NA ----> NA


Intron 1 GTAAAGGTCA ... CTTTTGGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A159.04173712
A261.9163418
A367.7410384
A461.912354
A51000141
A675.8369292141
A773.734920075
A879.4657299142
A970.475319855
A1068.633211030



>TRINITY_DN46756_c0_g1_i5 from sample A10 / Example spliced isoform
TTCAAGTTTGATCACTTCAAGAATCACCATCTACTCGTCGTATTCATCTTGCTGAGGCCGTACTCCTCAACTGCTGGGTTGTATCTCCATTTTGGGCTTCCATTCCTTTACCCACAGGCCGTACAGCTGGATTGGAAATCGGGTCATATCTGTGGGCAAGTTTGGTTGGAGATTAGAGCCATATTCTGGGGCGTCTTCAT
TGCTGGGAATTACCTTCTATTCCAGGCCACTGTACTTTAAGAGGCTAGGGTACAGTTTCTTGTGGCTGGGCGCACTTCCCAAGAGCTGTCCAAAACCAGCAGTCTACACCACGGTTTCCAGCGTTCAAACAAGGTTGCTGCCATCTCAAGACTCCCATGCGTGACTGTTATTGCCAGACAAGAAGTTTGCTGCCAGCTTG
GATCTTCTTTGGGATAGAAGAATACTGTTTGAAGTGTTCTTTGTAACACAGATTTATGGGTTAAAGTTGCATTATATGGGTACTGGTGAAGTAAAACAATGCATTGTCAATTTGTCACCCATCAAGGTGTTATGCTTGGCAGTGGCTGCTATTTTAATCTGACCAAAAGAGTGTGTTTTGATATTGTCACCCATCAAGGG
TTGTATGCCTGACAGTGGCTGCTACCTGCACCTCACCAAAAGAGTGAGTTTTGATATTGTCACCCACAACTTGGACCTGCGGAGTGTTTTAGTGATCCTTGCTGAAGCCTAATTGATGCAACCAAGTAGAGGTTCTAATGCTGAATGGAGAAGTTCACTATTTAGTATTATTTTATGATGTTCAAATCCTAGAAGCTTCC
CTTTTGCAAGTCTCTTAAGTTGCAGATTCCATATTTGATTTGATCCTCCTTTGTGGCTCAAACAATTTGGTCAGATGGAAAATAAAGTTAGCAATGGAACTGTAGGAGTTTCTTCATCCAGGCCTCCTTCCAATACTGAAACAGCAGCAGCAAGTGCAATGTCACAATCAGGTGCACCTAAAGCAGCACCACGAAGATTT
GTGAGGCAACAGATACCAGATTCAATTTTGAATGATCCTGCACTTAAGGCTGCAATGGCAGTTTTGCCTCTCAACTATAATCTGGAAATACCAAAATGTATTTGGAGGATTAAGCAAGCTGGAGCAAAGCGTGTAGCACTGCAATTTCCGGAGGGTTTGCTTATGTACTCCCTCACAATTTGTGATATTTTAGAGGCATT
TACTGATGTTGACGAATGCTTTGTACTTGGGGATGTTACTTATGGAGCATGTTGTGTTGATGATTATTCGGCTACAGCACTTGGGGCTGATTTTCTCATTCACTATGGTCATAGTTGTTTAGTCCCAATCGATTTTACAATTATCCCATGCTTATATGTCTTTGTGGATATACAAATTGATGTGCAGCATCTAGTTGAGA
CAATAAGGTATAACTTCAAACCAGAAGATAGACTTGCTTTGGCTGGGACTATCCAGTTTTCAACTGCTATCCATGCAGCCAAAGCTGCTCTGGCAGATCAGTATCCAAACATCAATGTTCCTCAAGTGAAACCACTATCGCCTGGAGAGGTTCTTGGGTGCACGGCACCATCACTGCCCCGTGGCACCATTGATATTGCT
