sp|Q8RWU5|FBL3_ARATH ----> F-box/LRR-repeat protein 3
Intron 1 GTTCCTTAAA ... GTTCATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.31 | 48 | 14 | 12 |
| A2 | 28.58 | 28.8 | 13 | 10 |
| A3 | 32.2 | 30 | 15.3 | 13.3 |
| A4 | 19.3 | 46 | 14 | 8 |
| A5 | 28.57 | 5 | 3 | 1 |
| A6 | 20 | 53 | 13 | 13.5 |
| A7 | 23.85 | 87 | 29.8 | 24.8 |
| A8 | 25.96 | 111.3 | 29 | 49 |
| A9 | 23.13 | 59 | 16.5 | 19 |
| A10 | 16.02 | 76 | 18 | 11 |
>TRINITY_DN47045_c1_g1_i6 from sample A7 / Example spliced isoformGGGGTGGACAATCCTGTTTTGGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGG
GAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGTGAGGCTCAACTGTGAGAAA
TCTTGTTTGGATTTCTTCATCTTCTCTCAACTGAGCTGGGCTGAAAATTTGGGTTGCTTGCTTGCCTTGTGCAATGTGTAAATCTGTTTTTTTAGCTTTAAGATACATGGGATGGCGTGGAAGAGTAATCCATTGCTAGGTTAAAGAGAATAACTCAATTTTTGTCTTGGGTTTTCTAGAATTTTGAAATCTGATTTGGG
TTTAAGCAGATAACTGCAGTTATGAATTCACATCGGTCAAAATCGCATATAGTATTCGAGTTTCGATGAAAAACTTGATGATTTTGATTTTGAGCTGGCAAGGCTTAGGGATCAAATTGAGGTATCCACTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAGGTCCGTAGGGGCAATTTTCGATTATAACAGTCTAATGTGTAATTTAGGGT
TTCGTTGCGGTCTGACCTCTTCCCACAAAAAAATTCGGCAAAGCCCTCTGCCCGCCTGCCCTCTAGAGGTCGACAAATAATGTCGATCTCTACCTCCCTTGAACAGAGGCAGCTCTGTCGGTACTAGAGCATGTTCTTCTCTGCTTTGGTTACAGTATATACCTGAAGTCTGAGTTGGTTTCAGAGAATGTTCGTTTGGT
GCTTTGGACTTGGAAGAACTCTAACATCCAAGTTGAGTTTGGTACACAAACGTCATTGCAGATTGTGTATGTGTAGACTTCTGAAATGTAATCTGGTTTTTCCACAAAGAAACTTCAATATCTGGTTAAGTCTGCCTGGAGTTGTAAAATCAGATATTGAGTTTCTGCAACGATCGTCAATGTCATATTTGGGTATGCCT
TTAACTACATAACCTAATGTGCATACAGAAGGCTTCCTGAATGCTATGTATGTGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAATATGACCTAATGTGCATACAGAAGGGTTCCTTAATACTATGTATATGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAAGATGATGTGACCTTATTTTTGGTTTGGAAATTTTTTCATTAGGCGTTTACG
ATTTTGATATCTGGCAATGGAGAACATTGTTATCCATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCT
CAGAATTACTTCCGAGGATTTTGAGAAGATACAGCAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCTATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTG
GTCGAAATCGATCTTTCCAATTGCACTGGAATCACAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGT
CGAGCTGGTTGTGGTAAAATGCAAGGATATACGGAATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAA
ATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTG
AGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGTAATTGCGGCATGCTGTACAGAACTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCTGCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAG
TTTGACTATGCTCGGAGAGGGATGCCCTTTCCTGCAACAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCTGAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCCATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGT
ACCGATCTGTTGGAATTGGTGATGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGATGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTA
GGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCTGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGATAAATGTCTCTTATTGTCCAATCTCAGATGTTGGGTTGTCAGCATTGGCAAGGCTTAGTTGCTTACAGAATATGAAGCTGGTTCATTTGAAGAATGTAAC
AGTGAGTTGTTTTGCATCTGCTCTGCTGGAGTGCGAGAGTTTAAAGAAACTCAAGCTTTTTGAAGGCTTAAAGTTTATTTTACCACGAAGTCTAATTGAGTGCTTGGAAGCCCGTGGGTGCAGTATTCATTGGATGGATAAGTCTTTTATGATTTAACTTGCATATATTGCATAATTATCCAATAATCGAGGTTTTTGGA
AAATGTAATATGTATCTGAGAGTTTCTTTGTAGGTACATCTTTTGGCATAGAGAAAGCAAATTCATGAACTCTTCAGTTGTGTCTGAATCTTTTTGTACTATTTTATGCTCTTTAGCTCAGATTGCAAAATTTCAGATAGAAGGCATCTTGTGAGATGGAAATAAACAACCTATACTATCATCTATACATTGAAGAGTTT
TGGGTTTGTTCCTTAGTGATATATTTTAGCTTACAGACTGGAGGATTTCACAGGTAAACATATTGAATGTGTTTAGTTTGCTGCACTACTTGTGAAATTTTCTTGCCCAACATTTGGGTTATGGGCCATCTCCAGGTGAAAGAGCAGATTTATACAGTCTTATTTCTGCTTTGTTTTTTAATTTCCCAATATGCTCTTCA
AATCACAAATAGTTTCCAACAGGGGCCTTGGATCATGGGCAAGGTTGACAGAGTATTAAGCCATCCACTAGGGTTCCATTCTTGCTGTGGTCTACTGCACTTGAAGAGAAAGAGGCTAAGTGCAAGCCTTGAACTATTTTTATATAATATTTATCCTTCCGAATTGGGAACTAAACCGAATTAAGTCTTCTCTTTGTAGT
GCAGCACTTTGGAGTGTGTTTCTTGAAGCACTCTCAAGAAATGAAATTCACAAGTAGTTTTCTATTGTTTGAAGTCTGCAAACATCTTTATGCCATTCTTTAAATGCAACTGCTATAATTTGCAAAGCTTTTATGATAAACTTTTGAGCTTTTTGCAGCATATGACAATTGAATAAATACAGCCG
>TRINITY_DN47045_c1_g1_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGGGTGGACAATCCTGTTTTGGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGG
GAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGTGAGGCTCAACTGTGAGAAA
TCTTGTTTGGATTTCTTCATCTTCTCTCAACTGAGCTGGGCTGAAAATTTGGGTTGCTTGCTTGCCTTGTGCAATGTGTAAATCTGTTTTTTTAGCTTTAAGATACATGGGATGGCGTGGAAGAGTAATCCATTGCTAGGTTAAAGAGAATAACTCAATTTTTGTCTTGGGTTTTCTAGAATTTTGAAATCTGATTTGGG
TTTAAGCAGATAACTGCAGTTATGAATTCACATCGGTCAAAATCGCATATAGTATTCGAGTTTCGATGAAAAACTTGATGATTTTGATTTTGAGCTGGCAAGGCTTAGGGATCAAATTGAGGTATCCACTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAGGTCCGTAGGGGCAATTTTCGATTATAACAGTCTAATGTGTAATTTAGGGT
TTCGTTGCGGTCTGACCTCTTCCCACAAAAAAATTCGGCAAAGCCCTCTGCCCGCCTGCCCTCTAGAGGTCGACAAATAATGTCGATCTCTACCTCCCTTGAACAGAGGCAGCTCTGTCGGTACTAGAGCATGTTCTTCTCTGCTTTGGTTACAGTATATACCTGAAGTCTGAGTTGGTTTCAGAGAATGTTCGTTTGGT
GCTTTGGACTTGGAAGAACTCTAACATCCAAGTTGAGTTTGGTACACAAACGTCATTGCAGATTGTGTATGTGTAGACTTCTGAAATGTAATCTGGTTTTTCCACAAAGAAACTTCAATATCTGGTTAAGTCTGCCTGGAGTTGTAAAATCAGATATTGAGTTTCTGCAACGATCGTCAATGTCATATTTGGGTATGCCT
TTAACTACATAACCTAATGTGCATACAGAAGGCTTCCTGAATGCTATGTATGTGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAATATGACCTAATGTGCATACAGAAGGGTTCCTTAATACTATGTATATGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAAGATGATGTGACCTTATTTTTGGTTTGGAAATTTTTTCATTAGGCGTTTACG
ATTTTGATATCTGGCAATGGAGAACATTGTTATCCATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCT
