sp|Q9LZQ9|DEAH2_ARATH ----> Probable pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DEAH2


Intron 1 GTATGTTCTC ... CTTTCTATAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A140.21291128
A239.78282215
A347.92251729
A448.84221527
A556.768129
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A743.88392338
A846.6720926
A934.88421431
A1046.09311934



>TRINITY_DN104158_c0_g2_i3 from sample A3 / Example spliced isoform
CATTGATACTTTACATTGTTCGTAAGAAATCATTTAATCCTTTCTTCCATCACTTCCAGACCGTCCGATTGAGCGATCGCATCCGTCCAGCAGGCCCTTGGAACTGGTAACCCTAGATAGCGATCTCCGTGTGAAAGCTCCGGGCCACCGGCGTCGGGGAGGCAGGGAAGCTCATTTTGCTTTGCCGATCTTGTACAGTT
GATATCCCAATCCCCCACTACGCGTTATTTCCTGTTCTCGGGATCGAATCTCGTTGAGAATCAAATTGCGTCGGACTAAATAGTTAAGTGTTCGATGGGCTATTCTGAGCGGAAAAAGAAAGTGAGCCTGTTTGATGTGGTAAGCGAAAACGCTGATGGTTTCAACAAGACGAACGCCGACGGAATGGCCGCTGTTACGA
ACCGCTGGAACAATCGCCCGTATTCCCCCAGGTACTATGAAATCCTCGATAAAAGAAAAACCCTACCGGTGTGGCAGCAGCGACATGAGTTCCTCGACATGCTTGACAAATCTCAGACCTTGATTTTGGTTGGAGAGACCGGCAGCGGCAAGACCACACAGATTCCCCAATTTGTGGTAGAGGCTGGGTACACTAACAAT
CGGAAACAGATTGCTTGCACCCAACCTCGCAGGGTGGCTGCTATGTCTGTTTCTCGTCGTGTAGCAGAGGAAATGGATGTGACAATTGGAGAAGAAGTTGGATATAGCATCCGGTTTGAAGATTGCAGTAGTCCAAAGACTGTTTTGAAGTACTTGACAGATGGAATGCTTCTCAGAGAAGCAATGGCTGATCCACTTTT
AGAGCGTTACAGAGTGATTATTCTGGATGAAGCTCATGAAAGGACATTAGCTACAGATGTTCTTTTTGGATTACTTAAGGAAGTTGTAAAGAATAGACCTGATTTGAAGCTTGTTGTAATGAGTGCAACATTAGAGGCAGAAAAATTTCAAGCATATTTCAATGGGGCACCTCTTATGAAAGTACCTGGAAGGTTACATC
CAGTTGAGATATTCTTCACTCAGGAACCTGAGAAAGATTACTTAGAAGCAGCAATTAGGACGGTTGTTCAAATACACATATGTGAACGACCTGGGGACATGCTTATTTTCCTCACCGGGGAGGAGGAAATAGAAGATGCTTGTAGAAAAATTACTAGGGAGGTACAGAATTTGGGTGATCAGGCTGGGCCTTTGAAAGTT
GTTCCTTTATATTCAACCCTTCCTCCAGCCATGCAGCAAAGGATATTTGAGCCAGCTCCACCACCCACAAAGGAGGGTGGTCGTCCAGGAAGAAAAATAGTGGTATCCACTAATATTGCAGAAACATCACTGACTATTGATGGCATAGTGTATGTGATTGATCCTGGTTTTTCAAAACAGAAAGTATACAACCCTAGAGT
GCGTGTTGAGTCATTACTTGTTTCTCCTATATCAAAAGCAAGTGCTCATCAGAGAGCAGGTCGGGCTGGGCGTACACAGCCTGGAAAATGTTTCAGACTGTACACAGAGATGAGTTTTCAGAATGACCTTCAACCACAGACGTATCCTGAAATTTTGCGGTCAAATCTTGCGAATGTAGTTCTGACCCTGAAAAAACTGG
GGATTGATGATCTGGTGCATTTTGATTTTATGGATCCTCCTGCCCCAGAAACTTTGATGCGTGCACTAGAGCTTTTGAACTATTTGGGTGCATTGGATGAAGATGGGAGTTTGACAAAGCTGGGAGAGCTGATGAGTGAATTTCCACTGGACCCACAGATGTCCAGGATGTTAGTCAGCAGCCCCAATTTCAACTGCTCT
