sp|Q9LHN7|PHSC_ARATH ----> Probable polyamine transporter At3g13620

Intron 1 GTAAGTACAG ... GTAATCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	77.78	9	28	35
A2	100	0	23	13
A3	63.64	10	20	15
A4	92.59	1	17	8
A5	61.29	6	7	12
A6	80.8	12	63	38
A7	86.21	10	83	42
A8	91.55	6	85	45
A9	91.49	6	83	46
A10	84.62	9	63	36

>TRINITY_DN124861_c0_g3_i4 from sample A1 / Example spliced isoform

TGTAGGAGATGATCCATTGCATGGAGTTCTGTAGCATTGTGCAAAGCAATTTGATTTATGCTTCTGCAGAGGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAGCCCACGGCTCTTGGGATCAAAAGTTTACTGCTCAACACTTTAACTAGTCTATGTG
CATTGTGCCTCATGTTTATGGAGGCAGCCCTTGAATGACCAAATGACATGTCTTGTTTGGCTCTATGATGTAAAGGGGTTATACAGGGCATCTAGTTTGAATTCATTTGAGATTC

>TRINITY_DN124861_c0_g3_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:

GGAAAATGATCATATATTTGATGTGGATGCGCCAGTGGGTTGTGTAGACGGATAATGAAGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATATGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAAGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCC
ATTGCATgtaagtacagatgatctgttgcatttaagtacagaggttcaatattccactaatcattgttgaccaaaatattgtatgattgtatccacaatatgataaaatttcatttcccatgactttgggtatatgtattttatatgtcatgatgtaatcacagggagttctgtagcattgtgcaaagcaatttgattta
tgcttctgcagatgtgtagaaaatgactgaaggggctgtgagcatgaaaatttgagatgctcagaaaatatgatagttaccagagaaggggacgtgatgcttgtaggagatgatccattgcatgtaagtacagatgatctgttgcatttaagtacagaggttcaatattccactaatcattgttgaccaaaatattgtat
gattgtatccacaatatgataaaatttcatgtcctatgactttgggtatatgtattttatatgtcatgatgtaatcacagGGAGTTCTGTAGCATTGTGCAAAGCAATTTGATTTATGCTTCTGCAGAGGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGA
GAGCCCACGGCTCTTGGGATCAAAAGTTTACTGCTCAACACTTTAACTAGTCTATGTGCATTGTGCCTCATGTTTATGGAGGCAGCCCTTGAATGACCAAATGACATGTCTTGTTTGGCTCTATGATGTAAAGGGGTTATACAGGGCATCTAGTTTGAATTCATTTGAGATTC

Intron 2 GTAAGTACAG ... GCTTCTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	57.52	24	43	22
A2	53.85	18	20	22
A3	44.83	24	28	11
A4	57.38	13	22	13
A5	38.89	11	9	5
A6	33.11	98	46	51
A7	44.03	89	80	60
A8	46.27	72	72	52
A9	31.21	97	37	51
A10	42.75	75	56	56

>TRINITY_DN118161_c0_g2_i8 from sample A3 / Example spliced isoform

GGTTACAATAGCCACTCCTTCCTTTTTCCTCTGCGCTCTCCTGTGTTTAGCTGTACTGTAATGGCGGCGCGTGAAGAAGCATGGCACGCTACCGGCTGGGTACTAATCTTACATGGCTTCTGCAGAGGAAAATCCGGTGTACTAATGAAATGTCATGTTGATGGAAAGGGTCGGCAGGGTTAAGTATATGGATCCGGCGT
CTGCGAGAATCCATCCCCTCTGTGCAAAGGCGCAGTTGCCCTAATACGTGTAGCTTCATTTATCCGGGATCGGCTGGTGAGAAAATAGCATATCAGTATGCCAAATGGAGTCAGCTACAGAAAATAGACTCTCTCTGGGGTCTAGTGCGTAATATAACAAACTCAGCTGTGTCTAGCCATGGATTTTTGTGACACTGCAA
GCCAAACCAGATGGTGGAAAATGATCATATATTTGATGTGGATGCGCCAGTGGGTTGTGTAGACGGATAATGAAGGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATATGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAAGGGGACGTGATGC
TTGTAGGAGATGATCCATTGCATAGTCCTGTCACTAGCTCTGCCGTGTCCCCTATCACTAGGGCCTCCAGCATGCTCCATATGAACAGGAAGACGAGGAACTCTGCTATGGCCAACAGCGGCCCGGCCATATGAGCGGGACTTCGAGGTATATCAGAAATATGAGCGGGATGAGGTTCAGCTTCTTCGATTTCAAATCCG
AACAAGGTTCGATCCACTGACTACGGCGTTCTTTTAGTCCACTATAACTTTCGTTAACTATAAGGAATCATTGATTGATTGGGTGTAACCATTTTCTTAACGCTGTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAGCCCACGGCTCTTGGGATCAAAAGTTTACTGCTCAACACTTTAAC
TAGTCTATGTGCATTGTGCCTCATGTTTATGGAGGCAGCCCTTGAATGACCAAATGACATGTCTTGTTTGGCTCTATGATGTAAAGGGGTTATACAGGGCAACTAGTTTGAATTCATTTGAGATTCTACGGTGCTGCCTCTATCACTTTGTAAGTGATTTGTTATAATGTTAGCTTCCGGGATGAAGGTCACCTCAGTGC
CTTGTTTCGCAGTTAGGAAGCTTCCAGGAAAGTTGCCAAGTTAACTTTTTTATATTGTTTGGATGAAGGGAAGGGATATGATCCCAGTTCTACTCCGACAAAAGAAACTATTAGTGGGAGAGGTTTTCCCATTCTAATCAGACCAAGATGAACCAGTCTTCTGTAGTTTTATGTTCCTTTGATGTTTTTGGGCTTGAATA
ATTTAGGCTCTTGGATGCAATGAGGTTTTGGAGAATGTGTTAAAACAGACACTGCTAGTGGTGGAGCGACCGTGTGGATGTCACGAAAGCAAGACATTGAGTGACATGAATTGATGGTTGCATTTGCATATCTAACGTTCATTGGCTAGATGCTCGATTCTGTACTTGTGAAGTTCCAATGCAGTTCTTTTTTGTCCAAC
CATAAAAATTATGCATGTACGACTCTGTATCATGGAAATCGTATGCTTTTGCATCAACTCTGAGAATAAAAATGTGCA

