sp|P68430|H32_ONOVI ----> Histone H3.2

Intron 1 GTGGGTATTG ... ATTCTTCAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	50.88	14	11	18
A2	69.23	2	2	7
A3	44	7	2	9
A4	48.57	9	4	13
A5	52.38	5	4	7
A6	51.9	38	25	57
A7	52.68	75	60	107
A8	53.5	93	74	140
A9	47.2	66	48	70
A10	55.21	43	21	85

>TRINITY_DN115527_c0_g1_i3 from sample A1 / Example spliced isoform

AAGGAGTCTGTTTATGGTCTTTTTAAAGCCAGTCATTTCAGGGACTTGAATGTCATCATCGGGACTATTTTCAAGCCAGTAATGTTGCAGCTCTTTGAACTGATGCATTTAAAGCCCCAACGAACATATAGTTTGAGGTGCACCCAGAAATAAAAGGGTTCTTATATGCTTGGTTCTTTTAAGCTGCTTCTGGTCAAGAT
CAATCGACATAGGTTTTGTAGTAGAAGTATATTAAGAAAATGTGAATCTCATTGTAATGATTCTTATTATTTATGAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGCCTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACAATTTTCCTTTGGGTTATTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGC
AGGATGTGAATCACATTGTAATGATTCTTATTTATTAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTTCCTTTGGGTTGTTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGT
TATTCTTCAAGGTGGGTATTGGAACAAACACAAAAGCTGAATTGGTTGTCTTGTGCAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTCTTTGGTGATTTGCAATGTATTGTTGATTGGTCTTGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGA
TAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAGGGTCCTGATAAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGTATGT
GGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTC

>TRINITY_DN115527_c0_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AAGGAGTCTGTTTATGGTCTTTTTAAAGCCAGTCATTTCAGGGACTTGAATGTCATCATCGGGACTATTTTCAAGCCAGTAATGTTGCAGCTCTTTGAACTGATGCATTTAAAGCCCCAACGAACATATAGTTTGAGGTGCACCCAGAAATAAAAGGGTTCTTATATGCTTGGTTCTTTTAAGCTGCTTCTGGTCAAGAT
CAATCGACATAGGTTTTGTAGTAGAAGTATATTAAGAAAATGTGAATCTCATTGTAATGATTCTTATTATTTATGAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGCCTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACAATTTTCCTTTGGGTTATTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGC
AGGATGTGAATCACATTGTAATGATTCTTATTTATTAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTTCCTTTGGGTTGTTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGT
TATTCTTCAAGgtgggtattgggacaaacacaaaagctgaactggttgtcttgtgcaggcttttgtattttacagctattcttcaagGTGGGTATTGGAACAAACACAAAAGCTGAATTGGTTGTCTTGTGCAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTCTTTGGTGATTTGCAATGTATT
GTTGATTGGTCTTGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAGGGTCCTGATAAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATA
TTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGTATGTGGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATT
GATTACGTTC

Intron 2 GTGGGTATTG ... TCTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	76.27	8.5	11	23
A2	75	4	2	12
A3	94.44	1.5	2	24
A4	90.47	2	4	17
A5	90	1	4	9
A6	82.79	20.5	25	93
A7	90.6	17.5	59	157
A8	92.41	18	74	207
A9	82.97	31	48	134
A10	87.4	19	21	126

>TRINITY_DN44308_c0_g1_i10 from sample A9 / Example spliced isoform

GGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAAGTTCTGTCAAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCC
AATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGT

>TRINITY_DN44308_c0_g1_i6 from sample A9 / Example unspliced isoform:

GGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGGTGTGTTTCCACACCACCACTTGCTTTATCTTCAAATTTGTTTTCCCTGC
CAAATCCTCTCACCTTTACCCTTTTCCCTTTTCCTTTCTCTTCTTCTTGCACGGCTGTTTCGTAGTTAGTTACGTTGAATCAAGTACATGTGCTTTCTTTGATGTGGTTGAATTTAACGTTGAGGTCATTAGCAATCCTGGTTACACAGGTATTCCAGGGTCGAATTTGAAACTAATGGCTAAACATTTAGACACATATT
GAAGTTTGCGTCATTAAAGTTGTGAACTGACCCGATAGATTGAAAGGTTTTTGATATATCCAATGGTGACATTGTTATTCATAAGATTGACAAGTTGAAGTTGTCTCTCTGTTGGTCTTCTTCATATGAATACTGTTCTGTGATTGAACAACATGCCTCTGTTCGTCTTTATCTGTTTTTATCTTGAAGGTTTCATCTTG
AATTTGAAATTTTCCTCTATTTCTAATCCTTGGCCCTTTTTGTTTTGTGTCGAAACCTTGATCTCCTCCTTTAAGTTATCCTTATTACTTGTTAGGGTTAGTTCAATTTAATCTGTTTTCTCAAGAGCTTTGTTCTTTACTATAGCATTCCTTGCAATGCTTGAATCCCTTTTCAGAGTAAGGACTATCATGGTCTATTT
GGTTTTATAATTGGATCTGAACATCTCTTGGAAGGGAATGCTATTGCTTTATTCAGGCTACCAGGGCCATCATGGTACTTCCAGACTAAGAGACGAGATTGTATCCTTCTCTCACACACACGTATATATATATATGCAGTAGCAGTCTCTTTTCGGTCTCCGCATTTCCCAGAAATTGAATGTCAGTAGCATTTTGTAGA
TTACAATGTTTATATGTCTATATGTTAGGTGAGTTTGTATTTACTTCATAAATAAACATATATACATAGACCGTATCAATTTATATACATAGACCGTATCAATTAGGTGAGTTTGTATTTACTTTATAAATCAATCCGAGGGCTTAAGCCACGAAACAGCAGAGCACTGCGCGCCCGCCATTAATTCTCTTTATATTGAT
TCTCTTTAGTTGTAGTAGTTGTATTTTTATAGGGAACAGTTTTATAATTTTATATATTCTACGGAGTTACAGCTATAACAACAAAATAAAATAAACAGAACACGGGTTATGTAGAATTATATCAAGAATATGTGAATCGCATTGTAATTAATGATTGTTATTTTTAGTTTACGGACACCTTGCCGACTTACCTATGAGCT
GCGCAGTTCGCCCATACGCATTATGTTAGTTCCTCATAGGAAGCGGAAAGGAAGTTCGTTTCAGTTACCATTATCCCTCACCAGACCTGCACGCGGAATCACCTTTTTATTTATACTTGATTAGCCCGAGGAAGGGGCCTGTTTATGAACTTTTTAAAGCCAGTCATTTCAGGGACTTGAATGTCATCATCGGGACTATT
TTCAAGCCAGTAAATGTTGCAGCTCTTTGAACTGATGCATTTAAAGCCCCAACGAACATATAGTTTGAGGTGCACCCATAAATAAAAGTGTTCTTATATGCTTGGTTCTTTTAAGCTGCTGCTGGTTAAGATCAATCGACATAGGTTTTGTAGTAGAAGTATATTAATAAAATGTGAATCACATTGTAATGATTCTTATT
ATTTATTAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGCCTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACAATTTACCTTTGGGTTATTTTGAATCTTCAATGAGGAACTTCGTGGGGGGCAGGATGTGAATCACATTGTAATGATTGTTATTTATTAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGTGTC
ATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTTCCTTTGGGTTATTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGgtgggtattggaacaaacacaaaagctgaattggttgtcttgtgcagtctcttgta
ttttgtagttattcttcaaggtgggtattgggacaaacacaaaagctgaattggttgtcttgtgcagTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTTTTTGGTGATTTGCAATGTTTTGTTGATTGGTCATGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGTTGAAACCATGGATGGACAAAGTCA
GGGTCCTGATAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAGGGTCCTGATAAATGTTT
TCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGCATGTGGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTG
TTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCTTC

Intron 3 GTGGGTATTG ... TCTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	78.36	7.2	11	23.8
A2	72.45	5	3	13
A3	93.11	2	2	26
A4	89.68	2.2	4	17.8
A5	87.12	1.5	5	10
A6	80.88	24.8	27.5	100.8
A7	90.63	17.3	62.7	161.7
A8	91.25	21.5	76.5	216.5
A9	80.82	35.5	50	138.7
A10	86.07	23.2	22.3	138.7

>TRINITY_DN45070_c0_g2_i7 from sample A6 / Example spliced isoform

CTGGCCACCAAGGCAGCTCGAAAATCTGCACCGGCAACCGGTGGTGTGAAGAAGCCACACAGGTTCAGGCCTGGCACCGTTGCTCTTCGGGAGATCCGAAAATACCAGAAGAGCACTGATCTGCTCATAAGGAAGCTTCCCTTCCAGCGCCTAGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTC
TTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGCTTCA
ATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTTTTTGGTGATTTGCAATGTTTTGTTGATTGGTCATGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGTTGAAACCATGGATGGACAA
AGTCAGGGTCCTGAT

