sp|P24805|TSJT1_TOBAC ----> Stem-specific protein TSJT1

Intron 1 GTAATATTGG ... GCTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	11.54	46	6	3
A2	1.67	59	1	0
A3	12.5	91	13	0
A4	0	37	0	0
A5	3.7	26	1	0
A6	6.72	583	42	0
A7	10.05	376	42	0
A8	9.27	362	37	1
A9	12.58	417	60	2
A10	7.99	288	25	0

>TRINITY_DN42265_c0_g1_i11 from sample A9 / Example spliced isoform

AACTGTCTGCATTAACCTTGGCGATGTCGGTGCCATGGCCTACACTCACTCGCGCCAGTCTCTCCTGACACCCAGATCTTTCGGAGTTGTCGATGACATATTCTGCATATTCGTGGGCATCTTGGATAATGTAGCGATGTTGAGGCAACGATACGGTCTCAACAAAACTGCAAACGAAGTGGCTATTGTCATAGAAGCCT
ATCGGAGTCTCAGAGATCGGGGCCCTTACCCTGCAGATCAGGTCGTCAGAGATCTCTCTGGAAAGTTTGCCTTCGTTCTTTACGATTCCACTTCCCACGCTCTCTTCACCGCAGTTGATGTTGATGGTTCAGTGCCATTCTTTTGGGGCACTGCAGCTGATGGTTACCTTGTCTTATCTGATGAGCCAAATGTCCTCAAA
GAAGGTTGTGGAAAATCTTTTGCTCCTTTTCCCCGAGGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAG

>TRINITY_DN42265_c0_g1_i14 from sample A9 / Example unspliced isoform:

CAAACTGACTTGACTCAGATCCCAATCTTCCAAGTTTCAACCTGACTTTGTGCTTCTGCATTCCTCTAAGTTCGGAGATCTGGTCTTAGGGAGACCATTTTTGACCTACCATTTTAATATATGTTACATAATATAGCAGTTTGGCTCGTGAATATAGCTCTTTGCTAAAAAATTTAAATGGTTTGTATTCCTTTGTAAAT
GCAGTGAAGAAATTCTTGTAAGTCTGGCAACATTCCTATTTTGCCTTTTGTTTTAACATTGATTATTTTCCCACGGATATATGTTCCCTTCTATCTGTTTGGGGAAGGGAAGGCTTTTTCTTTTATTTGTTTGTTGTTTGGGGAGGGAAGGGGAAGATAGGTTTTCAGAATCATCAGATGGGCAATTGAGATCTTTTTCC
CTGAGATGTATGTTTATATATTAGATTTTTATAATTTTACAAAAAATGCTGCACTGAGTATCTATAAGTATCTTTTTATTTGAACAAAATCATTCCTTAAAATTGTGGAATTTTGGTTTTTGACTCTAATTATTTTGATTGCAGGATGTTGATGGTTCAGTGCCTTTCTTTTGGGGCACTGCAGCTGATGGTTACCTTGT
CTTATCTGATGAGCCAAATGTCCTCAAAGAAGGTTGTGGAAAATCTTTTGCTCCTTTTCCCCGAGgtaatattggattgctaaattagaacttatataatatcacattaaaataattaaactttagcttcttgtagatattgatgttatatatgcttttgcagGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAGTTT
TGAACATCCTTTGAATA

Intron 2 GTAATTTGTT ... GTCTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	27.33	250	41	147
A2	28.65	274	55	165
A3	26.75	308	82	143
A4	27.5	174	37	95
A5	30.69	131	26	90
A6	25.72	3088	564	1574
A7	26.41	1712	347	882
A8	24.28	1757	308	819
A9	25	1970	364	949
A10	25.82	1231	256	601