>TRINITY_DN118161_c0_g2_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CTGTGCACTGTGCAGATAGATAATGAATGAGATGTGATGCTTATAGGAGATGATCCATAGCATTGACTGCAAATACTCAATATTCCACTGATCATTGTTGATGAAAAAATCATTTGATTGATTCTTTTACAATTCTGTGTGTGAGGCTGCTCAGCTCTTGGTATAGAAGTAGAAAAACATGACAATATCCTCTGAGAAAC
AACTCATCAGGTTGATGGAATCATCTGGCATAACCTTTGCAACTCTTTTATCACGGGTTGTGACTACAATATTATTTTTATTTTCCTATGACAACCAAATAGAGAGCACTTTCCTTTCTCAGATTTCGATTTTGATCAATTGGAAGTTCCATCTGCATGTTTCTTCTCTTGGACCAGCTGTGTCTAGCCATGGATTTTTG
TGACACTGCAAGCCAAACCAGATGGTGGAAAATGATCATATATTTGATGTGGATGCGCCAGTGGGTTGTGTAGACGGATAATGAAGGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATgtaagtacagatgatctgttgcatttaagtacagaggttcaatattccactaatcattgttgaccaaaatattgtatg
attgtatccacaatatgataaaatttcatttcccatgactttgggtatatgtattttatatgtcatgatgtaatcacagggagttctgtagcattgtgcaaagcaatttgatttatgcttctgcagATGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAG
AAGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATGTAAGTACAGATGATCTGTTGCATTTAAGTACAGAGGTTCAATATTCCACTAATCATTGTTGACCAAAATATTGTATGATTGTATCCACAATATGATAAAATTTCATGTCCTATGACTTTGGGTATATGTATTTTATATGTCATGATGTAATCACAGGAGTC
CTGTCACTAGCTCTGCCGTGTCCCCTATCACTAGGGCCTCCAGCATGCTCCATATGAACAGGAAGACGAGGAACTCTGCTATGGCCAACAGCGGCCCGGCCATATGAGCGGGACTTCGAGGTATATCAGAAATATGAGCGGGATGAGGTTCAGCTTCTTCGATTTCAAATCCGAACAAGGTTCGATCCACTGACTACGGC
GTTCTTTTAGTCCACTATAACTTTCGTTAACTATAAGGAATCATTGATTGATTGGGTGTAACCATTTTCTTAACGCTGGAGTTCTGTAGCATTGTGCAAAGCAATTTGATTTATGCTTCTGCAGAGGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAG
CCCACGGCTCTTGGGATCAAAAGTTTACTGCTCAACACTTTAACTAGTCTATGTGCATTGTGCCTCATGTTTATGGAGGCAGCCCTTGAATGACCAAATGACATGTCTTGTTTGGCTCTATGATGTAAAGGGGTTATACAGGGCAACTAGTTTGAATTCATTTGAGATTCTACGGTGCTGCCTCTATCACTTTGTAAGTG
ATTTGTTATAATGTTAGCTTCCGGGATGAAGGTCACCTCAGTGCCTTGTTTCGCAGTTAGGAAGCTTCCAGGAAAGTTGCCAAGTTAACTTTTTTATATTGTTTGGATGAAGGGAAGGGATATGATCCCAGTTCTACTCCGACAAAAGAAACTATTAGTGGGAGAGGTTTTCCCATTCTAATCAGACCAAGATGAACCAG
TCTTCTGTAGTTTTATGTTCCTTTGATGTTTTTGGGCTTGAATAATTTAGGCTCTTGGATGCAATGAGGTTTTGGAGAATGTGTTAAAACAGACACTGCTAGTGGTGGAGCGACCGTGTGGATGTCACGAAAGCAAGACATTGAGTGACATGAATTGATGGTTGCATTTGCATATCTAACGTTCATTGGCTAGATGCTCG
ATTCTGTACTTGTGAAGTTCCAATGCAGTTCTTTTTTGTCCAACCATAAAAATTATGCATGTACGACTCTGTATCATGGAAATCGTATGCTTTTGCATCAACTCTGAGAATAAAAATGTGCA

