sp|P42748|UBC4_ARATH ----> Ubiquitin-conjugating enzyme E2 4

Intron 1 GTAAGCTAAA ... TTCTATGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25.18	710	37.9	239
A2	22.21	571	34.3	163
A3	22.32	623	31.9	179
A4	24.48	546	25.2	177
A5	21.73	245	9.6	68
A6	24.27	2200	116.4	705
A7	23.04	3606.5	208.3	1080
A8	23.49	3599	189.6	1105
A9	23.73	3788	218	1179
A10	20.49	2899	147.8	747

>TRINITY_DN120525_c3_g5_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGGCGTTCACTGTGTACGCA
CGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCTGGGGTAAATCTTATCTG
CCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAGTTTAAAGGACCTCGAGACAGTCCTTACAATTGTGGGGTTTGGAAGATCCATGTGGACATACCAGATGCCTACCCGTATAAATCTCCTTCTATA
GGTTTTGTGAACAGGATATACCATCCCAATGTCGATGAAATGTCGGGCTCAGTGTGCCTGGATGTAATCAATCAGAATTGGAGTCCAATGTTTGATTTATTAAACATATTTGAAGTCTTTCTCCCTCAACTTTTGTTGTATCCAAATCCAACTGATCCCTTGAACGGAGAAGCTGCCGCTCTAATGATGCAGGATAGGGA
TCTCTATAACCGGAGAGTTAAAGAGCACTGTGCAAAGTATGCCAAGTCTGAAGTTGAAGGAAAAAAACAGGAAAAGGAAAGCAGTGGTGACGAAATCAGTGACGATGAATATTCCTCTTGTGAAGAGGAATGACAGGCCATACAGACCATGATTCTTTAATGGGCTTACCAATTCAATACGGACATGTCTAAACATGTAA
CAAATTTTGAGAATTGAAACCCTGTATAATCAGCCATTCCTTCATCCATTCTCTGCCACTGATCAAGTACGTTGTTTGGAACTATGGAATGTGCACACTTTAACTGGGTTGCAGGGATATGAATATATTGTGGAAAGGCGGATCACTCAAAGTTTACTTAAAAATTGTTAATTTGGGAAACCTGCATTGGTTTAACATCT
TGCTCCTTTTTTTATTGAATTGTTTTGTTTAACACTAACTTTGCATTGTTTTCTTATGTTTTTTGTCAAAACTTTGAAGCAAAAGCAAATTATGTTTGGTTTCAAATTTTCAACGTTATCTACGGAAGATCTGAAGGAGGCCCCTTGTATTAGTGGCAATGCATTTCTTCATGC

>TRINITY_DN120525_c3_g5_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGGCGTTCACTGTGTACGCA
CGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCTGGGGTAAATCTTATCTG
CCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAGTTTAAAGGACCTCGAGACAGTCCTTACAATTGTGGGGTTTGGAAGATCCATGTGGACATACCAGATGCCTACCCGTATAAATCTCCTTCTATA
GGTTTTGTGAACAGGATATACCATCCCAATGTCGATGAAATGTGAGGGTTTGTTTACTGAATTTATTTGTGGCCTTCTAAGAATACTTGTTTAACATTTTGTCCCTCTTATATGGGTGGGCATTATCAAAGCAGTGAAATCCTAACTATGTTTGAAATTGTTTGTAATTAAGGTCGGGCTCAGTGTGCCTGGATGTAATC
AATCAGAATTGGAGTCCAATGTTTGgtaagctaaaacatcaatttgtttgtatgcactttggattgtttatggtttacttttggatttatggggtggtacttagttatttaattagatgccaaggccaagtattcagaacttgagggctcacctgcattgcttattttgtggtaatcattaatttctttattgaataatt
aattgttttctatgtagATTTATTAAACATATTTGAAGTCTTTCTCCCTCAACTTTTGTTGTATCCAAATCCAACTGATCCCTTGAACGGAGAAGCTGCCGCTCTAATGATGCAGGATAGGGATCTCTATAACCGGAGAGTTAAAGAGCACTGTGCAAAGTATGCCAAGTCTGAAGTTGAAGGAAAAAAACAGGAAAAGG
AAAGCAGTGGTGACGAAATCAGTGACGATGAATATTCCTCTTGTGAAGAGGAATGACAGGCCATACAGACCATGATTCTTTAATGGGCTTACCAATTCAATACGGACATGTCTAAACATGTAACAAATTTTGAGAATTGAAACCCTGTATAATCAGCCATTCCTTCATCCATTCTCTGCCACTGATCAAGTACGTTGTTT
GGAACTATGGAATGTGCACACTTTAACTGGGTTGCAGGGATATGAATATATTGTGGAAAGGCGGATCACTCAAAGTTTACTTAAAAATTGTTAATTTGGGAAACCTGCATTGGTTTAACATCTTGCTCCTTTTTTTATTGAATTGTTTTGTTTAACACTAACTTTGCATTGTTTTCTTATGTTTTTTGTCAAAACTTTGA
AGCAAAAGCAAATTATGTTTGGTTTCAAATTTTCAACGTTATCTACGGAAGATCTGAAGGAGGCCCCTTGTATTAGTGGCAATGCATTTCTTCATGC