AATGAGATTCTTTCCATCACTGCTATGCTTTCAGTCCCAAATTGCTTTCTCCGGCCACGGGAGGCCCAGAAGGCTGCAGATGAAGCAAAGGCTTGTTTTGCACACGTTGATGGGGATCATCTTACGTTGCTGAATGTATATCACGCATACAAGCAGAACAAGGAAGATCCAAATTGGTGCTACGAAAATTTTATAAATAC
AAGGGCTCTCAAAGTTGCTGACAATGTAAGACAGCAGTTAGTTCGTATCATGACAAGATACAACCTCAAGCTGTGTAGCACGGATTTTAAAAGTCCCGAGTACTATCTTAATTTGAGGAAGGCAATGCTCGCAGGCTATTTCATGCAGGTGGCTCATCGAGAGCGGAGTGGACAGTATCTCACAGTAAAAGATAATCAGA
TTGTCCAGTTGCATCCTTCAACCTGTGTTGATCATAAGCCAGAATGGGTCCTATACAATGAGTATGTGTTGACTAGTAGTAATTTTGTTCGTGTCGTCACTGATATTCGAGGAGAGTGGCTGATAGATATCGCTCCTCATTATTACGACCTTAGCAACTTTCCTCAGTGCGAGGCAAAGTGTGTCTTGGAGAGGCTTTAT
AACAAGCGTGAAAGAGACAAATCGGTTCGTAAGCATAAGGGTAAAAGAACAGTTCTTAAATCAGCTTTATGTTAGCAAGATCTATGCTCTCTCTATTCGTCTGAGAAAGTTAAATACATATATGGTTTATAGAGGCCATATTGTTGACTGAAGGTCCAGACTAAAACATATGGAATGAACTTGTTCATTGGGGAAATTGT
ATGGCATGTTAAACTAAGTTGCTGTTATTACCAGCATCATATTGTTTTCTTGAAATAATGTAATTTATAATGTATTGGTCTCTATTTCATTCGGCA


>TRINITY_DN104158_c0_g2_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CATTGATACTTTACATTGTTCGTAAGAAATCATTTAATCCTTTCTTCCATCACTTCCAGACCGTCCGATTGAGCGATCGCATCCGTCCAGCAGGCCCTTGGAACTGGTAACCCTAGATAGCGATCTCCGTGTGAAAGCTCCGGGCCACCGGCGTCGGGGAGGCAGGGAAGCTCATTTTGCTTTGCCGATCTTGTACAGTT
GATATCCCAATCCCCCACTACGCGTTATTTCCTGTTCTCGGGATCGAATCTCGTTGAGAATCAAATTGCGTCGGACTAAATAGTTAAGTGTTCGATGGGCTATTCTGAGCGGAAAAAGAAAGTGAGCCTGTTTGATGTGGTAAGCGAAAACGCTGATGGTTTCAACAAGACGAACGCCGACGGAATGGCCGCTGTTACGA
ACCGCTGGAACAATCGCCCGTATTCCCCCAGGTACTATGAAATCCTCGATAAAAGAAAAACCCTACCGGTGTGGCAGCAGCGACATGAGTTCCTCGACATGCTTGACAAATCTCAGACCTTGATTTTGGTTGGAGAGACCGGCAGCGGCAAGACCACACAGATTCCCCAATTTGTGGTAGAGGCTGGGTACACTAACAAT
CGGAAACAGATTGCTTGCACCCAACCTCGCAGGGTGGCTGCTATGTCTGTTTCTCGTCGTGTAGCAGAGGAAATGGATGTGACAATTGGAGAAGAAGTTGGATATAGCATCCGGTTTGAAGATTGCAGTAGTCCAAAGACTGTTTTGAAGTACTTGACAGATGGAATGCTTCTCAGAGAAGCAATGGCTGATCCACTTTT
AGAGCGTTACAGAGTGATTATTCTGGATGAAGCTCATGAAAGGACATTAGCTACAGATGTTCTTTTTGGATTACTTAAGGAAGTTGTAAAGAATAGACCTGATTTGAAGCTTGTTGTAATGAGTGCAACATTAGAGGCAGAAAAATTTCAAGCATATTTCAATGGGGCACCTCTTATGAAAGTACCTGGAAGGTTACATC
CAGTTGAGATATTCTTCACTCAGGAACCTGAGAAAGATTACTTAGAAGCAGCAATTAGGACGGTTGTTCAAATACACATATGTGAACGACCTGGGGACATGCTTATTTTCCTCACCGGGGAGGAGGAAATAGAAGATGCTTGTAGAAAAATTACTAGGGAGGTACAGAATTTGGGTGATCAGGCTGGGCCTTTGAAAGTT
