NA ----> NA

Intron 1 GTGGGTGGTT ... GCTGTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	62.54	59	80	117
A2	68.83	36	72	87
A3	64.02	34	67	54
A4	67.54	31	53	76
A5	65.06	29	51	57
A6	86.67	1	11	2
A7	45.45	18	27	3
A8	68.75	10	41	3
A9	57.14	9	23	1
A10	56.1	9	17	6

>TRINITY_DN47439_c0_g1_i15 from sample A7 / Example spliced isoform

TTTTCATTCATTCTTGTGGATGGAGTTCTGCAAAGGGGAAAGAACGGGCGGTGTCGAAACCCAGACCTCTCCGTTCTTTCGGTTTATGGACGAGATTTGATCCTTTGTTCCTGTCCAGCTTGCTATCTTTGAAGTGCAGAACTTCTGTTAATGATCATGGACACAACATGGCCAATGCTTTATATTATGCATGAATAGAC
ACCTCTGGATTCTTATGGAAAACAATATGCAAACAATTTTGGAAGCTCATGGCAAACAATTTGGCGTCTTAATGATTGCTTGAGCAGCCTAGGATGTCATGATGTCCAACCTCTCAGAGATTGCAAACTTTCATATCAGTTTATGAGGATGCTATCTTCATTGTGACAAAAGTTGGGGGCATCTCTTTTAGGCCAAAATG
CCTTCTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATGTTGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGTTACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAAAGTGATGTA
GCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAAATAATAAAATGATATTTTTTTGGGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTCTGTTTATGGTTTCTTGTTTGACGGTATGATTGTGTGATGTTTTTGCTACAGATGAGACTGATGGGGAAGATAACTCTTTGTCTG
TTATTTATGCCATCAAATTAAGCTGCTATTGGCATGAATTTTATTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTGATTCTCCACACAGCATCCATTTATGATGAAGCTATTTCTGGGAGTTGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATGAATGGAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTAT
AAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAATTAACATCTCTGTGAGTACTGAGGAATATTTGATCAGATCCAACGTAAAAGAGAACTTCTGTTAATGACCATGTGAAACAGCAACACAGTTTGTGTATGCTTCATAGATAATCATCATGGACACAACCTTATTATGCATGGACAGGCACCTCTTGATTCT
TGTGGAAAACAATATGCAAATAATGATGGAGGCTTATGGCAAGCAGTTTGGCGTCTTAATGATTTCTTGGGCAGCCTAGGATGTCTCCAACTTCTCAGAGATATTTCACTGTCATCAGTTTATGAGGGTGCTATCTTCATTGTGACAGAAGTGTCATATTTTCTTGGAGCATCTCATTTAGGCCAAATGCCTTTTAGAAA
TTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATTTAGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGATGTATAAAAGACTAGATGATGTGGCCTTGAGACAGTTTATATATGTTATGTCTGTACCCTGTGTTTTTTTTTAAGGCTCTTGCCTATTTGCTTTTGTAATTTACAAATTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCC
GTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAGATAATAAAATGAGTGTTTTTTGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTTCTTGTTTGACGGTGTGATTGTGATGTTTTGTTACAGATGAGACTGATGAGGGAGATAACTCTGTCTGTTGTTTATGTCATCAAATTAAGTTGCTA
TTGGCATGACTTTTGTTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTAATTCTTCACACAGCATCCGTTTTTGATGAAGCTATTTATGGGAGTTGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATAAACAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCT
GGCCAGTTAATATCTACAAGAACTTAGCTTTCTTTCCAACCAACCTTACAGCTGGAGGATTAACATCTCTGTGACTACTGAGGAATATTTGATCAGATTCAACGCAAAAAGAGGCTTCATTTAAAAAAAAATCAGATCGGTTGCTAGAGGTCAAGCTGTAAGATGGGATGTGGGATGAGTTATGTTATGATATATAGTTT
