NA ----> NA
Intron 1 GTAAAGGTCA ... CTTTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 59.04 | 17 | 37 | 12 |
| A2 | 61.9 | 16 | 34 | 18 |
| A3 | 67.74 | 10 | 38 | 4 |
| A4 | 61.9 | 12 | 35 | 4 |
| A5 | 100 | 0 | 14 | 1 |
| A6 | 75.83 | 69 | 292 | 141 |
| A7 | 73.73 | 49 | 200 | 75 |
| A8 | 79.46 | 57 | 299 | 142 |
| A9 | 70.47 | 53 | 198 | 55 |
| A10 | 68.63 | 32 | 110 | 30 |
>TRINITY_DN46756_c0_g1_i5 from sample A10 / Example spliced isoformTTCAAGTTTGATCACTTCAAGAATCACCATCTACTCGTCGTATTCATCTTGCTGAGGCCGTACTCCTCAACTGCTGGGTTGTATCTCCATTTTGGGCTTCCATTCCTTTACCCACAGGCCGTACAGCTGGATTGGAAATCGGGTCATATCTGTGGGCAAGTTTGGTTGGAGATTAGAGCCATATTCTGGGGCGTCTTCAT
TGCTGGGAATTACCTTCTATTCCAGGCCACTGTACTTTAAGAGGCTAGGGTACAGTTTCTTGTGGCTGGGCGCACTTCCCAAGAGCTGTCCAAAACCAGCAGTCTACACCACGGTTTCCAGCGTTCAAACAAGGTTGCTGCCATCTCAAGACTCCCATGCGTGACTGTTATTGCCAGACAAGAAGTTTGCTGCCAGCTTG
GATCTTCTTTGGGATAGAAGAATACTGTTTGAAGTGTTCTTTGTAACACAGATTTATGGGTTAAAGTTGCATTATATGGGTACTGGTGAAGTAAAACAATGCATTGTCAATTTGTCACCCATCAAGGTGTTATGCTTGGCAGTGGCTGCTATTTTAATCTGACCAAAAGAGTGTGTTTTGATATTGTCACCCATCAAGGG
TTGTATGCCTGACAGTGGCTGCTACCTGCACCTCACCAAAAGAGTGAGTTTTGATATTGTCACCCACAACTTGGACCTGCGGAGTGTTTTAGTGATCCTTGCTGAAGCCTAATTGATGCAACCAAGTAGAGGTTCTAATGCTGAATGGAGAAGTTCACTATTTAGTATTATTTTATGATGTTCAAATCCTAGAAGCTTCC
CTTTTGCAAGTCTCTTAAGTTGCAGATTCCATATTTGATTTGATCCTCCTTTGTGGCTCAAACAATTTGGTCAGATGGAAAATAAAGTTAGCAATGGAACTGTAGGAGTTTCTTCATCCAGGCCTCCTTCCAATACTGAAACAGCAGCAGCAAGTGCAATGTCACAATCAGGTGCACCTAAAGCAGCACCACGAAGATTT
GTGAGGCAACAGATACCAGATTCAATTTTGAATGATCCTGCACTTAAGGCTGCAATGGCAGTTTTGCCTCTCAACTATAATCTGGAAATACCAAAATGTATTTGGAGGATTAAGCAAGCTGGAGCAAAGCGTGTAGCACTGCAATTTCCGGAGGGTTTGCTTATGTACTCCCTCACAATTTGTGATATTTTAGAGGCATT
TACTGATGTTGACGAATGCTTTGTACTTGGGGATGTTACTTATGGAGCATGTTGTGTTGATGATTATTCGGCTACAGCACTTGGGGCTGATTTTCTCATTCACTATGGTCATAGTTGTTTAGTCCCAATCGATTTTACAATTATCCCATGCTTATATGTCTTTGTGGATATACAAATTGATGTGCAGCATCTAGTTGAGA
