NA ----> NA
Intron 1 GTTAATGCTC ... TCACTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.55 | 6.3 | 8.8 | 15 |
| A2 | 78.57 | 3 | 7 | 15 |
| A3 | 64.71 | 9 | 15 | 18 |
| A4 | 87.88 | 2 | 14 | 15 |
| A5 | 64 | 9 | 15 | 17 |
| A6 | 44.69 | 9.8 | 8.8 | 7 |
| A7 | 50.43 | 20 | 15.8 | 25 |
| A8 | 36.36 | 7 | 0 | 8 |
| A9 | 43.75 | 9 | 7 | 7 |
| A10 | 53.19 | 11 | 7 | 18 |
>TRINITY_DN40058_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformGGGACGGGTCAATCTAACCAAAGTCCCGATTTACTGAAAAAGTTTCGATGTTTTTTTCTTGGAAGAAACTTCCAACGGAGATATAAGTTTGAAAATTCCTATCAAAACCAGGCGTCGTTACAAACTTCTGCTAAACAATCGCCCAAGGGTTTCTGTTAAATTATATTTGAGCTCGGCACCAATATCACCCACTCTGCAAC
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>TRINITY_DN40058_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:GGGACGGGTCAATCTAACCAAAGTCCCGATTTACTGAAAAAGTTTCGATGTTTTTTTCTTGGAAGAAACTTCCAACGGAGATATAAGTTTGAAAATTCCTATCAAAACCAGGCGTCGTTAgttaatgctcgacaattttaccgcgttccaattaaattattcgcgcgctttttgaataaagaaggatttttcagagcaaa
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AAGGAAGTAATTATGACTCATTTAGGTTACCAAAACACTTTCCCATTCAACATCTTGCGAAATATGATAATGCTGAAAAGTCACTCCATCACTGACTTTTGTCAAAAATTATCATCTGTATCAGCTTTTTTAAAGTTTACATCGTGGAACATTGGCTTATTTCGTTTACAATGCAAAGGGTATTGTTTAGTAGTCATGCA
TTTGCATTGATTAAAGGCAGTAAATTTTGCTAAATATACGGGGCAATGAATTATTGTAATAATATCCCGAGTGTTGCTTCTATATGGGACTCAACGTTGCCTATTAGCTAGTTCTGTAATTAAAGGTCTGAATATGAAGTTGGATTCGTTTGGCATATATACATGCGTGCAATTAGCTTCCCCTCGGTGCATTTAGCTAT
AAAATAATTTCTAGTATAGCCTTCATAATCTTACATTCTACATGACCTCTTTAGAAGGTTGTGAAATGATGGTTAAAATTAGAACACTTTTGATTGGTCTAATTTTGTAACTAAGGCCCTTCTGAAGTTTTAATTAATTCAAATATG