>TRINITY_DN45070_c0_g2_i6 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CTGGCCACCAAGGCAGCTCGAAAATCTGCACCGGCAACCGGTGGTGTGAAGAAGCCACACAGGTTCAGGCCTGGCACCGTTGCTCTTCGGGAGATCCGAAAATACCAGAAGAGCACTGATCTGCTCATAAGGAAGCTTCCCTTCCAGCGCCTAGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTC
TTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGGTGTG
TTTCCACACCACCACTTGCTTTATCTTCAAATTTGTTTTCCCTGCCAAATCCTCTCACCTTTACCCTTTTCCCTTTTCCTTTCTCTTCTTCTTGCACGGCTGTTTCGTAGTTAGTTACGTTGAATCAAGTACATGTGCTTTCTTTGATGTGGTTGAATTTAACGTTGAGGTCATTAGCAATCCTGGTTACACAGGTATTC
CAGGGTCGAATTTGAAACTAATGGCTAAACATTTAGACACATATTGAAGTTTGCGTCATTAAAGTTGTGAACTGACCCGATAGATTGAAAGGTTTTTGATATATCCAATGGTGACATTGTTATTCATAAGATTGACAAGTTGAAGTTGTCTCTCTGTTGGTCTTCTTCATATGAATACTGTTCTGTGATTGAACAACATG
CCTCTGTTCGTCTTTATCTGTTTTTATCTTGAAGGTTTCATCTTGAATTTGAAATTTTCCTCTATTTCTAATCCTTGGCCCTTTTTGTTTTGTGTCGAAACCTTGATCTCCTCCTTTAAGTTATCCTTATTACTTGTTAGGGTTAGTTCAATTTAATCTGTTTTCTCAATAGCTTTGTTCTTTACTATAGCATTTCTTGC
AATGCTTGAATCCTTTTTCAGAGTAAGGACTATCATGGTCTATTTGGTTTTATAATTGGATCTGAACATCTCTTGGAAGGGAATGCTATTGCTTTATTCAGGCTACCAGGGCCATCATGGTACTTCCAGACTAAGAGACGAGATTGTATCCTTCTCTCACACACACATATATATATATATGCAGTAGCAGTCTCTTTTCG
GTCTCCGCATTTCCCAGAAATTGAATGTCAGTAGCATTTTGTAGATTACAATGTTTATATGTCTATATGGTAGGTGAGTTTGTATTTACTTCATAAGTAAACACATAGACCATATCAATTAGGTGAGTTTGTATTTACTTTATAAATTAATCGGAGGGCTTAAGCCACGAAACATCAGAGCATTGCGCGCCCGCCATTAA
TTCTCTTTATATTGATTCTCTTTAGTTGTAGTAGTTGTATTTTTATAGGGAACAGTTTTATAATTTTATATATTCTACAGAGTTAAAGCTATAACAACAAAATAAAATAAACAGAACACGGGTTATGTAGAATTATATTAAGAATATGTGAATCGCATTGTAATTAATGATTGTTATTTTTAGTTTACGGACACCTTGCC
GACTTACCTATGACAGCTGCGCAGTTCGCCCATACGCATTATGTTAGTTCCTCATAGGAAGCGGAAAGGAAGTTCGTTTCAGTTACCATTATTCCTTACAAGACCTGCACGCGGATTCACCTTTTTATTTATACTTGATTAGCCCGAGGAAGGAGTCTGTTTATGGACTTTTTAAAGCCAGTCATTTCAGGGACTTGAAT
GTCATCATCGGGACTATTTTCAAGCCAGTAATGTTGCAGCTCTTTGAACTGATGCATTTAAAGCCCCAACGAACATATAGTTTGAGGTGCACCCAGAAATAAAAGGGTTCTTATATGCTTGGTTCTTTTAAGCTGCTTCTGGTCAAGATCAATCGACATAGGTTTTGTAGTAGAAGTATATTAAGAAAATGTGAATCTCA
TTGTAATGATTCTTATTATTTATTAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGCCTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACAATTTACCTTTGGGTTATTTTGAATCTTCAATGAGGAACTTCGTGGGGGGCAGGATGTGAATCACATTGTAATGATTCTTATTTATTAAGAATATGTGAAT
CATCGTAAAGGAGTCTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTTCCTTTGGGTTGTTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGgtgggtattggaacaaacacaaaagctgaattggttg
tcttgtgcagtctcttgtattttgtagttattcttcaaggtgggtattgggacaaacacaaaagctgaactggttgtcttgtgcaggcttttgtattttacagctattcttcaaggtgggtattgggacaaacacaaaagctgaactggttgtcttgtgcagTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTT
ATGGGTTTTTGGTGATTTGCAATGTTTTGTTGATTGGTCATGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGTTGAAACCATGGATGGACAAAGTCAGGGTCCTGATGAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATG
GGAAATTGCATGTGGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCTTCATTTAATAAAAAG

Intron 4 GTGTGTTTCC ... TATTTTGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	78.87	15	56	9
A2	67.24	19	39	3
A3	75	12	36	4
A4	73.02	17	46	5
A5	74.29	9	26	0
A6	77.48	91	313	19
A7	75	77	231	34
A8	74.49	62	181	44
A9	78.27	88	317	44
A10	76.8	74	245	19

>TRINITY_DN44308_c0_g1_i10 from sample A9 / Example spliced isoform

GGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAAGTTCTGTCAAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCC
AATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGT

>TRINITY_DN44308_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:

GGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAAGTTCTGTCAAAGgtgtgtttccacaccaccacttgctttatcttcaaatttgttttccctgc
caaatcctctcacctttacccttttcccttttcctttctcttcttcttgcatggatgtttcgtagttagttacgttgaatcaagtggatgtgctttctttgatgtggttgaatttaacgttgaggtcattagcaatcctggttacacaggtattccagggtcggttttgaaactaatggctaaatatttagacacatatt
gaagtttgcgtcattaaagttgtgaactgacccgatagattgaaaggtttttgatatatccaatggtgacattgttattcataagagtgacaagttgaaactgtctctctgttggtattcttcatatgaatactgttctgtgattgaacaacatgcctctgttcgtctttatctgtttttatcttgaaggtttcatcttg
aatttgaaattttcctctatttctaatccttggccctttttgttttgtgtcgaaaccttgatctcctcctttaagttatccttattacttgttagggttagttcaatttaatctgttttctcaagagctttgttctttactatagcattccttgcaatgcttgaatcccttttcagagtaaggactatcatggtctattt
ggttttataattggatctgaacatctcttggaagggaatgctattgctttattcaggctaccagggccatcatggtacttccagactaagagacgagattgtatccttctctcacacacacgtatatatatatatgcagtagcagtctcttttcggtctccgcatttcccagaaattgaatgtcagtagcattttgtaga
ttacaatgtttatatgtctatatgttaggtgagtttgtatttacttcataaataaacatatatacatagaccgtatcaatttatatacatagaccgtatcaattaggtgagtttgtatttactttataaatcaatccgagggcttaagccacgaaacagcagagcactgcgcgcccgccattaattctctttatattgat
tctctttagttgtagtagttgtatttttatagggaacagttttataattttatatattctacggagttacagctataacaacaaaataaaataaacagaacacgggttatgtagaattatatcaagaatatgtgaatcgcattgtaattaatgattgttatttttagtttacggacaccttgccgacttacctatgagct
gcgcagttcgcccatacgcattatgttagttcctcataggaagcggaaaggaagttcgtttcagttaccattatccctcaccagacctgcacgcggaatcacctttttatttatacttgattagcccgaggaaggggcctgtttatgaactttttaaagccagtcatttcagggacttgaatgtcatcatcgggactatt
ttcaagccagtaaatgttgcagctctttgaactgatgcatttaaagccccaacgaacatatagtttgaggtgcacccataaataaaagtgttcttatatgcttggttcttttaagctgctgctggttaagatcaatcgacataggttttgtagtagaagtatattaataaaatgtgaatcacattgtaatgattcttatt
atttattaagaatatgtgaatcatcgtaaaggagcctgtcatcaaaagcaaaagacagttttgttttattgaggatcctcacaatttacctttgggttattttgaatcttcaatgaggaacttcgtggggggcaggatgtgaatcacattgtaatgattgttatttattaagaatatgtgaatcatcgtaaaggagtgtc
atcaaaagcaaaagacagttttgttttattgaggatcctcacatttttcctttgggttattttgaagCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGGTGGGTATT

Intron 5 GTGTGTTTCC ... TCTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	69.14	25	56	13
A2	63.93	22	39	6
A3	69.23	16	36	8
A4	68.66	21	46	9
A5	70.27	11	26	6
A6	69.21	141	317	51
A7	66.11	121	236	89
A8	61.36	114	181	126
A9	68.09	149	318	71
A10	65.08	132	246	63

