sp|Q94BY9|GAP22_ARATH ----> Rab GTPase-activating protein 22


Intron 1 GTGCCTATAT ... TGTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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>TRINITY_DN44281_c1_g3_i1 from sample A8 / Example spliced isoform
TCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCTTTCAAGGGAAGAAAGATACTTAAGCCAGACAAATGGCGAGCAGCTTTTGACAGTGAGGGCAGGCCTGTGGGGTTCCAGAAGGCTCTCAAGACAATTATTTTTGGGGGTGTGGATGCATCTATAAGGGCAGAAGTTTGGGAATATTTGCTTGGTTGTTATGCGCTTAG
CAGCACTGCAGAGTATCGGCAGCAGCTAAGGATATCTCGAAGGAAGAGATATAGAGATTTGATCGACCAATGTCAAATGATGCACTCTAGCATTGGTACTGGTTCCCTTGCTTACACTGTTGGGTCTAAAGTAATGGATGTGCGGATAATGTCTAAAGATAGTGCCAAGAAAGAAGCAAAAATGGGTGTTGAGCGCATTA
CTCAAGAGGCAAAGTCTAAGCTTGAATCATCTCGTGGTATGTGGAATAGTGGAAGGATTGAAGCATCAGTTGCTTATGAGAATGATAGACAGAGCTCTACAGATTCAACAGACTTTGGAAGTGCCAGGGAAAACCCAAATTATACAACCTTGAATTCTTCATACGGTATGTCTAGTGCAGGTCTAGACAGTGGCGTTGGT
TCAGAATCTGAAAGAGAATACGATGGGACACTTGATAGGCAAAACAGTTTTGATTTTCCCTATCTGCCCGTTACAAACCTTTTTGAAAGAAGCGATACAGAAATTGTGGAATCTGAAGCAATTTCACCGAGGCGACGAGCAGTGGAAAATACAGATCATAATTCAAAAAGAAATGACAATAAAGGAGGAGATTTACTTAT
GGAAGATGCTATATTTAGATTAGAATATGATACTAAAACCACTACTTCAAACATAGAATCAGCAGGGAAGGATAACATTGACTATTTGGAAGACACAACTTATCATAAAAAGGAGAAATTTACTTTGGCTAAAGCTTTGGTGCAAGAGCAGGTGCCAGGAATCAATGGGTCGGAGCATCAACCAGGAACTATTGGAAGGA
TGAAGATATCAGATGCTCCAGAACTAGGTGACTCGCCTCTAATGAATCCAGTAGTAGCACTTGGGGTCAATGTGAATGAAGACAGAGTTGCAGATTGGCTCTGGACACTTCACAGGATTGTTGTGGATGTTGTAAGAACAGATAGGCATCTTGAATTCTATGGAGATGCAAAAAACATGGCTCGGATGTCAGATATCCTT
GCTGTATATGCCTGGGTGGATCCCACAACTGGTTATTGCCAAGGTATGAGTGATTTGTTATCTCCATTCATTATTCTTTTTGAGGATGATGCGGATGCATTCTGGTGCTTTGAGAGTCTTCTCCGAAGAATGAGACCAAATTTCCAGATGGAAGGCCCCATTGGTGTGATGAAACAATTAGAAGCCCTGGGAAAAATATT
AGAGTTGACTGACCTTCAATTATTCAAGCACTTGTCTCAGATTGGTGCAGAAAGTCTTCTTTTTGCATTTCGCATGCTGCTTGTCCTCTTTCGCCGGGAATTGTCGTTCGAGGATGCACTTTGTATGTGGGAGATGATGTGGGCTGCTGATTTTGATGAAGCTATGTCATGGGCATTGGAAAATAACTGCCTTGAACCAC
TGGTCTTGAGCCCTCTAAATGCTTTACATGGAGATACCAACATTGAAAATGGAGAAAACACCCCTTGTTCAAAGAGTGATCAATCTGAACTACCTGATGCAGATATTTCCGTTTCTGGAAACAGTGATGCCAAATATCTTTCTAGAAGCCCGTTATGTGGCTTGAGACCAGGCAATTTCTGGCCTAAACAAAGTCAGCAA
CAGATTTGTACTATGAGTTCACTCCTCAAGAAAAATGGGGATGATGAACTATCTGTCTTTTGTGTAGCAGCTATTCTTGTCCTCAATAGGTCAAAGTTCATCAAGGAGATTCATTCGATGGATGATGCCATTAAGATGTTCAACGACATGCCGTTTGAAATTAAGGTGAAGAGATGTATACGAATGGCCATTAAATTGCG
