sp|Q9M0Y8|NSF_ARATH ----> Vesicle-fusing ATPase

Intron 1 GTAAAAAGGT ... GCATATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	15.79	64	12	0
A2	22.06	53	15	0
A3	22.03	46	13	1
A4	20.24	67	17	2
A5	26.47	25	9	2
A6	22.58	24	7	0
A7	20.22	71	18	0
A8	4	24	1	0
A9	22.89	64	19	0
A10	17.39	57	12	0

>TRINITY_DN119299_c0_g1_i13 from sample A3 / Example spliced isoform

CGCGCGGATAAATTAGAGAAACAGGTCAACGATTTTCGTCGTTTGTGGATTACTCGGATCAATGCAGCAGCCCGTGCCAATGGAGTCTCTTATAACATATTAATCCAATATTTGTACAAGACATATTAATCCAATTTTTGTACAAGAGGCAGTTGCTTCCAAACCTCAGATCTTTTATACCTCAAGAGTTGGACCTTACA
GGATTCGATCTCCATGCGAGGAGCGTTGACCATGGGAAACGGCGGTACAATGATCGTCACCAACACTCCAGGAGCGGATTTAGCACTGACAAACTGTGCATATTGTTCTTCTTCTGATCTGCGTAGGTTCATTGTTCCGGGACTCGGCCAGGCCTTGGCATCCATTGGATCTTCTATGGTTCTCACCTTGCGCCCGCATG
AAGGCATACAGGATGGTTTTATTGCTCTGAATGCTATTCAGCGGCGCCATGCTAAGATTTCTACTGGGGATACCGTTTCAGTCACTAGGTTTGTTCCACTAGAATCGAAATTCAAGCTGGTCTTGTTAACGCTTGAACTGGAGTTTGTCAAAGCTAAGGGCAAAACCGAACAGCTTGATGCCGTAGTTCTCGCTAAGCAG
CTTCAAAAAAGATTCTTGGATCAGGTATGTTTCTTGTGGATCCAGTGAGATTCTATGATTTGAGTTTTATTTGGATTGCGTTGTAGGTTGTGGATTGGTCTTTGTTATAACAAAGATTCATGACTATGTTGAGATTTGAAATACTAATCTTGTTGTCCAATCTGAGTGGAAGTCATCTAATGCTTTAGTAGGGTAAATGC
AATATAGTTGAGATCTTTGATTTAACCAGTAGTATTACTTATATTGGCTCTGGCTTTAGTGTTGGGC

>TRINITY_DN119299_c0_g1_i17 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CGCGCGGATAAATTAGAGAAACAGGTCAACGATTTTCGTCGTTTGTGGATTACTCGGATCAATGCAGCAGCCCGTGCCAATGGAGTCTCTTATAACATATTAATCCAATATTTGTACAAGACATATTAATCCAATTTTTGTACAAGAGGCAGTTGCTTCCAAACCTCAGATCTTTTATACCTCAAGAGTTGGACCTTACA
GGATTCGATCTCCATGCGAGGAGCGTTGACCATGGGAAACGGCGGTACAATGATCGTCACCAACACTCCAGGAGCGGATTTAGCACTGACAAACTGTGCATATTGTTCTTCTTCTGATCTGCGTAGGTTCATTGTTCCGGGACTCGGCCAGGCCTTGGCATCCATTGGATCTTCTATGGTTCTCACCTTGCGCCCGCATG
AAGGCATACAGGATGGTTTTATTGCTCTGAATGCTATTCAGCGGCGCCATGCTAAGATTTCTACTGGGGATACCGTTTCAGTCACTAGGTTTGTTCCACTAGAATCGAAATTCAAGCTGGTCTTGTTAACGCTTGAACTGGAGTTTGTCAAAGCTAAGGGCAAAACCGAACAGgtaaaaaggttcctttttatgctagaa
ggctttgatgcacttattctagttcaaaatgatgtgatatccattggcatatgcagCTTGATGCCGTAGTTGTCGCTAAGCAGCTTCAAAAAAGATTCTTGGATCAGGTATGTTTCTTGTGGATCCAGTGAGATTCTATGATTTGAGTTTTATTTGGATTGCGTTGTAGGTTGTGGATTGGTCTTTGTTATAACAAAGAT
TCATGACTATGTTGAGATTTGAAATACTAATCTTGTTGTCCAATCTGAGTGGAAGTCATCTAATGCTTTAGTAGGGTAAATGCAATATAGTTGAGATCTTTGATTTAACCAGTAGTATTACTTATATTGGCTCTGGCTTTAGTGTTGGGC