Intron 2 GTGAGGGTTT ... TGTAATTAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.54	621.2	191.4	5
A2	21.63	560.8	154.8	4
A3	20.88	597	157.6	0
A4	20.27	525.2	133.6	0
A5	20.02	212.4	53.2	0
A6	22.97	2105.8	628.4	1
A7	23.73	3437.4	1070	8
A8	21.66	3282	908.2	11
A9	22.59	3571	1042.8	4
A10	22.29	2758.4	791.6	5

>TRINITY_DN120525_c3_g5_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGGCGTTCACTGTGTACGCA
CGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCTGGGGTAAATCTTATCTG
CCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAGTTTAAAGGACCTCGAGACAGTCCTTACAATTGTGGGGTTTGGAAGATCCATGTGGACATACCAGATGCCTACCCGTATAAATCTCCTTCTATA
GGTTTTGTGAACAGGATATACCATCCCAATGTCGATGAAATGTCGGGCTCAGTGTGCCTGGATGTAATCAATCAGAATTGGAGTCCAATGTTTGATTTATTAAACATATTTGAAGTCTTTCTCCCTCAACTTTTGTTGTATCCAAATCCAACTGATCCCTTGAACGGAGAAGCTGCCGCTCTAATGATGCAGGATAGGGA
TCTCTATAACCGGAGAGTTAAAGAGCACTGTGCAAAGTATGCCAAGTCTGAAGTTGAAGGAAAAAAACAGGAAAAGGAAAGCAGTGGTGACGAAATCAGTGACGATGAATATTCCTCTTGTGAAGAGGAATGACAGGCCATACAGACCATGATTCTTTAATGGGCTTACCAATTCAATACGGACATGTCTAAACATGTAA
CAAATTTTGAGAATTGAAACCCTGTATAATCAGCCATTCCTTCATCCATTCTCTGCCACTGATCAAGTACGTTGTTTGGAACTATGGAATGTGCACACTTTAACTGGGTTGCAGGGATATGAATATATTGTGGAAAGGCGGATCACTCAAAGTTTACTTAAAAATTGTTAATTTGGGAAACCTGCATTGGTTTAACATCT
TGCTCCTTTTTTTATTGAATTGTTTTGTTTAACACTAACTTTGCATTGTTTTCTTATGTTTTTTGTCAAAACTTTGAAGCAAAAGCAAATTATGTTTGGTTTCAAATTTTCAACGTTATCTACGGAAGATCTGAAGGAGGCCCCTTGTATTAGTGGCAATGCATTTCTTCATGC

