NA ----> NA
Intron 1 GTGAGGTGTT ... ACAAGTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 16.67 | 75 | 15 | 7 |
| A2 | 23.4 | 72 | 22 | 7 |
| A3 | 19.51 | 66 | 16 | 10 |
| A4 | 33.33 | 60 | 30 | 6 |
| A5 | 26.32 | 28 | 10 | 2 |
| A6 | 20 | 196 | 49 | 16 |
| A7 | 23.55 | 263 | 81 | 11 |
| A8 | 20.96 | 328 | 87 | 33 |
| A9 | 23.51 | 244 | 75 | 24 |
| A10 | 17.41 | 261 | 55 | 23 |
>TRINITY_DN47907_c2_g2_i13 from sample A7 / Example spliced isoformTTCAAGTCTAAAAAATTAATGGCTTTCTATCATCATACCCAAATGTTTCACACTCCATGTAACGAATTATAAAGCGCCATCGTCAGGTGTCGGTGGAGTGACCGGATACCAGAGGTGGAGAAAGTGGAGAAAGCAGAGAGAGAGGTGCTAGTGATTAAGGTTCAGCCCGGTGAGAGAGCAGTGTTGGAATTCAGAAATCA
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>TRINITY_DN47907_c2_g2_i14 from sample A7 / Example unspliced isoform:TTCAAGTCTAAAAAATTAATGGCTTTCTATCATCATACCCAAATGTTTCACACTCCATGTAACGAATTATAAAGCGCCATCGTCAGGTGTCGGTGGAGTGACCGGATACCAGAGGTGGAGAAAGTGGAGAAAGCAGAGAGAGAGGTGCTAGTGATTAAGGTTCAGCCCGGTGAGAGAGCAGTGTTGGAATTCAGAAATCA
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gctgctgcagttggagaattgtgcatgtgtggaccttgactatttatgttttaaattgtgttataaaatttgactttagttccataacctgcaacatctgtgacaaatgagaaaagcactaattattgtttcctataaacaagtacagATTTTTGCAACAGCAGTAAGAGACCTAAAGCCAAATTGAGGTCAAGCATCTG
ACAAGTGATGTGTCCAAAATTGTGACACCAAGAAGCAGGAGCATGAGTCTTGTCTTCTTTTCCAAAAGAAGTATGCTCCTCAGGTTGGATTTGTGGTTGCAACAGCTCATGTGGCCAGAATACAGTTACAGTTGCAAAGGAAAGGGAAAAGTAGCAGGGCAGGGTAGCAGCCTTGAATCAACCTGAATTTGATGTATCTA
TTCATCCAATCTATAGTGTTCTTGGCATCCAGGATGATCATAGTTTTAAAGTTTTTAAATATTTGAGATTGTGGATGTGTTTAAAATGTAACTAATTAAAGATGTTTCAGGGTTCAGAGCTTATAAATGGTTTAAAGCAGGTTTTGTTTTATTGAACACGCATCTCCAGGCTTGATAAACTAGATGGGGGCCTATAAAGT
GCTTTTAGTGAGTTCAGATGAAACTTTAGGTGTCTGGCATGCATGTACTGTTAATGGCATTCTGCCCTGCAATTTAAACACAATAAGAGTGCACAAGTAGCCGAGATGTTATATCAAATCTCTTATTTGGGATAGGAATTTCTTCCTGCCTTTCAGGTCGTGCTTTTGAAACTTCAGGCTATTCTAAAGGTTCTAGCCTT
CAGGTACAATAATCACCCCAGAGATAACGCTTTACATGAGTCTGGAGTCCAGTGCTGGCATGAAATGCATGCCTATGTTCCAAAGTTTTATTTTTAGTTTATTTCTTTGAAATATACTCTGTACCAGGCCCTGCAAATAAATAATACTGCCCTTTGATGCTGTACACTTAAAGTTCTTGGAGTTCCAATAGAAAGTCTGC
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TGTCAGAGCTTATAAATAGTTTAAGGCAGGTTGTTTTTATTGCATACGCATCACCAGGATTGAAAAACTAGATGTGGACATTTGAAGTGCTTTTGGCGAATTCAGATGAAACTTTAGGTGTCTGGCATGTGTGTACTGTTTTGGCATTCTGCCCTGCAATTTAAACAATGATAAGAGTGCACAAGTAGTCGAAATGTCAA
TCAAATCTCTAGTCTGGGACAGGAATTTCTTCTTTTTCTTCAGGTCATGCTTTTGAAACTTAAGGATATTTTAAAGGCTCAAGTCTTCAGGCACAAGAACCACCCCAAAGAAATAACAGTTTACGTGAGTCTGGAGTTGAGTGCTGGCATGAAATGCAAGGCTATGGTCCAAAGTTTTCATTTCTAGTTTGTTTCTTTCA
ATATATACTGTTCCAGACCCAGTAAATAAATAATACTTCCCTTGATGATGTACACTCGACGTTTTTGCAATCCTGGGGGATGTAATGGTGTTCAGAACTTGGCTTTTTCATGATAGGTGCTCAAGTCATCATAATCTGCATGAGCTTGAAAACAACATGTTAGAGATGGTCAAAGCAAATACTATATATTTTTTTGGGAT
TGAACAGAATTCAGAAAGGCAAAATTGCCTATAAATATTATGAAGTGGAATATATTGCAAGTAAATTTATCC