NA ----> NA

Intron 1 GTAATCAACT ... TTTGCAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	85.1	9	49.7	53.7
A2	89.63	4	30	40.7
A3	92.69	5	59	68.7
A4	85.6	7	43	42
A5	84.17	5	28.7	25.3
A6	100	0	7.3	6.3
A7	77.12	4	15	13.3
A8	60	4	10	6
A9	88.73	1	12	8.7
A10	90.63	2	21	19.3

>TRINITY_DN110860_c1_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform

AAACATAAAAAGATAAAAAGCTCAGCAGTTGCAAACGTTTCTATCCTTTCGAATTCTCTCAGAGGTAGTTTCCTGGAGCAGTAGCTATTCTAAGAAGCTGAAGCCGAAGCCAAAGCCAAAGTCAGAACCCTATTAGCAGCAAGAGCCCAAGCAAGTACGCTTCCTCAGATCGATCGATTTTATGTTCAAATACACAACTA
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AATATAGGTAAACAGTGGTTTACAGATTTGATTTTCTTTGGTTTATTTTGAAATTTGAATGAA

>TRINITY_DN110860_c1_g1_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:

AAACATAAAAAGATAAAAAGCTCAGCAGTTGCAAACGTTTCTATCCTTTCGAATTCTCTCAGAGGTAGTTTCCTGGAGCAGTAGCTATTCTAAGAAGCTGAAGCCGAAGCCAAAGCCAAAGTCAGAACCCTATTAGCAGCAAGAGCCCAAGCAAGTACGCTTCCTCAGATCGATCGATTTTATGTTCAAATACACAACTA
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CTCTGCCAGTTCTTGCTTTCGGATAACCAGTTTAACCCTCACAACACCTTCGGGTCCTGTATATTAAGACACGAAACCAGTTTAACCCTCACAACACCGCTGGTTTCGACGAGCTCAAATCTTTTGTTTCTTCGCTTTTGTTGCCGCGAGTCTCTCGTTTTTTTATATCGCCGGCACTAGAATCCGGATGAAGGAGATGG
TTAGGATCATGAGGAGGCTGCTCGTTTAGGCGCCCAACCTGTTGAGGAACCGTGTGTTGCCCATGCTGACCTGAAAGAGAATTATCCTGGAGCTTTGTATTGTAAAACCCTCCCGTTAATTTTCATGGTCCTCAGGAACTCACCGCTGGTTTCGGTCGAAACCATTTTGGAGCTAGGCGGCATATAATTGCCCATTTTTA
CTTTTGACTGTTGCGGGATCGAAACTCCTGGGACGTATGATTATCAGATACAGTTCCCTGAGAGAATTAAACCAGATCTAGTTGTGAACCATACCATAGCCCAACAAACTCAGTTGCCCATTCTGTTACCCACTAAAGCAAATATTATTAATCTGGCGGACTCAATACCAATGTAAGCTTCTGTTCGTCTATCAATGGCA
ACCTTCCAGCCTGATCAGTGTTTCAATACCAGCGTAAGCTTATGTTTGGGTGTAATTAAAAACAGAACGGTAATGTCGTTTACAATATAAGAACTAGAACTGACCTGAGACAAATATTATTCTTAGGTTATGTGAGGGTGGTTGATGATAAGCATTTGGGCATTTTTTGTCATTTTTTGTTTTTAGGTTTTTGTGAGTAG
TCTTGGAATGATGTTAACGATGGATTAACTCAACCTCATAAATGTAAATGGACGATTAACGCAACTCTAGAATATAGTGGAGGCTAAACCTACCCTACCGCAAACAGAGGTCACAAGAAGAAGAGTGCAATCTGAGAGATGATAGAGAATCCTGCCTTGATAGAGACTACTGTAGAGGAGATCGACATTCATATATTGGA
GGTAATCAATTA