTGCTATTGAATTCAATGATGGATGTCCAATTCACGTCTATGCAAGTACTTCCCGTGACAACTTGCTTGCAGCAGTTCGAGATGTTCTGCAAACAGAAAGACAGT
GCCCCATTCCCATTTTGCCAAGATTGACTATGCCTGGCCATTGTCTTAATCCTCCCTGTGGAAGAATTTCTCCACAACCTCAACAAGTGGCAAGTGCAGCACAGCGTCTTTTTGCAGATGTCGAAGGTGAGGCTATGCATCTAAAACATCTGGCAGCTGCAGCCAAAGATGCTGTAGCTGAAGGCGGATCTATTCCTGGT
TCAAGAGCGAAGCTATGGCGCAGAGTCAGAGAATTTAATGCTTGCATTCCTTATAGTGGAGTCCTGCCTAATACAGAAGTACCAGAGGTGGCATTAATGGCCTTGATGACAATGCTTCCAGCCCCCCCAAACTTACCTCCAGAATTACCACCACCACCACCTCCCTCTCCCAAAGCATCTGCAACTCTTATGGGTTTTAT
TGCATGCCTACGTCGCTTGCTGACATCAGTTAGTGCAGCTTCAGCTGTTCTGTCAATTCCTGCTGCTGTAATCAGAATAATGGGTTTGCTGAGAAGTGGTTCAGAAGGAGTAGCTGCAGAAGCAGCTGGGCTGGTGGCCATGCTTATCGGAGGTGGTCCTGGAGAAACGAATTTGCAACTGGATTCCAAGGGTGAGCATC
ATGCTACTTCCATGCACACAAAATCAGTGCTATTTGGCCATCAAAATTATGTAACTATCCTTGTCAACAGACTCAAGCCAGTGTCAGTATCACCTTTGCTATCAATGGCAGTGGTGGAAGTTCTTGAGGCAATGCTATGTGAACCTTTGGGTGAGACAACACAGCTTGCTACTTTTGTCGAAATGTTGCGTCAAGTAGCT
GGCTTGCGGCGGCGATTGTTTGCCTTGTTTGGGCATCCTGCAGAAAGTGTAAGAGAAACTGTGGCAGTGATCATGCGAACAATTGCAGAGGAGGATGCTATTGCGGCTGAGTCAATGCGTGATGCTGCATTACGTGATGGTGCTTTACTGCGACATCTGGTACATGCATTTTTTCTTCCTGTTGGTGAGCGTCGTGAAGT
TAGTCGGCAGCTTGTAGCTTTGTGGGCAGATTCCTATCAGCCTGCTTTGGATCTACTGTCACGAATGCTTCCTCCGGGGCTTGTTGCATATTTACATACACGTCCAGCTGAGGATGATAATGATGATGGGCAGGTACAACTTAACCAGGCAGTAACTTCTTCTAAACGTAGGCAGAGGCGTATTCTTCAGCGTAGAAAAG
GTCGCATTGCAAGGGTGAAAGGTGCTAGTGAATACAATCCAGCTTCTAACAAGGTAGAAGATGTATCACGGGCTGTAGATGGCTTCCTGCACTCAAATGGAAACTCACATTTGGGACAGGGTTCAACCTATTCTGCTGGAATATCTGGTGTGCCTATAGTCAATGCAGTTTCTAATGCAGGAAATACAGGTTGTGATGAT
GCTCTAGCCTCTGCACCTTTCAGAGGGTCTTCTTTTCCTGTATCATCACAGTTGGGGAATTCGGTTACTTCAGACTCAGTTGAATATGATGCCAATGCAGGGATTTCTTCACAATCGACTTTTCCTGCACCAGCACAAGTGGTTGTAGAAAATACACCTGTAGGCTCTGGCAGACTTCTTTGTAACTGGCCTGAATTTTG
GAGGGAATTTAGTCTTGATCACAACCGTGCAGATCTGATATGGAATGAGCAGACGAGACAGGAGCTTAGGGAGGCTCTTCAGGCAGAAGTTCATAATTTAGATGTTGAGAAAGCACGCACTGAGGATGTTCTTGGTCTTGGAGGTCACACAGATGAGGAGAGCATGGGCCAGGAGACTGCAATTCAATTATCTTGGAATT