AAAAATGTAAACAGACAGAGGGTTATAGAAAGCGGTTTAGTGTGACCTAAAGGTTAATAATATTGATGGAAAATTCAGAGGCTAACATTGGCTTTTTGGGCCTAAAGTGGCTCATTGATTGATAATGAAGATGTGCCCAATTTTGGACAGAGATAAGATGTTTTATAATTATAAATTATAATATTATTTGATAAGAGAAG
AGTTGCTCTTTTTTCAGGAAACATACACGAACATAAAAACCACTTAATTATTGAATATTATGCTATGAAACTGGATGAATCAATATAATGATTGATGTTATCAGTTAGAAATTAGAGGGAGGAAAACATTAGTTGCAAGTTCAGTAAAAAAATCTCTAATTGATGGT

>TRINITY_DN47439_c0_g1_i18 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GCTTGCTGAAGCTTTCGAAGAGCTGCAACTCACATTGGGATTGGATTGATCAATCCCACATTTTAATAAGTGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGTTACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAAAGTGATGTAGCT
ACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAAATAATAAAATGATATTTTTTTGGGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTCTGTTTATGGTTTCTTGTTTGACGGTATGATTGTGTGATGTTTTTGCTACAGATGAGACTGATGGGGAAGATAACTCTTTGTCTGTTA
TTTATGCCATCAAATTAAGCTGCTATTGGCATGAATTTTATTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTGATTCTCCACACAGCATCCATTTATGATGAAGCTATTTCTGGGAGTTGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATGAATGGAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAG
GAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAATTAACATCTCTGTGAGTACTGAGGAATATTTGATCAGATCCAACGTAAAAGAGGGCACCTCTTGATTCTTGTGGAAAACAATATGCAAATAATGATGGAGGCTTATGGCAAGCAGTTTGGCGTCTTAATGATTTCTTGGGCAGCCTAGGATGTCTCCAACTTC
TCAGAGATATTTCACTGTCATCAGTTTATGAGGGTGCTATCTTCATTGTGACAGAAGTGTCATATTTTCTTGGAGCATCTCATTTAGGCCAAATGCCTTTTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATTTAGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGATGTATAAAAGACTAGATGATGTGGCCTTG
AGACAGTTTATATATGTTATGTCTGTACCCTGTGTTTTTTTTTAAGGCTCTTGCCTATTTGCTTTTGTAATTTACAAATTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAGATAATAAAATGAGTGTTTTTTGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTG
TGTTGTGATTTCTTGTTTGACGGTGTGATTGTGATGTTTTGTTACAGATGAGACTGATGAGGGAGATAACTCTGTCTGTTGTTTATGTCATCAAATTAAGTTGCTATTGGCATGACTTTTGTTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTAATTCTTCACACAGCATCCGTTTTTGATGAAGCTATTTATGGGAGT
TGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATAAACAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAATATCTACAAGAACTTAGCTTTCTTTCCAACCAACCTTACAGCTGGAGGATTAACATCTCTGTGACTACTGAGGAATATTTGATC
AGATTCAACGCAAAAAGAGgtgggtggttgttttcaattgctttggacagtattttgttattataagtaacgcagctcagataatggtcatgctaacaagaatattgctgctgattagataaagtaaacgatagataatggccattgtggctagtgtaatcaacgtggctgattattttggggccttgggctaaacatag
tagcatctttgagaatatttttgctgtcttagacaatgcttttgctgttctattttgtaggattaggttttaggatgaggacttaaggtgtaatatttttgtgtaattaggtgctagattaaagaatattattatgtaactaattatctgcctgtttaaagagtcattatttatcaatttccgaggctgaattgctgttg
