sp|Q9FKM7|IAA33_ARATH ----> Auxin-responsive protein IAA33
Intron 1 GTAAATTGAT ... CATTTCGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.41 | 14.5 | 6 | 2 |
| A2 | 13.75 | 6.4 | 1 | 0 |
| A3 | 13.38 | 19.5 | 3 | 0 |
| A4 | 47.62 | 11 | 10 | 0.5 |
| A5 | 31.66 | 4.5 | 2 | 0 |
| A6 | 13.45 | 49 | 7.5 | 0.5 |
| A7 | 19.98 | 52.8 | 13 | 4 |
| A8 | 19.75 | 81.4 | 19.5 | 4 |
| A9 | 17.73 | 59.6 | 12.5 | 0 |
| A10 | 8.89 | 53.5 | 5 | 0.5 |
>TRINITY_DN43153_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformGCTCAATGGATTTATTTGACTATGATTCTTGTCTGATGCATAAAAAATAACTGGTTTAAAAACTCAAATGAATGAAGACTTTTGTCTCATTATCATAATGAAACATCTCTTTTCTGACTATGAAATTTGTCTATTTTAAGCAATGGCAGTCCAAGCAGACAAAACATCAACGCTCATCTTGAAATAATACTTGGCAATGC
CCAACTGCAGCAATGGCTGTTTGCCAAGTGCCTGGCATTATCACAGTCCAATCAGCTCAGTGTTATGTGGTTGTTTCCCTTCATAAATCGCAGGCTTTGGAATTAAAGAATCTGAGGCAGGAAGAGTATTTTTCACAGGGCGAAGCATCATTCTGCTTGTCAGCAACAATGGTCAAATCCAATGAGCCCGAGGATACAGC
AACATCTGAGTTGAGGATTTCAACTTCATCTGGGCCTTCACAAACCCACGAACTTGAATTATCTATTAGTGATGCCCATGCATTGGAATTAACAGGAGCCCCAGGCAGTAGTGTTGATGCACAGGTTATAAATTTGCAGGCATCTTTGGGAAGATCGGCAGATGTGATAGAAGAAGGTTCTATCTCTAGTGCGGACTCTG
GAAAGTTGAGCCTTGTAGGACGGTCAATGAAAAGGATCAGGTCAAATGTATTGGCCTTTAACCCTGATGGAAATAAGACAGGCCTTGAAAATGAGCATTTGCAATTTAAATGCCCCTCTCTAACAATTGGCAATGGTGACACAGTTGTGGGAATAAATAATTCAGCTTCATCTTCTGACAAAGACTTGTCTTGGGCCCAC
AACAGTAGCCCTGTTGATTGGAAGCTAGCAATGTCATGGCAATCTACACCTGACCATTCATTGGGATCATCATCATCACACCAACTGATTCATGGGGCTTTTAGAAAAGTTGGACAACAGGATTCTCAACTAAAACAGCCTACTTTGCTTCCCCATTTACTTTCTGTATCAAAATGCAAGGATGGTTCCGAATTTAGCAG
GGGTACTATTATTTCCCCTGGTCTCATGGGCTTGGAAAGGCCATTTATGTATCAGAGGCCTAGTTATTTGCATAATATCTGCACATCAAGCAATGAGTTATTAACCTACTGCTCAAATACAACCAACCATACCAGAGATGAGATAGATCCAATCTCAACAGGCTTGTTGTATGGAAACATTTCAGAACCAGTGACGTCAC
ATGATCATGAAATATTTCAACAAAATCGTCCATCCATAGAGTTTGGGCAGATAAACTTGAACCAGTGGCATTTACCTTTACTGGAAAATAGGCAACATATTCCAAATTCGGATTTTCCAAATGGCATGTTTTCGGAAAATGTGAGCATAGATTTGCATCGTACATGTTCAGTTGAAGGAAAGAAAGCAAAAGGCTTGACG
TTGTCACAAACAAGCATGGAACTTGTTTCTAATCCCAATGCCATCTGTGGACTGTCACCGGCACCAGTTTTTTCACCTATTCAACCAAATCCACACACACCAGAGTTCCCCTTTGAAATGAAAACCAGCTCTGAAATACTAATGCAAAACTTAAAATTTCCTTCCTTTTCAGCCATGAATGCTCCTTTCCCGCCTTCCAT