ATACGGAATTTTCTGTTCGATATCCTAGTTTGTCAAAAGAAGTATGTGTTGGACAGTATTACCTACGTCTTTTGCTTGATAGCGGAGCTGGAGGCAGTGCTCAGGATTTTCCTCTCAGAGATCCAGTTGCTTTCTTCAGAGCACTATATCACAGGTTTCTCTGTGATGCAGACGTAGGACTTACTGTTGAAGGTGCAGCT
CCGGATGTGTTAGGTGCATCGGATGACTGGTGTGATATGGGAAGGTTGGATGGTTTTGGTGGGGGTGGAGGTTCATCTGTTAGGGAACTTTGTGCAAGGGCAATGACAATTGTTTATGAGCAGCATTATCAAGCAATAGGTCCTTTTGATGGCACTGCACATATTACTGTGTTACTTGATAGAACAAATGACAGAGCACT
TAGACACCGTCTGTTGTTACTCTTGAAGGTACTGATGAAAGTTCCAGCAAATGTGGAGGCATGTGTCTCAGTTGGAGGTTGTGCATTAGCTGTAGATCTTCTCACAACAAGTCACGAGGCATCTGAGAGGACATCAATTCCTTTGCAATCCAATTTAATTGCTGCCACTGCATTTATGGAGCCACCCAAGGAATGGTTAT
TTGTTAACAAGGATGGTGTGCAGGTTGGACCAGTTGAGAAGGATGGGGTAAGAAGAGCTTGGTCGAAACAAGAGATTGACTTGAACTCCAGGTGTTGGGCTTCAGGGATGACAGAATGGAAAAGAATGCGTGACGTTCGTGAGTTGCGATGGGCCATGGCATCTCGTATTGCTGTCCTTACTCCGGTGCAGGTTGGGGAG
GCTGCATTGTCCATATTACACAGTATGGTATCTGTCCATTCAGACTTGGATGATGCTGGAGAGATTGTAACTCCTACCCCTAGAGTGAAGAGAATTCTGTCAAGTCCTCGCTGCCTTCCTCATATAGCTCAGGTTTTGTTAACAGGGGAGCCAGGTATTGTGGAAGGTGCAGCTGTGTTGCTGAAGGCAGTTGTGACAAG
GAATCCCAAGGCAATGGTTCGACTTTATAACACAGGTGTTTTCTATTTTGCATTAGTTTATGCTGGATCCAATCTATCTACAATTGCAAAGCTTTTTGCTGTGACGCATGGGCACCAAGCATTTCATGGTGGGGAGGATGCTGCAGTGTCATCCTCACTACCTTTGGCAAAGCGCAGTGTTTTGGGAGGAATCTTGCCTG
AGTCATTGCTCTATGTTCTTGAGCGGAGTGGTCCATATGCATTTGCAGCTGGCATGATTTCTGATTCTGATACCCCAGAGATAATTTGGACCCACAAGATGCGCGCAGAACGTTTAATTGTTCAGGTTATGCAGCATCTGGGGGATTTCCCACAAAAGCTATCTCAGCACTGTCATTTATTATATGAGTATGCTCCCATG
CCGCCTGTAACATATCCAGAGTTGCAGGATGAGATGTGGTGCCATCGGTACTATCTAAGGAACCTTTGTGATGAGATACGGTTTCCTGGTTGGCCAATTGTTGAACATGTAGAGTTTCTGCAGTCATTGTTGGCTATGTGGCGGGAGGAGCTAACTAGGCGACCTATGGATCTTTCTGAAGAGGAAGCTTGTAAAATATT
AGAGATTCCTTTGGATGATGACAGTGGGATAGTAGATGATGCTGATTGCAAGCAAAATAATGACCTTGAAGAAGATGGGAGTATTAAAGGCAAGCTGATTGGACGGGTAGATGAAGAAAAACTCAAACGGCAATATCGGAAGTTAGCTATGAAGTATCATCCTGATAAAAATCCAGAAGGAAGAGAGAAGTTTGTCTCAG