GAAAAAATATCTCCATAAGTTGACCAAGAAAGCAGGAATCAGGATATTATCAGCTAAACAGCCCTCATGAGTGATAATGAATGGTGCCAAATAAGCTATTGTATTTTCCAAACTATTGAGTTGAGTTGCTCAAGCATCCAGACTATATTAAGCAGTTAAGAAATAGTTCACTGAATGTTTGGAGGTTTGGTAGAAGCTGG
GTATGGAACTGCCATTGTTTCCGGGTTGTGTAGCTTAATACCTGTGCAAGAGGCCTTGAATTGCAGGTGTAAAGCATTTGTACAGGTAATGCGATGCGTCCTTTATACGTAGAGTGAGAAAGAATTGACTCTGAACTGAGTCCTGTTCAGTTTAAATTGTTTCAAATGTTGATTGACAGAAATTATTGCCGGGATATTCA
CAGATAAATCTTGGGGAACTGCATACATCTTCCAGAAATTCTGTAATCCATGAGCTGTAAGATCTAATTTTCCACTTCTGTATTTTCAGCTTTGAATTGCTCCCCCGTGGTTCTATGCTCTTGGTTGTTTTTTCTTCTAAGCAACATTAACATGTATGTTATGGCTTCCATGAATTGGATAAGAACATGGTGCATATCAA
GGTTTTTGAGCAGTTGGCCTGGAAATTTAAGAACAAGCATTAAAGATATGCTGTTCATTCCAACTGATTTTCTAAATGATACGGGAATTTGTAAGTCTAGTTGAGTCCAACATGTGAAGATATTCTCAAAAGATTCTAGAATGATCCGAGTTGTTTCTACTGTTTCTTATTATCCATGGAAATGTTCAAGCATGATATAT
TGGAACAAAGAATCACATCACACTTGCATGCATGTTTACAAAGAACACTAGATTAAAGTTAGGGCTGCCTCTTTTACATTTGATGTGTTTGTAATATATTTAATTTTGACCAAGCTATTTTTCTAAGTGGAATTCAAGATAAAGTTAATTTCACACACATTGACACTGTTGTGGACCTGTGGTATTGTCAAGCAAGGTTT
AGTGCTTCTCTTGATAGATTGAAGATGCTCAAAGTTTGTAAAAGTACAATGATACAAAGGAGATGAAAATTTCCATGGGACTAATTTTTTGGAACAAGGAGGGAGGGTGCACTAGCTCAACTTGGGAAAATCGTTTTCACCTTGGAGCTCATCAAATCGGTTGGAAATTGATTCAAGGGGGTTAGAGA


>TRINITY_DN44281_c1_g3_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:
ACAAATGACAAAGTTTTGAATGTCAATCCACAGAAAACATGCGTGCATATAAGCTGTAATGTCTTACAGAGGAGCACAGGGATAATCTGAGGGAAAATAACTCCTTGAAGTAGACACCTCCATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCTTTCAAGGGAAGAAAGATACTTAAGCCAGACAAATGGCGAGCAGCTTT
TGACAGTGAGGGCAGGCCTGTGGGGTTCCAGAAGGCTCTCAAGACAATTATTTTTGGGGGTGTGGATGCATCTATAAGGGCAGAAGTTTGGGAATATTTGCTTGGTTGTTATGCGCTTAGCAGCACTGCAGAGTATCGGCAGCAGCTAAGGATATCTCGAAGGAAGAGATATAGAGATTTGATCGACCAATGTCAAATGA
TGCACTCTAGCATTGGTACTGGTTCCCTTGCTTACACTGTTGGGTCTAAAGTAATGGATGTGCGGATAATGTCTAAAGATAGTGCCAAGAAAGAAGCAAAAATGGGTGTTGAGCGCATTACTCAAGAGGCAAAGTCTAAGCTTGAATCATCTCGTGGTATGTGGAATAGTGGAAGGATTGAAGCATCAGTTGCTTATGAG
AATGATAGACAGAGCTCTACAGATTCAACAGACTTTGGAAGTGCCAGGGAAAACCCAAATTATACAACCTTGAATTCTTCATACGGTATGTCTAGTGCAGGTCTAGACAGTGGCGTTGGTTCAGAATCTGAAAGAGAATACGATGGGACACTTGATAGGCAAAACAGTTTTGATTTTCCCTATCTGCCCGTTACAAACCT
TTTTGAAAGAAGCGATACAGAAATTGTGGAATCTGAAGCAATTTCACCGAGGCGACGAGCAGTGGAAAATACAGATCATAATTCAAAAAGAAATGACAATAAAGGAGGAGATTTACTTATGGAAGATGCTATATTTAGATTAGAATATGATACTAAAACCACTACTTCAAACATAGAATCAGCAGGGAAGGATAACATTG
ACTATTTGGAAGACACAACTTATCATAAAAAGGAGAAATTTACTTTGGCTAAAGCTTTGGTGCAAGAGCAGGTGCCAGGAATCAATGGGTCGGAGCATCAACCAGGAACTATTGGAAGGATGAAGATATCAGATGCTCCAGAACTAGGTGACTCGCCTCTAATGAATCCAGTAGTAGCACTTGGGGTCAATGTGAATGAA
