sp|Q8RXT5|AIPP3_ARATH ----> ASI1-immunoprecipitated protein 3
Intron 1 GTAAGTCAGA ... TCCTGTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 68.85 | 19 | 42 | 6 |
| A2 | 62.32 | 26 | 43 | 1 |
| A3 | 65.14 | 38 | 71 | 2 |
| A4 | 63.16 | 28 | 48 | 1 |
| A5 | 62.16 | 14 | 23 | 1 |
| A6 | 73.79 | 222 | 625 | 9 |
| A7 | 74.95 | 114 | 341 | 21 |
| A8 | 68.78 | 286 | 630 | 15 |
| A9 | 69.57 | 154 | 352 | 4 |
| A10 | 76.61 | 40 | 131 | 6 |
>TRINITY_DN48579_c2_g2_i5 from sample A7 / Example spliced isoformTTTACGGCCAATTGCAAAGCCTCGAGCTTAAGACCTCCAGCGTTCGAATCTCGTGGCCTGCATCTTTTCAATCTGTTCTGTCCCAGTTGAAAATATTCCTCTGGAGTTCATATTGCATAACTTTTAGTTGATCTGGGAGCAATTTCGCGAAATTTTGTTCAATGAAAGGCGGATTTTGGTATTCCTTTTGATGAGATTTG
TGCGGCCGATGGACGAGGTCTCGCGTTCGAGTCGCGGGAGCAGCAATTATGCCGTCGTGAGATTTGAGGTAGATGTTGAGCTTTTACCTGCCGTGCTTGAGAGAATACAAGGTGATGGAAGACGGGACGAAATGGAGCTACAGCCGCGGCGGAGAGCTTGCAAAGGATGGGCGGAAGATCAATGTTGGAGACTGTGCCCT
TTTCGAGGCCGAGAATGCACCTCCTTTAATTGGAATAATTCGATCCTTCTCAGTAGACACCAAGGGTCAAGCCAAGGTGAGTGTAAACTGGCTCTATAGATCCCCAGATATCAAGCTGGGGAAAGGAGTTTTGCTAGAAGCTGCGCCAAATGAGATATTTTATTCATTCCACAAGGATGAAATAGCAGCCAAATATTTGC
TTCATCCATGTAAAGTTGCATTTCTCAGGAAAGGCATTGAACTTCCTTCAGGCATATCTTCATTTGTGTGTAGGAGAGTTTATGACACTACAAACAGGTGTTTATGGTGGTTAACTGATCAAGACTATACTGATGAACACCAAGAAGAAGTAAATAAGCTATTGGATAAGACGAGACACGAAATGCATGCAGCAGTGCAG
TCAGGAGGGCCCTCCCCTAAAGATTTGAATGGCCCAGCAACAACTTTAAAAACTAGTTCAGATAGCACACAGAATACTTCATTTCCTTCTCAAGTTAAGGGGAAGAAAAGGGAGCGTGCTGATCAGAATACAGATCCTCTTAAACGAGAGCGTTTTTCAAAGTCAGATGGCAGTGATACAGGGCATTTCAAACAAGAGTG
CATTATGAGGCCTGAAGAAGTTGCCAGAATCACTAACAAAGATGGATGCCTCATCAACTCAGAAGCTGTTGGGCAGCTTGTGCATCTAATGCAGCTGGAGAGAAGCGATGATGGTAAGAAAGGAATTGATTTGGCTTTGTGGCGTACATCCCTTGTAGGTGTGATTGCAACCACCGATCAAGATGACTGTCTCAGTCAAT
TTGTGCAGCTCAAGGGCTTGCCCATTTTGGATGATTGGCTTCAAGAAGCCCACAAAGGAAAGACTGGAGATGCAGGCAGTCCAAAGGAGGGTGACAAAGTTGTTGAAGAATTGCTGTTAATGTTGCTGCGCGCTCTTGATAGACTACCTGTAGATCTTGATGCTCTGAAGACTTGTAATGTTGGGAAATCTGTAAACCAC
TTGAAAAATCACAAGAACCAGGAGATTCAGAGGAAGGCTAGGATCTTAGTTGATACATGGAAGAAACGTGTCGATGCAGAAATGAAGAACAATGACACAAAGTCTGGATCAAGCCAGGGAGCATCTTTGCCCTGTAAGCAGGCTACTGGCGAAGTTGCTTATACTCATGGTGGCAGGCGTTCCGGATCTGCTGAAGCTGT
GAAAAACTCAACACCATTAAACTCTACTGCAAAAACAGTCTCAAACAGATCAGGCCAGACAGATATTCTATCAAGATCAACATCTGTCCCCTCAGGTTCTGGCAAGGTTTCTACATTGCTCTCCTCAACCATTAGCACCAAGGATTCTCATTGTAAGTTGACCATGTCGAGTGGCACAAACGAGTTTCCGGTGACTTCAA
TTAAGGAAGAGAAAAGTAGCAGTTCCAGTCAATCACAGAATAACAGTCAGTCCTGGTCGAGTGAGCCTGGAAAGGCTGCAGGTTCAGTTTGGAAAGAGGATGCTAGGAGCTCTACAGCAGGTTCTATGAGTGCTAAAGGCTCAAGTTCGGGATCACGTCACAGGAAATCAAGTAATGGAGCTTTGGGATCTGGTAAATCA
GGATGCCAGAAAGAGGCCAGTGGAGGGAAGCTAATATGGAGTAAAAGTGCAACGTGTGAAAAGGCATCACAATCGTGTCACACATCTGACAAGGCAATAGATAATTCCCGTGGGGATAATACAAACAGTCCCAGACTGATAGTTAAACTTCCCAACGCTGGACGCACTCCAGCTCCATGTCCCAGTAGTGGGACAGTAGA
