sp|Q6AWU6|HOL3_ARATH ----> Probable thiol methyltransferase 2


Intron 1 GTGCAAGTTA ... CTGATGGTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A17.69610
A2-1000
A371.43123
A425.27133.85
A566.67104
A628.7817.368
A7201023
A837.51039
A932.7913.385
A1018.5673.20



>TRINITY_DN40440_c0_g1_i5 from sample A6 / Example spliced isoform
GGAAGCCCTCCCAAAAAAACATGGATTGCCAAAAAATGGACCAAACATTATAAAATAAAAAATAAAATGGATTGCCAAACACCACTGTGTAGCGTTATCGAATGTTCGTCCACCCTTCTTCCTCCTCCTGAGGGGATGAGTATCTGTACCAAGGGCCAGGGTTTAGTGGGGAGGTTCAAGGTTCGGAGTCCGAGATCTTT
GGCCGTGGATTCCGTGTGCCCAGGTTCAGTTTCAGGTACCAATAGCACCACAAGGACAATGAGTGGAAAGAATGGTTATGCGCTCAGAGACACTAGTCTGTTTAACACTTACAACTATGGAGATGTTGGGTATTGGGATAACAGGTACCTTCAAGAAGTTGGGCCGTTCGACTGGTACCAGCGTTATTCCGAACTCAAAC
CCTACATAAATACACACATTCCTAAAGCCTCCCGTATTCTTGTGGTTGGCTGCGGAAATGCAGTTATGTCAGAAGATATGGTGATAGATGGATATCGAGAAATTGTGAACATTGATATCTCTTCCGTCTCGATAGGCATGATGCAAAAGAAGTATGAGCATATTCCTCAACTGAAATATGTGCACATGGATGCCCGTGAT
ATGAGTTGTTTCTCTAATGAATTATTTGATTCGGTAATAGACAAAGGCACCCTGGATTCTCTTATGTGTGGAGCAAGTGCACCATTAAGTGCTGCAAGCATGTTAGAGGAAGTGAGCAGGGTGCTCAAGCCTGGAGGGGTTTATATGCTGATTACGTATGGTGATCCTCGTTTGAGAGTGCCTCACTTGAACCTTCCTCA
CTACAATTGGACTGTTACTTTATACATTATCCCTAGGCCAGGCTTTGAAAAATCGGGGGCGAGTTCTGCTAAGTCTCATTTGGAACCCGTTCCACTGACAGAGGATGGAAGAAAAGCTGATAGTCATGCAAGGGAAAACTTATTAGAATGTTTCGCTTGAATTTGGATTCAAATATTGCACAATTATTGAAGAACTTTCC
AGGATTTCTGGTCCCTGTGATCAGAGTCTTGGTCCTGTCCTACAAGAGGAGGCTGAGAACTCTTCTGGAAGGGCCAGATTCAAAGAAGTTGACATTGGCCACAATGTGGTGTCTTATTAGGTTTATTGAGGGCCAGCTCAAAAAAAAAAGGCCCGGGATTTTTCCAGTTTGATTTTACATATGAAGGCAAAGTTATGGGT
TCAGTATGGTTATCATGCTGTATTGTTTCCTTGCCTTGTTTTGACTTCAGTTTCCTATTTCTGCTATTATATGGAGGGCAAATTGATGACAAACAAGAATTGACTTTTTAAGACCCAAGAGATAAGTGGTCTGATTGGGATAGGGCTTGCTGCTTAGAGAGGTTTTTACTACTTCAGCCAACATCACATATTTGGCTCTT
TTTAATCTTATCTTTTTCTTATCATTCTATTATTTTATTTTCTTCTGCTGTTAATAACAGCTCTGGCCCACTTGGGAACAGGCCTGATTTTACTATGTTTTCGTGGCTCAAAGTTAGCCATGGAGGTCTAATGTTATGTACATTACTATGAATTAACTTCTGCATGCCATGATTATCAATGCTGCTCTAACTCTGGAGTC