GACAGAGTTGCAGATTGGCTCTGGACACTTCACAGGATTGGTATGAACATATTGTGGATGTTGTAAGAACAGATAGGCATCTTGAATTCTATGGAGATGCAAAAAACATGGCTCGGATGTCAGATATCCTTGCTGTATATGCCTGGGTGGATCCCACAACTGGTTATTGCCAAGGTATGAGTGATTTGTTATCTCCATTC
ATTATTCTTTTTGAGGATGATGCGGATGCATTCTGGTGCTTTGAGAGTCTTCTCCGAAGAATGAGACCAAATTTCCAGATGGAAGGCCCCATTGGTGTGATGAAACAATTAGAAGCCCTGGGAAAAATATTAGAGTTGACTGACCTTCAATTATTCAAGCACTTGTCTCAGATTGGTGCAGAAAGTCTTCTTTTTGCATT
TCGCATGCTGCTTGTCCTCTTTCGCCGGGAATTGTCGTTCGAGGATGCACTTTGTATGTGGGAGATGATGTGGGCTGCTGATTTTGATGAAGCTATGTCATGGGCATTGGAAAATAACTGCCTTGAACCACTGGTCTTGAGCCCTCTAAATGCTTTACATGGAGATACCAACATTGAAAATGGAGAAAACACCCCTTGTT
CAAAGAGTGATCAATCTGAACTACCTGATGCAGATATTTCCGTTTCTGGAAACAGTGATGCCAAATATCTTTCTAGAAGCCCGTTATGTGGCTTGAGACCAGGCAATTTCTGGCCTAAACAAAGTCAGCAACAGATTTGTACTATGAGTTCACTCCTCAAGAAAAATGGGGATGATGAACTATCTGTCTTTTGTGTAGCA
GCTATTCTTGTCCTCAATAGGTCAAAGTTCATCAAGGAGATTCATTCGATGGATGATGCCATTAAGATGTTCAACGACATGCCGTTTGAAATTAAGGTGAAGAGATGTATACGAATGGCCATTAAATTGCGGAAAAAATATCTCCATAAGTTGACCAAGAAAGCAGGAATCAGGATATTATCAGCTAAACAGCCCTCATG
AGTGATAATGAATGGTGCCAAATAAGgtgcctatattattttgtccatctgaataaacacaagtggtgaggatgatgccttcttcagatatggggttgtagcattagatgttatctacatcaaccgctctgattctgttttgcagCTATTGTATTTTCCAAACTATTGAGTTGAGTTGCTCAAGCATCCAGACTATATTA
AGCAGTTAAGAAATAGTTCACTGAATGTTTGGAGGTTTGGTAGAAGCTGGGTATGGAACTGCCATTGTTTCCGGGTTGTGTAGCTTAATACCTGTGCAAGAGGCCTTGAATTGCAGGTGTAAAGCATTTGTACAGGTAATGCGATGCGTCCTTTATACGTAGAGTGAGAAAGAATTGACTCTGAACTGAGTCCTGTTCAG
TTTAAATTGTTTCAAATGTTGATTGACAGAAATTATTGCCGGGATATTCACAGATAAATCTTGGGGAACTGCATACATCTTCCAGAAATTCTGTAATCCATGAGCTGTAAGATCTAATTTTCCACTTCTGTATTTTCAGCTTTGAATTGCTCCCCCGTGGTTCTATGCTCTTGGTTGTTTTTTCTTCTAAGCAACATTAA
CATGTATGTTATGGCTTCCATGAATTGGATAAGAACATGGTGCATATCAAGGTTTTTGAGCAGTTGGCCTGGAAATTTAAGAACAAGCATTAAAGATATGCTGTTCATTCCAACTGATTTTCTAAATGATACGGGAATTTGTAAGTCTAGTTGAGTCCAACATGTGAAGATATTCTCAAAAGATTCTAGAATGATCCGAG
TTGTTTCTACTGTTTCTTATTATCCATGGAAATGTTCAAGCATGATATATTGGAACAAAGAATCACATCACACTTGCATGCATGTTTACAAAGAACACTAGATTAAAGTTAGGGCTGCCTCTTTTACATTTGATGTGTTTGTAATATATTTAATTTTGACCAAGCTATTTTTCTAAGTGGAATTCAAGATAAAGTTAATT
TCACACACATTGACACTGTTGTGGACCTGTGGTATTGTCAAGCAAGGTTTAGTGCTTCTCTTGATAGATTGAAGATGCTCAAAGTTTGTAAAAGTACAATGATACAAAGGAGATGAAAATTTCCATGGGACTAATTTTTTGGAACAAGGTAGATAGCGCATTTTTGCTTTGTTATATTTATGATGTTACAAATTTCTTAT
CCCACTTTTAACCAAAGCTTAAATTTTGAAAAAGGAGAAAATGGCATTGATGTAGCC