sp|Q8RY81|OFT13_ARATH ----> O-fucosyltransferase 13
Intron 1 GTAATTTATT ... AATGATACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 42.25 | 41 | 30 | 9 |
| A2 | 21.67 | 47 | 13 | 3 |
| A3 | 25.45 | 41 | 14 | 4 |
| A4 | 18.18 | 72 | 16 | 7 |
| A5 | 34.12 | 56 | 29 | 2 |
| A6 | 5.8 | 65 | 4 | 0 |
| A7 | 12.82 | 34 | 5 | 0 |
| A8 | 10.34 | 26 | 3 | 0 |
| A9 | 4.65 | 41 | 2 | 0 |
| A10 | 16.67 | 45 | 9 | 0 |
>TRINITY_DN106052_c1_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoformTTGGAACTTGGAAGGTGAAAGCAATCACATCGAGCGGTGTGAAAAAAAAAAATCACATCTAGCCATCGTGGATATTTTAAAGATTGAATTACACATAAATAACTCCTAAATTTTTTACCTGCTCCACGATTTATGTGCACGCAGAGCACTAGATGCAAACCTATCAGATGCCTTTGCTCACATAATCAATGTGTAAGCAA
CAGAATTAACAACCCAGATCAGATCATAGGGAGCCCTGAAGAATGCCACTCCTCTCAACTCGTTTTGTGTTCAACTGCACTTCTACATGCATAGACAGTCACACAAATCTGGTGGACTATTATGCCCACACAAGCTCTGCATGTCACCAGTTTGCACAGAAAATGAAAATACAACTCAAAGCAATCAACGGATTTATAGA
TTCAAACTTTAGCATAAATGCTTTTGATGTTTGCACGGAGTCTGGTCCCTGCAGAAGCTTGAATTTCAAGTTGTGTTCATTGTTGGGAGCTTCAGATCTAAGCTAATTCCTATTAACTAGAGCTTAACCGTCAAGTGGGTTAAAGACTTGCGAAAGTTCCGTGAAAGTTCTCAACTTTCAATGGCAGCTTTCAAGCAACC
GCTTAATGGTGGGTTCATAGCAGCAGCAGCAGTCCTTATATGTTTGCTTCTAATTCACATGAGTCCAAGGCCTCCGGCCCAGCAGAATGAGTACCTTGGGACTTTTCCTCCTATAGACAGGACTGTAATGCCCAGAAAAACGAGTCCACGAAAAAGTATTTGGAATGTGCAGAGCCTTGTGCACTGGAAGCCTTGCGAAT
GGTGGACTGCAAAACCCATAACAGGTCCTCCAGTGGAAAGCAATGGATATATTAAAATTGATTGCCATGGAGGTCTTAATCAGATGCGACGAGATCTATGCGATGGTGTAGATGTTGCTCGTCTGCTCAATGCAACATTAGTCCTGCCAAATTTTGAAACAGCCTCATATTGGAATGATACAAGTGGTTTTGCAGAAATT
TTCAATGTAGACTATTTCATTCAGCAGATGGAGGGATTTGTCGGTGTAGTGAAAGAACCACCACAAGGACTGGCCTCAATAAATCCAGTTAGAGTTGATTGTCGTAAACAGAAAGGTCATTTCGATTATATAGAGTCTGTACTTCCTTCTTTGGTGAAGCATCAATACATCATCATTACCCCTGCAGCAAGTCAAAAAAT
AGATAGACACCCATTTTATGCCAAAGCAGCTCGTTGTCATGCATGTTTCAGAGCTCTACGCCTTGCTAAGCATCTTGAGCTAAAGGGAGCTGAACTACTACAAAGGATCCCTCAACCTTTTTTGTCTTTGCATCTGAGATTTGAGCCTGACATGATAGCTTACAGTAGATGTGAGTATACTGGCCTTGCTCAGAGCTCTT
TGGATGCAATTAATGCAGCTAGAAATGGTAGGATAAGCTTCTCAGGGGATGTGGGACTAGCATGGAGGAAGAGAGGAAAGTGCCCACTAACTCCGAGAGAGACGGCCTTCATTTTGCAGGCCCTTGGAATCCCCACTAACACAACTATTTATTTGGCTGCTGGTAAAAGCCTATTGGAGTGGAAGGATTTCACTTCTGTG
TACAAGAACATTTACACCAAATCTTCTATTCTAGACAAGGCAAGCTTGGTGGGATTGCATGGAAATAGCAGAGCTGCATTGGACTACTATATATCCATCAACAGTGAGGCATACATTGGGACATATTTTGGGAACATGGACAAGATGGTAGCTGCAATGAGAGCTTTGAATGGGCGACCAAACACAATTTTTCTCAACAG
