NA ----> NA

Intron 1 GCTTTGTATT ... GGGCTGGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	40.82	87	39	81
A2	47.73	121	73	148
A3	51.43	68	48	96
A4	43.61	139	64	151
A5	50.72	51	35	70
A6	47.86	140	83	174
A7	51.66	219	154	314
A8	50.21	181	124	241
A9	54.22	141	101	233
A10	46.06	171	91	201

>TRINITY_DN116582_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

TGGAAGTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACGTTTTATGCATCCATGTTGGGCTGGAAGTCAATTTGCAAGCTCTGTATTTAGTTATGAGTTCTTTAAAAAAATGTTTTATGTATCCATGTTGGGTTGGAAGTCGATTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACAT
TTTATGCATCCATGTTGTGCTGGAAGTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACGTTTTATGCATCCATGTTGGGCTGGAAGTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTATTGTGCAGTTATGAGTTCTTTAAAAAGAGGTTTTATGCATCCATGTTGGGCTGGAAGTCAACTTG
CACGCTCTGTATGCAGTTATGAGTTCTCTAAAAACGTTTTATGCACATTGTTGGGCTAGAAGTCGATTTGCAAGCTCTCTATGCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACGTTTTATGCATCCATGTTGGGCT

>TRINITY_DN116582_c0_g1_i5 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TGGAAGTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACGTTTTATGCATCCATGTTGGGCTGGAAGGAGAGCCTTCACGCAGTGGGCATAGAGCATGGATTCGAAGGGAAACGTTACAGCTCTGTTTTCTTCCTTAGTTTGAATGAAAACACCTTTGGAACCTCTGTATGACGGATGGATCTTGAATGA
AAATGTTTTGGCTTTTCAGTAATGCCCATTTAGTTTGAAAACGTTTTAGTTCTGTATTTTTCTGCCTGGAATTGACATGAAGGTGTTTGGGCATCTCTGCTCTTTGATGTGTGTTGGAAAACGATTTTAACCTCTGTATGTCTACAATGAAGTTTGAAAATGTTTTGGTATTCATCTGTGGGTTCTGGAAAACGATTTTA
ATCAATTTGCAAGCTCTGTATTTAGTTATGAGTTCTTTAAAAAAATGTTTTATGTATCCATGTTGGGTTGGAAGTCGATgctttgtattcagttatgagttctttaaaaaacgtttcatgcatccatgttgggctggaagTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACATTTTATGCATCCATGT
TGTGCTGGAAGTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACGTTTTATGCATCCATGTTGGGCTGGAAGTCGATTTGCAAGCTCTGTATTCAGTTATGAGTTCTTTATTGTGCAGTTATGAGTTCTTTAAAAAGAGGTTTTATGCATCCATGTTGGGCTGGAAGTCAACTTGCACGCTCTGTATGCA
GTTATGAGTTCTCTAAAAACGTTTTATGCACATTGTTGGGCTAGAAGTCGATTTGCAAGCTCTCTATGCAGTTATGAGTTCTTTAAAAACGTTTTATGCATCCATGTTGGGCT