NA ----> NA


Intron 1 GTTGGTGCTG ... TACTGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A121.2328.35.388.3
A222.6226010.776
A317.16299.31562
A420.06257.7464.7
A521.211303.335
A622.7569120.3
A719.82160.753.3
A822.71010.729.7
A918.681931.344.3
A1020.332091.753.3



>TRINITY_DN117251_c9_g1_i11 from sample A1 / Example spliced isoform
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCCAGCAGTTTCTCTTGAATTTTGGACGGTGAATCCGTGATTATGC
TTTAATTTGCTTTCGAACGCTGAATTTCTCTGTTCAAGGTTTTCAGCGGTGAAGTATGGCTGATTTTGGCCTTCGTTTTATCTGTTCTTGTTGGGAACTTCAGTATTTCATTGATTTTGGATGGTGAAATTATTGTCTCTGCTTAATTTTGGCTTGCGATCTGAAAACCCTTGAAGTAGGGCTCTTTTAGCGGCTAAATA
TAGCTGAATTTGTGTTTCTTAAATAATTGTCTTATCTCTTTCCTATAAATTTTGGGGTTTTGTTTGGGTTTCATGCTTTAATGGGTTTACGCGTTTTGCTTATTGTTTGTGTATTTGTGCATCTCGTTGGGCAGTGGTGTTGTTTTTTTCTTGAATTTCATTTGTGGATTGAAAATTGAACAAATTAAAACCTGATAGTG
AGCTCTTTAGGTGAATGAGATCTCGTGTTTACCAAACTGGGTTTATCCCTGTTTTTGAAGGTAGGGTCTGTGACAATGTCGATGGTGAGCATGCTATCGAAAAATTTACAATTATTGTAAGAAGTAAAGACAGACGAGCTGGCTATATATAGTTATTACTGTGCACGAGAGGGAGATTCAGTGACAGACTTGATTGAAGT
CATATGATTATAGTATGCTTTTCGACTTGATTGGACGCCTTTGATAAACAAATTAAAGTCATATTATTATATTCTAGACATTCTAATTTGTCAAAAAACACATATTGGGCGCAGATACCAGGGTCATCATAGTCCTGTGATGGGGTAGGGCTTGAATGTGTGATTTGGAACAATGAAAGCCCAATCTGTTGAGTACCTAA
ATGACCTTGCTAGTTCCAACTTATGCAGCGATTCCAAATGTCTTTTATCCGAGGAATGGTTTTGATGATGCCAATATGTCGTCTTCACAAATTTGCACTGATGTAACCTTATTTTATGGTCCTCCTCCCCAAACAAAGAGTTAAAACCAGTGTTTCACAGTTCTGTAATTGGGGAGCATTGCATAATTTCAAGGGGAAAA
TGTCATGACTCGTGGCTACTATCCATGGTCGAACAGGACTATATGTCCGCTACCCAAAATCTCAATGATTCATTGTCCAATGCATTTTTTCTCAACCATGGAATGAGGCTGTCATAGTCTTCATCGCTAGCACGCTTTTTGTTTAAAACATGGAAATGTTTTGAGTATTGGAAATTTATCTATTCCAATCAGATATCGGA
TGTATATCTGTCCATTGAGATGGGGTTTGCGAGTGTTAATTTTTAGAGTGCGTTTTTCATGTTAGAATTTTAGACAGTAGTTACAAAATACTAAGAAGCTGAGAACATATCTGCAATGTTCAACTATGTTGATAATAGTGCCGGACTTACAAAAATCCTTTCAATGCAAAAGCCATTTAGTGCCGTACTTTTTGTCCAAA
TTACAATATTGTAAACATATTATTTGAAGGTAGCAAGATTTCATGTTGAGGATCTGTGTTCCATAGGATAATGGGCTAGATCCATATCTGCTTTATGCCAAATGTGAGGGAGCTTGGGCCAAACACCTACCCTAACTGACATTATTGGGAAGATGTGGAGTGATTCATTTTCACAAAAGAAGTAACATTTCTGCATGAGA
TTTAAAAAGAAGCAGATTTAAACGTAATATGAAAAACACACATGGAATTTCAAAGGGTCTTCTGATCCAAAATTCCAAATATTGACCAATCTTGAGTTGTATAAAACAGGCAAAGAACTCATTTACTGAATCGGGTATGGTGTGCTTATCATTTTCATTTGGGTGAAAGACATTGACACTTTATTAATATCAAATTACCT
GATCACTTAGTGGGGTCTGGTTTTTGTTTCAGCCATGGACGCATGCTTATACATTTCTAGTATTAGATGCATGTTCATTCCATATCTGAAATCAGGCAATGAATGCTTGATCTGCACAATTTTCTACTGGACATAAATCATATTGTATCTGTTAATGCGTCCTTAGCATGTTCAAATTCAGATGGATACGTCATAGTAGC
TCTTGCATGGCTGTATTTTTTCACTCTTACTTGCCAATGCCAACATACCAGGAATTACAGTTTTTATAATGATGGACATGTGATTGTGCAGCGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCAC
CAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCA
GCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACTTGCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATC
TGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTT
GTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAG
TTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGC
AGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATA
CCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAG
GAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGGTGGTTAACATGTTTTGAGTTGTCAAACCTTTTCCACTTAAGTAGGCACTTTAATGACCATGGTTTGAAAATTGATTTTTATGAATTTACAGCATGCGGGTGAGGTATAT
GGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGGTAACATATGTAAATTTCTTTCGTTTTTAAGTTTTTCTTAATTTGATACAATTTTCAAATTTCTCACATGTTTCCCAAAATATAAGTCCCTTGAGCTCGAT
GGGTTTTGTGTGCATGTATTGAAA


