sp|P81898|PNAA_PRUDU ----> Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl)asparagine amidase A
Intron 1 GTCTGATTTT ... GCTGTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 64.29 | 5 | 9 | 9 |
| A2 | 73.33 | 4 | 5 | 17 |
| A3 | 31.03 | 10 | 2 | 7 |
| A4 | 77.78 | 1 | 2 | 5 |
| A5 | 20 | 2 | 0 | 1 |
| A6 | 56.76 | 8 | 8 | 13 |
| A7 | 58.62 | 6 | 11 | 6 |
| A8 | 47.37 | 5 | 0 | 9 |
| A9 | 41.82 | 16 | 9 | 14 |
| A10 | 61.11 | 7 | 17 | 5 |
>TRINITY_DN44703_c1_g1_i3 from sample A9 / Example spliced isoformACAGCTTCTTGGATTTCAAGATCCCAGTTTTAAAGAAGACTCAAAGACGTGTGGGATTCGATGGCGTACCCTAGATCAAACAGCACTCAAACCAAACCAATCAACCGGCTGCAGGCACATAGCTAAGTTTATATTGTACTGTCAACGAGTAAATGCCCGAGGCTAAAGCATAGCACCAGGTGCAGATTTTCGTCGTACTT
GGAGGTCAACCCCAACCACAGACAACTAACCATGTGCTCCTCTCCATAGTTTGCAGACCAGGAGGATTCTGGGCCTCTAATATGGTGGCTATTCTCCATTCAGCGATGGAAAAGATAGCGTTGATCTGCATCTCCTGACCCACAAATTCAATGCTTATCCAGAAGAATACATTGAAGTCAGCAGGCCGGTAAACTATCCT
GCCAACAAGTCTTGTTCTATTCTTGTCCTGAAACATGATTTCGGCAACACTTATGGCAAACCTCCTGTCAAAGTATCCTACAACCCACCTGCAAAATGCTCCAATAACTGGGACAAAGTGGTTCTCCAATGGAGGGCTACCTGCAAAGGTGAACAATATGACAGAATTGCAGGTGTTTGGCTGAGTGGCGTTGAGATCCT
CAGAACAAGCACCGCTGAGCCTAATGAAGCAGGCATTTCATGGGAGGTCAACAAGGACATAACAAGGTATTCTACATTACTTAATAAGCCCCAGTCTCTGGTTGTAATGTTGGAAAATTTGGTTGATGGCACTTTTACTGGTATTTACCATGTCACCATCAGTTTCCATTTTTTTGAAAACCATGACGCCCAATTCCCCA
AATACACTGCACCAGCAGATCTGATCCTCCCAATCTCAAAATCCTCACCTAACAATGGGGGCCATTGGTTTTGGTTGCAGAATACATCTGATATTCAGTCACAGAAATTGTTGGTACCATCTAACGCCTATAGGGCTGTTATTGAAATTTATGTGTCAGCCCATGTGAATGATGAATTTTGGTACTCAAATCCTCCAGAT
GCTTACATAGAGGCCAACAACCTGACCACCCCCCGTGGCAATGGGGCTTTTAGGGAAGTGGTTAGTTTCATAGATGGGGTTGTTGTGGGTGCTGTGTGGCCTTTTCCTGTTGTGTTTACAGGGGGCATCAACCCTTTGTTCTGGGAACCTGTTGTGGGCATCGGGGCTTTCGATTTGCCTGCACACGACCTTGAGGTAAC
CCCTTTTCTTGGGCAGTTGCTGGATGGAAAGCATCACACCTTTGGCCTTAGTGTAATGGACGGTATTGCCACTTGGTTTGTGGATGCAAATTTGCACCTGTGGTTGGATAAAATTAGTGTGCAGACACTGGGAATGTTGGTGGATTATAAAGCACCTGCTTTTAGCCCTTCTCTAGTTTCAAACTTCGAGGGTTTGGATG
GGTTCTTTAGAACATATGGTGAAAGAACGATTTCATATTCTGGGTGGGTTAAATCAACACAAGGGAACCTTACAACTCATGTTTTGCAAATCTTCAATTACTCTAACCTTATCACTTTTGAACACAAGGGTAGTACTAAAATTGTGAAACTAAAAATCAAAACAACCGAGAAGGTGACAGTGGAGACGCCTTTGGAATCA