Intron 2 GTATTTGTTG ... ATTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.38	127	23	42
A2	24.64	78	19	32
A3	20.51	93	11	37
A4	21.02	62	10	23
A5	20.37	43	12	10
A6	18.21	447	62	137
A7	20.81	447	73	162
A8	20.56	543	88	193
A9	20.22	426	57	159
A10	18.98	301	45	96

>TRINITY_DN119299_c0_g1_i9 from sample A3 / Example spliced isoform

CGCGCGGATAAATTAGAGAAACAGGTCAACGATTTTCGTCGTTTGTGGATTACTCGGATCAATGCAGCAGCCCGTGCCAATGGAGTCTCTTATAACATATTAATCCAATATTTGTACAAGAGGCAGTTGCTTCCAAACCTCAGATCTTTTATACCTCAAGAGTTGGACCTTACAGGATTCGATCTCCATGGGAGGAGCGT
CGACCATGGGAAACGGCGGGACAATGATCGTCACCAACACTCCAGGAGCGGATTTAGCACTGACAAACTGTGCATATTGTTCTTCTTCTGATCTGCGTAGGTTCATTGTTCCGGCACCCGGCCAGGCCTTGGCATCCATTGGATCTATGGTTCTCACCTTGCGCCCGCATGAAGGCATACAGGATGGTTTTATTGCTCTG
AATGCTATTCAGCGGCGCCATGCTAAGATTTCTACTGGGGATACCGTTTCAGTCACTAGGTTTGTTCCACCAGATGGGAAATTCAAGCTGGTCTTGTTAACGCTTGAACTGGAGTTTGTCAAAGCTAAGGGCAAAACTGAACAGCTTGATGCCGTAGTTCTCGCTAAGCAGCTTCAAAAAAGATTCTTGGATCAGGTTTT
CACTATGGGGCAGAGAGTTACATTTGAATACTGTGGAACAAATTACATCTTCACTGTGAATCAGACTATTGTGGAAGGACAGGAAGATAACAAAAATATAGTTAGAGGAATGCTATCAAAAGAAACATATTTTATCTTTGAAGCATTGCCAAATTCTGGCATAAAGATAACGAATCAACGTGAAGCGGCAAGCAGCAACA
TATTTAAGCAGAAGGATTTTGACCTGCAAAAATTGGGCATCGGTGGCCTCGGTGAACAATTCCAGGACATATTTCGCAGAGCATTTGCATCTAGGGTTTTCCCTCCACATGTCACAAACAAGTTGGGTATCAAACATGTTAAAGGAATGCTGCTTCATGGACCTCCCGGAACAGGGAAGACGCTTATTGCCCGTCAAATT
GGAAAGATGCTCAATGGCAAAGAACCAAAGATTGTTAATGGACCTGAAGTCTTAAGCAAGTATGTGGGGGAAACCGAAAAAAATGTTCGGGATCTGTTTGCTGATGCTGAGAATGATCAGAGGACTCTTGGTGACCAAAGTGAATTGCATGTTATTATTTTCGATGAAATTGATGCTATTTGCAAGACTAGAGGATCGAC
AAGGGATGGAACTGGAGTACACGATGGAATTGTAAATCAACTCCTAACAAAGATAGATGGTGTCGAGTCTTTAAACAACGTCTTACTGATAGGAATGACAAACAGGAAGGACCTTATTGATGAGGCTCTCCTCAGGCCAGGGCGTCTGGAAATTCAAATAGAGATTGGCCTTCCTGATGAAAGTGGGCGTCTACAGATTT
TGCAGATACACACTACCAAAATGAAAGAAAACTCTTTTCTTGCTGCTGACGTGAACCTTGAAGAGCTTGCTGCACGGACAAAAAATTTCAGTGGAGCTGAAATTGAAGGTGTAGTGAAAAGTGCAGTGTCTTTTGCCTTGAACAGGCAAATCAGCCTTGATGATCTTAGTAAACCTTTAGATGAAGAGAATATAAAGGTA
ACCATGGGTGATTTCTTAAATGCACTTCAAGAAGTAAAAGCTGCATTTGGAGCAGCTACGGACAATCTCGAGAGATGCAGATTGAATGGTATGGTCGATTGTGGCGAGAGACACAAACACATATATGAGAGAGTAATGTTATTAGTAGAGCAAGTGAAATGGAGCAAAGGAAGTCCCCTAATGACTTGTCTTCTTGAAGG
GCCTACAGGCAGTGGGAAAACATCCATGGCAGCAACAATTGGCATTGACAGCAACTTTCCATTTGTTAAAGTTGTATCTGCAGAGTCAATGATTGGATTGAGTGAGAGCAGCAAATGTGCAGTTATAGTCAAGGTTTTTGAGGATGCATACAAGTCTCCATTGAGTATTATCATCCTTGATGATATTGAACGATTACTGG
AGTTTGTGGTGATAGGGCCCCGGTTTTCAAACTTGATCTCACAGACATTGTTGGTGCTTCTTAAGAAAATCCCCCCCAAGGGAAGGAACCTGTTGGTTATTGGGACTACAAGTGAAGCGCATGTCCTTGATTCTCTGGGTATTCGCAAAGCTTTTGGTATCACATTTCATGTGCCAACATTGAGGCGTGCAGACACAAAG
AAGGTTCTTGAGAAGCTATCTATGTTTGCAGAACATGATCTTGATGCAGCAGTGGAAGCTGTTGATGAGATACCAATCAAGAAGTTGTTTATGTTAGTGGAGATGGTGGCACAAGGCGAGAAAGGAAACAGTGCGGAAGCTATCTACTCTGGAAAGGAGAAAATAAACATTAATCATTTCTTTGATTGCCTTCATTATCT
TACTGGGAATGATGACGACTTAGATTAGTTCAAGCTATATCCTTGATTTTCTATAGTTCTTCCTTTGCCAAAAATAGCATGTGAGGAGTTGAAAGACATTGGTTGGTTTCAATAACCAATGTTTTGTAGAATCCAGCTCAACTTTCTTAAGGCAATTCTTATTGCCTATTTCTATGATTTGCGGGAAGCTGTGTTGTTTG
GTTATATGAATTGCTGTCTTTTTGACATGAAAGTTCCTGCTGTCAGTTTTGACAGATTGTGACATGCTTGGTCTGTTTCCAAAATGTTATCCATTTTATTGATTTTCAGAAACAGTTTTGCTATTAAGGAAGTCATTTTGTTAATAGAATCAGAATAAGAGC