GAGAGCTTTTGCAGAAGCTGTTTCTCAAGGTCTCGATGGAGATAGGCTGGCAGATTATTTGTGGGAGGCTCACAGGAATGCTTTAGTTGATGGAAGAGGATCTGCTCTACCTGATTGCTTTTGCATGTCCAACATTACAGATTCGCATTAATTGTAATGATAATTAAGTTATACGTTATCTCCACATTCCATGGTTTCGG
AAACATGATTTCATCTATGGAGTGTCTCTTCAACATGAGATATTTCTGTTCTTTTTTGAAAGTTTATTGCCAGATTTTTACAATGGTTTTTGTTAGTTGCAGTGAAGGGAAGGGAACCACAGCTTATAAAAATTATGTTGCTTCTGATCTTTTTCAGAGTTTACAATGGAACCTGCAAAGCTCGTCTATTGGAGTAAATC
ACCATGTTTTTAGATTGCAGCAAGGAATTATACATTTTTAGTAGCTTCC
>TRINITY_DN106052_c1_g1_i7 from sample A4 / Example unspliced isoform:TTGGAACTTGGAAGGTGAAAGCAATCACATCGAGCGGTGTGAAAAAAAAAAATCACATCTAGCCATCGTGGATATTTTAAAGATTGAATTACACATAAATAACTCCTAAATTTTTTACCTGCTCCACGATTTATGTGCACGCAGAGCACTAGATGCAAACCTATCAGATGCCTTTGCTCACATAATCAATGTGTAAGCAA
CAGAATTAACAACCCAGATCAGATCATAGGGAGCCCTGAAGAATGCCACTCCTCTCAACTCGTTTTGTGTTCAACTGCACTTCTACATGCATAGACAGTCACACAAATCTGGTGGACTATTATGCCCACACAAGCTCTGCATGTCACCAGTTTGCACAGAAAATGAAAATACAACTCAAAGCAATCAACGGATTTATAGA
TTCAAACTTTAGCATAAATGCTTTTGATGTTTGCACGGAGTCTGGTCCCTGCAGAAGCTTGAATTTCAAGTTGTGTTCATTGTTGGGAGCTTCAGATCTAAGCTAATTCCTATTAACTAGAGCTTAACCGTCAAGTGGGTTAAAGACTTGCGAAAGTTCCGTGAAAGTTCTCAACTTTCAATGGCAGCTTTCAAGCAACC
GCTTAATGGTGGGTTCATAGCAGCAGCAGCAGTCCTTATATGTTTGCTTCTAATTCACATGAGTCCAAGGCCTCCGGCCCAGCAGAATGAGTACCTTGGGACTTTTCCTCCTATAGACAGGACTGTAATGCCCAGAAAAACGAGTCCACGAAAAAGTATTTGGAATGTGCAGAGCCTTGTGCACTGGAAGCCTTGCGAAT
GGTGGACTGCAAAACCCATAACAGgtaatttattatttgcctgattctttgtgtagataaagttttcatttgtgtgcaggtagatctacttctgaatcatctattactatttaagatcacagttcaaaggtcttacttgaactcctgtaacgtcctagttctgagctttgcttagacaagtaaggtcctgtcctgagctc
tgcccaagcaggcaaggtcctgactgaaaagtcttactggacctaaggaaaggtcgtaagttaggtctgtattcattcgctgtcactgaaatgatacagGTCCTCCAGTGGAAAGCAATGGATATATTAAAATTGATTGCCATGGAGGTCTTAATCAGATGCGACGAGATGTAAGTATCTGAAATAACAGATTAATTCTG
AGTTGATGTTGATTTTTTTCTGAAAAAATGATTCTTTTAGTAACAATAAAAGTACAAAGTTCTAATTGGCTTACGGCTATATAAAGGACAGCAAAAATGTACTTAAGATAGATTGAGCTCCAGGATCACAACTATTTCAGCATACATCAACGAGTATACTCCATCTGGAGGCTAAGATACACTGCAGTCATGTTAAAAAA
TTTTACCCAACTCAAACAAGTCTTTTTCATTTTCTTGCATATCTATTATGAACAATCTAGCTTGGACTTTTCTGTTTTCCAAATTCAGAAAAGAGTTTGTTGATAGTGTTTTCTATGCCAATCTTGTTGTCTTTGCAGCTATGCGATGGTGTAGATGTTGCTCGTCTGCTCAATGCAACATTAGTCCTGCCAAATTTTGA
