NA ----> NA

Intron 1 GTGGTGGAGC ... GGCGGAGCAG

Found issues: Low number of reads

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	69.23	2	4	5
A2	68.26	1	1	3.3
A3	60	3	3	6
A4	60	1	1	2
A5	-1	0	0	0
A6	52.38	5	5	6
A7	42.86	6	7	2
A8	60	2	2	4
A9	47.37	5	6	3
A10	50	2	2	2

>TRINITY_DN44333_c0_g3_i8 from sample A9 / Example spliced isoform

GGTGGACACGGAGGAGGAATTGGTGGTGGTGCTGGCGGCCTTGGTGGCGGACACGGTGGAGGATGGTGGAGCCGGTGGGGGTGGCGGCCTTGGTGGAGGGCACGGTGGAGGAGTTGGTGGTGGAGCCGGCGGGGGTGGCGGCCTTGGTGGAGGACACGGTGGAGGAATTGGTGGTGGAGCTGGCGGGGGTGGTGGCCTTG
GTGGAGGACACGGCGGAGGCCTTGGTGGTGGAGCCGGAGGGGGAGGCGGCCTTGGTGGTGGACACGGTAAAGGAATTGGTGGTGGCGCCGGAGGGGGTGGCGGCCTAGGTGGTGGTCATGGCGGAGGAATTGGAGGCGGAGCAGGTGGCGGTGGTGGAGTTGGAGGCGGAGTAGGTGGTGGAGTTGGCGGTGGAGCAGGT
GGCGGAGCTGGTGGAGGAGCCGGGGTAGGAGCCGGCGGAGGAATTGGCGGAGGAGCCGGTGGT

>TRINITY_DN44333_c0_g3_i4 from sample A9 / Example unspliced isoform:

CACGGTGGAGGAGTTGGTGGTGGAGCCGGCGGGGGTGGCGGCCTTGGTGGCGGACACGGTGGAGGAATTGGTGGTGGAGCCGGTGGGGGTGGCGGCCTTGGTGGAGGGCACGGTGGAGGAGTTGGTGGTGGAGCCGGCGGGGGTGGCGGCCTTGGTGGAGGACACGGTGGAGGAATTGGTGGTGGAGCTGGCGGGGGTGG
TGGCCTTGGTGGAGGACACGGCGGAGGCCTTGGTGGTGGAGCCGGAGGGGGAGGCGGCCTTGGTGGTGGACACGGTAAAGGAATTGGTGGTGGCGCCGGAGGGGGTGGCGGCCTAGGTGGTGGTCATGGCGGAGGAATTGGAGGCGGAGCAGGTGGCGGTGGTGGAGTTGGAGGCGGAGTAGgtggtggagcaggtggcg
gagctggtggaggggccggggttggtggcggagcagGTGGTGGAGTTGGCGGTGGAGCAGGTGGCGGAGCTGGTGGAGGAGCCGGGGTAGGAGCCGGCGGAGGAATTGGCGGAGGAGCCGGTGGTATTGGAGCAGGCGGTGGTATTGGAGCTGGCGGTGGAGCCGGAGCTGGCGGTGGTGGTGGAGCAGGCG