>TRINITY_DN108900_c0_g2_i1 from sample A4 / Example spliced isoform

CGAAAGTACCAGAAGAGCACCGATCTGCTCATAAGGAAGCTCCCCTTCCAGCGCCTTGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTCTTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGAC
CATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGGCTTTTGTATTTTACAGCTATTCTTCAAGGTGGGTATTGGGACAAACACAAAAGCTGAACTGGTTGTCTTGTGCAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAA
GGGGTTACTTTTTATGGGTCTTTGGTGATTTGCAATGTATTGTTGATTGGTCTTGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAG
GGTCCTGATAAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGCATGTGGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACT
GGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCG

>TRINITY_DN108900_c0_g2_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:

GAAAATACCAGAAGAGCACTGATCTGCTCATAAGGAAGCTTCCCTTCCAGCGCCTAGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTCTTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACC
ATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGgtgtgtttccacaccaccacttgctttatcttcaaatttgttttccctgccaaatcctctcacctttacccttttcccttttcctttctcttcttcttgcac
ggctgtttcgtagttagttacgttgaatcaagtacatgtgctttctttgatgtggttgaatttaacgttgaggtcattagcaatcctggttacacaggtattccagggtcgaatttgaaactaatggctaaacatttagacacatattgaagtttgcgtcattaaagttgtgaactgacccgatagattgaaaggttttt
gatatatccaatggtgacattgttattcataagattgacaagttgaagttgtctctctgttggtcttcttcatatgaatactgttctgtgattgaacaacatgcctctgtttgtctttatctgtttttatcttgaaggtttcatcttgaatttgaaattttcctctatttctaatccttggcactttttgttttgtgtca
aaaccttgatctcctcctttaagttatccttattacttgttagggttagttcaatttaatctgttttctcaagagctttgttctttactatagcattccttgcaatgcttgaatcccttttcagagtaaggactatcatggtctatttggttttataattggatctgaacatctcttggaagggaatgctattgctttat
tcaggctaccagggccatcatggtacttccagactaagagacgagattgtatccttctctcacacacacatatatatatatatgcagtagcagtctctttttggtctccgcatttcccagaaattgaatatcagtagcattttgtagattacaatgtttatatgtctatgttaggtgagtttgtatttacttcataaata
aacatatatacatagaccgtatcaatttatatacatagaccgtatcaattaggtgagtttgtatttactttataaatcaatccgagggcttaagccacgaaacagcagagcactgcgcgcccgccattaattctctttatattgattctctttagttgtagtagttgtatttttatagggaacagttttataattttata
tattctacggagttacagctataacaacaaaataaaataaacagaacacgggttatgtagaattatatcaagaatatgtgaatcgcattgtaattaatgattgttatttttagtatacggacaccttgccgacttacctatgagctgcgcagttcgcccatacgcattatgttagttcctcataggaagaggaaaggaag
ttcgtttcagttaccattatccctcaccagacctgcacgcggaatcacctttttatttatacttgattagcccgaggaaggggcctgtttatgaactttttaaagccagtcatttcagggacttgaatgtcatcatcgggactattttcaagccagtaaatgttgcagctccttgaactgatgcatttaaagccccaacg
aacatatagtttgaggtgcacccataaataaaagtgttcttatatgcttggttcttttaagctgctgctggttaagatcaatcgacataggttttgtagtagaagtatattaataaaatgtgaatcacattgtaatgattcttattatttattaagaatatgtgaatcatcgtaaaggagcctgtcatcaaaagcaaaag
acagttttgttttattgaggatcctcacaattttcctttgggttgttttgaagcttcaatgaggaactttgtgggggcaggatgtgtcttcaaagtcagccccaattattgttttcagttattcttcaaggtgggtattgggacaaacacaaaagctgaactggttgtcttgtgcagGCTTTTGTATTTTACAGCTATTC
TTCAAGGTGGGTATTGGGACAAACACAAAAGCTGAACTGGTTGTCTTGTGCAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTCTTTGGTGATTTGCAATGTATTGTTGATTGGTCTTGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAAT
GCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAGGGTCCTGATAAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGCATGTGGAGG
AATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCG

Intron 6 GTGTGTTTCC ... TGTTTTGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	77.78	16	56	9
A2	67.24	19	39	3
A3	75	12	36	3
A4	71.88	18	46	7
A5	74.29	9	26	0
A6	76.94	95	317	22
A7	74.92	79	236	41
A8	74.18	63	181	56
A9	78.13	89	318	52
A10	76.4	76	246	19