>TRINITY_DN116015_c0_g1_i10 from sample A1 / Example spliced isoform

CGTGGTTATCCAATTACTTGCAAGATGATCGGTATATATATACGTACCAAGATCATGGTTGCTCAAACCGCCTCATAGAAAACATCCATTAAAAGCAAGCAGCCAAGAAGAGTGTTGATCTCTGTCTTTATCTTCTCTACAAAAATTTTCTCGTGGTTTTGTTTTTGTTTCTGCTACAAGGTTTGTCTGTTCTAAGGTTG
TTTCTGCCTCCAAAAATGCTGACGGTATTGAAGAGATCCGTGGCAAAAGGCCCTGAGGAATTGACGAGCCCCCGTGTTGGGCTTGACCAGAGGAAAAATGGGATGGATTTGGTTCAATCTTTCGTTTCCGCTAATTCCGGAAGCGTTTGCATTAACCTTGGCGATGTCGGTGCTATGGCCTACACTCACTCGCGCCAGCC
TCTCCTCACACCCAGGCATGCTTTCTATTCTCATTTTTTTTTCTTTTAATCTCTTGTTTTGTAGATCTGTTATTATAGTCGGTGGTTCTTGAATGCCGCAGATCTTTCGGAGTTGTAGATGACATATTCTGCATATTCGAAGGCCTCCTTGATAATGTAGCGGTGTTGAGACAACGACATGGTCTTAACAAATCTTCAAA
TGAAGTAGCCATTGTCATCGAGGCCTACAGGACTCTCAGAGATCGGGGCCCCTACCCTGCAGATCAGGTCGTCAGAGATCTGTCTGGGAAGTTTTCATTCGTTCTTTACGACTCCGCTTCGCAGGCTCTCTTCACCGCAGTTGATGCTGATGGTTCAGTGCCCTTCTTTTGGGGCACTGCAGCCGATGGTTACCTTGTCC
TATCAGATGAGCCAGATGTCCTTAAAGAAGGATGCGGGAAGTCTTTTGCTCCTTTTCCCCGAGGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAGCTTTGAACATCCGTTCAATAAGCTGATGCCAATGCCTCGTGTTGATAGTGATGGGGAAATGTGTGGTGCTAACTTCAAAGTAGATGTGTATGCGAAGAAGCAG
TCTAGCATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGATGTTAGGATCAGATGTTTATAGTATCAAGTAGATGTGCATGCGAAGAAGCAGTCTAACATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGAGGCTAGTGACGCGAACTG
GGCAAATACATTTTAATATGATCAATTTGATGTCAGGATCAGATGTTACTGGTCATATGAGGTTTTAAGTGAAAGTTGGATTCATCTTTTCGTTCATGTTTCACTCATCTTTGCTTTTATAAAATTTCTTCAACCCAAAGAGTTTAAAAGTCTCTTTGTTTAATAGTTGAAATTTTCTTGCACCTATCTATTAATTTTTG
GAAACTGTTCTCAATGTATCGCTATACTTGAAATTTTACGGGGTCTTAGTTTTCATACACC

>TRINITY_DN116015_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CGTGGTTATCCAATTACTTGCAAGATGATCGGTATATATATACGTACCAAGATCATGGTTGCTCAAACCGCCTCATAGAAAACATCCATTAAAAGCAAGCAGCCAAGAAGAGTGTTGATCTCTGTCTTTATCTTCTCTACAAAAATTTTCTCGTGGTTTTGTTTTTGTTTCTGCTACAAGGTTTGTCTGTTCTAAGGTTG
TTTCTGCCTCCAAAAATGCTGACGGTATTGAAGAGATCCGTGGCAAAAGGCCCTGAGGAATTGACGAGCCCCCGTGTTGGGCTTGACCAGAGGAAAAATGGGATGGATTTGGTTCAATCTTTCGTTTCCGCTAATTCCGGAAGCGTTTGCATTAACCTTGGCGATGTCGGTGCTATGGCCTACACTCACTCGCGCCAGCC
TCTCCTCACACCCAGATCTTTCGGAGTTGTAGATGACATATTCTGCATATTCGAAGGCCTCCTTGATAATGTAGCGGTGTTGAGACAACGACATGGTCTTAACAAATCTTCAAATGAAGTAGCCATTGTCATCGAGGCCTACAGGACTCTCAGAGATCGGGGCCCCTACCCTGCAGATCAGGTCGTCAGAGATCTGTCTG
GGAAGTTTTCATTCGTTCTTTACGACTCCGCTTCGCAGGCTCTCTTCACCGCAGTTGATGCTGATGGTTCAGTGCCCTTCTTTTGGGGCACTGCAGCCGATGGTTACCTTGTCCTATCAGATGAGCCAGATGTCCTTAAAGAAGGATGCGGGAAGTCTTTTGCTCCTTTTCCCCGAGgtaatttgttttctagctatctg
acacatcaagtgaaacagaataatggctatagagcttcttatgtaatattgcttgttgcatttgtctttgcagGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAGCTTTGAACATCCGTTCAATAAGCTGATGCCAATGCCTCGTGTTGATAGTGATGGGGAAATGTGTGGTGCTAACTTCAAAGTAGATGTGTATGC
GAAGAAGCAGTCTAGCATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGATGTTAGGATCAGATGTTTATAGTATCAAGTAGATGTGCATGCGAAGAAGCAGTCTAACATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGAGGCTAGTG
ACGCGAACTGGGCAAATACATTTTAATATGATCAATTTGATGTCAGGATCAGATGTTACTGGTCATATGAGGTTTTAAGTGAAAGTTGGATTCATCTTTTCGTTCATGTTTCACTCATCTTTGCTTTTATAAAATTTCTTCAACCCAAAGAGTTTAAAAGTCTCTTTGTTTAATAGTTGAAATTTTCTTGCACCTATCTA
TTAATTTTTGGAAACTGTTCTCAATGTATCGCTATACTTGAAATTTTACGGGGTCTTAGTTTTCATACACC

