sp|Q9ZST9|TIC22_PEA ----> Protein TIC 22, chloroplastic


Intron 1 GTTATAGGTA ... GCTTAACAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A150777
A271.434128
A3607147
A486.6721412
A538.46882
A658.97243831
A755.88152018
A869.39154028
A951.85262927
A107541113



>TRINITY_DN39332_c0_g2_i2 from sample A9 / Example spliced isoform
TGGGGCAGTCTGCTTTTCTCACTGCATCAATCAAATGCAGCGAAAGGGACCTACTACATGCGTTAAACTACCCTTAATCGATGTGCGATATGAATCCAAGTGTCGTGAAAATTGAGAGACCTGATTTAAAAAACTACTCGCGAATTTGTGCGAATTGATTTTCGCAATATAGATATTTGCAATCTAAACACCAGGCGATT
CAAAAAGTTTTAAAGCTACTGGCCGAGTATTCTTCTTCCCATTTCCGAGTATTAATTCAACCAGCAAAACAGTCTGCTCCTCTTTCACGGGAAGCAGACACTGAAATAGAGACATGCAGTCGTACCCGAAAAGCCCAGAGCATCAAGAAAAACTACTCTTTCCCATTGGCCTTCAACCGCCCGTGTCTACTATATGTCTG
GGTATCCAACAACAATGGAAGCGAACGCACGACTGTTTTAACAGTGGCCTTAATCACTGCATCAATCAAATGCCGCAAAAATTTCGAGTACCCGATAAGGTTACGGGTCTTAAAGTACCATTCATTAATTTGGGTTTCGAATCCAAGTGCGGGCTTTCGAAAAGAGGCGAAGATTGGCAAACCCAATTGAAGAAAACAGG
GGAAACAGTGGAAATGCATGTTGGGAACACAGTACAAGCAGGAAAGGAGAAGCTTGCAGAGGTTTTTGGATGGAAGTCTGAAAGAAAGCCGATGTGGGCTTGTACTTCTGTGTCTCAGAATCTTCCCAAGAGTGATTTTGAAGCTCAGCACCTATTTGATTTGGCCATGAGTAGCAAAGAGGTCTCCAAACGGTTGGACG
GGATCCCAGTTTACACGGTTAGCAATTCGGCCAAAGAGTTTGTTTTGGTCTCAGACATGAGTAATCAGAGGTCCCTTGGGCTGTTTTGCTTTAGACATCAGGATGCAGAGGCTCTTCTTTCCCAGGTGTATGAGCTCCGTAAAGAGGGAATTACCTTAAGGTTTTTGCCTGATCCCCATCAGGTCAAGAATGCTCTTCAG
ACGGCTTCAGAAGCAGGAGTTCCTGCACATTCTTTCCCTGGGGTTCCTGTTTTTCAGTCAAACAATCTAATATTGAGGAGTCATGATAAGAGGTTTCGCCCAATTTTCTTTAGCAAGGAAGACTTGGAAGGCTCTCTTGCACGAGCATTTCAACAGCAGAAGAAACTAAATCCATCTTTTGACGTTAGTACAGATATTCA
GGTCGGAAGCTTTGAAGATGTAATCAGGAGGATGGAGTCCGGGGAAGAAAGCTCTGCATGGGAAGAAATTGTTTTCATTCCCCCAGGCCTTGATGTCTTTAATCATGTGGGAAAGACAGGCTCAGCTCAGTTTCCAAATGATG


>TRINITY_DN39332_c0_g2_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:
TGGGGCAGTCTGCTTTTCTCACTGCATCAATCAAATGCAGCGAAAGGGACCTACTACATGCGTTAAACTACCCTTAATCGATGTGCGATATGAATCCAAGTGTCGTGAAAATTGAGAGACCTGATTTAAAAAACTACTCGCGAATTTGTGCGAATTGATTTTCGCAATATAGATATTTGCAATCTAAACACCAGGCGATT
CAAAAAGTTTTAAAGCTACTGGCCGAGTATTCTTCTTCCCATTTCCGAGTATTAATTCAACCAGCAAAACAGTCTGCTCCTCTTTCACGGGAAGCAGACACTGAAATAGAGACATGCAGTCGTACCCGAAAAGCCCAGAGCATCAAGAAAAACTACTCTTTCCCATTGGCCTTCAACCGCCCGTGTCTACTATATGTCTG