cagGCTTCATTTAAAAAAAAATCAGATCGGTTGCTAGAGGTCAAGCTGTAAGATGGGATGTGGGATGAGTTATGTTATGATATATAGTTTAAAAATGTAAACAGACAGAGGGTTATAGAAAGCGGTTTAGTGTGACCTAAAGGTTAATAATATTGATGGAAAATTCAGAGGCTAACATTGGCTTTTTGGGCCTAAAGTGG
CTCATTGATTGATAATGAAGATGTGCCCAATTTTGGACAGAGATAAGATGTTTTATAATTATAAATTATAATATTATTTGATAAGAGAAGAGTTGCTCTTTTTTCAGGAAACATACACGAACATAAAAACCACTTAATTATTGAATATTATGCTATGAAACTGGATGAATCAATATAATGATTGATGTTATCAGTTAGAA
ATTAGAGGGAGGAAAACATTAGTTGCAAGTTCAGTAAAAAAATCTCTAATTGATGGT

Intron 2 GTATGCAATC ... TTTTTATCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25.29	129	54	33.3
A2	20.29	182	54	38.7
A3	14.92	134	32	15
A4	20.75	121	38	25.3
A5	23.94	81	31	20
A6	1.59	62	2	0
A7	7.14	39	6	0
A8	9.09	40	8	0
A9	5.15	46	5	0
A10	5.6	59	5	2

>TRINITY_DN125622_c0_g3_i10 from sample A1 / Example spliced isoform

GGCCCTTCATTTTCATTCATTCTTGTGGATGGAGTTCTGCAAAGGGGAAAGAACGGGCGGTGTCGAAACCCAGACCTCTCCGTTCTTTCGGTTTATGGACGAGATTTGATCCTTTGTTCCTGTCCAGCTTGCTATCTTTGAAGTGCAGAACTTCTGTTAATGATCATGGACACAACATGGCCAATGCTTTATATTATGCA
TGAATAGACACCTCTGGATTCTTATGGAAAACAATATGCAAACAATTTTGGAAGCTCATGGCAAACAATTTGGCGTCTTAATGATTGCTTGAGCAGCCTAGGATGTCATGATGTCCAACCTCTCAGAGATTGCAAACTTTCATATCAGTTTATGAGGATGCTATCTTCATTGTGACAAAAGTTGGGGGCATCTCTTTTAG
GCCAAAATGCCTTCTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATGTTGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGTTACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAA
AGTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAAATAATAAAATGATATTTTTTTGGGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTCTGTTTATGGTTTCTTGTTTGCATAAGTGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGT
TACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAAAGTGATGCACCTCTTGATTCTTGTGGAAAACAATATGCAAATAATGATGGAGGCTTATGGCAAGCAGTTTGGCGTCTTAATGATTTCTTGGGCAGCCTAGGATGTCTCCAACTTCTCAGAGATATTTCACT
GTCATCAGTTTATGAGGGTGCTATCTTCATTGTGACAGAAGTGTCATATTTTCTTGGAGCATCTCATTTAGGCCAAATGCCTTTTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATTTAGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGATGTATAAAAGACTAGATGATGTGGCCTTGAGACAGTTTATATATG
TTATGTCTGTACCCTGTGTTTTTTTTTAAGGCTCTTGCCTATTTGCTTTTGTAATTTACAAATTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAGATAATAAAATGAGTGTTTTTTGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTTCTTGT
TTGACGGTGTGATTGTGATGTTTTGTTACAGATGAGACTGATGAGGGAGATAACTCTGTCTGTTGTTTATGTCATCAAATTAAGTTGCTATTGGCATGACTTTTGTTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTAATTCTTCACACAGCATCCGTTTTTGATGAAGCTATTTATGGGAGTTGGATTGGATTTGATC
ATTATTGGAATAAACAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAAT

>TRINITY_DN125622_c0_g3_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGCCCTTCATTTTCATTCATTCTTGTGGATGGAGTTCTGCAAAGGGGAAAGAACGGGCGGTGTCGAAACCCAGACCTCTCCGTTCTTTCGGTTTATGGACGAGATTTGATCCTTTGTTCCTGgtatgcaatcgatctacttttctctgtctatttgttttaataacaagtctctggctgatcagcgagggttcgactcca