Intron 3 GTGAGTATCA ... ATGCTGACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	79.31	6	2	23
A2	86.11	5	3	31
A3	92.89	3	7	39.2
A4	75	2	0	6
A5	80	3	2	12
A6	78.95	36	35	135
A7	75.31	40	22	122
A8	69.66	44	13	101
A9	81.45	46	40	202
A10	78.77	45	30	167

>TRINITY_DN43110_c0_g1_i6 from sample A6 / Example spliced isoform

GTTGGCAACCATTCTTAAAATCCGTGCAGAGCTTATCCAAAATAATCCAACGTCATTGTCAGCCATATTATCCAGTGTCTGTGTCAGCTTGACTGGACCAGATTGTCATTGTAAGTGCATACATGGCCCACACCGAGGTGGCGTGGTTATCCAATTAGCTGACCGTTGGATTAGCGGATAAATAATAACATGCCCGGCCA
TGAAACGCATGCATACAGCAATCCATTCAACTGAACGCCGGTCGTCTCCTATTGAAGAGATCCGTGGCACAAGGCCCTCAGGAATTGACGAGCCCCCATGTTGAGGCTCACCCGAGGAAAAATGGCATCGATTTGGTTCACTCTTTCGTCTCTGCCAATCCTGGAACTGTCTGCATTAACCTTGGCGATGTCGGTGCCAT
GGCCTTTACTCAGTCGAGCCAGCCTCTCTTCACACCCAGATCTTTGGGAGTTGTAGATGACATATTCTGCATATTCGTGGGCATCTTGGATAATGTAGCGATGTTGAGGCAACGATACGGGCTCAACAAAAGTGCAAATGAAGTGGCTATTGTCATAGAAGCCTATCGGACTCTCAGAGATAGGGGCCCTTACCCTGCAG
ATCAGGTTGTCAGAGATCTCTCTGGAAAGTTTGCCTTCGTTCTTTACGACTCCACTTCCCAGGCTCTCTTCACCGCAGTTGATGTTGATGGTTCAGTGCCTTTCTTTTGGGGCACTGCAGCTGATGGTTACCTTGTCTTATCTGATGAGCCAAATGTCCTCAAAGAAGGTTGTGGAAAATCTTTTGCTCCTTTTCCCCGA
GGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAGTTTTGAACATCCTTTGAATAGTTTGATGCCGATGCCACGTGTTGATAGTGAGGGGCAAATGTGTGGGGCCAACTTCAAAGTAGATGTATTTACTAAAAAGCAAGTTAGCATGCCTAGAGTAGGTAGTGAGGCCAATTGGGCCAATGAATTTTGATACAAACAATT
TTGAATTAAAAATATCAATTTTATTTTTATTTAATATAAGTTAAATGTCTTAAAAGTGGTATCAAAGCTCTTACTGACCTAAGTTGGCTATGTGCAAAGATGGTTATTCCAACCCCTTCTTATTGATCTTTATTGTTCACTTGTGCGAACCATTCTATTGTGGGTATGGGCACGTTCATTTCTCTTCTTATTGATCTTTA
TTGTTCACTTGTGCGAACCATTCTATTGTGGGTATGGGCACGTTCATTTCTCTTATTGTTAATATTTGGAAAGTTATTTATTAATATATTTGTTAACTTTGATGCAAA