CAGAATTACTTCCGAGGATTTTGAGAAGATACAGCAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCTATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTG
GTCGAAATCGATCTTTCCAATTGCACTGGAATCACAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGT
CGAGCTGGTTGTGGTAAAATGCAAGGATATACGGAATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAA
ATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTG
AGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGTAATTGCGGCATGCTGTACAGAACTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCTGCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAG
TTTGACTATGCTCGGAGAGGGATGCCCTTTCCTGCAACAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGgttccttaaattatttagatatgaaaaagaggcttaatagtaatagggttattagattaaaaagttttctctcattatcttctattcttgtgtttaccatatctgttcatgcagGATTAAAATCGA
TTTCTAGGTGCTCTGAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCCATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGTGACGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGC
ATAAATGTCACTGATGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCTGAGTCGTGCCA
AAATTTACGACAGGTAGGACATTTCATATTAGGGAGATGCATTTTCTTGGTTCATATGCCCTGGTATATCTGTTGGATGATGACCTTTACAATTGCTAGCTG
Intron 2 GTAGGACATT ... ATCTCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 23.69 | 27.6 | 6 | 11.1 |
| A2 | 18.83 | 16 | 4 | 3.4 |
| A3 | 23.17 | 26 | 3 | 12.7 |
| A4 | 26.97 | 29 | 11 | 10.4 |
| A5 | 20.75 | 18 | 1.4 | 8 |
| A6 | 20.98 | 67 | 14 | 21.6 |
| A7 | 20.79 | 98 | 16 | 35.4 |
| A8 | 21.68 | 153 | 35 | 49.7 |
| A9 | 19.11 | 93.4 | 18 | 26.1 |
| A10 | 28.14 | 58 | 9 | 36.4 |
>TRINITY_DN108940_c1_g4_i1 from sample A4 / Example spliced isoformCACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGGGAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAAC
TGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGTGAGGCTCAACTGTGAGAAATCTTGTTTGGATTTCTTCATCTTCTCTCAACTGA
GCTGGGCTGAAAATTTGGGTTGCTTGCTTGCCTTGTGCAATGTGTAAATCTGTTTTTTTAGCTTTAAGATACATGGGATGGCGTGGAAGAGTAATCCATTGCTAGGTTAAAGAGAATAACTCAATTTTTGTCTTGGGTTTTCTAGAATTTTGTAATCTGATTTGGGTTTAAGCAGATAACTGCAGTTATGAATTCACATC
GGTCAAAATCGCATATAGTATTCGAGTTTCGATGAAAAACTTGATGATTTTGATTTTGAGCTGGCAAGGCTTAGGGATCAAATTGAGGTATCCACTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAGGTCCGTAGGGGCAATTTTCGATTATAACAGTCTAATGTGTAATTTAGGGTTTCGTTGCGGTCTGACCTCTTCCCACAAAAAAAT
TCGGCAAAGCCCTCTGCCCGCCTGCCCTCTAGAGGTCGACAAATAATGTCGATCTCTACCTCCCTTGAACAGAGGCAGCTCTGTCGGTACTAGAGCATGTTCTTCTCTGCTTTGGTTACAGTATATACCTGAAGTCTGAGTTGGTTTCAGAGAATGTTCGTTTGGTGCTTTGGACTTGGAAGAACTCTAACATCCAAGTT
GAGTTTGGTACACAAACGTCATTGCAGATTGTGTATGTGTAGACTTCTGAAATGTAATCTGGTTTTTCCACAAAGAAACTTCAATATCTGGTTAAGTCTGCCTGGAGTTGTAAAATCAGATATTGAGTTTCTGCAACGATCGTCAATGTCATATTTGGGTATGCCTTTAACTACATAACCTAATGTGCATACAGAAGGCT
TCCTGAATGCTATGTATGTGAAATTATTGCTCAGAATTGGAGAATATGACCTAATGTGCATACAGAAGGGTTCCTTAATACTATGTATATGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAAGATGATGTGACATTATTTTTGGTTTGGAAAATTTTTCATTAGGCGTTTACGATTTTGATATCTGGCAATGGAGAACATTGTTATC
CATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCTCAGAATTACTTCCGAGGATTTTGAGAAGATACAG
CAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCCATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTGGTCGAAATCGATCTTTCCAATTGCACTGGAATCA
CAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGTCGAGCTGGTTGTGGTAAAATGCAAGGATATACGG
AATCTTGATCTCTCTTACTTACAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTAT
GATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTGAGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGTAATTGCGGCATGCTGTACAGAACTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCTGCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGAT
ATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAGTTTGACTATGCTCGGAGAGGGATGCCCTTTCCTGCAACAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCTGAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGG
ATCATCCATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGTGATGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGATGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGT
TCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCTGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGATAAATGTCTCTTATTGTCCAATCTCAGATGTTGGGTTGTCAGCATTGACAA
GGCTTAGTTGCTTACAGAATATGAAGCTGGTTCATTTGAAGAATGTAACAGTGAGTTGTTTTGCATCTGCTCTGCTGGAGTGCGAGAGTTTAAAGAAACTCAAGCTTTTTGAAGGCTTAAAGTTTATTTTACCACGAAGTCTAATTGAGTGCTTGGAAGCCCGTGGGTGCAGTATTCATTGGATGGATAAGTCTTTTATG
ATTTAACTTGCATATATTGCATAATTATCCAATAATCGAGGTTTTTGGAAAATGTAATATGTATCTGAGAGTTTCTTTGTAGGTACATCTTTTGGCATAGAGAAAGCAAATTCATGAACTCTTCAGTTGTGTCTGAATCTTTTTGTACTATTTTATGCTCTTTAGCTCAGATTGCAAAATTTCAGATAGAAGGCATCTTG
TGAGATGGAAATAAACAACCTATACTATCATCTATACATTGAAGAGTTTTGGGTTTGTTCCTTAGTGATATATTTTAGCTTACAGACTGGAGGATTTCACAGGTAAACATATTGAATGTGTTTAGTTTGCTGCACTACTTGTGAAATTTTCTTGCCCAACATTTGGGTTATGGGCCATCTCCAGGTGAAAGAGCAGATTT
ATACAGTCTTATTTCTGCTTTGTTTTTTAATTTCCCAATATGCTCTTCAAATCACAAATAGTTTCCAACAGGGGCCTTGGATCATGGGCAAGGTTGACAGAGTATTAAGCCATCCACTAGGGTTCCATTCTTGCTGTGGTCTACTGCACTTGAAGAGAAAGAGGCTAAGTGCAAGCCTTGAACTATTTTTATATAATATT
TATCCTTCCGAATTGGGAACTAAACCGAATTAAGTCTTCTCTTTGTAGTGCAGCACTTTGGAGTGTGTTTCTTGAAGCACTCTCAAGAAATGAAATTCACAAGTAGTTTTCTATTGTTTGAAGTCTGCAAACATCTTTATGCCATTCTTTAAATGCAACTGCTATAATTTGCAAAGCTTTTATGATAAACTTTTGAGCTT
TTTGCAGCATATGACAATTGAATAAATACAGTCGTTGATTTGTCCAAGTGTGGCCTTTAT
>TRINITY_DN108940_c1_g4_i6 from sample A4 / Example unspliced isoform:CACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGGGAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAAC
TGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGTGAGGCTCAACTGTGAGAAATCTTGTTTGGATTTCTTCATCTTCTCTCAACTGA
GCTGGGCTGAAAATTTGGGTTGCTTGCTTGCCTTGTGCAATGTGTAAATCTGTTTTTTTAGCTTTAAGATACATGGGATGGCGTGGAAGAGTAATCCATTGCTAGGTTAAAGAGAATAACTCAATTTTTGTCTTGGGTTTTCTAGAATTTTGTAATCTGATTTGGGTTTAAGCAGATAACTGCAGTTATGAATTCACATC
GGTCAAAATCGCATATAGTATTCGAGTTTCGATGAAAAACTTGATGATTTTGATTTTGAGCTGGCAAGGCTTAGGGATCAAATTGAGGTATCCACTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAGGTCCGTAGGGGCAATTTTCGATTATAACAGTCTAATGTGTAATTTAGGGTTTCGTTGCGGTCTGACCTCTTCCCACAAAAAAAT
TCGGCAAAGCCCTCTGCCCGCCTGCCCTCTAGAGGTCGACAAATAATGTCGATCTCTACCTCCCTTGAACAGAGGCAGCTCTGTCGGTACTAGAGCATGTTCTTCTCTGCTTTGGTTACAGTATATACCTGAAGTCTGAGTTGGTTTCAGAGAATGTTCGTTTGGTGCTTTGGACTTGGAAGAACTCTAACATCCAAGTT
GAGTTTGGTACACAAACGTCATTGCAGATTGTGTATGTGTAGACTTCTGAAATGTAATCTGGTTTTTCCACAAAGAAACTTCAATATCTGGTTAAGTCTGCCTGGAGTTGTAAAATCAGATATTGAGTTTCTGCAACGATCGTCAATGTCATATTTGGGTATGCCTTTAACTACATAACCTAATGTGCATACAGAAGGCT
TCCTGAATGCTATGTATGTGAAATTATTGCTCAGAATTGGAGAATATGACCTAATGTGCATACAGAAGGGTTCCTTAATACTATGTATATGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAAGATGATGTGACATTATTTTTGGTTTGGAAAATTTTTCATTAGGCGTTTACGATTTTGATATCTGGCAATGGAGAACATTGTTATC
CATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCTCAGAATTACTTCCGAGGATTTTGAGAAGATACAG
CAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCCATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTGGTCGAAATCGATCTTTCCAATTGCACTGGAATCA
CAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGTCGAGCTGGTTGTGGTAAAATGCAAGGATATACGG
AATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAG
TGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATGATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTGAGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCA
CAGATGATGGAATATCTGCAATTGCGGCATGCTGTACAGAGCTGAACAAGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCTGAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCCATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGTGATGT
TGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGATGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGG
ATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCTGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGgtaggacatttcatattagggagatgcattttcttggttcatatgccctggtatatctgttggatgatgacctttacaattgctagctgttgcatctctgcagATAAATGTCTCTTATTGTCCAAT
CTCAGATGTTGGGTTGTCAGCATTGACAAGGCTTAGTTGCTTACAGAATATGAAGCTGGTTCATTTGAAGAATGTAACAGTGAGTTGTTTTGCATCTGCTCTGCTGGAGTGCGAGAGTTTAAAGAAACTCAAGCTTTTTGAAGGCTTAAAGTTTATTTTACCACGAAGTCTAATTGAGTGCTTGGAAGCCCGTGGGTGCA
GTATTCATTGGATGGATAAGTCTTTTATGATTTAACTTGCATATATTGCATAATTATCCAATAATCGAGGTTTTTGGAAAATGTAATATGTATCTGAGAGTTTCTTTGTAGGTACATCTTTTGGCATAGAGAAAGCAAATTCATGAACTCTTCAGTTGTGTCTGAATCTTTTTGTACTATTTTATGCTCTTTAGCTCAGA
TTGCAAAATTTCAGATAGAAGGCATCTTGTGAGATGGAAATAAACAACCTATACTATCATCTATACATTGAAGAGTTTTGGGTTTGTTCCTTAGTGATATATTTTAGCTTACAGACTGGAGGATTTCACAGGTAAACATATTGAATGTGTTTAGTTTGCTGCACTACTTGTGAAATTTTCTTGCCCAACATTTGGGTTAT
GGGCCATCTCCAGGTGAAAGAGCAGATTTATACAGTCTTATTTCTGCTTTGTTTTTTAATTTCCCAATATGCTCTTCAAATCACAAATAGTTTCCAACAGGGGCCTTGGATCATGGGCAAGGTTGACAGAGTATTAAGCCATCCACTAGGGTTCCATTCTTGCTGTGGTCTACTGCACTTGAAGAGAAAGAGGCTAAGTG
CAAGCCTTGAACTATTTTTATATAATATTTATCCTTCCGAATTGGGAACTAAACCGAATTAAGTCTTCTCTTTGTAGTGCAGCACTTTGGAGTGTGTTTCTTGAAGCACTCTCAAGAAATGAAATTCACAAGTAGTTTTCTATTGTTTGAAGTCTGCAAACATCTTTATGCCATTCTTTAAATGCAACTGCTATAATTTG
CAAAGCTTTTATGATAAACTTTTGAGCTTTTTGCAGCATATGACAATTGAATAAATACAGTCGTTGATTTGTCCAAGTGTGGCCTTTAT
Intron 3 GTTCCATACA ... CTTCATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.67 | 20 | 6 | 2 |
| A2 | 25 | 36 | 12 | 12 |
| A3 | 32.31 | 22 | 7 | 14 |
| A4 | 17.33 | 31 | 8 | 5 |
| A5 | 17.65 | 7 | 1 | 2 |
| A6 | 33.86 | 42 | 13 | 30 |
| A7 | 25.74 | 37 | 12.7 | 13 |
| A8 | 24.8 | 49 | 10.3 | 22 |
| A9 | 22.48 | 50 | 12 | 17 |
| A10 | 22.47 | 29.3 | 7 | 10 |
>TRINITY_DN117786_c4_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoformAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCAGATTTGCGTCAATTTACTCTTGCCTATTGCATACCAATTTCTGATGCTCTTCTTAAGAGCTTCTAAAACTGTGACAGACTACAAACGATCAAATTTGATGGTTGTGTAATTTCCAGCACAGCATTGGAACC
AGTTGGGAAAATCTGCAAATCTTTGAGGGAATTGAGCTTAAGCAAGTGTATTGGAGTTACAGATGAAGGTGGCATGCTGTAGAGAGCTTAACAAGTTAGATCTCACCTGCTGCCGTGATCTAACTGATGTTGCTTTCTCGGCCATTGCAACATCATGCAGATATCTTTCATCTCTTAAGATGGAATCCTGCAGCTTGGTC
ACAGAAAGAAGTTTGACTATGTTAGGAGAGGGTTGTCCTTTCATGGAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTAGCATAAACAACACAGGATTGAAATCCCTTTCTAAGTGCTCGGAATTGGTCACGTTGAAACGAGGATTCTGCCCAAATATATCCAATGAAGGGATTGTCCATGTTGGAGCCCGTTTCTCATGTCTGCAAGA
ACTTGATTTGTACAGATCTGTAG
>TRINITY_DN117786_c4_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCACTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGGGAGGTACTTCTATCTAATAGG
CGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGATAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGTGAGGCTCAACTGTGAGAAATCTTGTTTGGATTTCTTCATC
TTCTCTCAACTGAGCTGGGCTGAAAATTTGGGTTGCTTGCTTGCCTTGTGCAATGTGTAAATCTGTTTTTTTAGCTTTAAGATACATGGGATGGCGTGGAAGAGTAATCCATTGCTAGGTTAAAGAGAATAACTCAATTTTTGTCTTGGGTTTTCTAGAATTTTGTAATCTGATTTGGGTTTAAGCAGATAACTGCAGTT
ATGAATTCACATCGGTCAAAATCGCATATAGTATTCGAGTTTCGATGAAAAACTTGATGATTTTGATTTTGAGCTGGCAAGGCTTAGGGATCAAATTGAGGTATCCACTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAGGTCCGTAGGGGCAATTTTCGATTATAACAGTCTAATGTGTAATTTAGGGTTTCGTTGCGGTCTGACCTCTT
CCCACAAAAAAATTCGGCAAAGCCCTCTGCCCGCCTGCCCTCTAGAGGTCGACAAATAATGTCGATCTCTACCTCCCTTGAACAGAGGCAGCTCTGTCGGTACTAGAGCATGTTCTTCTCTGCTTTGGTTACAGTATATACCTGAAGTCTGAGTTGGTTTCAGAGAATGTTCGTTTGGTGCTTTGGACTTGGAAGAACTC