>TRINITY_DN119299_c0_g1_i8 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CGCGCGGATAAATTAGAGAAACAGGTCAACGATTTTCGTCGTTTGTGGATTACTCGGATCAATGCAGCAGCCCGTGCCAATGGAGTCTCTTATAACATATTAATCCAATATTTGTACAAGAGGCAGTTGCTTCCAAACCTCAGATCTTTTATACCTCAAGAGTTGGACCTTACAGGATTCGATCTCCATGGGAGGAGCGT
CGACCATGGGAAACGGCGGGACAATGATCGTCACCAACACTCCAGGAGCGGATTTAGCACTGACAAACTGTGCATATTGTTCTTCTTCTGATCTGCGTAGGTTCATTGTTCCGGCACCCGGCCAGGCCTTGGCATCCATTGGATCTATGGTTCTCACCTTGCGCCCGCATGAAGGCATACAGGATGGTTTTATTGCTCTG
AATGCTATTCAGCGGCGCCATGCTAAGATTTCTACTGGGGATACCGTTTCAGTCACTAGGTTTGTTCCACCAGATGGGAAATTCAAGCTGGTCTTGTTAACGCTTGAACTGGAGTTTGTCAAAGCTAAGGGCAAAACTGAACAGCTTGATGCCGTAGTTCTCGCTAAGCAGCTTCAAAAAAGATTCTTGGATCAGGTTTT
CACTATGGGGCAGAGAGTTACATTTGAATACTGTGGAACAAATTACATCTTCACTGTGAATCAGACTATTGTGGAAGGACAGGAAGATAACAAAAATATAGTTAGAGGAATGCTATCAAAAGAAACATATTTTATCTTTGAAGCATTGCCAAATTCTGGCATAAAGATAACGAATCAACGTGAAGCGGCAAGCAGCAACA
TATTTAAGCAGAAGGATTTTGACCTGCAAAAATTGGGCATCGGTGGCCTCGGTGAACAATTCCAGGACATATTTCGCAGAGCATTTGCATCTAGGGTTTTCCCTCCACATGTCACAAACAAGTTGGGTATCAAACATGTTAAAGGAATGCTGCTTCATGGACCTCCCGGAACAGGGAAGACGCTTATTGCCCGTCAAATT
GGAAAGATGCTCAATGGCAAAGAACCAAAGATTGTTAATGGACCTGAAGTCTTAAGCAAGTATGTGGGGGAAACCGAAAAAAATGTTCGGGATCTGTTTGCTGATGCTGAGAATGATCAGAGGACTCTTGGTGACCAAAGTGAATTGCATGTTATTATTTTCGATGAAATTGATGCTATTTGCAAGACTAGAGGATCGAC
AAGGGATGGAACTGGAGTACACGATGGAATTGTAAATCAACTCCTAACAAAGATAGATGGTGTCGAGTCTTTAAACAACGTCTTACTGATAGGAATGACAAACAGGAAGGACCTTATTGATGAGGCTCTCCTCAGGCCAGGGCGTCTGGAAATTCAAATAGAGATTGGCCTTCCTGATGAAAGTGGGCGTCTACAGATTT