>TRINITY_DN117251_c9_g1_i13 from sample A1 / Example unspliced isoform:
ATCTGATGAAATCATATTGACAGgttggtgctggttttcagtttttgatgatatggtatattaaatgttttttgattaggtctttattgcaatgtttgcactgattttcattttttatggacttacattcctgatgaacattgatatgtattgtaattgttgctcctgtgctatcccttgttataatacatttaactggt
ttcattttcagtttctattgtttttgcatttagggaatgtttgatgagatcctattgcaaaattgagttttaattcccatagacttgcatgctttattctctcactgaaaatgatgtttgtagggagggttgtacgtggaactctttttaactcttaagaagaaaagattttgtgggaagcttttttgttccaattacaa
cttctttcgatttttactgtgcag
ATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACT
TCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATAC
CGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTA
ATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATT
GATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGC
CAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTA
TTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAG




Intron 2 GTATGAATAT ... GATATTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A119.01524.7101.8144.5
A219.38421.112676.5
A316.58489.210292.5
A419.83410.510499.1
A519.03196.54646.4
A619.59782018
A719.3336.38773.8
A813.941081421
A915.81243.55635.5
A1017.193478658.1



>TRINITY_DN117251_c9_g1_i11 from sample A1 / Example spliced isoform
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCCAGCAGTTTCTCTTGAATTTTGGACGGTGAATCCGTGATTATGC
TTTAATTTGCTTTCGAACGCTGAATTTCTCTGTTCAAGGTTTTCAGCGGTGAAGTATGGCTGATTTTGGCCTTCGTTTTATCTGTTCTTGTTGGGAACTTCAGTATTTCATTGATTTTGGATGGTGAAATTATTGTCTCTGCTTAATTTTGGCTTGCGATCTGAAAACCCTTGAAGTAGGGCTCTTTTAGCGGCTAAATA
TAGCTGAATTTGTGTTTCTTAAATAATTGTCTTATCTCTTTCCTATAAATTTTGGGGTTTTGTTTGGGTTTCATGCTTTAATGGGTTTACGCGTTTTGCTTATTGTTTGTGTATTTGTGCATCTCGTTGGGCAGTGGTGTTGTTTTTTTCTTGAATTTCATTTGTGGATTGAAAATTGAACAAATTAAAACCTGATAGTG
AGCTCTTTAGGTGAATGAGATCTCGTGTTTACCAAACTGGGTTTATCCCTGTTTTTGAAGGTAGGGTCTGTGACAATGTCGATGGTGAGCATGCTATCGAAAAATTTACAATTATTGTAAGAAGTAAAGACAGACGAGCTGGCTATATATAGTTATTACTGTGCACGAGAGGGAGATTCAGTGACAGACTTGATTGAAGT
CATATGATTATAGTATGCTTTTCGACTTGATTGGACGCCTTTGATAAACAAATTAAAGTCATATTATTATATTCTAGACATTCTAATTTGTCAAAAAACACATATTGGGCGCAGATACCAGGGTCATCATAGTCCTGTGATGGGGTAGGGCTTGAATGTGTGATTTGGAACAATGAAAGCCCAATCTGTTGAGTACCTAA
ATGACCTTGCTAGTTCCAACTTATGCAGCGATTCCAAATGTCTTTTATCCGAGGAATGGTTTTGATGATGCCAATATGTCGTCTTCACAAATTTGCACTGATGTAACCTTATTTTATGGTCCTCCTCCCCAAACAAAGAGTTAAAACCAGTGTTTCACAGTTCTGTAATTGGGGAGCATTGCATAATTTCAAGGGGAAAA
TGTCATGACTCGTGGCTACTATCCATGGTCGAACAGGACTATATGTCCGCTACCCAAAATCTCAATGATTCATTGTCCAATGCATTTTTTCTCAACCATGGAATGAGGCTGTCATAGTCTTCATCGCTAGCACGCTTTTTGTTTAAAACATGGAAATGTTTTGAGTATTGGAAATTTATCTATTCCAATCAGATATCGGA
TGTATATCTGTCCATTGAGATGGGGTTTGCGAGTGTTAATTTTTAGAGTGCGTTTTTCATGTTAGAATTTTAGACAGTAGTTACAAAATACTAAGAAGCTGAGAACATATCTGCAATGTTCAACTATGTTGATAATAGTGCCGGACTTACAAAAATCCTTTCAATGCAAAAGCCATTTAGTGCCGTACTTTTTGTCCAAA
TTACAATATTGTAAACATATTATTTGAAGGTAGCAAGATTTCATGTTGAGGATCTGTGTTCCATAGGATAATGGGCTAGATCCATATCTGCTTTATGCCAAATGTGAGGGAGCTTGGGCCAAACACCTACCCTAACTGACATTATTGGGAAGATGTGGAGTGATTCATTTTCACAAAAGAAGTAACATTTCTGCATGAGA
TTTAAAAAGAAGCAGATTTAAACGTAATATGAAAAACACACATGGAATTTCAAAGGGTCTTCTGATCCAAAATTCCAAATATTGACCAATCTTGAGTTGTATAAAACAGGCAAAGAACTCATTTACTGAATCGGGTATGGTGTGCTTATCATTTTCATTTGGGTGAAAGACATTGACACTTTATTAATATCAAATTACCT
GATCACTTAGTGGGGTCTGGTTTTTGTTTCAGCCATGGACGCATGCTTATACATTTCTAGTATTAGATGCATGTTCATTCCATATCTGAAATCAGGCAATGAATGCTTGATCTGCACAATTTTCTACTGGACATAAATCATATTGTATCTGTTAATGCGTCCTTAGCATGTTCAAATTCAGATGGATACGTCATAGTAGC
TCTTGCATGGCTGTATTTTTTCACTCTTACTTGCCAATGCCAACATACCAGGAATTACAGTTTTTATAATGATGGACATGTGATTGTGCAGCGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCAC
CAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCA
GCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACTTGCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATC
TGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTT
GTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAG
TTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGC
AGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATA
CCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAG
GAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGGTGGTTAACATGTTTTGAGTTGTCAAACCTTTTCCACTTAAGTAGGCACTTTAATGACCATGGTTTGAAAATTGATTTTTATGAATTTACAGCATGCGGGTGAGGTATAT
GGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGGTAACATATGTAAATTTCTTTCGTTTTTAAGTTTTTCTTAATTTGATACAATTTTCAAATTTCTCACATGTTTCCCAAAATATAAGTCCCTTGAGCTCGAT
GGGTTTTGTGTGCATGTATTGAAA