TAACCCGAGTGGCAACTTGCTGTATAGTTCAGGTCCTCCAGTTAGCAACATCGATGTGTCCAGGTCAGATCAATGGCCTTCTATTGATTCTAGATTTCAACCCAAAGGAGAGCAGCAGTCTCCCTTGATAAATGTTCTTAATTCTGCTAAGGACCGCCCAAGTCTTATTTCAGATCTGAACTTGTCACTATTGGTGCATG
GGGAAGACCCTCATAGTAGTTCATCACCACTTCATTCCTTTCCATTAGCCTCAGAAAATTTTATTTCTGCTAATAATCTATCTGTGAGTACAGGAGGAATGGGGTTGGAGCTTTTAGGACTTTCAAATATATCTCCAGATTTTGGTGCTCCCTCAGTTGATTCAGACGATCACAATGTTCCTCCATCCTTATCTGTAGTG
ATGGATGATAGGTCTATTGGAGGAAGGGTCTGTCTTCAAAAGCTCGATGGTTATGAAAGCTTTGCTCTTAGCATGTGGAACATGTTTAAGGACAACATTCCAGAGGATAGCATGGCTGCTTGTGGAGAAGGTTGCAATCTTTCTAATGCAATTCCAGGGTTTGTGATTGCCTATGAAGATGCAGAAGGTGACCTTCTTCT
CGCTGGTGATCTGTCATGGAGGGATTTTGTTCGTGTTGCAAAGTGCATTAAAGTGATACCAGCAAAGAAAAACAAAATGAAAGGGAGCTCATGAATATTTGTATCAATCTTACTGTACACAAAAATTGGCATAAAAACATTTTTTGACAGGCGCCATCAGTCAAATGACCGATACAATATTTGCTTGCAAGCACTGCCCA
GTTGCAAACCACATATTTTAATGTTCTGGGGTTCTGTGGCTAAACATTAAAAAGATGATGTTTTACGTGTTCCAGAAGATTCTCGCTAGCAAGTTAGTTGGCAATTTACCATGCAGTAAACAAGAACCAAAGCACCTGTAATTGTCCTTAGTCAGATGAGGAGAACGAGGGAAATGATCAAGAAAAGGAGCATGTGCAAG
CTAAAGCTGTTGGCTTACAGGTGCTAAAATATTATTTGTCAGTCATATACTGGCTCTGCTCAATAGTGTACAGTTTATATTTCCATGATTTTCCAAATCCTTTGTGTAAATCTTGTATTGGTCTGACTCCTGAGAAATCCACGTATCAGTATAAAGGGAGGTGTTCTATCGCAGCTTCCATAAGAATGTGCATAATAAAT
CAGAATTTTCTCCTAAACAATTTTTTTATCTGAATTTAAACAATATAATATCCAATTTTGTTCTTCTAAAGTTTTGCATATAGAAATAT
>TRINITY_DN43153_c0_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:GCTCAATGGATTTATTTGACTATGATTCTTGTCTGATGCATAAAAAATAACTGGTTTAAAAACTCAAATGAATGAAGACTTTTGTCTCATTATCATAATGAAACATCTCTTTTCTGACTATGAAATTTGTCTATTTTAAGCAATGGCAGTCCAAGCAGACAAAACATCAACGCTCATCTTGAAATAATACTTGGCAATGC
CCAACTGCAGCAATGGCTGTTTGCCAAGTGCCTGGCATTATCACAGTCCAATCAGCTCAGTGTTATGTGGTTGTTTCCCTTCATAAATCGCAGGCTTTGGAATTAAAGAATCTGAGGCAGGAAGAGTATTTTTCACAGGGCGAAGCATCATTCTGCTTGTCAGCAACAATGGTCAAATCCAATGAGCCCGAGGATACAGC
AACATCTGAGTTGAGGATTTCAACTTCATCTGGGCCTTCACAAACCCACGAACTTGAATTATCTATTAGTGATGCCCATGCATTGGAATTAACAGGAGCCCCAGGCAGTAGTGTTGATGCACAGGTTATAAATTTGCAGGCATCTTTGGGAAGATCGGCAGATGTGATAGAAGAAGGTTCTATCTCTAGTGCGGACTCTG