TAACATCCAAGTTGAGTTTGGTACACAAACGTCATTGCAGATTGTGTATGTGTAGACTTCTGAAATGTAATCTGGTTTTTCCACAAAGAAACTTCAATATCTGGTTAAGTCTGCCTGGAGTTGTAAAATCAGATATTGAGTTTCTGCAACGATCGTCAATGTCATATTTGGGTATGCCTTTAACTACATAACCTAATGTG
CATACAGAAGGCTTCCTGAATGCTATGTATGTGAAATTATTGCTCAGAATTGGAGAATATGACCTAATGTGCATACAGAAGGGTTCCTTAATACTATGTATATGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAAGATGATGTGACATTATTTTTGGTTTGGAAAATTTTTCATTAGGCGTTTACGATTTTGATATCTGGCAATGGA
GAACATTGTTATCCATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCTCAGAATTACTTCCGAGGATTT
TGAGAAGATACAGCAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCCATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTGGTCGAAATCGATCTTTCCAAT
TGCACTGGAATCACAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGTCGAGCTGGTTGTGGTAAAATG
CAAGGATATACGGAATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATAA
TTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCAGATTTGCGTCAATTTACTCTTGCCTATTGCATACCAATTTCTGATGCTCTTCTTAAGAGCTTCTAAAACTGTGACAGACTACAAACGATCAAATTTGATGGTTGCTGTAATTTCCAGCACAGCATTGGAACCAGTTGGGAAAATCTGCAAATCTTTGAGGGAATTGAGCTTAAGCAA
GTGTATTAGAGTTACAGATGAAGGACTGACTGCACTTGTGGCATGCTGTAGAGAGCTGAACAAGTTAGATCTCACCTGCTGCCGTGATCTAACTGATGTTGCTTTCTCGGCCATTGCAACATCATGCAGATATCTTTCATCTCTTAAGATGGAATCCTGCAGCTTGGTCACAGAAAGAAGTTTGACTATGTTAGGAGAGG
GTTGTCCTTTCATGGAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTAGCATAAACAACACAGgttccatacattgtttagctatgaagagaattttgacactaacgatgttaattgtaattgttattattttttggagattattttattgtcttctctgcttcttgtatttaccctatcccttcatgcagGATTGAAATCCCTTTCTA
AGTGCTCGGAATTGGTCACGTTGAAACGAGGATTCTGCCCAAATATATCCAATGAAGGGATTGTCCATGTTGGAGCCCGTTTCTCATGTCTGCAAGAACTTGATTTGTACAGATCTGTAGGAGTTCGGGATGTTGGATTAGCAGCAATTGCAAATGGTTGCCCGAGGTTAAAGAGTATTAATGGTTATTACTGCGTACAT
GTCACTGACAATGGTCTGAGATCTCTCGCTCAACTGCAAAAACTTCATCAGCTTGAAATTCAAGGTTGTTCAGGGATTTCCTCTGCTGGTCTTTCTGCAATCGCTTTAGGATATAAGCGTATCGTTGAATTGGATATCAAAAGGTGCTACGGTGTTGATGATGTCGGAAATTCGGAATATTGGCCGTAGCCGAGTCATGT
CAAAATTTGCGTCAGATGAATGTCTCATATTGTCCAATCACAGATGTTGGGTTGTTAGCATTGGCAAGTCTTAGATGCTTACAGGACATTAAGTTAGTTTATTTGAGGAATGTAACGGTCAATGGTTTCATGTCTGCTCTGCTGGCTTGCTCAAGCTTCTTCAATTATTAAATTTCAATTTACCGCGAGGTCTGATTGAG
ATGTTGGAAGCCCGTGGGTGCAATATTCGATGGATGGACAAGCCTTTTGTGATACAGGATGCCCATCTCAAATAATTCAGTACTTGATTTTTTCCCGGAAAATGTAATATATAACTCAGAGTTCCATTTAGCGGTTGTTGTTGTCCAACTCTAAACAAATCAAATTTGTGTGTTCATGAATTTCTGTTTAAACCTCGTGA
ATTTGTGGGGTTTAATTCCATCTTCTGAGAGATGAAATGAGCACCTATGATATCATAGGTACATTTGTATATTGAAGAGTCCTGTGTTTATTCAAAAA
Intron 4 GTGAGGCTCA ... TTTTCATTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 70.87 | 30 | 78 | 68 |
| A2 | 56.93 | 59 | 100 | 56 |
| A3 | 70.95 | 26 | 80 | 47 |
| A4 | 68.55 | 25 | 53 | 56 |
| A5 | 58.26 | 24 | 53 | 14 |
| A6 | 63.27 | 9 | 13 | 18 |
| A7 | 63.46 | 38 | 69 | 63 |
| A8 | 61.4 | 11 | 8 | 27 |
| A9 | 68.15 | 25 | 52 | 55 |
| A10 | 70 | 24 | 70 | 42 |
>TRINITY_DN47045_c1_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoformGGGGTGGACAATCCTGTTTTGGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGG
GAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGCGTTTACGATTTTGATATCT
GGCAATGGAGAACATTGTTATCCATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCTCAGAATTACTTC
CGAGGATTTTGAGAAGATACAGCAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCTATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTGGTCGAAATCGAT
CTTTCCAATTGCACTGGAATCACAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGTCGAGCTGGTTGT
GGTAAAATGCAAGGATATACGGAATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTA
CAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCAGATTTGCGTCAATTTACTCTTGCCTATTGCATACCAATTTCTGATGCTCTTCTTAAGAGCTTCCAAAACTGTGACAGACTACAAACGATCAAATTTGATGGTTGTGTAATTTCCAGCACAGCATTGGAACCAGTTGGGAAAATCTGCAAATCTTTGAGGGAATTGAGC
TTAAGCAAGTGTATTGGAGTTACAGATGAAGGTGGCATGCTGTAGAGAGCTTAACAAGTTAGATCTCACCTGCTGCCGTGATCTAACTGATGTTGCTTTCTCGGCCATTGCAACATCATGCAGATATCTTTCATCTCTTAAGATGGAATCCTGCAGCTTGGTCACAGAAAGAAGTTTGACTATGTTAGGAGAGGGCTGTC
CTTTCATGGAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTAGCATAAACAACACAGGATTGAAATCCCTTTCTAAGTGCTCGGAATTGGTCACGTTGAAACGAGGATTCTGCCCAAATATATCCAATGAAGGGATTGTCCATGTTGGAGCCCGTTTCTCATGTCTGCAAGAACTTGATTTGTACAGATCTGTAGGAGTTCGGGATGTT
GGATTAGCAGCAATTGCAAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATGGTTATTACTGCGTACATGTCACTGACAATGGTCTGAGATCTCTCGCTCAACTGCAAAAACTTCATCAGCTTGAAATTCAAGGTTGTTCAGGGATTTCCTCTGCTGGTCTTTCTGCAATCGCTTTAGGATATAAGCGTATCGTTGAATTGGA
TATCAAAAGGTGCTACGGTGTTGATGATGTCGGAAATTCGGAATATTGGCCGTAGCCGAGTCATGTCAAAATTTGCGTCAGATGAATGTCTCATATTGTCCAATCACAGATGTTGGGTTGTTAGCATTGGCAAGTCTTAGATGCTTACAGGACATTAAGTTAGTTTATTTGAGGAATGTAACGGTCAATGGTTTCATGTC
TGCTCTGCTGGCTTGCTCAAGCTTCTTCAATTATTAAATTTCAATTTACCGCGAGGTCTGATTGAGATGTTGGAAGCCCGTGGGTGCAATATTCGATGGATGGACAAGCCTTTTGTGATATAGGATGCCCATCTCAAATAATTCAGTACTTGATTTTTTCCCGGAAAATGTAATATATAACTCAGAGTTCCATTTAGCGG
TTGTTGTTGTCCAACTCTAAACAAATCAAATTTGTGTGTTCATGAATTTCTGTTTAAACCTCTTGAATTTGTGGGGTTTAATTCCATCTTCTGAGAGATGAAATGAGCACCTATGATATCATAGGTACATTTGTATATTGAAGAGTCCTGTGTTTATTCTGAATGGTATCGTTTTCATTTGTATGTAGG
>TRINITY_DN47045_c1_g1_i10 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGGGTGGACAATCCTGTTTTGGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGG
GAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGgtgaggctcaactgtgagaaa
tcttgtttggatttcttcatcttctctcaactgagctgggctgaaaatttgggttgcttgcttgccttgtgcaatgtgtaaatctgtttttttagctttaagatacatgggatggcgtggaagagtaatccattgctaggttaaagagaataactcaatttttgtcttgggttttctagaattttgaaatctgatttggg
tttaagcagataactgcagttatgaattcacatcggtcaaaatcgcatatagtattcgagtttcgatgaaaaacttgatgattttgattttgagctggcaaggcttagggatcaaattgaggtatccactttctcagtgtggcttgggaggtccgtaggggcaattttcgattataacagtctaatgtgtaatttagggt