>TRINITY_DN117251_c9_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTTCGACA
ACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGgtatgaatatgatttctaaatgattttatcaaccttattta
tttgttctaaggatatacaggcatcccatccgaatgcacaaattgtttttccatttcaatcagggaattgcaatatattgctaaaaagtgatagatttatatgatattacag
CAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTAT
TCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTAT
CTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTT
GTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGA
TGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAAC
TAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCT
TGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAG
AGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTC
TGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAA
CTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATGGATTTCTAGCTGCAGCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCA
TTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTATCAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAG
AGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTCGAGGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATG
TTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGC
TATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATATTAGATGCTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAAT
TTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGAGTATTATGTATTTTTTGGAATGATCTTTATTTGAACATTCTGTGATTGTGTTTTTGTAATTTACTCCATTTAATTGTGTGTTTGTCTACCCACTTTTTAAAATTCAATCCAGTTGAAATGTAGTTAAAT




Intron 3 GTTGGTGCTG ... TACTGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A119.69328.473.687.4
A220.2726056.276
A322.23299.6108.962.3
A419.95257.463.864.6
A520.961303435
A621.036916.720.1
A717.7621639.953.4
A819.381011929.6
A917.8319339.344.4
A1019.720949.653.1



>TRINITY_DN111006_c0_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform
AGCGGAGAGTATTTGCTCACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGCCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCCGTGGAAAGGTGCATTGGACTT
TTTGGAATCAGCAAAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGTAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCT
TTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCG
TCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATATTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGA
GTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGT
GAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAA
TCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTGAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAG
ACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAG
AAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAATGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGA
GAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCCA
TGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAAT
GCATTTCTAGCTGCACCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCATTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTATCAGTCCAT
TGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAGAGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGTTCAAAATATTCTGTCGAGGCAGAGA
AGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTCATCGAGCA
TAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGCTAGCTAT
ATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGA


>TRINITY_DN111006_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:
AGCGGAGAGTATTTGCTCACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGCCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCCGTGGAAAGGTGCATTGGACTT
TTTGGAATCAGCAAGTTCGACAACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGTAAGAGAAGTGCATTCAAG
AGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGG
AAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGgttggtgctggttttcagtttttgatgatatggtatattaaatgttttttgattaggtctttattgca
atgtttgcactgattttcattttttatggacttacattcctgatgaacattgatatgtattgtaattgttgctcctgtgctatcccttgttataatacatttaactggtttcattttcagtttctattgtttttgcatttagggaatgtttgatgagatcctattgcaaaattgagttttaattcccaatagacttgcat
gctttattctctcactgaaaatgatgtttgtagggagggttgtacgtggaactctttttaactcttaagaagaaaagattttgtgggaagcttttttgttccaattacaacttctttcgatttttactgtgcag
ATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATATTGAACATC
CTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAA
ATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTAC
AAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTGAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGA
ATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAA
GGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAATGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGA
TATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGG
AGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCCATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATG
GATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATGCATTTCTAGCTGCACCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCATTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTC
TCTGCATAGCAGTCTGTATCAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAGAGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAA
GTTCAAAATATTCTGTCGAGGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAAT
CGGTGTCCGGCAGTCCTTCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAA
AACCAAGCAATGTTAGATGCTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGA




Intron 4 GTAACATATG ... AAAACAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A113.564599153
A213.1350310646
A311.9454211037
A410.73175521
A513.272555325
A69.95467842
A710.75117522954
A812.2289117771
A910.9699517867
A1010.9896117067