>TRINITY_DN43110_c0_g1_i10 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GTTGGCAACCATTCTTAAAATCCGTGCAGAGCTTATCCAAAATAATCCAACGTCATTGTCAGCCATATTATCCAGTGTCTGTGTCAGCTTGACTGGACCAGATTGTCATTGTAAGTGCATACATGGCCCACACCGAGGTGGCGTGGTTATCCAATTAGCTGACCGTTGGATTAGCGGATAAATAATAACATGCCCGGCCA
TGAAACGCATGCATACAGCAATCCATTCAACTGAACGCCGGTCGTCTCCgtgagtatcaagaaagctgttctgtgtcttatcttctctctaaacatcgtcgcgtcgcatagtttagttttgttttcgtttctccgaccagttagtttggatttaaggttgtttcaactgaaaatgctgacagTATTGAAGAGATCCGTGG
CACAAGGCCCTCAGGAATTGACGAGCCCCCATGTTGAGGCTCACCCGAGGAAAAATGGCATCGATTTGGTTCACTCTTTCGTCTCTGCCAATCCTGGAACTGTCTGCATTAACCTTGGCGATGTCGGTGCCATGGCCTTTACTCAGTCGAGCCAGCCTCTCTTCACACCCAGATCTTTGGGAGTTGTAGATGACATATTC
TGCATATTCGTGGGCATCTTGGATAATGTAGCGATGTTGAGGCAACGATACGGGCTCAACAAAAGTGCAAATGAAGTGGCTATTGTCATAGAAGCCTATCGGACTCTCAGAGATAGGGGCCCTTACCCTGCAGATCAGGTTGTCAGAGATCTCTCTGGAAAGTTTGCCTTCGTTCTTTACGACTCCACTTCCCAGGCTCT
CTTCACCGCAGTTGATGTTGATGGTTCAGTGCCTTTCTTTTGGGGCACTGCAGCTGATGGTTACCTTGTCTTATCTGATGAGCCAAATGTCCTCAAAGAAGGTTGTGGAAAATCTTTTGCTCCTTTTCCCCGAGGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAGTTTTGAACATCCTTTGAATAGTTTGATGCCGA
TGCCACGTGTTGATAGTGAGGGGCAAATGTGTGGGGCCAACTTCAAAGTAGATGTATTTACTAAAAAGCAAGTTAGCATGCCTAGAGTAGGTAGTGAGGCCAATTGGGCCAATGAATTTTGATACAAACAATTTTGAATTAAAAATATCAATTTTATTTTTATTTAATATAAGTTAAATGTCTTAAAAGTGGTATCAAAG
CTCTTACTGACCTAAGTTGGCTATGTGCAAAGATGGTTATTCCAACCCCTTCTTATTGATCTTTATTGTTCACTTGTGCGAACCATTCTATTGTGGGTATGGGCACGTTCATTTCTCTTCTTATTGATCTTTATTGTTCACTTGTGCGAACCATTCTATTGTGGGTATGGGCACGTTCATTTCTCTTATTGTTAATATTT
GGAAAGTTATTTATTAATATATTTGTTAACTTTGATGCAAA

Intron 4 GCATGCTTTC ... AATGCCGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	16.67	220	74	14
A2	18.72	165	52	24
A3	17.34	267	80	32
A4	17.4	178	56	19
A5	17.65	147	41	22
A6	18.44	2004	630	276
A7	17.38	1127	375	99
A8	16.96	982	287	114
A9	17.17	1401	417	164
A10	18.38	1008	343	111