>TRINITY_DN120525_c3_g5_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGGCGTTCACTGTGTACGCA
CGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCTGGGGTAAATCTTATCTG
CCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAGTTTAAAGGACCTCGAGACAGTCCTTACAATTGTGGGGTTTGGAAGATCCATGTGGACATACCAGATGCCTACCCGTATAAATCTCCTTCTATA
GGTTTTGTGAACAGGATATACCATCCCAATGTCGATGAAATgtgagggtttgtttactgaatttatttgtggccttctaagaatacttgtttaacattttgtccctcttatatgggtgggcattatcaaagcagtgaaatcctaactatgtttgaaattgtttgtaattaagGTCGGGCTCAGTGTGCCTGGATGTAATC
AATCAGAATTGGAGTCCAATGTTTGGTAAGCTAAAACATCAATTTGTTTGTATGCACTTTGGATTGTTTATGGTTTACTTTTGGATTTATGGGGTGGTACTTAGTTATTTAATTAGATGCCAAGGCCAAGTATTCAGAACTTGAGGGCTCACCTGCATTGCTTATTTTGTGGTAATCATTAATTTCTTTATTGAATAATT
AATTGTTTTCTATGTAGATTTATTAAACATATTTGAAGTCTTTCTCCCTCAACTTTTGTTGTATCCAAATCCAACTGATCCCTTGAACGGAGAAGCTGCCGCTCTAATGATGCAGGATAGGGATCTCTATAACCGGAGAGTTAAAGAGCACTGTGCAAAGTATGCCAAGTCTGAAGTTGAAGGAAAAAAACAGGAAAAGG
AAAGCAGTGGTGACGAAATCAGTGACGATGAATATTCCTCTTGTGAAGAGGAATGACAGGCCATACAGACCATGATTCTTTAATGGGCTTACCAATTCAATACGGACATGTCTAAACATGTAACAAATTTTGAGAATTGAAACCCTGTATAATCAGCCATTCCTTCATCCATTCTCTGCCACTGATCAAGTACGTTGTTT
GGAACTATGGAATGTGCACACTTTAACTGGGTTGCAGGGATATGAATATATTGTGGAAAGGCGGATCACTCAAAGTTTACTTAAAAATTGTTAATTTGGGAAACCTGCATTGGTTTAACATCTTGCTCCTTTTTTTATTGAATTGTTTTGTTTAACACTAACTTTGCATTGTTTTCTTATGTTTTTTGTCAAAACTTTGA
AGCAAAAGCAAATTATGTTTGGTTTCAAATTTTCAACGTTATCTACGGAAGATCTGAAGGAGGCCCCTTGTATTAGTGGCAATGCATTTCTTCATGC

Intron 3 GTAGAGGGGG ... AGAAATCTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.36	751.2	161.5	190
A2	20.21	655	92	165
A3	17.67	774	132.7	165
A4	21	528.8	120.3	139
A5	16.64	288.3	54	57
A6	21.14	2633.8	362.3	703
A7	20.96	4257.7	615.7	1124
A8	21.14	3556.5	567	948
A9	21.73	3970.2	539.3	1098
A10	19.9	3450	474.3	853