GTATTATCTCAAACAGTTTCGAGCTCTTATCCTCTATATATGTACTCTGCTTCCTTCAATAAGGAGAATGGTACGTATCTTGCTATTACAAACATTTCTCATGCTTTCAATAAAGATGTAGCCAATGTCTTCCCCAGCCGCAGTTTATTCAGTTCTTTGAAGAATTCTCAGAATGCACAGGGCTCTATGCTTGTCAAGGA
TCATTCTGTGCTCAGTGGCAATGCGAGCACTGAGCAGACATATAAATACAGGGGAAGTGATGGATGCTATTTCCGAATTCTGAGCGTTAAGGATTCTAACTTTATCAAAGATTACTCTGATACCTTGTGCAACTACTTTTTATAGAAATTTGATCCACCATTTGCTTAGATTGAATCCTCTATATATGTACTCCGCTTCT
GTTGATGAAGAGAATGGTACGTATCTTTCTCTTACAAACATTTCTCACGCTCTCAATAAGGATGTAACCAATGTCTTCCCAGCGGCAGTTCATCCAATTCTTTAAAGAATTCTCAGAATGCACAGGGCTCTATGCTTGCCAAGGATCATTCTGTGCTCAGTGGCAAAACGAGCACTGAGCAGACATATAAATACAGGGGA
AGTGATGGATGTTGTTTCCGGATTCTGAGCGTAAAGGATTCTAAATTTATCAAAGATTACTCTGATACCTTGTGCAACTACTTGATTAGAAAAGAGAAGGGCTTAGATTGATTAGAAAAAGTACTGAGTGATTTTCTTTCGCTTCAACACAAAGAACTGTTCTTAAAGGCAGCAATTAAGCCTCCTGTATTATTATGTTT
CCATATGTCCTGCTAAAATCAAGAGGGAGTGTGTATATTTCATCTTTACTTTCTAACCTTCGACCATAATGCGCCTATCCTTTTCTTCTATGTTTGTGGCGATGTTATGTAGTACACTACGCAAACTATTGGTTATTAGGAGCAAGTAAAATGCATATCGTATTTTGTTTCAAAGTCATGCTAATCTTTAGCAGAAAAGG
GCCTCAACGCTTATTGAAACAAATTATGGGCTCCAGTCAATCATAAGGCAGAGATTTGTTTTGACTAGCAATGTTATAGTTAGAAAATTTTTAGAAGCATGAAAAAACTCTTTTATGTTCCAGAGCTTTTAAGTTTCCTTTAGCATGTAAGAGTAATAGTAGAATAAGACTAAGTTTGTTAGCCTGGAACGAAATCTCAC
CATGAGGATATGCAACTGTATTAATAACTTGCAATTGTGGACACCACATAAATAACAAACAGAAGCCAGAAGGCCCAGAAGGCTTGACATTGACACCGTTAATTTTACCAGATGTAAGTACTAATGGCAAATTTTAAGGATTCG
>TRINITY_DN44703_c1_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:ACAGCTTCTTGGATTTCAAGATCCCAGTTTTAAAGAAGACTCAAAGACGTGTGGGATTCGATGGCGTACCCTAGATCAAACAGCACTCAAACCAAACCAATCAACCGGCTGCAGGCACATAGCTAAGTTTATATTGTACTGTCAACGAGTAAATGCCCGAGGCTAAAGCATAGCACCAGGTGCAGATTTTCGTCGTACTT
GGAGGTCAACCCCAACCACAGACAACTAACCATGTGCTCCTCTCCATAGTTTGCAGACCAGGAGGATTCTGGGCCTCTAATATGGTGGCTATgtctgattttaacccatctctttatatattttaatccatagaggaatatatttatggaaagatggaataagattttgagtggttcaatagttcaagcacgatgggttt
gaatgccatcagctttcatataatactttttctgctgtttcagTCTCCATTCAGCGATGGAAAAGATAGCGTTGATCTGCATCTCCTGACCCACAAATTCAATGCTTATCCAGAAGAATACATTGAAGTCAGCAGGCCGGTAAACTATCCTGCCAACAAGTCTTGTTCTATTCTTGTCCTGAAACATGATTTCGGCAACA
