sp|Q501D1|Y1490_ARATH ----> Hypothetical protein At1g04090

Intron 1 GTTCCAAGCT ... TGTTACAAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	65.17	31	58	9
A2	65.22	24	45	15
A3	71.79	11	28	3
A4	67.31	17	35	8
A5	45.45	18	15	14
A6	33.33	2	1	4
A7	55.88	15	19	12
A8	78.26	5	18	1
A9	80	2	8	2
A10	80	2	8	3

>TRINITY_DN43957_c0_g4_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

TAAATATTCATGCCTTTTTCAGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTACGTGTATTCTTATCTTGGTATACAG


ATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAA
ATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGA
GGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAAT
TATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATG
AAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCC
TCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGACGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAAT
GGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTA
AAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGTTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCG
CCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTACAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTA
TTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTA
GTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCAC
GGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCTTGTTAATAATGCATTTGTATTAGTCATTTTCTCTTTGACAGGTGCACTGAGTTCTATGGTCCTTTAACATTTTTCCCCTCATTGTTCTAGATGGGATGACATTTCTATTTTATTCATCATGCTTTCAATC
GGAATTTGCGATTTTTTCATGGATTTATCCATTGGATGGTTAGCTAAATCTGTCTAAATGGACTTGGACTGTTTCAAGGCAGAGTTTGCTGTGAGGTTCTCTGATCCTCTATCCGGATGCCTTGGAAAAAAAATTAATAGGATTTTTAAATAATTCCAATTTGGTTTGGAATTTGACAGCTAGAGTAAATTGTACCTTCA
AAATATTGTGGTGTAACCACTACCTTCTTTTAACATATTGTAAACTTGTTGTGGATTCGAGTAGCC

>TRINITY_DN43957_c0_g4_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TAAATATTCATGCCTTTTTCAGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTACGTGTATTCTTATCTTGGTATACAG


gttccaagctctccaaatgttgtgctaatggttaaaattcatgaaccaattatttggcgacttcatgagatgttccaaaaaatgaaccttggcagactaaccacaagtcagacaactgatgttgcaattgatcctattatacgaatcgggtatatgacaataaagcctttgatacactgttgaactaaagcactacaaca
ttgtacattcttttatagttcagttttttgttctttgctttcttcttcattatttttgttcctcttcatgttatccgatgccattttctttttgttgttacaaagATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGA
TGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAA
GGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCA
AGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATC
GAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGA
AAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTG
TGAATCTCGACAGGCAGACGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTG
GCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGAC
CAGAGAACACGTTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTACAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCAC
AAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTT
GGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGAT
ACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCTTGTTAATAATGCATTTGTATTAGTC
ATTTTCTCTTTGACAGGTGCACTGAGTTCTATGGTCCTTTAACATTTTTCCCCTCATTGTTCTAGATGGGATGACATTTCTATTTTATTCATCATGCTTTCAATCGGAATTTGCGATTTTTTCATGGATTTATCCATTGGATGGTTAGCTAAATCTGTCTAAATGGACTTGGACTGTTTCAAGGCAGAGTTTGCTGTGAG
GTTCTCTGATCCTCTATCCGGATGCCTTGGAAAAAAAATTAATAGGATTTTTAAATAATTCCAATTTGGTTTGGAATTTGACAGCTAGAGTAAATTGTACCTTCAAAATATTGTGGTGTAACCACTACCTTCTTTTAACATATTGTAAACTTGTTGTGGATTCGAGTAGCC

Intron 2 GTGTGGAATT ... TGTTTTCTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	6.12	23	1	2
A2	17.33	31	3	10
A3	18.03	25	4	7
A4	14.85	43	10	5
A5	9.68	28	0	6
A6	-1	0	0	0
A7	-1	0	0	0
A8	-1	0	0	0
A9	-1	0	0	0
A10	0	4	0	0

>TRINITY_DN123972_c0_g2_i20 from sample A3 / Example spliced isoform

TGGCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTT
CTGATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAA
GATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAG
ATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTA
CATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAA
GTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTC
AGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAAC
AAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAG
ATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAA
AGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGT
GTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGT
CAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAG
ATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCA
AAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAA
GGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAG
CAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGC
AATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGA
TTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGC
CAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACA
TTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTT
GCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTT
CCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATT
GTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTC
TATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATA
TTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTA
CAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAG
AAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGA
GAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAG
CAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAA
TGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTA
TTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTC
GATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGAT
TGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATC
ATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCT
AATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAG
CAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATATGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAG
GGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATGCTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACA
GTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAA
ATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAG
CATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATTCGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAG
CAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTCTGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCT
TGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGGTATAAGAGATTCATTCTGTTCTTATCCTTTCTTTTCTTTTGGTGACTAATTGTTAATATTTGTTTTTGATGGTATCATGCAAATCTGGGTTTTCTTCTT
GCTTTTTTTCACAGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTT
ATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACA
GCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCT
TACCTCTATCTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACA
GTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGTCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATC
TCAGTTTGTTGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCT
CTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAG
GGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGTTAGACAATAAGCT
TCCTTGTAATGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAG
ATTCTCTTCCTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACA
GATTCTTTCTTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCAAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAATGCTCTCACCACAGACAACTTTCTCTCGTACTGGATTTTCACCATTCTCTCGAGA
GGATGAAAGCCTATTATCACCGCGATTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACTAAGGTTGTACATTTTC
AGCCTCACACTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGTTAATAGTGAAGGAATA
ATGCACATCAACTTGAAAAGTGAGCTGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATGATGATTCCTGGAAGTT
TATTCAGACAGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCA
ATGTGGTAAAAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGCGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATT
CAAAATCTCATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAA
TTACGTGTATTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCC
GATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGT
CAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTT
TCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGG
AGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAG
GGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCA
CTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTG
TGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCT
GTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATCTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGC
AAACAAATCTGATGGAAAATTTTTACAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGA
AGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAA
TTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATG
AGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAA

>TRINITY_DN123972_c0_g2_i11 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TATGAGCAAAAAGTATGCATCTGCATAACAATTGCAGACTAGCTTTCTTGTGTAAATACTAAATATTACTATGGCTTAGGAAAAAGTTAAAACTTCATTAATTTCTATAGCCAGTCTTTTGATGACGTCCTTTTGCCACTTACACCGTTTCATTTTGTTTTGAGGATACCAGTTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTT
CAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGgtgtggaattttcattttttgtttctttatttcactgttacagtgaatagctaatgtttatctttaagtttagatgcataaaaattgcatttgattctcatattttctttgttttctag


ATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCATAGATTG
TGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTT
CATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGATGTTGAT
GGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGG
GCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACT
TGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGA
ATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGC
TGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGC
AAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAG

Intron 3 GTAAGTTTTC ... ATTATTTCAG

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>TRINITY_DN124908_c0_g1_i23 from sample A2 / Example spliced isoform

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AGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAA
GCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGC
AAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATG
AGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCA
GTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAG
ATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAAC
AAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCA
TCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGT
AAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTG
GAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTA
TTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAG
AGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTG
CTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGT
TGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCT
GCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTC
TAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCT
GTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGA
CTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACA
GACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATG
AATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACAC
AGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATA
AAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCT
GCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGGTAACTGCCTATTTCACAGGCTTGGC
AACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAAGTATGCATCTGCATAACAATTGCAGACTAGCTTTCTTGTGT
AAATACTAAATATTACTATGGCTTAGGAAAAAGTTAAAACTTCATTAATTTCTATAGCCAGTCTTTTGATGACGTCCTTTTGCCACTTACACCGTTTCATTCTGTTTTGAGGATACCAGTTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGC
CGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTT

