sp|O65902|ACAP1_ARATH ----> Cyclase-associated protein 1


Intron 1 GTAAGTCCTG ... GTATGGACAG

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>TRINITY_DN44525_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoform
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CACAGCGGTTGGATGTCCGGATTTGGTAGAAGAGTTGAAGACATGGAGGAATTGGTAGCCAGATTGGAGGCAGCAGTTTCGAAACTTGAATTTATTGGGTCTAAAGACGGGGTAGCCCCGTCTCTCTCTGCATCATCATCTGCTAGAGAAATTCAAGCACCACCCACATCATCTGTTGCCGATCCAAGCATTAATGAATA
CGATGAGTTGGTGCAGAAATCACTCGGAAGAGTCTTGGGTGCAGCAGAAAAGATTGGTGGGCAGATTTTGGAAGGCACCCATCTTCTCAAGGATGCATTTGCTGCTCAGAGGGACCTTCTCCTCAACTTCAAGAAATGCAAGCAACCCGATCTTCAAGGTTTGACAAAAATGATTCAGCCACTAAATGAAAGGATTATAA
AGGCAAATGCGTTAACAGAAGGAAGGCGAACTGGATCTTTCAACCACTTAAAGACTGTTGCAGAGAGCATGACAGCACTAGCATGGGTTACCTATACTGGTAAAGACTGCGGAATGAGTCTTCCTGCTGCTCATGTGGAAGAGAGCTGGCAAACTGCAGAGTTCTATAACAATAAGGTTCTCGTGGAATACAGAAATAAA
GACAGCAACCATGTTGAGTGGGCAAAGGCTATGAAGGAACTTTATGTGCCAGGACTGAGGGACTTTGTTAGGAAATTCTATCCTCAAGGACCTGTTTGGAATACTGCGGGGGCTGGTTCAAGCATTCCCGTTTCAGCAACGGCTGTCAAATCTGGACCTCGTCCTCCACCTCCTCCACCACCACCACTGCCAACTTTTGA
GCCCACAGAAGCAGTAGAAAGCTCAAAAGAAGGAATGGGTGCTGTATTTCAAGAGATCAGCAGAGGAGAATCTGTAACTGCAGGTTTGAAAAAGGTCACAGCTGAAATGAAGACAAAAAATCGCCCTGATAGATCAGGAGCTGTTCCTGTGGCAGCTGGAAAGGATAAGAATGCTACTAGTGGCCATTCATTTTCTAAAA
CAGGGCCTCCCAAGCTGGAGCTACAAATGGGTCGCAAATGGGTTGTTGAGAATCAAATTGGTAAGAAGAACCTGGTCATAGAAGATTGTGATTCAAAACAGTCAGTGTACATTTTTGGCTGCCAAGATTCTGTTTTGCTAGTTAAAGGCAAAGTTAACAATATTACTGTTGACAAATGCACGAAGACAGGAGTTGTCTTT
ACAGATGTTGTGTCAGCTTGTGAGATAGTGAACTGTAATCGCATTGAGGTGCAATGTCAGGGTACAGCTCCAACTTTTGCTATTGACAACACATCTGGATGCCAACTATATCTAAGCAAAGGCTCTTTAGATGCATCTATTACAACAGCTAAGTCAAGTGAAGTTAATGTGTTGGTACCTGGTGCAAGTGATGATGCGGA
TTTGATTGAACATTCCTTGCCTGAGCAGTTCAGTCATACATTCAAGGATGGAGGCTTTGTTACTTCTGCTGTATCCCACTCTGGTGGTTGATTTTGTATGGTGCAGTCAAGTCATATTGGTTTATCTAGTGATTTAAAATCCATTTAACATGTTGCGGCGTTTGAGTTTGCTATGTGCTTGTTGGGAGCTTGCCGTTAAT
ACCCACAGGGATGGTTTGCATTGAAATGAAATAGCGATTTTTTATTTGTCCGTGACTTGCGGAACTAGCCTGTGGTCTATAAGAAACCATGACCGAGGGGCATCTAAGCTTTCAAAATCACCTGGGGATCACACCCGGCCTGGGCCACACCAACCCTTAGCATGGCTGGATTTTAAGTCTCCTCTCGGCTACCTTAAGAG
GTTCGAACTCAGGTTGCCAACCCTTAGCATGCAAAACGAAGCCCGTCGAAACCAACCATGCTAGAGGGATTTTATGATAATGGACACTTCTTACTAGCATGGTTTTTCGACTATGTTGTTGCTGAATACTAAGCTTGATATTTTTAGTTTTAAGTTGTGATTGATTTATCTTTGGTCAATGCCTTCTTATGGGTTGGGTT
TGAACTTTTGCGTTCTAATTTTGGGGGTCTAGATTATATCTGTTGCTGCTTATTTACAATGTGTCCAACAATGTTTAAATGTACAAAGATGATATCTTTAAAATATACCATAGCAAGGCATAAATGAAGGGCTTGCAACTCAATTAGCAGGTTACCAAGATGAAAATACATGAAAGAAAAGCAAAGTTGTATCATCTACA
TGATAGGTTTTCTTACAATTTGCATGCATACTATCTTGATTCTTCTATATCAGTACAATGCCAAAAG