GGACATTGTCATCCCAGCAAGTAGAGGATCTTCTCCCATTATCTCTGATAAACATGATGCAAGTGATGCAAGAACAAAAGTGAAGATTGATGTTTCTCATGCTAATAGTGTCCCAGAGGTTAATACTGAATCATGGCAGAGCAATGAGGTTAAAGATGTTTTCACAGAAGGGGATGATGGAGATAGATCATCTGCTGCCA
TTCCAAATGAAGAGCGTAGCAGAATTGGTGAAGAAATTGAGAAAACATCGGAAATATCTAAAATGGCTCCATCATCAGAGTCTGGCAAGGAGAATGATCCATCAAAGGGTCTGATTGAAGTAGAAACTGTTAAGACAAGTGAGCGAGTTGGCTTTGCAATTGTTTCAAAGAAGAGCTGCTCACAACTTTCTAATGCAACT
GTAGGTGATATGGATGATGGGGGTATGAAGCTACTGGTAAATCTGGCAGCCACTGAAAATTCCAAGGACAGGCAAGTGCCTGTTGTTGTCAGTGAAAGATGTTCCTCAGCAGCAGGAGAGGGTAGCCTGGATGAGTCTACAATAAGGTGCTCTGTTGATAAAATCCATTCTAATCCTAGTGATCATGCAGATGACAGAAG
TACCATTTGCATAAAGGAAGCGAAGGAACTTACTGTTGCCAGGGGGAGTCCAGATGTTTCCAGCTATGACTTGTTGAATAAGATTCAGAAAATTGGAATGCCTGTTCCTCAGAAAGGCATGCCTGACATCCCCAAGGCTTTAGAGCACCCTACTAGTGAGGATTCAGAGGATTTAAACTCTTCTTTAGATGGCATTGGCA
AGGTTCCTGTCTGTCCACGCATGCCCCCTGAACATAAATTTGCTGGAAAGAGGAAAGGCATTTCCTCCAATCAAGAGGTGGAGCACTGTACAGAACATAGCTCTGTTCCAGTTGGGAAACTAGGTGAAGCAGTGAAAGAGATGGTTTCTGACGCACTAACAGAAATGGCTTGTGTTTCTGGAAAGAGGACAGAGGATGGG
TTAAATGCATCCAAGATGAGTAAAGATGATGGTGAACAAGAAGCTCAAACAGATGTGTTTGCTGGTGAAGTTAGATTGGACAGAGATATTAAAGATAATAGTGCAGATGATCAATTGATAGTCATGGAGCATTGTGCAGGTGCAGGGACCCTTGATAAAACAGTGGTGGTTGCTTCCCCGGCGTTGAAAGAAGTTGAGCA
AGAGGTGGCTGTAGATAGCAAATCTGTTCTGAACATGGCTTCCTTTAATGATACTAGCAATAAAAGCTCAGCCTATAACCTCAGAAGTGACCAAGTAAGAGATAGTGACCTACAAGATGACCTACAAGATGGTAAGCAACTGCAAAATTCTGTGAAGGTTGAAGACAGGCAGCAAGACATGGGTGTTGATAATCATCATC
TTCGTAGCACAAAGAGCATTGCATACTTGGATGATAGTCAAAAAACTGTCACCGAAAAAAGAGAAGACATGGAGGTAGAAAAAACTGCAGGAGCTGCAGATGGAGAAGAAATAAATCAGACAAGTCAAGTTCAAGTTGGCATCTTCAAGAAAATTGCAGACATACAGACAGGACCAGATTCAGGTAAGTGTGAAAGTGAA
AGATGTGATTGTAAGGAGGAGTGTTTACCTTCCAGTCATCCTGCCTGTCCAGCAATTTCTGATGCAGAAGCAGAAAAGAAGCAGATTGCAGACTCTACAATACACAAAGGGCATGCAGGTATAGTGGATGCTGATGACAAGACTATAACAGAGATATTGGTGGATACCACGGGTGTTGTTGGAGCCAGTGACACAAGTGT
TAAACTTGATTTTGACTTAAATGAAGGTTTTCCTATGGAAGACACAAATCAAGATGATGCAGCAGCTTCTGCTCTGTCTATGGTTATTTCTAGTGCTTCAGATACCCTTATATCAAAATCCAGTGGGTTAGCAACGCCAATTGCAGTGGCCGCTAAAGCAAAAGGGCCTTTGATACCTCCGGCCAGTCCTTTGCGGGTCA
CAGGTGAGCTAGGCTGGAAAGGATCTGCAGCAACAAGTGCTTTTCGGCCTGCCGAACCTCGAAGAACTCCTGAGAGGCAACATGTCACTTCTGAAGGTCTGCCCTTGGATGCTGCAATCAGTGCAATTGCCGGTACAAGTGGCAATCAAAGTCGTCCCCATTTAGATATTGATCTTAATGTGCCAGATGAAGGTATAGTA
GAAGACGGTTTGATGACTTGTTCTTCCTCTCAAATTTCCGCACGAGTGACAAGTTCAGAGCTTGCCACTGTAAGTGGTCATGATTTTGTGCTTTTGACAAGGGAACTGTCTGCTCCTAGTGGGTCTGCTAGTGCTGGAAAGCTAGATTTGGATTTGAATCGTGTTGAGGAGTGTGAGGATACTGGACCAGTTAATACTGA
AGTTTTAGGTTCTTCATTAAATTTTTTTGCAAATGGTTTTTCTAATGGGGAGTCACAAGTGCCAAGGGGTTTTGATTTGAACGATGGACCTTCTCTAGAAGATGCAGTGGTTGAACCTGGTCCCTGGAATTCCAATGTCAAGACCAAAGGGAACTCTTGTCTCCCATCATCTGGCTGGAGAATGAATGGGGATGTGTCGA
ACTTAACATCATGGTTGGCTCCAGGAACTTCTCATCCAGGTCTTTCTATTCACCCATATCCTTCTGATGTAACTGAACGGTCTTACCCAGCTGTTGCTCCAGGTGCAACACCGCATGTTTTGACTTCAGCATCTGGACCTACATACAATTGTGATCCATATAGAGGGACAGTACTTACGTCAGCTCCTGCTGTTGCATAC