AACAGCCTCATATTGGAATGATACAAGGTAGCGTACAATGTCTGATATGAGTATGCAAATTAACCAATTGGAAATGTTTCACCACACAATGAGAAGATTTAGAATCTTCTTTGAAGTTTTACAAGCAAAGAAATACTGGTGCCCTTGTTTCTATGGTTATGTAAACAAAGTGCTAGGAAATAAATATGTCAATTCTGTGG
AACAGGGGAAACTGAAATTAACAGCATGTGTTATTAAAGGATTACCATATAAACACATAAGAGAGAGGGATTCAACTACTTTCAAACATTGGAGTCAATTAAGATACAAACATCATTAGACTTAGAACTAGAGAACTTTGGGTATCTCATTACATAGATCCTTGAAGATAGGGCAGGGCCTATCGAATACATTGTGATGT
ATCTGTAACAGGTTTTATAGACCAATTGGTCTAAGATGTTAATTGAATTCATTCAGATTTCATCATTAGGTTATCCCTTTTTCATCTCCAATTGGCCACTAAAAAGTGCTCAATCATGGCCTGCTGTGTTCAGTGATTTGTCTCTTAGGGTCACTGGGTAGCTGGAACTGGGAGCTGGATACGTCAGCTACAAACTTGTA
AGAGCCTAGCCTTTTGTCCTTGAAAAAGATGAATTGGCTGCTAGCATTATATAACTCTTATTTTGGGGAAGACAGCTCAACTTTAAGGAACATGCCAATCTCAGGCATCAGATTCCGGATAGTCATTGTTGAAAATTTGTGACAGTTTTGTTTGTTTCTATAGGGCACATATGCACAGGAGAAGAAAATAATGAATTTTC
ACACTAAACTCTTAATTTTGTATTGCATCAGATAAGATAAGATAGTTTTATTAATGTAAAACAAATGACCACAAGAGTAGGTCAATGGGGCTAAAAGGTTTGCCTAGTGCAAATACAGTGTGGGAGTGTGCAAGCAACTCCTTTAACAATGCTGAAAGCGAAAAGAAAATGAAAATAAAGGAGCATAACAAAATATCTAG
AAGCATAACTATCACTCAAACCAGAAGATACAAAAGCATAAGTTCAGTGATACAATAGAAAGGCCAGGGACTGGAGATCCCAGTGCTGAGCAAGAGAGAGAGAGAGGGTGTCAAGTCCTGCTGGTCCTGATGGCCAAGGGCAAGGGAGGGGGGAGGACCGAGGTATATTTTCATGATACACAATTTGTTCCAAAATTGGA
CCAAATTATCATAAATGTTTATGCTATCGTATTTTTTCCACTTCTATTTTAGCAGAGCAGGGTACCCAACTAGAAAGGTCATTACATCTTGAACACCCCCTTAATGACCACTTTATTATCTTTTACAGCAAGCATCTCCCGAAATTTCTGAAGTTTCTCCTTGCTCAAAGCTTTCATGAAGACGTCTGCAAGCTAATCTT
TAGTTGTGCAGTACACAACCCCAACTTCTCCAGTGTTATCATTGGACCTGACTATCTCTAGCATCATTGGTCACACAGCCTAAGGATTTCCCTTGGAAGTTGAGGGTTTGCTACCACCAGCTACGTGCTGAGACAAACCACCATATTTCTCTTTGCAAGTGGGTCTACCGTCTTTGTTCTCTCGAAGAGGTTGAGAATGC
GGAGCACTTCATTTTCTAGTTCCCCATCTATTATAAGTTCCAGGGAAGATATACCATTGTTTGTATTGAGACTTGGGAGGTTCCTTATCCACCTTCCACTATCGCAATCAAATATATGTAGCCCTATTCCTCCGAGACACTGCCACTTTCAGACATAGAGATTTGCAAGAGACCCCTGGGGCCAATTTTAGGCCTACAAG
GTTGACCACCTTCTTTCAGCGTATTCCAGAGATTGGGGGTACTAAGCACCCTTTCCACACATAGGCAGGTAGATATAGGTCAATGAGACAATGTTCCTC
Intron 2 GTAAGTATCT ... GTCTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.15 | 41 | 8 | 14 |
| A2 | 11.67 | 53 | 7 | 7 |
| A3 | 16.81 | 47 | 3 | 16 |
| A4 | 15.38 | 66 | 19 | 5 |
| A5 | 12.2 | 54 | 7 | 8 |
| A6 | 0 | 71 | 0 | 0 |
| A7 | 0 | 38 | 0 | 0 |
| A8 | 0 | 27 | 0 | 0 |
| A9 | 4.55 | 42 | 0 | 4 |
| A10 | 0.88 | 56 | 1 | 0 |