ttcgttgcggtctgacctcttcccacaaaaaaattcggcaaagccctctgcccgcctgccctctagaggtcgacaaataatgtcgatctctacctcccttgaacagaggcagctctgtcggtactagagcatgttcttctctgctttggttacagtatatacctgaagtctgagttggtttcagagaatgttcgtttggt
gctttggacttggaagaactctaacatccaagttgagtttggtacacaaacgtcattgcagattgtgtatgtgtagacttctgaaatgtaatctggtttttccacaaagaaacttcaatatctggttaagtctgcctggagttgtaaaatcagatattgagtttctgcaacgatcgtcaatgtcatatttgggtatgcct
ttaactacataacctaatgtgcatacagaaggcttcctgaatgctatgtatgtgaagttattgctcagaattggaaaatatgacctaatgtgcatacagaagggttccttaatactatgtatatgaagttattgctcagaattggaaaagatgatgtgaccttatttttggtttggaaattttttcattagGCGTTTACG
ATTTTGATATCTGGCAATGGAGAACATTGTTATCCATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCT
CAGAATTACTTCCGAGGATTTTGAGAAGATACAGCAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCTATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTG
GTCGAAATCGATCTTTCCAATTGCACTGGAATCACAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGT
CGAGCTGGTTGTGGTAAAATGCAAGGATATACGGAATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAA
ATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCAGATTTGCGTCAATTTACTCTTGCCTATTGCATACCAATTTCTGATGCTCTTCTTAAGAGCTTCCAAAACTGTGACAGACTACAAACGATCAAATTTGATGGTTGCTGTAATTTCCAGCACAGCATTGGAACCAGTTGGGAAAATCTGCAAATCTTT
GAGGGAATTGAGCTTAAGCAAGTGTATTAGAGTTACAGATGAAGGACTGACTGCACTTGTGGCATGCTGTAGAGAGCTGAACAAGTTAGATCTCACCTGCTGCCGTGATCTAACTGATGTTGCTTTCTCGGCCATTGCAACATCATGCAGATATCTTTCATCTCTTAAGATGGAATCCTGCAGCTTGGTCACAGAAAGAA
GTTTGACTATGTTAGGAGAGGGCTGTCCTTTCATGGAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTAGCATAAACAACACAGGTTCCATACATTGTTTAGCTATGAAGAGAATTTTGACAGTAACGATGTTAATTGTAATTGTTATTATTTTTTGGAGATTATTTTATTGTCTTCTCTGCTTCTTGTATTTACCCTATCCCTTCATG
CAGGATTGAAATCCCTTTCTAAGTGCTCGGAATTGGTCACGTTGAAACGAGGATTCTGCCCAAATATATCCAATGAAGGGATTGTCCATGTTGGAGCCCGTTTCTCATGTCTGCAAGAACTTGATTTGTACAGATCTGTAGCAGTTGGGGATGTTGGATTAGCAGCAATTGCAAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATT
AATGTTTATTACTGCATACATGTCACTGACAATGGTCTGAGATCTCTCGCTCAACTGCAAAAACTTCATCAGCTTGGAATTCGAGGTTGTTCAGGGATTTCCTCTGCTGGTCTTTCTGCAATCGCTTTAGGATATAAGCGTATCGTTGAATTGGATATCAAAAGGTGCTACGGTGTTGATGATGTCGGAAATTCGGAATA
TTGGCCGTAGCCGAGTCATGTCAAAATTTGCGTCAGATGAATGTCTCATATTGTCCAATCACAGATGTTGGGTTGTTAGCATTGGCAAGTCTTAGATGCTTACAGGACATTAAGTTAGTTTATTTGAGGAATGTAACGGTCAATGGTTTCATGTCTGCTCTGCTGGCTTGCTCAAGCTTCTTCAATTATTAAATTTCAAT
TTACCGCGAGGTCTGATTGAGATGTTGGAAGCCCGTGGGTGCAATATTCGATGGATGGACAAGCCTTTTGTGATATAGGATGCCCATCTCAAATAATTCAGTACTTGATTTTTTCCCGGAAAATGTAATATATAACTCAGAGTTCCATTTAGCGGTTGTTGTTGTCCAACTCTAAACAAATCAAATTTGTGTGTTCATGA
ATTTCTGTTTAAACCTCTTGAATTTGTGGGGTTTAATTCCATCTTCTGAGAGATGAAATGAGCACCTATGATATCATAGGTACATTTGTATATTGAAGAGTCCTGTGTTTATTCTGAATGGTATCGTTTTCATTTGTATGTAGG
Intron 5 GTACATGTTA ... TTTATATCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.19 | 40 | 11 | 8 |
| A2 | 30.5 | 12.5 | 7 | 4 |
| A3 | 20.39 | 52 | 13.6 | 13 |
| A4 | 28.36 | 24 | 10 | 9 |
| A5 | 27.27 | 12 | 5 | 4 |
| A6 | 23.94 | 54 | 18 | 16 |
| A7 | 22.57 | 92 | 15.6 | 38 |
| A8 | 24.61 | 119.5 | 41 | 37 |
| A9 | 20.65 | 84 | 24.7 | 19 |
| A10 | 22.83 | 53 | 20.4 | 11 |
>TRINITY_DN47045_c1_g1_i3 from sample A7 / Example spliced isoformGGGGTGGACAATCCTGTTTTGGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGG
GAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGTGAGGCTCAACTGTGAGAAA
TCTTGTTTGGATTTCTTCATCTTCTCTCAACTGAGCTGGGCTGAAAATTTGGGTTGCTTGCTTGCCTTGTGCAATGTGTAAATCTGTTTTTTTAGCTTTAAGATACATGGGATGGCGTGGAAGAGTAATCCATTGCTAGGTTAAAGAGAATAACTCAATTTTTGTCTTGGGTTTTCTAGAATTTTGAAATCTGATTTGGG
TTTAAGCAGATAACTGCAGTTATGAATTCACATCGGTCAAAATCGCATATAGTATTCGAGTTTCGATGAAAAACTTGATGATTTTGATTTTGAGCTGGCAAGGCTTAGGGATCAAATTGAGGTATCCACTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAGGTCCGTAGGGGCAATTTTCGATTATAACAGTCTAATGTGTAATTTAGGGT
TTCGTTGCGGTCTGACCTCTTCCCACAAAAAAATTCGGCAAAGCCCTCTGCCCGCCTGCCCTCTAGAGGTCGACAAATAATGTCGATCTCTACCTCCCTTGAACAGAGGCAGCTCTGTCGGTACTAGAGCATGTTCTTCTCTGCTTTGGTTACAGTATATACCTGAAGTCTGAGTTGGTTTCAGAGAATGTTCGTTTGGT
GCTTTGGACTTGGAAGAACTCTAACATCCAAGTTGAGTTTGGTACACAAACGTCATTGCAGATTGTGTATGTGTAGACTTCTGAAATGTAATCTGGTTTTTCCACAAAGAAACTTCAATATCTGGTTAAGTCTGCCTGGAGTTGTAAAATCAGATATTGAGTTTCTGCAACGATCGTCAATGTCATATTTGGGTATGCCT
TTAACTACATAACCTAATGTGCATACAGAAGGCTTCCTGAATGCTATGTATGTGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAATATGACCTAATGTGCATACAGAAGGGTTCCTTAATACTATGTATATGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAAGATGATGTGACCTTATTTTTGGTTTGGAAATTTTTTCATTAGGCGTTTACG
ATTTTGATATCTGGCAATGGAGAACATTGTTATCCATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCT
CAGAATTACTTCCGAGGATTTTGAGAAGATACAGCAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCTATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTG
GTCGAAATCGATCTTTCCAATTGCACTGGAATCACAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGT
CGAGCTGGTTGTGGTAAAATGCAAGGATATACGGAATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAA
ATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTG
AGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGTAATTGCGGCATGCTGTACAGAACTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCTGCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAG
TTTGACTATGCTCGGAGAGGGATGCCCTTTCCTGCAACAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGTTCCTTAAATTATTTAGATATGAAAAAGAGGCTTAATAGTAATAGGGTTATTAGATTAAAAAGTTTTCTCTCATTATCTTCTATTCTTGTGTTTACCATATCTGTTCATGCAGGATTAAAATCGA
TTTCTAGGTGCTCTGAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCCATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGTGACGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGC
ATAAATGTCACTGATGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCTGAGTCGTGCCA
AAATTTACGACAGGTAGGACATTTCATATTAGGGAGATGCATTTTCTTGGTTCATATGCCCTGGTATATCTGTTGGATGATGACCTTTACAATTGCTAGCTG
>TRINITY_DN47045_c1_g1_i8 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGGGTGGACAATCCTGTTTTGGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGG
GAGGTACTTCTATCTAATAGGCGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGGTGAGGCTCAACTGTGAGAAA
TCTTGTTTGGATTTCTTCATCTTCTCTCAACTGAGCTGGGCTGAAAATTTGGGTTGCTTGCTTGCCTTGTGCAATGTGTAAATCTGTTTTTTTAGCTTTAAGATACATGGGATGGCGTGGAAGAGTAATCCATTGCTAGGTTAAAGAGAATAACTCAATTTTTGTCTTGGGTTTTCTAGAATTTTGAAATCTGATTTGGG
TTTAAGCAGATAACTGCAGTTATGAATTCACATCGGTCAAAATCGCATATAGTATTCGAGTTTCGATGAAAAACTTGATGATTTTGATTTTGAGCTGGCAAGGCTTAGGGATCAAATTGAGGTATCCACTTTCTCAGTGTGGCTTGGGAGGTCCGTAGGGGCAATTTTCGATTATAACAGTCTAATGTGTAATTTAGGGT
TTCGTTGCGGTCTGACCTCTTCCCACAAAAAAATTCGGCAAAGCCCTCTGCCCGCCTGCCCTCTAGAGGTCGACAAATAATGTCGATCTCTACCTCCCTTGAACAGAGGCAGCTCTGTCGGTACTAGAGCATGTTCTTCTCTGCTTTGGTTACAGTATATACCTGAAGTCTGAGTTGGTTTCAGAGAATGTTCGTTTGGT
GCTTTGGACTTGGAAGAACTCTAACATCCAAGTTGAGTTTGGTACACAAACGTCATTGCAGATTGTGTATGTGTAGACTTCTGAAATGTAATCTGGTTTTTCCACAAAGAAACTTCAATATCTGGTTAAGTCTGCCTGGAGTTGTAAAATCAGATATTGAGTTTCTGCAACGATCGTCAATGTCATATTTGGGTATGCCT
TTAACTACATAACCTAATGTGCATACAGAAGGCTTCCTGAATGCTATGTATGTGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAATATGACCTAATGTGCATACAGAAGGGTTCCTTAATACTATGTATATGAAGTTATTGCTCAGAATTGGAAAAGATGATGTGACCTTATTTTTGGTTTGGAAATTTTTTCATTAGGCGTTTACG
ATTTTGATATCTGGCAATGGAGAACATTGTTATCCATCGTATCCAACGTAACGCATCAATCAACACCCTTGGTGATGAGATCCTCATAACTATTCTTGGTAAACTACAGGATCCCATAGACAGAAAGTCGTGGTGCCTAGTCTGCAAGTATTTTTTCCTCTTGGAGGCCAGCTATAGGAAGAAAGTACAACTGATGCGCT
CAGAATTACTTCCGAGGATTTTGAGAAGATACAGCAAGATTGAATGTTTGGACTTATCTCTGTGTGCTCAGATCACAGACGAGGCTTTGGGGCATGTGGCTCATATCATTGGGAATCATTTACTTTCTATCAATCTTTCAAAGCTGTGGACGTTTACGAACTTGGGCCTTGCTCAGCTGGTTGAGAGTTGTCAGTCTTTG
GTCGAAATCGATCTTTCCAATTGCACTGGAATCACAGATTATGATTTAGAAGCCATAGCACATGCTCAGAAGTTGCAATCTTTGAAACTAGTGAAATGCAAGCAGATCACCGACATAGGTCTCGGGTGCATAGCTGTGGGATGCAGTGAATTACAGACTTTGAATCTCAAGTGGTGTGTGGGGATCACAGACATTGGAGT
CGAGCTGGTTGTGGTAAAATGCAAGGATATACGGAATCTTGATCTCTCTTACTTACAGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAA
ATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTG
AGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGTAATTGCGGCATGCTGTACAGAACTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCTGCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAG
TTTGACTATGCTCGGAGAGGGATGCCCTTTCCTGCAACAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCTGAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCCATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGT
ACCGgtacatgttattatttgagtacaccaattacatcgttgtgatagtgtttgtaaattttagaaaatgaacatttaaatatgtttattgaattcttgtgttagcactcagttttcgaactttgaagatgtttgcagcttactagtggaaattgtttatatcagATCTGTTGGAATTGGTGATGTTGGATTAGAAGCAA
TTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGATGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGC
TACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCTGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGGTAGGACATTTCATATTAGGGAGATGCATTTTCTTGGTTCATATGCCCTGGTATATCTGTTGGATGATGACCTTTACAATTGCTAGCTG
Intron 6 GTGAGGCTCA ... TTACTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 72.41 | 32 | 78 | 90 |
| A2 | 62.91 | 51 | 100 | 73 |
| A3 | 75.81 | 30 | 80 | 108 |
| A4 | 69.7 | 25 | 53 | 62 |
| A5 | 67.35 | 24 | 53 | 46 |
| A6 | 72.41 | 12 | 13 | 50 |
| A7 | 74.51 | 39 | 69 | 159 |
| A8 | 73.33 | 20 | 8 | 102 |
| A9 | 82.14 | 20 | 52 | 132 |
| A10 | 76.19 | 30 | 70 | 122 |
>TRINITY_DN43335_c0_g2_i1 from sample A9 / Example spliced isoformGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGGGAGGTACTTCTATCTAATAGG
CGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTT
CTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGC
CAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTGAGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGCAATTGCGGCATGCTGTACAGAGCTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCT
GCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAGTTTGACTATGCTCGGAGAGGGATGCCCTTTCCTGCAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCT
GAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCTATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGTGACGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGA
TGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCCGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGA
TAAATGTCTCTTATTGTCCAATCTCAGATGTTGGGTTGTCAGCATTGGCAAGGCTTAGTTGCTTACAGAATATGAAGCTGGTTCATTTGAAGAATGTAACAGTGAGTTGTTTTGCATCTGCTCTGCTGGAGTGCGAGAGTTTAAAGAAACTCAAGCTTTTTGAAGGCTTAAAGTTTATTTTACCACGAAGTCTAATTGAG
TGCTTGGAAGCCCGTGGGTGCAGTATTCATTGGATGGATAAGTCTTTTATGATTTAACTTGCATATATTGCATAATTATCCAATAATCGAGGTTTTTGGAAAATGTAATATGTATCTGAGAGTTTCTTTGTAGGTACATCTTTTGGCATAGAGAAAGCAAATTCATGAACTCTTCAGTTGTGTCTGAATCTTTTTGTACT
ATTTTATGCTCTTTAGCTCAGATTGCAAAATTTCAGATAGAAGGCATCTTGTGAGATGGAAATAAACAACCTATACTATCATCTATACATTGAAGAGTTTTGGGTTTGTTCCTTAGTGATATATTTTAGCTTACAGACTGGAGGATTTCACAGGTAAACATATTGAATGTGTTTAGTTTGCTGCACTACTTGTGAAATTT
TCTTGCCCAACATTTGGGTTATGGGCCATCTCCAGGTGAAAGAGCAGATTTATACAGTCTTATTTCTGCTTTGTTTTTTAATTTCCCAATATGCTCTTCAAATCACAAATAGTTTCCAACAGGGGCCTTGGATCATGGGCAAGGTTGACAGAGTATTAAGCCATCCACTAGGGTTCCATTCTTGCTGTGGTCTACTGCAC
TTGAAGAGAAAGAGGCTAAGTGCAAGCCTTGAACTATTTTTATATAATATTTATCCTTCCGAATTGGGAACTAAACCGAATTAAGTCTTCTCTTTGTAGTGCAGCACTTTGGAGTGTGTTTCTTGAAGCACTCTCAAGAAATGAAATTCACAAGTAGTTTTCTATTGTTTGAAGTCTGCAAACATCTTTATGCCATTCTT