Intron 3 GTAAGTACAG ... GTAATCACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	80.67	9.5	33	18.5
A2	72.52	9	22.5	11
A3	67.78	12.5	23.5	10.5
A4	86.75	3.5	23	10
A5	64.59	6	9	11
A6	67.61	25	52.5	32.5
A7	82.19	19.5	88	45
A8	76.21	25	80.5	45.5
A9	72.09	19.5	56.5	36.5
A10	79.41	18	74	42.5

>TRINITY_DN118161_c0_g2_i5 from sample A3 / Example spliced isoform

GGTTACAATAGCCACTCCTTCCTTTTTCCTCTGCGCTCTCCTGTGTTTAGCTGTACTGTAATGGCGGCGCGTGAAGAAGCATGGCACGCTACCGGCTGGGTACTAATCTTACATGGCTTCTGCAGAGGAAAATCCGGTGTACTAATGAAATGTCATGTTGATGGAAAGGGTCGGCAGGGTTAAGTATATGGATCCGGCGT
CTGCGAGAATCCATCCCCTCTGTGCAAAGGCGCAGTTGCCCTAATACGTGTAGCTTCATTTATCCGGGATCGGCTGGTGAGAAAATAGCATATCAGTATGCCAAATGGAGTCAGCTACAGAAAATAGACTCTCTCTGGGGTCTAGTGCGTAATATAACAAACTCAGCTGTGTCTAGCCATGGATTTTTGTGACACTGCAA
GCCAAACCAGATGGTGGAAAATGATCATATATTTGATGTGGATGCGCCAGTGGGTTGTGTAGACGGATAATGAAGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATGGAGTTCTGTAGCATTGTGCAAAGCAATTTGATTTATGCTTCTGCAGATGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTG
AGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAAGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATGAGTCCTGTCACTAGCTCTGCCGTGTCCCCTATCACTAGGGCCTCCAGCATGCTCCATATGAACAGGAAGACGAGGAACTCTGCTATGGCCAACAGCGGCCCGGCCATATGAGCGGGACTTCGAGGTATAT
CAGAAATATGAGCGGGATGAGGTTCAGCTTCTTCGATTTCAAATCCGAACAAGGTTCGATCCACTGACTACGGCGTTCTTTTAGTCCACTATAACTTTCGTTAACTATAAGGAATCATTGATTGATTGGGTGTAACCATTTTCTTAACGCTGGAGTTCTGTAGCATTGTGCAAAGCAATTTGATTTATGCTTCTGCAGAG
GTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAGCCCACGGCTCTTGGGATCAAAAGTTTACTGCTCAACACTTTAACTAGTCTATGTGCATTGTGCCTCATGTTTATGGAGGCAGCCCTTGAATGACCAAATGACATGTCTTGTTTGGCTCTATGATGT
AAAGGGGTTATACAGGGCAACTAGTTTGAATTCATTTGAGATTCTACGGTGCTGCCTCTATCACTTTGTAAGTGATTTGTTATAATGTTAGCTTCCGGGATGAAGGTCACCTCAGTGCCTTGTTTCGCAGTTAGGAAGCTTCCAGGAAAGTTGCCAAGTTAACTTTTTTATATTGTTTGGATGAAGGGAAGGGATATGAT
CCCAGTTCTACTCCGACAAAAGAAACTATTAGTGGGAGAGGTTTTCCCATTCTAATCAGACCAAGATGAACCAGTCTTCTGTAGTTTTATGTTCCTTTGATGTTTTTGGGCTTGAATAATTTAGGCTCTTGGATGCAATGAGGTTTTGGAGAATGTGTTAAAACAGACACTGCTAGTGGTGGAGCGACCGTGTGGATGTC
ACGAAAGCAAGACATTGAGTGACATGAATTGATGGTTGCATTTGCATATCTAACGTTCATTGGCTAGATGCTCGATTCTGTACTTGTGAAGTTCCAATGCAGTTCTTTTTTGTCCAACCATAAAAATTATGCATGTACGACTCTGTATCATGGAAATCGTATGCTTTTGCATCAACTCTGAGAATAAAAATGTGCA