CAATAAGGTATAACTTCAAACCAGAAGATAGACTTGCTTTGGCTGGGACTATCCAGTTTTCAACTGCTATCCATGCAGCCAAAGCTGCTCTGGCAGATCAGTATCCAAACATCAATGTTCCTCAAGTGAAACCACTATCGCCTGGAGAGGTTCTTGGGTGCACGGCACCATCACTGCCCCGTGGCACCATTGATATTGCT
GTTTTTGTGTCTGATGGCCGGTTTCATCTTGAGGCTTTTATGATAGCAAATCCTCAAGTTCAGGCTTTCCGGTATGACCCTTATTTGAAAGTCTTGGTTTTAGAAAAATATGACCATAAGGGTATGAAAGATACCCGCAAGAAAGCCATCCTGCAAGCACAGACAGGTAAACAGTGGGGCATAATTCTGGGAACTTTAGG
GCGACAAGGAAATCCTAAAGTACTTAATCACATTGAGCAACGGTTTGCAGAAAAGGGTATCTCATTTACAGTTTTCCTCATGTCTGAAATCTCACCCTCCAAAATTGCACTTTTCGGGGATTCTGTTGATGCTTGGGTACAGATTGCTTGTCCCCGTCTTTCAATTGATTGGGGTGAAGCTTTTACTAAGCCTTTGCTGA
CAACATTCGAGGCAGAAGTGGCACTTGGTTTTGTGCAGCCTTGGTGGAATAGAGAAATTGAACAGGAGGATGCTTGCAGACAAATGGCAGAGAGTCAGGTTCAGTCATGTGGTTCTTGTGCAGAAACAGGGCCCAATGTCGTGACTTGTAATAAGAATTCATGCTGTGCTGGCATAAGTTCTCTAAATGGAACTGCCAGT
GTTACTGATATTGCCAAGACCAAAAGTGAGGAAAGTTGTCTGCCAGATGGGATATTGGAAAATGCCGTATATCCTATGGACTACTATGCTCGAGATGGAGGATCTTGGAATTCTGCATATATTCAGAAGGGTCCTTCTCAAAGAAGATGTCAAACAGTGCGAGATAATGGGATAAGATGGTGACCTTGAATTAGTTTCCA
CCATCATAACCAACTGATGGTTTTGGTTTTTACTTTGATCATCAATGAGGAATTTTGTTTGCAATGAGTTGCTGGATCAATGATGTCTCG
>TRINITY_DN46756_c0_g1_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:TTCAAGTTTGATCACTTCAAGAATCACCATCTACTCGTCGTATTCATCTTGCTGAGGCCGTACTCCTCAACTGCTGGGTTGTATCTCCATTTTGGGCTTCCATTCCTTTACCCACAGGCCGTACAGCTGGATTGGAAATCGGGTCATATCTGTGGGCAAGTTTGGTTGGAGATTAGAGCCATATTCTGGGGCGTCTTCAT
TGCTGGGAATTACCTTCTATTCCAGGCCACTGTACTTTAAGAGGCTAGGGTACAGTTTCTTGTGGCTGGGCGCACTTCCCAAGAGCTGTCCAAAACCAGCAGTCTACACCACGGTTTCCAGCGTTCAAACAAGGTTGCTGCCATCTCAAGACTCCCATGCGTGACTGTTATTGCCAGACAAGAAGTTTGCTGCCAGCTTG
GATCTTCTTTGGGATAGAAGAATACTGTTTGAAGTGTTCTTTGTAACACAGATTTATGGGTTAAAGTTGCATTATATGGGTACTGGTGAAGTAAAACAATACATTGTCAATTTGTCACCCTTCAAGGTGTTATGCTTGACAGTGGCTGCTATTTTAATCTGACCAAAAGAGTGTGTTTTGATATTGTCACCCATCAAGGG
TTGTATGCCTGACAGTGGCTGCTACCTGCACCTCACCAAAAGAGTGAGTTTTGATATTGTCACCCACAACTTGGACCTGCGGAGTGTTTTAGTGATCCTTGCTGAAGCCTAATTGATGCAACCAAGTAGAGGTTCTAATGCTGAATGGAGAAGTTCACTATTTAGTATTATTTTATGATGTTCAAATCCTAGAAGCTTCC
