sp|Q680P8|RS29_ARATH ----> Small ribosomal subunit protein uS14z/uS14y/uS14x
Intron 1 GTACCTGAAG ... CTCATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 38.46 | 20 | 14 | 11 |
| A2 | 56.16 | 16 | 28 | 13 |
| A3 | 48.94 | 12 | 10 | 13 |
| A4 | 59.14 | 19 | 28 | 27 |
| A5 | 58.82 | 14 | 26 | 14 |
| A6 | 26.19 | 93 | 15 | 51 |
| A7 | 24.53 | 120 | 13 | 65 |
| A8 | 24.81 | 50 | 12 | 21 |
| A9 | 24.56 | 86 | 9 | 47 |
| A10 | 25.44 | 85 | 16 | 42 |
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i3 from sample A1 / Example spliced isoformGTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGTTTGCTTTCACTCTCTGATCTCTCTTGAGTGCTTTCAATCTTTACATAGGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGG
TCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAGAAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTGCTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGG
TGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAATGGAAATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGT
TAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGTAGAGCTTTTGGAGACAATTATTCTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCGTAGTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCA
TGATTGAGCTTTTGGAGACAATTATTTTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCTTATTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGGCCATCGTTCTCTAATATCCTTTCTCTATTTGCAATATT
TACTTTCAAAGCCTCTATCCTGTTTGCTTTGTAGACACTTTTTCAACTAAACTTTATTTGCATCGATTATCGTTTTTACTTTTAATTTCTATGGTAAGCAATAATTGGATTGGATACCAGGCATTTTATAATGGAACATTTATCCTTTGGTTAGTTTGAAAATTTAAAGCTAATATTTCAGAGGAAGCTTCGTCCAAATT
AAAGTTGTAATGTGTAATGCAACTCTAGGGAAGCTGGTGGAAGGCACAGGCAAAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACA
ACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCTTCAACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTT
CTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACAAATCCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACC
GTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGTGCATTTGTGTTGACGTTTTAGTTAGGACCAATCCTTCACATGCACACCTCATCTTTTGGGGGGTTGTGGTGTGCATTTGTGTTGAGCTTATAGTTAGGACCAATCATTCACACGTGTACACACATGACCTCCCTTTTAGGGGTTGCGGTGT
GCATGCACACCTCATCCTTTCGGGGGTTCTGTGCATTTATTTTGACATTTTAGAGAGGACCAACCCTTCATGTGTACACATTTGCACACCTCATCTCTCTGGGGGTTGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGGACCAACCCTTCACATGTGTACACAAATGCACACCTCACCCTTTTGGGGTTTCTGTGTATTTGT
GTTGACCTTTTAATTAGTACCTTCGACCAACCCTTCACACATGCACATTGCTGGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGgtacctgaagaagcccatttcagtgttttctcctatttccgttgattttctgtgtattctagtgtctaggg
ttttataagccttcattaaatttcaaaattactgcagggttttagtgagctagggttagatggcttttagaagttttgacatatgcgaatgagtcttgtatttttagaaaattatatggttcacatgatatatcgcttgatcataatccgtctgttgatataataactgacgaggttttctcatttcagTTTGCTTTCAC
TCTCTGATCTCTCTTGAGTGCTTTCAATCTTTACATAGGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGGTCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAGAAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGGTATGTATAAACATTTATGGAACTTTCTTTTACTATAGAAAATAGAGAGCTGCAGCCCGATCATT
CGTTTATAGTAGAGGTTATTAATGAATCGAATACTGTGCTAAAGATAGTACACGTTATGCGGTTGGTGGGTTTTCTTTAGCAGCCCCAACTCTTTAATATGCATTTTCTCATGGTTTCTTTGTGACTTTTGTATCAGTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTG
CTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGGTATATGTTTTATTTGAACTTCTTTGTGATCTTCTTGTCACAGCCTCTTCTGTATCATTCAGATGTTTGGACAGTACATTTTAGTGTTGGTATTGTTTGAACATCAAGTCACATTAGGGGTGCTGAATAGGGCAGTAGACCTTGACTTTTTGTGAGTCAGTGA