GGTATCCAACAACAATGGAAGCGAACGCACGACTGTTTTAACAGTGGCCTTAATCACTGCATCAATCAAATGCCGCAAAAATTTCGAGTACCCGATAAGGTTACGGGTCTTAAAGTACCATTCATTAATTTGGGTTTCGAATCCAAGTGCGGGCTTTCGAAAAGAGGCGAAGATTGGCAAACCCAATTGAAGAAAACAGG
GGAAACAGTGGAAATGCATGTTGGGAACACAGTACAAGCAGGAAAGGAGAAGCTTGCAGAGGTTTTTGGATGGAAGTCTGAAAGAAAGCCGATGTGGGCTTGTACTTCTGTGTCTCAGAATCTTCCCAAGAGTGATTTTGAAGCTCAGCACCTATTTGATTTGGCCATGAGTAGCAAAGAGGTCTCCAAACGGTTGGACG
GGATCCCAGTTTACACGGTTAGCAATTCGGCCAAAGAGTTTGTTTTGGTCTCAGACATGAGTAATCAGAGGTCCCTTGGGCTGTTTTGCTTTAGACATCAGGATGCAGAGGCTCTTCTTTCCCAGgttataggtacagagccaagagtgggcggccgagcaaaagtaattgccgtatcgcttaacaagGTGTATGAGCTC
CGTAAAGAGGGAATTACCTTAAGGTTTTTGCCTGATCCCCATCAGGTCAAGAATGCTCTTCAGACGGCTTCAGAAGCAGGAGTTCCTGCACATTCTTTCCCTGGGGTTCCTGTTTTTCAGTCAAACAATCTAATATTGAGGAGTCATGATAAGAGGTTTCGCCCAATTTTCTTTAGCAAGGAAGACTTGGAAGGCTCTCT
TGCACGAGCATTTCAACAGCAGAAGAAACTAAATCCATCTTTTGACGTTAGTACAGATATTCAGGTCGGAAGCTTTGAAGATGTAATCAGGAGGATGGAGTCCGGGGAAGAAAGCTCTGCATGGGAAGAAATTGTTTTCATTCCCCCAGGCCTTGATGTCTTTAATCATGTGGGAAAGACAGGCTCAGCTCAGTTTCCAA
ATGATGGTACTGCTTTTTGTTGATATTGAGCAGAGATGTATATGTATCTTGATCCTGTCTTAAAAACTACTGCAGGTGTTTTATTTCTCTTGTGTTTTTTCGTCAATGTTGCTTACTTTGCAGTAATTTATCATATATGGGAGCTTTCTGGGCAAGCGCTGTAGATGATTGGCTTATTGTTTAATTTTTAGGGCTGTAGA
TAATTGGCTTATTATTTAATTTTTTAAATAAGAATTAAGAAAATTTAGAGAAATATACAATCTGAATAGCAAACAAGCTTTGAGAAGAAGTGTCTCAGCTGGTAACTTGTCACTGAGGCATCAGCAAGGTGGTCCTATTCTTTTATTGGATGAATTTTATGGAATTATTTTGTTTTTGTAAGTGCTGGGCCACATTGGCT
AAGTAATCAACATGGTTGCAATGGAAAGCCTGCATATGTGCTATCATTCACAAACATTTTAAATTCATGTAATCACACTTTGGGAACACATTTTTGCAGATAATAAAGCCAAGCTTTTGGCTCTGTAGCTTTTATAGTTTGTTTGCCCCTTTTGCTCTCCATTTTGGGCACTCACGCTATCAAAACATAAGCTTGGAATG
GCATGTGCATTACACTCATGCAAGTGATGAGCAAAAATGACATCTCAAGCCACAATATTAATGTAAATCAAGTTATTTTCAATGCTTCATTTTCTTCTTAGAGAGATACTTGGCTACTTGACATTGGTGCTACCTACCACATGACTTTTAGAAAATAATTCTTTGAAGAATTGAATAACAAAGTCGATGGTATAGTATAT
TTTGTAGATAAATACAACCTCAAACCCAAGGGAATTGGTATCATCATGCTCAAATAACTTGGATTCTCAGACTTTCTAATAAAAAATGTGATCTATCTTATAGAGTTGCAGAGGAACTTGATGTTTCTTGTGCATATTCGACAGCAACGTAAAAGTTGAGATAAGGAGATCTTCTGACAACTGAGGTCATCGTGACGAGA
TAGGAAGATGAGACATTGTTGACTTTGAAAGGAACATCTGCAAAGGCATAGAATTTTGCA



Intron 2 GTACTGCTTT ... TACTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A181.82154