TGCAGATACACACTACCAAAATGAAAGAAAACTCTTTTCTTGCTGCTGACGTGAACCTTGAAGAGCTTGCTGCACGGACAAAAAATTTCAGTGGAGCTGAAATTGAAGGTGTAGTGAAAAGTGCAGTGTCTTTTGCCTTGAACAGGCAAATCAGCCTTGATGATCTTAGTAAACCTTTAGATGAAGAGAATATAAAGGTA
ACCATGGGTGATTTCTTAAATGCACTTCAAGAAGTAAAAGCTGCATTTGGAGCAGCTACGGACAATCTCGAGAGATGCAGATTGAATGGTATGGTCGATTGTGGCGAGAGACACAAACACATATATGAGAGAGTAATGTTATTAGTAGAGCAAGTGAAATGGAGCAAAGGAAGTCCCCTAATGACTTGTCTTCTTGAAGG
GCCTACAGGCAGTGGGAAAACATCCATGGCAGCAACAATTGGCATTGACAGCAACTTTCCATTTGTTAAAGTTGTATCTGCAGAGTCAATGATTGGATTGAGTGAGAGCAGCAAATGTGCAGTTATAGTCAAGGTTTTTGAGGATGCATACAAGTCTCCATTGAGTATTATCATCCTTGATGATATTGAACGATTACTGG
AGTTTGTGGTGATAGGGCCCCGGTTTTCAAACTTGATCTCACAGACATTGTTGGTGCTTCTTAAGAAAATCCCCCCCAAGGGAAGGAACCTGTTGGTTATTGGGACTACAAGTGAAGCGCATGTCCTTGATTCTCTGGGTATTCGCAAAGCTTTTGGTATCACATTTCATGTGCCAACATTGAGGCGTGCAGACACAAAG
AAGgtatttgttgaacagtttgatattaatcgagatgtagttcagtgacccggtttggttacaaatatagaagtctgatatagttatcccttttatttgccttaaactatgaaaaaccattctcaggtactgggaaatcagggcctctattacttgggggtcttcgcttgtcttggttaaattttcacgataaacaattt
tgcagaggggtagcctttcaatgggtgataggatgagacatgaagagagtgataacaattgtggattaatgcacttatctttatattttctgggatgaatttgtgcagGTTCTTGAGAAGCTATCTATGTTTGCAGAACATGATCTTGATGCAGCAGTGGAAGCTGTTGATGAGATACCAATCAAGAAGTTGTTTATGTT
AGTGGAGATGGTGGCACAAGGCGAGAAAGGAAACAGTGCGGAAGCTATCTACTCTGGAAAGGAGAAAATAAACATTAATCATTTCTTTGATTGCCTTCATTATCTTACTGGGAATGATGACGACTTAGATTAGTTCAAGCTATATCCTTGATTTTCTATAGTTCTTCCTTTGCCAAAAATAGCATGTGAGGAGTTGAAAG
ACATTGGTTGGTTTCAATAACCAATGTTTTGTAGAATCCAGCTCAACTTTCTTAAGGCAATTCTTATTGCCTATTTCTATGATTTGCGGGAAGCTGTGTTGTTTGGTTATATGAATTGCTGTCTTTTTGACATGAAAGTTCCTGCTGTCAGTTTTGACAGATTGTGACATGCTTGGTCTGTTTCCAAAATGTTATCCATT
TTATTGATTTTCAGAAACAGTTTTGCTATTAAGGAAGTCATTTTGTTAATAGAATCAGAATAAGAGC