CCAAATACACAACCTGCATTCCCATATGGTGGACTTTCTTTTGGTTCAAATTTTTCAATGACTTCCACATCCTTCTCAGGAGGGCCAGCTTCTTCGTATGGAGATTCCTTAGGAACATCATGTTTTTCTGCAGTTCCCTCACAACTTGTTACTTCAGGGGCAGTTTCGTCTCCAGGTGTAAGGCCCTATATGATGGGTCT
CACTGATGTTTCTGGCATGGAAGGCACTCGCAAATGGCCAAGACCAATTCTTGATTTAAATGCAGGTCCTGGAACAGTTGATTTAGAAGTTAGAGATTCTAAGCAATTTGCCATTGCTGACAGTTGGGTTTCACCAGATGGTCAGACAAGATCCTTTAACCAGACAATAGCCTCAGCAGTACTGCCATCGAAGAGAAAAG
AACCTGAAGGAGGCTGGGATTCCCATTCTATTGGATTCGTCCAGTCTCCATGGCAATAACCTTTTTCTCATTTTTTAAGCTGTCCTATGGAGGAACTTGCCACAATTTCAGATTATCATTGGTTAATTTTCACATGGCTGTGGTTTGTAAGGGATCAGAATTTCCCACATCATTACATCTCGTGCAGAGAATATAATGTG
ACCAATTGTTGTATGGCAGTTGCTTCACGATCTAAAGCACCCTGCTTCTGTTCTCTACATACAGTTGCTTCACGATCTAAAGCATCCTGCTTCTGATCTCTACATGTCCTTCTGAGTTGTATCAAATTCCAAGGTATCAAAATTTGGAAGTATTTTATGGAGTCTTATTCATGGCTGCTGCTCTTACTAGATTTGTTCGG
AATCGAAGCATAGTTTACATCCAGGCTGTGAAGACCACAAAGAATAGATTTCATTGGTGCAATATCGCAGTTGCCTATGTGTTCTTGTCTGATATTCTCCAATAGCTTTTGGCTCAAGGAGAAGGTCCTATCACTACGTTACCTTTCACAGGGTACCATTTAATATTCTCAATCATGCCTGTTGTGTTTTCCTGTCTCCA
TACATTTCTCTTGTTTATGTTATATGATTTACTGTTTTGGTACAAGTTCCTTGAATATCCTTTCTTCGGACAATTTGGAAAACACGAGGTGAGTTAAATGGAGAAGAACGGGAAGGGGATGGATTGCCTTTTGGAACAATGTTTCATTTCCGGAAAACAGAGTTAATAAAATATATAATTTTCTATGTTTTTGCGGATTT
ATCTTGTGGGGGTGACATTCTTGGAAGGAGTTAAAGAGAGCGATTTATCTCATTAAAAAATTTCAACGACATTGCTTAATTTCTATGAAATGTATTTATATTTTGATTCCTGATTACAAC
>TRINITY_DN48579_c2_g2_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:ACTCCGCATTTTCCATCTCCCTCAGCTCGTTGAAAACCTAAGAGAAAGGAGAAGATAAAACATTGTGAATAGGTCGCCGAATCCACCGCCAAATCGGCTATTTCTCCCTGGATCTGTCCTCGAGTCATCGTGCAGATCAATTCAAGCCGTTTTTCGAAGCTCGCCGTTGAAAATTTGGCCCATTTTGGGGATTTAATCAA
ACCCTACCCGCGTAGCAGAGTTTCAGAGACGATGTACTGTTTTTGCGTCCTCGGCACGGCAGAAAATATTAAGAACCGAGGATTTTGAAGAAATTTACCGTCGACGATATTTCGAAGCTTTAGCACGGATTTTTGCAAGAGAAATCTCAGAAATCTTGCCTGAACGGCATATTTTTGAGGCCCGTGAAGAAATTTGAGAC
CCGATCAGGTTTTGAAAGCTTCCCCGCTGTTTTTCCCGTCAGGAAACCTTAATAATCTCGAACTTACGCGGCTCGTTTTGGGATTCCCGTAGAAATTTGTGTGCACGTCGTAGTTTCTGAACCATTTGTGAAATTTCACGAGAATCGGTGTGATCTAGCAGTTGCAGCAAAGAATGGACGCTATGAGGCCGGGAAACGGA
ACGAAAACTTAAGAAGGTTAATGGAAAAAAATAAATAATTGCTGTTCCTTTAAAGGAGAAAATTGGCAAAGATGCTAGGCTATGCATGGGCGACAGAGTGAAGAGCGACAACGGCAGCGGCACATGTTGCCTGTCCCTGGTCACGGTACAGTTGGCGATTCTTCCATTATCAAGTTTTTTTCTAAGGATGGCCGTAAAAT
CAGTATTGGAGATTGTGCACTCTTTCAGGCTGGTAATGCACCGCCTTTCATTGGGATTATTCGTTGCTTGACTTCAGATAAAGAGGGTCACGTGAAGCTAAGTGTCAACTGGCTTTATCGACAAGCTGACGTTAGGCTAGGCAAAGGGATTTTGCTTGATGCTGCCCCGAATGAGGTCTTCTATTCATTTCACAAAGATG
AGATATCAGCTGCCTCATTGCTTCATCCATGTAAAGTTGCATTTCTCAGGAAAGGCATTGAACTTCCTTCAGGCATATCTTCATTTGTGTGTAGGAGAGTTTATGACACTACAAACAGGTGTTTATGGTGGTTAACTGATCAAGACTATACTGATGAACACCAAGAAGAAGTAAATAAGCTATTGGATAAGACGAGACAC
GAAATGCATGCAGCAGTGCAGTCAGGAGGGCCCTCCCCTAAAGATTTGAATGGCCCAGCAACAACTTTAAAAACTAGTTCAGATAGCACACAGAATACTTCATTTCCTTCTCAAGTTAAGGGGAAGAAAAGGGAGCGTGCTGATCAGAATACAGATCCTCTTAAACGAGAGCGTTTTTCAAAGTCAGATGGCAGTGATAC