>TRINITY_DN106052_c1_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoformTTGGAACTTGGAAGGTGAAAGCAATCACATCGAGCGGTGTGAAAAAAAAAAATCACATCTAGCCATCGTGGATATTTTAAAGATTGAATTACACATAAATAACTCCTAAATTTTTTACCTGCTCCACGATTTATGTGCACGCAGAGCACTAGATGCAAACCTATCAGATGCCTTTGCTCACATAATCAATGTGTAAGCAA
CAGAATTAACAACCCAGATCAGATCATAGGGAGCCCTGAAGAATGCCACTCCTCTCAACTCGTTTTGTGTTCAACTGCACTTCTACATGCATAGACAGTCACACAAATCTGGTGGACTATTATGCCCACACAAGCTCTGCATGTCACCAGTTTGCACAGAAAATGAAAATACAACTCAAAGCAATCAACGGATTTATAGA
TTCAAACTTTAGCATAAATGCTTTTGATGTTTGCACGGAGTCTGGTCCCTGCAGAAGCTTGAATTTCAAGTTGTGTTCATTGTTGGGAGCTTCAGATCTAAGCTAATTCCTATTAACTAGAGCTTAACCGTCAAGTGGGTTAAAGACTTGCGAAAGTTCCGTGAAAGTTCTCAACTTTCAATGGCAGCTTTCAAGCAACC
GCTTAATGGTGGGTTCATAGCAGCAGCAGCAGTCCTTATATGTTTGCTTCTAATTCACATGAGTCCAAGGCCTCCGGCCCAGCAGAATGAGTACCTTGGGACTTTTCCTCCTATAGACAGGACTGTAATGCCCAGAAAAACGAGTCCACGAAAAAGTATTTGGAATGTGCAGAGCCTTGTGCACTGGAAGCCTTGCGAAT
GGTGGACTGCAAAACCCATAACAGGTCCTCCAGTGGAAAGCAATGGATATATTAAAATTGATTGCCATGGAGGTCTTAATCAGATGCGACGAGATCTATGCGATGGTGTAGATGTTGCTCGTCTGCTCAATGCAACATTAGTCCTGCCAAATTTTGAAACAGCCTCATATTGGAATGATACAAGTGGTTTTGCAGAAATT
TTCAATGTAGACTATTTCATTCAGCAGATGGAGGGATTTGTCGGTGTAGTGAAAGAACCACCACAAGGACTGGCCTCAATAAATCCAGTTAGAGTTGATTGTCGTAAACAGAAAGGTCATTTCGATTATATAGAGTCTGTACTTCCTTCTTTGGTGAAGCATCAATACATCATCATTACCCCTGCAGCAAGTCAAAAAAT
AGATAGACACCCATTTTATGCCAAAGCAGCTCGTTGTCATGCATGTTTCAGAGCTCTACGCCTTGCTAAGCATCTTGAGCTAAAGGGAGCTGAACTACTACAAAGGATCCCTCAACCTTTTTTGTCTTTGCATCTGAGATTTGAGCCTGACATGATAGCTTACAGTAGATGTGAGTATACTGGCCTTGCTCAGAGCTCTT
TGGATGCAATTAATGCAGCTAGAAATGGTAGGATAAGCTTCTCAGGGGATGTGGGACTAGCATGGAGGAAGAGAGGAAAGTGCCCACTAACTCCGAGAGAGACGGCCTTCATTTTGCAGGCCCTTGGAATCCCCACTAACACAACTATTTATTTGGCTGCTGGTAAAAGCCTATTGGAGTGGAAGGATTTCACTTCTGTG
TACAAGAACATTTACACCAAATCTTCTATTCTAGACAAGGCAAGCTTGGTGGGATTGCATGGAAATAGCAGAGCTGCATTGGACTACTATATATCCATCAACAGTGAGGCATACATTGGGACATATTTTGGGAACATGGACAAGATGGTAGCTGCAATGAGAGCTTTGAATGGGCGACCAAACACAATTTTTCTCAACAG
GAGAGCTTTTGCAGAAGCTGTTTCTCAAGGTCTCGATGGAGATAGGCTGGCAGATTATTTGTGGGAGGCTCACAGGAATGCTTTAGTTGATGGAAGAGGATCTGCTCTACCTGATTGCTTTTGCATGTCCAACATTACAGATTCGCATTAATTGTAATGATAATTAAGTTATACGTTATCTCCACATTCCATGGTTTCGG
AAACATGATTTCATCTATGGAGTGTCTCTTCAACATGAGATATTTCTGTTCTTTTTTGAAAGTTTATTGCCAGATTTTTACAATGGTTTTTGTTAGTTGCAGTGAAGGGAAGGGAACCACAGCTTATAAAAATTATGTTGCTTCTGATCTTTTTCAGAGTTTACAATGGAACCTGCAAAGCTCGTCTATTGGAGTAAATC