TTCAAAAAGCCTATGAACGGCTTCAGGCTACACTGCAAGGTTTGCAAGGACCACAACTTTGGAGGCTACTGCTTCTGCTGAAAGGGCAGTGTATATTATATAGGAGATATGGAGATGTGTTGCAACCTTTTAAGTATGCTGGTTACCCCATGTTACTTAATGCAATAACAGTTGACAAAGATGATAGCAATTTCCTCTCT
GCTGAACGGGCTCCTCTACTTGTAGCAGCTTCTGAGCTTACATGGTTAACGTGTGTCTCTTCTGCATTGAATGGTGAGGAGCTTGTGAGGGATGGGGGTGTGCCTCTACTGGCAACTCTTTTGACTCGGTGTATGTATGTGGTGCAGCCAAGTACGCCTCCAACTGAACCATCTGCAATGATTGTGACAAATGTGATGCA
AACATTTGCATGCATTAGTAAGTTTGCAAGTGCGCGATCTGAGATGCTTCATTGTGCTGGGTTTGTGGAAGATGTTGTACATTGTACTGAATTGGAATTTGCTACTGCTGCCGTTGATGCTGCCCTTCAGACTGTTGCACTTCTTACTGCCTCATCAGAGTTACAGGATAATTTACTGAAGGCTGGTGTTTTGTGGTATC
TTCTACCATTGCTTTTACAGTATGACTCTACTGCCGAAGAAAATGCAGCTGCAGAAGCCCATGGTGTTGGAAGTAATGTGCAGATTGCAAAAAATACACATGCTGTGCTATCAGCTCGAGCACTGGCAAGAATTGCTGGATATCGTGGAGACGAACTTACTACACCATACAACCCTACAGCAGCTAATTCATTGAAAGCC
CTATTAACTCCAAAACTGTCAGATATGCTTAACGATGACTTGTCAAAGGAGCTTCTCTCAAACCTTATCTCAAACTTGGAGTCACCAGAGATAATTTGGAATTCGGCTACCCGAGCAGAGTTATTAAAGTTTGTAGATCAACAGAGGGCATGTCAATGCCCAGATGGTTCTTATGATATGCAGGAAGCACAGCTTTTCAA
GTACAAAGCACTCTCGAAAGAAATACAAGTTGGGAGTGTCTATTTGAGAGTATACAATGAGCAACCTGATTTTGAGATTAGCCAACCAGAATCATTTTGTGCTGCACTCCTTCAGTTTCTATGGAAACTTGTGGAAGATAGGAAGAAGATCCGGGAATCTAATATTCTTGAAGAGTCGTTGAGCAATAAAGAGGTTGTGT
TGGATATCTCTAAAGTTAAACCACTTGAGCCCATAGATGATATGAATGAAGAAGATTGCACATGGCAAGAAGAAGCTGTAATAGAATCAGCTGATGAACAAGCATCTGTTAAAGACCACAATTTAGTTAACAATTTGACCATTGGATTGACATCTCTTCAGAATTTACTTACATCTAATCCAGGACTTGCAGTAATGTTT
TCAGCAAAAGAACAGCTTATACCCTTGTTTGAATGTTTTGTTGATACAAATACATCAAGTGGGGAAGTCCCTCAACTCTGCCTCAATGTATTATCACGTTTGACAACATACGCTCCATGTTTGGAGGCCATGGTTGCAGACCGGGAAAGTTTGCTTCTCTTGTTACAACTATTACACTGTACTCCATCTTGCAGGCCAGG
TGCACTTCATGTTCTTTATGCTCTAGCTAGCACGTCAGAGCTTGGATGGGCGACAGCAAAACATGGGGGAGTTGTGTACATTCTCCAGCTTCTTTTACCAGTCCAAGAAGAGATTCCTTTACAACAAAGAGCAGCTGCTGCCTCTTTACTGGGGAAACTTGTTGGGCAGCCGATGCATGGGCCTCGGGTGGCTATAGCAT