GTTCCTTTATATTCAACCCTTCCTCCAGCCATGCAGCAAAGGATATTTGAGCCAGCTCCACCACCCACAAAGGAGGGTGGTCGTCCAGGAAGAAAAATAGTGGTATCCACTAATATTGCAGAAACATCACTGACTATTGATGGCATAGTGTATGTGATTGATCCTGGTTTTTCAAAACAGAAAGTATACAACCCTAGAGT
GCGTGTTGAGTCATTACTTGTTTCTCCTATATCAAAAGCAAGTGCTCATCAGAGAGCAGGTCGGGCTGGGCGTACACAGCCTGGAAAATGTTTCAGACTGTACACAGAGATGAGTTTTCAGAATGACCTTCAACCACAGACGTATCCTGAAATTTTGCGGTCAAATCTTGCGAATGTAGTTCTGACCCTGAAAAAACTGG
GGATTGATGATCTGGTGCATTTTGATTTTATGGATCCTCCTGCCCCAGAAACTTTGATGCGTGCACTAGAGCTTTTGAACTATTTGGGTGCATTGGATGAAGATGGGAGTTTGACAAAGCTGGGAGAGCTGATGAGTGAATTTCCACTGGACCCACAGATGTCCAGGATGTTAGTCAGCAGCCCCAATTTCAACTGCTCT
AATGAGATTCTTTCCATCACTGCTATGCTTTCAGgtatgttctcagtcataattgtttcaaagtctgcagctgtctgatgctttgtttgatgtggtcaataggtaaaggttaaatttttgtttttgtttttactggggtgggggattagtcttccgtctgcatttatcttagcttaggcatagtctggttgctgtgtgac
ctagattctttaagtttagcgatgatgcagatagctgcagttctctatgcacaagtcatggtgcatgtggtgtggtctcgcctctatgcatctgctgaccttccgtgggcctcatctgtgataacaaatttctctttctatag
TCCCAAATTGCTTTCTCCGGCCACGGGAGGCCCAGAAGGCTGCAGATGAAGCAAAGG
CTTGTTTTGCACACGTTGATGGGGATCATCTTACGTTGCTGAATGTATATCACGCATACAAGCAGAACAAGGAAGATCCAAATTGGTGCTACGAAAATTTTATAAATACAAGGGCTCTCAAAGTTGCTGACAATGTAAGACAGCAGTTAGTTCGTATCATGACAAGATACAACCTCAAGCTGTGTAGCACGGATTTTAAA
AGTCCCGAGTACTATCTTAATTTGAGGAAGGCAATGCTCGCAGGCTATTTCATGCAGGTGGCTCATCGAGAGCGGAGTGGACAGTATCTCACAGTAAAAGATAATCAGATTGTCCAGTTGCATCCTTCAACCTGTGTTGATCATAAGCCAGAATGGGTCCTATACAATGAGTATGTGTTGACTAGTAGTAATTTTGTTCG
TGTCGTCACTGATATTCGAGGAGAGTGGCTGATAGATATCGCTCCTCATTATTACGACCTTAGCAACTTTCCTCAGTGCGAGGCAAAGTGTGTCTTGGAGAGGCTTTATAACAAGCGTGAAAGAGACAAATCGGTTCGTAAGCATAAGGGTAAAAGAACAGTTCTTAAATCAGCTTTATGTTAGCAAGATCTATGCTCTC
TCTATTCGTCTGAGAAAGTTAAATACATATATGGTTTATAGAGGCCATATTGTTGACTGAAGGTCCAGACTAAAACATATGGAATGAACTTGTTCATTGGGGAAATTGTATGGCATGTTAAACTAAGTTGCTGTTATTACCAGCATCATATTGTTTTCTTGAAATAATGTAATTTATAATGTATTGGTCTCTATTTCATT
CGGCA




Intron 2 GTAAGTGCAC ... ACTGTAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A441.1820141
A551.5677.50.5
A626.48100.3360
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A827.8114.5442
A924.4115371.3
A1022.3876.5221



>TRINITY_DN100527_c0_g1_i9 from sample A4 / Example spliced isoform