ACCATGTTTTTAGATTGCAGCAAGGAATTATACATTTTTAGTAGCTTCC
>TRINITY_DN106052_c1_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:TTGGAACTTGGAAGGTGAAAGCAATCACATCGAGCGGTGTGAAAAAAAAAAATCACATCTAGCCATCGTGGATATTTTAAAGATTGAATTACACATAAATAACTCCTAAATTTTTTACCTGCTCCACGATTTATGTGCACGCAGAGCACTAGATGCAAACCTATCAGATGCCTTTGCTCACATAATCAATGTGTAAGCAA
CAGAATTAACAACCCAGATCAGATCATAGGGAGCCCTGAAGAATGCCACTCCTCTCAACTCGTTTTGTGTTCAACTGCACTTCTACATGCATAGACAGTCACACAAATCTGGTGGACTATTATGCCCACACAAGCTCTGCATGTCACCAGTTTGCACAGAAAATGAAAATACAACTCAAAGCAATCAACGGATTTATAGA
TTCAAACTTTAGCATAAATGCTTTTGATGTTTGCACGGAGTCTGGTCCCTGCAGAAGCTTGAATTTCAAGTTGTGTTCATTGTTGGGAGCTTCAGATCTAAGCTAATTCCTATTAACTAGAGCTTAACCGTCAAGTGGGTTAAAGACTTGCGAAAGTTCCGTGAAAGTTCTCAAGTGGGTTTACGAATCTTGAAAGTTTC
TGTGAAAATTCTTAAGTGGGTTGAACCATAATCGACGTTTCTGGCGAAATTCTCAGTTGGGTCTAAGTATTTTGAAAGCTTCTGCCAGAAAAGTTCAATTGATTTGAGGATTTTTGTATTGGCAGCTTTCAATGGCAGCTTTCAAGCAACCGCTTAATGGTGGGTTCATAGCAGCAGCAGCAGTCCTTATATGTTTGCTT
CTAATTCACATGAGTCCAAGGCCTCCGGCCCAGCAGAATGAGTACCTTGGGACTTTTCCTCCTATAGACAGGACTGTAATGCCCAGAAAAACGAGTCCACGAAAAAGTATTTGGAATGTGCAGAGCCTTGTGCACTGGAAGCCTTGCGAATGGTGGACTGCAAAACCCATAACAGGTAATTTATTATTTGCCTGATTCTT
TGTGTAGATAAAGTTTTCATTTGTGTGCAGGTAGATCTACTTCTGAATCATCTATTACTATTTAAGATCACAGTTCAAAGGTCTTACTTGAACTCCTGTAACGTCCTAGTTCTGAGCTTTGCTTAGACAAGTAAGGTCCTGTCCTGAGCTCTGCCCAAGCAGGCAAGGTCCTGACTGAAAAGTCTTACTGGACCTAAGGA
AAGGTCGTAAGTTAGGTCTGTATTCATTCGCTGTCACTGAAATGATACAGGTCCTCCAGTGGAAAGCAATGGATATATTAAAATTGATTGCCATGGAGGTCTTAATCAGATGCGACGAGATgtaagtatctgaaataacagattaattctgagttgatgttgatttttttctgaaaaaatgattcttttagtaacaataa
aagtacaaagttctaattggcttacggctatataaaggacagcaaaaatgtacttaagatagattgagctccaggatcacaactatttcagcatacatcaacgagtatactccatctggaggctaagatacactgcagtcatgttaaaaaattttacccaactcaaacaagtctttttcattttcttgcatatctattat
gaacaatctagcttggacttttctgttttccaaattcagaaaagagtttgttgatagtgttttctatgccaatcttgttgtctttgcagCTATGCGATGGTGTAGATGTTGCTCGTCTGCTCAATGCAACATTAGTCCTGCCAAATTTTGAAACAGCCTCATATTGGAATGATACAAGGTAGCGTACAATGTCTGATATG
AGTATGCAAATTAACCAATTGGAAATGTTTCACCACACAATGAGAAGATTTAGAATCTTCTTTGAAGTTTTACAAGCAAAGAAATACTGGTGCCCTTGTTTCTATGGTTATGTAAACAAAGTGCTAGGAAATAAATATGTCAATTCTGTGGAACAGGGGAAACTGAAATTAACAGCATGTGTTATTAAAGGATTACCATA
TAAACACATAAGAGAGAGGGATTCAACTACTTTCAAACATTGGAGTCAATTAAGATACAAACATCATTAGACTTAGAACTAGAGAACTTTGGGTATCTCATTACATAGATCCTTGAAGATAGGGCAGGGCCTATCGAATACATTGTGATGTATCTGTAACAGGTTTTATAGACCAATTGGTCTAAGATGTTAATTGAATT