>TRINITY_DN44525_c0_g1_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:
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CACAGCGGTTGGATGTCCGGATTTGGTAGAAGAGTTGAAGACATGGAGGAATTGGTAGCCAGATTGGAGGCAGCAGTTTCGAAACTTGAATTTATTGGGTCTAAAGACGGGGTAGCCCCGTCTCTCTCTGCATCATCATCTGCTAGAGAAATTCAAGCACCACCCACATCATCTGTTGCCGATCCAAGCATTAATGAATA
CGATGAGTTGGTGCAGAAATCACTCGGAAGAGTCTTGGGTGCAGCAGAAAAGATTGGTGGGCAGATTTTGGAAGGCACCCATCTTCTCAAGGATGCATTTGCTGCTCAGAGGGACCTTCTCCTCAACTTCAAGAAATGCAAGCAACCCGATCTTCAAGGTTTGACAAAAATGATTCAGCCACTAAATGAAAGGATTATAA
AGGCAAATGCGTTAACAGAAGGAAGGCGAACTGGATCTTTCAACCACTTAAAGACTGTTGCAGAGAGCATGACAGCACTAGCATGGGTTACCTATACTGGTAAAGACTGCGGAATGAGTCTTCCTGCTGCTCATGTGGAAGAGAGCTGGCAAACTGCAGAGTTCTATAACAATAAGGTTCTCGTGGAATACAGAAATAAA
GACAGCAACCATGTTGAGTGGGCAAAGGCTATGAAGGAACTTTATGTGCCAGGACTGAGGGACTTTGTTAGGAAATTCTATCCTCAAGGACCTGTTTGGAATACTGCGGGGGCTGGTTCAAGCATTCCCGTTTCAGCAACGGCTGTCAAATCTGGACCTCGTCCTCCACCTCCTCCACCACCACCACTGCCAACTTTTGA
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CAGGGCCTCCCAAGCTGGAGCTACAAATGGGTCGCAAATGGGTTGTTGAGAATCAAATTGGTAAGAAGAACCTGGTCATAGAAGATTGTGATTCAAAACAGTCAGTGTACATTTTTGGCTGCCAAGATTCTGTTTTGCTAGTTAAAGGCAAAGTTAACAATATTACTGTTGACAAATGCACGAAGACAGGAGTTGTCTTT
ACAGATGTTGTGTCAGCTTGTGAGATAGTGAACTGTAATCGCATTGAGGTGCAATGTCAGgtaagtcctgttatgttttatgtgtatttgccaaacaagtttaaccatgtactatatcattctcactctacccgataacctattgcaatgaatgggtgtttaaaacaagtaaacttaggaaagccacttgaatgttaaaa
aaataaattaaaggtactaaaagttgtgtaagccttcattgcaagcgatttttcttcttaaaagtaactgtggaacatattatcccattacttttaagttttttaccatgtagactttatatagcaatatggaaactaaacaaagaattttcttgaatctcataattgattatcttcttgtgcatgttgccatttaatat
ttaatttttcatttgctatagctagtttgtttaatgaactattagagattgtgttcttatattcaattttatgtaatgtacactgtatggacagGGTACAGCTCCAACTTTTGCTATTGACAACACATCTGGATGCCAACTATATCTAAGCAAAGGCTCTTTAGATGCATCTATTACAACAGCTAAGTCAAGTGAAGTTA
ATGTGTTGGTACCTGGTGCAAGTGATGATGCGGATTTGATTGAACATTCCTTGCCTGAGCAGTTCAGTCATACATTCAAGGATGGAGGCTTTGTTACTTCTGCTGTATCCCACTCTGGTGGTTGATTTTGTATGGTGCAGTCAAGTCATATTGGTTTATCTAGTGATTTAAAATCCATTTAACATGTTGCGGCGTTTGAG
TTTGCTATGTGCTTGTTGGGAGCTTGCCGTTAATACCCACAGGGATGGTTTGCATTGAAATGAAATAGCGATTTTTTAGTGAGTACTTCCTGTATGAGTGTATTTTGACATTATTTTGTAATGTGGGGGTATTTTGTAATGGCTGAGTCAATCTGGTTCATATTAATAATAAAAGTTGTTTTACAACTACTATTGTATGT
GTTGTATGTGTTGCTATTGTTTTGTGCTTTAATATTTTTGAAAAACGAAGCAAATTTGCGGTTGATCCC



Intron 2 GTAAGTTTGA ... TTTGTTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A622.1281023
A718.3183041
A823.08100030
A920136034
A1020.83171045