CTTTTGCAAGTCTCTTAAGTTGCAGATTCCATATTTGATTTGATCCTCCTTTGTGGCTCAAACAATTTGGTCAGATGGAAAATAAAGTTAGAGATGGAACTGTAGGAGTTTCTTCATCCAGGCCTCCTTCCAATACTGAAACAGCAGCAGCAAGTGCAATGTCACAATCAGGTGCACCTAAAGCAGCACCACGAAGATTT
GTGAGGCAACAGATACCAGATTCAATTTTGAATGATCCTGCACTTAAGGCTGCAATGGCAGTTTTGCCTCTCAACTATAATCTGGAAATACCAAAATGTATTTGGAGGATTAAGCAAGCTGGAGCAAAGCGTGTAGCACTGCAATTTCCGGAGGGTTTGCTTATGTACTCCCTCACAATTTGTGATATTTTAGAGGCATT
TACTGATGTTGACGAATGCTTTGTACTTGGGGATGTTACTTATGGAGCATGTTGTGTTGATGATTATTCGGCTACAGCACTTGGGGCTGATTTTCTCATTCACTATGGTCATAGTTGTTTAGTCCCAATCGATTTTACAATTATCCCATGCTTATATGTCTTTGTGGATATACAAATTGATGTGCAGCATCTAGTTGAGA
CAATAAGGTATAACTTCAAACCAGAAGATAGACTTGCTTTGGCTGGGACTATCCAGTTTTCAACTGCTATCCATGCAGCCAAAGCTGCTCTGGCAGATCAGTATCCAAACATCAATGTTCCTCAAGTGAAACCACTATCGCCTGGAGAGGTTCTTGGGTGCACGGCACCATCACTGCCCCGTGGCACCATTGATATTGCT
GTTTTTGTGTCTGATGGCCGGTTTCATCTTGAGGCTTTTATGATAGCAAATCCTCAAGTTCAGGCTTTCCGGTATGACCCTTATTTGAAAGTCTTGGTTTTAGAAAAATATGACCATAAGGGTATGAAAGATACCCGCAAGAAAGCCATCCTGCAAGCACAGACAGGTAAACAGTGGGGCATAATTCTGGGAACTTTAGG
GCGACAAGGAAATCCTAAAGTACTTAATCACATTGAGCAACGGTTTGCAGAAAAGGGTATCTCATTTACAGTTTTCCTCATGTCTGAAATCTCACCCTCCAAAATTGCACTTTTCGGGGATTCTGTTGATGCTTGGGTACAGATTGCTTGTCCCCGTCTTTCAATTGATTGGGGTGAAGCTTTTACTAAGCCTTTGCTGA
CAACATTCGAGGCAGAAGTGGCACTTGGTTTTGTGCAGCCTTGGTGGAATAGAGAAATTGAACAGGAGGATGCTTGCAGACAAATGGCAGAGAGTCAGGTTCAGTCATGTGGTTCTTGTGCAGAAACAGGGCCCAATGTCGTGACTTGTAATAAGAATTCATGCTGTGCTGGCATAAGTTCTCTAAATGGAACTGCCAGT
GTTACTGATATTGCCAAGACCAAAAGTGAGGAAAGTTGTCTGCCAGATGGGATATTGGAAAATGCCGTATATCCTATGGACTACTATGCTCGAGATGGAGGATCTTGGAATTCTGCATATATTCAGAAGGGTCCTTCTCAAAGAAGATGTCAAACAGTGCGAGATAATGgtaaaggtcattaaatatgctgtcttcattt
gtcatatcaaatgcaccgggtagtcttatcttttgattgtggatccttttgctccattgcttgtagttccttgtactgaatgcattttgggaaaaaaaggtcagaacatgtcacacaatcttaatatatctttcaatgtaattgatatacatgtctgattagtatccttgataatttcagtttttaaaatattcatttat
tttatcaaaaaagtctctgcttttggcagGGATAAGATGGTGACCTTGAATTAGTTTCCACCATCATAACCAACTGATGGTTTTGGTTTTTACTTTGATCATCAATGAGGAATTTTGTTTGCAATGAGTTGCTGGATCAATGATGTCTCG