>TRINITY_DN43832_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoform
CACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGATAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCAAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGCCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTT
CGACAACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGTAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGA
GGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAG
CATGACTTGCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAA
TTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGC
AATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCAGAGACCGCAATGGATCAACGTACTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAA
GAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTGAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGT
GGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTA
AGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAATGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTA
TATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGT
GCTTTCCATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTTTCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAAT
TTGCAAATGCATTTCTAGCTGCACCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCATTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTAT
CAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAGAGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTCGA
GGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTC
ATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATG
CTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGAGTATTATGTATTTTTTGGAATGATCTTTATTTGAACATTCTGTGATTGTGTTTTTGTAATTTACC


>TRINITY_DN43832_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:
CACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGATAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCAAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGCCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTT
CGACAACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGTAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGA
GGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAG
CATGACTTGCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAA
TTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGC
AATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCAGAGACCGCAATGGATCAACGTACTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAA
GAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTGAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGT
GGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTA
AGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAATGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTA
TATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGgtaacatatgtaaatttctttcgtttttaagtttttcttaatttgatacaattttcaaatttctcacatgtttcccaaaatataagtcccttgagctc
gatgggttttgtgtgcatgtattgaaagcttctcaacttttttgagaaattgctctactttatacctggaaagtttggatgtatttcactattcacattgcgggtagcttagctgcgagattagatcccattttgttgccttcaagacaattttcatacatttatgatttttggtagcctagcaactgtggtcgtgattt
caactttcttttatgatttttggtagcctagcaactgtggtcgtgatttcaactttcttttctccaaagaattttaataggaaagatagttctgcctcgtgcattgctgtcttgctagatctgtaagtgcctgaaatgcataataaaaatttcatccatatagaaaagccagaattgtgctttgatcttggggtaagcta
gcattttctcagaaaaacacaaaattctgagatgaagggaaaaacctgttgtgatctttgcctaaaagaacccaaaagcctgagttaaatccaactaggaaaaggaggctttgatggctactctagttccagccctgcaactggcatgctcaggcaaaattgtattctaagcttcaaatgaatccttcaagccactgtac
agtggaaatttattcatggttttaaagaggaaaacaacacacggataaagtgattttaatttctgcatgattctctctgcattttttgttagggggtttggaggaacttgagtttttgcacataatagagtacatgtctattgtatctatattattaataggcaaatgcccttgctaggtctacttgtttgatttacacg
ttcagattgtcagttaaaataaaaatatttatattcaatctaatgcttctaagtatgttccttctaagtttctgatacactaaccaaggttcaaaacagcag
ATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGT
GCTTTCCATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTTTCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAAT
TTGCAAATGCATTTCTAGCTGCACCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCATTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTAT
CAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAGAGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTCGA
GGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTC
ATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATG
CTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGAGTATTATGTATTTTTTGGAATGATCTTTATTTGAACATTCTGTGATTGTGTTTTTGTAATTTACC




Intron 5 GTATGAATAT ... TTTCAATCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A194.4461028
A296.9241267
A398.0821027
A495.41510416
A59244610
A695.241201
A71000870
A81000140
A998.251562
A1098.851861



>TRINITY_DN117251_c9_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform
GGATATCTTAAATAGTCCAGAGGGAATTGCAATATATTGCTAAAAAGTGATAGATTTATATGATATTACAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATT
CAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGAC


>TRINITY_DN117251_c9_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTTCGACA
ACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGgtatgaatatgatttctaaatgattttatcaaccttattta
tttgttctaaggatatacaggcatcccatccgaatgcacaaattgtttttccatttcaatcag
GGAATTGCAATATATTGCTAAAAAGTGATAGATTTATATGATATTACAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTAT
TCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTAT
CTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTT
GTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGA
TGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAAC
TAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCT
TGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAG
AGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTC
TGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAA
CTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATGGATTTCTAGCTGCAGCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCA
TTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTATCAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAG
AGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTCGAGGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATG
TTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGC
TATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATATTAGATGCTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAAT
TTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGAGTATTATGTATTTTTTGGAATGATCTTTATTTGAACATTCTGTGATTGTGTTTTTGTAATTTACTCCATTTAATTGTGTGTTTGTCTACCCACTTTTTAAAATTCAATCCAGTTGAAATGTAGTTAAAT




Intron 6 GTAACATATG ... AAAACAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A112.954598551.7
A212.525039846
A311.43541.3101.338.3
A410.5331751.723
A513.3625551.727
A69.65467244
A710.251175213.754.7
A811.66891.716372.3
A910.23996.3161.365.7
A1010.5696115671



>TRINITY_DN40760_c0_g1_i6 from sample A8 / Example spliced isoform
CTCACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGATAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCAAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGCCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAG
TTCGACAACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGTAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTG
GAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTG
AGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATT
AATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCT
GCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCAGAGACCGCAATGGATCAACGTACTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATG
AAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAAT
GTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGC
TAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGG
TATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAA
GTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTTTCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAA
ATTTGCAAATGCATTTCTAGCTGCACCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCATTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGT
ATCAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAGAGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTC
GAGGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCT
TCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGA
TGCTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGTTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGAGTATTATGTATTTTTTGGAATGATCTTTATTTGAACATTCTGTGATTGTGTTTTTGTAA