GAAAGTTGAGCCTTGTAGGACGGTCAATGAAAAGGATCAGGTCAAATGTATTGGCCTTTAACCCTGATGGAAATAAGACAGGCCTTGAAAATGAGCATTTGCAATTTAAATGCCCCTCTCTAACAATTGGCAATGGTGACACAGTTGTGGGAATAAATAATTCAGCTTCATCTTCTGACAAAGACTTGTCTTGGGCCCAC
AACAGTAGCCCTGTTGATTGGAAGCTAGCAATGTCATGGCAATCTACACCTGACCATTCATTGGGATCATCATCATCACACCAACTGATTCATGGGGCTTTTAGAAAAGTTGGACAACAGGATTCTCAACTAAAACAGCCTACTTTGCTTCCCCATTTACTTTCTGTATCAAAATGCAAGGATGGTTCCGAATTTAGCAG
GGGTACTATTATTTCCCCTGGTCTCATGGGCTTGGAAAGGCCATTTATGTATCAGAGGCCTAGTTATTTGCATAATATCTGCACATCAAGCAATGAGTTATTAACCTACTGCTCAAATACAACCAACCATACCAGAGATGAGATAGATCCAATCTCAACAGGCTTGTTGTATGGAAACATTTCAGAACCAGTGACGTCAC
ATGATCATGAAATATTTCAACAAAATCGTCCATCCATAGAGTTTGGGCAGATAAACTTGAACCAGTGGCATTTACCTTTACTGGAAAATAGGCAACATATTCCAAATTCGGATTTTCCAAATGGCATGTTTTCGGAAAATGTGAGCATAGATTTGCATCGTACATGTTCAGTTGAAGGAAAGAAAGCAAAAGGCTTGACG
TTGTCACAAACAAGCATGGAACTTGTTTCTAATCCCAATGCCATCTGTGGACTGTCACCGGCACCAGTTTTTTCACCTATTCAACCAAATCCACACACACCAGAGTTCCCCTTTGAAATGAAAACCAGCTCTGAAATACTAATGCAAAACTTAAAATTTCCTTCCTTTTCAGCCATGAATGCTCCTTTCCCGCCTTCCAT
TAACCCGAGTGGCAACTTGCTGTATAGTTCAGGTCCTCCAGTTAGCAACATCGATGTGTCCAGGTCAGATCAATGGCCTTCTATTGATTCTAGATTTCAACCCAAAGGAGAGCAGCAGTCTCCCTTGATAAATGTTCTTAATTCTGCTAAGGACCGCCCAAGTCTTATTTCAGATCTGAACTTGTCACTATTGGTGCATG
GGGAAGACCCTCATAGTAGTTCATCACCACTTCATTCCTTTCCATTAGCCTCAGAAAATTTTATTTCTGCTAATAATCTATCTGTGAGTACAGGAGGAATGGGGTTGGAGCTTTTAGGACTTTCAAATATATCTCCAGATTTTGGTGCTCCCTCAGTTGATTCAGACGATCACAATGTTCCTCCATCCTTATCTGTAGTG
ATGGATGATAGGTCTATTGGAGGAAGGGTCTGTCTTCAAAAGCTCGATGGTTATGAAAGCTTTGCTCTTAGCATGTGGAACATGTTTAAGGACAACATTCCAGAGGATAGCATGGCTGCTTGTGGAGAAGGTTGCAATCTTTCTAATGCAATTCCAGGGTTTGTGATTGCCTATGAAGATGCAGAAGGTGACCTTCTTCT
CGCTGGTGATCTGTCATGGAGgtaaattgatttttgtctgagcatattctttagtcaggggtggacatttctgaatatatatactgacgtgtttcagaaaacgtcatatgtatagctagacaattttcacatgtacctgttacagctggaaacaccattaactatgactacttcagaaatatagagatgcaaatacactg
tgtgtattgtgttctctgttttatttggataggaaagtatagaacttaaagcgaattataacattaacaggattaccttattgttcgttgaaaatacactggtatttaatgcttattcagtttacttttgtcagttaatcttgagactcaaaaaactagttttttaatgtttttgaagctcatttcgcagGGATTTTGTT
CGTGTTGCAAAGTGCATTAAAGTGATACCAGCAAAGAAAAACAAAATGAAAGGTATTGATAAGTTCAATTTTTGTACACACATTTTATTGGTGCAATTTTTTTATTGTTTAG
Intron 2 GCGCCATCAG ... GTTCCAGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 71.19 | 17 | 10 | 42 |