>TRINITY_DN124908_c0_g1_i18 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATCTGCTgtaagttttcgtcgttctcattaaattcggatcgatattcttc
tgatttcgttgcagtgcagccgttggatgattgcggaattatttcagGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAG
ATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGA
TGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTAC
ATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAG
TTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTCA
GAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACA
AAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGA
TCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAA
GAACTTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTG
TTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTC
AGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGA
TTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAA
AGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAG
GATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGC
AAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCA
ATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGAT
TTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCC
AGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACAT
TTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTG
CCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTC
CATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTG
TTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCT
ATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATAT
TAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTAC
AAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGA
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AGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAAT
GGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTAT
TGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCG
ATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATT
GATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCA
TCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTA
ATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGC
AAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATATGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGG
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TGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAA
TTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGC
ATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATTCGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGC
AGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGTTTCTATTTGAGATAACATACTTTCTTCCTAGTCAATGTCTAAGTGTTTTCTTGAAGCTGTTTCATATGATTGTTATATTTATGCACTAATTTATACTATTGATCCTTGAATCCTCCCATTGAAAAACAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATG
CATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTCTGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATAC
TATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAA
CTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCC
ATACATTTGGCTTACAGCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACG
AGCATACGTTCTGTCTTACCTCTATCTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTC
TGATACAAATAGGACAGTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGTCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATT
GGTTTGTTGACAAATCTCAGTTTGTTGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTA
CTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTC
TATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCA
AGTTAGACAATAAGCTTCCTTGTAATGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTT
TCTGATCCATCATCAGATTCTCTTCCTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTC
ACACAGTTCCGAGACAGATTCTTTCTTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCAAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAATGCTCTCACCACAGACAACTTTCTCTCGTACTGGATTTT
CACCATTCTCTCGAGAGGATGAAAGCCTATTATCACCGCGATTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACT
AAGGTTGTACATTTTCAGCCTCACACTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGT
TAATAGTGAAGGAATAATGCACATCAACTTGAAAAGTGAGCTGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATG
ATGATTCCTGGAAGTTTATTCAGACAGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTAT
AAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAAAAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGTGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACT
ACTCTACTTGTCCATTCAAAATCTCATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATC
GTGGATCACCGGATAATTACGTGTATTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTG
AATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCG
TAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTT
TTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCA
GCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCA
TTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTT
CGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGA
AAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACAC
AGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTA
GTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTA
CGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAA
TTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCAGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTG
AGGAGAATTTTGTATGAGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCA

Intron 4 GTGGGCATAT ... TTATATGTAG

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>TRINITY_DN123972_c0_g2_i12 from sample A3 / Example spliced isoform

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AGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAG
CAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGAT
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TAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATT
GGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGT
ATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAA
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TTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCC
TGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTT
CTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTC
TGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATG
ACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAAC
AGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGAT
GAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACA
CAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGGTCTCTTTTGTACTCTTGGATCCCTTAAAAGTACTTTTGAGAATATTCATGGCAGATACTAATGAGCATATATACTGTTACATTGTGCTCTCTCTCTCTAAACAAATCCAAATAAATGCAGACAATAATATTATAATAGTAACTGGTACATAAAAAAGGGATCAGAAATTGCTTTTG
AACGTACCTTGTGAAAGTGATTGTTATGTCTCGCATATTCTTGAAAATATAAATTTAAAATTTGATGTAGTACTAAGTTATTAGGCATGATATTTCTTGGAATGTGTTTAATATTGAAATAAATTGGTCCAAATCATACTATATCTGTCTCAGGCATTTTAATCATCTTTTTCATAACTACAATACATAACTCTGTAATT
ATCTTTAGAGGCTACTAATCCTGAGAACAATCATACATTTATTATAAAAGAAAAGTTGACAGTGC

>TRINITY_DN123972_c0_g2_i5 from sample A3 / Example unspliced isoform:

GTCATTTGTTGGACATTAATAAAATTATCTGATCTTATCTACTGAAAAATATGTGCATAGATAGCACTGGGGCTCAGTTGTGATGGTTTAATGAGAAGGTAAAGATATTCCCATTTTTTGAAGTCAATAAAATAATTGGCCATTCATAAAAAAATTGAAACTTAAGGAGAATCCGAGGCAAACTTTGCTGAATTTTGGAG
ATGCCTTTCATATTATGGATTTCATGTCTGGTTAGGGTTCAATTTTCTTTTCAAGTTGTAGTTTGAAGGCTATTTTGTGGCAACACTCTCAACGTCTTTTATTGTACTTGAGTTTCTCAGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGC
AACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGgtgggcatattgtttttacatgtataaatgtttgtgttttttacacattttttgtagcctgttgtgcactggagtgaaatggttgtgtaaaggtattgttattttgcagataaagattctc
atggtgactaacatttgttggttccctgattgttatatgtagGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGTTTGTTGATGTTTGATTGGTGCACCTAGTTTCAAATTAATATGCACAAGATTGGTCTTAGT
TATTTGCGGGATTCTTTCCTAATAATATTTCTTCTAATAGAAATGCTATGTTTATAAACAAAATACTCTGTTTTATAGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCT

Intron 5 GTATATTGCT ... AATGTGTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
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>TRINITY_DN135788_c1_g1_i15 from sample A1 / Example spliced isoform

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TTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTG
GCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAA
GATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCA
TGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTAT
CAAAATGGGCCCGAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATAT
CGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAAT
ACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTA
ATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAAC
AACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGA
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ACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTAC
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CTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGC
TGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTT
GGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACT
TACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATG
TAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGT
TCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGT
TGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCG
TACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGAC
AAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACT
AGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAA
TGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTT
GTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGATCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATAC
AATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATG
AAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCA
AAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAG
TGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGG
GATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTT
GCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATC
TGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTG
ATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGG
AAGGGTCCTGAAGATGCTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAG
CTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACA
ATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGCATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATT
CGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTC
TGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATG
CAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAA
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GAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCTTACCTCTAT
CTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAA
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TGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTT
TGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAA
TTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGGTAGACAATAAGCTTCCTTGTAA
TGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTC
CTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACAGATTCTTTC
TTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCGAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAATGCTCTCACCACAGACAACTTTCTCTCGTACTGGATTTTCACCATTCTCTCGAGAGGATGAAAG
CCTATTATCACCGCGATTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACTAAGGTTGTACATTTTCAGCCTCACA
CTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGTTAATAGTGAAGGAATAATGCACATC
AACTTGAAAAGTGAGCTGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATGATGATTCCTGGAAGTTTATTCAGAC
AGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAA
AAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGCGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATTCAAAATCTC
ATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTACGTGTA
TTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAG
TATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTG
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TACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTAC
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GTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGC
TCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATC
TGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAG
ATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCT
GAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGCAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCATAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTAT
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>TRINITY_DN135788_c1_g1_i24 from sample A1 / Example unspliced isoform:

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TGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGgtatattgcttacacatggtatctaccatttctaaatcagaaagattttcatgtctata
gttcaactatagttgttatgtatgtgcttattattgcttgtactaaagttcattttcttaaatactgatgagatacacatgcaatgactttgtaaaaatgtgtcagCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAA
AAGGTATATTGCTATGTAAATCTAATGTAGAACTTGATGTCTTTCAACTTTAAAATAAAACTTTTAAGCTTTATATGAATGACATATCGCATTACATTTATGATTTTACCCAAAACATTCTGTAATGATTCAGACATCCCTTAAAGTTTTAGCTTATTGATGAGAAAGTTGCTGTCTGTTTTATATTGAAATATTCTTTC
CGA

Intron 6 GTTTCTATTT ... TGAAAAACAG

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TCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTT
TCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTA
TGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAAT
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GCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGT
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GATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAAAAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATG
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>TRINITY_DN124908_c0_g1_i18 from sample A2 / Example unspliced isoform:

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TTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGC
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TAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTT
TTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCA
GCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCA
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CGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGA
AAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACAC
AGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTA
GTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTA
CGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAA
TTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCAGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTG
AGGAGAATTTTGTATGAGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCA

Intron 7 GTTTGTTGAT ... TGTTTTATAG

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AACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGA
AAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAG
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GGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACT
TACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATG
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TCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGT
TGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCG
TACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGAC
AAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACT
AGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAA
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GTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGATCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATAC
AATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATG
AAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCA
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GCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATC
TGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTG
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CGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTC
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TGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTT
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TTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGGTAGACAATAAGCTTCCTTGTAA
TGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTC
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>TRINITY_DN135788_c1_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:

CTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGgtttgttgatgtttgattggtgcacctagtttcaaattaatatgcacaagattggtcttagttatttgcgggattctttcctaataatatttcttctaatagaaatgctatgtttataaacaaaatactctgttttatagGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTT
CTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAA
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AGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAGAAGAAC
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Intron 8 GTTTTCTCTT ... TACGATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
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>TRINITY_DN124908_c0_g1_i18 from sample A2 / Example spliced isoform