TGAA


>TRINITY_DN40440_c0_g1_i10 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GGAAGCCCTCCCAAAAAAACATGGATTGCCAAAAAATGGACCAAACATTATAAAATAAAAAATAAAATGGATTGCCAAACACCACTGTGTAGCGTTATCGAATGTTCGTCCACCCTTCTTCCTCCTCCTGAGGGGATGAGTATCTGTACCAAGGGCCAGGGTTTAGTGGGGAGGTTCAAGGTTCGGAGTCCGAGATCTTT
GGCCGTGGATTCCGTGTGCCCAGGTTCAGTTTCAGGTACCAATAGCACCACAAGGACAATGAGTGGAAAGAATGGTTATGCGCTCAGAGACACTAGTCTGTTTAACACTTACAACTATGGAGATGTTGGGTATTGGGATAACAGGTACCTTCAAGAAGTTGGGCCGTTCGACTGGTACCAGCGTTATTCCGAACTCAAAC
CCTACATAAATACACACATTCCTAAAGCCTCCCGTATTCTTGTGGTTGGCTGCGGAAATGCAGTTATGTCAGAAGATATGGTGATAGATGGATATCGAGAAATTGTGAACATTGATATCTCTTCCGTCTCGATAGGCATGATGCAAAAGAAGTATGAGCATATTCCTCAACTGAAATATGTGCACATGGATGCCCGTGAT
ATGAGTTGTTTCTCTAATGAATTATTTGATTCGGTAATAGACAAAGGCACCCTGGATTCTCTTATGTGTGGAGCAAGTGCACCATTAAGTGCTGCAAGCATGTTAGAGGAAGTGAGCAGGGTGCTCAAGCCTGGAGGGGTTTATATGCTGATTACGTATGGTGATCCTCGTTTGAGAGTGCCTCACTTGAACCTTCCTCA
CTACAATTGGACTGTTACTTTATACATTATCCCTAGGCCAGGCTTTGAAAAATCGGGGGCGAGTTCTGCTAAGTCTCATTTGGAACCCGTTCCACTGACAGAGGATGGTATGCTTCCACCAAATTTTGTATTGGAAGATCCTGATTCTCACTATATCTATGTTTGTAAAAAACTTATGAAGATAGACTTTTAATCATCTA
ATATCATGAGAATGAGTTATGTATCATTAAGTTATAAATTTCCTGATTCAACATTAATAGTAAGATCATCTTTAGCTGATCTTTAGAACATAGCTACAGGAAACATTGCCTCCTTAAGATGAATTATTCGATTTTAATTTTCTCTACATAAATTCATTCTTCTTATAGGTCAGGTAGGACTCAGGAGAGAATCTGTTTAT
TTCTATTAGTAATATGGGTTACTCCCTGTAGTATATTATTTGATTATTCCTGAATATCTAGGTTGAGAGATTATCATCATATTTGAAAGTGCCTTGTGCATGGAAATTCATGCCAGGAAGAAAAGCTGATAGTCATGCAAGGGAAAACTTATTAGAATGTTTCGCTTGAATTTGGATTCAAATATTGCACAATTATTGAA
GAACTTTCCAGGATTTCTGGTCCCTGTGATCAGgtgcaagttacaactcaaagcatgtgatttctagtatttgtttcaaagtgttttgtggaagaaactaattcatgcaagttccagtacttatgaagcctttcttgtatgtgttacatctgatggtagAGTCTTGGTCCTGTCCTACAAGAGGAGGCTGAGAACTCTTC
TGGAAGGGCCAGATTCAAAGAAGTTGACATTGGCCACAATGTGGTGTCTTATTAGGTTTATTGAGGGCCAGCTCAAAAAAAAAAGGCCCGGGATTTTTCCAGTTTGATTTTACATATGAAGGCAAAGTTATGGGTTCAGTATGGTTATCATGCTGTATTGTTTCCTTGCCTTGTTTTGACTTCAGTTTCCTATTTCTGCT