>TRINITY_DN118161_c0_g2_i3 from sample A3 / Example unspliced isoform:

CTGTGCACTGTGCAGATAGATAATGAATGAGATGTGATGCTTATAGGAGATGATCCATAGCATTGACTGCAAATACTCAATATTCCACTGATCATTGTTGATGAAAAAATCATTTGATTGATTCTTTTACAATTCTGTGTGTGAGGCTGCTCAGCTCTTGGTATAGAAGTAGAAAAACATGACAATATCCTCTGAGAAAC
AACTCATCAGGTTGATGGAATCATCTGGCATAACCTTTGCAACTCTTTTATCACGGGTTGTGACTACAATATTATTTTTATTTTCCTATGACAACCAAATAGAGAGCACTTTCCTTTCTCAGATTTCGATTTTGATCAATTGGAAGTTCCATCTGCATGTTTCTTCTCTTGGACCAGCTGTGTCTAGCCATGGATTTTTG
TGACACTGCAAGCCAAACCAGATGGTGGAAAATGATCATATATTTGATGTGGATGCGCCAGTGGGTTGTGTAGACGGATAATGAAGGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATGTAAGTACAGATGATCTGTTGCATTTAAGTACAGAGGTTCAATATTCCACTAATCATTGTTGACCAAAATATTGTATG
ATTGTATCCACAATATGATAAAATTTCATTTCCCATGACTTTGGGTATATGTATTTTATATGTCATGATGTAATCACAGGGAGTTCTGTAGCATTGTGCAAAGCAATTTGATTTATGCTTCTGCAGATGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAG
AAGGGGACGTGATGCTTGTAGGAGATGATCCATTGCATgtaagtacagatgatctgttgcatttaagtacagaggttcaatattccactaatcattgttgaccaaaatattgtatgattgtatccacaatatgataaaatttcatgtcctatgactttgggtatatgtattttatatgtcatgatgtaatcacagGAGTC
CTGTCACTAGCTCTGCCGTGTCCCCTATCACTAGGGCCTCCAGCATGCTCCATATGAACAGGAAGACGAGGAACTCTGCTATGGCCAACAGCGGCCCGGCCATATGAGCGGGACTTCGAGGTATATCAGAAATATGAGCGGGATGAGGTTCAGCTTCTTCGATTTCAAATCCGAACAAGGTTCGATCCACTGACTACGGC
GTTCTTTTAGTCCACTATAACTTTCGTTAACTATAAGGAATCATTGATTGATTGGGTGTAACCATTTTCTTAACGCTGGAGTTCTGTAGCATTGTGCAAAGCAATTTGATTTATGCTTCTGCAGAGGTGTAGAAAATGACTGAAGGGGCTGTGAGCATGAAAATTTGAGATGCTCAGAAAATATGATAGTTACCAGAGAG
CCCACGGCTCTTGGGATCAAAAGTTTACTGCTCAACACTTTAACTAGTCTATGTGCATTGTGCCTCATGTTTATGGAGGCAGCCCTTGAATGACCAAATGACATGTCTTGTTTGGCTCTATGATGTAAAGGGGTTATACAGGGCAACTAGTTTGAATTCATTTGAGATTCTACGGTGCTGCCTCTATCACTTTGTAAGTG
ATTTGTTATAATGTTAGCTTCCGGGATGAAGGTCACCTCAGTGCCTTGTTTCGCAGTTAGGAAGCTTCCAGGAAAGTTGCCAAGTTAACTTTTTTATATTGTTTGGATGAAGGGAAGGGATATGATCCCAGTTCTACTCCGACAAAAGAAACTATTAGTGGGAGAGGTTTTCCCATTCTAATCAGACCAAGATGAACCAG
TCTTCTGTAGTTTTATGTTCCTTTGATGTTTTTGGGCTTGAATAATTTAGGCTCTTGGATGCAATGAGGTTTTGGAGAATGTGTTAAAACAGACACTGCTAGTGGTGGAGCGACCGTGTGGATGTCACGAAAGCAAGACATTGAGTGACATGAATTGATGGTTGCATTTGCATATCTAACGTTCATTGGCTAGATGCTCG
ATTCTGTACTTGTGAAGTTCCAATGCAGTTCTTTTTTGTCCAACCATAAAAATTATGCATGTACGACTCTGTATCATGGAAATCGTATGCTTTTGCATCAACTCTGAGAATAAAAATGTGCA