CATTCAGATTTCATCATTAGGTTATCCCTTTTTCATCTCCAATTGGCCACTAAAAAGTGCTCAATCATGGCCTGCTGTGTTCAGTGATTTGTCTCTTAGGGTCACTGGGTAGCTGGAACTGGGAGCTGGATACGTCAGCTACAAACTTGTAAGAGCCTAGCCTTTTGTCCTTGAAAAAGATGAATTGGCTGCTAGCATTA
TATAACTCTTATTTTGGGGAAGACAGCTCAACTTTAAGGAACATGCCAATCTCAGGCATCAGATTCCGGATAGTCATTGTTGAAAATTTGTGACAGTTTTGTTTGTTTCTATAGGGCACATATGCACAGGAGAAGAAAATAATGAATTTTCACACTAAACTCTTAATTTTGTATTGCATCAGATAAGATAAGATAGTTTT
ATTAATGTAAAACAAATGACCACAAGAGTAGGTCAATGGGGCTAAAAGGTTTGCCTAGTGCAAATACAGTGTGGGAGTGTGCAAGCAACTCCTTTAACAATGCTGAAAGCGAAAAGAAAATGAAAATAAAGGAGCATAACAAAATATCTAGAAGCATAACTATCACTCAAACCAGAAGATACAAAAGCATAAGTTCAGTG
ATACAATAGAAAGGCCAGGGACTGGAGATCCCAGTGCTGAGCAAGAGAGAGAGAGAGGGTGTCAAGTCCTGCTGGTCCTGATGGCCAAGGGCAAGGGAGGGGGGAGGACCGAGGTATATTTTCATGATACACAATTTGTTCCAAAATTGGACCAAATTATCATAAATGTTTATGCTATCGTATTTTTTCCACTTCTATTT
TAGCAGAGCAGGGTACCCAACTAGAAAGGTCATTACATCTTGAACACCCCCTTAATGACCACTTTATTATCTTTTACAGCAAGCATCTCCCGAAATTTCTGAAGTTTCTCCTTGCTCAAAGCTTTCATGAAGACGTCTGCAAGCTAATCTTTAGTTGTGCAGTACACAACCCCAACTTCTCCAGTGTTATCATTGGACCT
GACTATCTCTAGCATCATTGGTCACACAGCCTAAGGATTTCCCTTGGAAGTTGAGGGTTTGCTACCACCAGCTACGTGCTGAGACAAACCACCATATTTCTCTTTGCAAGTGGGTCTACCGTCTTTGTTCTCTCGAAGAGGTTGAGAATGCGGAGCACTTCATTTTCTAGTTCCCCATCTATTATAAGTTCCAGGGAAGA
TATACCATTGTTTGTATTGAGACTTGGGAGGTTCCTTATCCACCTTCCACTATCGCAATCAAATATATGTAGCCCTATTCCTCCGAGACACTGCCACTTTCAGACATAGAGATTTGCAAGAGACCCCTGGGGCCAATTTTAGGCCTACAAGGTTGACCACCTTCTTTCAGCGTATTCCAGAGATTGGGGGTACTAAGCAC
CCTTTCCACACATAGGCAGGTAGATATAGGTCAATGAGACAATGTTCCTC
Intron 3 GTGGGTTTAC ... GTATTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.26 | 40 | 28 | 33 |
| A2 | 48.75 | 41 | 21 | 57 |
| A3 | 36.51 | 40 | 14 | 32 |
| A4 | 48.43 | 41 | 27 | 50 |
| A5 | 56.57 | 38 | 50 | 49 |
| A6 | 47.37 | 40 | 34 | 38 |
| A7 | 46.67 | 28 | 16 | 33 |
| A8 | 41.67 | 14 | 9 | 11 |
| A9 | 43.62 | 53 | 39 | 43 |
| A10 | 33.79 | 48 | 25 | 24 |
>TRINITY_DN106052_c1_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoformTTGGAACTTGGAAGGTGAAAGCAATCACATCGAGCGGTGTGAAAAAAAAAAATCACATCTAGCCATCGTGGATATTTTAAAGATTGAATTACACATAAATAACTCCTAAATTTTTTACCTGCTCCACGATTTATGTGCACGCAGAGCACTAGATGCAAACCTATCAGATGCCTTTGCTCACATAATCAATGTGTAAGCAA