TGGCCAGGTTTTTTCCAGATGGCTTGGTTTCTGCAATAAGAGATGGACCTGGTGAATCTGTAGTCACAGCTCTCGAGCAGACTTCAGAGACACCAGAACTAGTTTGGACACCAGCAATGGCTGCCTCATTAGGAGCACAAATTGCAACCATGGCATCTGATCTTTATCGTGAACAGATAAAAGGTCGGGTTGTAGACTGG
GATCTTCCAGAGCATGCATCGGGTCAGGAAATGAAAGATGAGCCACAGGTTGGTGGTGTTTATGTACGCCTGTTTCTGAAAGATCCAAAGTTCCCTTTGAGAAACCCTAAAAGATTCCTGGAAGGGCTGTTGGACCAATATGTCTCAGCTGTTGCTGCTACTCATTACACAAAAGAGATGCAGCCTGCTGATCCAGAGCT
CCCTTTGTTGCTATCTGCAGCTCTTGTATCACTATTACGAGTTCATCCTGCTCTGGCAGACCATGTGGGATATCTTGGATATGTTCCAAAGCTGGTTGCAGCCATGGCATATGAAGGAAGGAGAGAAACGATGGCCTCAGAGGATGTAAAAACTGCAAATCATTGTCAACCTGGCGAGTTTTGGGACCCTGAAGATGGTG
AGAGTAACCTAGGTAGCCAAACGTCACAGGAGCGTGTTCGACTTAGTTGTTTACGGGTTCTACATCAGCTTGCTGCAAGCACTACTTGTGCTGAAGCTATGGCAACGGCAAGCACAGGCACACCCCAGGTTGTTCCACTGCTAATGAAAGCAATAGGATGGCAAGGAGGGAGCGTACTGGCACTTGAGACACTTAAACGT
GTAGTTGTTGCTGGCAATCGAGCTAGAGATGCCCTTGTGGCTCAAGGTCTAAAAATTGGCTTGGTTGAAGTTCTGTTAGGTTTGCTTGACTGGAGAGCTGGAGGTACACATGGACTTTGTGCGCAGATGAAATGGAATGAATCTGAAGCTTCTGTTGGGAGGGTGTTGGCAGTTGAGGTATTGCACGCCTTCGCAACTGA
AGGAGCACACTGCGCTAAAGTTCGCAATATACTTAATGCATCAGATGTTTGGAGTGCATACAAGGATCAGAGGCATGATCTTTTTCTTCCCTCAAATGCTCAATCAGCTGCAGCTGGGGTAGCAGGCCTTATTGAAAGCTCTTCAGGGAGACAAACCTATGCACTCACAGCTCCAACACCACAGCCTGCTCTTGGGAGAC
TGCCCACTTCAAGGAATACTCAAGCAGATGCCAGGGAGGAAGTTTCAACAGAACAGTAGTCCATTATTCAAGAATCATGATTGAGATTCTCAAGTTTATAATGCCTAATCAACTGTGCTGTTTAAGGTTTAACTAGGAAACTTATTTTTGGAAAAAAAAGGTGTGGCTGATTTGCCATAAGGTGCCAGCTGATATTTCTC
ATATGGATTTTTCACTTTCTGTGCAGTCCTTTTTTACCCTATTAGTTTTTATTGCTTAGTTATTCTTTTTGGAAATTAAATTGAGATGTAACTACTGTAAAATTGAAGGTTCATGTGCAATAGAATGGAAAGTTTCGTTTTTTAATATGTATTTTGAAGATAATCTTCAATCATACTGCGCATGCATGTAAAATATTTGA
CAATTTTGGTGGAGGGCTTCACAGTTTAGGCCATGTCAGAA

>TRINITY_DN106663_c0_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:

GATGTGAAGATAATTCCAACATGCTACTTGCTCTTCTTTCTTTTAACAGTTGAATATATTTGATTATTGATAGCTTGTGGCAATGCAGGTTTTGTTAACAGGGGAGCCAGGTATTGTGGAAGGTGCAGCTGTGTTGCTGAAGGCAGTTGTGACAAGGAATCCCAAGGCAATGGTTCGACTTTATAACACAGGTGTTTTCT