CTTATGGCAAACCTCCTGTCAAAGTATCCTACAACCCACCTGCAAAATGCTCCAATAACTGGGACAAAGTGGTTCTCCAATGGAGGGCTACCTGCAAAGGTGAACAATATGACAGAATTGCAGGTGTTTGGCTGAGTGGCGTTGAGATCCTCAGAACAAGCACCGCTGAGCCTAATGAAGCAGGCATTTCATGGGAGGTC
AACAAGGACATAACAAGGTATTCTACATTACTTAATAAGCCCCAGTCTCTGGTTGTAATGTTGGAAAATTTGGTTGATGGCACTTTTACTGGTATTTACCATGTCACCATCAGTTTCCATTTTTTTGAAAACCATGACGCCCAATTCCCCAAATACACTGCACCAGCAGATCTGATCCTCCCAATCTCAAAATCCTCACC
TAACAATGGGGGCCATTGGTTTTGGTTGCAGAATACATCTGATATTCAGTCACAGAAATTGTTGGTACCATCTAACGCCTATAGGGCTGTTATTGAAATTTATGTGTCAGCCCATGTGAATGATGAATTTTGGTACTCAAATCCTCCAGATGCTTACATAGAGGCCAACAACCTGACCACCCCCCGTGGCAATGGGGCTT
TTAGGGAAGTGGTTAGTTTCATAGATGGGGTTGTTGTGGGTGCTGTGTGGCCTTTTCCTGTTGTGTTTACAGGGGGCATCAACCCTTTGTTCTGGGAACCTGTTGTGGGCATCGGGGCTTTCGATTTGCCTGCACACGACCTTGAGGTAACCCCTTTTCTTGGGCAGTTGCTGGATGGAAAGCATCACACCTTTGGCCTT
AGTGTAATGGACGGTATTGCCACTTGGTTTGTGGATGCAAATTTGCACCTGTGGTTGGATAAAATTAGTGTGCAGACACTGGGAATGTTGGTGGATTATAAAGCACCTGCTTTTAGCCCTTCTCTAGTTTCAAACTTCGAGGGTTTGGATGGGTTCTTTAGAACATATGGTGAAAGAACGATTTCATATTCTGGGTGGGT
TAAATCAACACAAGGGAACCTTACAACTCATGTTTTGCAAATCTTCAATTACTCTAACCTTATCACTTTTGAACACAAGGGTAGTACTAAAATTGTGAAACTAAAAATCAAAACAACCGAGAAGGTGACAGTGGAGACGCCTTTGGAATCAGTATTATCTCAAACAGTTTCGAGCTCTTATCCTCTATATATGTACTCTG
CTTCCTTCAATAAGGAGAATGGTACGTATCTTGCTATTACAAACATTTCTCATGCTTTCAATAAAGATGTAGCCAATGTCTTCCCCAGCCGCAGTTTATTCAGTTCTTTGAAGAATTCTCAGAATGCACAGGGCTCTATGCTTGTCAAGGATCATTCTGTGCTCAGTGGCAATGCGAGCACTGAGCAGACATATAAATAC
AGGGGAAGTGATGGATGCTATTTCCGAATTCTGAGCGTTAAGGATTCTAACTTTATCAAAGATTACTCTGATACCTTGTGCAACTACTTTTTATAGAAATTTGATCCACCATTTGCTTAGATTGAATCCTCTATATATGTACTCCGCTTCTGTTGATGAAGAGAATGGTACGTATCTTTCTCTTACAAACATTTCTCACG
CTCTCAATAAGGATGTAACCAATGTCTTCCCAGCGGCAGTTCATCCAATTCTTTAAAGAATTCTCAGAATGCACAGGGCTCTATGCTTGCCAAGGATCATTCTGTGCTCAGTGGCAAAACGAGCACTGAGCAGACATATAAATACAGGGGAAGTGATGGATGTTGTTTCCGGATTCTGAGCGTAAAGGATTCTAAATTTA
TCAAAGATTACTCTGATACCTTGTGCAACTACTTGATTAGAAAAGAGAAGGGCTTAGATTGATTAGAAAAAGTACTGAGTGATTTTCTTTCGCTTCAACACAAAGAACTGTTCTTAAAGGCAGCAATTAAGCCTCCTGTATTATTATGTTTCCATATGTCCTGCTAAAATCAAGAGGGAGTGTGTATATTTCATCTTTAC