TAAATGCAACTGCTATAATTTGCAAAGCTTTTATCATAAACTTTTGAGCTTTTTGCAGCATATGACAATTGAATAAATATAGTCGTTGATTTGTCCAAAG
>TRINITY_DN43335_c0_g2_i10 from sample A9 / Example unspliced isoform:GTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGGGAGGTACTTCTATCTAATAGG
CGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGgtgaggctcaactgtgagaaatcttgtttggatttcttcatc
ttctctcaactgagctgggctgaaaatttgggttgcttgcttgccttgtgcaatgtgtaaatctgtttttttagctttaagatacatgggatggcgtggaagagtaatccattgctaggttaaagagaataactcaatttttgtcttgggttttctagaattttgtaatctgatttgggtttaagcagataactgcagtt
atgaattcacatcggtcaaaatcgcatatagtattcgagtttcgatgaaaaacttgatgattttgattttgagctggcaaggcttagggatcaaattgaggtatccactttctcagtgtggcttgggaggtccgtaggggcaattttcgattataacagtctaatgtgtaatttagggtttcgttgcggtctgacctctt
cccacaaaaaaattcggcaaagccctctgcccgcctgccctctagaggtcgacaaataatgtcgatctctacctcccttgaacagaggcagctctgtcggtactagagcatgttcttctctgctttggttacagtatatacctgaagtctgagttggtttcagagaatgttcgtttggtgctttggacttggaagaactc
taacatccaagttgagtttggtacacaaacgtcattgcagattgtgtatgtgtagacttctgaaatgtaatctggtttttccacaaagaaacttcaatatctggttaagtctgcctggagttgtaaaatcagatattgagtttctgcaacgatcgtcaatgtcatatttgggtatgcctttaactacataacctaatgtg
catacagaaggcttcctgaatgctatgtatgtgaagttattgctcagaattggaaaatatgacctaatgtgcatacagaagggttccttaatactatgtatatgaagttattgctcagaattggaaaagatgatgtgaccttatttttggtttggaaattttttcattaggcgtttacgattttgatatctggcaatgga
gaacattgttatccatcgtatccaacgtaacgcatcaatcaacacccttggtgatgagatcctcataactattcttggtaaactacaggatcccatagacagaaagtcgtggtgcctagtctgcaagtattttttcctcttggaggccagctataggaagaaagtacaactgatgcgctcagaattacttccgaggattt
tgagaagatacagcaagattgaatgtttggacttatctctgtgtgctcagatcacagacgaggctttggggcatgtggctcatatcattgggaatcatttactttctatcaatctttcaaagctgtggacgtttacgaacttgggccttgctcagctggttgagagttgtcagtctttggtcgaaatcgatctttccaat
tgcactggaatcacagattatgatttagaagccatagcacatgctcagaagttgcaatctttgaaactagtgaaatgcaagcagatcaccgacataggtctcgggtgcatagctgtgggatgcagtgaattacagactttgaatctcaagtggtgtgtggggatcacagacattggagtcgagctggttgtggtaaaatg
caaggatatacggaatcttgatctctcttacttacagATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATAA
TTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTGAGGGAAATAAGCTTAAGCAAG
TGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGCAATTGCGGCATGCTGTACAGAGCTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCTGCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAGTTTGACTATGCTCGGAGAGGG
ATGCCCTTTCCTGCAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGTTCCTTAAATTATTTAGATATGAAAAAGAGGCTTAATAGTAATAGGGTTATTAGATTAAAAAGTTTTCTCTCATTATCTTCTATTCTTGTGTTTACCATATCTGTTCATGCAGGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCTGAATTGA
TCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCTATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGTGATGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGATGATGCT
ATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCCGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGATAAATGT
CTCTTATTGTCCAATCTCAGATGTTGGGTTGTCAGCATTGGCAAGGCTTAGTTGCTTACAGAATATGAAGCTGGTTCATTTGAAGAATGTAACAGTGAGTTGTTTTGCATCTGCTCTGCTGGAGTGCGAGAGTTTAAAGAAACTCAAGCTTTTTGAAGGCTTAAAGTTTATTTTACCACGAAGTCTAATTGAGTGCTTGG
AAGCCCGTGGGTGCAGTATTCATTGGATGGATAAGTCTTTTATGATTTAACTTGCATATATTGCATAATTATCCAATAATCGAGGTTTTTGGAAAATGTAATATGTATCTGAGAGTTTCTTTGTAGGTACATCTTTTGGCATAGAGAAAGCAAATTCATGAACTCTTCAGTTGTGTCTGAATCTTTTTGTACTATTTTAT
GCTCTTTAGCTCAGATTGCAAAATTTCAGATAGAAGGCATCTTGTGAGATGGAAATAAACAACCTATACTATCATCTATACATTGAAGAGTTTTGGGTTTGTTCCTTAGTGATATATTTTAGCTTACAGACTGGAGGATTTCACAGGTAAACATATTGAATGTGTTTAGTTTGCTGCACTACTTGTGAAATTTTCTTGCC
CAACATTTGGGTTATGGGCCATCTCCAGGTGAAAGAGCAGATTTATACAGTCTTATTTCTGCTTTGTTTTTTAATTTCCCAATATGCTCTTCAAATCACAAATAGTTTCCAACAGGGGCCTTGGATCATGGGCAAGGTTGACAGAGTATTAAGCCATCCACTAGGGTTCCATTCTTGCTGTGGTCTACTGCACTTGAAGA
GAAAGAGGCTAAGTGCAAGCCTTGAACTATTTTTATATAATATTTATCCTTCCGAATTGGGAACTAAACCGAATTAAGTCTTCTCTTTGTAGTGCAGCACTTTGGAGTGTGTTTCTTGAAGCACTCTCAAGAAATGAAATTCACAAGTAGTTTTCTATTGTTTGAAGTCTGCAAACATCTTTATGCCATTCTTTAAATGC
AACTGCTATAATTTGCAAAGCTTTTATCATAAACTTTTGAGCTTTTTGCAGCATATGACAATTGAATAAATATAGTCGTTGATTTGTCCAAAG
Intron 7 GTGAGGCTCA ... TTACTTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 72.41 | 32 | 78 | 90 |
| A2 | 62.91 | 51 | 100 | 73 |
| A3 | 75.81 | 30 | 80 | 108 |
| A4 | 69.7 | 25 | 53 | 62 |
| A5 | 67.35 | 24 | 53 | 46 |
| A6 | 72.41 | 12 | 13 | 50 |
| A7 | 74.51 | 39 | 69 | 159 |
| A8 | 73.33 | 20 | 8 | 102 |
| A9 | 82.14 | 20 | 52 | 132 |
| A10 | 76.19 | 30 | 70 | 122 |
>TRINITY_DN43335_c0_g2_i1 from sample A9 / Example spliced isoformGTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGGGAGGTACTTCTATCTAATAGG
CGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTT
CTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATAATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGC
CAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTGAGGGAAATAAGCTTAAGCAAGTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGCAATTGCGGCATGCTGTACAGAGCTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCT
GCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAGTTTGACTATGCTCGGAGAGGGATGCCCTTTCCTGCAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCT
GAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCTATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGTGACGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGA
TGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGCATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCCGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGA
TAAATGTCTCTTATTGTCCAATCTCAGATGTTGGGTTGTCAGCATTGGCAAGGCTTAGTTGCTTACAGAATATGAAGCTGGTTCATTTGAAGAATGTAACAGTGAGTTGTTTTGCATCTGCTCTGCTGGAGTGCGAGAGTTTAAAGAAACTCAAGCTTTTTGAAGGCTTAAAGTTTATTTTACCACGAAGTCTAATTGAG
TGCTTGGAAGCCCGTGGGTGCAGTATTCATTGGATGGATAAGTCTTTTATGATTTAACTTGCATATATTGCATAATTATCCAATAATCGAGGTTTTTGGAAAATGTAATATGTATCTGAGAGTTTCTTTGTAGGTACATCTTTTGGCATAGAGAAAGCAAATTCATGAACTCTTCAGTTGTGTCTGAATCTTTTTGTACT
ATTTTATGCTCTTTAGCTCAGATTGCAAAATTTCAGATAGAAGGCATCTTGTGAGATGGAAATAAACAACCTATACTATCATCTATACATTGAAGAGTTTTGGGTTTGTTCCTTAGTGATATATTTTAGCTTACAGACTGGAGGATTTCACAGGTAAACATATTGAATGTGTTTAGTTTGCTGCACTACTTGTGAAATTT
TCTTGCCCAACATTTGGGTTATGGGCCATCTCCAGGTGAAAGAGCAGATTTATACAGTCTTATTTCTGCTTTGTTTTTTAATTTCCCAATATGCTCTTCAAATCACAAATAGTTTCCAACAGGGGCCTTGGATCATGGGCAAGGTTGACAGAGTATTAAGCCATCCACTAGGGTTCCATTCTTGCTGTGGTCTACTGCAC
TTGAAGAGAAAGAGGCTAAGTGCAAGCCTTGAACTATTTTTATATAATATTTATCCTTCCGAATTGGGAACTAAACCGAATTAAGTCTTCTCTTTGTAGTGCAGCACTTTGGAGTGTGTTTCTTGAAGCACTCTCAAGAAATGAAATTCACAAGTAGTTTTCTATTGTTTGAAGTCTGCAAACATCTTTATGCCATTCTT
TAAATGCAACTGCTATAATTTGCAAAGCTTTTATCATAAACTTTTGAGCTTTTTGCAGCATATGACAATTGAATAAATATAGTCGTTGATTTGTCCAAAG
>TRINITY_DN43335_c0_g2_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:GTAGAATATAAAACACACAGCTGGTATGTTGATATAACATAAAATAATGTGAGCCAGGAGCCACTGGACATATTTTATTTTTCTTCTGTGTTCATTGTTCAACACATGGAGTTTTGGAATATCAGAATGGTACTCCCTGTTGAACACTTGGACGCAGGAGAAAATATAATCATGTGGGGGAGGTACTTCTATCTAATAGG
CGAAACTGTAAACTGTTTCCCATTTATCGATGGACGGTCAATACTGGAGTTGACATTGATGTGGGAAGCGAACACTAGAGCTCTAATATTGAGAGAGTCGACAAGCATGGAGCCACAGAGATTGCAGAATGAAATTAGAGGCTGCATTCGACGTTGCGgtgaggctcaactgtgagaaatcttgtttggatttcttcatc
ttctctcaactgagctgggctgaaaatttgggttgcttgcttgccttgtgcaatgtgtaaatctgtttttttagctttaagatacatgggatggcgtggaagagtaatccattgctaggttaaagagaataactcaatttttgtcttgggttttctagaattttgtaatctgatttgggtttaagcagataactgcagtt
atgaattcacatcggtcaaaatcgcatatagtattcgagtttcgatgaaaaacttgatgattttgattttgagctggcaaggcttagggatcaaattgaggtatccactttctcagtgtggcttgggaggtccgtaggggcaattttcgattataacagtctaatgtgtaatttagggtttcgttgcggtctgacctctt
cccacaaaaaaaattcggcaaagccctctgcccgcctgccctctagaggtcgacaaataatgtcgatctctacctcccttgaacagaggcagctctgtcggtactagagcatgttcttctctgctttggttacagtatatacctgaagtctgagttggtttcagagaatgttcgtttggtgctttggacttggaagaact
ctaacatccaagttgagtttggtacacaaacgtcattgcagattgtgtatgtgtagacttctgaaatgtaatctggtttttccacaaagaaacttcaatatctggttaagtctgcctggagttgtaaaatcagatattgagtttctgcaacgatcgtcaatgtcatatttgggtatgcctttaactacataacctaatgt
gcatacagaaggcttcctgaatgctatgtatgtgaagttattgctcagaattggaaaatatgacctaatgtgcatacagaagggttccttaatactatgtatatgaagttattgctcagaattggaaaagatgatgtgaccttatttttggtttggaaattttttcattaggcgtttacgattttgatatctggcaatgg
agaacattgttatccatcgtatccaacgtaacgcatcaatcaacacccttggtgatgagatcctcataactattcttggtaaactacaggatcccatagacagaaagtcgtggtgcctagtctgcaagtattttttcctcttggaggccagctataggaagaaagtacaactgatgcgctcagaattacttccgaggatt
ttgagaagatacagcaagattgaatgtttggacttatctctgtgtgctcagatcacagacgaggctttggggcatgtggctcatatcattgggaatcatttactttctatcaatctttcaaagctgtggacgtttacgaacttgggccttgctcagctggttgagagttgtcagtctttggtcgaaatcgatctttccaa
ttgcactggaatcacagattatgatttagaagccatagcacatgctcagaagttgcaatctttgaaactagtgaaatgcaagcagatcaccgacataggtctcgggtgcatagctgtgggatgcagtgaattacagactttgaatctcaagtggtgtgtggggatcacagacattggagtcgagctggttgtggtaaaat
gcaaggatatacggaatcttgatctctcttacttacagATAACAAACAAATGTCTTGCCTCAATTGCACATCTAAATCTTCTGGAGAACTTAGCATTAGTTGGATGTGTTGGTGTGGGTGATGATGGCCTTACCTATCTCAGTAAATCTTTGCAGAGACTTGATGTTTCAAAGTGTCGAAATGTCAGCTGTACAGGAATA
ATTTCCCTTGCAAGTGGTTCCTCACACTTGCGCCAACTTACTCTTGCCTATTGCATACCAGTTACAAATGCACTTCTTGCCAGCTTCCAAAATTTTGATAGATTACAAACAATCAAATTTGATGGCTGTATAATCTCTAGCACTGCACTTGAATCTATTGGGAAAAGCTGCAAGTCTCTGAGGGAAATAAGCTTAAGCAA
GTGCATTGGAGTCACAGATGATGGAATATCTGCAATTGCGGCATGCTGTACAGAGCTGAACAAGTTAGATCTCTCTTGCTGCCGTGATCTAACTGATATTGCTATTAGAGCCGTTGCAACCTCATGTAGATATCTTTCCATTTTCAAGATGGAATCCTGTCGCTTGGTGACAGAAAGAAGTTTGACTATGCTCGGAGAGG
GATGCCCTTTCCTGCAAGAGCTTGACCTTACCGACTGTCACATAAACAATAAAGGATTAAAATCGATTTCTAGGTGCTCTGAATTGATCACATTAAATCTAGGATTCTGCTCAAATATATCTGACGAGGGGATCATCTATATAGGAGCATGTTGCTCAAACCTTCAAGAACTTGATCTGTACCGATCTGTTGGAATTGGT
GACGTTGGATTAGAAGCAATTACTAATGGTTGCCGGAGGTTAAAGAGTATTAATCTTTCCTACTGCATAAATGTCACTGATGATGCTATGAAATCTCTCTCCCGATTGCAAAAACTTCATAACCTTGAAGTTCGAGGTTGTCCTGGTATCTCATCTGCTGGTCTTTCTGCAATAGCTTTAGGATGTAAGCGGATAGTTGC
ATTGGATGTCAAAGGTTGCTACAATATTTATGATGCAGGAATATTGGCAATAGCCGAGTCGTGCCAAAATTTACGACAGATAAATGTCTCTTATTGTCCAATCTCAGATGTTGGGTTGTCAGCATTGGCAAGGCTTAGTTGCTTACAGAATATGAAGCTGGTTCATTTGAAGAATGTAACAGTGAGTTGTTTTGCATCTG
CTCTGCTGGAGTGCGAGAGTTTAAAGAAACTCAAGCTTTTTGAAGGCTTAAAGTTTATTTTACCACGAAGTCTAATTGAGTGCTTGGAAGCCCGTGGGTGCAGTATTCATTGGATGGATAAGTCTTTTATGATTTAACTTGCATATATTGCATAATTATCCAATAATCGAGGTTTTTGGAAAATGTAATATGTATCTGAG
AGTTTCTTTGTAGGTACATCTTTTGGCATAGAGAAAGCAAATTCATGAACTCTTCAGTTGTGTCTGAATCTTTTTGTACTATTTTATGCTCTTTAGCTCAGATTGCAAAATTTCAGATAGAAGGCATCTTGTGAGATGGAAATAAACAACCTATACTATCATCTATACATTGAAGAGTTTTGGGTTTGTTCCTTAGTGAT
ATATTTTAGCTTACAGACTGGAGGATTTCACAGGTAAACATATTGAATGTGTTTAGTTTGCTGCACTACTTGTGAAATTTTCTTGCCCAACATTTGGGTTATGGGCCATCTCCAGGTGAAAGAGCAGATTTATACAGTCTTATTTCTGCTTTGTTTTTTAATTTCCCAATATGCTCTTCAAATCACAAATAGTTTCCAAC
AGGGGCCTTGGATCATGGGCAAGGTTGACAGAGTATTAAGCCATCCACTAGGGTTCCATTCTTGCTGTGGTCTACTGCACTTGAAGAGAAAGAGGCTAAGTGCAAGCCTTGAACTATTTTTATATAATATTTATCCTTCCGAATTGGGAACTAAACCGAATTAAGTCTTCTCTTTGTAGTGCAGCACTTTGGAGTGTGTT
TCTTGAAGCACTCTCAAGAAATGAAATTCACAAGTAGTTTTCTATTGTTTGAAGTCTGCAAACATCTTTATGCCATTCTTTAAATGCAACTGCTATAATTTGCAAAGCTTTTATCATAAACTTTTGAGCTTTTTGCAGCATATGACAATTGAATAAATATAGTCGTTGATTTGTCCAAAG