A261.94103
A376.923911
A4100020
A5100022
A664.6204429
A773.1393019
A870.49184541
A969.23143627
A107061117



>TRINITY_DN35163_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform
CAGCGAAAGGGACCTACTACATGCGTTAAACTACCCTTAATCGATGTGCGATATGAATCCAAGTGTCGTGAAAATTGAGAGACCTGATTTAAAAAACTACTCGCGAATTTGTGCGAATTGATTTTCGCAATATAGATATTTGCAATCTAAACACCAGGCGATTCAAAAAGTTTTAAAGCTACTGGCCGAGTATTCTTCTT
CCCATTTCCGAGTATTAATTCAACCAGCAAAACAGTCTGCTCCTCTTTCACGGGAAGCAGACACTGAAATAGAGACATGCAGTCGTACCCGAAAAGCCCAGAGCATCAAGAAAAACTACTCTTTCCCATTGGCCTTCAACCGCCCGTGTCTACTATATGTCTGGGTATCCAACAACAATGGAAGCGAACGCACGACTGTT
TTAACAGTGGCCTTAATCACTGCATCAATCAAATGCCGCAAAAATTTCGAGTACCCGATAAGGTTACGGGTCTTAAAGTACCATTCATTAATTTGGGTTTCGAATCCAAGTGCGGGCTTTCGAAAAGAGGCGAAGATTGGCAAACCCAATTGAAGAAAACAGGGGAAACAGTGGAAATGCATGTTGGGAACACAGTACAA
GCAGGAAAGGAGAAGCTTGCAGAGGTTTTTGGATGGAAGTCTGAAAGAAAGCCGATGTGGGCTTGTACTTCTGTGTCTCAGAATCTTCCCAAGAGTGATTTTGAAGCTCAGCACCTATTTGATTTGGCCATGAGTAGCAAAGAGGTCTCCAAACGGTTGGACGGGATCCCAGTTTACACGGTTAGCAATTCGGCCAAAGA
GTTTGTTTTGGTCTCAGACATGAGTAATCAGAGGTCCCTTGGGCTGTTTTGCTTTAGACATCAGGATGCAGAGGCTCTTCTTTCCCAGGTTATAGGTACAGAGCCAAGAGTGGGCGGCCGAGCAAAAGTAATTGCCGTATCGCTTAACAAGGTGTATGAGCTCCGTAAAGAGGGAATTACCTTAAGGTTTTTGCCTGATC
CCCATCAGGTCAAGAATGCTCTTCAGACGGCTTCAGAAGCAGGAGTTCCTGCACATTCTTTCCCTGGGGTTCCTGTTTTTCAGTCAAACAATCTAATATTGAGGAGTCATGATAAGAGGTTTCGCCCAATTTTCTTTAGCAAGGAAGACTTGGAAGGCTCTCTTGCACGAGCATTTCAACAGCAGAAGAAACTAAATCCA
TCTTTTGACGTTAGTACAGATATTCAGGTCGGAAGCTTTGAAGATGTAATCAGGAGGATGGAGTCCGGGGAAGAAAGCTCTGCATGGGAAGAAATTGTTTTCATTCCCCCAGGCCTTGATGTCTTTAATCATGTGGGAAAGACAGGCTCAGCTCAGTTTCCAAATGATGTAATTTATCATATATGGGAGCTTTCTGGGCA
AGCGCTGTAGATGATTGGCTTATTGTTTAATTTTTAGGGCTGTAGATAATTGGCTTATTATTTAATTTTTTAAATAAGAATTAAGAAAATTTAGAGAAATATACAATCTGAATAGCAAACAAGCTTTGAGAAGAAGTGTCTCAGCTGGTAACTTGTCACTGAGGCATCAGCAAGGTGGTCCTATTCTTTTATTGGATGAA
TTTTATGGAATTATTTTGTTTTTGTAAGTGCTGGGCCACATTGGCTAAGTAATCAACATGGTTGCAATGGAAAGCCTGCATATGTGCTATCATTCACAAACATTTTAAATTCATGTAATCACACTTTGGGAACACATTTTTGCAGATAATAAAGCCAAGCTTTTGGCTCTGTAGCTTTTATAGTTTGTTTGCCCCTTTTG
CTCTCCATTTTGGGCACTCACGCTATCAAAACATAAGCTTGGAATGGCATGTGCATTACACTCATGCAAGTGATGAGCAAAAATGACATCTCAAGCCACAATATTAATGTAAATCAAGTTATTTTCAATGCTTCATTTTCTTCTTAGG