TTTCTAACCTTCGACCATAATGCGCCTATCCTTTTCTTCTATGTTTGTGGCGATGTTATGTAGTACACTACGCAAACTATTGGTTATTAGGAGCAAGTAAAATGCATATCGTATTTTGTTTCAAAGTCATGCTAATCTTTAGCAGAAAAGGGCCTCAACGCTTATTGAAACAAATTATGGGCTCCAGTCAATCATAAGGC
AGAGATTTGTTTTGACTAGCAATGTTATAGTTAGAAAATTTTTAGAAGCATGAAAAAACTCTTTTATGTTCCAGAGCTTTTAAGTTTCCTTTAGCATGTAAGAGTAATAGTAGAATAAGACTAAGTTTGTTAGCCTGGAACGAAATCTCACCATGAGGATATGCAACTGTATTAATAACTTGCAATTGTGGACACCACAT
AAATAACAAACAGAAGCCAGAAGGCCCAGAAGGCTTGACATTGACACCGTTAATTTTACCAGATGTAAGTACTAATGGCAAATTTTAAGGATTCG
Intron 2 GTGGCTATGT ... GCTGTTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 64.29 | 5 | 9 | 9 |
| A2 | 73.33 | 4 | 5 | 17 |
| A3 | 31.03 | 10 | 2 | 7 |
| A4 | 100 | 0 | 2 | 5 |
| A5 | 20 | 2 | 0 | 1 |
| A6 | 54.29 | 8 | 6 | 13 |
| A7 | 56.25 | 7 | 12 | 6 |
| A8 | 45.45 | 6 | 1 | 9 |
| A9 | 42.86 | 18 | 13 | 14 |
| A10 | 61.11 | 7 | 17 | 5 |
>TRINITY_DN43767_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoformCAGCACTCAAACCAAACCAATCAACCGGCTGCAGGCACATAGCTAAGTTTATATTGTACTGTCAACGAGTAAATGCCCGAGGCTAAAGCATAGCACCAGGTGCAGATTTTCGTCGTACTTGGAGGTCAACCCCAACCACAGACAACTAACCATGTGCTCCTCTCCATAGTTTGCAGACCAGGAGGATTCTGGGCCTCTAA
TATGTCTCCATTCAGCGATGGAAAAGATAGCGTTGATCTGCATCTCCTGACCCACAAATTCAATGCTTATCCAGAAGAATACATTGAAGTCAGCAGGCCGGTAAACTATCCTGCCAACAAGTCTTGTTCTATTCTTGTCCTGAAACATGATTTCGGCAACACTTATGGCAAACCTCCTGTCAAAGTATCCTACAACCCAC
CTGCAAAATGCTCCAATAACTGGGACAAAGTGGTTCTCCAATGGAGGGCTACCTGCAAAGGTGAACAATATGACAGAATTGCAGGTGTTTGGCTGAGTGGCGTTGAGATCCTCAGAACAAGCACCGCTGAGCCTAATGAAGCAGGCATTTCATGGGAGGTCAACAAGGACATAACAAGGTATTCTACATTACTTAATAAG
CCCCAGTCTCTGGTTGTAATGTTGGAAAATTTGGTTGATGGCACTTTTACTGGTATTTACCATGTCACCATCAGTTTCCATTTTTTTGAAAACCATGACGCCCAATTCCCCAAATACACTGCACCAGCAGATCTGATCCTCCCAATCTCAAAATCCTCACCTAACAATGGGGGCCATTGGTTTTGGTTGCAGAATACATC
TGATATTCAGTCACAGAAATTGTTGGTACCATCTAACGCCTATAGGGCTGTTATTGAAATTTATGTGTCAGCCCATGTGAATGATGAATTTTGGTACTCAAATCCTCCAGATGCTTACATAGAGGCCAACAACCTGACCACCCCCCGTGGCAATGGGGCTTTTAGGGAAGTGGTTAGTTTCATAGATGGGGTTGTTGTGG
GTGCTGTGTGGCCTTTTCCTGTTGTGTTTACAGGGGGCATCAACCCTTTGTTCTGGGAACCTGTTGTGGGCATCGGGGCTTTCGATTTGCCTGCACACGACCTTGAGGTAACCCCTTTTCTTGGGCAGTTGCTGGATGGAAAGCATCACACCTTTGGCCTTAGTGTAATGGACGGTATTGCCACTTGGTTTGTGGATGCA