AGGGCATTTCAAACAAGAGTGCATTATGAGGCCTGAAGAAGTTGCCAGAATCACTAACAAAGATGGATGCCTCATCAACTCAGAAGCTGTTGGGCAGCTTGTGCATCTAATGCAGCTGGAGAGAAGCGATGATGGTAAGAAAGGAATTGATTTGGCTTTGTGGCGTACATCCCTTGTAGGTGTGATTGCAACCACCGATC
AAGATGACTGTCTCAGTCAATTTGTGCAGCTCAAGGGCTTGCCCATTTTGGATGATTGGCTTCAAGAAGCCCACAAAGGAAAGACTGGAGATGCAGGCAGTCCAAAGGAGGGTGACAAAGTTGTTGAAGAATTGCTGTTAATGTTGCTGCGCGCTCTTGATAGACTACCTGTAGATCTTGATGCTCTGAAGACTTGTAAT
GTTGGGAAATCTGTAAACCACTTGAAAAATCACAAGAACCAGGAGATTCAGAGGAAGGCTAGGATCTTAGTTGATACATGGAAGAAACGTGTCGATGCAGAAATGAAGAACAATGACACAAAGTCTGGATCAAGCCAGGGAGCATCTTTGCCCTGTAAGCAGGCTACTGGCGAAGTTGCTTATACTCATGGTGGCAGGCG
TTCCGGATCTGCTGAAGCTGTGAAAAACTCAACACCATTAAACTCTACTGCAAAAACAGTCTCAAACAGATCAGGCCAGACAGATATTCTATCAAGATCAACATCTGTCCCCTCAGGTTCTGGCAAGGTTTCTACATTGCTCTCCTCAACCATTAGCACCAAGGATTCTCATTGTAAGTTGACCATGTCGAGTGGCACAA
ACGAGTTTCCGGTGACTTCAATTAAGGAAGAGAAAAGTAGCAGTTCCAGTCAATCACAGAATAACAGTCAGTCCTGGTCGAGTGAGCCTGGAAAGGCTGCAGGTTCAGTTTGGAAAGAGGATGCTAGGAGCTCTACAGCAGGTTCTATGAGTGCTAAAGGCTCAAGTTCGGGATCACGTCACAGGAAATCAAGTAATGGA
GCTTTGGGATCTGGTAAATCAGGATGCCAGAAAGAGGCCAGTGGAGGGAAGCTAATATGGAGTAAAAGTGCAACGTGTGAAAAGGCATCACAATCGTGTCACACATCTGACAAGGCAATAGATAATTCCCGTGGGGATAATACAAACAGTCCCAGACTGATAGTTAAACTTCCCAACGCTGGACGCACTCCAGCTCCATG
TCCCAGTAGTGGGACAGTAGAGGACATTGTCATCCCAGCAAGTAGAGGATCTTCTCCCATTATCTCTGATAAACATGATGCAAGTGATGCAAGAACAAAAGTGAAGATTGATGTTTCTCATGCTAATAGTGTCCCAGAGGTTAATACTGAATCATGGCAGAGCAATGAGGTTAAAGATGTTTTCACAGAAGGGGATGATG
GAGATAGATCATCTGCTGCCATTCCAAATGAAGAGCGTAGCAGAATTGGTGAAGAAATTGAGAAAACATCGGAAATATCTAAAATGGCTCCATCATCAGAGTCTGGCAAGGAGAATGATCCATCAAAGGGTCTGATTGAAGTAGAAACTGTTAAGACAAGTGAGCGAGTTGGCTTTGCAATTGTTTCAAAGAAGAGCTGC
TCACAACTTTCTAATGCAACTGTAGGTGATATGGATGATGGGGGTATGAAGCTACTGGTAAATCTGGCAGCCACTGAAAATTCCAAGGACAGGCAAGTGCCTGTTGTTGTCAGTGAAAGATGTTCCTCAGCAGCAGGAGAGGGTAGCCTGGATGAGTCTACAATAAGGTGCTCTGTTGATAAAATCCATTCTAATCCTAG
TGATCATGCAGATGACAGAAGTACCATTTGCATAAAGGAAGCGAAGGAACTTACTGTTGCCAGGGGGAGTCCAGATGTTTCCAGCTATGACTTGTTGAATAAGATTCAGAAAATTGGAATGCCTGTTCCTCAGAAAGGCATGCCTGACATCCCCAAGGCTTTAGAGCACCCTACTAGTGAGGATTCAGAGGATTTAAACT
CTTCTTTAGATGGCATTGGCAAGGTTCCTGTCTGTCCACGCATGCCCCCTGAACATAAATTTGCTGGAAAGAGGAAAGGCATTTCCTCCAATCAAGAGGTGGAGCACTGTACAGAACATAGCTCTGTTCCAGTTGGGAAACTAGGTGAAGCAGTGAAAGAGATGGTTTCTGACGCACTAACAGAAATGGCTTGTGTTTCT
GGAAAGAGGACAGAGGATGGGTTAAATGCATCCAAGATGAGTAAAGATGATGGTGAACAAGAAGCTCAAACAGATGTGTTTGCTGGTGAAGTTAGATTGGACAGAGATATTAAAGATAATAGTGCAGATGATCAATTGATAGTCATGGAGCATTGTGCAGGTGCAGGGACCCTTGATAAAACAGTGGTGGTTGCTTCCCC
GGCGTTGAAAGAAGTTGAGCAAGAGGTGGCTGTAGATAGCAAATCTGTTCTGAACATGGCTTCCTTTAATGATACTAGCAATAAAAGCTCAGCCTATAACCTCAGAAGTGACCAAGTAAGAGATAGTGACCTACAAGATGACCTACAAGATGGTAAGCAACTGCAAAATTCTGTGAAGGTTGAAGACAGGCAGCAAGACA
TGGGTGTTGATAATCATCATCTTCGTAGCACAAAGAGCATTGCATACTTGGATGATAGTCAAAAAACTGTCACCGAAAAAAGAGAAGACATGGAGGTAGAAAAAACTGCAGGAGCTGCAGATGGAGAAGAAATAAATCAGACAAGTCAAGTTCAAGTTGGCATCTTCAAGAAAATTGCAGACATACAGACAGGACCAGAT