| A2 | 69.39 | 15 | 9 | 34 |
| A3 | 75.76 | 8 | 14 | 25 |
| A4 | 77.78 | 4 | 6 | 14 |
| A5 | 61.54 | 10 | 7 | 16 |
| A6 | 64.97 | 62 | 30 | 115 |
| A7 | 67.97 | 74 | 38 | 157 |
| A8 | 75.46 | 67 | 41 | 206 |
| A9 | 64.06 | 78 | 45 | 139 |
| A10 | 70.91 | 32 | 17 | 78 |
>TRINITY_DN106024_c0_g4_i1 from sample A2 / Example spliced isoformCAGTGTTATTAGCTCCCCTCTCCAATCACAGGCCTCGGCTCGACCTACAGATATCCCCTCATTACGAAAAACAGGGATTTTGTTCGTGTTGCAAAGTGCATTAAAGTGATACCAGCAAAGAAAAACAAAATGAAAGATTCTCGCTAGCAAGTTAGTTGGCAATTTACCATGCAGTAAACAAGAACCAAAGCACCTGTAAT
TGTCCTTAGTCAGATGAGGAGAACGAGGGAAATGATCAAGAAAAGGAGCATGTGCAAGCTAAAGCTGTTGGCTTACAGTGTTGATCTTTGCAAACTCTTGGTTGGAATCAACCTTATGGACGTAAATTCTTTCTTCAGACACCATTCAGAGGCGTATTTTGTTCAAGGATGAAAGCAACACCAGAAAAGAAAATTCGAAT
TGCCACATGATGTAATGCCATTAGAGGCACCAGAGCAGCAAGGAATCAATATCACCGCCCTTTTTGGCTCCCAACTCAAGAGTAAAGGTAGAACCCTTGTCTAGTGGGGTACTGCCAATCCTCTGTTTCCCCATTTGTAAGTCTACCTTCTTTTTCTTCCATAAGTTGTTTGGTAGGTGGTGTGTAGTATAGAGGGAATC
TTGTCATGCTTAGGATTTGGAGCTTTCGTTGTGGTAGCTATTGACATTACCCCAGACTTCTCGGAAGGATTGAGCATTACACTCAGAAAAGTAAAACATTCACATAAAGAATCGATATACAACCATGTTGGAGTACCCCTCAATTTGATGGATTTCCATTACTTAATAACCCTAACGGTGAGATAATACAAGATACCACC
AACCAAATATGTGGTAAGTGGAATATGATGGGCTATATCATGTAACAACAAAAACAAGAACAATCATCTATTTGTAAGGTCACAGCCAAACCAGACACCAATTTGGTGTATGAGACAACAAGGGAC
>TRINITY_DN106024_c0_g4_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:GTCAGATCAATGGCCTTCTATTGATTCTAGATTTCAACCCAAAGGAGAGCAGCAGTCTCCCTTGATAAATGTTCTTAATTCTGCTAAGGACCGCCCAAGTCTTATTTCAGATCTGAACTTGTCACTATTGGTGCATGGGGAAGACCCTCATAGTAGTTCATCACCACTTCATTCCTTTCCATTAGCCTCAGAAAATTTTA
TTTCTGCTAATAATCTATCTGTGAGTACAGGAGGAATGGGGTTGGAGCTTTTAGGACTTTCAAATATATCTCCAGATTTTGGTGCTCCCTCAGTTGATTCAGACGATCACAATGTTCCTCCATCCTTATCTGTAGTGATGGATGATAGGTCTATTGGAGGAAGGGTCTGTCTTCAAAAGCTCGATGGTTATGAAAGCTTT
GCTCTTAGCATGTGGAACATGTTTAAGGACAACATTCCAGAGGATAGCATGGCTGCTTGTGGAGAAGGTTGCAATCTTTCTAATGCAATTCCAGGGTTTGTGATTGCCTATGAAGATGCAGAAGGTGACCTTCTTCTCGCTGGTGATCTGTCATGGAGGGATTTTGTTCGTGTTGCAAAGTGCATTAAAGTGATACCAGC
AAAGAAAAACAAAATGAAAGgcgccatcagtcaaatgaccgatacaatatttgcttgcaagcactgcccagttgcaaaccacatattttaatgttctggggttctgtggctaaacattaaaaagatgatgttttacgtgttccagaagATTCTCGCTAGCAAGTTAGTTGGCAATTTACCATGCAGTAAACAAGAACCAA