GTTTTTGTGTCTGATGGCCGGTTTCATCTTGAGGCTTTTATGATAGCAAATCCTCAAGTTCAGGCTTTCCGGTATGACCCTTATTTGAAAGTCTTGGTTTTAGAAAAATATGACCATAAGGGTATGAAAGATACCCGCAAGAAAGCCATCCTGCAAGCACAGACAGGTAAACAGTGGGGCATAATTCTGGGAACTTTAGG
GCGACAAGGAAATCCTAAAGTACTTAATCACATTGAGCAACGGTTTGCAGAAAAGGGTATCTCATTTACAGTTTTCCTCATGTCTGAAATCTCACCCTCCAAAATTGCACTTTTCGGGGATTCTGTTGATGCTTGGGTACAGATTGCTTGTCCCCGTCTTTCAATTGATTGGGGTGAAGCTTTTACTAAGCCTTTGCTGA
CAACATTCGAGGCAGAAGTGGCACTTGGTTTTGTGCAGCCTTGGTGGAATAGAGAAATTGAACAGGAGGATGCTTGCAGACAAATGGCAGAGAGTCAGGTTCAGTCATGTGGTTCTTGTGCAGAAACAGGGCCCAATGTCGTGACTTGTAATAAGAATTCATGCTGTGCTGGCATAAGTTCTCTAAATGGAACTGCCAGT
GTTACTGATATTGCCAAGACCAAAAGTGAGGAAAGTTGTCTGCCAGATGGGATATTGGAAAATGCCGTATATCCTATGGACTACTATGCTCGAGATGGAGGATCTTGGAATTCTGCATATATTCAGAAGGGTCCTTCTCAAAGAAGATGTCAAACAGTGCGAGATAATGGGATAAGATGGTGACCTTGAATTAGTTTCCA
CCATCATAACCAACTGATGGTTTTGGTTTTTACTTTGATCATCAATGAGGAATTTTGTTTGCAATGAGTTGCTGGATCAATGATGTCTCG


>TRINITY_DN46756_c0_g1_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:
TTCAAGTTTGATCACTTCAAGAATCACCATCTACTCGTCGTATTCATCTTGCTGAGGCCGTACTCCTCAACTGCTGGGTTGTATCTCCATTTTGGGCTTCCATTCCTTTACCCACAGGCCGTACAGCTGGATTGGAAATCGGGTCATATCTGTGGGCAAGTTTGGTTGGAGATTAGAGCCATATTCTGGGGCGTCTTCAT
TGCTGGGAATTACCTTCTATTCCAGGCCACTGTACTTTAAGAGGCTAGGGTACAGTTTCTTGTGGCTGGGCGCACTTCCCAAGAGCTGTCCAAAACCAGCAGTCTACACCACGGTTTCCAGCGTTCAAACAAGGTTGCTGCCATCTCAAGACTCCCATGCGTGACTGTTATTGCCAGACAAGAAGTTTGCTGCCAGCTTG
GATCTTCTTTGGGATAGAAGAATACTGTTTGAAGTGTTCTTTGTAACACAGATTTATGGGTTAAAGTTGCATTATATGGGTACTGGTGAAGTAAAACAATACATTGTCAATTTGTCACCCTTCAAGGTGTTATGCTTGACAGTGGCTGCTATTTTAATCTGACCAAAAGAGTGTGTTTTGATATTGTCACCCATCAAGGG
TTGTATGCCTGACAGTGGCTGCTACCTGCACCTCACCAAAAGAGTGAGTTTTGATATTGTCACCCACAACTTGGACCTGCGGAGTGTTTTAGTGATCCTTGCTGAAGCCTAATTGATGCAACCAAGTAGAGGTTCTAATGCTGAATGGAGAAGTTCACTATTTAGTATTATTTTATGATGTTCAAATCCTAGAAGCTTCC