ATTTTGCATTAGTTTATGCTGGATCCAATCTATCTACAATTGCAAAGCTTTTTGCTGTGACGCATGGGCACCAAGCATTTCATGGTGGGGAGGATGCTGCAGTGTCATCCTCACTACCTTTGGCAAAGCGCAGTGTTTTGGGAGGAATCTTGCCTGAGTCATTGCTCTATGTTCTTGAGCGGAGTGGTCCATATGCATTT
GCAGCTGGCATGATTTCTGATTCTGATACCCCAGAGATAATTTGGACCCACAAGATGCGCGCAGAACGTTTAATTGTTCAGGTTATGCAGCATCTGGGGGATTTCCCACAAAAGCTATCTCAGCACTGTCATTTATTATATGAGTATGCTCCCATGCCGCCTGTAACATATCCAGAGTTGCAGGATGAGATGTGGTGCCA
TCGGTACTATCTAAGGAACCTTTGTGATGAGATACGGTTTCCTGGTTGGCCAATTGTTGAACATGTAGAGTTTCTGCAGTCATTGTTGGCTATGTGGCGGGAGGAGCTAACTAGGCGACCTATGGATCTTTCTGAAGAGGAAGCTTGTAAAATATTAGAGATTCCTTTGGATGATGACAGTGGGATAGTAGATGATGCTG
ATTGCAAGCAAAATAATGACCTTGAAGAAGATGGGAGTATTAAAGGCAAGCTGATTGGACGGGTAGATGAAGAAAAACTCAAACGGCAATATCGGAAGTTAGCTATGAAGTATCATCCTGATAAAAATCCAGAAGGAAGAGAGAAGTTTGTCTCAGTTCAAAAAGCCTATGAACGGCTTCAGGCTACACTGCAAGGTTTG
CAAGGACCACAACTTTGGAGGCTACTGCTTCTGCTGAAAGGGCAGTGTATATTATATAGGAGATATGGAGATGTGTTGCAACCTTTTAAGTATGCTGGTTACCCCATGTTACTTAATGCAATAACAGTTGACAAAGATGATAGCAATTTCCTCTCTGCTGAACGGGCTCCTCTACTTGTAGCAGCTTCTGAGCTTACATG
GTTAACGTGTGTCTCTTCTGCATTGAATGGTGAGGAGCTTGTGAGGGATGGGGGTGTGCCTCTACTGGCAACTCTTTTGACTCGGTGTATGTATGTGGTGCAGCCAAGTACGCCTCCAACTGAACCATCTGCAATGATTGTGACAAATGTGATGCAAACATTTGCATGCATTAGTAAGTTTGCAAGTGCGCGATCTGAGA
TGCTTCATTGTGCTGGGTTTGTGGAAGATGTTGTACATTGTACTGAATTGGAATTTGCTACTGCTGCCGTTGATGCTGCCCTTCAGACTGTTGCACTTCTTACTGCCTCATCAGAGTTACAGGATAATTTACTGAAGGCTGGTGTTTTGTGGTATCTTCTACCATTGCTTTTACAGTATGACTCTACTGCCGAAGAAAAT
GCAGCTGCAGAAGCCCATGGTGTTGGAAGTAATGTGCAGATTGCAAAAAATACACATGCTGTGCTATCAGCTCGAGCACTGGCAAGAATTGCTGGATATCGTGGAGACGAACTTACTACACCATACAACCCTACAGCAGCTAATTCATTGAAAGCCCTATTAACTCCAAAACTGTCAGATATGCTTAACGATGACTTGTC
AAAGGAGCTTCTCTCAAACCTTATCTCAAACTTGGAGTCACCAGAGATAATTTGGAATTCGGCTACCCGAGCAGAGTTATTAAAGTTTGTAGATCAACAGAGGGCATGTCAATGCCCAGATGGTTCTTATGATATGCAGGAAGCACAGCTTTTCAAGTACAAAGCACTCTCGAAAGAAATACAAGTTGGGAGTGTCTATT