tttgttgcggttttgtggtatatgtgcttcaagggtttctttgattttttctttgccctttaaggatttcgtgagttctttgtattggaatcgtctccatccgttttctctttgctgcgaggggctgtctttggattgcggcataattgatgaggatttgctcgtttttctatattactatcatttttgttgtaaaatac
cctttcattcgaagacctttataggctgaaaaccattgccttaggaattatgcatgatgagtgtctattctgccgaaattgcaaaggccttgcatccgggtttgtctgcttccctacttgataaactgcctttgatgagttggcctggaggtatcacgagatcgcccaacaaacttgacgatttagcatgttattgggaa
actgaatcggtgtcgcggcaaagaaatcacacacaatgtggcccttgatagcaacaacccggaaaacatctaaaactataattcatggggacgcattgatcccctgtgtcaaagatggggtggcggcatgtgtttaccatgttccttgggtttccctgaatgtctgtcctgtgtccaccggacattcctttttcgcccgt
gggccgtcctcagcatagaggggatatttgggagatgcgtggatgttgtttgaccctggtagagggatgtacacagcccccaactacatgccaacaaaagctattaataaataataataaaatgaccggtatctcctgcggggaaagtcaggtgctcttgcagcttgggtggatgaggtgtgttaggtatgtccgttaag
gaaaaaatgatttcctatttattaattcaaaaaataaattcatttattaattactataatctataaataataagtaattaagcacaaataaataaataaataggtaattagacacctaaaataaataaataacatagatccatgttgatttcaccatttattcattaatactaaataaataaataacatagatccatctt
gatatgaccatttatttataaatagagtttataatttatttattaatataatttataaagaaataaataattgacatagatgtaagttatgctggatcaagcagtgaaatggttgcaagaggcttgcagaattcattcgtcttgttctatctggttttacagaattcctccggctctggttttatccgggttataagatg
atgaatctatgctagtgtgcactcaagtatgttttggctctatcttggttataatatgaatttatacgaatgtgcacaaaggtatgttcgttagatgatgccaatttccaggattcacgcaagctgggttatagtgatgactgataggaataattgctttggtgaaccagaaaaacttcaaacggttatagtttatgata
tgctatactatctatatatacaacaataaatactcatttttaaatttttgtggtgtcgtcctttgccacttcctctacatacggtgaaatttaggtgatctcttcagcagtcaatgaaaggcatctccatgtctctgtggcaacctgttgcctaactgccgtgaaagatgaaacataggctgtaaatagtaactgaatgg
cttttgtattcgagggccttggacaatcgtctcatattctgttgatcgactgtggtgatgttttgcatgcatattcttttttaatatatgtttgccttgaggtgttgcaaaggcgctctaattgtattgatgcataattgtgggtaaactctttaaggcgggaaatttcatattggcaacattgtttatatctatatatg
tctggaaatttctagtcttcaaggtagatgcagattcagctattacccggctggttagaaatttcaacatttctgaactagaatttatttttagttgattctattgttcggtgatacataaattcggatgtgtttttatcagTCCAGCTTGCTATCTTTGAAGTGCAGAACTTCTGTTAATGATCATGGACACAACATGG
CCAATGCTTTATATTATGCATGAATAGGAAACAGCAACACAGTTTGTGTATGCTTCATAGATAATCATCATGGACACAACCTTATTATGCATGGACAGGTATCTTTTAAATTTATATAACGCAGTTTGTTTTGAAATAATTCATAATATAAATATAACTCAGTGAGGAAGCCTATTTTAAGTATTTAATGTGCTGTATGT
TTTAAGTTTATACAATGCAGTTGTTTGGAAATAACTCATAATACATACATAACTCAATGAGGAAGCCTATTTTAAATATTTAATGTGCAGCTAGGTGTTTTCTCATCGTTTTATGCACTGTGCAGACACCTCTGGATTCTTATGGAAAACAATATGCAAACAATTTTGGAAGCTCATGGCAAACAATTTGGCGTCTTAAT
GATTGCTTGAGCAGCCTAGGATGTCATGATGTCCAACCTCTCAGAGATTGCAAACTTTCATATCAGTTTATGAGGATGCTATCTTCATTGTGACAAAAGTTGGGGGCATCTCTTTTAGGCCAAAATGCCTTCTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATGTTGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAG
TGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGTTACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAAAGTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAAATAATAAAATGATATTTTTTTGG
GGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTCTGTTTATGGTTTCTTGTTTGACGGTATGATTGTGTGATGTTTTTGCTACAGATGAGACTGATGGGGAAGATAACTCTTTGTCTGTTATTTATGCCATCAAATTAAGCTGCTATTGGCATGAATTTTATTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGA
ATTGATTCTCCACACAGCATCCATTTATGATGAAGCTATTTCTGGGAGTTGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATGAATGGAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAATTAACATCTCTGTGAGTACTGAGGAATATTTGA
TCAGATCCAACGTAAAAGAGAACTTCTGTTAATGACCATGTGAAACAGCAACACAGTTTGTGTATGCTTCATAGATAATCATCATGGACACAACCTTATTATGCATGGACAGGCACCTCTTGATTCTTGTGGAAAACAATATGCAAATAATGATGGAGGCTTATGGCAAGCAGTTTGGCGTCTTAATGATTTCTTGGGCA
GCCTAGGATGTCTCCAACTTCTCAGAGATATTTCACTGTCATCAGTTTATGAGGGTGCTATCTTCATTGTGACAGAAGTGTCATATTTTCTTGGAGCATCTCATTTAGGCCAAATGCCTTTTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATTTAGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGATGTATAAA
AGACTAGATGATGTGGCCTTGAGACAGTTTATATATGTTATGTCTGTACCCTGTGTTTTTTTTTAAGGCTCTTGCCTATTTGCTTTTGTAATTTACAAATTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAGATAATAAAATGAGTGTTTTTTGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTAC
CCCTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTTCTTGTTTGACGGTGTGATTGTGATGTTTTGTTACAGATGAGACTGATGAGGGAGATAACTCTGTCTGTTGTTTATGTCATCAAATTAAGTTGCTATTGGCATGACTTTTGTTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTAATTCTTCACACAGCATCCGTTTTT
GATGAAGCTATTTATGGGAGTTGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATAAACAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAAT

Intron 3 GTATGTTTTA ... CACTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	49.31	100.3	25	97
A2	47.41	98	27	88
A3	37.64	90	12	53
A4	45.99	72.3	20	61
A5	43.29	47.3	9	36
A6	23.35	43	0	13
A7	26	20	2	7
A8	20.31	23.7	0	6
A9	18.91	39	0	9
A10	29.17	30.7	5	12

>TRINITY_DN125622_c0_g3_i10 from sample A1 / Example spliced isoform

GGCCCTTCATTTTCATTCATTCTTGTGGATGGAGTTCTGCAAAGGGGAAAGAACGGGCGGTGTCGAAACCCAGACCTCTCCGTTCTTTCGGTTTATGGACGAGATTTGATCCTTTGTTCCTGTCCAGCTTGCTATCTTTGAAGTGCAGAACTTCTGTTAATGATCATGGACACAACATGGCCAATGCTTTATATTATGCA
TGAATAGACACCTCTGGATTCTTATGGAAAACAATATGCAAACAATTTTGGAAGCTCATGGCAAACAATTTGGCGTCTTAATGATTGCTTGAGCAGCCTAGGATGTCATGATGTCCAACCTCTCAGAGATTGCAAACTTTCATATCAGTTTATGAGGATGCTATCTTCATTGTGACAAAAGTTGGGGGCATCTCTTTTAG
GCCAAAATGCCTTCTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATGTTGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGTTACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAA
AGTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAAATAATAAAATGATATTTTTTTGGGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTCTGTTTATGGTTTCTTGTTTGCATAAGTGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGT
TACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAAAGTGATGCACCTCTTGATTCTTGTGGAAAACAATATGCAAATAATGATGGAGGCTTATGGCAAGCAGTTTGGCGTCTTAATGATTTCTTGGGCAGCCTAGGATGTCTCCAACTTCTCAGAGATATTTCACT
GTCATCAGTTTATGAGGGTGCTATCTTCATTGTGACAGAAGTGTCATATTTTCTTGGAGCATCTCATTTAGGCCAAATGCCTTTTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATTTAGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGATGTATAAAAGACTAGATGATGTGGCCTTGAGACAGTTTATATATG
TTATGTCTGTACCCTGTGTTTTTTTTTAAGGCTCTTGCCTATTTGCTTTTGTAATTTACAAATTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAGATAATAAAATGAGTGTTTTTTGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTTCTTGT
TTGACGGTGTGATTGTGATGTTTTGTTACAGATGAGACTGATGAGGGAGATAACTCTGTCTGTTGTTTATGTCATCAAATTAAGTTGCTATTGGCATGACTTTTGTTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTAATTCTTCACACAGCATCCGTTTTTGATGAAGCTATTTATGGGAGTTGGATTGGATTTGATC
ATTATTGGAATAAACAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAAT

>TRINITY_DN125622_c0_g3_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGCCCTTCATTTTCATTCATTCTTGTGGATGGAGTTCTGCAAAGGGGAAAGAACGGGCGGTGTCGAAACCCAGACCTCTCCGTTCTTTCGGTTTATGGACGAGATTTGATCCTTTGTTCCTGGTATGCAATCGATCTACTTTTCTCTGTCTATTTGTTTTAATAACAAGTCTCTGGCTGATCAGCGAGGGTTCGACTCCA
TTTGTTGCGGTTTTGTGGTATATGTGCTTCAAGGGTTTCTTTGATTTTTTCTTTGCCCTTTAAGGATTTCGTGAGTTCTTTGTATTGGAATCGTCTCCATCCGTTTTCTCTTTGCTGCGAGGGGCTGTCTTTGGATTGCGGCATAATTGATGAGGATTTGCTCGTTTTTCTATATTACTATCATTTTTGTTGTAAAATAC
CCTTTCATTCGAAGACCTTTATAGGCTGAAAACCATTGCCTTAGGAATTATGCATGATGAGTGTCTATTCTGCCGAAATTGCAAAGGCCTTGCATCCGGGTTTGTCTGCTTCCCTACTTGATAAACTGCCTTTGATGAGTTGGCCTGGAGGTATCACGAGATCGCCCAACAAACTTGACGATTTAGCATGTTATTGGGAA
ACTGAATCGGTGTCGCGGCAAAGAAATCACACACAATGTGGCCCTTGATAGCAACAACCCGGAAAACATCTAAAACTATAATTCATGGGGACGCATTGATCCCCTGTGTCAAAGATGGGGTGGCGGCATGTGTTTACCATGTTCCTTGGGTTTCCCTGAATGTCTGTCCTGTGTCCACCGGACATTCCTTTTTCGCCCGT
GGGCCGTCCTCAGCATAGAGGGGATATTTGGGAGATGCGTGGATGTTGTTTGACCCTGGTAGAGGGATGTACACAGCCCCCAACTACATGCCAACAAAAGCTATTAATAAATAATAATAAAATGACCGGTATCTCCTGCGGGGAAAGTCAGGTGCTCTTGCAGCTTGGGTGGATGAGGTGTGTTAGGTATGTCCGTTAAG
GAAAAAATGATTTCCTATTTATTAATTCAAAAAATAAATTCATTTATTAATTACTATAATCTATAAATAATAAGTAATTAAGCACAAATAAATAAATAAATAGGTAATTAGACACCTAAAATAAATAAATAACATAGATCCATGTTGATTTCACCATTTATTCATTAATACTAAATAAATAAATAACATAGATCCATCTT
GATATGACCATTTATTTATAAATAGAGTTTATAATTTATTTATTAATATAATTTATAAAGAAATAAATAATTGACATAGATGTAAGTTATGCTGGATCAAGCAGTGAAATGGTTGCAAGAGGCTTGCAGAATTCATTCGTCTTGTTCTATCTGGTTTTACAGAATTCCTCCGGCTCTGGTTTTATCCGGGTTATAAGATG
ATGAATCTATGCTAGTGTGCACTCAAGTATGTTTTGGCTCTATCTTGGTTATAATATGAATTTATACGAATGTGCACAAAGGTATGTTCGTTAGATGATGCCAATTTCCAGGATTCACGCAAGCTGGGTTATAGTGATGACTGATAGGAATAATTGCTTTGGTGAACCAGAAAAACTTCAAACGGTTATAGTTTATGATA