ATTCCCCAATTTGTGGTAGAGGCTGGGTACACTAACAATCGGAAACAGATTGCTTGCACCCAACCTCGCAGGGTGGCTGCTATGTCTGTTTCTCGTCGTGTAGCAGAGGAAATGGATGTGACAATTGGAGAAGAAGTTGGATATAGCATCCGGTTTGAAGATTGCAGTAGTCCAAAGACTGTTTTGAAGTACTTGACAGA
TGGAATGCTTCTCAGAGAAGCAATGGCTGATCCACTTTTAGAGCGTTACAGAGTGATTATTCTGGATGAAGCTCATGAAAGGACATTAGCTACAGATGTTCTTTTTGGATTACTTAAGGAAGTTGTAAAGAATAGACCTGATTTGAAGCTTGTTGTAATGAGTGCAACATTAGAGGCAGAAAAATTTCAAGCATATTTCA
ATGGGGCACCTCTTATGAAAGTACCTGGAAGGTTACATCCAGTTGAGATATTCTTCACTCAGGAACCTGAGAAAGATTACTTAGAAGCAGCAATTAGGACGGTTGTTCAAATACACATATGTGAACGACCTGGGGACATGCTTATTTTCCTCACCGGGGAGGAGGAAATAGAAGATGCTTGTAGAAAAATTACTAGGGAG
GTACAGAATTTGGGTGATCAGGCTGGGCCTTTGAAAGTTGTTCCTTTATATTCAACCCTTCCTCCAGCCATGCAGCAAAGGATATTTGAGCCAGCTCCACCACCCACAAAGGAGGGTGGTCGTCCAGGAAGAAAAATAGTGGTATCCACTAATATTGCAGAAACATCACTGACTATTGATGGCATAGTGTATGTGATTGA
TCCTGGTTTTTCAAAACAGAAAGTGTACAACCCTAGAGTGCGTGTTGAGTCATTACTTGTTTCTCCTATATCAAAAGCAAGTGCTCATCAGAGAGCAGGTCGGGCTGGGCGTACACAGCCTGGAAAATGTTTCAGACTGTACACAGAGATGAGTTTTCAGAATGACCTTCAACCACAGACGTATCCTGAAATTTTGCGGT
CAAATCTTGCGAATGTAGTTCTGACCCTGAAAAAACTGGGGATTGATGATCTGGTGCATTTTGATTTTATGGATCCTCCTGCCCCAGAAACTTTGATGCGTGCACTAGAGCTTTTGAACTATTTGGGTGCATTGGATGAAGATGGGAGTTTGACAAAGCTGGGAGAGCTGATGAGTGAATTTCCACTGGACCCACAGATG
TCCAGGATGTTAGTCAGCAGCCCCAATTTCAACTGCTCTAATGAGATTCTTTCCATCACTGCTATGCTTTCAGATAGCTGCAGTTCTCTATGCACAAGTCATGGTGCATGTGGTGTGGTCTCGCCTCTATGCATCTGCTGACCTTCCGTGGGCCTCATCTGTGATAACAAATTTCTCTTTCTATAGTCCCAAATTGCTTT
CTCCGGCCACGGGAGGCCCAGAAGGCTGCAGATGAAGCAAAGGCTTGTTTTGCACACGTTGATGGGGATCATCTTACGTTGCTGAATGTATATCACGCATACAAGCAGAACAAGGAAGATCCAAATTGGTGCTACGAAAATTTTATAAATACAAGGGCTCTCAAAGTTGCTGACAATGTAAGACAGCAGTTAGTTCGTAT
CATGACAAGATACAACCTCAAGCTGTGTAGCACGGATTTTAAAAGTCCCGAGTACTATCTTAATTTGAGGAAGGCAATGCTCGCAGGCTATTTCATGCAGGTGGCTCATCGAGAGCGGAGTGGACAGTATCTCACAGTAAAAGATAATCAGATTGTCCAGTTGCATCCTTCAACCTGTGTTGATCATAAGCCAGAATGGG
TCCTATACAATGAGTATGTGTTGACTAGTAGTAATTTTGTTCGTGTCGTCACTGATATTCGAGGAGAGTGGCTGATAGATATCGCTCCTCATTATTACGACCTTAGCAACTTTCCTCAGTGCGAGGCAAAGTGTGTCTTGGAGAGGCTTTATAACAAGCGTGAAAGAGACAAATCGGTTCGTAAGCATAAGGGTAAAAGA
ACAGTTCTTAAATCAGCTGTATGTTAGCAAGATCTATGCTCTCTCTATTCGTCTGAGAAAGTTAAATACATATATTATGGTTTATAGAGGCCATATTGTTGACTGAAGGTCCAGA


>TRINITY_DN100527_c0_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:
ATTGATACTTTACATTGTTCGTAAGAAATCATCTAATCCTTTCTTCCATCACTTCCAGACCGTCCGATTGAGCGATCGCATCCGTCCAGCAGGCCCTTGGAACTGGTAACCCTAGATAGCGATCTCCGTGTGAAAGCTCCGGGCCACCGGCGTCGGGGAGGCAGGGAAGCTCATTTTGCTTTGCCGATCTTGTACAGTTG