>TRINITY_DN34559_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

TGCGCATGTCGGCAACAGTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGG
CGTTCACTGTGTACGCACGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCT
GGGGTAAATCTTATCTGCCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAGTTTAAAGGACCTCGAGACAGTCCTTACAATTGTGGGGTTTGGAAGATCCATGTGGACATACCAGATGCCTACCCGT
ATAAATCTCCTTCTATAGGTTTTGTGAACAGGATATACCATCCCAATGTCGATGAAATGTCGGGCTCAGTGTGCCTGGATGTAATCAATCAGAATTGGAGTCCAATGTTTGATTTATTAAACATATTTGAAGTCTTTCTCCCTCAACTTTTGTTGTATCCAAATCCAACTGATCCCTTGAACGGAGAAGCTGCCGCTCTA
ATGATGCAGGATAGGGATCTCTATAACCGGAGAGTTAAAGAGCACTGTGCAAAGTATGCCAAGTCTGAAGTTGAAGGAAAAAAACAGGAAAAGGAAAGCAGTGGTGACGAAATCAGTGACGATGAATATTCCTCTTGTGAAGAGGAATGACAGGCCATACAGACCATGATTCTTTAATGGGCTTACCAATTCAATACGGA
CATGTCTAAACATGTAACAAATTTTGAGAATTGAAACCCTGTATAATCAGCCATTCCTTCATCCATTCTCTGCCACTGATCAAGTACGTTGTTTGGAACTATGGAATGTGCACACTTTAACTGGGTTGCAGGGATATGAATATATTGTGGAAAGGCGGATCACTCAAAGTTTACTTAAAAATTGTTAATTTGGGAAACCT
GCATTGGTTTAACATCTTGCTCCTTTTTTTATTGAATTGTTTTGTTTAACACTAACTTTGCATTGTTTTCTTATGTTTTTTGTCAAAACTTTGAAGCAAAAGCAAATTATGTTTGGTTTCAAATTTTCAACGTTATCTACGGAAGATCTGAAGGAGGCCCCTTGTATTAGTGGCAATGCATTTCTTCATGCCAGATGCAT
GTTGAACTGGCTTTTCCACTGTACTGATTCACTTCAGAAAATCTGAATGCATTTGTTGATCAGCATGTCTCTGTAGGAGACATTTGAAATATCAGAATTCTATTTTAATTTTTTTACCGAGCGTGAACTATATGGTCTTCCATTGCAAGAGTTGTCTAATGAGCTGAACATAGGAACCCCCCATGCATGCTTGTATGCGT
ATGTTTGCCTGATAGTGAGAGTAAGTGAAATACAGGGATCTTGACATAAGCAATCAGGATGTGTTTTCAAACATGGTGTTAGATTCTATAGCTGTGTTTTGTATTTAATGCCTTTACAGTCTCA

>TRINITY_DN34559_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TGCGCATGTCGGCAACAGTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGG
CGTTCACTGTGTACGCACGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCT
GGGGTAAATCTTATCTGCCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAGTTTAAAGGACCTCGAGACAgtagagggggtgcactagctcatttgatcaaaacaatgtcacttggaacttcatcaa
atcagctcgaaattgttgcgacaggaaaagaacttcattgcacttgccatctacaagaaatctagGTCCTTACAATTGTGGGGTTTGGAAGATCCATGTGGACATACCAGATGCCTACCCGTATAAATCTCCTTCTATAGGTTTTGTGAACAGGATATACCATCCCAATGTCGATGAAATGTCGGGCTCAGTGTGCCTGG
ATGTAATCAATCAGAATTGGAGTCCAATGTTTGGTAAGCTAAAACATCAATTTGTTTGTATGCACTTTGGATTGTTTATGGTTTACTTTTGGATTTATGGGGTGGTACTTAGTTATTTAATTAGAT

Intron 4 GTAAGCTAAG ... TGTTGGTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	12.93	540.7	81.7	9.5
A2	16.77	412.7	84.8	13.7
A3	13.87	554.4	91.2	9.5
A4	11.04	395.7	49.9	4
A5	16.75	224.1	46.3	4.2
A6	12.32	1387.8	197.8	5
A7	13.27	2369.6	367.7	9.5
A8	12.19	2118.7	298.4	11
A9	14.07	2312.1	386.9	12.7
A10	14.13	2059.2	343.8	16.7