>TRINITY_DN40760_c0_g1_i5 from sample A8 / Example unspliced isoform:
CTCACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGATAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCAAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGCCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCGAATTACAGTTTTTATAATGATGGACATGTGATTGTG
CAGTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTTCGACAACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGT
CCAGAGTAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAA
CTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCA
AACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGAT
CTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCAGAGACCGCAATGGAT
CAACGTACTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATAC
TGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGA
TTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTC
TCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGGTGGTTAACATGTTTTGAGTTGTCAAACCTTTTCCACTTAAGTAGGCACTTTAATGACCATGGTTTGAAAATTGATTTTTATGAATTTACAGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCA
GCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGgtaacatatgtaaatttctttcgtttttaagtttttcttaatttgatacaattttcaaatttctcacatgtttcccaaaatataagtcccttgagctcgatgggttttgtgtgcatgtattgaaagcttctcaacttttttgagaaattgctctactttatacc
tggaaagtttggatgtatttcactattcacattgcgggtagcttagctgcgagattagatcccattttgttgccttcaagacaattttcatacatttatgatttttggtagcctagcaactgtggtcgtgatttcaactttcttttatgatttttggtagcctagcaactgtggtcgtgatttcaactttcttttctcca
aagaattttaataggaaagatagttctgcctcggcattgctgtcttgctagatctgtaagtgcctgaaatgcataataaaaatttcatccatatagaaaagccagaattgtgctttgatcttggggtaagctagcattttctcagaaaaacacaaaattctgagatgaagggaaaaacctgttgtgatctttgcctaaaa
gaacccaaaagcctgagttaaatccaactaggaaaaggaggctttgatggctactctagttccagccctgcaactggcatgctcaggcaaaattgtattctaagcttcaaatgaatccttcaagccactgtacagtggaaatttattcatggttttaaagaggaaaacaacacacggataaagtgattttaatttctgca
tgattctctctgcattttttgttagggggtttggaggaacttgagtttttgcacataatagagtacatgtctattgtatctatattattaataggcaaatgcccttgctaggtctacttgtttgatttacacgttcagattgtcagttaaaataaaaatatttatattcaatctaatgcttctaagtatgttccttctaa
gtttctgatacactaaccaaggttcaaaacagcag
ATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCA
GAAACTAACACCAAG




Intron 7 GTAAGCGACT ... TTTTATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A116.72416.135.893.1
A215.484214086.3
A314.97464.233.192.1
A416.0134027.772.9
A521.91201.519.662.9
A615.63734.250.6153.3
A714.061130.791.3205.3
A814.65934.670179.1
A915.111000.799.4199.7
A1015.2891.384.4177.1



>TRINITY_DN117251_c9_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoform
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTTCGACA
ACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGGTATGAATATGATTTCTAAATGATTTTATCAACCTTATTTA
TTTGTTCTAAGGATATACAGGCATCCCATCCGAATGCACAAATTGTTTTTCCATTTCAATCAGGGAATTGCAATATATTGCTAAAAAGTGATAGATTTATATGATATTACAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTAT
TCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTAT
CTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTT
GTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGA
TGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAAC
TAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCT
TGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAG
AGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTC
TGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAA
CTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATGGATTTCTAGCTGCAGCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCA
TTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTATCAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAG
AGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTCGAGGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATG
TTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGC
TATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATATTAGATGCTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAAT
TTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGAGTATTATGTATTTTTTGGAATGATCTTTATTTGAACATTCTGTGATTGTGTTTTTGTAATTTACTCCATTTAATTGTGTGTTTGTCTACCCACTTTTTAAAATTCAATCCAGTTGAAATGTAGTTAAAT


>TRINITY_DN117251_c9_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTTCGACA
ACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCT
TCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGA
CCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCT
TGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGC
AGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGC
AAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAAT
TAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAA
GAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGG
AGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTT
CAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGGTGCGTGGCACCTTTAGAGGTTTCATTTTTTTATGCATCTTTGCATCTTTTGATGGTCATATCTGTTCTTCTGTTTCACTAATCTGGATGTATGGTGCAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTG
TGGTCACATGGTTGATGCATTGCAgtaagcgactttttcatcagcgctatttagttttgttaggctctaaagtattcttttgttttcatttcctcttgcatgttggtacgctaaaaacatggtggtgtggttctttgtcaatcgagtttagctttattatctctggtaggcagaaatgtctctagattggtttttgatta
aaagactgtttgactggttttatgcag
AGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATG




Intron 8 GTGCGTGGCA ... TATGGTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A127.12446169.211.9
A222.15413119.43.9
A326.21536.5194.211.1
A423.86324.3103.46.1
A527.119373.38.7
A623.09726.5221.77.3
A724.281287.542014.9
A823.611022.5321.414.1
A924.021078.4346.915.9
A1024.61050.3349.117.7



>TRINITY_DN117251_c9_g1_i6 from sample A1 / Example spliced isoform
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTTCGACA
ACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGGTATGAATATGATTTCTAAATGATTTTATCAACCTTATTTA
TTTGTTCTAAGGATATACAGGCATCCCATCCGAATGCACAAATTGTTTTTCCATTTCAATCAGGGAATTGCAATATATTGCTAAAAAGTGATAGATTTATATGATATTACAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTAT
TCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTAT
CTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTT
GTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGA
TGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAAC
TAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCT
TGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAG
AGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTC
TGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAA
CTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATGGATTTCTAGCTGCAGCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCA
TTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATGCACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTATCAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAG
AGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGTCCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTCGAGGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATG
TTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGC
TATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAATTTCATGTCTTTGCAAGTACATTCGGTGAAAGATAGTTTTCTTAAGTACTTTCCTCCTGTTGTTTTGTCTCGGATTCTCAAAATACAATAGGGAAAACCAAGCAATATTAGATGCTAGCTATATTTTGTGCTATAGTGGCAATTTTGCATGTACAGATTTTAGAAT
TTCATATCTCTGCAAGTGTATTTGCTGAATGATAGGTTTTTATGTGCTGCTAAAATTCTGAGTATTATGTATTTTTTGGAATGATCTTTATTTGAACATTCTGTGATTGTGTTTTTGTAATTTACTCCATTTAATTGTGTGTTTGTCTACCCACTTTTTAAAATTCAATCCAGTTGAAATGTAGTTAAAT