>TRINITY_DN116015_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

CGTGGTTATCCAATTACTTGCAAGATGATCGGTATATATATACGTACCAAGATCATGGTTGCTCAAACCGCCTCATAGAAAACATCCATTAAAAGCAAGCAGCCAAGAAGAGTGTTGATCTCTGTCTTTATCTTCTCTACAAAAATTTTCTCGTGGTTTTGTTTTTGTTTCTGCTACAAGGTTTGTCTGTTCTAAGGTTG
TTTCTGCCTCCAAAAATGCTGACGGTATTGAAGAGATCCGTGGCAAAAGGCCCTGAGGAATTGACGAGCCCCCGTGTTGGGCTTGACCAGAGGAAAAATGGGATGGATTTGGTTCAATCTTTCGTTTCCGCTAATTCCGGAAGCGTTTGCATTAACCTTGGCGATGTCGGTGCTATGGCCTACACTCACTCGCGCCAGCC
TCTCCTCACACCCAGATCTTTCGGAGTTGTAGATGACATATTCTGCATATTCGAAGGCCTCCTTGATAATGTAGCGGTGTTGAGACAACGACATGGTCTTAACAAATCTTCAAATGAAGTAGCCATTGTCATCGAGGCCTACAGGACTCTCAGAGATCGGGGCCCCTACCCTGCAGATCAGGTCGTCAGAGATCTGTCTG
GGAAGTTTTCATTCGTTCTTTACGACTCCGCTTCGCAGGCTCTCTTCACCGCAGTTGATGCTGATGGTTCAGTGCCCTTCTTTTGGGGCACTGCAGCCGATGGTTACCTTGTCCTATCAGATGAGCCAGATGTCCTTAAAGAAGGATGCGGGAAGTCTTTTGCTCCTTTTCCCCGAGGTAATTTGTTTTCTAGCTATCTG
ACACATCAAGTGAAACAGAATAATGGCTATAGAGCTTCTTATGTAATATTGCTTGTTGCATTTGTCTTTGCAGGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAGCTTTGAACATCCGTTCAATAAGCTGATGCCAATGCCTCGTGTTGATAGTGATGGGGAAATGTGTGGTGCTAACTTCAAAGTAGATGTGTATGC
GAAGAAGCAGTCTAGCATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGATGTTAGGATCAGATGTTTATAGTATCAAGTAGATGTGCATGCGAAGAAGCAGTCTAACATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGAGGCTAGTG
ACGCGAACTGGGCAAATACATTTTAATATGATCAATTTGATGTCAGGATCAGATGTTACTGGTCATATGAGGTTTTAAGTGAAAGTTGGATTCATCTTTTCGTTCATGTTTCACTCATCTTTGCTTTTATAAAATTTCTTCAACCCAAAGAGTTTAAAAGTCTCTTTGTTTAATAGTTGAAATTTTCTTGCACCTATCTA
TTAATTTTTGGAAACTGTTCTCAATGTATCGCTATACTTGAAATTTTACGGGGTCTTAGTTTTCATACACC

>TRINITY_DN116015_c0_g1_i10 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CGTGGTTATCCAATTACTTGCAAGATGATCGGTATATATATACGTACCAAGATCATGGTTGCTCAAACCGCCTCATAGAAAACATCCATTAAAAGCAAGCAGCCAAGAAGAGTGTTGATCTCTGTCTTTATCTTCTCTACAAAAATTTTCTCGTGGTTTTGTTTTTGTTTCTGCTACAAGGTTTGTCTGTTCTAAGGTTG
TTTCTGCCTCCAAAAATGCTGACGGTATTGAAGAGATCCGTGGCAAAAGGCCCTGAGGAATTGACGAGCCCCCGTGTTGGGCTTGACCAGAGGAAAAATGGGATGGATTTGGTTCAATCTTTCGTTTCCGCTAATTCCGGAAGCGTTTGCATTAACCTTGGCGATGTCGGTGCTATGGCCTACACTCACTCGCGCCAGCC
TCTCCTCACACCCAGgcatgctttctattctcatttttttttcttttaatctcttgttttgtagatctgttattatagtcggtggttcttgaatgccgcagATCTTTCGGAGTTGTAGATGACATATTCTGCATATTCGAAGGCCTCCTTGATAATGTAGCGGTGTTGAGACAACGACATGGTCTTAACAAATCTTCAAA
TGAAGTAGCCATTGTCATCGAGGCCTACAGGACTCTCAGAGATCGGGGCCCCTACCCTGCAGATCAGGTCGTCAGAGATCTGTCTGGGAAGTTTTCATTCGTTCTTTACGACTCCGCTTCGCAGGCTCTCTTCACCGCAGTTGATGCTGATGGTTCAGTGCCCTTCTTTTGGGGCACTGCAGCCGATGGTTACCTTGTCC
TATCAGATGAGCCAGATGTCCTTAAAGAAGGATGCGGGAAGTCTTTTGCTCCTTTTCCCCGAGGTTGTTTTTTCTCTACATCAGGTGGCTTGCAGAGCTTTGAACATCCGTTCAATAAGCTGATGCCAATGCCTCGTGTTGATAGTGATGGGGAAATGTGTGGTGCTAACTTCAAAGTAGATGTGTATGCGAAGAAGCAG
TCTAGCATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGATGTTAGGATCAGATGTTTATAGTATCAAGTAGATGTGCATGCGAAGAAGCAGTCTAACATGCCTAGAGTGGCTAGTGACGCTAACTGGGCAAATAAATTTTAATATGATCAATTTGAGGCTAGTGACGCGAACTG
GGCAAATACATTTTAATATGATCAATTTGATGTCAGGATCAGATGTTACTGGTCATATGAGGTTTTAAGTGAAAGTTGGATTCATCTTTTCGTTCATGTTTCACTCATCTTTGCTTTTATAAAATTTCTTCAACCCAAAGAGTTTAAAAGTCTCTTTGTTTAATAGTTGAAATTTTCTTGCACCTATCTATTAATTTTTG
GAAACTGTTCTCAATGTATCGCTATACTTGAAATTTTACGGGGTCTTAGTTTTCATACACC