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AGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACAT
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TTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCT
ATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATAT
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TGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCG
ATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATT
GATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCA
TCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTA
ATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGC
AAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATATGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGG
GTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATGCTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAG
TGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAA
TTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGC
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AGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGTTTCTATTTGAGATAACATACTTTCTTCCTAGTCAATGTCTAAGTGTTTTCTTGAAGCTGTTTCATATGATTGTTATATTTATGCACTAATTTATACTATTGATCCTTGAATCCTCCCATTGAAAAACAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATG
CATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTCTGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATAC
TATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAA
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ATACATTTGGCTTACAGCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACG
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TGATACAAATAGGACAGTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGTCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATT
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CTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTC
TATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCA
AGTTAGACAATAAGCTTCCTTGTAATGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTT
TCTGATCCATCATCAGATTCTCTTCCTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTC
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CACCATTCTCTCGAGAGGATGAAAGCCTATTATCACCGCGATTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACT
AAGGTTGTACATTTTCAGCCTCACACTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGT
TAATAGTGAAGGAATAATGCACATCAACTTGAAAAGTGAGCTGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATG
ATGATTCCTGGAAGTTTATTCAGACAGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTAT
AAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAAAAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGTGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACT
ACTCTACTTGTCCATTCAAAATCTCATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATC
GTGGATCACCGGATAATTACGTGTATTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTG
AATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCG
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TTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCA
GCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCA
TTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTT
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AAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACAC
AGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTA
GTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTA
CGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAA
TTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCAGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTG
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AGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATT
GATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCAC
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TCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGTCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTG
ACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATCTCAGTTTGTTGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCT
GAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCA
AAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATC
CAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGTTAGACAATAAGCTTCCTTGTAATGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCA
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CTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACAGATTCTTTCTTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCAAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAA
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CCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATGATGATTCCTGGAAGTTTATTCAGACAGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCT
AAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAAAAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGTGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGA
GTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATTCAAAATCTCATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGC
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GATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCG
CCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGgttttctcttgtttttttc
gtcacttgcttcctttttaactttcattactttttaatttatgtgcttttatgcttattgatagattcagggagacttcagaaagggaatcttccataagaaaggcttatatttttcttttagtagctgtaattttccagaatctctggctgtatactgatttcttaatgcgttagagctgctaagatgaacttcatatt
ttccaatttccctacgatgcagGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAG
CTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCT
GAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGT
ATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTG
CCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACT
ACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGT
TTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTG
CCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATT
GCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCAGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGT
GTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCA

Intron 9 GTTTTTTTTA ... GAAAAGACAG

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A3	26.62	51	15	22
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>TRINITY_DN124908_c0_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoform

GGCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTC
TGATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGTTTTTTTTGAGTTATTTCGGCTCATCTTAAGGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAG
TATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGA
CCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGG
TTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCA
GTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAA
GCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTT
ATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGG
CTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGTTTGTTGATGTTTGATTGGTGCACCTAGTTTCAAATTAATATGCACAAGATTGGTCTTAGTTATTTGCGGGATTCTTTCCTAATAATATTTCTTCTAATAGAAA
TGCTATGTTTATAAACAAAATACTCTGTTTTATAGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTCTGCTTTCTGATAAGGA
GCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATAC
AGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCA
GCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAAAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGT
GAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCC
TTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCA
GGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGT
TGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAAC
CAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCC
CTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGC
TTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCC
ACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGAT
CGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGA

>TRINITY_DN124908_c0_g1_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GGCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTC
TGATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGTTTTTTTTGAGTTATTTCGGCTCATCTTAAGGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAG
TATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGA
CCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGG
TTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCA
GTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGgttttttttatctttcatgaatatgcttcgatatatctctactttctcactgattggcctttttattatgtttcttttctaacatctggcaaaatagaacactttgactaaattaggaaagc
tttgatatgatgggtgtatggaaactcagcaagttggcttgtttgtaatctgaaaagacagATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATC
CAAGTGTTCCTTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGTAATGGTTCTTATTCTGATATCTGTTGGCCTCTCCCATATATATTTGTAGGTAGTTTCTTAGTATCTAATTTCCGCAATCTTTCTGAGGATTTCTCTTAATTGTTTATATATATTAGAGTTGATGAATATATCCACT
TGATCACATCTGAAGCTGTGTGGAACTGGACATACAACTCCCTCCTGCTTGATTTTCTGTGCTTGCTGTTTTCTTGTCCCATATTAGTATTCTTGTATGCA

Intron 10 GTAATGGTTC ... TTGTATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.64	48	12.6	8
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A10	-1	0	0	0

>TRINITY_DN135788_c1_g1_i15 from sample A1 / Example spliced isoform

GTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATCTGCTGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTA
TTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTG
GCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAA
GATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCA
TGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTAT
CAAAATGGGCCCGAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATAT
CGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAAT
ACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTA
ATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAAC
AACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGA
AAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAG
AAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGAC
ACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTAC
ACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGC
TAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAG
TTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAAT
CTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGC
TGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTT
GGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACT
TACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATG
TAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGT
TCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGT
TGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCG
TACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGAC
AAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACT
AGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAA
TGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTT
GTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGATCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATAC
AATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATG
AAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCA
AAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAG
TGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGG
GATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTT
GCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATC
TGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTG
ATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGG
AAGGGTCCTGAAGATGCTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAG
CTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACA
ATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGCATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATT
CGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTC
TGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATG
CAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAA
GTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACAGCCATTAAA
GAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCTTACCTCTAT
CTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAA
ATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGGCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATCTCAGTTTGT
TGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTT
TGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAA
TTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGGTAGACAATAAGCTTCCTTGTAA
TGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTC
CTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACAGATTCTTTC
TTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCGAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAATGCTCTCACCACAGACAACTTTCTCTCGTACTGGATTTTCACCATTCTCTCGAGAGGATGAAAG
CCTATTATCACCGCGATTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACTAAGGTTGTACATTTTCAGCCTCACA
CTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGTTAATAGTGAAGGAATAATGCACATC
AACTTGAAAAGTGAGCTGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATGATGATTCCTGGAAGTTTATTCAGAC
AGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAA
AAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGCGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATTCAAAATCTC
ATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTACGTGTA
TTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAG
TATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTG
CAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGT
TACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTAC
TACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACT
GTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTAC
TTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTG
GTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGC
TCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATC
TGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAG
ATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCT
GAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGCAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCATAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTAT
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>TRINITY_DN135788_c1_g1_i35 from sample A1 / Example unspliced isoform:

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Ggtaatggttcttattctgatatctgttggcctctcccatatatatttgtaggtagtttcttagtatctaatttccgcaatctttctgaggatttctcttaattgtttatatatattagagttgatgaatatatccacttgatcacatctgaagctgtgtggaactggacatacaactccctcctgcttgattttctgtg
cttgctgttttcttgtcccatattagtactcttgtatgcagGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATG
TGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAA
GGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACT
TCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCT
GCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCC
TGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTG
GTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAAT
CGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGG
ATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGTATGTTTTTTTTCTTGACTTTCTTCTTCTGTACTCTTGTTTTTCCTTGTGGCCAGCTTTTAACACATGGGTATTTTTATATTTGCTACTAAAAGCTCATAGACTTTATTTTAGG

Intron 11 GTATGCATCT ... AGGATACCAG

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>TRINITY_DN135788_c1_g1_i15 from sample A1 / Example spliced isoform

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GGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACT
TACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATG
TAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGT
TCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGT
TGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCG
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AAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACT
AGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAA
TGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTT
GTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGATCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATAC
AATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATG
AAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCA
AAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAG
TGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGG
GATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTT
GCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATC
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ATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGGCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATCTCAGTTTGT
TGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTT
TGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAA
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TGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTC
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>TRINITY_DN135788_c1_g1_i7 from sample A1 / Example spliced isoform

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CTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAA
AATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTT
AGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAGAAGAAC
AAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGTCAGTATCATGTTCATCAATAAATAGATGTACTGTTTTGCGGTTTTGGAATTGTCTATTT