TCAGGTAAGTGTGAAAGTGAAAGATGTGATTGTAAGGAGGAGTGTTTACCTTCCAGTCATCCTGCCTGTCCAGCAATTTCTGATGCAGAAGCAGAAAAGAAGCAGATTGCAGACTCTACAATACACAAAGGGCATGCAGGTATAGTGGATGCTGATGACAAGACTATAACAGAGATATTGGTGGATACCACGGGTGTTGT
TGGAGCCAGTGACACAAGTGTTAAACTTGATTTTGACTTAAATGAAGGTTTTCCTATGGAAGACACAAATCAAGATGATGCAGCAGCTTCTGCTCTGTCTATGGTTATTTCTAGTGCTTCAGATACCCTTATATCAAAATCCAGTGGGTTAGCAACGCCAATTGCAGTGGCCGCTAAAGCAAAAGGGCCTTTGATACCTC
CGGCCAGTCCTTTGCGGGTCACAGGTGAGCTAGGCTGGAAAGGATCTGCAGCAACAAGTGCTTTTCGGCCTGCCGAACCTCGAAGAACTCCTGAGAGGCAACATGTCACTTCTGAAGGTCTGCCCTTGGATGCTGCAATCAGTGCAATTGCCGGTACAAGTGGCAATCAAAGTCGTCCCCATTTAGATATTGATCTTAAT
GTGCCAGATGAAGGTATAGTAGAAGACGGTTTGATGACTTGTTCTTCCTCTCAAATTTCCGCACGAGTGACAAGTTCAGAGCTTGCCACTGTAAGTGGTCATGATTTTGTGCTTTTGACAAGGGAACTGTCTGCTCCTAGTGGGTCTGCTAGTGCTGGAAAGCTAGATTTGGATTTGAATCGTGTTGAGGAGTGTGAGGA
TACTGGACCAGTTAATACTGAAGTTTTAGGTTCTTCATTAAATTTTTTTGCAAATGGTTTTTCTAATGGGGAGTCACAAGTGCCAAGGGGTTTTGATTTGAACGATGGACCTTCTCTAGAAGATGCAGTGGTTGAACCTGGTCCCTGGAATTCCAATGTCAAGACCAAAGGGAACTCTTGTCTCCCATCATCTGGCTGGA
GAATGAATGGGGATGTGTCGAACTTAACATCATGGTTGGCTCCAGGAACTTCTCATCCAGGTCTTTCTATTCACCCATATCCTTCTGATGTAACTGAACGGTCTTACCCAGCTGTTGCTCCAGGTGCAACACCGCATGTTTTGACTTCAGCATCTGGACCTACATACAATTGTGATCCATATAGAGGGACAGTACTTACG
TCAGCTCCTGCTGTTGCATACCCAAATACACAACCTGCATTCCCATATGGTGGACTTTCTTTTGGTTCAAATTTTTCAATGACTTCCACATCCTTCTCAGGAGGGCCAGCTTCTTCGTATGGAGATTCCTTAGGAACATCATGTTTTTCTGCAGTTCCCTCACAACTTGTTACTTCAGGGGCAGTTTCGTCTCCAGGTGT
AAGGCCCTATATGATGGGTCTCACTGATGTTTCTGGCATGGAAGGCACTCGCAAATGGCCAAGACCAATTCTTGATTTAAATGCAGGTCCTGGAACAGTTGATTTAGAAGTTAGAGATTCTAAGCAATTTGCCATTGCTGACAGTTGGGTTTCACCAGATGGTCAGACAAGATCCTTTAACCAGACAATAGCCTCAGCAG
TACTGCCATCGAAGAGAAAAGAACCTGAAGGAGGCTGGGATTCCCATTCTATTGGATTCGTCCAGTCTCCATGGCAATAACCTTTTTCTCATTTTTTAAGCTGTCCTATGGAGGAACTTGCCACAATTTCAGATTATCATTGGTTAATTTTCACATGGCTGTGGTTTGTAAGGGATCAGAATTTCCCACATCATTACATC
TCGTGCAGAGAATATAATGTGACCAATTGTTGTATGGCAGTTGCTTCACGATCTAAAGCACCCTGCTTCTGTTCTCTACATACAGTTGCTTCACGATCTAAAGCATCCTGCTTCTGATCTCTACATGTCCTTCTGAGTTGTATCAAATTCCAAGGTATCAAAATTTGGAAGTATTTTATGGAGTCTTATTCATGGCTGCT
GCTCTTACTAGAgtaagtcagaatgttaagatttaggctcaatgtattttctgtaaatttcatatcaaaatctcttttactggaaggactgttgcgtttttctttctagtccacatctagagttatcgttcataggcatgtccccattgaaaatcctatgacctaaatggaaataacatatgcgatcactatatgtgatc
ctgtgggttcagggtgtccattattggcatctcgcctctttgcaattgcaagtttgatctattgatatcttcatttacatctctagacaagaataataacctaaacaattctgaaactctcggaaggaatgtaagtgcaaaatattttgcatgtttttagtttagtaagattgtgtttttgaagcatgggaccctgccag
accccttttgattcccttttgattatgccattttgattaaactaaaagatgaactgagattgtgtatattgacaaagtttgaggttttcaagtacaggaccttgtcagacaatttcattcagggcctggacacattctttccagcaatgacgtctttcatgctagcagtcttcctgctgttagacaatttaatagtgagg
ttctggtgtgataattaattagctatatactgtagttcaaaactcctagttgttggaaagttcaactctgtttagttatttgcttgaagtctagttattttttgatagattttgaaaagccttagtgcctattgtgctaggtttgatttcaattaacgtgctttacaaacaatagtaaatttttctttaaaggaaaaaga
