NA ----> NA

Intron 1 GCCCATAATT ... GTTGCTATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	71.86	38	86	105
A2	70.59	35.5	70	96
A3	75.24	35.5	87	122
A4	75.59	24.5	68	83
A5	76.94	16.5	43	63
A6	100	0	3	5
A7	100	0	2	4
A8	50	2	1	3
A9	93.34	0.5	5	8
A10	100	0	1	0

>TRINITY_DN131757_c6_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

TAAATTAGATTAGCCTTCATTGCTATAGGCCCATAATTAAATTAATGTTGTGCCTTGTGTTTGATGCTATCGGGCGTGGGATAACTGGCACTCAAATTGCCCCGATGGCACGGATCTAGAGTTTAGCTTACGCCAACGATGAAGGCTAAGCTATAAGAGTTGAGAACCCATAATTAATTATTTAAACCCACAATAAATTA
GATTAGCCTTCATTGCTATAGGCCCATAATTAAATTAATGTTGTGCCTTGCGTTTGATGCTATCGGGCGTGGGATAACTGGCACTCAAATTGCCCCGATGGCACGGATCTAGAGTTTAGCTTACGCCAACGATGAAGGCTAAGCTATAAGAGTTGAGAACCCATAATTAATTAATTAAACCCACAATAAATTAGATTAGC
CTTCATTGCTATAGGCCCATAATTAAAT

>TRINITY_DN131757_c6_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CGATGAAGGCTAAGCTATAAGAGTTGAGAACCCATAATTAATTATTTAAACCCACAATAAATTAGATTAGCCTTCATTGCTATAGgcccataattaaattaatgttgtgccttgacgttgaaggcatttgcttcgttgccaacgatgttgctatagGCCCATAATTAAATTAATGTTGTGCCTTACATTGAAGGCATTTG
CTTCATTGCCAACGATGAACGCTAAGCATGAAGGCTAAGCTATGAGCGAGTAGGATAAAAGACAACTAAAACGCCCCGCTTTTCCGGCCAATTTTTATAAAAGCTGGTTAAAATTGTTCCTGGAAATTGGCATTTTTGCAATTTCAGCAATTGTAATTACCTGTCCTTGACTATGCCTGATTTTAAAACTACCCAGATCG
CTGAAATTGTGACTTGAGCACTCCAAATTGCGATTTCAGCAAGAACTGCTCTGGCGGGTTGAAGAACTGCTCTGGCAGGTTGGGGGCATTTTGGTTGGCGCTTACACTGCGCCAGCTTGAGAACCCATAATCATTTAAACCCACAATTAATTAATTAATTAAACCCATAATTAA