>TRINITY_DN45070_c0_g2_i7 from sample A6 / Example spliced isoform

CTGGCCACCAAGGCAGCTCGAAAATCTGCACCGGCAACCGGTGGTGTGAAGAAGCCACACAGGTTCAGGCCTGGCACCGTTGCTCTTCGGGAGATCCGAAAATACCAGAAGAGCACTGATCTGCTCATAAGGAAGCTTCCCTTCCAGCGCCTAGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTC
TTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGCTTCA
ATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTTTTTGGTGATTTGCAATGTTTTGTTGATTGGTCATGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGTTGAAACCATGGATGGACAA
AGTCAGGGTCCTGAT

>TRINITY_DN45070_c0_g2_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CTGGCCACCAAGGCAGCTCGAAAATCTGCACCGGCAACCGGTGGTGTGAAGAAGCCACACAGGTTCAGGCCTGGCACCGTTGCTCTTCGGGAGATCCGAAAATACCAGAAGAGCACTGATCTGCTCATAAGGAAGCTTCCCTTCCAGCGCCTAGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTC
TTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGgtgtg
tttccacaccaccacttgctttatcttcaaatttgttttccctgccaaatcctctcacctttacccttttcccttttcctttctcttcttcttgcacggctgtttcgtagttagttacgttgaatcaagtacatgtgctttctttgatgtggttgaatttaacgttgaggtcattagcaatcctggttacacaggtattc
cagggtcgaatttgaaactaatggctaaacatttagacacatattgaagtttgcgtcattaaagttgtgaactgacccgatagattgaaaggtttttgatatatccaatggtgacattgttattcataagattgacaagttgaagttgtctctctgttggtcttcttcatatgaatactgttctgtgattgaacaacatg
cctctgttcgtctttatctgtttttatcttgaaggtttcatcttgaatttgaaattttcctctatttctaatccttggccctttttgttttgtgtcgaaaccttgatctcctcctttaagttatccttattacttgttagggttagttcaatttaatctgttttctcaatagctttgttctttactatagcatttcttgc
aatgcttgaatcctttttcagagtaaggactatcatggtctatttggttttataattggatctgaacatctcttggaagggaatgctattgctttattcaggctaccagggccatcatggtacttccagactaagagacgagattgtatccttctctcacacacacatatatatatatatgcagtagcagtctcttttcg
gtctccgcatttcccagaaattgaatgtcagtagcattttgtagattacaatgtttatatgtctatatggtaggtgagtttgtatttacttcataagtaaacacatagaccatatcaattaggtgagtttgtatttactttataaatcaatccgagggcttaagccacgaaacagcagagcactgcgcgcccgccattaa
ttctctttatattgattctctttagttgtagtagttgtatttttatagggaacagttttataattttatatattctacggagttacagctataacaacaaaataaaataaacagaacacgggttatgtagaattatattaagaatatgtgaatcgcattgtaattaatgattgttatttttagtttacggacaccttgcc
gacttacctatgagctgcgcagttcgcccatacgcattatgttagttcctcataggaagcggaaaggaagttcgtttcagttaccattatccctcaccagacctgcacgcggaatcacctttttatttatacttgattagcccgaggaaggggcctgtttatgaactttttaaagccagtcatttcagggacttgaatgt
catcatcgggactattttcaagccagtaaatgttgcagctctttgaactgatgcatttaaagccccaacgaacatatagtttgaggtgcacccataaataaaagtgttcttatatgcttggttcttttaagctgctgctggttaagatcaatcgacataggttttgtagtagaagtatattaataaaatgtgaatcacat
tgtaatgattcttattatttattaagaatatgtgaatcatcgtaaaggagcctgtcatcaaaagcaaaagacagttttgttttattgaggatcctcacaatttacctttgggttattttgaatcttcaatgaggaacttcgtggggggcaggatgtgaatcacattgtaatgattcttatttattaagaatatgtgaatc
atcgtaaaggagtgtcatcaaaagcaaaagacagttttgttttattgaggatcctcacatttttcctttgggttgttttgaagCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGGTGGGTATTGGAACAAACACAAAAGCTGAATTGGTTGTCT
TGTGCAGTCTCTTGTATTTTGTAGTTATTCTTCAAGGTGGGTATTGGGACAAACACAAAAGCTGAACTGGTTGTCTTGTGCAGGCTTTTGTATTTTACAGCTATTCTTCAAGGTGGGTATTGGGACAAACACAAAAGCTGAACTGGTTGTCTTGTGCAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATG
GGTCTTTGGTGATTTGCAATGTATTGTTGATTGGTCTTGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGTTGAAACCATGGATGGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAATGCT
TTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAGGGTCCTGATGAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGCATGTGGAGGAAT
TCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCTTCATTTAATAAAAAG

Intron 7 GTGTGTTTCC ... TGTTTTGAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	77.78	16	56	9
A2	67.24	19	39	3
A3	75	12	36	3
A4	71.88	18	46	7
A5	74.29	9	26	0
A6	76.94	95	317	23
A7	74.92	79	236	41
A8	74.18	63	181	58
A9	78.13	89	318	54
A10	76.4	76	246	21

>TRINITY_DN45070_c0_g2_i7 from sample A6 / Example spliced isoform

CTGGCCACCAAGGCAGCTCGAAAATCTGCACCGGCAACCGGTGGTGTGAAGAAGCCACACAGGTTCAGGCCTGGCACCGTTGCTCTTCGGGAGATCCGAAAATACCAGAAGAGCACTGATCTGCTCATAAGGAAGCTTCCCTTCCAGCGCCTAGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTC
TTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGCTTCA
ATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTTTTTGGTGATTTGCAATGTTTTGTTGATTGGTCATGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGTTGAAACCATGGATGGACAA
AGTCAGGGTCCTGAT

>TRINITY_DN45070_c0_g2_i6 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CTGGCCACCAAGGCAGCTCGAAAATCTGCACCGGCAACCGGTGGTGTGAAGAAGCCACACAGGTTCAGGCCTGGCACCGTTGCTCTTCGGGAGATCCGAAAATACCAGAAGAGCACTGATCTGCTCATAAGGAAGCTTCCCTTCCAGCGCCTAGTAAGAGAGATCGCCCAGGACTTCAAGACCGATTTGAGATTCCAGTC
TTCTGCTGTGGCAGCGTTGCAAGAGGCTGCGGAGGCGTACCTGGTGGGTCTTTTCGAGGACACCAACCTGTGCGCCATTCATGCGAAGAGGGTGACCATTATGCCCAAGGACATTCAGCTTGCTCGCCGCATCCGCGGAGAGAGGGCATGATTCATTAATTGCCTATTCTCGTGTCTGTAAAGGTTCTGTCAAAGgtgtg
tttccacaccaccacttgctttatcttcaaatttgttttccctgccaaatcctctcacctttacccttttcccttttcctttctcttcttcttgcacggctgtttcgtagttagttacgttgaatcaagtacatgtgctttctttgatgtggttgaatttaacgttgaggtcattagcaatcctggttacacaggtattc
cagggtcgaatttgaaactaatggctaaacatttagacacatattgaagtttgcgtcattaaagttgtgaactgacccgatagattgaaaggtttttgatatatccaatggtgacattgttattcataagattgacaagttgaagttgtctctctgttggtcttcttcatatgaatactgttctgtgattgaacaacatg
cctctgttcgtctttatctgtttttatcttgaaggtttcatcttgaatttgaaattttcctctatttctaatccttggccctttttgttttgtgtcgaaaccttgatctcctcctttaagttatccttattacttgttagggttagttcaatttaatctgttttctcaatagctttgttctttactatagcatttcttgc
aatgcttgaatcctttttcagagtaaggactatcatggtctatttggttttataattggatctgaacatctcttggaagggaatgctattgctttattcaggctaccagggccatcatggtacttccagactaagagacgagattgtatccttctctcacacacacatatatatatatatgcagtagcagtctcttttcg
gtctccgcatttcccagaaattgaatgtcagtagcattttgtagattacaatgtttatatgtctatatggtaggtgagtttgtatttacttcataagtaaacacatagaccatatcaattaggtgagtttgtatttactttataaattaatcggagggcttaagccacgaaacatcagagcattgcgcgcccgccattaa
ttctctttatattgattctctttagttgtagtagttgtatttttatagggaacagttttataattttatatattctacagagttaaagctataacaacaaaataaaataaacagaacacgggttatgtagaattatattaagaatatgtgaatcgcattgtaattaatgattgttatttttagtttacggacaccttgcc
gacttacctatgacagctgcgcagttcgcccatacgcattatgttagttcctcataggaagcggaaaggaagttcgtttcagttaccattattccttacaagacctgcacgcggattcacctttttatttatacttgattagcccgaggaaggagtctgtttatggactttttaaagccagtcatttcagggacttgaat
gtcatcatcgggactattttcaagccagtaatgttgcagctctttgaactgatgcatttaaagccccaacgaacatatagtttgaggtgcacccagaaataaaagggttcttatatgcttggttcttttaagctgcttctggtcaagatcaatcgacataggttttgtagtagaagtatattaagaaaatgtgaatctca
ttgtaatgattcttattatttattaagaatatgtgaatcatcgtaaaggagcctgtcatcaaaagcaaaagacagttttgttttattgaggatcctcacaatttacctttgggttattttgaatcttcaatgaggaacttcgtggggggcaggatgtgaatcacattgtaatgattcttatttattaagaatatgtgaat
catcgtaaaggagtctgtcatcaaaagcaaaagacagttttgttttattgaggatcctcacatttttcctttgggttgttttgaagCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGGTGGGTATTGGAACAAACACAAAAGCTGAATTGGTTG
TCTTGTGCAGTCTCTTGTATTTTGTAGTTATTCTTCAAGGTGGGTATTGGGACAAACACAAAAGCTGAACTGGTTGTCTTGTGCAGGCTTTTGTATTTTACAGCTATTCTTCAAGGTGGGTATTGGGACAAACACAAAAGCTGAACTGGTTGTCTTGTGCAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTT
ATGGGTTTTTGGTGATTTGCAATGTTTTGTTGATTGGTCATGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGTTGAAACCATGGATGGACAAAGTCAGGGTCCTGATGAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTCTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATG
GGAAATTGCATGTGGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCTTCATTTAATAAAAAG

Intron 8 GTGGGTATTG ... TCTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	56.1	18	11	23
A2	76.47	4	3	13
A3	81.25	6	2	26
A4	80.95	4	4	17
A5	90.91	1	4	10
A6	70.9	39	25	95
A7	79	42	60	158
A8	79.54	53	74	206
A9	68.59	60	48	131
A10	79.75	32	21	126

>TRINITY_DN42282_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoform

TTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTACCTTTGGGTTATTTTGAATCTTCAATGAGGAACTTCGTGGGGGGCAGGATGTGAATCACATTGTAATGATTCTTATTTATTAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGTCTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTTCCTTTGGG
TTGTTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTCTTTGGTGATTTGCAATGTATTGTTGATTGGTCTTGGGGTATCTCATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGA
AACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAGGGTCCTGATAAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTTGTAAGTGGTT
GTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGTATGTGGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCTTCA

>TRINITY_DN42282_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:

TTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTACCTTTGGGTTATTTTGAATCTTCAATGAGGAACTTCGTGGGGGGCAGGATGTGAATCACATTGTAATGATTCTTATTTATTAAGAATATGTGAATCATCGTAAAGGAGTCTGTCATCAAAAGCAAAAGACAGTTTTGTTTTATTGAGGATCCTCACATTTTTCCTTTGGG
TTGTTTTGAAGCTTCAATGAGGAACTTTGTGGGGGCAGGATGTGTCTTCAAAGTCAGCCCCAATTATTGTTTTCAGTTATTCTTCAAGgtgggtattggaacaaacacaaaagctgaattggttgtcttgtgcagtctcttgtattttgtagttattcttcaaggtgggtattgggacaaacacaaaagctgaactggtt
gtcttgtgcaggcttttgtattttacagctattttgtagttattcttcaaggtgggtattgggacaaacacaaaagctgaactggttgtcttgtgcagTCTCTTGTATTTTGCAGCTGGTAAAGGGGTTACTTTTTATGGGTCTTTGGTGATTTGCAATGTATTGTTGATTGGTCTTGGGGTATCTCATCTTTTCACCCT
TTGAAGCTGAAACCATGGATAGACAAAGTCAGGGTCCTGATAAATGCTTTTGATCAGCTTACTATCAACCATATCTACATCTTTTCACCCTTTGAAGCTGAAACCATGGATGGACATACTCAGGGTCCTGATAAATGTTTTCAATCAGCTTACTATCAACCATATTTACAGAGAATTCAATACTGATGTAGATGCTCTTT
GTAAGTGGTTGTTGGGCGACATGGATGGGAAATTGTATGTGGAGGAATTCGTGGATGGTTGCTTGGTGGACCCTCACTGCTGGATGCTCACTGTTTGGACTTATACTGAGTTGATGTATTACTGGTCACTGGATGATGTGTTATGTTTCAGTAGCGATGAAATTGATTACGTTCCTTCA