TTCTTGTAGTCTTATGGTCAGTACATCGAATATTATTTTTAGTGGCATTTATGAATATTGAAGCTATCCATAGCGTTTTTTAAAGTAATTTATTTTAATTCAAAAATTGGGTTGTGTCTGCAGTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGGTGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAATGGA
AATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGTTAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGTAGA
GCTTTTGGAGACAATTATTCTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCGTAGTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGAGCTTTTGGAGACAATTATTTTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCA
TGTTTCTTATTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGGCCATCGTTCTCTAATATCCTTTCTCTATTTGCAATATTTACTTTCAAAGCCTCTATCCTGTTTGCTTTGTAGACACTTTTTCAACTAAAC
TTTATTTGCATCGATTATCGTTTTTACTTTTAATTTCTATGGTAAGCAATAATTGGATTGGATACCAGGCATTTTATAATGGAACATTTATCCTTTGGTTAGTTTGAAAATTTAAAGCTAATATTTCAGAGGAAGCTTCGTCCAAATTAAAGTTGTAATGTGTAATGCAACTCTAGGGAAGCTGGTGGAAGGCACAGGCA
AAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACAACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCTTCA
ACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTTCTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACAAAT
CCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACCGTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGTGCA
TTTGTGTTGACGTTTTAGTTAGGACCAATCCTTCACATGCACACCTCATCTTTTGGGGGGTTGTGGTGTGCATTTGTGTTGAGCTTATAGTTAGGACCAATCATTCACACGTGTACACACATGACCTCCCTTTTAGGGGTTGCGGTGTGCATGCACACCTCATCCTTTCGGGGGTTCTGTGCATTTATTTTGACATTTTA
GAGAGGACCAACCCTTCATGTGTACACATTTGCACACCTCATCTCTCTGGGGGTTGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGGACCAACCCTTCACATGTGTACACAAATGCACACCTCACCCTTTTGGGGTTTCTGTGTATTTGTGTTGACCTTTTAATTAGTACCTTCGACCAACCCTTCACACATGCACATTGCT
GGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC
Intron 2 GTATATGTTT ... GTGTCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.01 | 117.7 | 29.7 | 32 |
| A2 | 17.43 | 165.7 | 36 | 21 |
| A3 | 9.41 | 165.3 | 19.7 | 17 |
| A4 | 9.71 | 151.7 | 17.8 | 13 |
| A5 | 21.85 | 103.7 | 30.2 | 12 |
| A6 | 5.85 | 1483 | 100.7 | 110 |
| A7 | 4.93 | 1391.2 | 85.3 | 133 |
| A8 | 5.39 | 1008 | 64.8 | 107 |
| A9 | 5.07 | 1126.7 | 70 | 98 |
| A10 | 5.52 | 1122.7 | 78 | 104 |
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i3 from sample A1 / Example spliced isoformGTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGTTTGCTTTCACTCTCTGATCTCTCTTGAGTGCTTTCAATCTTTACATAGGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGG
TCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAGAAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTGCTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGG
TGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAATGGAAATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGT
TAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGTAGAGCTTTTGGAGACAATTATTCTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCGTAGTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCA
TGATTGAGCTTTTGGAGACAATTATTTTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCTTATTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGGCCATCGTTCTCTAATATCCTTTCTCTATTTGCAATATT
TACTTTCAAAGCCTCTATCCTGTTTGCTTTGTAGACACTTTTTCAACTAAACTTTATTTGCATCGATTATCGTTTTTACTTTTAATTTCTATGGTAAGCAATAATTGGATTGGATACCAGGCATTTTATAATGGAACATTTATCCTTTGGTTAGTTTGAAAATTTAAAGCTAATATTTCAGAGGAAGCTTCGTCCAAATT