TGCTATACTATCTATATATACAACAATAAATACTCATTTTTAAATTTTTGTGGTGTCGTCCTTTGCCACTTCCTCTACATACGGTGAAATTTAGGTGATCTCTTCAGCAGTCAATGAAAGGCATCTCCATGTCTCTGTGGCAACCTGTTGCCTAACTGCCGTGAAAGATGAAACATAGGCTGTAAATAGTAACTGAATGG
CTTTTGTATTCGAGGGCCTTGGACAATCGTCTCATATTCTGTTGATCGACTGTGGTGATGTTTTGCATGCATATTCTTTTTTAATATATGTTTGCCTTGAGGTGTTGCAAAGGCGCTCTAATTGTATTGATGCATAATTGTGGGTAAACTCTTTAAGGCGGGAAATTTCATATTGGCAACATTGTTTATATCTATATATG
TCTGGAAATTTCTAGTCTTCAAGGTAGATGCAGATTCAGCTATTACCCGGCTGGTTAGAAATTTCAACATTTCTGAACTAGAATTTATTTTTAGTTGATTCTATTGTTCGGTGATACATAAATTCGGATGTGTTTTTATCAGTCCAGCTTGCTATCTTTGAAGTGCAGAACTTCTGTTAATGATCATGGACACAACATGG
CCAATGCTTTATATTATGCATGAATAGgtatgttttaagtttatacaatgcagttgtttggaaataactcataatacatacataactcaatgaggaagcctattttaaatatttaatgtgcagctaggtgttttctcatcgttttatgcactgtgcagACACCTCTGGATTCTTATGGAAAACAATATGCAAACAATTTT
GGAAGCTCATGGCAAACAATTTGGCGTCTTAATGATTGCTTGAGCAGCCTAGGATGTCATGATGTCCAACCTCTCAGAGATTGCAAACTTTCATATCAGTTTATGAGGATGCTATCTTCATTGTGACAAAAGTTGGGGGCATCTCTTTTAGGCCAAAATGCCTTCTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATGT
TGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGCTGTATAAAAGACACGATGATGTGGTCTTGAGACAGATTATATATGTTACTAGTCTGTCCCCCGTGGGTTTTTACTTTTTTATAGGCTCTTGCCAATTTGCTTTTGTAATTTACAAAGTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGT
CGGTCCACAAATAATAAAATGATATTTTTTTGGGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTCTGTTTATGGTTTCTTGTTTGACGGTATGATTGTGTGATGTTTTTGCTACAGATGAGACTGATGGGGAAGATAACTCTTTGTCTGTTATTTATGCCATCAAATTAAGCTGCTATTGGCATGAATT
TTATTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTGATTCTCCACACAGCATCCATTTATGATGAAGCTATTTCTGGGAGTTGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATGAATGGAGACTTATTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAA
TTAACATCTCTGTGAGTACTGAGGAATATTTGATCAGATCCAACGTAAAAGAGGCACCTCTTGATTCTTGTGGAAAACAATATGCAAATAATGATGGAGGCTTATGGCAAGCAGTTTGGCGTCTTAATGATTTCTTGGGCAGCCTAGGATGTCTCCAACTTCTCAGAGATATTTCACTGTCATCAGTTTATGAGGGTGCT
ATCTTCATTGTGACAGAAGTGTCATATTTTCTTGGAGCATCTCATTTAGGCCAAATGCCTTTTAGAAATTATGCCACTGATGTTTATTGGCAAATTTAGTTGGGATTTGTCTGGCATCAAACAAGATAAGTGATGTATAAAAGACTAGATGATGTGGCCTTGAGACAGTTTATATATGTTATGTCTGTACCCTGTGTTTT
TTTTTAAGGCTCTTGCCTATTTGCTTTTGTAATTTACAAATTGATGTAGCTACCAAGGATCTTACTCCGTTGGGTGCGCTCGCGGGGTCGGTCCACAGATAATAAAATGAGTGTTTTTTGGGTTTTGGTGGGGGGCTTTACCCCTGCCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGATTTCTTGTTTGACGGTGTGATTGTGATGTT
TTGTTACAGATGAGACTGATGAGGGAGATAACTCTGTCTGTTGTTTATGTCATCAAATTAAGTTGCTATTGGCATGACTTTTGTTACCAACTTGGTTGCATATACAGCAAGGAATTAATTCTTCACACAGCATCCGTTTTTGATGAAGCTATTTATGGGAGTTGGATTGGATTTGATCATTATTGGAATAAACAGACTTA
TTGATGCTGCTTGAAGCATTATATTTTCTCATCACTATAAGGAGCACTACATTGTCAAAGAGCACTCTGGCCAGTTAAT