>TRINITY_DN135788_c1_g1_i12 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCT
ACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACT
TGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGgtaattgaagctaaaatcactg
tctttgaagtttgaagagtttgttcagatgtaacacatttgaataatagttagttctataatgtttcctattagtcagcatctacctggcgagggttgcacaacatgaaagataatcttttatataattagatgtaatgtatgcttttgttataaattccttgcaagtttttcttatctatataatattttcacatcctt
taactctattttcagtgttcaccataaggtgttatttgagatattgtttatttgtacagtcatcataagtttttgttctattaatgtctgtattacctgtgaaaaatttacgaggatatgccctttgtggtggttgctccaaaaatagatgtccgtaatatattttacaaaatctggatagcctattgtttttattgcct
tctacatttacttttgagcacagATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACA
TTGCGTACAGTGAACGTCAGTATCATGTTCATCAATAAATAGATGTACTGTTTTGCGGTTTTGGAATTGTCTATTT

Intron 13 GTATTGCTGA ... CTATTCAAAG

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>TRINITY_DN135788_c1_g1_i15 from sample A1 / Example spliced isoform

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TTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTG
GCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAA
GATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCA
TGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTAT
CAAAATGGGCCCGAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATAT
CGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAAT
ACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTA
ATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAAC
AACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCATTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGA
AAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAG
AAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGAC
ACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTAC
ACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGC
TAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAG
TTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAAT
CTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGC
TGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTT
GGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACT
TACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAATAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATG
TAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGT
TCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTGTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGT
TGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCG
TACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGAC
AAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACT
AGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAA
TGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTT
GTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGATCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATAC
AATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATG
AAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCA
AAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAG
TGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGG
GATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTT
GCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATC
TGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATTTGTCAACCTCACAATTTG
ATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGG
AAGGGTCCTGAAGATGCTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAG
CTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACA
ATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGCATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATT
CGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTC
TGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATG
CAAGGGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAA
GTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACAGCCATTAAA
GAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCTTACCTCTAT
CTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAA
ATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGGCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATCTCAGTTTGT
TGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTT
TGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAA
TTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGGTAGACAATAAGCTTCCTTGTAA
TGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTC
CTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACAGATTCTTTC
TTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCGAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAATGCTCTCACCACAGACAACTTTCTCTCGTACTGGATTTTCACCATTCTCTCGAGAGGATGAAAG
CCTATTATCACCGCGATTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACTAAGGTTGTACATTTTCAGCCTCACA
CTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGTTAATAGTGAAGGAATAATGCACATC
AACTTGAAAAGTGAGCTGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATGATGATTCCTGGAAGTTTATTCAGAC
AGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAA
AAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGCGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATTCAAAATCTC
ATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTACGTGTA
TTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAG
TATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTG
CAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGT
TACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTAC
TACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACT
GTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTAC
TTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTG
GTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGC
TCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATC
TGATGGAAAATTTTTGCAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAG
ATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCT
GAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGCAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCATAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTAT
GGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCTTGTTAATAATGCATTTGTATTAGTCATTTTCTCTTTGACAGGTGCACTGAGTTCTATGGTCCTTTAACATTTTTC

>TRINITY_DN135788_c1_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATCTGCTGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTA
TTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTG
GCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAA
GATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCA
TGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTAT
CAAAATGGGCCCGAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCCTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATAT
CGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAAT
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AAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAG
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ACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTAC
ACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGC
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TGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCTATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCG
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AAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACT
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AATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATG
AAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCA
AAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAG
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GCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGgtattgctgatttctttttctacatttttcattgttccatcattcttagataacatgaaatttgcgttggcttctagaaataaccag
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TCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATATTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTA
TCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTACAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATT
CAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGAAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGAC
AGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAGAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTG
TAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGCAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGA
AAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAATGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGA
CACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTATTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATT
TAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCGATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTA
CTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATTGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATC
CCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAG
CTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTAATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTG
CGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAGCAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATATGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGA
CAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAGGGTTGGACCCACCGAGTTTGGGTGTAGTTCTGAGGGATGACGATTCTGGACGCCTTGAGAAGCCTGCTAAGTTTAAGAAAACACAAATACCAGGGAAGGGTCCTGAAGATG
CTTTTATGTTGTTCCCTGTTGCTCCTGCTGGTTATGTATCTTTAGGTTGTATAGCTTCAAGATCAGCGACTCTACCTCCCTTAGACACAGTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAA
AACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAAATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATAT
AAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGCATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATTCGAATTACAGCAACAA
ATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGCAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTCTGAGAAATTAGTCATT
GAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCTTGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGGAGTTAATGTT
GACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTTATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCT
TAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACAGCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAAT
GATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCTTACCTCTATCTACAATACCAAAAGA
GCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACAGTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTG
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GCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCTCTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTAC
TACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAGGGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTC
TGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGTTAGACAATAAGCTTCCTTGTAATGCAGAATATATCATT
TGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAGATTCTCTTCCTAGTTTCTTCTGGAT
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TTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCAAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAATGCTCTCACCACAGACAACTTTCTCTCGTACTGGATTTTCACCATTCTCTCGAGAGGATGAAAGCCTATTATCACCGCGA
TTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACTAAGGTTGTACATTTTCAGCCTCACACTTTATTTGTTAACAG
GGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGTTAATAGTGAAGGAATAATGCACATCAACTTGAAAAGTGAGC
TGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATGATGATTCCTGGAAGTTTATTCAGACAGGCTCTGCTACATCA
TTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCAATGTGGTAAAAGTGGCAGACTGGAT
GCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGCGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATTCAAAATCTCATCATGTCATATGGCA
CTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTACGTGTATTCTTATCTTGGTATA
CAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTT
ACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTG
TTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACA
AAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCC
TCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATC
ATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCT
AGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGC
AACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCT
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CAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCC
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AGCTTCAATCAAA

>TRINITY_DN123972_c0_g2_i20 from sample A3 / Example unspliced isoform:

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GATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAG
ATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTA
CATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAA
GTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTC
AGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAAC
AAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAG
ATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCCATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAA
AGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTGTAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGT
GTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATTGGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGT
CAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGTATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAG
ATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCA
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GGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAG
CAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGC
AATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGA
TTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGC
CAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACA
TTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTT
GCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTT
CCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATT
GTTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTC
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TTAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTA
CAAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAG
AAGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGA
GAGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAG
CAGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAA
TGGTTCACGATTGGGGGAGCTCATATATTTAAGTAATGATAGCAGTTATTGTGCCTCTGTAGAAGACGGTGTGATTTTTGATGATTTAAATGATGAAGAATGCTCTTTTGACACTGATGGAATAAGGAATAAGGGCCAACGTCCATCTCTTGTTTCAGAAGAACATGGCACCAATTTTGATGGAGCAAACAATTTCATTA
TTGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTC
GATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGAT
TGATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATC
ATCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCT
AATTCAAGGGACCAAGATGGCTTCAGTATTTGGTGTATAGAAAATGCTGTTGGCTCTTTTCTTGCACACACATCTGTTGAACCTCCTCCAAAATCTGTGGTCTGTGATCTGCGTGAGATGCTGAACAGAAATTTTACTAACTCTGATTTGCACGAGGAAACATCAAATTCTGAAATGAATGCAAAATCTGATGTTGGAAG
CAAGCATGGGGTAGATAGCAGACCAAGCATGCCTCGATGGGATAGAACAGCATCCATAGCAAAATTGGCTCGTTATATGTCAACCTCACAATTTGATCTCATATGGTGGGACAAGGGCAGTGAATCTAGATCTGCAGTTTCTATTTGGCGACCTGTACCACCTCCTGGTTATGCTATTATTGGTGACAGCATTGTTGAAG
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GTGCGTTGTGTGCGTATGGACCTTGTAAACCAGGCAAATATGTCCAAGAAAGCTGTTTGGAGCATGCCAGGTCTGAAAGGATCATCTGGTTGTAGCTTATGGAGAGTTGAAAACCAGGCTAGCACATTTATTGCAATGCCTGACCTGAAAAGACCAGCAAGTCGGATGGCATATGGGCTTGCAGAGACTGGGAGACAAAA
ATTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAG
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CAGGCCCGTATGGCAATGCAGCTTGAAAAGGATATTAATGAATATGGCAGACCTGTATTGAATCGGAATGCATCTGCTCTAGAAGTAGATGATTCTGAGAAATTAGTCATTGAAAATAGACTTGGATGTAATTTGTATATCCGACAGTACAGAGACAATTTTGAAGATATTAAGCTATTGAAGCCTGACAGTAATGTTCT
TGTGCACCTTCCACCTCCAAGGTTTCCTGACAGATTGAATGCTGTCACAGAGACAAAGGCTTCTCGATACTATGTTGCTGTTCATATTTTAGATGCAAGGgtataagagattcattctgttcttatcctttcttttcttttggtgactaattgttaatatttgtttttgatggtatcatgcaaatctgggttttcttctt
gctttttttcacagGAGTTAATGTTGACTGAAGATGGAAATGGGAAAAACTTCTTTTGTGCTCTCCGTTTAGTAACCACAACGCAAACATCAGAGGATCAAAAGCCTTTTCCTCAGAGTGCAAGGTCTAGATGTGTTAGGCCATTGATGATAGAAACAAACAATCATGTAGTTGGTTCAGTAAACTGGAATGAAGTGTTT
ATATTTGAAGTTCCTCATCAGGGCTTAACAAGCTTGGAGGTTGTGGTAACAAATCTTTCAGCAAAAGCAGGAAAAGGGGAGGCTGTGGGAATGGTTTCTTTTCCTATGAAAAATGATACGAATTATTGGCCGTCACAAACATCACTTTCAAGATTCATGCAAAATTCTTCTGCTAGAAGTGCCCATACATTTGGCTTACA
GCCATTAAAGAAAAAGTGTCCAAATGATGACGGGAGTGAATGTTCAAATTGTGGATTAATATCCCTCACTACTTTCTACTTCATTGCTGAAGGAGATAAGAGCTTGAAAGGGGACTTTGGGAATACATTTAGCAATGGTGAAATTGGTTTGATGGTTGGGGTTAGCCCAGAAGGTCCTTGGACGAGCATACGTTCTGTCT
TACCTCTATCTACAATACCAAAAGAGCTGAATGGAACTTTTGGTGTTGAAGTTGTAATGCAGAAGGGTCAGAAACATGCAATTTTACGAAGTCTTTTCAGCATCGTGAATAATACAGATATTACTCTTGAAGTCTGTGTATGCCCTCTCTCTCTTTTAAATAGCACCGATGATCAACTAAGTTCTGATACAAATAGGACA
GTTGTGGAAATTGAAGAGATCTTTGAGAACCAGCGCTATAATCCACTTTCAGGATGGGGCAACAAACGTCCTGGTCTTCTCATGTCAACTGATCCAGGCCGTTGGAGTAGAAATGACTACTCCTACTCGTCTAAGGACTTTTTTGACTCTCCGCTGCCCTCAAATTGGGTATGGACATCAGATTGGTTTGTTGACAAATC
TCAGTTTGTTGATAGTGATGGTTGGGCATATGGTTCAGATTTTCAGAGTTTAAAATGGCCCCTTTCTTCTACAAAATCATCCAGGCGATCAGCTTTTGACTTTGTAAGACGACGCCGTTGGGTACGTACTCGGCAGCAATCATCTGAGAGTAAGGAAAGGCATACAAGGGAAGTTGTAGCTGTACTAAAACCAGGGTGCT
CTGTCCCTTTGCCCTGGAGTTGTACTACAAGTGATACTGATTTCTGTGTGCAAGTCCGCCCTTCCCCTCTGTCTGCACAGATGAGATATTTATGGGGACGTGTAATTTCAACCAGACGATCCAGCATCTCTGCTGGAAATGATCAAAATAACCTTGAAAAGGGCCAGTCATCTACAAGAAATTCTATTCGCCAAACAAAG
GGTGGGAAATTAGTTTCACCATTTCTGTTGAATCAGCTAGAGAAAACAGAAGAACTACTTATCTGTGATCTAGTATCTGGCTTGAAGCAGTCTGTCTGGCTCAGCGTGGAAACAGATGCTAATATTTACTCACAATTGACCAATCCAGTTTATGATTGGAAGATTTCAGTTAAGGCTCCTCTCAAGTTAGACAATAAGCT
TCCTTGTAATGCAGAATATATCATTTGGGAGAAAACTAATGAAGGAGGTAAAGCGAAGACGGAACGTGGTGTTGTTTTATCTGGAAGTTGTGCACACATATATTCTGTGGATGTCTGTAAGCCTATTTATCTGACATGGTTAGCACAAGGTGGATGGAAACCAGAAAAGGAAGTTGTCCTTCTTTCTGATCCATCATCAG
ATTCTCTTCCTAGTTTCTTCTGGATGGTTCATCCACAAAGCAGAAGGAGATTGCGAGTCAGCATGGAGCGTGACTTTGGAGAAACAATTGCTACAGCCAAATCAGTTCGGTTGTTTGTACCTTACTGGGTTTGCAATGATGCTGCCTTGCCATTAGCATATCGTTTAGTTGAGATTGAGCCTTCACACAGTTCCGAGACA
GATTCTTTCTTGCTTTCAAGGGCCATTAAAGATGCCAAGCAGGCTTCAAATCATCCCTCAAATAGAATACAGAAGAGTAAAGCAAGTGTACATAAAGTTGTTCAAACTCTTGAAGTACTTGAGGATTTGGGAGGTTTGCCAGTAATGCTCTCACCACAGACAACTTTCTCTCGTACTGGATTTTCACCATTCTCTCGAGA
GGATGAAAGCCTATTATCACCGCGATTGGGTATTTCAGTTGCCATCTTAAGAAGTGACAAGTATTTTACAGGCATTTCCTTCTGCGATTTGGAGAATAAGGAACATATTGATGTGAGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACTAAGGTTGTACATTTTC
AGCCTCACACTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCAATCTACTTTTGGAAGTGAACTTTTAAAGATCTGTGTTGATGGATACAAGTGGAGTCAGCCTTTCAGTGTTAATAGTGAAGGAATA
ATGCACATCAACTTGAAAAGTGAGCTGGATGAAAGCCCATTGTATCTTAGGACTGAAGTACAAACTGCAACCAAAGAATCCCGATTCTTAGTTATTTTTCGGCATGCTTCTTTCTCAAGTCCTTACAGGATTGAAAACCGGACTGCCATTTTCCCTATCCGTGTTCGCCAAGCTGGTGGAGATGATGATTCCTGGAAGTT
TATTCAGACAGGCTCTGCTACATCATTTGCCTGGGAGGACCTTAATAGAGAACAGTTATTAGAAGTTTTGGTGGATGGAGCTGATCCCAAAAAATCTTCTAAATATAATATTGATGAAATAGCTGAGCATCAACCTGTTCCCTCTAAAACTGGGCCTGTGACACCTCTTCGTTTAACAGTTTATAAGGAAGGCAACACCA
ATGTGGTAAAAGTGGCAGACTGGATGCCAAGCAATGAAGAATTGGCAATTGTGCCTGTTGGATTGTTGGAATCCTCTCCATGTGAACATACACTGTCAGCTGCGGGATCTGACAATCAATTTCATGTTATTGTTGAGCTTGCAGAGTTTGGGCTGTCTGTCGTGGATCATACTCCAGAGGAACTACTCTACTTGTCCATT
CAAAATCTCATCATGTCATATGGCACTGGTCTGGGTTCAGGAACTAGCCGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAA
TTACGTGTATTCTTATCTTGGTATACAGGTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCC
GATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGT
CAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTT
TCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGG
AGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAG
GGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCA
CTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGAAGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTG
TGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCT
GTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGGTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATCTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGC
AAACAAATCTGATGGAAAATTTTTACAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGA
AGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAA
TTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATG
AGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAA

Intron 15 GTATATGACA ... TGTTACAAAG

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>TRINITY_DN43957_c0_g4_i4 from sample A6 / Example spliced isoform

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GTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACC
AACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGATGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTG
ATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAG
CCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCAAGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCG
GGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATCGAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATC
GAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGAAAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGA
ATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTGTGAATCTCGACAGGCAGACGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAAC
ACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTGGCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTG
CCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGACCAGAGAACACGTTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTACAG
CCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCACAAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTAT
ATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTTGGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAG
CTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGATACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGC
TTCAATCAAAATGGTAGCTTGTTAATAATGCATTTGTATTAGTCATTTTCTCTTTGACAGGTGCACTGAGTTCTATGGTCCTTTAACATTTTTCCCCTCATTGTTCTAGATGGGATGACATTTCTATTTTATTCATCATGCTTTCAATCGGAATTTGCGATTTTTTCATGGATTTATCCATTGGATGGTTAGCTAAATCT
GTCTAAATGGACTTGGACTGTTTCAAGGCAGAGTTTGCTGTGAGGTTCTCTGATCCTCTATCCGGATGCCTTGGAAAAAAAATTAATAGGATTTTTAAATAATTCCAATTTGGTTTGGAATTTGACAGCTAGAGTAAATTGTACCTTCAAAATATTGTGGTGTAACCACTACCTTCTTTTAACATATTGTAAACTTGTTG
TGGATTCGAGTAGCC

