sp|A2YZ01|INV7_ORYSI ----> Beta-fructofuranosidase, insoluble isoenzyme 7

Intron 1 GTAAATCTTA ... ATTTTTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	47.83	6	10	1
A2	50	7	12	2
A3	64.71	3	9	2
A4	60	2	6	0
A5	50	1	1	1
A6	79.71	7	39	16
A7	66.07	19	58	16
A8	80.56	7	41	17
A9	63.41	30	73	31
A10	57.02	26	50	19

>TRINITY_DN43368_c1_g3_i3 from sample A6 / Example spliced isoform

CGCTGCTTAAACGATCATTGGGCAGTCACTAAGAAGTAACGCTAATGGAATCGTTGAGAGGGAAATCATATGTAACTGTGATGGAAGTGAATAAAATACAAATTTCGTAGATCCATTAAAGTGAATGTGAAAATAACCCCTTCAATCATGGCGATTCACATTTCTCTGCCAGACGTCATTCCTAAAGCCATCTCCCGTGC
CCAAACAAAGTCAGAGCTTCACAGCTATCGGAAGAGCATTTTTACTGGGCTCAGAGCTTCATGGGAGCCGAGGTATCTGTGAATTTCGTTATCGACATTGGCCATTTCCGTTCGGGAGTTCGGTTTGCATAAAGTTGTTTACGATATGTACAGAATGTGTGTTTAGTTACCTACCTTGCCTACTGCTCTTGAACCGAGAA
CCAGCTCTTAAAATAGGACAAAATATGCAGAGTATTTGACAAAACATAAGGTCTAGTATTATTGTATGCAAAGCATAAAGATTTAGCGTATACTGTATGCACAGTATATGGGAATTGTGCATAAAGTCGCTTCAACTACAACATTTGTCTCGAGGAATGCCTAACCCCAGCAGAACTGCACTATCTGTGAACGAATAAGG
CAGTATATCGGATATCCAGAATGTCAAACATCCCATCCGAATTTCAATGGAATGCTTGTTAACAGAAGACATGAATCTTCTTAATCCTTAAATCTTTAATACATAATCTGTCTATAAATTGTGTTTAGTTTAAGTGGTTGTGGGATGGAATGTTATTATCCCCTCTCCGGTTCTATTTCTATTTCTGCGTTTCTGTATGA
CATATTGAGCTCATAATGAATATATTGTTGTAATGACTTTGAGTCTTTGTTGATCTGGCCTTGTACCTTGAAGAATCCAAGGTTTACCTGGAATACCTTTC

>TRINITY_DN43368_c1_g3_i7 from sample A6 / Example unspliced isoform:

CGCTGCTTAAACGATCATTGGGCAGTCACTAAGAAGTAACGCTAATGGAATCGTTGAGAGGGAAATCATATGTAACTGTGATGGAAGTGAATAAAATACAAATTTCGTAGATCCATTAAAGTGAATGTGAAAATAACCCCTTCAATCATGGCGATTCACATTTCTCTGCCAGACGTCATTCCTAAAGCCATCTCCCGTGC
CCAAACAAAGTCAGAGCTTCACAGCTATCGGAAGAGCATTTTTACTGgtaaatcttacacgctaattggagcaaagcaattcgccaggttatcgcgatccaacctccggttttctaaacgggaaaactccggtctcccacgatcaatggcggagggcgcttcctgtgcaacaggttcttctatttattccacgaaacttc
cctcatttaatttctaagtcatcgcttcaacatttttgtagGGCTCAGAGCTTCATGGGAGCCGAGGTATCTGTGAATTTCGTTATCGACATTGGCCATTTCCGTTCGGGAGTTCGGTTTGCATAAAGTTGTTTACGATATGTACAGAATGTGTGTTTAGTTACCTACCTTGCCTACTGCTCTTGAACCGAGAACCAGCT
CTTAAAATAGGACAAAATATGCAGAGTATTTGACAAAACATAAGGTCTAGTATTATTGTATGCAAAGCATAAAGATTTAGCGTATACTGTATGCACAGTATATGGGAATTGTGCATAAAGTCGCTTCAACTACAACATTTGTCTCGAGGAATGCCTAACCCCAGCAGAACTGCACTATCTGTGAACGAATAAGGCAGTAT
ATCGGATATCCAGAATGTCAAACATCCCATCCGAATTTCAATGGAATGCTTGTTAACAGAAGACATGAATCTTCTTAATCCTTAAATCTTTAATACATAATCTGTCTATAAATTGTGTTTAGTTTAAGTGGTTGTGGGATGGAATGTTATTATCCCCTCTCCGGTTCTATTTCTATTTCTGCGTTTCTGTATGACATATT
GAGCTCATAATGAATATATTGTTGTAATGACTTTGAGTCTTTGTTGATCTGGCCTTGTACCTTGAAGAATCCAAGGTTTACCTGGAATACCTTTC

Intron 2 GTGTTGGATC ... CTTGTTCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	62.79	8	11	16
A2	62.96	5	11	6
A3	90.48	1	10	9
A4	60	9	17	10
A5	100	0	6	6
A6	60	64	98	94
A7	57.35	58	77	79
A8	65.12	64	119	120
A9	60.31	52	67	91
A10	63.43	32	58	53