CAGAATTAACAACCCAGATCAGATCATAGGGAGCCCTGAAGAATGCCACTCCTCTCAACTCGTTTTGTGTTCAACTGCACTTCTACATGCATAGACAGTCACACAAATCTGGTGGACTATTATGCCCACACAAGCTCTGCATGTCACCAGTTTGCACAGAAAATGAAAATACAACTCAAAGCAATCAACGGATTTATAGA
TTCAAACTTTAGCATAAATGCTTTTGATGTTTGCACGGAGTCTGGTCCCTGCAGAAGCTTGAATTTCAAGTTGTGTTCATTGTTGGGAGCTTCAGATCTAAGCTAATTCCTATTAACTAGAGCTTAACCGTCAAGTGGGTTAAAGACTTGCGAAAGTTCCGTGAAAGTTCTCAACTTTCAATGGCAGCTTTCAAGCAACC
GCTTAATGGTGGGTTCATAGCAGCAGCAGCAGTCCTTATATGTTTGCTTCTAATTCACATGAGTCCAAGGCCTCCGGCCCAGCAGAATGAGTACCTTGGGACTTTTCCTCCTATAGACAGGACTGTAATGCCCAGAAAAACGAGTCCACGAAAAAGTATTTGGAATGTGCAGAGCCTTGTGCACTGGAAGCCTTGCGAAT
GGTGGACTGCAAAACCCATAACAGGTCCTCCAGTGGAAAGCAATGGATATATTAAAATTGATTGCCATGGAGGTCTTAATCAGATGCGACGAGATCTATGCGATGGTGTAGATGTTGCTCGTCTGCTCAATGCAACATTAGTCCTGCCAAATTTTGAAACAGCCTCATATTGGAATGATACAAGTGGTTTTGCAGAAATT
TTCAATGTAGACTATTTCATTCAGCAGATGGAGGGATTTGTCGGTGTAGTGAAAGAACCACCACAAGGACTGGCCTCAATAAATCCAGTTAGAGTTGATTGTCGTAAACAGAAAGGTCATTTCGATTATATAGAGTCTGTACTTCCTTCTTTGGTGAAGCATCAATACATCATCATTACCCCTGCAGCAAGTCAAAAAAT
AGATAGACACCCATTTTATGCCAAAGCAGCTCGTTGTCATGCATGTTTCAGAGCTCTACGCCTTGCTAAGCATCTTGAGCTAAAGGGAGCTGAACTACTACAAAGGATCCCTCAACCTTTTTTGTCTTTGCATCTGAGATTTGAGCCTGACATGATAGCTTACAGTAGATGTGAGTATACTGGCCTTGCTCAGAGCTCTT
TGGATGCAATTAATGCAGCTAGAAATGGTAGGATAAGCTTCTCAGGGGATGTGGGACTAGCATGGAGGAAGAGAGGAAAGTGCCCACTAACTCCGAGAGAGACGGCCTTCATTTTGCAGGCCCTTGGAATCCCCACTAACACAACTATTTATTTGGCTGCTGGTAAAAGCCTATTGGAGTGGAAGGATTTCACTTCTGTG
TACAAGAACATTTACACCAAATCTTCTATTCTAGACAAGGCAAGCTTGGTGGGATTGCATGGAAATAGCAGAGCTGCATTGGACTACTATATATCCATCAACAGTGAGGCATACATTGGGACATATTTTGGGAACATGGACAAGATGGTAGCTGCAATGAGAGCTTTGAATGGGCGACCAAACACAATTTTTCTCAACAG
GAGAGCTTTTGCAGAAGCTGTTTCTCAAGGTCTCGATGGAGATAGGCTGGCAGATTATTTGTGGGAGGCTCACAGGAATGCTTTAGTTGATGGAAGAGGATCTGCTCTACCTGATTGCTTTTGCATGTCCAACATTACAGATTCGCATTAATTGTAATGATAATTAAGTTATACGTTATCTCCACATTCCATGGTTTCGG
AAACATGATTTCATCTATGGAGTGTCTCTTCAACATGAGATATTTCTGTTCTTTTTTGAAAGTTTATTGCCAGATTTTTACAATGGTTTTTGTTAGTTGCAGTGAAGGGAAGGGAACCACAGCTTATAAAAATTATGTTGCTTCTGATCTTTTTCAGAGTTTACAATGGAACCTGCAAAGCTCGTCTATTGGAGTAAATC
ACCATGTTTTTAGATTGCAGCAAGGAATTATACATTTTTAGTAGCTTCC
>TRINITY_DN106052_c1_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:TTGGAACTTGGAAGGTGAAAGCAATCACATCGAGCGGTGTGAAAAAAAAAAATCACATCTAGCCATCGTGGATATTTTAAAGATTGAATTACACATAAATAACTCCTAAATTTTTTACCTGCTCCACGATTTATGTGCACGCAGAGCACTAGATGCAAACCTATCAGATGCCTTTGCTCACATAATCAATGTGTAAGCAA