>TRINITY_DN35163_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CAGCGAAAGGGACCTACTACATGCGTTAAACTACCCTTAATCGATGTGCGATATGAATCCAAGTGTCGTGAAAATTGAGAGACCTGATTTAAAAAACTACTCGCGAATTTGTGCGAATTGATTTTCGCAATATAGATATTTGCAATCTAAACACCAGGCGATTCAAAAAGTTTTAAAGCTACTGGCCGAGTATTCTTCTT
CCCATTTCCGAGTATTAATTCAACCAGCAAAACAGTCTGCTCCTCTTTCACGGGAAGCAGACACTGAAATAGAGACATGCAGTCGTACCCGAAAAGCCCAGAGCATCAAGAAAAACTACTCTTTCCCATTGGCCTTCAACCGCCCGTGTCTACTATATGTCTGGGTATCCAACAACAATGGAAGCGAACGCACGACTGTT
TTAACAGTGGCCTTAATCACTGCATCAATCAAATGCCGCAAAAATTTCGAGTACCCGATAAGGTTACGGGTCTTAAAGTACCATTCATTAATTTGGGTTTCGAATCCAAGTGCGGGCTTTCGAAAAGAGGCGAAGATTGGCAAACCCAATTGAAGAAAACAGGGGAAACAGTGGAAATGCATGTTGGGAACACAGTACAA
GCAGGAAAGGAGAAGCTTGCAGAGGTTTTTGGATGGAAGTCTGAAAGAAAGCCGATGTGGGCTTGTACTTCTGTGTCTCAGAATCTTCCCAAGAGTGATTTTGAAGCTCAGCACCTATTTGATTTGGCCATGAGTAGCAAAGAGGTCTCCAAACGGTTGGACGGGATCCCAGTTTACACGGTTAGCAATTCGGCCAAAGA
GTTTGTTTTGGTCTCAGACATGAGTAATCAGAGGTCCCTTGGGCTGTTTTGCTTTAGACATCAGGATGCAGAGGCTCTTCTTTCCCAGGTTATAGGTACAGAGCCAAGAGTGGGCGGCCGAGCAAAAGTAATTGCCGTATCGCTTAACAAGGTGTATGAGCTCCGTAAAGAGGGAATTACCTTAAGGTTTTTGCCTGATC
CCCATCAGGTCAAGAATGCTCTTCAGACGGCTTCAGAAGCAGGAGTTCCTGCACATTCTTTCCCTGGGGTTCCTGTTTTTCAGTCAAACAATCTAATATTGAGGAGTCATGATAAGAGGTTTCGCCCAATTTTCTTTAGCAAGGAAGACTTGGAAGGCTCTCTTGCACGAGCATTTCAACAGCAGAAGAAACTAAATCCA
TCTTTTGACGTTAGTACAGATATTCAGGTCGGAAGCTTTGAAGATGTAATCAGGAGGATGGAGTCCGGGGAAGAAAGCTCTGCATGGGAAGAAATTGTTTTCATTCCCCCAGGCCTTGATGTCTTTAATCATGTGGGAAAGACAGGCTCAGCTCAGTTTCCAAATGATGgtactgctttttgttgatattgagcagagat
gtatatgtatcttgatcctgtcttaaaaactactgcaggtgttttatttctcttgtgttttttcgtcaatgttgcttactttgcagTAATTTATCATATATGGGAGCTTTCTGGGCAAGCGCTGTAGATGATTGGCTTATTGTTTAATTTTTAGGGCTGTAGATAATTGGCTTATTATTTAATTTTTTAAATAAGAATTA
AGAAAATTTAGAGAAATATACAATCTGAATAGCAAACAAGCTTTGAGAAGAAGTGTCTCAGCTGGTAACTTGTCACTGAGGCATCAGCAAGGTGGTCCTATTCTTTTATTGGATGAATTTTATGGAATTATTTTGTTTTTGTAAGTGCTGGGCCACATTGGCTAAGTAATCAACATGGTTGCAATGGAAAGCCTGCATAT
GTGCTATCATTCACAAACATTTTAAATTCATGTAATCACTACTTTGGGAACACATTTTTGCAGATAATAAAGCCAAGCTTTTGGCTCTGTAGCTTTTATAGTTTGTTTGCCCCTTTTGCTCTCCATTTTGGGCACTCACGCTATCAAAACATAAGCTTGGAATGGCATGTGCATTACACTCATGCAAGTGATGAGCAAAA
ATGACATCTCAAGCCACAATATTAATGTAAATCAAGTTATTTTCAATGCTTCATTTTCTTCTTAGG