>TRINITY_DN117251_c9_g1_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCTGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAGTTCGACA
ACTTGGTAAATCTTGAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGGGAGGATAAGGCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCT
TCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTGCCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGA
CCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCTATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCT
TGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGC
AGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGC
AAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAAT
TAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAA
GAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGG
AGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTT
CAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGgtgcgtggcacctttagaggtttcatttttttatgcatctttgcatcttttgatggtcatatctgttcttctgtttcactaatctggatgtatggtgcagTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTG
TGGTCACATGGTTGATGCATTGCAGTAAGCGACTTTTTCATCAGCGCTATTTAGTTTTGTTAGGCTCTAAAGTATTCTTTTGTTTTCATTTCCTCTTGCATGTTGGTACGCTAAAAACATGGTGGTGTGGTTCTTTGTCAATCGAGTTTAGCTTTATTATCTCTGGTAGGCAGAAATGTCTCTAGATTGGTTTTTGATTA
AAAGACTGTTTGACTGGTTTTATGCAGAGGGGAAGTATCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGAACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATG




Intron 9 GTAAGTTCTC ... TGTTCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A149.192822730
A249.923253240
A348.963453313
A450.6821822412
A5501581582
A648.8265620
A749.571771740
A85071710
A949.772152130
A1049.882032020



>TRINITY_DN105217_c0_g1_i9 from sample A5 / Example spliced isoform
GGCTCACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGATAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCAAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCCAGCAGTTTCTCTTGAATTTTGGACGGTGAATCCG
TGATTATGCTTTAATTTGCTTTCGAACGCTGAATTTCTCTGTTCAAGGTTTTCAGCGGTGAACGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAA


>TRINITY_DN105217_c0_g1_i12 from sample A5 / Example unspliced isoform:
GGCTCACCACTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGATAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCAAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCgtaagttctcttcgtgccattttttcacaatcaaa
tttggtgcaaaattggaagtgttttgtacttttgatcctaattgtagtttagagttttgatatgtcgccggatctgttctgcag
CAGCAGTTTCTCTTGAATTTTGGACGGTGAATCCGTGATTATGCTTTAATTTGCTTTCGAACGCTGAATTTCTCTGTTCAAGGTTTT




Intron 10 GTGGTTAACA ... GAATTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A110.12447153.450.3
A210.66366130.743.7
A316.01419.1166.279.9
A48.820073.319.3
A515.5618667.134.3
A69.9737398.341.3
A711.96821254.5111.5
A813.88620203.1100
A911.81768.6268.4103
A1011.5463123582.3



>TRINITY_DN117251_c9_g1_i13 from sample A1 / Example spliced isoform
ATCTGATGAAATCATATTGACAGGTTGGTGCTGGTTTTCAGTTTTTGATGATATGGTATATTAAATGTTTTTTGATTAGGTCTTTATTGCAATGTTTGCACTGATTTTCATTTTTTATGGACTTACATTCCTGATGAACATTGATATGTATTGTAATTGTTGCTCCTGTGCTATCCCTTGTTATAATACATTTAACTGGT
TTCATTTTCAGTTTCTATTGTTTTTGCATTTAGGGAATGTTTGATGAGATCCTATTGCAAAATTGAGTTTTAATTCCCATAGACTTGCATGCTTTATTCTCTCACTGAAAATGATGTTTGTAGGGAGGGTTGTACGTGGAACTCTTTTTAACTCTTAAGAAGAAAAGATTTTGTGGGAAGCTTTTTTGTTCCAATTACAA
CTTCTTTCGATTTTTACTGTGCAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTCCTATGATGAAAACACCATCCAAACT
TCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATAAATGTAGCACCAATTCAAAAAATAC
CGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTTATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTA
ATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTCCAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATT
GATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACCGTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGC
CAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGCATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTA
TTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATGAGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAG


>TRINITY_DN117251_c9_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CTTTCAAAGAGCAGGAGCAGGACCAGACGTCCCGTATTTTATTTGACAGCGGGAAGCTTAACGTTTCCGAGGGATTGCAAGCCTCTGGTCGATGTATGGTCATTGTTTGATTCTGCTAGGCTGTACCCCATTCTTCTAATAAACCCCGGCTATTTCCAGCAGTTTCTCTTGAATTTTGGACGGTGAATCCGTGATTATGC
TTTAATTTGCTTTCGAACGCTGAATTTCTCTGTTCAAGGTTTTCAGCGGTGAAGTATGGCTGATTTTGGCCTTCGTTTTATCTGTTCTTGTTGGGAACTTCAGTATTTCATTGATTTTGGATGGTGAAATTATTGTCTCTGCTTAATTTTGGCTTGCGATCTGAAAACCCTTGAAGTAGGGCTCTTTTAGCGGCTAAATA
TAGCTGAATTTGTGTTTCTTAAATAATTGTCTTATCTCTTTCCTATAAATTTTGGGGTTTTGTTTGGGTTTCATGCTTTAATGGGTTTACGCGTTTTGCTTATTGTTTGTGTATTTGTGCATCTCGTTGGGCAGTGGTGTTGTTTTTTTCTTGAATTTCATTTGTGGATTGAAAATTGAACAAATTAAAACCTGATAGTG
AGCTCTTTAGGTGAATGAGATCTCGTGTTTACCAAACTGGGTTTATCCCTGTTTTTGAAGGTAGGGTCTGTGACAATGTCGATGGTGAGCATGCTATCGAAAAATTTACAATTATTGTAAGAAGTAAAGACAGACGAGCTGGCTATATATAGTTATTACTGTGCACGAGAGGGAGATTCAGTGACAGACTTGATTGAAGT
CATATGATTATATTATGCTTGTCGACTTGATTGGACGCCTTTGATAAACAAATTAAAGTCATATTATTATATTCTAGACATTCTAATTTGTCAAAAAACACATATTGGGCGCAGATACCAGGGTCATCATAGTCCTGTGATGGGGTAGGGCTTGAATGTGTGATTTGGAACAATGAAAGCCCAATCTGTTGAGTACCTAA
ATGACCTTGCTAGTTCCAATAATTGAAGTCATATGATTATATTATGCTTGTCGACTTGATTGGACGCCTTTGATAAACAAATTAAAGTCATATTATTATATTCTAGACATTCTAATTTGTCAAAAAACACATATTGGGCGCAGATACCAGGGTCATCATAGTCCTGTGATGGGGTAGGGCTTGAATGTGTGATTTGGAAC
AATGAAAGCCCAATCTGTTGAGTACCTAAATGACCTTGCTAGTTCCAACTTATGCAGCGATTCCAAATGTCTTTTATCCGAGGAATGGTTTTGATGATGCCAATATGTCGTCTTCACAAATTTGCACTGATGTAACCTTATTTTATGGTCCTCCTCCCCAAACAAAGAGTTAAAACCAGTGTTTCACAGTTCTGTAATTG
GGGAGCATTGCATAATTTCAAGGGGAAAATGTCATGACTCGTGGCTACTATCCATGGTCGAACAGGACTATATGTCCGCTACCCAAAATCTCAATGATTCATTGTCCAATGCATTTTTTCTCAACCATGGAATGAGGCTGTCATAGTCTTCATCGCTAGCACGCTTTTTGTTTAAAACATGGAAATGTTTTGAGTATTGG
AAATTTATCTATTCCAATCAGATATCGGATGTATATCTGTCCATTGAGATGGGGTTTGCGAGTGTTAATTTTTAGAGTGCGTTTTTCATGTTAGAATTTTAGACAGTAGTTACAAAATACTAAGAAGCTGAGAACATATCTGCAATGTTCAACTATGTTGATAATAGTGCCGGACTTACAAAAATCCTTTCAATGCAAAA
GCCATTTAGTGCCGTACTTTTTGTCCAAATTACAATATTGTAAACATATTATTTGAAGGTAGCAAGATTTCATGTTGAGGATCTGTGTTCCATAGGATAATGGGCTAGATCCATATCTGCTTTATGCCAAATGTGAGGGAGCTTGGGCCAAACACCTACCCTAACTGACATTATTGGGAAGATGTGGAGTGATTCATTTT
CACAAAAGAAGTAACATTTCTGCATGAGATTTAAAAAGAAGCAGATTTAAACGTAATATGAAAAACACACATGGAATTTCAAAGGGTCTTCTGATCCAAAATTCCAAATATTGACCAATCTTGAGTTGTATAAAACAGGCAAAGAACTCATTTACTGAATCGGGTATGGTGTGCTTATCATTTTCATTTGGGTGAAAGAC
ATTGACACTTTATTAATATCAAATTACCTGATCACTTAGTGGGGTCTGGTTTTTGTTTCAGCCATGGACGCATGCTTATACATTTCTAGTATTAGATGCATGTTCATTCCATATCTGAAATCAGGCAATGAATGCTTGATCTGCACAATTTTCTACTGGACATAAATCATATTGTATCTGTTAATGCGTCCTTAGCATGT
TCAAATTCAGATGGATACGTCATAGTAGCTCTTGCATGGCTGTATTTTTTCACTCTTACTTGCCAATGCCAACATACCAGGAATTACAGTTTTTATAATGATGGACATGTGATTGTGCAGCGTGGAAAGGTGCATTGGACTTTTTGGAATCAGCAAAAGCTCGACTTTGTGTTAATTGGAATTTATGCAAGGAGGATAAG