CAGAATTAACAACCCAGATCAGATCATAGGGAGCCCTGAAGAATGCCACTCCTCTCAACTCGTTTTGTGTTCAACTGCACTTCTACATGCATAGACAGTCACACAAATCTGGTGGACTATTATGCCCACACAAGCTCTGCATGTCACCAGTTTGCACAGAAAATGAAAATACAACTCAAAGCAATCAACGGATTTATAGA
TTCAAACTTTAGCATAAATGCTTTTGATGTTTGCACGGAGTCTGGTCCCTGCAGAAGCTTGAATTTCAAGTTGTGTTCATTGTTGGGAGCTTCAGATCTAAGCTAATTCCTATTAACTAGAGCTTAACCGTCAAGTGGGTTAAAGACTTGCGAAAGTTCCGTGAAAGTTCTCAAgtgggtttacgaatcttgaaagtttc
tgtgaaaattcttaagtgggttgaaccataatcgacgtttctggcgaaattctcagttgggtctaagtattttgaaagcttctgccagaaaagttcaattgatttgaggatttttgtattggcagCTTTCAATGGCAGCTTTCAAGCAACCGCTTAATGGTGGGTTCATAGCAGCAGCAGCAGTCCTTATATGTTTGCTT
CTAATTCACATGAGTCCAAGGCCTCCGGCCCAGCAGAATGAGTACCTTGGGACTTTTCCTCCTATAGACAGGACTGTAATGCCCAGAAAAACGAGTCCACGAAAAAGTATTTGGAATGTGCAGAGCCTTGTGCACTGGAAGCCTTGCGAATGGTGGACTGCAAAACCCATAACAGGTCCTCCAGTGGAAAGCAATGGATA
TATTAAAATTGATTGCCATGGAGGTCTTAATCAGATGCGACGAGATCTATGCGATGGTGTAGATGTTGCTCGTCTGCTCAATGCAACATTAGTCCTGCCAAATTTTGAAACAGCCTCATATTGGAATGATACAAGTGGTTTTGCAGAAATTTTCAATGTAGACTATTTCATTCAGCAGATGGAGGGATTTGTCGGTGTAG
TGAAAGAACCACCACAAGGACTGGCCTCAATAAATCCAGTTAGAGTTGATTGTCGTAAACAGAAAGGTCATTTCGATTATATAGAGTCTGTACTTCCTTCTTTGGTGAAGCATCAATACATCATCATTACCCCTGCAGCAAGTCAAAAAATAGATAGACACCCATTTTATGCCAAAGCAGCTCGTTGTCATGCATGTTTC
AGAGCTCTACGCCTTGCTAAGCATCTTGAGCTAAAGGGAGCTGAACTACTACAAAGGATCCCTCAACCTTTTTTGTCTTTGCATCTGAGATTTGAGCCTGACATGATAGCTTACAGTAGATGTGAGTATACTGGCCTTGCTCAGAGCTCTTTGGATGCAATTAATGCAGCTAGAAATGGTAGGATAAGCTTCTCAGGGGA
TGTGGGACTAGCATGGAGGAAGAGAGGAAAGTGCCCACTAACTCCGAGAGAGACGGCCTTCATTTTGCAGGCCCTTGGAATCCCCACTAACACAACTATTTATTTGGCTGCTGGTAAAAGCCTATTGGAGTGGAAGGATTTCACTTCTGTGTACAAGAACATTTACACCAAATCTTCTATTCTAGACAAGGCAAGCTTGG
TGGGATTGCATGGAAATAGCAGAGCTGCATTGGACTACTATATATCCATCAACAGTGAGGCATACATTGGGACATATTTTGGGAACATGGACAAGATGGTAGCTGCAATGAGAGCTTTGAATGGGCGACCAAACACAATTTTTCTCAACAGGAGAGCTTTTGCAGAAGCTGTTTCTCAAGGTCTCGATGGAGATAGGCTG
GCAGATTATTTGTGGGAGGCTCACAGGAATGCTTTAGTTGATGGAAGAGGATCTGCTCTACCTGATTGCTTTTGCATGTCCAACATTACAGATTCGCATTAATTGTAATGATAATTAAGTTATACGTTATCTCCACATTCCATGGTTTCGGAAACATGATTTCATCTATGGAGTGTCTCTTCAACATGAGATATTTCTGT
TCTTTTTTGAAAGTTTATTGCCAGATTTTTACAATGGTTTTTGTTAGTTGCAGTGAAGGGAAGGGAACCACAGCTTATAAAAATTATGTTGCTTCTGATCTTTTTCAGAGTTTACAATGGAACCTGCAAAGCTCGTCTATTGGAGTAAATCACCATGTTTTTAGATTGCAGCAAGGAATTATACATTTTTAGTAGCTTCC