ATTATATGGAGGGCAAATTGATGACAAACAAGAATTGACTTTTTAAGACCCAAGAGATAAGTGGTCTGATTGGGATAGGGCTTGCTGCTTAGAGAGGTTTTTACTACTTCAGCCAACATCACATATTTGGCTCTTTTTAATCTTATCTTTTTCTTATCATTCTATTATTTTATTTTCTTCTGCTGTTAATAACAGCTCTG
GCCCACTTGGGAACAGGCCTGATTTTACTATGTTTTCGTGGCTCAAAGTTAGCCATGGAGGTCTAATGTTATGTACATTACTATGAATTAACTTCTGCATGCCATGATTATCAATGCTGCTCTAACTCTGGAGTCTGAA




Intron 2 GTTGAGAGAT ... TTCATGCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A146.15775
A218.18922
A345.45341
A425311
A5-1000
A624.2425124
A715.791651
A823.8116100
A947.6211119
A1048.89767.4



>TRINITY_DN38669_c0_g1_i4 from sample A9 / Example spliced isoform
CGTTATCGAATGTTCGTCCACCCTTCTTCCTCCTCCTGAGGGGATGAGTATCTGTAACAAGGGCCAGGGTTTAGTGGGGAGGTTCAAGGTTCGGAGTCCGAGATCTTTGGCCGTGGATTCCGTGTGCCCAGGTTCAGTTTCAGGTACCAATAGCACCACAAGGACAATGAGTGGAAAGAATGGTTATGCGCTCAGAGACA
CTAGTCTGTTTAACACTTACAACTATGGAGATGTTGGGTATTGGGATAACAGGTACCTTCAAGAAGTTGGGCCGTTCGACTGGTACCAGCGTTATTCCGAACTCAAACCCTACATAAATACACACATTCCTAAAGCCTCCCGTATTCTTGTGGTTGGCTGCGGAAATGCAGTTATGTCAGAAGATATGGTGATAGATGGA
TATCGAGAAATTGTGAACATTGATATCTCTTCCGTCTCGATAGGCATGATGCAAAAGAAGTATGAGCATATTCCTCAACTGAAATATGTGCACATGGATGCCCGTGATATGAGTTGTTTCTCTAATGAATTATTTGATTCGGTAATAGACAAAGGCACCCTGGATTCTCTTATGTGTGGAGCAAGTGCACCATTAAGTGC
TGCAAGCATGTTAGAGGAAGTGAGCAGGGTGCTCAAGCCTGGAGGGGTTTATATGCTGATTACGTATGGTGATCCTCGTTTGAGAGTGCCTCACTTGAACCTTCCTCACTACAATTGGACTGTTACTTTATACATTATCCCTAGGCCAGGCTTTGAAAAATCGGGGGCGAGTTCTGCTAAGTCTCATTTGGAACCCGTTC
CACTGACAGAGGATGGAAGAAAAGCTGATAGTCATGCAAGGGAAAACTTATTAGAATGTTTCGCTTGAATTTGGATTCAAATATTGCACAATTATTGAAGAACTTTCCAGGATTTCTGGTCCCTGTGATCAGAGTCTTGGTCCTGTCCTACAAGAGGAGGCTGAGAACTCTTCTGGAAGGGCCAGATTCAAAGAAGTTGA
CATTGGCCACAATGTGGTGTCTTATTAGGTTTATTGAGGGCCAGCTCAAAAAAAAAAGGCCCGGGATTTTTCCAGTTTGATTTTACATATGAAGGCAAAGTTATGGGTTCAGTATGGTTATCATGCTGTATTGTTTCCTTGCCTTGTTTTGACTTCAGTTTCCTATTTCTGCTATTATATGGAGGGCAAATTGATGACAA
ACAAGAATTGACTTTTTAAGACCCAAGAGATAAGTGGTCTGATTGGGATAGGGCTTGCTGCTTAGAGAGGTTTTTACTACTTCAGCCAACATCACATATTTGGCTCTTTTTAATCTTATCTTTTTCTTATCATTCTATTATTTTATTTTCTTCTGCTGTTAATAACAGCTCTGGCCCACTTGGGAACAGGCCTGATTTTA