ATATCCCAATCCCCCACTACGCGTTATTTCCTGTTCTCGGGATCGAATCTCGTTGAGAATCAAATTGCGTCGGACTAAATAGTTAAGTGTTCGATGGGCTATTCTGAGCGGAAAAAGAAAGTGAGCCTGTTTGATGTGGTAAGCGAAAACGCTGATGGTTTCAACAAGACGAACGCCGACGGAATGGCCGCTGTTACGAA
CCGCTGGAACAATCGCCCGTATTCCCCCAGGTACTATGAAATCCTCGATAAAAGAAAAACCCTACCGGTGTGGCAGCAGCGACATGAGTTCCTCGACATGCTTGACAAATCTCAGACCTTGATTTTGGTTGGAGAGACCGGCAGCGGCAAGACCACACAGATTCCCCAATTTGTGGTAGAGGCTGGGTACACTAACAATC
GGAAACAGATTGCTTGCACCCAACCTCGCAGGGTGGCTGCTATGTCTGTTTCTCGTCGTGTAGCAGAGGAAATGGATGTGACAATTGGAGAAGAAGTTGGATATAGCATCCGGTTTGAAGATTGCAGTAGTCCAAAGACTGTTTTGAAGTACTTGACAGATGGAATGCTTCTCAGAGAAGCAATGGCTGATCCACTTTTA
GAGCGTTACAGAGTGATTATTCTGGATGAAGCTCATGAAAGGACATTAGCTACAGATGTTCTTTTTGGATTACTTAAGGAAGTTGTAAAGAATAGACCTGATTTGAAGCTTGTTGTAATGAGTGCAACATTAGAGGCAGAAAAATTTCAAGCATATTTCAATGGGGCACCTCTTATGAAAGTACCTGGAAGGTTACATCC
AGTTGAGATATTCTTCACTCAGGAACCTGAGAAAGATTACTTAGAAGCAGCAATTAGGACGGTTGTTCAAATACACATATGTGAACGACCTGGGGACATGCTTATTTTCCTCACCGGGGAGGAGGAAATAGAAGATGCTTGTAGAAAAATTACTAGGGAGGTACAGAATTTGGGTGATCAGGCTGGGCCTTTGAAAGTTG
TTCCTTTATATTCAACCCTTCCTCCAGCCATGCAGCAAAGGATATTTGAGCCAGCTCCACCACCCACAAAGGAGGGTGGTCGTCCAGGAAGAAAAATAGTGGTATCCACTAATATTGCAGAAACATCACTGACTATTGATGGCATAGTGTATGTGATTGATCCTGGTTTTTCAAAACAGAAAGTGTACAACCCTAGAGTG
CGTGTTGAGTCATTACTTGTTTCTCCTATATCAAAAGCAAGTGCTCATCAGAGAGCAGGTCGGGCTGGGCGTACACAGCCTGGAAAATGTTTCAGACTGTACACAGAGATGAGTTTTCAGAATGACCTTCAACCACAGACGTATCCTGAAATTTTGCGGTCAAATCTTGCGAATGTAGTTCTGACCCTGAAAAAACTGGG
GATTGATGATCTGGTGCATTTTGATTTTATGGATCCTCCTGCCCCAGAAACTTTGATGCGTGCACTAGAGCTTTTGAACTATTTGGGTGCATTGGATGAAGATGGGAGTTTGACAAAGCTGGGAGAGCTGATGAGTGAATTTCCACTGGACCCACAGATGTCCAGGATGTTAGTCAGCAGCCCCAATTTCAACTGCTCTA
ATGAGATTCTTTCCATCACTGCTATGCTTTCAGGTATGTTCTCAGTCATAATTGTTTCAAAGTCTGCAGCTGTCTGATGCTTTGTTTGATGTGGTCAATAGGTAAAGGTTAAATTTTTGTTTTTGTTTTTACTGGGGTGGGGGATTAGTCTTCCGTCTGCATTTATCTTAGCTTAGGCATAGTCTGGTTGCTGTGTGACC
TAGATTCTTTAAGTTTAGCGATGATGCAGATAGCTGCAGTTCTCTATGCACAAGTCATGGTGCATGTGGTGTGGTCTCGCCTCTATGCATCTGCTGACCTTCCGTGGGCCTCATCTGTGATAACAAATTTCTCTTTCTATAGTCCCAAATTGCTTTCTCCGGCCACGGGAGGCCCAGAAGGCTGCAGATGAAGCAAAGGC
TTGTTTTGCACACGTTGATGGGGATCATCTTACGTTGCTGAATGTATATCACGCATACAAGCAGAACAAGGAAGATCCAAATTGGTGCTACGAAAATTTTATAAATACAAGGGCTCTCAAAGTTGCTGACAATGTAAGACAGCAGTTAGTTCGTATCATGACAAGATACAACCTCAAGCTGTGTAGCACGGATTTTAAAA