AAAGTTGTAATGTGTAATGCAACTCTAGGGAAGCTGGTGGAAGGCACAGGCAAAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACA
ACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCTTCAACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTT
CTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACAAATCCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACC
GTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGTGCATTTGTGTTGACGTTTTAGTTAGGACCAATCCTTCACATGCACACCTCATCTTTTGGGGGGTTGTGGTGTGCATTTGTGTTGAGCTTATAGTTAGGACCAATCATTCACACGTGTACACACATGACCTCCCTTTTAGGGGTTGCGGTGT
GCATGCACACCTCATCCTTTCGGGGGTTCTGTGCATTTATTTTGACATTTTAGAGAGGACCAACCCTTCATGTGTACACATTTGCACACCTCATCTCTCTGGGGGTTGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGGACCAACCCTTCACATGTGTACACAAATGCACACCTCACCCTTTTGGGGTTTCTGTGTATTTGT
GTTGACCTTTTAATTAGTACCTTCGACCAACCCTTCACACATGCACATTGCTGGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGGTACCTGAAGAAGCCCATTTCAGTGTTTTCTCCTATTTCCGTTGATTTTCTGTGTATTCTAGTGTCTAGGG
TTTTATAAGCCTTCATTAAATTTCAAAATTACTGCAGGGTTTTAGTGAGCTAGGGTTAGATGGCTTTTAGAAGTTTTGACATATGCGAATGAGTCTTGTATTTTTAGAAAATTATATGGTTCACATGATATATCGCTTGATCATAATCCGTCTGTTGATATAATAACTGACGAGGTTTTCTCATTTCAGTTTGCTTTCAC
TCTCTGATCTCTCTTGAGTGCTTTCAATCTTTACATAGGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGGTCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAGAAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGGTATGTATAAACATTTATGGAACTTTCTTTTACTATAGAAAATAGAGAGCTGCAGCCCGATCATT
CGTTTATAGTAGAGGTTATTAATGAATCGAATACTGTGCTAAAGATAGTACACGTTATGCGGTTGGTGGGTTTTCTTTAGCAGCCCCAACTCTTTAATATGCATTTTCTCATGGTTTCTTTGTGACTTTTGTATCAGTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTG
CTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGgtatatgttttatttgaacttctttgtgatcttcttgtcacagcctcttctgtatcattcagatgtttggacagtacattttagtgttggtattgtttgaacatcaagtcacattaggggtgctgaatagggcagtagaccttgactttttgtgagtcagtga
ttcttgtagtcttatggtcagtacatcgaatattatttttagtggcatttatgaatattgaagctatccatagcgttttttaaagtaatttattttaattcaaaaattgggttgtgtctgcagTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGGTGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAATGGA
AATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGTTAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGTAGA
GCTTTTGGAGACAATTATTCTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCGTAGTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGAGCTTTTGGAGACAATTATTTTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCA
TGTTTCTTATTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGGCCATCGTTCTCTAATATCCTTTCTCTATTTGCAATATTTACTTTCAAAGCCTCTATCCTGTTTGCTTTGTAGACACTTTTTCAACTAAAC
TTTATTTGCATCGATTATCGTTTTTACTTTTAATTTCTATGGTAAGCAATAATTGGATTGGATACCAGGCATTTTATAATGGAACATTTATCCTTTGGTTAGTTTGAAAATTTAAAGCTAATATTTCAGAGGAAGCTTCGTCCAAATTAAAGTTGTAATGTGTAATGCAACTCTAGGGAAGCTGGTGGAAGGCACAGGCA
AAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACAACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCTTCA
ACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTTCTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACAAAT
CCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACCGTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGTGCA
TTTGTGTTGACGTTTTAGTTAGGACCAATCCTTCACATGCACACCTCATCTTTTGGGGGGTTGTGGTGTGCATTTGTGTTGAGCTTATAGTTAGGACCAATCATTCACACGTGTACACACATGACCTCCCTTTTAGGGGTTGCGGTGTGCATGCACACCTCATCCTTTCGGGGGTTCTGTGCATTTATTTTGACATTTTA