>TRINITY_DN43957_c0_g4_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TAAATATTCATGCCTTTTTCAGGTTCAAATTACGTTTGGATGGGCTTCAAGTTGATAATCAGATACTTTTAACACCAATGCCTGTTCTATTTAGACCACAAATTGCCACTAACCAGCTTGAATTTCTGCTAAAGCTTACACTGACGATGCAAGATCGTGGATCACCGGATAATTACGTGTATTCTTATCTTGGTATACAG
GTTCCAAGCTCTCCAAATGTTGTGCTAATGGTTAAAATTCATGAACCAATTATTTGGCGACTTCATGAGATGTTCCAAAAAATGAACCTTGGCAGACTAACCACAAGTCAGACAACTGATGTTGCAATTGATCCTATTATACGAATCGGgtatatgacaataaagcctttgatacactgttgaactaaagcactacaaca
ttgtacattcttttatagttcagttttttgttctttgctttcttcttcattatttttgttcctcttcatgttatccgatgccattttctttttgttgttacaaagATTTCTGAATATCTCGGAGATCCGATTTAAAGTATCATTGGCTATGTTACCAACACAAAGACCAAGAGGAGTTCTTGGCTTCTGGTCATCTTTGA
TGATTGCATTGGGTAACACTGAGAACATGCCGGTTCGCATTACACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAA
GGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTCGCCAAAGACAGGAGAAAAAAGGCAACATAGAAGACATTGGTGATGTTATTCGGGAAGGTGGAGGGGCTTTTGCAAAAGGACTGTTTCGTGGAGTTACAGGTATTGTAACAAAGCCATTTGAAGGTGCCAGATCATCTGGTGTAGAGGGTTTTGTTCA
AGGTGTTGGAAAAGGGATAATTGGAGTAGCAGCTCAACCAATGAGTGGAGTTCTTGATCTGCTGTCAAAAACAACAGAAGGTGCAAATGCTATGAGGATGAAAATTATTGCAGCAATAACCTCTGAGGAGCAGCTACTACGTCACAGGCTTCCTCGGGCAATTAACGGAGACCATGTTCTCAGACCTTATGATGAATATC
GAGCTGAAGGCCAGGTTCTCCTACAACTTGCTGAGTGTGGTGCCTCATTTGGTCAAATAGACATTTTCAAAGTCCGTGGCAAGTTTGCCTTCTCAGATGTATATGAAGATCATTTTAACTTACCAAAGGGAAGAACTGTTATGATCACCAATCATCGAGTAATGCTGCTACAACATCCAACACAAACGAGTGTCCAGAGA
AAAATAGATCCATTAAGAGAGCCTTGTACAGTATTATGGGATGTAACATGGAATGATCTCTCAAAAGTAGAACCAAGGCGTGGGAAAAAGGACCCTCCAGGTTCCTCACCTTCGCAGTTGGTCGTTCACTTACGTACTTCACCTCAAGACTCTAGAATATTTGAATCCAAGGAAACAACTCATGTGATCAAATGCCATTG
TGAATCTCGACAGGCAGACGAAATATTTTCTGCCATTCAGCAAGCTATGATTACTTATGGGTCCGATCGTTCAGTGGTTCAATATCAGGGACAGGAGAAGAAAATGGTAAGAAAACCATATGCTGGTGTGGGAGCTGGTGCAGGGGCTGGAGCAACACTTGGAATGTTCACTGGATTTACAGCACCAATGGCCATTCCTG
GCATGGCAACCTTTGCTTCTCTTTTAGGTACTACTGCAGGACAATCTATGGTTGACAGAGATACGGACTCACTTTCATACAGTGATTCAAAACGTTTGCAACGTAAAGACACAGAGCATGCATTAGCTGTATCAAGCTCTACATATGGTACCTTTGCCAGTGGAAAGTTTATAAACAAACTAACTCTTGTATGGTCTGAC
CAGAGAACACGTTGGAATAAGAATCATCACGTTTCAGTATGGCGTGCAATGTGTCCAAATGGATACATTTCAGTGGGAGATATTGTTTGCCGCTCTTCTGATCCGCCTACTAGTGTTATGGTGTACGCAAACAAATCTGATGGAAAATTTTTACAGCCTTCAGGGTTTGATTTGGTATGGCGAAGTACAGATAGTGGCAC
AAGGGACCCGTTAACAATCTGGACACCTCGTGCCCCACCAGGTTATGTAGCTATCGGTTGTGTCATTGTTCCAGACTACTATGAGCCTGACCCAGGTGTGGTGTATTGTGTACGGAAAGATTGTGTGAAGAATGTAGATTTTGAAAAGCAGCCTATATTAAGAGATCACAGAGATGCAGACCTTTGGAAATGTAGTCTTT
GGCGAGTCCAAAATGATGCACACACTTTCATTGCTTGCCGGGACCACCAGCCACCTTCACTGAGCATTGCCTTTTCTGTACGGACATAATGTCTGAAACACATTAGTGGAAATTGGAATGTCTTGTAATTTTCTGCTGAATTTTCCATATAGGCAGCTACAGAGGCACCTCTCAAGAAAGGTGCCATTGCTCGGAATGAT
ACTCAAATGCTCAAGTTGGTCAGAGAATCTGTGTCAAATACAATTAATTTATGTAGGCATCTGATTTTTACCCCGAGTTCATCTTGTATCGTAAGTTTCTTGCACGGTGGTGAGGAGAATTTTGTATGAGTTATTATGGAAGCCCAATTGGGCAGCTTCAATCAAAATGGTAGCTTGTTAATAATGCATTTGTATTAGTC
ATTTTCTCTTTGACAGGTGCACTGAGTTCTATGGTCCTTTAACATTTTTCCCCTCATTGTTCTAGATGGGATGACATTTCTATTTTATTCATCATGCTTTCAATCGGAATTTGCGATTTTTTCATGGATTTATCCATTGGATGGTTAGCTAAATCTGTCTAAATGGACTTGGACTGTTTCAAGGCAGAGTTTGCTGTGAG
GTTCTCTGATCCTCTATCCGGATGCCTTGGAAAAAAAATTAATAGGATTTTTAAATAATTCCAATTTGGTTTGGAATTTGACAGCTAGAGTAAATTGTACCTTCAAAATATTGTGGTGTAACCACTACCTTCTTTTAACATATTGTAAACTTGTTGTGGATTCGAGTAGCC

Intron 16 GTCAGTATCA ... TTTCCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
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>TRINITY_DN124908_c0_g1_i8 from sample A2 / Example spliced isoform

GGCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATTTGCTGTAAGTTTTCGTCGTTCTCATTAAATTCGGATCGATATTCTTC
TGATTTCGTTGCAGTGCAGCCGTTGGATGATTGCGGAATTATTTCAGGTTTTTTTTGAGTTATTTCGGCTCATCTTAAGGGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAGAAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAG
TATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAAAGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGA
CCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAGCAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGG
TTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGATGAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCA
GTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTCAGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAA
GCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAAGATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTT
ATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAACAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGG
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GGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGT
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TTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCC
ACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGAT
CGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGA

>TRINITY_DN124908_c0_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TTTTACATTGCGTACAGTGAACgtcagtatcatgttcatcaataaatagatgtactgttttgcggttttggaattgtctatttactccaatatgtttactttcctgcagGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAAGAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCT
TTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTT
GGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATAT
CTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAAT
GGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGAC
AGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGA
GGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCCTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATG
AACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGC
ATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAAAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAA
GGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAG

Intron 17 GTAACTTCTT ... AACGTTGCAG

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AAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAA
AGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAG
CAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGAT
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AGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAA
GATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAA
CAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCC
ATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTG
TAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATT
GGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGT
ATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAA
GAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTGTTCCCTGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCT
GCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAGGATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTG
TTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGCAAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCC
TGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCAATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTT
CTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGATTTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTC
TGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCCAGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATG
ACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACATTTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAAC
AGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTGCCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGAT
GAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTCCATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACA
CAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGGTCTCTTTTGTACTCTTGGATCCCTTAAAAGTACTTTTGAGAATATTCATGGCAGATACTAATGAGCATATATACTGTTACATTGTGCTCTCTCTCTCTAAACAAATCCAAATAAATGCAGACAATAATATTATAATAGTAACTGGTACATAAAAAAGGGATCAGAAATTGCTTTTG
AACGTACCTTGTGAAAGTGATTGTTATGTCTCGCATATTCTTGAAAATATAAATTTAAAATTTGATGTAGTACTAAGTTATTAGGCATGATATTTCTTGGAATGTGTTTAATATTGAAATAAATTGGTCCAAATCATACTATATCTGTCTCAGGCATTTTAATCATCTTTTTCATAACTACAATACATAACTCTGTAATT
ATCTTTAGAGGCTACTAATCCTGAGAACAATCATACATTTATTATAAAAGAAAAGTTGACAGTGC

>TRINITY_DN123972_c0_g2_i7 from sample A3 / Example unspliced isoform:

TGGCGGTGGGAATCCCTCCGTCAAAACTCTAACATCGTTTCTCTCGATTTCCTTCGGGATTTAACGGAGACTCTGACGTACGCAGCACGAACGAAGTAGAAAGCAACATTTATTCGAGCGGAGAGCAACCCTGGGGCATTTTAGGTGCCCTATCTGCTGCAACTGGTTTGCGGATGAAGCATTTTGTGGCATCCGTTGAG
AAGTATTGAGCATTAGACGGCCCTGGCACAATGTTTGAAGCTCATGTTTTGCATTTGCTTCGTAGATATCTGGGAGAGTATGTGCACGGTCTTTCAACTGAGGCTTTGAAGATCAGTGTCTGGAAAGGTGATGTGGTATTAAGAGATTTGCATCTAAAGGCTGAGGCACTGAATGCTTTGAAGTTGCCCATTACAGTGAA
AGCTGGCTTCCTGGGTTCTGTGACACTTAAGGTTCCTTGGAAGAGCCTCGGAAAAGAACCAGTTATTGTTCTCATTGACCGTGTGTTTGTACTTGCAGAACCAGCACAAGATGAATGCTCTTTCACGGATGAAGCAAAGGAAAGGCTTTTTGAAGCAAAACGACGAAAAATTGAGGAAGCAGAGGTGGCAATGCTGGAAG
CAAAAGATAAGAGGAAAACAAAAATGGAAAATTCATCAGAAACAAATTCGTGGATAGGTTCTCTAATTGCGACAGTGGTTGGAAATTTAAAAATTTCTATCAGTAATGTACATATACGCTATGAGGACACAGTGAGCAACTCAGGACATCCATTTTGTTCTGGTATAACTTTGGCAAAGCTTGCTGCTGTGACAACTGAT
GAGCATGGTGTGGAAACTTTTGATACTAGTGGAGCATTAGACAGGCTACGCAAGTCATTGCAGCTTGAGCGTTTTGCAGTTTACCATGATTCTGATAGCGTCCCATGGAAGTTGGATAAGAGATTGGAAGAATTGACTGCTGATGAATGGAGCAAGATTTTTGAAGCTGGCATTCAAGAGTCAGAAAATGAGAGAAATTC
AGTATCAAAATGGGCCCTAGGGCGCCAGTATTTGCTATATCCTATTAATGGAACTCTCAAGTATTATCGTTTTGGAAAGCAAGATAAGCGGGATCCAAGTGTTCCTTCTCAGAAAATGTCCCTCACTCTAAACGATGTGTCAGTGACAGTCTCAGAGGCTCAGTATTGTGATGGAATGAAACTATTGGAAGGAGTTTCAA
GATATCGAACCCGCATTGAGGTCTCCCATTTCCGGCCATTGGTCTCCGTGTCTAAAGACACTCGAGTTTGGTGGCGTTATGCTTGTCAGGCAAGCCTACATCGGCAAAACAAAATGTGGCACCGTCTGTCATGGGAAAATGTTTCTCGTCTGTGTCAACATCGTAGGAAGTATGTTCGGCTTTATGCAGTGTATTTGCAA
CAAATACCCAGACTGGATAACAAAGAAATCAGAGAAATTGAGGAGGAGCTAGATGCAAAGGTTATCCTTCTATGGAGGCTACTTGCTCATGCCAGAGTTGAGAGTGCAAGATCAAAGGAAATGGCCTTAGAGAGGGCACGTGCAAGGAAATCTAGTTGGTGGTCTTTTGGATGGCGGTCAACAGCATCAGACTCAAACCC
ATCTAATGCTTCTGAAGATTCGGAAGGGGTTACTGACATGCCACATCTAGGACAGTTGACAAAAGAGGAGTGGAAGAAGCTTAATGAACTTTTAAGCTACAATTCTGCAAAGAACTTCTTTGTGCTTTCTGATAAGGAGCCTCCAGACATGCTACAGTACTCCTTGGATGCTACTGTTGGGAAAAGTGCAGCTCGAATTG
TAAACAACCAAAATTTGGAAATCATCTGTGGGAAGTTTGAGAGTCTTCATGTTGGTCTTAGAAGTTATCCCAAGAGCACTCATTGTGATACAAAACTGAAGTTATATGGTGTTTCTGCTCCTGAAGGATCCCTTATACAGAGTGTCAGCAGTGAAGAGAAGGAATATGCACTTGCTGCTACATTTGTACACTCTCCTATT
GGAGAAAACTTAGATTGGAAACTCTCTGCAACCGTGTCTCCTTGTCATGTCACGGTTTGGATGACAAGCTTTGAACGTTGTCTACAATTCCTGAGGAGGAGTAGTTCTGTCAGTCCTGAGGTAGCATTGGAAACTGCAGCAGCTTTGCAGATGAAGTTGGAGAAAGTGACTCGACGAGCACAGGAACAATTTCAGCTTGT
ATTAGAAGAACAAAGCAGGTTTTCTCTTGACATTGATTTGGATGCTCCAATACTGAGACTTCCGTTTCAGAGAGCAGAGTGTTCTGGAAGTTGCAGTCAGCTTGTAGTAGATTTTGGTCATTTTACATTGCGTACAGTGAACGAAGATGATGTTCATCCCCAAATACCAAGTCTTTACTCGCGGTTTCACATATCAGGAA
GAGACACCGCTGCCTTTTTCATGGATGGAATCTTTGATTGGACAGAGCTTAAACATGTTTATCTAGACTCTGCACATATAATGAATAACTCTGAAGTACTTCCTAACCCAAAGAATCGATCTAAACTATTCCCCGTCCTTGACAAATGTGGCATGCTAGCTGTTATTGACCAGgtaacttcttgtggatgtgatctcaaa
gcattttgtctgaggtttacctggttcatctctctgatgatgtatctagtttaacgttgcagATTAAACTTCAGCACCCAAAATACCCTGCTACACGAGTTTCGATTCAAGTGCCAAACCTTGGCTTGCACTTTTCACCTTCAAGATATAGTAGGATTATGAATCTCTTAGCAATATTTGATGAGAGAGATGCGAGAAAG
GATGGATTAACTCCTGCAGATCTTGCAGGAGATGCTAGGGTTCTCTTTTGGGGGGGAATTGGTAATTCTATTGCCGAGTGGCAATCTTGTTGGCTAGTCCTTGATGGGTCTTACTTATATATCTTGGAGTCCAAAACATCTAAAACTTATCAGCGGTGCTGCAGCATGAGTGCTAGGCAAGTTATGGAGATCCCCCCAGC
AAGTGTTGGTGGATCAGAATTCACTGTTGCCATAAGCAACAGAGGCTTTGATATACAAAAGGCGTTGGAATCATCTAGCACCGTTATCCTGCAGTTCAAAGATGAAAATGCGAAGGCAGAATGGATGAAGTCTTTTGTTCATGCTACATATAAAGCATCTGCTCCTCTGTCCATGTGCATACCTGGAAATCTTAGTGGCA
ATGAATCTGAAGACGAAAGCTGTCAACCAGTGGTTGTGTCAGAAAAGATAAACTTGTCTGTTGTTGGTACTCTGGTTGAAATGAAACTTCTAATCTATGGGAAGGAAGAAGAGGAAAATGACAGAGTTGGTGAAGAAAGAATGCTTTTGGAACTATTTGCTGGTGGAGGCAAGGTGAACCTTATACAGCAGGAGAATGAT
TTGACTGTGAGGATGAAATTGCATTCCCTAAAGATAGAAGATAAGCTTCAAGGTTGTGTGTCTACAACATGCAAGTATATTGCTCGTTCTGTGCTGGAAAATGATAGTCAATATCTGGTTGAGGAGGTCGACGATAAATGTAGCACAGCATTAGTAGAAAACATTTCAGAGGAGGATGAGTTTTTTAAAGATGCATTGCC
AGATTTTAGTTGCCCTTCTGACTATGCTTCTGTTCCCCAAAGCAACTTAAGCTCTTTCCCCTTAAAAGCAAGGGAAAATTCATCACATGACTTTGGAACCCCTGTTACAAATTCCAAATATGAACTTTTTGATTGGAATTTGGCCCTCGGAGAAGAACAAACTGAAGACGTAGATGTGTCTGATTTTGTGAGTGTTACAT
TTGTTAGAAGGCAGCCCAATTCTCCCCACTATGATGGAACAGACACCCAGATGAGCATTCGCATGACAAAGCTTGATTTCTTCTGCAACAGACTTACTGTTGTTTCTTTGATTGACTTTGGCATGGAACTGAGTGAGTTAATGGAGGTCATAGATGAGAAAGCATCTCCACAGAATGATATGGCAGGTTATGCTGTTTTG
CCAAGTGAAAACAAAGAAGGCACTGATCGTTTATTTGTTAAAGGGCTATTGGGTACTGGAAAATCTAGAGTTGTGTTTCAGCTGAAGATGAATGTAGACAGTGTTTGTATTTTCCTTAACAAGGATGATGGTTCTCAGTTGGCCATGTTGGTACAAGAGAAGTTTCAGATGGATTTGAGAGTTCATCCAAATTCTATTTC
CATTGAGGGGTTGTTAGGGAACCTGAGGATCTGTGACATGTCCCTTGGTCCAGATCACTGGTGGGGATGGCTTTGTGACATACGTGACACAGGTTCTGATTCGCTTGTAAAGTGGAAGTTTCAGTCTTTCAGTAGAGATGATGATGACTTTGAAGGCCATGATTACAGTCTCATTGCAAGACTTTCAGCTGTACGGATTG
TTTTTCTGTACAGGTTCATTCAGGAGGTAACTGCCTATTTCATAGGCTTGGCAACACCCCAAGCTCAACATGCAATCCAAGTTGTTGATAAAGTTGGAGGAATGGAGTGGCTTATTCAACAATCAGAAATTGATGGATCACCTTCATTGAAACTGGATGTTTCCCTGGACACTCCTATTATTATTATGCCACAGAATTCT
ATGAGCAAAAATTTCATGCAGCTGGACCTGGGTCGTCTTCAAATGTCTAACAATTTTGAGTGGCATGGTTGTAAGGAAAATGATCCATCTGCCGTACATCTTGATGTCCTTCATGCAGAGATAATGGGCATGAATATGGTTGTTGGGATTGATGGGCGACTGGGAAAACCAATGATACAAGAAGCTTGTGGATTGCATAT
TAAAGTGTGTCGTTCGCTACGGGATGTTTTCAAAAAGGTTCCCGAGGTGGCAGTTGACATACAGATCGACTTATTGCATGGAGTAATGTCTGACAAGGAATACATGGTTATCATAGATTGTGCTTCTTCAAATATATCTGAAGAGGCAGACCTTCCTCCAAATGTTAGAGATATTCCAGAAAGGCAATTGGATTGTCTAC
AAGTTGAAAATGAACAGGGAATATCCAATCAAAATATTCTCTCTCACGAGGATCAGATGAGCAGCCAAGATGGTTCATCCTATACACTAACACTAGTGACAGTTGAAATTCAATTTGCTTCATTAAAGTTATATAATGGAATTGATCGAGAGTCTCCTCTTGCTAGAATGGATCTACAAGGGCTTTGGATTGCGTATAGA
AGGTCCTCAATCTCAGAACTAGATCTCTATGTCACATTATCGAAATTGTCAGTTCTGGATCTGCGACCAAGTACGAAGCCTGAGATGCGCCGAATGCTTGGATCTATGACAGATGTTGATGGTGATGCACTTCATAATGAGTCAGGGGGACCAACAAAGTCAGACATTCCTAAACTAACCATGTTAGTGATGGATTGGAG
AGTCAAGACAGATTCCCAAGCATTTGTGGTTCGGATGCAGCAACCACGGCTGCTTGTTGTTCTGGACTTTTTGCTTGCTGTAGGTGAATATTTTGTGCCTGCACTGGGTGTAATTACTGGGCGAGAGGAAGCAATGGACATGCAAAATGATCCAGTAACCATGCATGGTCATGTTCGCCTAAATGCATCTCTCTATGAGC
AGAAAGAAGACATCGTATTTTTATCTCCACATCGACAACTAATTGTAGATGCCTATGATGTAGATGAGTTTACATATGATGGATGTGGGAATACAATCTGTTTGATTGGAAAGGATAACTTGTCTTCGCCTAGCTTGCAGCCCCTTGTCATAATTGGATATGGGAAAAAGCTTCGTTTCAAGAATATAAGAATTAAGAAT
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TGAAGTACAGGCTGTGGCTCCAGAACTTACATTCTATGACAGCACAAAATGGTCTTCAGAGAATATCTTGAACGGGGAAAAGTTGCTTCGGGCAAAACTGGACATCAATTTAATGTACGCTGCAAAAGAAAATGATAGATGGATCCGTGCATTTGTTAAAGGCCTTACAGTTGAAAGCGGTTCTGGTCTTGTTGTACTCG
ATCCAGTGGATATATCAGGCGAATACACCTGTGTTCAGGATAAGACTAGTTTTTCAGTTATGACAACTGATATTTATGTTCATCTTTCTCTGAGTGTTTTGCGCCTATTACTTCGGTTGCAAGATGAAACAGTTGCAGCATTGCAATTTGGAAGTGCAAATGCCTTATCCCGTTGCACCCATTTTGATAGAATTTGGATT
GATAAAAGAGGAAATGGTTCTAATAAGCATATAGCTATTTGGAGACCTCGTCCTCCTTCAAATTATGTTATTCTTGGTGACTGTGTTACATTGGGATCTGTGCCTCCATCCCAAGCTGTGATGGCGGTCAGCAATACTTATGGCCGTGTGAAAAAACCTCTTGGCTTTCAGCTAGTTTGGTCATTCTCTAGTTTAAATCA
TCTGGGAGCAGAATCCCAAAATCCTGATGGTGATGTAGAGTGTTCAGTGTGGATGCCTATAGCGCCTATGGGATATACTGTTCTTGGTTGTGTTGCACAAATTGGCAAAGCTCGTCCATCCACTAGTATTGTTAATTGTATTCGATCTGATCTTCTAACTTCTGCTATGTTCTCTGATTGTATATACTACATTCCTCCTA
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TTGCATGAAAACTTTAGTGGTGAAATGAAGATCGGCTGTTTATCAGTAACACTTTTGGATAATCTGCGTGGAATGGTGACACCTCTAGTGGACAATACACTAACAAATATAAATCTCGCTGCACATGGTCGACCAGAGGCATTGAATGTGGTAGTTGTCTCATCAGTAGCTGCTTCCACTTTCAATCCGGAGTTGGAAGC
ATGGGAGCCTCTAATTGAACCTTTTGACGGAATTTTCAAGTATGAAGCATATGATGCAAATTCTGATTTGCCATTGAGAGTTGGGAAACGCATTCGAATTACAGCAACAAATGTTGTAAATTTGAATATCACATCAGCAAATGTAGAAACACTTATAGGATCAATACTTGCTTGGAGAAAACAAGTAGATCATGAACAGC
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AGGGCATTCAATTCAAACAGAGAATATTACAAACTCTCAGCTTTCCTAGACTTGGCATCTGAGAGAACTAAGGTTGTACATTTTCAGCCTCACACTTTATTTGTTAACAGGGTTGGACGCCGGCTATTATTGCAGCAACATGGCAGTGCACAACTAGAATGGATTTATCCGACAGATCCTCCAAAAGTTCTCTTATGGCA
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ACCTCGCATACATGAGGATATTTGCATGCGCCAGAGCGCATTAATTGCTGCAGCAATTTCAAATATCCGTAAAGATCTTCTTAGTCAGCCACTGCAATTGCTATATGGTGTTGATATTCTTGGAAATGCAAGCAGTGCGCTTGGACACATGAGCAAAGGTGTTGCAGCACTGTCAATGGATAAGAAATTTATACAAAGTC
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