AGCACCTGTAATTGTCCTTAGTCAGATGAGGAGAACGAGGGAAATGATCAAGAAAAGGAGCATGTGCAAGCTAAAGCTGTTGGCTTACAGGTGCTAAAATATTATTTGTCAGTCATATACTGGCTCTGCTCAATATTGTACAGTTTATATTTCCATGATTTTCCAAATCCTTTGTGTAAATCTTGTATTGGTCTGACTCC
TGAGAAATCCACGTATCAGTATAAAGGGAGGTGTTCTATCGCAGCTTCCATAAGAATGTGCATAATAAATCAGAATTTTCTCCTAAACAATTTTTTTATCTGAATTTAAACAATATAATATCCA
Intron 3 GTGCTAAAAT ... CCGTTGATAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 69.7 | 10 | 23 | 2 |
| A2 | 80.77 | 5 | 21 | 0 |
| A3 | 75 | 6 | 18 | 1 |
| A4 | 53.33 | 14 | 16 | 2 |
| A5 | 56.25 | 7 | 9 | 1 |
| A6 | 80.2 | 39.3 | 159 | 1 |
| A7 | 73.33 | 56 | 154 | 5 |
| A8 | 82.13 | 40.3 | 185 | 4 |
| A9 | 74.11 | 51 | 146 | 7 |
| A10 | 68.63 | 32 | 70 | 2 |
>TRINITY_DN43383_c5_g1_i16 from sample A9 / Example spliced isoformGAAATAATTAATTTTGTAAACGGTGGGCATTAACACTAGATGTTCTATTATTAAAACGGAGGTGGTTTTTGTCTTATTTCTTACTCCGTATCCTCATGCAGGCGGTGACAGTGGACACCACCTTCTTAATAAGTAAATAACAGCGAGAATTCCATATAAAAAAACTAGAATGCATTTTATATTGCACAATGGCGACGGAC
TACAGTGTTATTAGCTCCCCTCTCCAATCACAGGCCTCGGCTCGACCTACAGATATCCCCTCATTACGAAAAACAGTCCAAGCAGACAAAACATCAACGCTCATCTTGAAATAATACTTGGCAATGCCCAACTGCAGCAATGGCTGTTTGCCAAGTGCCTGGCATTATCACAGTCCAATCAGCTCAGTGTTATGTGGTTG
TTTCCCTTCATAAATCGCAGGCTTTGGAATTAAAGAATCTGAGGCAGGAAGAGTATTTTTCACAGGGCGAAGCATCATTCTGCTTGTCAGCAACAATGGTCAAATCCAATGAGCCCGAGGATACAGCAACATCTGAGTTGAGGATTTCAACTTCATCTGGGCCTTCACAAACCCACGAACTTGAATTATCTATTAGTGAT
GCCCATGCATTGGAATTAACAGGAGCCCCAGGCAGTAGTGTTGATGCACAGGTTATAAATTTGCAGGCATCTTTGGGAAGATCGGCAGATGTGATAGAAGAAGGTTCTATCTCTAGTGCGGACTCTGGAAAGTTGAGCCTTGTAGGACGGTCAATGAAAAGGATCAGGTCAAATGTATTGGCCTTTAACCCTGATGGAAA
TAAGACAGGCCTTGAAAATGAGCATTTGCAATTTAAATGCCCCTCTCTAACAATTGGCAATGGTGACACAGTTGTGGGAATAAATAATTCAGCTTCATCTTCTGACAAAGACTTGTCTTGGGCCCACAACAGTAGCCCTGTTGATTGGAAGCTAGCAATGTCATGGCAATCTACACCTGACCATTCATTGGGATCATCAT
CATCACACCAACTGATTCATGGGGCTTTTAGAAAAGTTGGACAACAGGATTCTCAACTAAAACAGCCTACTTTGCTTCCCCATTTACTTTCTGTATCAAAATGCAAGGATGGTTCCGAATTTAGCAGGGGTACTATTATTTCCCCTGGTCTCATGGGCTTGGAAAGGCCATTTATGTATCAGAGGCCTAGTTATTTGCAT