AATTTGCACCTGTGGTTGGATAAAATTAGTGTGCAGACACTGGGAATGTTGGTGGATTATAAAGCACCTGCTTTTAGCCCTTCTCTAGTTTCAAACTTCGAGGGTTTGGATGGGTTCTTTAGAACATATGGTGAAAGAACGATTTCATATTCTGGGTGGGTTAAATCAACACAAGGGAACCTTACAACTCATGTTTTGCA
AATCTTCAATTACTCTAACCTTATCACTTTTGAACACAAGGGTAGTACTAAAATTGTGAAACTAAAAATCAAAACAACCGAGAAGGTGACAGTGGAGACGCCTTTGGAATCAGC
>TRINITY_DN43767_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:CAGCACTCAAACCAAACCAATCAACCGGCTGCAGGCACATAGCTAAGTTTATATTGTACTGTCAACGAGTAAATGCCCGAGGCTAAAGCATAGCACCAGGTGCAGATTTTCGTCGTACTTGGAGGTCAACCCCAACCACAGACAACTAACCATGTGCTCCTCTCCATAGTTTGCAGACCAGGAGGATTCTGGGCCTCTAA
TATGgtggctatgtctgattttaacccatctctttatatattttaatccatagaggaatatatttatggaaagatggaataagattttgagtggttcaatagttcaagcacgatgggtttgaatgccatcagctttcatataatactttttctgctgtttcagTCTCCATTCAGCGATGGAAAAGATAGCGTTGATCTGC
ATCTCCTGACCCACAAATTCAATGCTTATCCAGAAGAATACATTGAAGTCAGCAGGCCGGTAAACTATCCTGCCAACAAGTCTTGTTCTATTCTTGTCCTGAAACATGATTTCGGCAACACTTATGGCAAACCTCCTGTCAAAGTATCCTACAACCCACCTGCAAAATGCTCCAATAACTGGGACAAAGTGGTTCTCCAA
TGGAGGGCTACCTGCAAAGGTGAACAATATGACAGAATTGCAGGTGTTTGGCTGAGTGGCGTTGAGATCCTCAGAACAAGCACCGCTGAGCCTAATGAAGCAGGCATTTCATGGGAGGTCAACAAGGACATAACAAGGTATTCTACATTACTTAATAAGCCCCAGTCTCTGGTTGTAATGTTGGAAAATTTGGTTGATGG
CACTTTTACTGGTATTTACCATGTCACCATCAGTTTCCATTTTTTTGAAAACCATGACGCCCAATTCCCCAAATACACTGCACCAGCAGATCTGATCCTCCCAATCTCAAAATCCTCACCTAACAATGGGGGCCATTGGTTTTGGTTGCAGAATACATCTGATATTCAGTCACAGAAATTGTTGGTACCATCTAACGCCT
ATAGGGCTGTTATTGAAATTTATGTGTCAGCCCATGTGAATGATGAATTTTGGTACTCAAATCCTCCAGATGCTTACATAGAGGCCAACAACCTGACCACCCCCCGTGGCAATGGGGCTTTTAGGGAAGTGGTTAGTTTCATAGATGGGGTTGTTGTGGGTGCTGTGTGGCCTTTTCCTGTTGTGTTTACAGGGGGCATC
AACCCTTTGTTCTGGGAACCTGTTGTGGGCATCGGGGCTTTCGATTTGCCTGCACACGACCTTGAGGTAACCCCTTTTCTTGGGCAGTTGCTGGATGGAAAGCATCACACCTTTGGCCTTAGTGTAATGGACGGTATTGCCACTTGGTTTGTGGATGCAAATTTGCACCTGTGGTTGGATAAAATTAGTGTGCAGACACT
GGGAATGTTGGTGGATTATAAAGCACCTGCTTTTAGCCCTTCTCTAGTTTCAAACTTCGAGGGTTTGGATGGGTTCTTTAGAACATATGGTGAAAGAACGATTTCATATTCTGGGTGGGTTAAATCAACACAAGGGAACCTTACAACTCATGTTTTGCAAATCTTCAATTACTCTAACCTTATCACTTTTGAACACAAGG
GTAGTACTAAAATTGTGAAACTAAAAATCAAAACAACCGAGAAGGTGACAGTGGAGACGCCTTTGGAATCAGC