GCATATAGTATCCTGGACCTCTTTTGCACCAGCTTAATGTAAACTGGACCACAATAGCAGCACATGTTTTGAACGAGGATATCTTAAATAGTCCAGAGCAAGAGAAGTGCATTCAAGAGGAGTGATGGATTGGAGGGCTTCTTTTACTTCTCTTCGTGAGATTTTTCCACAGGTTGATGAACGTATTCTTAAGGCCGTTG
CCCTGGAGCACCGCACTGATGTTGATTCAGCTGTGGAATTTATCCTTAGTGAGGTGGTTCCAAACCAGACTGGCCGAATAGCTGTTGTGGAACTTGATTGTGAGAGTGGAACTTTGGAAGTTCCAAAAAGTGAGCATGACCGTCATCCAGGTTCCGAGCAATCAGCACCAACCTCTTCTCATTTATCTGATTGCTGCTCT
ATATCTGATGATGATGCATCGGAGGTATCTGATGAAATCATATTGACAGATAGAAGGTCAGAGTATGAACGCATTGTTGCTGATCTAAATCAAACTAAAATTAATGTTGAACATCCTAGCTCGTCATTGATTAATTCCTTGAGTGACGAGGAAATAATAAATAGCACGAAAAAGAGTTTTTTTCTTGTCTCAAAGCAGTC
CTATGATGAAAACACCATCCAAACTTCTTGTTCACCGTATCAGTTTAACTTGAACCAATCTCAAACTGGAATTGAAAACAAAGGATTCAGATCTCACTTGGATGATATGGCTGAAATTAAAGGTGATCACCTGCAATGCAGTGAAAAATCTTTAATACAGTTTGAGGATGCCAACACCAATGAAGATGTCAATGCTGATA
AATGTAGCACCAATTCAAAAAATACCGAGTTTAACTTGCTGGCAATAAGCTCTGTAGTTTTTGGTATGGTCGATTCCGAGACCGCAATGGATCAACGTCCTCATGTTGACACTACAAATGTTAGCAGTTATGAAGAAGCAAATCAATGCACCGAAGAAGCAGCAGTAAGGACAAGCGAGTCCAAACTAAACTTTTCAGTT
ATTGAGCGACCTGCAAAATCTCCTAATGCAGCTGAAACCTTCTATAAAGAAAGTACAGACAGTCTTCCTCTTATTCAGACAACTCAAGATACTGTTGGCTTGAGTGGCTTCAAGAATGACAATATCCTGAATGTGGAATTAGACACAGGATGCTCATTTATCAGTGTTGAAGATGGTTCACTTTCTTGCAGTCAGGCTTC
CAGCTCCGGCAAGATTGTAAATATTGATACCCTGGAAGGTTTTGTTGAAGATGAGTCACTTTCTTGCAGTCGGACATCCTCCTCCAGCCAGATTGTAAGTGTTGATACCGTGGAAGGTTTTGTTTCCGAGGCTAAGAAAGAGAAGGAAATGCTAATGGAAGCTATGGAATTAATTCGCTCCTTGAGAGCAGAAGCAGACC
GTGAAGAGGTTGCAGCTCAACATGCCAAGGAAGAGGCAGCAAAAGGTGGCGTGGACATTTTGTCCAAGGTTGAGGAGTTGAGAAAAATGCTCTCACGTGCAAAAGAAACAAATGATATGgtggttaacatgttttgagttgtcaaaccttttccacttaagtaggcactttaatgaccatggtttgaaaattgattttta
tgaatttacag
CATGCGGGTGAGGTATATGGAGAGAGAGCAATTCTAGCTACAGAAGCAAGAGAACTTCGATCTCGTCTGGCACAACTGTCAGCTGAGAAAGACAAAGCATTTTGTATTATTGGCGAGATGCGTGAAAATCTGCAAGCAAGAATTTCTGCTGCAAGAAAAGAGAGAGAAGCTGCCGAGGAGGAGAAAATG
AGAAAGGAGGAAAATGCCAGGAAAGTGCTTTCAATGGAAGAAGCCCTGATGTCTAAAGTGGCACAGGATTCTAAGGAACTTGAGCAAGAAGCAGAAACTAACACCAAGTTGAGGGAGTCCCTAATTGATTGTGGTCACATGGTTGATGCATTGCAAGGGGAAGTTTCTGTTCTATCTGAAGATGCCAAATTTTTTAAAGA
ACAGATGGATGGAGGTATAACTAAATTTGCAAATGCATTTCTAGCTGCACCTTCCAGATGTCAGAACATGGATGGGCATTGGACAGCCTCCAATGGCATTACCTTTGGATCGTTTTCTTCGACGAGGGCATATGGTAGGAATGACGATATCAATATGTCAAATTTCAGCATGCGAAGTGGCAGCCGTGATTCACAAGATG
CACAGTCTCTGCATAGCAGTCTGTATCAGTCCATTGATAATGTTGCCACCCTAAATCCTATTGCAAGTTCTGCCCGAGAGTTTGTCCCTTACACAAGTTTTTCCCCTTCAACACTTGATAGTGATGAGGAAATGGATTGCCTCATAGATGGAGTGGAAAGATGTATGGCTGAGACATATACAGAATGCCAGGTTGTGAGT
CCCAAAAGCTCAAAATATTCTGTCGAGGCAGAGAAGCAACTGAATCTGAAGATAGGTTCCGATGATGGATGGCAAATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTCAGGAAATCGGTGTCTGGCAGTCCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCTAAGTTAGATGGCTACGATGATGGATGGCAGATGTTAGATGTGTGTGGCGAATTC
AGGAAATCGGTGTCCGGCAGTCCTTCATCGAGCATAGGGAAAACCAAGCAATGTTAGATGTTTAGCTATATTTTGTGCTATAGTG