>TRINITY_DN42387_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoform

ATGAAATTTTGAAATTGGCAACATTTGTTACAAAAGCAAACAAAGCTCAAGTTGGAGTTGTTCACCATGGGTCCATTTGGCCATTGGAGCAAGTGGTAAACCTATCTGCTAACATTGATGCATTTCATATTAATGATATGATAGATGTTATCAATCATTGGGACTTTCTTTACAGTTGTATGAAACTTGAAGGCCCAGGT
ATCCAATTAGAAGATGTGAAATTTCTTGCTCCTATACCCAAGCCTTCTGGAGCGATAATGTGTATTGGCAAAAATTATGTGGACCATGTTAAAGAAGTTGATACATGGAAAACGGCTCCTGGCATAGCTTCACCCAGTATACCAAAGTACCCCATTGTCTTCACAAAGGCACCACAGTCAGTTATTGGACCAGGAGCTGC
AATAAGATATCCTCATTCAATAACAACCCAAGTGGACTATGAAACTGAGCTTGCAGTGATCATTGGAAAATCTGGACATGGCATAAAGAGGGAGGATGCAATGTCGCATGTGTTTGGGTATACTATACTAAATGATGTAACTGCAAGAGACTTGCAAAAGCGACATCAACAGTGGTTCATGGGGAAGAGCTGTGACACAT
TTTGTCCACTGGGCCCATGGATTGTGCCAGCAACTGAAATTAATGGTCAGGACCTTCAGATTCAGTGTTGGGTTAATGGGGAATTGAGGCAGGATGCCCGGACATCAGAAATGATTTTCTCAATACCACAGTTGATTGAGACAATTTCCTCTGGTATCACTCTGCAACCTGGTGATATTATAGCAACTGGTACTCCATCT
GGAGATTCCATTCTCATGAAAATCGAAGGTATTGGTGAACTACATAATCACGTTGTTTGAATGAAAAATTCAGATTCAACCATATAAGGCATTTGTTGATTACTCTGATGAATGTTTAATACTATGATTTTAATAAAATGCTCG

>TRINITY_DN42387_c0_g1_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

CTCTTCTATATGATGACGCTGCTTAAACGATCATTGAGCAGTCACTAAGAAGTAACGCTAATGGAATCGTTGAGAGGGAAATCATATGTAACTGTGATGGAAGTGAATAAAATACAAATTTCGTAGATCCATTAAAGTGAATGTGAAAATAACCCCTTCAATCATGGCGATTCACATTTCTCTGCCAGACGTCATTCCTA
AAGCCATCTCCCGTGCCCAAACAAAGTCAGAGCTTCACAGCTATCGGAAGAGCATTTTTACTGGTAAATCTTACACGCTAATTGGAGCAAAGCAATTCGCCAGGTTATCGCGATCCAACCTCCGGTTTTCTAAACGGGAAAACTCCGGTCTCCCACGATCAATGGCGGAGGGCGCTTCCTGTGCAACAGATGAAATTTTG
AAATTGGCAACATTTGTTACAAAAGCAAACAAAGCTCAAGTTGGAGTTGTTCACCATGGGTCCATTTGGCCATTGGAGCAAGTGGTAAACCTATCTGCTAACATTGATGCATTTCATATTAATGATATGATAGATGTTATCAATCATTGGGACTTTCTTTACAGTTGTATGAAACTTGAAGGCCCAGGTATCCAATTAGA
AGATGTGAAATTTCTTGCTCCTATACCCAAGCCTTCTGGAGCGATAATGTGTATTGGCAAAAATTATGTGGACCATGTTAAAGAAGTTGATACATGGAAAACGGCTCCTGGCATAGCTTCACCCAGTATACCAAAGTACCCCATTGTCTTCACAAAGGCACCACAGTCAGTTATTGGACCAGGAGCTGCAATAAGATATC
CTCATTCAATAACAACCCAAGTGGACTATGAAACTGAGCTTGCAGTGATCATTGGAAAATCTGGACATGGCATAAAGAGGGAGGATGCAATGTCGCATGTGTTTGGGTATACTATACTAAATGATGTAACTGCAAGAGACTTGCAAAAGCGACATCAACAGTGGTTCATGGGGAAGAGCTGTGACACATTTTGTCCACTG
GGCCCATGGATTGTGCCAGCAACTGAAATTAATGGTCAGGACCTTCAGATTCAGTGTTGGGTTAATGGGGAATTGAGGCAGGATGCCCGGACATCAGAAATGATTTTCTCAATACCACAGTTGATTGAGACAATTTCCTCTGGTATCACTCTGCAACCTGGTGATATTATAGCAACTGGTACTCCATCTGgtgttggatc
agggtttgacccaccacgccatcttgttccagGAGATTCCATTCTCATGAAAATCGAAGGTATTGGTGAACTACATAATCACGTTGTTTGAATGAAAAATTCAGATTCAACCATATAAGGCATTTGTTGATTACTCTGATGAATGTTTAATACTATGATTTTAATAAAATGCTCG