CTATGTTTTCGTGGCTCAAAGTTAGCCATGGAGGTCTAATGTTATGTACATTACTATGAATTAACTTCTGCATGCCATGATTATCAATGCTGCTCA


>TRINITY_DN38669_c0_g1_i7 from sample A9 / Example unspliced isoform:
CGTTATCGAATGTTCGTCCACCCTTCTTCCTCCTCCTGAGGGGATGAGTATCTGTAACAAGGGCCAGGGTTTAGTGGGGAGGTTCAAGGTTCGGAGTCCGAGATCTTTGGCCGTGGATTCCGTGTGCCCAGGTTCAGTTTCAGGTACCAATAGCACCACAAGGACAATGAGTGGAAAGAATGGTTATGCGCTCAGAGACA
CTAGTCTGTTTAACACTTACAACTATGGAGATGTTGGGTATTGGGATAACAGGTACCTTCAAGAAGTTGGGCCGTTCGACTGGTACCAGCGTTATTCCGAACTCAAACCCTACATAAATACACACATTCCTAAAGCCTCCCGTATTCTTGTGGTTGGCTGCGGAAATGCAGTGTGGAGCAAGTGCACCATTAAGTGCTGC
AAGCATGTTAGAGGAAGTGAGCAGGGTGCTCAAGCCTGGAGGGGTTTATATGCTGATTACGTATGGTGATCCTCGTTTGAGAGTGCCTCACTTGAACCTTCCTCACTACAATTGGACTGTTACTTTATACATTATCCCTAGGCCAGGCTTTGAAAAATCGGGGGCGAGTTCTGCTAAGTCTCATTTGGAACCCGTTCCAC
TGACAGAGGATGgttgagagattatcatcatatttgaaagtgccttgtgcatggaaattcatgccagGAAGAAAAGCTGATAGTCATGCAAGGGAAAACTTATTAGAATGTTTCGCTTGAATTTGGATTCAAATATTGCACAATTATTGAAGAACTTTCCAGGATTTCTGGTCCCTGTGATCAGGTGCAAGTTACAACTC
AAAGCATGTGATTTCTAGTATTTGTTTCAAAGTGTTTTGTGGAAGAAACTAATTCATGCAAGTTCCAGTACTTATGAAGCCTTTCTTGTATGTGTTACATCTGATGGTAGAGTCTTGGTCCTGTCCTACAAGAGGAGGCTGAGAACTCTTCTGGAAGGGCCAGATTCAAAGAAGTTGACATTGGCCACAATGTGGTGTCT
TATTAGGTTTATTGAGGGCCAGCTCAAAAAAAAAAGGCCCGGGATTTTTCCAGTTTGATTTTACATATGAAGGCAAAGTTATGGGTTCAGTATGGTTATCATGCTGTATTGTTTCCTTGCCTTGTTTTGACTTCAGTTTCCTATTTCTGCTATTATATGGAGGGCAAATTGATGACAAACAAGAATTGACTTTTTAAGAC
CCAAGAGATAAGTGGTCTGATTGGGATAGGGCTTGCTGCTTAGAGAGGTTTTTACTACTTCAGCCAACATCACATATTTGGCTCTTTTTAATCTTATCTTTTTCTTATCATTCTATTATTTTATTTTCTTCTGCTGTTAATAACAGCTCTGGCCCACTTGGGAACAGGCCTGATTTTACTATGTTTTCGTGGCTCAAAGT
TAGCCATGGAGGTCTAATGTTATGTACATTACTATGAATTAACTTCTGCATGCCATGATTATCAATGCTGCTCA




Intron 3 GTATGCTTCC ... TTCATGCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A148.536.967
A232.318.86.42
A3302.72.10
A446.462.941
A5100030
A640.6324.324.39
A741.3815.516.85
A845.4715.1223
A95410.515.59
A1052.486.87.47.6