>TRINITY_DN108547_c0_g1_i4 from sample A1 / Example spliced isoform
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CACAGCGGTTGGATGTCCGGATTTGGTAGAAGAGTTGAAGACATGGAGGAATTGGTAGCCAGATTGGAGGCAGCAGTTTCGAAACTTGAATTTATTGGGTCTAAAGACGGGGTAGCCCCGTCTCTCTCTGCATCATCATCTGCTAGAGAAATTCAAGCACCACCCACATCATCTGTTGCCGATCCAAGCATTAATGAATA
CGATGAGTTGGTGCAGAAATCACTCGGAAGAGTCTTGGGTGCAGCAGAAAAGATTGGTGGGCAGATTTTGGAAGGCACCCATCTTCTCAAGGATGCATTTGCTGCTCAGAGGGACCTTCTCCTCAACTTCAAGAAATGCAAGCAACCCGATCTTCAAGGTTTGACAAAAATGATTCAGCCACTAAATGAAAGGATTATAA
AGGCAAATGCGTTAACAGAAGGAAGGCGAACTGGATCTTTCAACCACTTAAAGACTGTTGCAGAGAGCATGACAGCACTAGCATGGGTTACCTATACTGGTAAAGACTGCGGAATGAGTCTTCCTGCTGCTCATGTGGAAGAGAGCTGGCAAACTGCAGAGTTCTATAACAATAAGGTTCTCGTGGAATACAGAAATAAA
GACAGCAACCATGTTGAGTGGGCAAAGGCTATGAAGGAACTTTATGTGCCAGGACTGAGGGACTTTGTTAGGAAATTCTATCCTCAAGGACCTGTTTGGAATACTGCGGGGGCTGGTTCAAGCATTCCCGTTTCAGCAACGGCTGTCAAATCTGGACCTCGTCCTCCACCTCCTCCACCACCACCACTGCCAACTTTTGA
GCCCACAGAAGCAGTAGAAAGCTCAAAAGAAGGAATGGGTGCTGTATTTCAAGAGATCAGCAGAGGAGAATCTGTAACTGCAGGTTTGAAAAAGGTCACAGCTGAAATGAAGACAAAAAATCGCCCTGATAGATCAGGAGCTGTTCCTGTGGCAGCTGGAAAGGATAAGAATGCTACTAGTGGCCATTCATTTTCTAAAA
CAGGGCCTCCCAAGCTGGAGCTACAAATGGGTCGCAAATGGGTTGTTGAGAATCAAATTGGTAAGAAGAACCTGGTCATAGAAGATTGTGATTCAAAACAGTCAGTGTACATTTTTGGCTGCCAAGATTCTGTTTTGCTAGTTAAAGGCAAAGTTAACAATATTACTGTTGACAAATGCACGAAGACAGGAGTTGTCTTT
ACAGATGTTGTGTCAGCTTGTGAGATAGTGAACTGTAATCGCATTGAGGTGCAATGTCAGGGTACAGCTCCAACTGTTGCTATTGACAACACATCTGGATGCCAACTATATCTAAGCAAAGGCTCTTTAGATGCATCTATTACAACAGCTAAGTCAAGTGAAGTTAATGTGTTGGTACCTGGTGCAAGTGATGATGCGGA
TTTGATTGAACATTCCTTGCCTGAGCAGTTCAGTCATACATTCAAGGATGGAGGCTTTGTTACTTCTGCTGTATCCCACTCTGGTGGTTGATTTTGTATGGTGCAGTCAAGTCATATTGGTTTATCTAGTGATTTAAAATCCATTTAACATGTTGCGGCGTTTGAGTTTGCTATGTGCTTGTTGGGAGCTTGCCGTTAAT
ACCCACAGGGATGGTTTGCATTGAAATGAAATAGCGATTTTTTAGTGAGTACTTCCTGTATGAGTGTATTTTGACATTATTTTGTAATGTGGGGGTATTTTGTAATGGCTGAGTCAATCTGGTTCATATTAATAATAAAAGTTGTTTTACAACTACTATTGTATGTGTTGTATGTGTTGCTATTGTTTTGTGCTTTAATA
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>TRINITY_DN108547_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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CAATAAGGTTCTCGTGGAATACAGAAATAAAGACAGCAACCATGTTGAGTGGGCAAAGGCTATGAAGGAACTTTATGTGCCAGGACTGAGGGACTTTGTTAGGAAATTCTATCCTCAAGGACCTGTTTGGAATACTGCGGGGGCTGGTTCAAGCATTCCCGTTTCAGCAACGGCTGTCAAATCTGGACCTCGTCCTCCAC
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GCTATGTGCTTGTTGGGAGCTTGCCGTTAATACCCACAGGGATGGTTTGCATTGAAATGAAATAGCGATTTTTTAGTGAGTACTTCCTGTATGAGTGTATTTTGACATTATTTTGTAATGTGGGGGTATTTTGTAATGGCTGAGTCAATCTGGTTCATATTAATAATAAAAGTTGTTTTACAACTACTATTGTATGTGTT
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GGCGCTTCTTTTTTTTTGTTTGCTG