GAGAGGACCAACCCTTCATGTGTACACATTTGCACACCTCATCTCTCTGGGGGTTGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGGACCAACCCTTCACATGTGTACACAAATGCACACCTCACCCTTTTGGGGTTTCTGTGTATTTGTGTTGACCTTTTAATTAGTACCTTCGACCAACCCTTCACACATGCACATTGCT
GGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC
Intron 3 GTACCTGAAG ... CTTTACATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 8.05 | 254.7 | 13.9 | 23.4 |
| A2 | 8.2 | 349.1 | 28 | 32.3 |
| A3 | 7.38 | 353.7 | 9.7 | 29.9 |
| A4 | 11.02 | 245 | 27.7 | 32 |
| A5 | 10.56 | 177 | 26 | 22.1 |
| A6 | 6.38 | 2118.3 | 13.4 | 156.7 |
| A7 | 5.91 | 2679.4 | 12.4 | 182.4 |
| A8 | 4.14 | 1710.9 | 10.6 | 82.9 |
| A9 | 6.27 | 2033.6 | 7.9 | 148.1 |
| A10 | 5.19 | 2433.1 | 13.7 | 143.9 |
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i2 from sample A1 / Example spliced isoformGTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGGTCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAG
AAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTGCTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGGTGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAAT
GGAAATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGTTAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGT
AGAGCTTTTGGAGACAATTATTCTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCGTAGTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGAGCTTTTGGAGACAATTATTTTAAAATGCTTTGAGGAATAGAA
TCATGTTTCTTATTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGGCCATCGTTCTCTAATATCCTTTCTCTATTTGCAATATTTACTTTCAAAGCCTCTATCCTGTTTGCTTTGTAGACACTTTTTCAACTA
AACTTTATTTGCATCGATTATCGTTTTTACTTTTAATTTCTATGGTAAGCAATAATTGGATTGGATACCAGGCATTTTATAATGGAACATTTATCCTTTGGTTAGTTTGAAAATTTAAAGCTAATATTTCAGAGGAAGCTTCGTCCAAATTAAAGTTGTAATGTGTAATGCAACTCTAGGGAAGCTGGTGGAAGGCACAG
GCAAAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACAACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCT
TCAACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTTCTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACA
AATCCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACCGTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGT
GCATTTGTGTTGACGTTTTAGTTAGGACCAATCCTTCACATGCACACCTCATCTTTTGGGGGGTTGTGGTGTGCATTTGTGTTGAGCTTATAGTTAGGACCAATCATTCACACGTGTACACACATGACCTCCCTTTTAGGGGTTGCGGTGTGCATGCACACCTCATCCTTTCGGGGGTTCTGTGCATTTATTTTGACATT
TTAGAGAGGACCAACCCTTCATGTGTACACATTTGCACACCTCATCTCTCTGGGGGTTGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGGACCAACCCTTCACATGTGTACACAAATGCACACCTCACCCTTTTGGGGTTTCTGTGTATTTGTGTTGACCTTTTAATTAGTACCTTCGACCAACCCTTCACACATGCACATT
GCTGGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGgtacctgaagaagcccatttcagtgttttctcctatttccgttgattttctgtgtattctagtgtctaggg
ttttataagccttcattaaatttcaaaattactgcagggttttagtgagctagggttagatggcttttagaagttttgacatatgcgaatgagtcttgtatttttagaaaattatatggttcacatgatatatcgcttgatcataatccgtctgttgatataataactgacgaggttttctcatttcagtttgctttcac
tctctgatctctcttgagtgctttcaatctttacatagGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGGTCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAGAAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGGTATGTATAAACATTTATGGAACTTTCTTTTACTATAGAAAATAGAGAGCTGCAGCCCGATCATT
CGTTTATAGTAGAGGTTATTAATGAATCGAATACTGTGCTAAAGATAGTACACGTTATGCGGTTGGTGGGTTTTCTTTAGCAGCCCCAACTCTTTAATATGCATTTTCTCATGGTTTCTTTGTGACTTTTGTATCAGTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTG
CTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGGTATATGTTTTATTTGAACTTCTTTGTGATCTTCTTGTCACAGCCTCTTCTGTATCATTCAGATGTTTGGACAGTACATTTTAGTGTTGGTATTGTTTGAACATCAAGTCACATTAGGGGTGCTGAATAGGGCAGTAGACCTTGACTTTTTGTGAGTCAGTGA
TTCTTGTAGTCTTATGGTCAGTACATCGAATATTATTTTTAGTGGCATTTATGAATATTGAAGCTATCCATAGCGTTTTTTAAAGTAATTTATTTTAATTCAAAAATTGGGTTGTGTCTGCAGTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGGTGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAATGGA
AATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGTTAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGTAGA
GCTTTTGGAGACAATTATTCTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCGTAGTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGAGCTTTTGGAGACAATTATTTTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCA
TGTTTCTTATTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCATGATTGGCCATCGTTCTCTAATATCCTTTCTCTATTTGCAATATTTACTTTCAAAGCCTCTATCCTGTTTGCTTTGTAGACACTTTTTCAACTAAAC
TTTATTTGCATCGATTATCGTTTTTACTTTTAATTTCTATGGTAAGCAATAATTGGATTGGATACCAGGCATTTTATAATGGAACATTTATCCTTTGGTTAGTTTGAAAATTTAAAGCTAATATTTCAGAGGAAGCTTCGTCCAAATTAAAGTTGTAATGTGTAATGCAACTCTAGGGAAGCTGGTGGAAGGCACAGGCA
AAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACAACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCTTCA
ACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTTCTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACAAAT
CCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACCGTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGTGCA
TTTGTGTTGACGTTTTAGTTAGGACCAATCCTTCACATGCACACCTCATCTTTTGGGGGGTTGTGGTGTGCATTTGTGTTGAGCTTATAGTTAGGACCAATCATTCACACGTGTACACACATGACCTCCCTTTTAGGGGTTGCGGTGTGCATGCACACCTCATCCTTTCGGGGGTTCTGTGCATTTATTTTGACATTTTA
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GGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC
Intron 4 GTATGTATAA ... TTTGTATCAG
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| A2 | 17.12 | 510 | 115.8 | 6.3 |
| A3 | 14.24 | 576.3 | 106 | 11 |
| A4 | 14.01 | 423 | 76.8 | 11.8 |
| A5 | 15.43 | 325 | 64.3 | 12.8 |
| A6 | 11.39 | 4683.3 | 651.3 | 13.3 |
| A7 | 14.95 | 4265.9 | 871 | 16.3 |
| A8 | 14.23 | 2816 | 535.5 | 12 |
| A9 | 13.42 | 3520.1 | 614.5 | 9.8 |
| A10 | 15.34 | 3587.9 | 753.3 | 10.8 |
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i3 from sample A1 / Example spliced isoformGTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGTTTGCTTTCACTCTCTGATCTCTCTTGAGTGCTTTCAATCTTTACATAGGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGG
TCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAGAAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTGCTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGG
TGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAATGGAAATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGT
TAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGTAGAGCTTTTGGAGACAATTATTCTAAAATGCTTTGAGGAATAGAATCATGTTTCGTAGTTCATTAAAATCTCTGGTTAATTGAACAACGAAAGGACTTCGTTTTTATTCCAAATGCCAAGACACCATATAGGGTTATTGTTGATGCTTTCA
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TACTTTCAAAGCCTCTATCCTGTTTGCTTTGTAGACACTTTTTCAACTAAACTTTATTTGCATCGATTATCGTTTTTACTTTTAATTTCTATGGTAAGCAATAATTGGATTGGATACCAGGCATTTTATAATGGAACATTTATCCTTTGGTTAGTTTGAAAATTTAAAGCTAATATTTCAGAGGAAGCTTCGTCCAAATT