TGAGAGTATACAATGAGCAACCTGATTTTGAGATTAGCCAACCAGAATCATTTTGTGCTGCACTCCTTCAGTTTCTATGGAAACTTGTGGAAGATAGGAAGAAGATCCGGGAATCTAATATTCTTGAAGAGTCGTTGAGCAATAAAGAGGTTGTGTTGGATATCTCTAAAGTTAAACCACTTGAGCCCATAGATGATATG
AATGAAGAAGATTGCACATGGCAAGAAGAAGCTGTAATAGAATCAGCTGATGAACAAGCATCTGTTAAAGACCACAATTTAGTTAACAATTTGACCATTGGATTGACATCTCTTCAGAATTTACTTACATCTAATCCAGGACTTGCAGTAATGTTTTCAGCAAAAGAACAGCTTATACCCTTGTTTGAATGTTTTGTTGA
TACAAATACATCAAGTGGGGAAGTCCCTCAACTCTGCCTCAATGTATTATCACGTTTGACAACATACGCTCCATGTTTGGAGGCCATGGTTGCAGACCGGGAAAGTTTGCTTCTCTTGTTACAACTATTACACTGTACTCCATCTTGCAGGCCAGGTGCACTTCATGTTCTTTATGCTCTAGCTAGCACGTCAGAGCTTG
GATGGGCGACAGCAAAACATGGGGGAGTTGTGTACATTCTCCAGCTTCTTTTACCAGTCCAAGAAGAGATTCCTTTACAACAAAGAGCAGCTGCTGCCTCTTTACTGGGGAAACTTGTTGGGCAGCCGATGCATGGGCCTCGGGTGGCTATAGCATTGGCCAGGTTTTTTCCAGATGGCTTGGTTTCTGCAATAAGAGAT
GGACCTGGTGAATCTGTAGTCACAGCTCTCGAGCAGACTTCAGAGACACCAGAACTAGTTTGGACACCAGCAATGGCTGCCTCATTAGGAGCACAAATTGCAACCATGGCATCTGATCTTTATCGTGAACAGATAAAAGGTCGGGTTGTAGACTGGGATCTTCCAGAGCATGCATCGGGTCAGGAAATGAAAGATGAGCC
ACAGGTTGGTGGTGTTTATGTACGCCTGTTTCTGAAAGATCCAAAGTTCCCTTTGAGAAACCCTAAAAGATTCCTGGAAGGGCTGTTGGACCAATATGTCTCAGCTGTTGCTGCTACTCATTACACAAAAGAGATGCAGCCTGCTGATCCAGAGCTCCCTTTGTTGCTATCTGCAGCTCTTGTATCACTATTACGAGTTC
ATCCTGCTCTGGCAGACCATGTGGGATATCTTGGATATGTTCCAAAGCTGGTTGCAGCCATGGCATATGAAGGAAGGAGAGAAACGATGGCCTCAGAGGATGTAAAAACTGCAAATCATTGTCAACCTGGCGAGTTTTGGGACCCTGAAGATGGTGAGAGTAACCTAGGTAGCCAAACGTCACAGGAGCGTGTTCGACTT
AGTTGTTTACGGGTTCTACATCAGCTTGCTGCAAGCACTACTTGTGCTGAAGCTATGGCAACGGCAAGCACAGGCACACCCCAGGTTGTTCCACTGCTAATGAAAGCAATAGGATGGCAAGGAGGGAGCGTACTGGCACTTGAGACACTTAAACGTGTAGTTGTTGCTGGCAATCGAGCTAGAGATGCCCTTGTGGCTCA
AGGTCTAAAAATTGGCTTGGTTGAAGTTCTGTTAGGTTTGCTTGACTGGAGAGCTGGAGGTACACATGGACTTTGTGCGCAGATGAAATGGAATGAATCTGAAGCTTCTGTTGGGAGGGTGTTGGCAGTTGAGGTATTGCACGCCTTCGCAACTGAAGGAGCACACTGCGCTAAAGTTCGCAATATACTTAATGCATCAG