ttgtgtttttcaactaacaatcttcagtgaaaaaggcatataattgtgcttttgttattcagtaggatcaaatctatcatgaggtcttctaaaagatgctttatcctgtgtagTTTGTTCGGAATCGAAGCATAGTTTACATCCAGGCTGTGAAGACCACAAAGAATAGATTTCATTGGTGCAATATCGCAGTTGCCTAT
GTGTTCTTGTCTGATATTCTCCAATAGCTTTTGGCTCAAGGAGAAGGTCCTATCACTACGTTACCTTTCACAGGGTACCATTTAATATTCTCAATCATGCCTGTTGTGTTTTCCTGTCTCCATACATTTCTCTTGTTTATGTTATATGATTTACTGTTTTGGTACAAGTTCCTTGAATATCCTTTCTTCGGACAATTTGG
AAAACACGAGGTGAGTTAAATGGAGAAGAACGGGAAGGGGATGGATTGCCTTTTGGAACAATGTTTCATTTCCGGAAAACAGAGTTAATAAAATATATAATTTTCTATGTTTTTGCGGATTTATCTTGTGGGGGTGACATTCTTGGAAGGAGTTAAAGAGAGCGATTTATCTCATTAAAAAATTTCAACGACATTGCTTA
ATTTCTATGAAATGTATTTATATTTTGATTCCTGATTACAAC
Intron 2 GTATCAAAAT ... TCCTGTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.63 | 55 | 105 | 6 |
| A2 | 68.42 | 42 | 91 | 1 |
| A3 | 70.86 | 44 | 107 | 2 |
| A4 | 76.07 | 28 | 89 | 1 |
| A5 | 68.12 | 22 | 47 | 1 |
| A6 | 73.09 | 331 | 899 | 9 |
| A7 | 73.62 | 167 | 466 | 21 |
| A8 | 73.18 | 339 | 925 | 15 |
| A9 | 73.01 | 183 | 495 | 4 |
| A10 | 70.63 | 84 | 202 | 6 |
>TRINITY_DN48579_c2_g2_i3 from sample A7 / Example spliced isoformACTCCGCATTTTCCATCTCCCTCAGCTCGTTGAAAACCTAAGAGAAAGGAGAAGATAAAACATTGTGAATAGGTCGCCGAATCCACCGCCAAATCGGCTATTTCTCCCTGGATCTGTCCTCGAGTCATCGTGCAGATCAATTCAAGCCGTTTTTCGAAGCTCGCCGTTGAAAATTTGGCCCATTTTGGGGATTTAATCAA
ACCCTACCCGCGTAGCAGAGTTTCAGAGACGATGTACTGTTTTTGCGTCCTCGGCACGGCAGAAAATATTAAGAACCGAGGATTTTGAAGAAATTTACCGTCGACGATATTTCGAAGCTTTAGCACGGATTTTTGCAAGAGAAATCTCAGAAATCTTGCCTGAACGGCATATTTTTGAGGCCCGTGAAGAAATTTGAGAC
CCGATCAGGTTTTGAAAGCTTCCCCGCTGTTTTTCCCGTCAGGAAACCTTAATAATCTCGAACTTACGCGGCTCGTTTTGGGATTCCCGTAGAAATTTGTGTGCACGTCGTAGTTTCTGAACCATTTGTGAAATTTCACGAGAATCGGTGTGATCTAGCAGTTGCAGCAAAGAATGGACGCTATGAGGCCGGGAAACGGA
ACGAAAACTTAAGAAGGTTAATGGAAAAAAATAAATAATTGCTGTTCCTTTAAAGGAGAAAATTGGCAAAGATGCTAGGCTATGCATGGGCGACAGAGTGAAGAGCGACAACGGCAGCGGCACATGTTGCCTGTCCCTGGTCACGGTACAGTTGGCGATTCTTCCATTATCAAGTTTTTTTCTAAGGATGGCCGTAAAAT
CAGTATTGGAGATTGTGCACTCTTTCAGGCTGGTAATGCACCGCCTTTCATTGGGATTATTCGTTGCTTGACTTCAGATAAAGAGGGTCACGTGAAGCTAAGTGTCAACTGGCTTTATCGACAAGCTGACGTTAGGCTAGGCAAAGGGATTTTGCTTGATGCTGCCCCGAATGAGGTCTTCTATTCATTTCACAAAGATG
AGATATCAGCTGCCTCATTGCTTCATCCATGTAAAGTTGCATTTCTCAGGAAAGGCATTGAACTTCCTTCAGGCATATCTTCATTTGTGTGTAGGAGAGTTTATGACACTACAAACAGGTGTTTATGGTGGTTAACTGATCAAGACTATACTGATGAACACCAAGAAGAAGTAAATAAGCTATTGGATAAGACGAGACAC
GAAATGCATGCAGCAGTGCAGTCAGGAGGGCCCTCCCCTAAAGATTTGAATGGCCCAGCAACAACTTTAAAAACTAGTTCAGATAGCACACAGAATACTTCATTTCCTTCTCAAGTTAAGGGGAAGAAAAGGGAGCGTGCTGATCAGAATACAGATCCTCTTAAACGAGAGCGTTTTTCAAAGTCAGATGGCAGTGATAC
AGGGCATTTCAAACAAGAGTGCATTATGAGGCCTGAAGAAGTTGCCAGAATCACTAACAAAGATGGATGCCTCATCAACTCAGAAGCTGTTGGGCAGCTTGTGCATCTAATGCAGCTGGAGAGAAGCGATGATGGTAAGAAAGGAATTGATTTGGCTTTGTGGCGTACATCCCTTGTAGGTGTGATTGCAACCACCGATC