AAAGTTGTAATGTGTAATGCAACTCTAGGGAAGCTGGTGGAAGGCACAGGCAAAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACA
ACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCTTCAACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTT
CTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACAAATCCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACC
GTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGTGCATTTGTGTTGACGTTTTAGTTAGGACCAATCCTTCACATGCACACCTCATCTTTTGGGGGGTTGTGGTGTGCATTTGTGTTGAGCTTATAGTTAGGACCAATCATTCACACGTGTACACACATGACCTCCCTTTTAGGGGTTGCGGTGT
GCATGCACACCTCATCCTTTCGGGGGTTCTGTGCATTTATTTTGACATTTTAGAGAGGACCAACCCTTCATGTGTACACATTTGCACACCTCATCTCTCTGGGGGTTGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGGACCAACCCTTCACATGTGTACACAAATGCACACCTCACCCTTTTGGGGTTTCTGTGTATTTGT
GTTGACCTTTTAATTAGTACCTTCGACCAACCCTTCACACATGCACATTGCTGGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC
>TRINITY_DN116131_c1_g2_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:GTCCTAATATTTATGGCGTCCTCTATTTACTTGCATTAGGGTTTGAAACCAGTATAGTGTTGGATACACGAAAGCGTGAGGGAAGGAGCAACAGCGCGAGGAAGGAGCGACATCTTATCAGTTAAAACGGTACCTGAAGAAGCCCATTTCAGTGTTTTCTCCTATTTCCGTTGATTTTCTGTGTATTCTAGTGTCTAGGG
TTTTATAAGCCTTCATTAAATTTCAAAATTACTGCAGGGTTTTAGTGAGCTAGGGTTAGATGGCTTTTAGAAGTTTTGACATATGCGAATGAGTCTTGTATTTTTAGAAAATTATATGGTTCACATGATATATCGCTTGATCATAATCCGTCTGTTGATATAATAACTGACGAGGTTTTCTCATTTCAGTTTGCTTTCAC
TCTCTGATCTCTCTTGAGTGCTTTCAATCTTTACATAGGTTGCGAGGTTGAATTTGGTGGTCTTGTATCGAAGATGCCTCACTCTGCAGTATGGAATTCTCACCCCAAGAAATATGGGCCTGGATCTCGCGCCTGgtatgtataaacatttatggaactttcttttactatagaaaatagagagctgcagcccgatcatt
cgtttatagtagaggttattaatgaatcgaatactgtgctaaagatagtacacgttatgcggttggtgggttttctttagcagccccaactctttaatatgcattttctcatggtttctttgtgacttttgtatcagTCGGGTGTGTGGTAATCCACATGGCATGATAAGGAAATATGGTCTTAACTGTTGTAGACAGTG
CTTTCGCACATATGCCAAGGACATTGGATTTGTTAAGGTATATGTTTTATTTGAACTTCTTTGTGATCTTCTTGTCACAGCCTCTTCTGTATCATTCAGATGTTTGGACAGTACATTTTAGTGTTGGTATTGTTTGAACATCAAGTCACATTAGGGGTGCTGAATAGGGCAGTAGACCTTGACTTTTTGTGAGTCAGTGA
TTCTTGTAGTCTTATGGTCAGTACATCGAATATTATTTTTAGTGGCATTTATGAATATTGAAGCTATCCATAGCGTTTTTTAAAGTAATTTATTTTAATTCAAAAATTGGGTTGTGTCTGCAGTATCGCTAAGAGATGGATTCGATGGTGAAGGCGCTGCAGGATTGGCAGTAGACCCTTTCCATTCTAGAATCAATGGA
AATGATTTATTATGGGAAATTCATGTTCAATTTGATTTACTTTGGGTTTTTGTCTGTTGTTTTTCATTATGTTGCTCTAGTTCCATTCCGTCATTCCAGAACTCATTGATGGAAAGATCGAAGTACTTGATAAAGTGTCAAGTTTTGTTAGGGCTGATTTACGCTGATTTATAATTCTACATCTAGGCTATATCTGTAGA
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AAGAAGAATGTAATATAGCTAAGCATTTTCTCAACTGATAATAGATCGAATGTCTTATGAGATTATAGTCAACTGTCCCAAAACCTATAACTGGTTTTTGAATTTGTAGGGCCTATGAACAGAATGCCCAACTGTACAAGAATCCACAACAGAGAATGTGTAATTTGTTTTAATTTGCCTTTTGCATCCTGCTGGCTTCA
ACTTGTGTTCCCACAATTATTGCTATTTTACCACATTATGGAGTATCATTTTCTCCGATCTGACTTTATTTTATTTGGTTTTGTTTGTGCCATTGGAAGAGCAGTTAATTGTTTTCAAATTGTTATGCTGTTCTGCGTTTGCTAATTTCTTCCACCTGTGGGAGGAGGGGTGGGCGAAGGTGTGTACTGTGTACACAAAT
CCATGCCTCACCTTTTGGGGCGTTTTGGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGAACCAACCCTTCAGATGTGTACACATATGCACTCCTCATCATTTTGGGGATTGTGGTGTGCATTTGTGTTGTCCTTTTAGTTAGGACCAACCGTTCACATAGTTACACATGCACACCTCATCTCTTTGGGGGCTGTGGTGTGCA
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GAGAGGACCAACCCTTCATGTGTACACATTTGCACACCTCATCTCTCTGGGGGTTGTGTGCATTTGTGTTGACCTTTTAGTTAGGACCAACCCTTCACATGTGTACACAAATGCACACCTCACCCTTTTGGGGTTTCTGTGTATTTGTGTTGACCTTTTAATTAGTACCTTCGACCAACCCTTCACACATGCACATTGCT
GGATTCATGGGATAAATGAGTGTAGACCCGTTATGACCAAGCAGGTTGTCCAACCTAAGTATTTTTAAAATGTACATTACCATCC