AATATCTGCACATCAAGCAATGAGTTATTAACCTACTGCTCAAATACAACCAACCATACCAGAGATGAGATAGATCCAATCTCAACAGGCTTGTTGTATGGAAACATTTCAGAACCAGTGACGTCACATGATCATGAAATATTTCAACAAAATCGTCCATCCATAGAGTTTGGGCAGATAAACTTGAACCAGTGGCATTT
ACCTTTACTGGAAAATAGGCAACATATTCCAAATTCGGATTTTCCAAATGGCATGTTTTCGGAAAATGTGAGCATAGATTTGCATCGTACATGTTCAGTTGAAGGAAAGAAAGCAAAAGGCTTGACGTTGTCACAAACAAGCATGGAACTTGTTTCTAATCCCAATGCCATCTGTGGACTGTCACCGGCACCAGTTTTTT
CACCTATTCAACCAAATCCACACACACCAGAGTTCCCCTTTGAAATGAAAACCAGCTCTGAAATACTAATGCAAAACTTAAAATTTCCTTCCTTTTCAGCCATGAATGCTCCTTTCCCGCCTTCCATTAACCCGAGTGGCAACTTGCTGTATAGTTCAGGTCCTCCAGTTAGCAACATCGATGTGTCCAGGTCAGATCAA
TGGCCTTCTATTGATTCTAGATTTCAACCCAAAGGAGAGCAGCAGTCTCCCTTGATAAATGTTCTTAATTCTGCTAAGGACCGCCCAAGTCTTATTTCAGATCTGAACTTGTCACTATTGGTGCATGGGGAAGACCCTCATAGTAGTTCATCACCACTTCATTCCTTTCCATTAGCCTCAGAAAATTTTATTTCTGCTAA
TAATCTATCTGTGAGTACAGGAGGAATGGGGTTGGAGCTTTTAGGACTTTCAAATATATCTCCAGATTTTGGTGCTCCCTCAGTTGATTCAGACGATCACAATGTTCCTCCATCCTTATCTGTAGTGATGGATGATAGGTCTATTGGAGGAAGGGTCTGTCTTCAAAAGCTCGATGGTTATGAAAGCTTTGCTCTTAGCA
TGTGGAACATGTTTAAGGACAACATTCCAGAGGATAGCATGGCTGCTTCTGGAGAAGGTTGCAATCTTTCTAATGCAATTCCAGGGTTTGTGATTGCCTATGAAGATGCAGAAGGTGACCTTCTTCTCGCTGGTGATCTGTCATGGAGGGATTTTGTTCGTGTTGCAAAGTGCATTAAAGTGATACCAGCAAAGAAAAAC
AAAATGAAAGGCGCCATCAGTCAAATGACCGATACAATATTTGCTTGCAAGCACTGCCCAGTTGCAAACCACATATTTTAATGTTCTGGGGTTCTGTGGCTAAACATTAAAAAGATGATGTTTTACGTGTTCCAGAAGATTCTCGCTAGCAAGTTAGTTGGCAATTTACCATGCAGTAAACAAGAACCAAAGCACCTGTA
ATTGTCCTTAGTCAGATGAGGAGAACGAGGGAAATGATCAAGAAAAGGAGCATGTGCAAGCTAAAGCTGTTGGCTTACAGTGTTGATCTTTGCAAACTCTTGGTTGGAATCAACCTTATGGACGTAAATTCTTTCTTCAGACACCATTCAGAGGCGTATTTTGTTCAAGGATGAAAGCAACACCAGAAAAGAAAATTCGA
ATTGCCACATGATGTAATGCCATTAGAGGCACCAGAGCAGCAAGGAATCAATATCACCGCCCTTTTTGGCTCCCAACTCAAGAGTAAAGGTAGAACCCTTGTCTAGTGGGGTACTGCCAATCCTCTGTTTCCCCATTTGTAAGTCTACCTTCTTTTTCTTCCATAAGTTGTTTGGTAGGTGGTGTGTAGTATAGAGGGAA
TCTTGTCATGCTTAGGATTTGGAGCTTTCGTTGTGGTAGCTATTGACATTACCCCAGACTTCTCGGAAGGATTGAGCATTACACTCAGAAAAGTAAAACATTCACATAAAGAATCGATATACAACCATGTTGGAGTACCCCTCAATTTGATGGATTTCCATTACTTAATAACCCTAACGGTGAGATAATACAAGATACCA
CCAACCAAATATGTGGTAAGTGGAATATGATGGGCTATATCATGTAACAACAAAAACAAGAACAATCATCTATTTGTAAGGTCACAGCCAAACCAGACACCAATTTGGTGTATGAGACAACAAGGGACCCCTTTTGCGCAGTGATTTGACTGCTAAAGTCTATGGAGGTGTACATACCCTACCCCCCTGACCTCTTAGGA