>TRINITY_DN40440_c0_g1_i5 from sample A6 / Example spliced isoform
GGAAGCCCTCCCAAAAAAACATGGATTGCCAAAAAATGGACCAAACATTATAAAATAAAAAATAAAATGGATTGCCAAACACCACTGTGTAGCGTTATCGAATGTTCGTCCACCCTTCTTCCTCCTCCTGAGGGGATGAGTATCTGTACCAAGGGCCAGGGTTTAGTGGGGAGGTTCAAGGTTCGGAGTCCGAGATCTTT
GGCCGTGGATTCCGTGTGCCCAGGTTCAGTTTCAGGTACCAATAGCACCACAAGGACAATGAGTGGAAAGAATGGTTATGCGCTCAGAGACACTAGTCTGTTTAACACTTACAACTATGGAGATGTTGGGTATTGGGATAACAGGTACCTTCAAGAAGTTGGGCCGTTCGACTGGTACCAGCGTTATTCCGAACTCAAAC
CCTACATAAATACACACATTCCTAAAGCCTCCCGTATTCTTGTGGTTGGCTGCGGAAATGCAGTTATGTCAGAAGATATGGTGATAGATGGATATCGAGAAATTGTGAACATTGATATCTCTTCCGTCTCGATAGGCATGATGCAAAAGAAGTATGAGCATATTCCTCAACTGAAATATGTGCACATGGATGCCCGTGAT
ATGAGTTGTTTCTCTAATGAATTATTTGATTCGGTAATAGACAAAGGCACCCTGGATTCTCTTATGTGTGGAGCAAGTGCACCATTAAGTGCTGCAAGCATGTTAGAGGAAGTGAGCAGGGTGCTCAAGCCTGGAGGGGTTTATATGCTGATTACGTATGGTGATCCTCGTTTGAGAGTGCCTCACTTGAACCTTCCTCA
CTACAATTGGACTGTTACTTTATACATTATCCCTAGGCCAGGCTTTGAAAAATCGGGGGCGAGTTCTGCTAAGTCTCATTTGGAACCCGTTCCACTGACAGAGGATGGAAGAAAAGCTGATAGTCATGCAAGGGAAAACTTATTAGAATGTTTCGCTTGAATTTGGATTCAAATATTGCACAATTATTGAAGAACTTTCC
AGGATTTCTGGTCCCTGTGATCAGAGTCTTGGTCCTGTCCTACAAGAGGAGGCTGAGAACTCTTCTGGAAGGGCCAGATTCAAAGAAGTTGACATTGGCCACAATGTGGTGTCTTATTAGGTTTATTGAGGGCCAGCTCAAAAAAAAAAGGCCCGGGATTTTTCCAGTTTGATTTTACATATGAAGGCAAAGTTATGGGT
TCAGTATGGTTATCATGCTGTATTGTTTCCTTGCCTTGTTTTGACTTCAGTTTCCTATTTCTGCTATTATATGGAGGGCAAATTGATGACAAACAAGAATTGACTTTTTAAGACCCAAGAGATAAGTGGTCTGATTGGGATAGGGCTTGCTGCTTAGAGAGGTTTTTACTACTTCAGCCAACATCACATATTTGGCTCTT
TTTAATCTTATCTTTTTCTTATCATTCTATTATTTTATTTTCTTCTGCTGTTAATAACAGCTCTGGCCCACTTGGGAACAGGCCTGATTTTACTATGTTTTCGTGGCTCAAAGTTAGCCATGGAGGTCTAATGTTATGTACATTACTATGAATTAACTTCTGCATGCCATGATTATCAATGCTGCTCTAACTCTGGAGTC
TGAA


>TRINITY_DN40440_c0_g1_i10 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GGAAGCCCTCCCAAAAAAACATGGATTGCCAAAAAATGGACCAAACATTATAAAATAAAAAATAAAATGGATTGCCAAACACCACTGTGTAGCGTTATCGAATGTTCGTCCACCCTTCTTCCTCCTCCTGAGGGGATGAGTATCTGTACCAAGGGCCAGGGTTTAGTGGGGAGGTTCAAGGTTCGGAGTCCGAGATCTTT