Intron 5 GTAATATTGG ... GCCTTTTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	7.14	13	2	0
A2	10.34	13	3	0
A3	0	25	0	0
A4	0	2	0	0
A5	14.29	6	1	1
A6	8.7	147	17	11
A7	12.26	136	21	17
A8	8.41	147	16	11
A9	5.06	169	11	7
A10	10.3	135	13	18

>TRINITY_DN43110_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

GTCTCTACGATACTGCTCGATTGAAAAGGTTTTCTACCATGCTCTGTGTCGTGTTCACGAGGTTTTCATCCGGAGTCCGAACGTACGCTCTAAGGCTCGGGCTTGGGGCTCGGACTTTCCAGGATGTTGATGGTTCAGTGCCTTTCTTTTGGGGCACTTCAGCTGATGGTTACCTTGTCCTATCTGATGAGCTAAATGTC
CTCAAAGAAGGATGTGGAAAATTTTTTGCGCCTTTTCCTCGGGGTTGTTTTTTCTCTACATCAAGTGGCTTGTAGAGTTTTGAACATCCTTTGAATAAGTTGATGTTGATGCCTCCTGTTGATAGTAAGGGACAAATGTGTGGTGCCAATTTCAAAGTAGATGTGTTTGCCAAAAAGCAAGCTAACATGCTTAGAGTAGG
TAGTGAGGCCAATTGGACCATTGAATTGTGATACCAACAATTTAGAATTTAAAAACATCAATTTTATTTTTATTTAATATGAAATAAATATCACATTTGACATTTCATAATCAACAAATGAATCAATTTTCC

>TRINITY_DN43110_c0_g1_i8 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GTCTCTACGATACTGCTCGATTGAAAAGGTTTTCTACCATGCTCTGTGTCGTGTTCACGAGGTTTTCATCCGGAGTCCGAACGTACGCTCTAAGGCTCGGGCTTGGGGCTCGGACTTTCCAGGATGTTGATGGTTCAGTGCCTTTCTTTTGGGGCACTTCAGCTGATGGTTACCTTGTCCTATCTGATGAGCTAAATGTC
CTCAAAGAAGGATGTGGAAAATTTTTTGCGCCTTTTCCTCGGGgtaatattggactgtgctaaattagagttgatttaacatcacacataataatgaatttttagtttcttatatatattggtgttgcatttgcctttttagGTTGTTTTTTCTCTACATCAAGTGGCTTGTAGAGTTTTGAACATCCTTTGAATAAGTT
GATGTTGATGCCTCCTGTTGATAGTAAGGGACAAATGTGTGGTGCCAATTTCAAAGTAGATGTGTTTGCCAAAAAGCAAGCTAACATGCTTAGAGTAGGTAGTGAGGCCAATTGGACCATTGAATTGTGATACCAACAATTTAGAATTTAAAAACATCAATTTTATTTTTATTTAATATGAAATAAATATCACATTTGAC
ATTTCATAATCAACAAATGAATCAATTTTCC