>TRINITY_DN120525_c3_g5_i2 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGGCGTTCACTGTGTACGCA
CGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCTGGGGTAAATCTTATCTG
CCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAGTTTAAAGGACCTCGAGACAGTACGTGGCATTTTTTTTCGTTTGTTATTTTTCTTAAAATTTCAGTATAATTTGTGTATTTTTCATTCTTGTTT
TCATACTTTCTTCCAGTTCTTTATTTTTCCCTGTTACTACTTTTAATCGTATAATCTTTTCTATTTTTCACCAATTCTTTTAAATTTGTTTTCGATGATAAATTTTTATTATCACTGACACAGACCTTATCAATTATTTGCAATTTTAGCTCTTCAATGGTTGATGAGTTTCAGGGCCTCTGTTAAATCCCCCAGATATT
TGTTTGACTGGACCTAGAAACATAATTCTGAATTATTTATTGTGTTTTTCAATGTGCATTTGGAATCTGTGTAATCTTTTCGTTAAAATCATTTTAGTGCAAGCCTGGGCAAGTGATGATTTAGTAGTAGTACCGTCTATTTGCCCTGTTCTCTGGATTTTCTTGCACAGCTTTGAGCTTCTTTTTATTTCCTTTGCTCT
GAGTTTTTTATTGGATTCAAGGTCCGAAATCGTTATATATACCATTTACCGTTAGCTCTCTTGAATGCTTCAGTCAGAAGATTCTCTACCTTATTTTCTATAAATTGCAACCTAAAGTCTACAACTACATATATTTTCTATGGCCTCATCTATTGCAGTTGGCAATAATGAAATGTAGACTGACCGAAATTTTATCTAGA
GTGCATGTTTTCATTATCTTGTTTCTTCTTCTTTGGTAGAGATAAGGCCATCTTACTCAGCATAGTAAATTGTAAACGTGGGTAAAACTTTTATAATATCGTACCTGATCAAAATTCACAGAGGAGTTTCTTATGATAGCTTCAGGGCACTAAACGAAAATTTGTTATACTTAATCAGGTCCCGGTTTCCTCTTTTTGGA
ACTCTTCTCAAAATAAATCAATTATGAAGTTTTGGTTTTCAAGGTGTTATATTGAGTGATCTGAAACTTTTCTACTTAACTATGTTTTCCTTCCTTCCCTGAATGACACTGGGAACAAGAATCCTTTGAATTGAAGTACTAGAATCTGAACTCCACATTTGTAGCGTTTCCAATCTAATTAAACACATGATCCATACATT
TTCTTATAATTTATGCTTCTTGGGTTTTTTGATAGATTTCCCTTTCTTTGATGATTTAAACCTTTGAAAGTTGTACTGGCTATAGTCTGAGTCTCTTCCAGGGTTTTTGGAGCATGGATTTTGTACTAACTGGCCTTGCGGCTCTGTTAGTCTGCCATAAGGCCCGGGGGGACTTTATAATTACCTTTCCACTAGGTAAT
GAAATCCTTCCCAAGGAAATACCCATTGATATTGATGCATAGCCTGACTATCAAGGAAGAAAGTCACTGCCATGAAACAGTTTTTTGTGGTCCATTGATTTTCTGAAATACCTTAGTTGTCTTTTTTGAATGGTATGAGTTATTTTATGGGGATAAAGCCACTCATTGGTATTACCAATTTTGGGTTGAAATCTAGAGCT
TGCCTCTATAGTTTTGGGACTTCCTTGATTGCACCCATGCATTGAAAGAAAATTTTATCCTTAAAGAATTTGTGTTAATATGTTTGGGTGGCAAAGTTTTGCATTAGCCACTCCTTCTATCAACCTTTCGATTACTTCCTTTAGATGT