GGCCGTGGATTCCGTGTGCCCAGGTTCAGTTTCAGGTACCAATAGCACCACAAGGACAATGAGTGGAAAGAATGGTTATGCGCTCAGAGACACTAGTCTGTTTAACACTTACAACTATGGAGATGTTGGGTATTGGGATAACAGGTACCTTCAAGAAGTTGGGCCGTTCGACTGGTACCAGCGTTATTCCGAACTCAAAC
CCTACATAAATACACACATTCCTAAAGCCTCCCGTATTCTTGTGGTTGGCTGCGGAAATGCAGTTATGTCAGAAGATATGGTGATAGATGGATATCGAGAAATTGTGAACATTGATATCTCTTCCGTCTCGATAGGCATGATGCAAAAGAAGTATGAGCATATTCCTCAACTGAAATATGTGCACATGGATGCCCGTGAT
ATGAGTTGTTTCTCTAATGAATTATTTGATTCGGTAATAGACAAAGGCACCCTGGATTCTCTTATGTGTGGAGCAAGTGCACCATTAAGTGCTGCAAGCATGTTAGAGGAAGTGAGCAGGGTGCTCAAGCCTGGAGGGGTTTATATGCTGATTACGTATGGTGATCCTCGTTTGAGAGTGCCTCACTTGAACCTTCCTCA
CTACAATTGGACTGTTACTTTATACATTATCCCTAGGCCAGGCTTTGAAAAATCGGGGGCGAGTTCTGCTAAGTCTCATTTGGAACCCGTTCCACTGACAGAGGATGgtatgcttccaccaaattttgtattggaagatcctgattctcactatatctatgtttgtaaaaaacttatgaagatagacttttaatcatcta
atatcatgagaatgagttatgtatcattaagttataaatttcctgattcaacattaatagtaagatcatctttagctgatctttagaacatagctacaggaaacattgcctccttaagatgaattattcgattttaattttctctacataaattcattcttcttataggtcaggtaggactcaggagagaatctgtttat
ttctattagtaatatgggttactccctgtagtatattatttgattattcctgaatatctaggttgagagattatcatcatatttgaaagtgccttgtgcatggaaattcatgccag
GAAGAAAAGCTGATAGTCATGCAAGGGAAAACTTATTAGAATGTTTCGCTTGAATTTGGATTCAAATATTGCACAATTATTGAA
GAACTTTCCAGGATTTCTGGTCCCTGTGATCAGGTGCAAGTTACAACTCAAAGCATGTGATTTCTAGTATTTGTTTCAAAGTGTTTTGTGGAAGAAACTAATTCATGCAAGTTCCAGTACTTATGAAGCCTTTCTTGTATGTGTTACATCTGATGGTAGAGTCTTGGTCCTGTCCTACAAGAGGAGGCTGAGAACTCTTC
TGGAAGGGCCAGATTCAAAGAAGTTGACATTGGCCACAATGTGGTGTCTTATTAGGTTTATTGAGGGCCAGCTCAAAAAAAAAAGGCCCGGGATTTTTCCAGTTTGATTTTACATATGAAGGCAAAGTTATGGGTTCAGTATGGTTATCATGCTGTATTGTTTCCTTGCCTTGTTTTGACTTCAGTTTCCTATTTCTGCT
ATTATATGGAGGGCAAATTGATGACAAACAAGAATTGACTTTTTAAGACCCAAGAGATAAGTGGTCTGATTGGGATAGGGCTTGCTGCTTAGAGAGGTTTTTACTACTTCAGCCAACATCACATATTTGGCTCTTTTTAATCTTATCTTTTTCTTATCATTCTATTATTTTATTTTCTTCTGCTGTTAATAACAGCTCTG
GCCCACTTGGGAACAGGCCTGATTTTACTATGTTTTCGTGGCTCAAAGTTAGCCATGGAGGTCTAATGTTATGTACATTACTATGAATTAACTTCTGCATGCCATGATTATCAATGCTGCTCTAACTCTGGAGTCTGAA