CTTTTGCAAGTCTCTTAAGTTGCAGATTCCATATTTGATTTGATCCTCCTTTGTGGCTCAAACAATTTGGTCAGATGGAAAATAAAGTTAGAGATGGAACTGTAGGAGTTTCTTCATCCAGGCCTCCTTCCAATACTGAAACAGCAGCAGCAAGTGCAATGTCACAATCAGGTGCACCTAAAGCAGCACCACGAAGATTT
GTGAGGCAACAGATACCAGATTCAATTTTGAATGATCCTGCACTTAAGGCTGCAATGGCAGTTTTGCCTCTCAACTATAATCTGGAAATACCAAAATGTATTTGGAGGATTAAGCAAGCTGGAGCAAAGCGTGTAGCACTGCAATTTCCGGAGGGTTTGCTTATGTACTCCCTCACAATTTGTGATATTTTAGAGGCATT
TACTGATGTTGACGAATGCTTTGTACTTGGGGATGTTACTTATGGAGCATGTTGTGTTGATGATTATTCGGCTACAGCACTTGGGGCTGATTTTCTCATTCACTATGGTCATAGTTGTTTAGTCCCAATCGATTTTACAATTATCCCATGCTTATATGTCTTTGTGGATATACAAATTGATGTGCAGCATCTAGTTGAGA
CAATAAGGTATAACTTCAAACCAGAAGATAGACTTGCTTTGGCTGGGACTATCCAGTTTTCAACTGCTATCCATGCAGCCAAAGCTGCTCTGGCAGATCAGTATCCAAACATCAATGTTCCTCAAGTGAAACCACTATCGCCTGGAGAGGTTCTTGGGTGCACGGCACCATCACTGCCCCGTGGCACCATTGATATTGCT
GTTTTTGTGTCTGATGGCCGGTTTCATCTTGAGGCTTTTATGATAGCAAATCCTCAAGTTCAGGCTTTCCGGTATGACCCTTATTTGAAAGTCTTGGTTTTAGAAAAATATGACCATAAGGGTATGAAAGATACCCGCAAGAAAGCCATCCTGCAAGCACAGACAGGTAAACAGTGGGGCATAATTCTGGGAACTTTAGG
GCGACAAGGAAATCCTAAAGTACTTAATCACATTGAGCAACGGTTTGCAGAAAAGGGTATCTCATTTACAGTTTTCCTCATGTCTGAAATCTCACCCTCCAAAATTGCACTTTTCGGGGATTCTGTTGATGCTTGGGTACAGATTGCTTGTCCCCGTCTTTCAATTGATTGGGGTGAAGCTTTTACTAAGCCTTTGCTGA
CAACATTCGAGGCAGAAGTGGCACTTGGTTTTGTGCAGCCTTGGTGGAATAGAGAAATTGAACAGGAGGATGCTTGCAGACAAATGGCAGAGAGTCAGGTTCAGTCATGTGGTTCTTGTGCAGAAACAGGGCCCAATGTCGTGACTTGTAATAAGAATTCATGCTGTGCTGGCATAAGTTCTCTAAATGGAACTGCCAGT
GTTACTGATATTGCCAAGACCAAAAGTGAGGAAAGTTGTCTGCCAGATGGGATATTGGAAAATGCCGTATATCCTATGGACTACTATGCTCGAGATGGAGGATCTTGGAATTCTGCATATATTCAGAAGGGTCCTTCTCAAAGAAGATGTCAAACAGTGCGAGATAATGgtaaaggtcattaaatatgctgtcttcattt
gtcatatcaaatgcaccgggtagtcttatcttttgattgtggatccttttgctccattgcttgtagttccttgtactgaatgcattttgggaaaaaaaggtcagaacatgtcacacaatcttaatatatctttcaatgtaattgatatacatgtctgattagtatccttgataatttcagtttttaaaatattcatttat
tttatcaaaaaagtctctgcttttggcag
GGATAAGATGGTGACCTTGAATTAGTTTCCACCATCATAACCAACTGATGGTTTTGGTTTTTACTTTGATCATCAATGAGGAATTTTGTTTGCAATGAGTTGCTGGATCAATGATGTCTCG