sp|Q94BR5|CHR28_ARATH ----> Helicase-like transcription factor CHR28
Intron 1 GTTTGCTTCA ... GATTTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0 | 15 | 0 | 0 |
| A2 | 11.76 | 15 | 2 | 2 |
| A3 | 48.15 | 7 | 7 | 6 |
| A4 | 50 | 1 | 2 | 0 |
| A5 | 42.86 | 4 | 4 | 2 |
| A6 | 68.07 | 38 | 81 | 81 |
| A7 | 64.29 | 25 | 47 | 43 |
| A8 | 75.97 | 28 | 87 | 90 |
| A9 | 73.79 | 27 | 73 | 79 |
| A10 | 64.1 | 14 | 27 | 23 |
>TRINITY_DN47846_c0_g8_i1 from sample A7 / Example spliced isoformTTAGCTTTCATTTAGCTCTTACTTGTTAGATACAGAGGAACCGCCATATGCAACAACCAAAATTTCGGTTCACAAAATCTTTGAACATCAGATATCTTTCAATAGTATGAGATATTGCTGCAGGGGTTTCACAGTCCTTGCATAGACCGCAATATTCTAATTCTGGGCCATCAAAACTTCAGTAGTGGTGTTCAATCACA
ACAGTGGGACTAGCAGAGTGTAGGAGATCATGTGCAAACCTGGGCTCATATCCTCACGTCGAGATTGCATTGCCTTTGGGTAAACAATTGCAGATGCCAAAAACAGTAATTGTGTTACCTTATCTCCCATGACAAGTGGCTGATGAATGGTATGTTCCAGCGATGCGTGGGATGGCTTCTCTGGTAGTACCAGGATTTAC
CAACCGTGGACTCTACCCCTGATGATGGTCTTTTGGCAGTACCTTTGCTTAAGCACTAGAGGATTGCATTGGCTTGGATGGTTCTACATGAGACAAAAAACATGCATTGTTCTGGTGGTATTCTTGTAGATGATCAAGTTAATTTAATAATCTTTCGTTGTGTTCAAACTTGAACTGTGTGCTATATTTTTTGTAGCTTT
GTTTAAGCACCAAAGATTAAACCCTGCACCCTTCCTGCATTTCACATGTTGTCATAGGGATATATTAAGGCTCGGTAATAGACTCATGTTTCCATGTTCCTATTTAGGTTCCATTGCAAATGTTGTTATTCTCTATTACATAATGCTCGCTGCCCAGCTGTCGATTTTTATGTTTTTAGATATTGGGGTACATAATGGTT
TTGATTGGGACATATTATATTGTTTCCATTGATATTTCCTTCAATGGTTGTACGTAAGTACTGCTTTTGTGTTGCGGAGACAATAAGAAAGCCTAATAATTATGCTTTTAG
>TRINITY_DN47846_c0_g8_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:TTAGCTTTCATTTAGCTCTTACTTGTTAGATACAGAGGAACCGCCATATGCAACAACCAAAATTTCGGTTCACAAAATCTTTGAACATCAGATATCTTTCAATAGTATGAGATATTGCTGCAGGGGTTTCACAGTCCTTGCATAGACCGCAATATTCTAATTCTGGGCCATCAAAACTTCAGTAGTGGTGTTCAATCACA
ACAGTGGGACTAGCAGAGTGTAGGAGATCATGTGCAAACCTGGGCTCATATCCTCACGTCGAGATTGCATTGCCTTTGGGTAAACAATTGCAGATGCCAAAAACAGTAATTGTGTTACCTTATCTCCCATGACAAGTGGCTGATGAATGGTATGTTCCAGCGATGCGTGGGATGGCTTCTCTGGTAGTACCAGGATTTAC
CAACCGTGGACTCTACCCCTGATGATGGTCTTTTGGCAGTACCTTTGCTTAAGCACTAGgtttgcttcatatcactagtgatggtagttgatctctctgtagttcttatcacatgctgagaaaaatttaatgaatttgattttacagAGGATTGCATTGGCTTGGATGGTTCTACATGAGACAAAAAACATGCATTGTTC
TGGTGGTATTCTTGTAGATGATCAAGTTAATTTAATAATCTTTCGTTGTGTTCAAACTTGAACTGTGTGCTATATTTTTTGTAGCTTTGTTTAAGCACCAAAGATTAAACCCTGCACCCTTCCTGCATTTCACATGTTGTCATAGGGATATATTAAGGCTCGGTAATAGACTCATGTTTCCATGTTCCTATTTAGGTTCC
ATTGCAAATGTTGTTATTCTCTATTACATAATGCTCGCTGCCCAGCTGTCGATTTTTATGTTTTTAGATATTGGGGTACATAATGGTTTTGATTGGGACATATTATATTGTTTCCATTGATATTTCCTTCAATGGTTGTACGTAAGTACTGCTTTTGTGTTGCGGAGACAATAAGAAAGCCTAATAATTATGCTTTTAG