AAGATGACTGTCTCAGTCAATTTGTGCAGCTCAAGGGCTTGCCCATTTTGGATGATTGGCTTCAAGAAGCCCACAAAGGAAAGACTGGAGATGCAGGCAGTCCAAAGGAGGGTGACAAAGTTGTTGAAGAATTGCTGTTAATGTTGCTGCGCGCTCTTGATAGACTACCTGTAGATCTTGATGCTCTGAAGACTTGTAAT
GTTGGGAAATCTGTAAACCACTTGAAAAATCACAAGAACCAGGAGATTCAGAGGAAGGCTAGGATCTTAGTTGATACATGGAAGAAACGTGTCGATGCAGAAATGAAGAACAATGACACAAAGTCTGGATCAAGCCAGGGAGCATCTTTGCCCTGTAAGCAGGCTACTGGCGAAGTTGCTTATACTCATGGTGGCAGGCG
TTCCGGATCTGCTGAAGCTGTGAAAAACTCAACACCATTAAACTCTACTGCAAAAACAGTCTCAAACAGATCAGGCCAGACAGATATTCTATCAAGATCAACATCTGTCCCCTCAGGTTCTGGCAAGGTTTCTACATTGCTCTCCTCAACCATTAGCACCAAGGATTCTCATTGTAAGTTGACCATGTCGAGTGGCACAA
ACGAGTTTCCGGTGACTTCAATTAAGGAAGAGAAAAGTAGCAGTTCCAGTCAATCACAGAATAACAGTCAGTCCTGGTCGAGTGAGCCTGGAAAGGCTGCAGGTTCAGTTTGGAAAGAGGATGCTAGGAGCTCTACAGCAGGTTCTATGAGTGCTAAAGGCTCAAGTTCGGGATCACGTCACAGGAAATCAAGTAATGGA
GCTTTGGGATCTGGTAAATCAGGATGCCAGAAAGAGGCCAGTGGAGGGAAGCTAATATGGAGTAAAAGTGCAACGTGTGAAAAGGCATCACAATCGTGTCACACATCTGACAAGGCAATAGATAATTCCCGTGGGGATAATACAAACAGTCCCAGACTGATAGTTAAACTTCCCAACGCTGGACGCACTCCAGCTCCATG
TCCCAGTAGTGGGACAGTAGAGGACATTGTCATCCCAGCAAGTAGAGGATCTTCTCCCATTATCTCTGATAAACATGATGCAAGTGATGCAAGAACAAAAGTGAAGATTGATGTTTCTCATGCTAATAGTGTCCCAGAGGTTAATACTGAATCATGGCAGAGCAATGAGGTTAAAGATGTTTTCACAGAAGGGGATGATG
GAGATAGATCATCTGCTGCCATTCCAAATGAAGAGCGTAGCAGAATTGGTGAAGAAATTGAGAAAACATCGGAAATATCTAAAATGGCTCCATCATCAGAGTCTGGCAAGGAGAATGATCCATCAAAGGGTCTGATTGAAGTAGAAACTGTTAAGACAAGTGAGCGAGTTGGCTTTGCAATTGTTTCAAAGAAGAGCTGC
TCACAACTTTCTAATGCAACTGTAGGTGATATGGATGATGGGGGTATGAAGCTACTGGTAAATCTGGCAGCCACTGAAAATTCCAAGGACAGGCAAGTGCCTGTTGTTGTCAGTGAAAGATGTTCCTCAGCAGCAGGAGAGGGTAGCCTGGATGAGTCTACAATAAGGTGCTCTGTTGATAAAATCCATTCTAATCCTAG
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CTTCTTTAGATGGCATTGGCAAGGTTCCTGTCTGTCCACGCATGCCCCCTGAACATAAATTTGCTGGAAAGAGGAAAGGCATTTCCTCCAATCAAGAGGTGGAGCACTGTACAGAACATAGCTCTGTTCCAGTTGGGAAACTAGGTGAAGCAGTGAAAGAGATGGTTTCTGACGCACTAACAGAAATGGCTTGTGTTTCT
GGAAAGAGGACAGAGGATGGGTTAAATGCATCCAAGATGAGTAAAGATGATGGTGAACAAGAAGCTCAAACAGATGTGTTTGCTGGTGAAGTTAGATTGGACAGAGATATTAAAGATAATAGTGCAGATGATCAATTGATAGTCATGGAGCATTGTGCAGGTGCAGGGACCCTTGATAAAACAGTGGTGGTTGCTTCCCC
GGCGTTGAAAGAAGTTGAGCAAGAGGTGGCTGTAGATAGCAAATCTGTTCTGAACATGGCTTCCTTTAATGATACTAGCAATAAAAGCTCAGCCTATAACCTCAGAAGTGACCAAGTAAGAGATAGTGACCTACAAGATGACCTACAAGATGGTAAGCAACTGCAAAATTCTGTGAAGGTTGAAGACAGGCAGCAAGACA
TGGGTGTTGATAATCATCATCTTCGTAGCACAAAGAGCATTGCATACTTGGATGATAGTCAAAAAACTGTCACCGAAAAAAGAGAAGACATGGAGGTAGAAAAAACTGCAGGAGCTGCAGATGGAGAAGAAATAAATCAGACAAGTCAAGTTCAAGTTGGCATCTTCAAGAAAATTGCAGACATACAGACAGGACCAGAT
TCAGGTAAGTGTGAAAGTGAAAGATGTGATTGTAAGGAGGAGTGTTTACCTTCCAGTCATCCTGCCTGTCCAGCAATTTCTGATGCAGAAGCAGAAAAGAAGCAGATTGCAGACTCTACAATACACAAAGGGCATGCAGGTATAGTGGATGCTGATGACAAGACTATAACAGAGATATTGGTGGATACCACGGGTGTTGT
TGGAGCCAGTGACACAAGTGTTAAACTTGATTTTGACTTAAATGAAGGTTTTCCTATGGAAGACACAAATCAAGATGATGCAGCAGCTTCTGCTCTGTCTATGGTTATTTCTAGTGCTTCAGATACCCTTATATCAAAATCCAGTGGGTTAGCAACGCCAATTGCAGTGGCCGCTAAAGCAAAAGGGCCTTTGATACCTC