ATGTTTGGAGTGCATACAAGGATCAGAGGCATGATCTTTTTCTTCCCTCAAATGCTCAATCAGCTGCAGCTGGGGTAGCAGGCCTTATTGAAAGCTCTTCAGGGAGACAAACCTATGCACTCACAGCTCCAACACCACAGCCTGCTCTTGGGAGACTGCCCACTTCAAGGAATACTCAAGCAGATGCCAGGGAGGAAGTT
TCAACAGAACAGTAGTCCATTATTCAAGAATCATGATTGAGATTCTCAAGTTTATAATGCCTAATCAACTGTGCTGTTTAAGGTTTAACTAGGAAACTTATTTTTGGAAAAAAAAGgtataatgacgagggtctcatctacgtatcaaatataagcggtttgttgagctctgaaagatggtattaagttacagaagcagt
ctaagttgtagaggcacatagtcatgctgtcagagccactaggctgatttgtaatatgtttgtctgtgttcagGTGTGGCTGATTTGCCATAAGGTGCCAGCTGATATTTCTCATATGGATTTTTCACTTTCTGTGCAGTCCTTTTTTACCCTATTAGTTTTTATTGCTTAGTTATTCTTTTTGGAAATTAAATTGAGAT
GTAACTACTGTAAAATTGAAGGTTCATGTGCAATAGAATGGAAAGTTTCGTTTTTTAATATGTATTTTGAAGATAATCTTCAATCATACTGCGCATGCATGTAAAATATTTGACAATTTTGGTGGAGGGCTTCACAGTTTAGGCCATGTCAGAA

Intron 4 GTAATTTTCT ... CGCACCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	76.77	69	11	228
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>TRINITY_DN126868_c4_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

GGAGGGCAGGACAACATGCGAAGGGACCCTCTCTTCCTCGGGGAGAGGGAGGTGGAGGGATAACCATAGGTTACTTGGCTATATATAATCGCTAATCACGGGTGAAGAAGAAGGAGGAGGTTAATGGTGTGGAGTCGAAGTTTCTTCTGTAAATAAAAAATCTCGAGAATTAACTAGTACTGGATCGATCACAGGTAAAG
GTAGGTTTGGATTGGATTCATGACAAATCGCAATTGCAATTTCAGATGGTAGAAGCTGGTGCCGATGAAGAATATGTTTCCTTGGGCTGATACGGGGAGGGAGGGTTTGAGGGGAATTCAAGCAAATTGAGATACGATCGTTCGATCTTCGTGATCAGATTTTCCTTAGGGCTTCAAATAGGGAGAGCTGGGGGCGAATC
AGTCCAGGGGCGGAGGCAGCACAGCAGTTAAGTGGTGGGGTTGGTGGCTCCTCCGCCCGAATGCGACTCGAACCCGCTACCTTGAGTTACTTCCGCATATGGATTTCGTGAGTAGACACGCATCCTCATCGTCCCATGATCAGCCGTCGTCCTCTTCAGGCGATGTTCTGGCGGAGGAGATGGATTACCTTGCGCGTTAC
TTGGTGACGAAGCACTCATGGAGGGGGCGGTACAAAAGGATTCTCTGTATTTCGCAGTTGTCCATCGTCACTCTCGATCCCGCGACCTTAAATGTTACAAATTCCTATGACGTGCTCAACGATTTCGAGGGAGCTGCGCCCTTGTTTGGTCGAGACGACAATGCGAGTGAGTTTACGATTAGTGTCAGGACCGACGGCCG