GTCCCGAGTACTATCTTAATTTGAGGAAGGCAATGCTCGCAGGCTATTTCATGCAGGTGGCTCATCGAGAGCGGAGTGGACAGTATCTCACAGTAAAAGATAATCAGATTGTCCAGTTGCATCCTTCAACCTGTGTTGATCATAAGCCAGAATGGGTCCTATACAATGAGTATGTGTTGACTAGTAGTAATTTTGTTCGT
GTCGTCACTGATATTCGAGGAGAGTGgtaagtgcacactatctccttgttgcttatgatgtgtgttggtcttacttttgtaactaataccttttctgtcttacaattcccccactgtaacagGCTGATAGATATCGC




Intron 3 GTATGTTCTC ... GATGATGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A116.6740115
A232.3924221
A332.69351717
A442.47211516
A532.3122129
A634.1527217
A731.43362310
A821.742796
A932.08361420
A1029.09391913



>TRINITY_DN104158_c0_g2_i2 from sample A3 / Example spliced isoform
CATTGATACTTTACATTGTTCGTAAGAAATCATTTAATCCTTTCTTCCATCACTTCCAGACCGTCCGATTGAGCGATCGCATCCGTCCAGCAGGCCCTTGGAACTGGTAACCCTAGATAGCGATCTCCGTGTGAAAGCTCCGGGCCACCGGCGTCGGGGAGGCAGGGAAGCTCATTTTGCTTTGCCGATCTTGTACAGTT
GATATCCCAATCCCCCACTACGCGTTATTTCCTGTTCTCGGGATCGAATCTCGTTGAGAATCAAATTGCGTCGGACTAAATAGTTAAGTGTTCGATGGGCTATTCTGAGCGGAAAAAGAAAGTGAGCCTGTTTGATGTGGTAAGCGAAAACGCTGATGGTTTCAACAAGACGAACGCCGACGGAATGGCCGCTGTTACGA
ACCGCTGGAACAATCGCCCGTATTCCCCCAGGTACTATGAAATCCTCGATAAAAGAAAAACCCTACCGGTGTGGCAGCAGCGACATGAGTTCCTCGACATGCTTGACAAATCTCAGACCTTGATTTTGGTTGGAGAGACCGGCAGCGGCAAGACCACACAGATTCCCCAATTTGTGGTAGAGGCTGGGTACACTAACAAT
CGGAAACAGATTGCTTGCACCCAACCTCGCAGGGTGGCTGCTATGTCTGTTTCTCGTCGTGTAGCAGAGGAAATGGATGTGACAATTGGAGAAGAAGTTGGATATAGCATCCGGTTTGAAGATTGCAGTAGTCCAAAGACTGTTTTGAAGTACTTGACAGATGGAATGCTTCTCAGAGAAGCAATGGCTGATCCACTTTT
AGAGCGTTACAGAGTGATTATTCTGGATGAAGCTCATGAAAGGACATTAGCTACAGATGTTCTTTTTGGATTACTTAAGGAAGTTGTAAAGAATAGACCTGATTTGAAGCTTGTTGTAATGAGTGCAACATTAGAGGCAGAAAAATTTCAAGCATATTTCAATGGGGCACCTCTTATGAAAGTACCTGGAAGGTTACATC
CAGTTGAGATATTCTTCACTCAGGAACCTGAGAAAGATTACTTAGAAGCAGCAATTAGGACGGTTGTTCAAATACACATATGTGAACGACCTGGGGACATGCTTATTTTCCTCACCGGGGAGGAGGAAATAGAAGATGCTTGTAGAAAAATTACTAGGGAGGTACAGAATTTGGGTGATCAGGCTGGGCCTTTGAAAGTT
GTTCCTTTATATTCAACCCTTCCTCCAGCCATGCAGCAAAGGATATTTGAGCCAGCTCCACCACCCACAAAGGAGGGTGGTCGTCCAGGAAGAAAAATAGTGGTATCCACTAATATTGCAGAAACATCACTGACTATTGATGGCATAGTGTATGTGATTGATCCTGGTTTTTCAAAACAGAAAGTATACAACCCTAGAGT