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TACTGGACCAGTTAATACTGAAGTTTTAGGTTCTTCATTAAATTTTTTTGCAAATGGTTTTTCTAATGGGGAGTCACAAGTGCCAAGGGGTTTTGATTTGAACGATGGACCTTCTCTAGAAGATGCAGTGGTTGAACCTGGTCCCTGGAATTCCAATGTCAAGACCAAAGGGAACTCTTGTCTCCCATCATCTGGCTGGA
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TCAGCTCCTGCTGTTGCATACCCAAATACACAACCTGCATTCCCATATGGTGGACTTTCTTTTGGTTCAAATTTTTCAATGACTTCCACATCCTTCTCAGGAGGGCCAGCTTCTTCGTATGGAGATTCCTTAGGAACATCATGTTTTTCTGCAGTTCCCTCACAACTTGTTACTTCAGGGGCAGTTTCGTCTCCAGGTGT
AAGGCCCTATATGATGGGTCTCACTGATGTTTCTGGCATGGAAGGCACTCGCAAATGGCCAAGACCAATTCTTGATTTAAATGCAGGTCCTGGAACAGTTGATTTAGAAGTTAGAGATTCTAAGCAATTTGCCATTGCTGACAGTTGGGTTTCACCAGATGGTCAGACAAGATCCTTTAACCAGACAATAGCCTCAGCAG
TACTGCCATCGAAGAGAAAAGAACCTGAAGGAGGCTGGGATTCCCATTCTATTGGATTCGTCCAGTCTCCATGGCAATAACCTTTTTCTCATTTTTTAAGCTGTCCTATGGAGGAACTTGCCACAATTTCAGATTATCATTGGTTAATTTTCACATGGCTGTGGTTTGTAAGGGATCAGAATTTCCCACATCATTACATC
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TGGTACAAGTTCCTTGAATATCCTTTCTTCGGACAATTTGGAAAACACGAGGTGAGTTAAATGGAGAAGAACGGGAAGGGGATGGATTGCCTTTTGGAACAATGTTTCATTTCCGGAAAACAGAGTTAATAAAATATATAATTTTCTATGTTTTTGCGGATTTATCTTGTGGGGGTGACATTCTTGGAAGGAGTTAAAGA
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TTGTGCAGCTCAAGGGCTTGCCCATTTTGGATGATTGGCTTCAAGAAGCCCACAAAGGAAAGACTGGAGATGCAGGCAGTCCAAAGGAGGGTGACAAAGTTGTTGAAGAATTGCTGTTAATGTTGCTGCGCGCTCTTGATAGACTACCTGTAGATCTTGATGCTCTGAAGACTTGTAATGTTGGGAAATCTGTAAACCAC
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GAAAAACTCAACACCATTAAACTCTACTGCAAAAACAGTCTCAAACAGATCAGGCCAGACAGATATTCTATCAAGATCAACATCTGTCCCCTCAGGTTCTGGCAAGGTTTCTACATTGCTCTCCTCAACCATTAGCACCAAGGATTCTCATTGTAAGTTGACCATGTCGAGTGGCACAAACGAGTTTCCGGTGACTTCAA
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GGACATTGTCATCCCAGCAAGTAGAGGATCTTCTCCCATTATCTCTGATAAACATGATGCAAGTGATGCAAGAACAAAAGTGAAGATTGATGTTTCTCATGCTAATAGTGTCCCAGAGGTTAATACTGAATCATGGCAGAGCAATGAGGTTAAAGATGTTTTCACAGAAGGGGATGATGGAGATAGATCATCTGCTGCCA
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GTAGGTGATATGGATGATGGGGGTATGAAGCTACTGGTAAATCTGGCAGCCACTGAAAATTCCAAGGACAGGCAAGTGCCTGTTGTTGTCAGTGAAAGATGTTCCTCAGCAGCAGGAGAGGGTAGCCTGGATGAGTCTACAATAAGGTGCTCTGTTGATAAAATCCATTCTAATCCTAGTGATCATGCAGATGACAGAAG
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GAAGACGGTTTGATGACTTGTTCTTCCTCTCAAATTTCCGCACGAGTGACAAGTTCAGAGCTTGCCACTGTAAGTGGTCATGATTTTGTGCTTTTGACAAGGGAACTGTCTGCTCCTAGTGGGTCTGCTAGTGCTGGAAAGCTAGATTTGGATTTGAATCGTGTTGAGGAGTGTGAGGATACTGGACCAGTTAATACTGA
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GGAGAAGAACGGGAAGGGGATGGATTGCCTTTTGGAACAATGTTTCATTTCCGGAAAACAGAGTTAATAAAATATATAATTTTCTATGTTTTTGCGGATTTATCTTGTGGGGGTGACATTCTTGGAAGGAGTTAAAGAGAGCGATTTATCTCATTAAAAAATTTCAACGACATTGCTTAATTTCTATGAAATGTATTTAT
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