GCAAACACATGTATAACAAGATAACAAGATACATCAGGGTGTGCATACCCTACCCCCTTGACCTCTTAGGAGGAAACACATGTATAATGAGATACATCATAATGTGGCCTAGGGTGATCATTAAGTGCAACTCAAATAATAAAATATACATCTTAATGTGGGCTAGGGTGATCATTATGTGACTCAAATAATAAAATATA
CATCATAATGTGGGTTACGCTGGTTATTAAGTGACTCAAATTATAAAATATTTATCATAATGTGTGTTAGGGTGGCCATTAAGTGAAACTTGAGCATTCCTATAAGGTCATCTCATCGACCATGGCTCCAATTGTCATTTTGAATATCTCGAACGTGTTCTTTTCCAATCACTTGACAAGGATATTTTTTGTTTTCTCCT
TTGTAGGAAAATACCTCAATATATTTTTTATCAATCCCTGTTCTGCGAGATGGTGACAATGAACCTAAATGTGTTTGGTACACGCATGGTATATTGGACTCTTCATGATTTTATGAGTTAGAGATTGACCAAGTCCATCTATGATTGAGAAAGAGAGAATTGAGTCAAAATTTATGAGTATGGGTGCAAACATTTGGTTG
TTGCATTAAAGGTGTATAATAACTCAAAATTAGTGGTGGACATTGCAGTGGTTAACTTTTAGTGCTGATTAATGTGGTGTGTTGTGAACATGCTAATATTAACACAATTTTGATGTTGCGACCCATTCATACAAGAATAAAGTTTGGTTGCACTATTATTTGTCACACAAACTAATGCATTGATTTTGATTGGAGACGAC
CAATCAATGTAGGCATGTTGGTGCGAATGAACAACTCATTGACTTGCAATGAAGACCAACAACGATAAAGAATCGTCTTCCTTATATGTTTACCCATCTTTCTCGGAGTTTTGTATGTTATGTAGTATAGAGAATATGAATAGATGAGAAACAAAGTGTTTCATATTCCTTAGCTAGATTATTGATAGTTGGTCATGAAA
CTGTACATTGGTTGATTGGTTGAATAGTTTTCCCCAGTGATAATACTAATTAGTTGAGGTTGTTCATATTTGGTTGTACATTCTTACTTTGTTTATGACAAACTGAATTTGATTCATTCAATTCTATCATGCG
>TRINITY_DN43383_c5_g1_i10 from sample A9 / Example unspliced isoform:GAAATAATTAATTTTGTAAACGGTGGGCATTAACACTAGATGTTCTATTATTAAAACGGAGGTGGTTTTTGTCTTATTTCTTACTCCGTATCCTCATGCAGGCGGTGACAGTGGACACCACCTTCTTAATAAGTAAATAACAGCGAGAATTCCATATAAAAAAACTAGAATGCATTTTATATTGCACAATGGCGACGGAC
TACAGTGTTATTAGCTCCCCTCTCCAATCACAGGCCTCGGCTCGACCTACAGATATCCCCTCATTACGAAAAACAGGGATTTTGTTCGTGTTGCAAAGTGCATTAAAGTGATACCAGCAAAGAAAAACAAAATGAAAGGGAGCTCATGAATATTTGTATCAATCTTACTGTACACAAAAATTGGCATAAAAACATTTTTT
GACAGGCGCCATCAGTCAAATGACCGATACAATATTTGCTTGCAAGCACTGCCCAGTTGCAAACCACATATTTTAATGTTCTGGGGTTCTGTGGCTAAACATTAAAAAGATGATGTTTTACGTGTTCCAGAAGATTCTCGCTAGCAAGTTAGTTGGCAATTTACCATGCAGTAAACAAGAACCAAAGCACCTGTAATTGT
CCTTAGTCAGATGAGGAGAACGAGGGAAATGATCAAGAAAAGGAGCATGTGCAAGCTAAAGCTGTTGGCTTACAGgtgctaaaatattatttgtcagtcatatactggctctgctcaatattgtacagtttatatttccatgattttccaaatcctttgtgtaaatcttgtattggtctgactcctgagaaatccacgta