>TRINITY_DN120525_c3_g5_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTGGGGTTGGCCAATATTAAACGGAAGAAATGGACGGCAAGGAAACGGGCGCCAAAGACAGTGGGGAATCATCACTTGCACACGGTCTGAGGTCGCTCCACATATCTGAAATCCAGGTTTCCGCTTCGATCTCCGGGAGTCTCATTTTTTTTTTTATTTGATCTGTCCGACGCCAGGTGTGGGCGTTCACTGTGTACGCA
CGGAGAATGTAAGGGTGGCCCTCTGACACTTCCCGTGCAAGAACAAGCGGGAACTACCCATCTGCCTGCCTGGGTTGGTGAATTATTATTATCATAAGAGTCTTCCTCGTATCTGAAGTCTTCGCCGTATTTGAGGTAAAGAGTTCGAGTTCAGAGGGTTTGAGCCTTCGTTATTACAATTCTGGGGTAAATCTTATCTG
CCATGGGCAACCTCGGCAAGCGGCGGGACATGGACGTAATGAAGCTgtaagctaagctaaatctacatgtatccttcataaattcttcttgtttacattgagaatttgcctgatgctgctgggatgttttgttggttagAATGATGCGTGACTATAAAGTGGAGACGGTAAAGGATGACCTGAACGAATTCTATGTGGAG
TTTAAAGGACCTCGAGACAGTACGTGGCATTTTTTTTCGTTTGTTATTTTTCTTAAAATTTCAGTATAATTTGTGTATTTTTCATTCTTGTTTTCATACTTTCTTCCAGTTCTTTATTTTTCCCTGTTACTACTTTTAATCGTATAATCTTTTCTATTTTTCACCAATTCTTTTAAATTTGTTTTCGATGATAAATTTTT
ATTATCACTGACACAGACCTTATCAATTATTTGCAATTTTAGCTCTTCAATGGTTGATGAGTTTCAGGGCCTCTGTTAAATCCCCCAGATATTTGTTTGACTGGACCTAGAAACATAATTCTGAATTATTTATTGTGTTTTTCAATGTGCATTTGGAATCTGTGTAATCTTTTCGTTAAAATCATTTTAGTGCAAGCCTG
GGCAAGTGATGATTTAGTAGTAGTACCGTCTATTTGCCCTGTTCTCTGGATTTTCTTGCACAGCTTTGAGCTTCTTTTTATTTCCTTTGCTCTGAGTTTTTTATTGGATTCAAGGTCCGAAATCGTTATATATACCATTTACCGTTAGCTCTCTTGAATGCTTCAGTCAGAAGATTCTCTACCTTATTTTCTATAAATTG
CAACCTAAAGTCTACAACTACATATATTTTCTATGGCCTCATCTATTGCAGTTGGCAATAATGAAATGTAGACTGACCGAAATTTTATCTAGAGTGCATGTTTTCATTATCTTGTTTCTTCTTCTTTGGTAGAGATAAGGCCATCTTACTCAGCATAGTAAATTGTAAACGTGGGTAAAACTTTTATAATATCGTACCTG
ATCAAAATTCACAGAGGAGTTTCTTATGATAGCTTCAGGGCACTAAACGAAAATTTGTTATACTTAATCAGGTCCCGGTTTCCTCTTTTTGGAACTCTTCTCAAAATAAATCAATTATGAAGTTTTGGTTTTCAAGGTGTTATATTGAGTGATCTGAAACTTTTCTACTTAACTATGTTTTCCTTCCTTCCCTGAATGAC
ACTGGGAACAAGAATCCTTTGAATTGAAGTACTAGAATCTGAACTCCACATTTGTAGCGTTTCCAATCTAATTAAACACATGATCCATACATTTTCTTATAATTTATGCTTCTTGGGTTTTTTGATAGATTTCCCTTTCTTTGATGATTTAAACCTTTGAAAGTTGTACTGGCTATAGTCTGAGTCTCTTCCAGGGTTTT
TGGAGCATGGATTTTGTACTAACTGGCCTTGCGGCTCTGTTAGTCTGCCATAAGGCCCGGGGGGACTTTATAATTACCTTTCCACTAGGTAATGAAATCCTTCCCAAGGAAATACCCATTGATATTGATGCATAGCCTGACTATCAAGGAAGAAAGTCACTGCCATGAAACAGTTTTTTGTGGTCCATTGATTTTCTGAA
ATACCTTAGTTGTCTTTTTTGAATGGTATGAGTTATTTTATGGGGATAAAGCCACTCATTGGTATTACCAATTTTGGGTTGAAATCTAGAGCTTGCCTCTATAGTTTTGGGACTTCCTTGATTGCACCCATGCATTGAAAGAAAATTTTATCCTTAAAGAATTTGTGTTAATATGTTTGGGTGGCAAAGTTTTGCATTAG
CCACTCCTTCTATCAACCTTTCGATTACTTCCTTTAGATGT