sp|Q71T45|H32_EUPES ----> Histone H3.2

Intron 1 GTGTGTTTTC ... TATGCTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	-1	0	0	0
A2	0	2	0	2
A3	0	1	0	1
A4	100	0	1	1
A5	85.71	1	6	1
A6	89.9	10	89	17
A7	88.89	4	32	14
A8	84.47	16	87	10
A9	91.89	6	68	5
A10	100	0	35	2

>TRINITY_DN44827_c1_g5_i3 from sample A6 / Example spliced isoform

ATCCACGCCAAGAGGGTTACAATTATGCCCAAGGATATCCAGCTTGCTCGCCGCATCCGTGGAGAGAGGGCATAAATTTATATCATATGTTATCATGATTATGCAGTGCTAGTGCATTTACCTGTCAGTGTCAATGTAATGGGCACGGACAGGAGAAACTGATGTTGAGCTCTTCAGATGCAGAGAAGTGAATTTATTAA
ATGGTAGTTGTGGAGGGAAAATAGTGAAGTTCAGTTCTTCAGGTGCAAAGAGGCGAACCTATTAAATGGCGCTAAAATTTAAAAAAAAATTGAGCTTATCTGTATCGAGGTTTAAATCCTCGGAAGTGAGTTATGGGCTCACCACGCTTCCGCTGCGCCACTCTCATATGCTGTCTTGTATTGTATTTTTTATGGTTATA
AACCGCCAAGGCAGTTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTATTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTATTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATTTATTCCTCTGCTGTA

>TRINITY_DN44827_c1_g5_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

ATCCACGCCAAGAGGGTTACAATTATGCCCAAGGATATCCAGCTTGCTCGCCGCATCCGTGGAGAGAGGGCATAAATTTATATCATATTTTTTCATGATTATGCAGTGCTAGTGCATTTGCCTGTCAGTGTCAATGgtgtgttttcacaccaccatctgcttctttaaatttgttttccctctacttctccctcttttga
attgttcatttacatctgcttctgtattgttgattcacagcaatctcccttttaacctgcttaattgttgatttacatctgctttcgcattgttgattctcagcaaagtaagtttatttgatcttatttgtatgaaaaatttcaattttatgctttagTAATGGGCACGGACAGGAGAAACTGATGTTGAGCTCTTCAGA
TGCAGAGAAGTGAATTTATTAAATGGTAGTTGTGGAGGGAAAATAGTGAAGTTCAGTTCTTCAGGTGCAAAGAGGCGAACCTATTAAATGGCGCTAAAATTTAAAAAAAAATTGAGCTTATCTGTATCGAGGTTTAAATCCTCGGAAGTGAGTTATGGGCTCACCACGCTTCCGCTGCGCCACTCTCATATGCTGTCTTG
TATTGTATTTTTTATGGTTATAAACCGCCAAGGCAGTTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTATTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTATTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATT
TATTCCTCTGCTGTA

Intron 2 GTGTGTTTTC ... TATGCTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	100	0	37	0
A2	91.67	2	22	2
A3	97.22	1	35	1
A4	100	0	33	1
A5	96.43	1	27	1
A6	97.97	10	482	17
A7	98.86	4	348	14
A8	97.52	16	628	10
A9	98.7	6	454	5
A10	100	0	230	2

>TRINITY_DN44827_c1_g5_i3 from sample A6 / Example spliced isoform

ATCCACGCCAAGAGGGTTACAATTATGCCCAAGGATATCCAGCTTGCTCGCCGCATCCGTGGAGAGAGGGCATAAATTTATATCATATGTTATCATGATTATGCAGTGCTAGTGCATTTACCTGTCAGTGTCAATGTAATGGGCACGGACAGGAGAAACTGATGTTGAGCTCTTCAGATGCAGAGAAGTGAATTTATTAA
ATGGTAGTTGTGGAGGGAAAATAGTGAAGTTCAGTTCTTCAGGTGCAAAGAGGCGAACCTATTAAATGGCGCTAAAATTTAAAAAAAAATTGAGCTTATCTGTATCGAGGTTTAAATCCTCGGAAGTGAGTTATGGGCTCACCACGCTTCCGCTGCGCCACTCTCATATGCTGTCTTGTATTGTATTTTTTATGGTTATA
AACCGCCAAGGCAGTTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTATTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTATTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATTTATTCCTCTGCTGTA

>TRINITY_DN44827_c1_g5_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

ATCCACGCCAAGAGGGTTACAATTATGCCCAAGGATATCCAGCTTGCTCGCCGCATCCGTGGAGAGAGGGCATAAATTTATATCATATGTTATCATGATTATGCAGTGCTAGTGCATTTACCTGTCAGTGTCAATGgtgtgttttcacaccaccatctgcttctttaaatttgttttccctctacttctcccttttatca
tgcttttgaattgttttttttcagcgaatcatgcttttgaattgttcatttacatctgcttctgtattgttgattcacagcaatctcccttttaacctgcttaattgttgatttacatctgctttcgcattgttgattctcagcaaagtaagtttatttgatcttatttgtatgaaaaatttcaattttatgctttagTA
ATGGGCACGGACAGGAGAAACTGATGTTGAGCTCTTCAGATGCAGAGAAGTGAATTTATTAAATGGTAGTTGTGGAGGGAAAATAGTGAAGTTCAGTTCTTCAGGTGCAAAGAGGCGAACCTATTAAATGGCGCTAAAATTTAAAAAAAAATTGAGCTTATCTGTATCGAGGTTTAAATCCTCGGAAGTGAGTTATGGGC
TCACCACGCTTCCGCTGCGCCACTCTCATATGCTGTCTTGTATTGTATTTTTTATGGTTATAAACCGCCAAGGCAGTTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTATTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATTTATTCCTCTGCTGTAAATTAGAACTAAATTGTATTGTA
TTTTTTATGGTTGTTATAAACCGCCAAGGCAATTTGCATTTATTCCTCTGCTGTA