GCGTGTTGAGTCATTACTTGTTTCTCCTATATCAAAAGCAAGTGCTCATCAGAGAGCAGGTCGGGCTGGGCGTACACAGCCTGGAAAATGTTTCAGACTGTACACAGAGATGAGTTTTCAGAATGACCTTCAACCACAGACGTATCCTGAAATTTTGCGGTCAAATCTTGCGAATGTAGTTCTGACCCTGAAAAAACTGG
GGATTGATGATCTGGTGCATTTTGATTTTATGGATCCTCCTGCCCCAGAAACTTTGATGCGTGCACTAGAGCTTTTGAACTATTTGGGTGCATTGGATGAAGATGGGAGTTTGACAAAGCTGGGAGAGCTGATGAGTGAATTTCCACTGGACCCACAGATGTCCAGGATGTTAGTCAGCAGCCCCAATTTCAACTGCTCT
AATGAGATTCTTTCCATCACTGCTATGCTTTCAGATAGCTGCAGTTCTCTATGCACAAGTCATGGTGCATGTGGTGTGGTCTCGCCTCTATGCATCTGCTGACCTTCCGTGGGCCTCATCTGTGATAACAAATTTCTCTTTCTATAGTCCCAAATTGCTTTCTCCGGCCACGGGAGGCCCAGAAGGCTGCAGATGAAGCA
AAGGCTTGTTTTGCACACGTTGATGGGGATCATCTTACGTTGCTGAATGTATATCACGCATACAAGCAGAACAAGGAAGATCCAAATTGGTGCTACGAAAATTTTATAAATACAAGGGCTCTCAAAGTTGCTGACAATGTAAGACAGCAGTTAGTTCGTATCATGACAAGATACAACCTCAAGCTGTGTAGCACGGATTT
TAAAAGTCCCGAGTACTATCTTAATTTGAGGAAGGCAATGCTCGCAGGCTATTTCATGCAGGTGGCTCATCGAGAGCGGAGTGGACAGTATCTCACAGTAAAAGATAATCAGATTGTCCAGTTGCATCCTTCAACCTGTGTTGATCATAAGCCAGAATGGGTCCTATACAATGAGTATGTGTTGACTAGTAGTAATTTTG
TTCGTGTCGTCACTGATATTCGAGGAGAGTGGCTGATAGATATCGCTCCTCATTATTACGACCTTAGCAACTTTCCTCAGTGCGAGGCAAAGTGTGTCTTGGAGAGGCTTTATAACAAGCGTGAAAGAGACAAATCGGTTCGTAAGCATAAGGGTAAAAGAACAGTTCTTAAATCAGCTTTATGTTAGCAAGATCTATGC
TCTCTCTATTCGTCTGAGAAAGTTAAATACATATATGGTTTATAGAGGCCATATTGTTGACTGAAGGTCCAGACTAAAACATATGGAATGAACTTGTTCATTGGGGAAATTGTATGGCATGTTAAACTAAGTTGCTGTTATTACCAGCATCATATTGTTTTCTTGAAATAATGTAATTTATAATGTATTGGTCTCTATTT
CATTCGGCA


>TRINITY_DN104158_c0_g2_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CATTGATACTTTACATTGTTCGTAAGAAATCATTTAATCCTTTCTTCCATCACTTCCAGACCGTCCGATTGAGCGATCGCATCCGTCCAGCAGGCCCTTGGAACTGGTAACCCTAGATAGCGATCTCCGTGTGAAAGCTCCGGGCCACCGGCGTCGGGGAGGCAGGGAAGCTCATTTTGCTTTGCCGATCTTGTACAGTT
GATATCCCAATCCCCCACTACGCGTTATTTCCTGTTCTCGGGATCGAATCTCGTTGAGAATCAAATTGCGTCGGACTAAATAGTTAAGTGTTCGATGGGCTATTCTGAGCGGAAAAAGAAAGTGAGCCTGTTTGATGTGGTAAGCGAAAACGCTGATGGTTTCAACAAGACGAACGCCGACGGAATGGCCGCTGTTACGA
ACCGCTGGAACAATCGCCCGTATTCCCCCAGGTACTATGAAATCCTCGATAAAAGAAAAACCCTACCGGTGTGGCAGCAGCGACATGAGTTCCTCGACATGCTTGACAAATCTCAGACCTTGATTTTGGTTGGAGAGACCGGCAGCGGCAAGACCACACAGATTCCCCAATTTGTGGTAGAGGCTGGGTACACTAACAAT
CGGAAACAGATTGCTTGCACCCAACCTCGCAGGGTGGCTGCTATGTCTGTTTCTCGTCGTGTAGCAGAGGAAATGGATGTGACAATTGGAGAAGAAGTTGGATATAGCATCCGGTTTGAAGATTGCAGTAGTCCAAAGACTGTTTTGAAGTACTTGACAGATGGAATGCTTCTCAGAGAAGCAATGGCTGATCCACTTTT