CGGCAAGTTCAAGCCTATGAAATTTTCATCCAGGTACCGGGCAGGCATTTTGACAGAGTTACATAGATTAAGGTGGAACAAAAATGTTGGACATGCACTGAGTACGGTAGTTGTGGCAGAATTCTCGGTACTACATCTTCGTCGAAGGAATTCTGATTGGATACCATTTATTATGAGAGTAACACCTGTAGGAATTGAAA
TCATGGAATCAAAAACTAGAGACCTACGTTGGTGTTTGGATTTCAGGGACATGGATTCTCCTGGAATCATTGTCTTATCTGATGCATATGGAAAGAAAGGTGAAGAGGGTGGGGGGTTTGTTCTTTGTCCCATGTATGGAAGAAAATGCAAAGCTTTTATGGCAGCTTCTGGTGCCTCAAACACAGCAATTATATCAAAA
CTGACGAAAACTCCAAAATCACTAGTGGGAATAATGGTTTCTTTAGACAACTCTCAGACAATCGGTGCTTCAGAATTTTTGAAGCAAAGGGCCAAGGTTGCAGTTGGTGCAGAAGAAACTCCATTGGGGGAATGGTCTGTAACAAGGCTACGATCTGCTGCTCATGGAACTGCTAACACTCTGGGATTAACCTTGGGTGT
TGGGCCCAAAGGTGGGCTGGGTGAGAGGGGTGATGCTGTATCTAGGCAACTTATACTGACGAAAATGTCACTAGTTGAACGCCGACCAGACAATTATGAGGCAGTCATTGTTCGCCCATTGTCTGCTGTGGGTGCCCTTGTTCGCTTTGCTGAGGAGCCACAAATGTTTGCTATTGAATTCAATGATGGATGTCCAATTC
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>TRINITY_DN126868_c4_g1_i14 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAGGGCAGGACAACATGCGAAGGGACCCTCTCTTCCTCGGGGAGAGGGAGGTGGAGGGATAACCATAGGTTACTTGGCTATATATAATCGCTAATCACGGgtaattttctctcttctcgctcgagacaaggagaccgtcgatttgggcttttggcttgccttcgtttttgtgttatgtagtcatttctctgccccctcc
acctgctttactaatacaccgcaccacagGTGAAGAAGAAGGAGGAGGTTAATGGTGTGGAGTCGAAGTTTCTTCTGTAAATAAAAAATCTCGAGAATTAACTAGTACTGGATCGATCACAGGTAAAGGTAGGTTTGGATTGGATTCATGACAAATCGCAATTGCAATTTCAGATGGTAGAAGCTGGTGCCGATGAAGAA
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CCCGCTACCTTGAGTTACTTCCGCATATGGATTTCGTGAGTAGACACGCATCCTCATCGTCCCATGATCAGCCGTCGTCCTCTTCAGGCGATGTTCTGGCGGAGGAGATGGATTACCTTGCGCGTTACTTGGTGACGAAGCACTCATGGAGGGGGCGGTACAAAAGGATTCTCTGTATTTCGCAGTTGTCCATCGTCACT
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CTTGTCTGTTTAGTCCTATTTATTCGCATTTTTAGAAAAATAAGTTTTTTTCTTGGTTTACCAATTGCATTTCATTTCAGGATGATGAAAGAATGCCCATAATTTATATTGGTGGTTCCTATTTATGAGCAGAAGTTAGTGTCAGATATTTGATGCACTTGGTCCTTAAATTAGAAATCAAAGGCATTAGGCAATTTTAA
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