tcagtataaagggaggtgttctatcgcagcttccataagaatgtgcataataaatcagaattttctcctaaacaatttttttatctgaatttaaacaatataatatccaattttgttcttctaaagttttgcatatagaaatattgctataatctgaaagagtaatttaaattttactttatctcttagtctaatggaca
tatttgctaaactctagtcagttggccgttgatagTGTTGATCTTTGCAAACTCTTGGTTGGAATCAACCTTATGGACGTAAATTCTTTCTTCAGACACCATTCAGAGGCGTATTTTGTTCAAGGATGAAAGCAACACCAGAAAAGAAAATTCGAATTGCCACATGATGTAATGCCATTAGAGGCACCAGAGCAGCAAGG
AATCAATATCACCGCCCTTTTTGGCTCCCAACTCAAGAGTAAAGGTAGAACCCTTGTCTAGTGGGGTACTGCCAATCCTCTGTTTCCCCATTTGTAAGTCTACCTTCTTTTTCTTCCATAAGTTGTTTGGTAGGTGGTGTGTAGTATAGAGGGAATCTTGTCATGCTTAGGATTTGGAGCTTTCGTTGTGGTAGCTATTG
ACATTACCCCAGACTTCTCGGAAGGATTGAGCATTACACTCAGAAAAGTAAAACATTCACATAAAGAATCGATATACAACCATGTTGGAGTACCCCTCAATTTGATGGATTTCCATTACTTAATAACCCTAACGGTGAGATAATACAAGATACCACCAACCAAATATGTGGTAAGTGGAATATGATGGGCTATATCATGT
AACAACAAAAACAAGAACAATCATCTATTTGTAAGGTCACAGCCAAACCAGACACCAATTTGGTGTATGAGACAACAAGGGACCCCTTTTGCGCAGTGATTTGACTGCTAAAGTCTATGGAGGTGTACATACCCTACCCCCCTGACCTCTTAGGAGCAAACACATGTATAACAAGATAACAAGATACATCAGGGTGTGCA
TACCCTACCCCCTTGACCTCTTAGGAGGAAACACATGTATAATGAGATACATCATAATGTGGCCTAGGGTGATCATTAAGTGCAACTCAAATAATAAAATATACATCTTAATGTGGGCTAGGGTGATCATTATGTGACTCAAATAATAAAATATACATCATAATGTGGGTTACGCTGGTTATTAAGTGACTCAAATTATA
AAATATTTATCATAATGTGTGTTAGGGTGGCCATTAAGTGAAACTTGAGCATTCCTATAAGGTCATCTCATCGACCATGGCTCCAATTGTCATTTTGAATATCTCGAACGTGTTCTTTTCCAATCACTTGACAAGGATATTTTTTGTTTTCTCCTTTGTAGGAAAATACCTCAATATATTTTTTATCAATCCCTGTTCTG
CGAGATGGTGACAATGAACCTAAATGTGTTTGGTACACGCATGGTATATTGGACTCTTCATGATTTTATGAGTTAGAGATTGACCAAGTCCATCTATGATTGAGAAAGAGAGAATTGAGTCAAAATTTATGAGTATGGGTGCAAACATTTGGTTGTTGCATTAAAGGTGTATAATAACTCAAAATTAGTGGTGGACATTG
CAGTGGTTAACTTTTAGTGCTGATTAATGTGGTGTGTTGTGAACATGCTAATATTAACACAATTTTGATGTTGCGACCCATTCATACAAGAATAAAGTTTGGTTGCACTATTATTTGTCACACAAACTAATGCATTGATTTTGATTGGAGACGACCAATCAATGTAGGCATGTTGGTGCGAATGAACAACTCATTGACTT
GCAATGAAGACCAACAACGATAAAGAATCGTCTTCCTTATATGTTTACCCATCTTTCTCGGAGTTTTGTATGTTATGTAGTATAGAGAATATGAATAGATGAGAAACAAAGTGTTTCATATTCCTTAGCTAGATTATTGATAGTTGGTCATGAAACTGTACATTGGTTGATTGGTTGAATAGTTTTCCCCAGTGATAATA
CTAATTAGTTGAGGTTGTTCATATTTGGTTGTACATTCTTACTTTGTTTATGACAAACTGAATTTGATTCATTCAATTCTATCATGCG