AGAGCGTTACAGAGTGATTATTCTGGATGAAGCTCATGAAAGGACATTAGCTACAGATGTTCTTTTTGGATTACTTAAGGAAGTTGTAAAGAATAGACCTGATTTGAAGCTTGTTGTAATGAGTGCAACATTAGAGGCAGAAAAATTTCAAGCATATTTCAATGGGGCACCTCTTATGAAAGTACCTGGAAGGTTACATC
CAGTTGAGATATTCTTCACTCAGGAACCTGAGAAAGATTACTTAGAAGCAGCAATTAGGACGGTTGTTCAAATACACATATGTGAACGACCTGGGGACATGCTTATTTTCCTCACCGGGGAGGAGGAAATAGAAGATGCTTGTAGAAAAATTACTAGGGAGGTACAGAATTTGGGTGATCAGGCTGGGCCTTTGAAAGTT
GTTCCTTTATATTCAACCCTTCCTCCAGCCATGCAGCAAAGGATATTTGAGCCAGCTCCACCACCCACAAAGGAGGGTGGTCGTCCAGGAAGAAAAATAGTGGTATCCACTAATATTGCAGAAACATCACTGACTATTGATGGCATAGTGTATGTGATTGATCCTGGTTTTTCAAAACAGAAAGTATACAACCCTAGAGT
GCGTGTTGAGTCATTACTTGTTTCTCCTATATCAAAAGCAAGTGCTCATCAGAGAGCAGGTCGGGCTGGGCGTACACAGCCTGGAAAATGTTTCAGACTGTACACAGAGATGAGTTTTCAGAATGACCTTCAACCACAGACGTATCCTGAAATTTTGCGGTCAAATCTTGCGAATGTAGTTCTGACCCTGAAAAAACTGG
GGATTGATGATCTGGTGCATTTTGATTTTATGGATCCTCCTGCCCCAGAAACTTTGATGCGTGCACTAGAGCTTTTGAACTATTTGGGTGCATTGGATGAAGATGGGAGTTTGACAAAGCTGGGAGAGCTGATGAGTGAATTTCCACTGGACCCACAGATGTCCAGGATGTTAGTCAGCAGCCCCAATTTCAACTGCTCT
AATGAGATTCTTTCCATCACTGCTATGCTTTCAGgtatgttctcagtcataattgtttcaaagtctgcagctgtctgatgctttgtttgatgtggtcaataggtaaaggttaaatttttgtttttgtttttactggggtgggggattagtcttccgtctgcatttatcttagcttaggcatagtctggttgctgtgtgac
ctagattctttaagtttagcgatgatgcag
ATAGCTGCAGTTCTCTATGCACAAGTCATGGTGCATGTGGTGTGGTCTCGCCTCTATGCATCTGCTGACCTTCCGTGGGCCTCATCTGTGATAACAAATTTCTCTTTCTATAGTCCCAAATTGCTTTCTCCGGCCACGGGAGGCCCAGAAGGCTGCAGATGAAGCAAAGG
CTTGTTTTGCACACGTTGATGGGGATCATCTTACGTTGCTGAATGTATATCACGCATACAAGCAGAACAAGGAAGATCCAAATTGGTGCTACGAAAATTTTATAAATACAAGGGCTCTCAAAGTTGCTGACAATGTAAGACAGCAGTTAGTTCGTATCATGACAAGATACAACCTCAAGCTGTGTAGCACGGATTTTAAA
AGTCCCGAGTACTATCTTAATTTGAGGAAGGCAATGCTCGCAGGCTATTTCATGCAGGTGGCTCATCGAGAGCGGAGTGGACAGTATCTCACAGTAAAAGATAATCAGATTGTCCAGTTGCATCCTTCAACCTGTGTTGATCATAAGCCAGAATGGGTCCTATACAATGAGTATGTGTTGACTAGTAGTAATTTTGTTCG
TGTCGTCACTGATATTCGAGGAGAGTGGCTGATAGATATCGCTCCTCATTATTACGACCTTAGCAACTTTCCTCAGTGCGAGGCAAAGTGTGTCTTGGAGAGGCTTTATAACAAGCGTGAAAGAGACAAATCGGTTCGTAAGCATAAGGGTAAAAGAACAGTTCTTAAATCAGCTTTATGTTAGCAAGATCTATGCTCTC
TCTATTCGTCTGAGAAAGTTAAATACATATATGGTTTATAGAGGCCATATTGTTGACTGAAGGTCCAGACTAAAACATATGGAATGAACTTGTTCATTGGGGAAATTGTATGGCATGTTAAACTAAGTTGCTGTTATTACCAGCATCATATTGTTTTCTTGAAATAATGTAATTTATAATGTATTGGTCTCTATTTCATT
CGGCA